植物MYB类转录因子研究进展
MYB转录因子在水稻抗逆基因工程中的研究进展
MYB转录因子在水稻抗逆基因工程中的研究进展董勤勇张圆圆魏景芳朱昀摘要:干旱、寒冷、高盐以及病虫害胁迫是造成水稻减产的重要因素。
近年来,植物特异性转录因子在水稻抗旱、抗寒、抗盐以及抗病虫害胁迫机制上扮演着重要角色。
MYB转录因子是植物最大的转录因子家族之一,其结构高度保守,常见1R-MYB/MYB-related、R2R3-MYB、3R-MYB以及4R-MYB4种结构类型。
MYB转录因子主要参与植物生长发育、生物以及非生物胁迫的应答过程。
本文就MYB转录因子的结构特征、分类以及在水稻(Oryzaativa)生物及非生物胁迫中的应答进行综述,为MYB转录因子的研究及植物抗逆新品种培育提供参考。
关键词:MYB转录因子;生物胁迫;非生物胁迫Keyword:MYBtrancriptionfactor;biotictre;abiotictre植物在田間会遭受干旱、寒冷、高盐等非生物胁迫以及包括害虫和病原体在内的生物胁迫。
植物自身具备应对复杂胁迫反应的机制与策略,转录因子(Trancriptionfactor)是逆境响应的主要调控因子,其编码基因是作物改良的最佳候选基因[1]。
转录因子是一类调节基因表达水平的重要调控蛋白,通过与靶标基因启动子区的顺式作用元件结合,激活或抑制靶标基因的转录表达[1]。
据报道在已发现的80个转录因子家族中,只有MYB、NAC、bZIP、锌指蛋白等少量转录因子在逆境胁迫响应中起到重要作用。
其中MYB转录因子是最大的植物转录因子家族之一,它在植物生长发育、激素信号转导以及植物对生物及非生物应答中起到十分重要的作用[2-5]。
目前从水稻中已鉴定出185个MYB转录因子[6],研究发现这些转录因子的功能不仅体现在调节植物生长发育上,在植物应对复杂的生物和非生物胁迫反应方面上也具有显著的作用。
这些MYB转录因子基因提高了水稻的综合抗逆能力,是实现水稻抗逆遗传改良的重要资源。
1 MYB转录因子的结构与分类MYB转录因子结构上具有1~4个重复单元构成的MYB结构域,每个重复单元由50~53个氨基酸构成[7]。
番茄MYB_转录因子研究进展
中国瓜菜2023,36(3):9-14收稿日期:2022-11-18;修回日期:2023-01-16基金项目:国家现代农业产业技术体系(CARS-23-G11);烟台市科技计划项目(2022XCZX091);重庆市巫山县科技项目(wskjdx-bxm2022003)作者简介:石雪燕,女,在读硕士研究生,研究方向:植物分子生物学。
E-mail :*****************通信作者:王虹云,女,高级农艺师,研究方向:蔬菜育种及分子生物学。
E-mail :************************转录因子(transcription factor ,TF )是能够特异性地结合基因5’端上游特定核苷酸序列的蛋白,能够调控基因表达功能,加强或抑制基因的转录,也可称作反式作用因子[1]。
转录因子作用过程是在植物根据不同的发育阶段以及面对外部环境的变化时,与相应的顺式元件特异性地结合,激活特定基因转录表达,做出一系列应答反应[2]。
不仅如此,当DNA 转录成RNA 时,在转录起始过程中转录因子起着辅助RNA 聚合酶的作用,是此过程必不可少的一部分[3]。
现在已经发现数百种基因编码植物转录因子,按照DNA 结构域可以分为MYB 、SBP 、HB 、DREB 、NAC 、bZIP 、WRKY 和AP2/EREBP 等家族[4]。
转录因子参与植物许多生理过程,在植物面对外界刺激变化时诱导相关基因表达,开启植物的防御机制,在植物抗逆性方面起着重要作用[5]。
MYB 转录因子家族在植物中数量较多、功能多样,大多数与植物生长发育及逆境胁迫有关,备受学者关番茄MYB 转录因子研究进展石雪燕1,2,李涛1,2,王虹云2,张瑞清2,曹守军2,张丽莉2,姚建刚2,刘佳凤1,2(1.烟台大学生命科学学院山东烟台264005;2.山东烟台市农业科学研究院山东烟台264421)摘要:MYB 转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,能够结合基因5’端上游特定核苷酸序列,协助RNA 聚合酶催化DNA 模板链转录成RNA ,起到调控目的基因表达的作用。
茄科植物转录因子MYB_基因家族研究现状
2023年第18期现代园艺茄科植物转录因子MYB基因家族研究现状江舟,韩丽君(云南中医药大学,云南昆明650500)摘要:植物转录因子myb是一种DNA结合蛋白,最常出现在植物类型中,也是植物中覆盖面积最广的转录因子家族,和真核基因启动子区域特异性相互作用,是通过彼此间相互作用调控基因表达的一种转录因子。
实践证明,转录因子MYB基因家族成员积极参与茄科植物生长发育过程,目前已成为茄科植物的重要成员。
主要分析前人的研究成果,如归纳MYB转录因子的结构特征、生物学特性、调控机制等,结合国内外相关研究进展,全面分析茄科植物转录因子MYB基因家族的研究现状。
关键词:茄科植物;MYB;转录因子植物在生长发育过程中经常遭受各种逆境影响,如低温、盐渍、强光、干旱等环境,产生多样化特有基因表达模式,用来抵御各种不良环境。
转录因子是通过特异性方式和基因端上游的特定因子结合,是最典型的调节蛋白,具有特殊结构,能调控基因表达,对基因表达效应具有较强的抑制作用。
同时,MYB基因家族作为一个特殊的转录因子家族,在涉及到各种植物类型,其功能趋于多样化,和植物生长发育有必然联系,在大多数MYB 转录因子结构中都有保守的MYB结构域。
研究表明,真核生物基因表达关键因子是不同逆境相关基因启动子中顺式因子和转录因子的协同作用,MYB转录因子通过和这些顺式因子专一性结合,进而调控植物生长发育的应答机制,让其能正常生理代谢,从而限制基因的转录过程[1]。
作为蔬菜作物中最重要种类,茄科植物经济价值仅次于本科和豆科植物,有约3000种植物,如土豆、西红柿、辣椒、茄子、枸杞、烟草、碧冬茄等。
茄科植物类型多种多样,且物种内表型存在严重差异性,但茄科植物在基因组水平基本相同,在这里能明确看到其存在明显反差,能将其少数作物作为一种模式作物,植物能适应复杂环境的生活条件,研究植物中存在遗传变异现象。
随着基因组学和生物信息学的不断发展,MYB转录因子的分离、克隆和功能的研究,已逐渐成为人们关注的热点[2]。
植物转录因子MYB基因家族的研究进展
植物转录因子MYB基因家族的研究进展一、本文概述植物转录因子在植物生长发育和响应环境胁迫等过程中起着至关重要的作用。
其中,MYB基因家族作为植物转录因子中最大的家族之一,其成员数量众多,功能多样,研究价值极高。
本文旨在全面综述近年来植物MYB基因家族的研究进展,从MYB基因的结构特点、分类、功能及其在植物抗逆、次生代谢、生长发育等过程中的应用进行阐述,以期为进一步深入研究MYB基因家族在植物中的功能和应用提供有益的参考。
本文将对MYB基因家族的结构特点进行概述,包括其DNA结合域的结构、保守性及其与DNA结合的机制等。
我们将对MYB基因家族进行分类,包括R2R3-MYB、3R-MYB、4R-MYB和单R-MYB等亚族,并简要介绍各亚族的特点和代表性成员。
在此基础上,我们将重点综述MYB基因在植物抗逆、次生代谢、生长发育等方面的功能和应用,包括其在响应干旱、盐碱、低温等逆境胁迫中的作用,以及在调节植物次生代谢、控制植物形态建成和生长发育过程中的作用等。
我们将对MYB基因家族的研究前景进行展望,以期为植物生物学和农业科学研究提供新的思路和方法。
二、MYB基因家族概述MYB基因家族是植物中最大且最复杂的一类转录因子家族,它们在植物的生长、发育以及应对生物和非生物胁迫等多个生物学过程中发挥着关键作用。
