药物设计学简答题

简答题

11、理想的药物靶点应具有哪些特点？

（1）药物作用于靶点对疾病治疗的有效性。

（2）中靶后引起的毒副作用反应小。

（3）便于筛选药物的靶点成药性

13、骨架迁越及在药物设计中的应用？

骨架迁越：由苗头或先导化合物分子产生新结构的分子，保留原有的生物活性，通过结构骨架变换，连接适宜的药效团，产生新结构类型的药物，骨架迁越涉及丰富的药物化学内涵和技巧。

应用：（1）将化合物转化成为类药分子-----改善药物动力学性质；

刚-柔骨架的变换，改善药代性质；亲脂-极性骨架变换，改善溶解性和分配性；新的骨架若参与同受体结合，可改善与受体的亲和力；骨架适中的策略如果过小的骨架如苯环缺乏有用信息；过于复杂的骨架带来成本过高问题。

（2）创制具有自主知识产权的新药或IP产品--破专利，Me-too，Me-better；

14、前药设计应注意哪些原则？

（1）在母体药物最适宜功能基处键合载体分子。

（2）前药应无活性或活性较低，转运基团应无活性。

（3）明确前药在体内的活化机制。

（4）转化为母体药物的速度应该是快速动力学过程，并降低母体药物的直接代谢，以保证母体药物在靶点有足够的浓度。

（5）应容易合成与纯化，最好是一步反应，且载体廉价易得。

1、简述基于靶点结构的药物设计的基本流程。

定义活性位点→产生配体分子→配体分子打分→合成及活性测定→先导物

2、根据设计来源不同软药可以分为几种类型？软药和前药的区别有几个方面？

软类似物；活化的软类似物；用控释内源物设计天然软药；活性代谢物；无活性代谢物等类型。区别：①先导物不一样，前药是以原药为先导物的，软药的先导物既可以是原药也可以是原药的代谢物；②作用方式不一样，前药在体外无活性，只有到达靶点释放出原药才有活性，而软药在体外是有活性的，它们到达靶点发挥治疗作用后一步代谢失活。

3、简述先导物发现的可能途径。

①筛选途径：从众多的化合物中运用生物筛选模型挑选有生物活性的先导物。现代筛

选途径涉及组合化学、组合库和高通量高内含筛选。

②合理药物设计：基于靶点和配体的作用机制、三维结构和识别过程以及与药物理化

性质相关的体内过程，进行有的放矢的药物设计。

4、药物作用的靶点的定义及理想的药物靶点特点是什么？

靶点：也称靶标，指具有重要生理或病理功能，能够与药物相结合并产生药理作用的生物大分子及其特定的结构位点，这些生物大分子主要是蛋白质，有一些是核酸或其他物质。特点：①药物作用于靶点对疾病治疗的有效性②药物作用于靶点后引起的毒副反应小③便于筛选药物靶点的成药性。

5、简述药效基团的虚拟筛选一般流程。

小分子准备→产生构象→由活性分子生成药效基团的假设→优化、修改药效基