MYB转录因子的命名源于其特有的DNA结合域——MYB结构域,该结构域由一系列不完全重复的R(repeat)单元构成,每个R单元约包含51-53个氨基酸,通过形成螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix)结构来特异性地识别并结合DNA序列。
根据MYB结构域的数量和序列特征,植物MYB基因家族通常被分为四大类:R1/2-MYB、R3-MYB、MYB-related和4R-MYB。
其中,R1/2-MYB 和R3-MYB分别含有一个和三个MYB结构域,而MYB-related类则仅包含不完整的MYB结构域。
水稻逆境相关转录因子研究进展
水稻逆境相关转录因子研究进展罗成科;肖国举;李茜【摘要】干旱、盐碱、高温和低温等逆境因子胁迫水稻的生长发育,进而影响水稻的产量和品质。
因此,研究水稻的抗逆性,尤其是揭示其抗逆分子机理具有重要的生物学意义。
近年来,水稻抗逆分子机理的研究主要集中在转录因子及其分子调控机制方面。
在水稻中,目前研究较多的转录因子类型主要有 bZIP、MYB/MYC、WRKY、AP2/EREBP 和 NAC,它们的结构通常由 DNA 结合结构域、转录活化结构域、寡聚化位点和核定位信号组成。
转录因子在水稻逆境信号转导途径中起着中心调节作用,它们将逆境信号传递和放大,通过与目的基因启动子区中顺式作用元件特异结合,调控下游多个逆境相关基因的表达,从而引起水稻对逆境应答反应,最终实现水稻获得综合抗逆性的提升。
该文简要概述了植物转录因子的调控机制、结构特点、分类与功能特性,重点论述了转录因子在水稻抗逆中的作用,指出了转录因子应用过程中转基因水稻产生的负效应问题,并提出了解决负效应问题的研究思路,同时展望了今后转录因子的研究前景,以期为挖掘和应用新的水稻转录因子基因以及阐明其抗逆调控机制提供理论依据。
%Adverse environmental factors,such as drought,salinization,high temperature and low temperature, severely threaten rice growth and development,and then damage rice yield and quality.Therefore,the research on rice resistance,especially dissecting molecular mechanism of rice,has important biological significance.In recent years,the reports on molecular mechanism of rice resistance have been mainly focused on isolating and identifying transcriptional factor genes as well as their regulatory mechanisms.For example, several main types of transcriptional factors,such as bZIP,MYB/ MYC,WRKY,AP2/EREBPand NAC families,were relatively clearly studied in rice.Each of these transcriptional factors was usually composed of a DNA-binding domain,a transcription regulation domain,a oligomerization site and a nuclear localization domain.Transcriptional factors played a pivotal role in the adversity signal transduction pathways of rice,they acted as the integrators of environmental factors to transmit and amplify adversity signal,and then regulated many of stress-related genes expression by specifically inter-acting with cis-acting elements existed in the promoter sequences of target genes,which made rice response to adver-sity stresses,eventually confers enhanced comprehensive stress resistances in rice.In this review,the regulatory mechanisms,structural characteristics,classification and functional properties of transcriptional factors are summa-rized,their regulatory roles in the stress response and tolerance of rice were discussed,the negative effects of geneti-cally modified rice in the process of transcriptional factors application were mentioned,and research approaches of sol-ving the negative effects problem were suggested,as well as the future study of transcriptional factors werediscussed.Overall,the aim of this paper was to provide the basis for identifying and applying new transcriptional fac-tor genes from rice,and clarifying their molecular mechanism in rice stress resistances.【期刊名称】《广西植物》【年(卷),期】2015(000)006【总页数】14页(P942-955)【关键词】水稻;逆境胁迫;抗逆性;转录因子;基因表达【作者】罗成科;肖国举;李茜【作者单位】宁夏大学新技术应用研究开发中心,银川 750021;宁夏大学新技术应用研究开发中心,银川 750021;宁夏大学新技术应用研究开发中心,银川750021【正文语种】中文【中图分类】Q945.78;Q786人类社会经济的快速发展、人口膨胀和生态环境不断恶化,造成了干旱、盐碱、极端温度和病虫害等自然灾害日趋加重,使得粮食作物的生长发育、产量和品质受到不同程度的影响。
植物MYB转录因子调控次生代谢的研究进展
评述与展望Review and Progress植物MYB 转录因子调控次生代谢的研究进展张驰1王艳芳1,2陈静1,2王义1,2张美萍1,2*1吉林农业大学生命科学学院,长春,130118;2吉林省人参基因资源开发与利用工程研究中心,长春,130118*通信作者,*********************.edu摘要转录因子调节是植物基因表达和调节机制的重要组成部分,MYB 转录因子(V-myb avian myelobl-astosis viral oncogene homolog),是植物中最大转录因子家族之一。
MYB 转录因子对多种次生代谢产物的生物合成具有转录调控作用,如硫代葡萄糖苷、黄酮类、萜类、木质素类和芪类化合物等。
本综述将对MYB 转录因子家族对植物次生代谢的影响作详细阐述,以期为后续进一步探究该转录因子家族基因的功能提供理论参考。
关键词MYB,调控,次生代谢Research Advances on the Regulation of Secondary Metabolism by Plant MYB Transcription FactorsZhang Chi 1Wang Yanfang 1,2Chen Jing 1,2Wang Yi 1,2Zhang Meiping 1,2*1College of Life Sciences,Jilin Agricultural University,Changchun,130118;2Research Center For Ginseng Genetic Resources Development and Uti-lization,Changchun,130118*Corresponding author,*********************.edu DOI:10.13417/j.gab.039.004171Abstract The transcription factor regulation is an important part of plant gene expression and regulation mechanism.MYB transcription factor (v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)is one of the largest families of transcription factors in plants.A variety of secondary metabolites is regulated by MYB transcription factors,such as the biosynthesis of glucosinolates,flavonoids,terpenoids,lignins and stilbenes.To provide reference for further exploration of the function,this review focuses on the influence of the MYB transcription factor family on plant secondary metabolism.KeywordsMYB,Regulation,Secondary metabolism基金项目:本研究由国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2013AA102604-3)、吉林省发改委-吉林省省级产业创新专项(2016C04;2018C047-3)、吉林省科技厅自然基金项目(20170101010JC;20180101027JC)和吉林省科技厅国际合作项目(201804-14077GH)共同资助引用格式:Zhang C.,Wang Y.F.,Chen J.,Wang Y.,and Zhang M.P.,2020,Research advances on the regulation of secondary meta-bolism by plant MYB transcription factors,Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology),39(9):4171-4177(张驰,王艳芳,陈静,王义,张美萍,2020,植物MYB 转录因子调控次生代谢的研究进展,基因组学与应用生物学,39(9):4171-4177)在漫长的自然选择和进化过程中,植物形成了独特的调节机制,其中转录因子调节是其重要的组成部分(牛义岭等,2016)。
拟南芥中MYB类转录因子研究进展
拟南芥中MYB类转录因子研究进展[摘要]:MYB 转录因子家族是植物中最大的转录因子家族之一。
以含有保守的MYB 结构域为共同特征,广泛参与植物发育和代谢的调节。
含单一MYB 结构域的MYB 转录因子在维持染色体结构和转录调节上发挥着重要作用,其中一项重要功能就是对非生物逆境的应答。
是MYB 转录因子家族中较为特殊的一类。
这类转录因子通过调控生长发育,影响代谢产物的合成和影响激素信号等多方面参与非生物逆境的应答。
[关键字]:拟南芥;MYB转录因子;结构和分类;逆境胁迫;次生代谢1.引言转录因子是通过特定的方式激活或抑制目的基因的表达,使其以特定强度在特定的时间和空间表达,来调控细胞的发育、增殖和新陈代谢等生理生化反应。
MYB 转录因子家族是一个庞大的转录因子家族,广泛地存在于所有真核生物中。
(1)根据与DNA结合的方式可以把TF分为两类:普遍性转录因子(general transcription factor,GTF)和特异性转录因子(sequence—specific transcription factor)(3~5)。
GTF能和启动子的核心序列TATA框结合,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体,可以激活所有基因的转录。
而特异性转录因子受到一些类固醇激素,生长因子或其他刺激后,和DNA序列上的其它调节元件结合,只能激活特定的基因。
典型的转录因子一般具有4个功能区:DNA结合区、转录调控区、核定位信号区和寡聚化位点。
通常根据保守性较强的DNA结合区把转录因子分类,例如螺旋一转角一螺旋(helix-turn-helix)、锌指(zinc finger)结构、亮氨酸拉链(1eucine zipper)和MADS盒等结构。
而MYB 转录因子家族是功能多样,数量众多的转录因子家族之一,参与调控植物发育,代谢和对生物与非生物胁迫的反应等多种生理过程。
第一个MYB 基因v-MYB是在禽类成髓细胞瘤病毒(avian myeloblastosis virus)中发现的一个癌基因,因此人们把这一类的基因都称为MYB 基因。
转录因子在植物抗逆性中的调控机制
转录因子在植物抗逆性中的调控机制转录因子在植物抗逆性中的调控机制是一个复杂而精细的生物学过程。
以下是根据您提供的文档结构,撰写的关于该主题的文章。
一、转录因子概述转录因子是一类能够结合到DNA上的蛋白质,调控基因的转录过程。
在植物中,转录因子对抗逆性基因的表达起着至关重要的作用。
植物在面临逆境如干旱、盐碱、低温、高温、病原菌侵染等环境压力时,转录因子能够通过调节下游基因的表达,增强植物的适应性和生存能力。
1.1 转录因子的功能转录因子通过识别特定的DNA序列,与基因的启动子区域结合,从而激活或抑制基因的转录。
它们可以是激活因子,促进基因表达;也可以是抑制因子,抑制基因表达。
转录因子的活性受到多种信号通路的调控,包括植物激素信号、环境信号和内部代谢信号等。
1.2 转录因子的分类转录因子可以根据其结构域和功能进行分类。
常见的转录因子家族包括AP2/ERF家族、bZIP家族、WRKY家族、MYB 家族等。
每个家族的转录因子都有其特定的DNA结合模式和调控特性。
二、转录因子在植物抗逆性中的调控机制植物在逆境条件下,转录因子通过多种机制调控基因表达,以应对不同的环境压力。
2.1 逆境信号的识别与响应植物首先需要识别逆境信号,如干旱、盐分、低温等。
这些信号通过植物的感知系统被识别后,会激活一系列的信号传导途径,最终导致转录因子的激活或抑制。
2.2 转录因子的激活与功能逆境信号激活的转录因子会进入细胞核,结合到特定基因的启动子区域,调控这些基因的表达。
这些基因通常编码与抗逆性相关的蛋白质,如渗透调节蛋白、抗氧化酶、抗冻蛋白等。
2.3 转录因子的相互作用转录因子之间也存在相互作用,它们可以通过形成同源或异源二聚体,或者通过相互竞争DNA结合位点,来协同调控基因表达。
这种相互作用增加了调控网络的复杂性,使得植物能够精细调控其抗逆性反应。
2.4 转录因子的后转录调控除了直接调控基因的转录,转录因子还可以通过影响mRNA的加工、稳定性和翻译等后转录过程,进一步调节基因表达。
大豆MYB转录因子GmPHR1转化及功能研究_吴冰
第32卷第3期2013年6月大豆科学SOYBEAN SCIENCEVol.32No.3Jun.2013大豆MYB 转录因子GmPHR 1转化及功能研究吴冰,李喜焕,刘翠,王运杰,李文龙,常文锁,张彩英(河北农业大学/教育部华北作物种质资源研究与利用重点实验室,河北保定071001)摘要:在克隆获得MYB 转录因子GmPHR 1基础上,构建基因超表达载体,采用农杆菌介导子叶节转化技术将其转入冀豆12,获得GmPHR 1高效表达转基因新材料,并分析基因在耐低磷和低磷敏感品种中的表达差异。
结果表明:成功构建了目的基因超表达载体pBI121-GmPHR 1,获得了经PCR 验证为阳性的T 4转基因新材料;荧光实时定量PCR 检测发现,其中4个株系的GmPHR 1表达量达到野生型对照的2倍以上,说明GmPHR 1能够在转基因新材料中高效表达;进一步分析低磷胁迫下不同耐低磷特性品种的基因表达量,发现GmPHR 1在耐低磷品种中呈现快速诱导、持续表达与高表达量的模式,而在低磷敏感品种中则表现缓慢诱导、迅速下降和低表达量的模式。
关键词:大豆;MYB 转录因子;载体构建;农杆菌转化;高效表达中图分类号:S565.1文献标识码:A 文章编号:1000-9841(2013)03-0302-04收稿日期:2013-01-14基金项目:国家转基因重大专项(2009ZX08004-004B );国家自然科学基金(31071441);河北省自然科学基金(C2010000749);河北省教育厅科学研究项目(2009)。
第一作者简介:吴冰(1987-),女,在读硕士,主要从事大豆分子生物学与转基因研究。
E-mail :bingmisswu@126.com 。
通讯作者:张彩英(1960-),女,研究员,博士生导师,主要从事大豆遗传育种与转基因研究。
E-mail :zhangcaiying@hebau.edu.cn 。
Genetic Transformation and Function Analysis of Transcription Factor GmPHR 1in SoybeanWU Bing ,LI Xi-huan ,LIU Cui ,WANG Yun-jie ,LI Wen-long ,CHANG Wen-suo ,ZHANG Cai-ying(North China Key Laboratory of Crop Germplasm Resources ,Education Ministry of China /Agricultural University of Hebei ,Baoding 071001,China )Abstract :To develop new transgenic soybean materials with MYB transcription factor GmPHR 1,and to study the expressionpatterns of GmPHR 1in different low-P tolerant soybean varieties ,a over-expression vector pBI121-GmPHR 1was constructedand introduced into Jidou12by Agrobacterium -mediated cotyledonary-node transformation method.PCR and real-time quantita-tive PCR analysis results of the transformed T 4plants showed that the GmPHR 1was successfully incorporated into the soybean genome and expressed at a higher level than the wild-type.Expression patterns assayed by real-time quantitative PCR revealedthat the expression level of GmPHR 1in low-P tolerant variety NF37was induced quickly for a longer period at a higher level than that in sensitive variety Niumaohuang under phosphate starvation condition.Key words :Soybean ;MYB transcription factor ;Vector construction ;Agrobacterium -mediated transformation ;Highly expressed大豆是蛋白质、油脂及多种保健活性物质重要来源,具有广阔的市场。
植物Myb转录因子的研究进展
s铂O量e嘲noml警cs与an擘dA乏p嵩pl跫edBm—lo—gywww.genoappibi01.orgIX)I:10.3969/gab.028.000365有超过80个M),b转录因子(gabinowiczeta1..1999),而棉花中发现大约有200个Myb转录因子(Cedronieta1.,2003)。
功能研究表明,M如参与了植物次生代谢(UimariandStrommer,1997;杜海等,2008),激素和环境因子应答(Chenetal。
2003;Hoerenetal.,1998;Leaetal.,2007),并对细胞分化、细胞周期(Payneeta1.,2000;Suoeta1.。
2003)以及叶片等器官形态建成(LeeandSchiefelbein,2002;Legayeta1.,2007;Yangeta1.,2007)具有重要的调节作用。
最近的研究发现,Myb转录因子参与了植物积累花色素过程,对果皮、果肉、叶片和花器官等各种颜色的形成具有重要作用(Azumaeta1..2008;Baneta1..2007;Esp.1eyeta1.,2007;Takoseta1.,2006)。
本文就Myb转录因子的特点和最新功能研究进展进行了综述,以期为该因子的研究和利用提供参考。
1Myb类转录因子的发现Myb基因序列早在1941年便从引起禽急性成髓细胞白血病病毒AMV和E26中成功鉴定出来(Graf,1992)。
Klempnauer等(1982)又从禽成髓细胞瘤病毒(avianmyeloblastosisvhats)中鉴定出一个corn.mantransforming基因,称为影一myb癌基因。
不久后发现,在正常动物细胞中也存在相应的原癌基因c—myb,而且具有调控细胞增值和分化作用的c.myb等位基因A一,扎伯和曰—m伯已从人类肿瘤细胞中被成功鉴定出来(Golayetal.,1996)。
一个新的棉花MYB类基因(GhTF1)的克隆及染色体定位分析
作物学报ACTA AGRONOMICA SINICA 2008, 34(2): 207−211 /zwxb/ ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@DOI: 10.3724/SP.J.1006.2008.00207一个新的棉花MYB类基因(GhTF1)的克隆及染色体定位分析房栋吕俊宏郭旺珍*张天真(南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室, 江苏南京210095)摘要: MYB类转录因子是指含有MYB结构域的一类转录因子, 广泛参与植物发育和代谢调节。
含2个MYB结构域的R2R3类MYB转录因子在植物体内主要参与次生代谢的调节和控制细胞的形态发生。
从优质材料7235不同发育时期的棉纤维混合cDNA文库中克隆了一个棉花MYB转录因子基因GhTF1(GenBank登录号: EF651783)。
该cDNA序列长1 115 bp, 其开放读码框长度为771 bp, 编码256个氨基酸。
表达特征分析表明, 该基因在陆地棉7235不同组织中均表达, 但表达量不同, 特别在开花前1 d, 开花后8 d和11 d的纤维细胞中优势表达。
该基因在二倍体棉种非洲棉和雷蒙德氏棉中开放读码框区的序列较保守, 但在非编码区差异较大, 在内含子区存在大片段插失和碱基替换现象。
Southern杂交结果表明该基因在陆地棉基因组中存在2个拷贝, 推测A、D亚组中各有1个拷贝。
利用海7124和TM-1两亲本配置的BC1作图群体, 将GhTF1定位在染色体10上。
关键词: 棉花; MYB基因; 克隆; 表达; 基因定位Cloning and Mapping of a New MYB Transcription Factor (GhTF1) in CottonFANG Dong, LÜ Jun-Hong, GUO Wang-Zhen*, and ZHANG Tian-Zhen(State Key Laboratory of Crop Genetics & Germplasm Enhancement, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, Jiangsu, China)Abstract: Plant MYB transcription factors are characterized by containing a structurally conserved MYB domain, they play important roles in the regulation of plant development and metabolism. Of them, the R2R3 MYB proteins with two MYB domains are involved in regulating secondary metabolism and cellular morphogenesis. Cotton fibers are single-celled seed trichomes. So far, the molecular process of fiber initiation is poorly understood. However, some transcriptional factors such as MYB genes are responsible to fiber cell initiation. Just like in Arabidopsis, leaf trichome formation is mediated through positive and negative regulators such as GL1 and GL2 encoding MYB transcription factors.In cotton, several MYB transcription factors have been cloned. Expression of type I genes (GhMYB1, 2, and 3) was detected in all tissues tested, while type II genes (GhMYB4, 5, and 6) process involving many other pathways such as signal transduction and transcriptional regulation. Moreover, GhMYB109, a gene encoding a R2R3 MYB transcription factor, was expressed specifi-cally in fiber initials and elongating fibers. And over-expression of GaMYB2 complemented gl1 phenotype as well as induced seed trichome development in Arabidopsis, suggesting a role of MYB-like transcription factors in cotton fiber cell differentiation. The objective of the study was to clone new MYB genes, further put a foundation to illustrate these genes function in cotton fiber developmental stages. In this paper, a MYB transcription factor gene, GhTF1 was isolated from developmentally different cotton fiber pools of elite material 7235 library. GhTF1 (GenBank No.: EF651783) is a 1 115 bp cDNA, its open reading frame is 771 bp, and encodes a polypeptide containing 256 amino acids. GhTF1 was expressed constitutively in every tissue with different expres-sion levels, e.g. with higher levels in fiber cells at initiation and elongations stages. GhTF1 had conserved coding region in A and D diploid cotton species, G. herbaceum and G. raimondii, however, there existed a large DNA fragment insertion/deletion and base substitutions in their corresponding intron region. Southern blotting analysis showed that there were two copies of GhTF1 in the基金项目:国家自然科学基金项目(30471104); 国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2002CB111303); 教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-04-0500); 教育部长江学者和创新团队发展计划项目(IRT0432)作者简介:房栋(1981– ), 男, 硕士。
黄秋葵MYB转录因子的鉴定及与果实老化关系分析
组织呈绿色,木质素为紫红色。 由图 1 可知,随黄秋葵
尔公司) 软化 14 d。 参照改良的石蜡包埋法
厚,花后 10 d 增厚更加明显;薄壁细胞在花后 2 ~ 6 d
液中固定 24 h,然后用植物软化液( G1115,武汉塞维
[22]
制作石
蜡切片。 将脱蜡的切片用蒸馏水清洗,再将切片放入
5%盐酸间苯三酚染色液中染色 2 ~ 5 min,之后进行蒸
( Arabidopsis thaliana ) 中 已 发 现 近 200 个 MYB 成
员 [9] 。 植物细胞周期、新陈代谢及环境响应等众多生
命活动都有 MYB 类转录因子的作用。 随着生物科学
研究的发展,植物中越来越多的 MYB 类转录因子被鉴
定和分析,已成为研究植物基因功能和表达调控的热
的维 管 束 细 胞 壁 增 厚, 纤 维 素、 木 质 素 等 大 量 积
植物 MYB 转录因子参与众多生物学过程,包括细
谢反应过程,对纤维素、木质素和木聚糖生物合成与沉
积,以及次生细胞壁形成具有重要的调控作用 [10] 。 拟
南芥的 AtMYB46 [11] 、AtMYB83、AtMYB58 [12] 、AtMYB63、
收稿日期:2021⁃12⁃15 接受日期:2022⁃03⁃01
7500 软件中的 ΔΔCT 法分析处理数据并得出目的基
因的表达情况。
2 结果与分析
2 1 黄秋葵果实细胞组织的形态结构观察
观察盐酸间苯三酚染色的石蜡切片,纤维素细胞
将 1 1 中试验材料于保存前去芯去籽,迅速放入
甲醛 - 乙酸 - 乙醇( formalin - aceto - alcohol, FAA) 固定
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植物MYB类转录因子研究进展
综 述R evie w2002201215收到,2002201228接受。
国家重点基础研究发展规划项目(973项目G 1999011604)资助。
3联系人,E 2mail :zywang @ ,Tel :02126404209024423。
植物MYB 类转录因子研究进展陈 俊 王宗阳3(中国科学院上海植物生理研究所,上海200032)摘要:植物M Y B 转录因子以含有保守的M Y B 结构域为共同特征,广泛参与植物发育和代谢的调节。
含单一M Y B 结构域的M Y B 转录因子在维持染色体结构和转录调节上发挥着重要作用,是M Y B 转录因子家族中较为特殊的一类。
含两个M Y B 结构域的M Y B 转录因子成员众多,在植物体内主要参与次生代谢的调节和控制细胞的形态发生。
含3个M Y B 结构域的M Y B 蛋白与c 2M Y B 蛋白高度同源,可能在调节细胞周期中起作用。
关键词:M Y B 结构域,M Y B 转录因子,组合调控学科分类号:Q74 随着多种模式生物基因组计划的完成,如何从这些浩如烟海的DNA 序列中揭示基因的功能以及它们有序的时空表达,已成为后基因组时代的重要课题。
人类基因组计划的完成显示人类只有30000~50000个基因,生命体是如何以如此少的基因完成如此复杂的生命活动的呢?很重要的一点在于基因的表达调控,使得每一个基因能适时、适地、适量地表达,并且使得某些基因可以产生多种功能各异的蛋白质。
真核基因的表达随细胞内外环境的改变而在不同层次上受到精确调控,如染色体DNA 水平、转录水平及转录后水平的调控等。
而转录水平的调控发生在基因表达的初期阶段,是很多基因表达调控的主要方式。
转录水平的调控指一类称为转录因子(有时又称反式作用因子)的蛋白质特异结合到靶基因调控区的顺式作用元件上,或调节基因表达的强度,或应答激素刺激和外界环境胁迫,或控制靶基因的时空特异性表达。
转录因子通常是一种模块化的蛋白,一般由几个独立的功能域组成,包括DNA 结合功能域,转录激活功能域,蛋白2蛋白相互作用功能域,信号分子结合功能域,核定位信号区等。
MYB转录因子功能与调控研究进展
MYB转录因子功能与调控研究进展郭弘光;吴繁花【摘要】综述了MYB蛋白家族的结构、功能和调控机制的研究进展,为分析、预测和阐明植物多物种中的NYB家族成员的功能打下良好的基础.%The structure,functions and regulation mechanisms of MYB protein were summarized,laying foundation for analyzing,predicting and e-lucidating the MYB proteins in plant species.【期刊名称】《安徽农业科学》【年(卷),期】2012(040)020【总页数】4页(P10381-10383,10516)【关键词】MYB;结构和功能;转录因子;调控【作者】郭弘光;吴繁花【作者单位】海南大学农学院,海南海口570228;海南大学农学院,海南海口570228【正文语种】中文【中图分类】S188;Q943植物MYB转录因子家族是功能多样、数量众多的转录因子之一,参与调控植物发育、代谢和对生物与非生物胁迫的反应等多种生理过程。
1987年,从玉米谷粒糊粉中克隆了COLORED1(C1)基因,编码一个具有MYB结构域的蛋白,参与花青素合成[1]。
拟南芥基因组测序成功后,第一次全面地对植物MYB基因家族进行描述和分类,为系统研究MYB转录因子家族在植物中的作用打下良好基础[2-3]。
目前,随着遗传学和分子生物学方法的应用,已在拟南芥、大豆[4]、玉米、水稻、葡萄、杨树等多种植物物种中研究了MYB蛋白家族成员的功能。
在控制MYB蛋白活性的调控机制、基因表达规律和靶标基因研究中取得一定进展[5-7]。
然而,MYB结构域中仅有少数DNA结合位点的功能得到阐明。
因此,笔者综述了MYB转录因子家族的分类、结构、生物功能以及调控机制的最新进展,结合更多的植物基因组测序结果,以阐明这一大类转录因子的进化规律和家族各成员的功能。
MYB类转录因子在植物细胞生长发育中的作用及其应用
MYB类转录因子在植物细胞生长发育中的作用及其应用刘忠丽;丛悦玺;苟维超;王响;陈坤明【摘要】The MYB family is one of the most important transcription factors family in plants. They play important roles in various processes including anthocyanin biosynthesis, environmental stress resistance, and the regulation of the growth and development of cotton fibers. Furthermore, these processes interact with each other with MYB as a key bridge. In this review,*we summarized and discussed these processes according to recent researches in MYB, mainly about the roles of MYB in the formation of anthocyanin, reaction to environmental stresses, and development of cotton fibers.%MYB是植物中重要的转录因子家族之一,它在调节花色素形成,抵抗逆境胁迫,调节棉花纤维发育等过程中发挥着重要的作用,且上述过程以MYB为中心,相互制约和影响.文章简要综述了人们近年来对于MYB在花色素形成、环境胁迫应答以及棉花纤维发育的过程中的作用.【期刊名称】《浙江农业学报》【年(卷),期】2012(024)001【总页数】6页(P174-179)【关键词】MYB类转录因子;花色素;干旱;棉花纤维【作者】刘忠丽;丛悦玺;苟维超;王响;陈坤明【作者单位】浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所,浙江杭州310058;浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所,浙江杭州310058;西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100;西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100;西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100【正文语种】中文【中图分类】Q78MYB(myeloblastosis)家族转录因子是植物中重要的一类转录因子,在生物体内主要起转录激活作用。
植物MYB转录因子与非生物胁迫响应研究_唐宁
第 31 卷第 3 期 2014 年 6 月
doi∶10. 3969 / j. issn. 2095 - 1736. 2014. 03. 001
基金项目: 高等学校博士学科点专项科研基金 ( 编号: 20124320110012 ) 作者介绍: 唐 Email: tangning0826@ 163. com; 宁, 硕士, 研究方向: 植物逆境分子生物学, Email: xinbochen@ live. cn。 通讯作者: 陈信波, 教授, 研究方向: 植物生物化学与分子生物学,
[9 ] TaMYB30B[10] 和 子, 因此也研究的最多, 如 MYB60 、 NbPHAN[11]。3RMYB 亚族 MYB 转录因子, 它们含有 3 个 MYB 结 构 域,在 植 物 中 数 量 较 少,如
TaMYB3R1[12]。非典型 MYB 亚族含有 4 或 5 个 MYB 结构 域, 植 物 中 数 量 稀 少, 一 般 只 有 1 ~ 2 个, 如 AT3G18100 和 LOC_Os07g04700[5]。
收稿日期: 2013 - 12 - 05 ; 修回日期: 2013 - 12 - 24
MYB 基因是玉米中的 COLORED1 , 它参与了玉米花青 素的合成调控 。 动物中通常只有 4 ~ 5 个 MYB 基因, 而植物中的 MYB 基因的数量较多, 每个物种基因组内
[1 ] 一般有 100 ~ 200 个 , 如拟南芥中有 196 个, 水稻中 [2 ] 有 185 个 。 数量丰富的 MYB 转录因子基因主要在
Research of MYB transcription factors in plant and abiotic stress response
植物转录因子MYB 基因家族研究进展
农业科学N O N G Y E KE XU E 植物转录因子MYB基因家族研究进展扬州大学动物科学与技术学院曹翔彭贤瑞范吉标摘要:转录因子是响应环境胁迫,即干旱、盐分和寒冷等植物信号传导途径的主要调节剂,MYB是植物最大转录因子家族之一,MYB转录因子亚家族特定于植物界。
综述提供了MYB基因家族在植物中的最新功能调控研究进展,以了解植物中MYB转录因子的调控机制,为植物分子育种研究提供新思路。
关键词:转录因子;MYB;基因家族;研究进展转录因子(TF)是控制所有生物基因表达的重要调节因子,在植物发育、细胞周期、细胞信号和逆境反应中发挥重要作用。
TF通过与目的基因的远端和局部顺式元件结合来调控基因表达,其中与基因组特征、DNA结构和TF相互作用而行使功能。
目前有各种针对不同作物的转录因子数据库,如,植物转录因子数据库、草转录因子数据库等,已发现的主要的TF家族有WRKY、MYB、NAC和AP2/ERF,是与不同逆境相关的各种基因的重要调节因子,是提高植物对不同逆境刺激抗性的基因工程的研究热点。
根据植物的TF数据库,在水稻、大麦等许多植物中已报道了大量的转录因子。
到目前为止,新的转录因子正在继续被发现,研究的植物品种也在增多。
MYB转录因子家族是一类含有高度保守的DNA结合域,由5052个氮基酸为一个重复组成的高度保守的肽段,大多数MYB蛋白在N端含有一段氨基酸残基组成的MYB结构域,根据其蛋白重复结构域数量,可分为4R-MYB、3R-MYB、1R-MYB(MYB-related)、R2R3-MYB等4类,植物中绝大多数MYB是R2R3-MYB转录因子[1]。
R2R3-MYB型转录因子,具有两个与DNA结合的成骨细胞相关的(MYB)结构域重复序列,是一组关键的调控因子,是响应环境胁迫的重要调节因子,控制着植物不同的发育过程和逆境耐受性。
第一个植物MYB转录因子是1987年从玉米中克隆到的ZmMYBC1,研究发现,ZmMYBC1主要参与玉米花青素的合成。
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综 述R evie w2002201215收到,2002201228接受。
国家重点基础研究发展规划项目(973项目G 1999011604)资助。
3联系人,E 2mail :zywang @ ,Tel :02126404209024423。
植物MYB 类转录因子研究进展陈 俊 王宗阳3(中国科学院上海植物生理研究所,上海200032)摘要:植物M Y B 转录因子以含有保守的M Y B 结构域为共同特征,广泛参与植物发育和代谢的调节。
含单一M Y B 结构域的M Y B 转录因子在维持染色体结构和转录调节上发挥着重要作用,是M Y B 转录因子家族中较为特殊的一类。
含两个M Y B 结构域的M Y B 转录因子成员众多,在植物体内主要参与次生代谢的调节和控制细胞的形态发生。
含3个M Y B 结构域的M Y B 蛋白与c 2M Y B 蛋白高度同源,可能在调节细胞周期中起作用。
关键词:M Y B 结构域,M Y B 转录因子,组合调控学科分类号:Q74 随着多种模式生物基因组计划的完成,如何从这些浩如烟海的DNA 序列中揭示基因的功能以及它们有序的时空表达,已成为后基因组时代的重要课题。
人类基因组计划的完成显示人类只有30000~50000个基因,生命体是如何以如此少的基因完成如此复杂的生命活动的呢?很重要的一点在于基因的表达调控,使得每一个基因能适时、适地、适量地表达,并且使得某些基因可以产生多种功能各异的蛋白质。
真核基因的表达随细胞内外环境的改变而在不同层次上受到精确调控,如染色体DNA 水平、转录水平及转录后水平的调控等。
而转录水平的调控发生在基因表达的初期阶段,是很多基因表达调控的主要方式。
转录水平的调控指一类称为转录因子(有时又称反式作用因子)的蛋白质特异结合到靶基因调控区的顺式作用元件上,或调节基因表达的强度,或应答激素刺激和外界环境胁迫,或控制靶基因的时空特异性表达。
转录因子通常是一种模块化的蛋白,一般由几个独立的功能域组成,包括DNA 结合功能域,转录激活功能域,蛋白2蛋白相互作用功能域,信号分子结合功能域,核定位信号区等。
根据DNA 结合功能域的结构,转录因子可分为以下几类:bHL H (碱性螺旋2环2螺旋)、bZIP (碱性亮氨酸拉链)、homeodomain 蛋白、MADS 2box 蛋白、zinc 2finger 蛋白、Myb 蛋白、Ap2/EREBP 蛋白、HSF 蛋白、HM G蛋白和A T hook 蛋白等(Schwechheimer 和Bevan 1998)。
本文试以植物中数量最多、功能最多样化的M Y B 类转录因子为例,对该类转录因子的研究历史和现状作一简单介绍。
阐述了M Y B 转录因子的结构、功能和进化,并举例说明M Y B 类转录因子如何与其它转录因子家族成员相互作用,通过组合调控(combinatorial control )的方式实现对靶基因的精密调控。
1 MYB 类转录因子M Y B 类转录因子家族是指含有M Y B 结构域的一类转录因子。
M Y B 结构域是一段约51~52个氨基酸的肽段,包含一系列高度保守的氨基酸残基和间隔序列(图1)。
首先是每隔约18个氨基酸规则间隔的色氨酸(W )残基,它们参与空间结构中疏水核心的形成。
有时色氨酸残基会被某个芳香族氨基酸或疏水氨基酸所取代,尤其是在植物R2R32M Y B 转录因子中,R3M Y B 结构域的第一个色氨酸经常被亮氨酸、异亮氨酸或苯丙氨酸所取代。
其次,在每个保守的色氨酸前后都存在一些高度保守的氨基酸,例如在第一个色氨酸的C 2末端通常是一簇酸性氨基酸(图1)。
正是上述这些保守的氨基酸残基使M Y B 结构域折叠成螺旋2螺旋2转角2螺旋(helix 2helix 2turn 2helix )结构。
1982年K lempnauer 等在禽成髓细胞瘤病毒(avian myeloblastosis virus )中鉴定出一个能直接导致急性成髓细胞白血病(acute myeloblastic leukemia )的癌基因,称为v 2myb ,不久发现在正常动物细胞中也存在相应的原癌基因c 2myb ,随后研究结果表明v 2M Y B ,c 2M Y B 蛋白都定位在细胞核中,与核基质和染色质紧密相连,而且都具有DNA18植物生理与分子生物学学报,J ournal of Plant Physiology and Molecular Biology 2002,28(2):81-88结合活性和转录调节功能(Biedenkapp等1988, Luscher和Eisenman1990)。
Ogata等(1994)通过核磁共振(NMR)的方法最终确定了c2M Y B蛋白结合DNA时的空间结构,明确表明c2M Y B蛋白的3个M Y B结构域都能形成类似于螺旋2转角2螺旋的结构,其中R2和R3负责特异结合DNA序列。
至此,尽管M Y B蛋白不具备当时已知的转录因子类型,如bHL H、bZIP和zinc finger等的结构花式(motif),然而对c2M Y B蛋白和v2M Y B蛋白的研究结果都显示,M Y B类蛋白都含有由M Y B结构域组成的DNA结合功能域为共同特征,它们自成一类新的转录因子家族。
图1 M Y B转录因子的DNA结合功能域Fig.1 DNA2binding domain of M Y B transcription factorsDNA binding domains of M Y B transcription factors are aligned by Pileup program from GCG software package.The protein se2 quences included in this comparison are from human,c2M Y B;A rabidopsis,Atpc2myb1,Atpcmyb2,At G L1;maize,IBP1,Zm2 M Y BC1;Oryz a sativa,RTBP1.Among them,IBP1and RTBP1contain only a single M Y B domain;At G L1and ZmM Y BC1 are R2R32M Y B proteins;Atpc2myb1,Atpcmyb2and c2M Y B belong to R1R2R32M Y B subfamily.The regularly spaced W residues and I,F residues often re placing the W residue in R3M Y B domain are in bold.The C ys residue involved in redox poten2 tial regulation is italic and in bold.The DNA recognition helix of IBP1,RTBP1are boxed. 1982年以来,人们不断地从人、小鼠、酵母、玉米、拟南芥、金鱼草、水稻和棉花中鉴定出与c2M Y B蛋白同源的蛋白。
它们的共同特征是N2端区域高度保守,通常由2个M Y B结构域(R2,R3)或3个M Y B结构域(R1,R2和R3)构成。
植物物种中的M Y B蛋白与c2M Y B蛋白不同,大都只含有两个M Y B结构域,这极大地引起了人们对植物中M Y B类转录因子的研究兴趣。
自从Paz2Ares等从单子叶植物玉米中克隆出与色素合成有关的Zm M YB C1基因后,又从很多植物中分离到功能各异的m yb基因(Rabinowicz等1999)。
Romero等(1998)的研究指出拟南芥中至少有80个表达的m yb基因。
Rabinowicz等(1999)发现玉米中至少也含有80个表达的m yb基因。
除含两个M Y B结构域的M Y B蛋白以外,在植物中还发现了含一个M Y B结构域的M Y B蛋白以及含3个M Y B结构域的M Y B蛋白。
Stmyb1是植物中鉴定的第一个只含一个M Y B结构域的M Y B蛋白,随后相继发现IBP1、BPF1、CCA1和L H Y等只含有一个M Y B结构域的M Y B蛋白(Bilaud等1996)。
植物中含3个M Y B结构域的M Y B蛋白的发现,更是极大地丰富了人们对植物M Y B蛋白的认识(Kranz等2000)。
植物中含单个M Y B结构域和含3个M Y B结构域的M Y B蛋白与主要的含两个M Y B结构域的M Y B蛋白共同构成了植物M Y B类转录因子家族,并与动物等其它物种中的M Y B蛋白形成了一类古老而且高度保守的转录因子超家族。
2 植物MYB类转录因子家族植物M Y B类转录因子以含有M Y B结构域为共同特征,根据所含M Y B结构域的数目,植物中的M Y B类转录因子可简单分成3个亚类:只含一28植物生理与分子生物学学报 28卷个M Y B 结构的M Y B 蛋白亚类成员可能是一类重要的端粒结合蛋白,在维持染色体结构的完整性和调节基因转录上起重要作用(Bilaud 等1996);R2R3亚类成员含有两个M Y B 结构域,对应于动物中c 2M Y B 蛋白的R2和R3M Y B 结构域。
该类成员数目众多,它们或参与次生代谢的调节,或控制细胞的分化,或应答激素刺激和外界环境胁迫以及抵抗病原菌的侵害;R1R2R3亚类成员含有3个M Y B 结构域,与动物、真菌中的R1R2R32M Y B 蛋白高度同源,主要参与细胞周期的控制和调节细胞的分化(Ito 2000)。
表1列举了已知的植物M Y B 类转录因子及其可能的生物学功能。
2.1 植物中只含一个MYB 结构域的MYB 蛋白植物中发现的这类M Y B 蛋白,如表1所示,有L H Y 、CCA1、CPC 和R TBP1(Yu 等2000)等。
它们在结构上都只含一个M Y B 结构域,可存在于肽链的N 2端,C 2端或中间。
由于无论是R1R2R32M Y B 蛋白还是R2R32M Y B 蛋白,它们的R2、R3M Y B 结构域都是特异结合DNA 序列所必需,而只含一个M Y B 结构的M Y B 蛋白很可能以不同的方式结合DNA 序列,如水稻R TBP1蛋白正是通过形成同源二聚体而结合到端粒序列上(Yu 等2000)。
根据是否具有一种称为端粒盒(TELOBOX )的结构,可以把这类M Y B 蛋白分成两个小类。
第一小类成员都含有端粒盒结构,如IBP1、R TBP1、BPF1和PcM Y B1蛋白等(表1)。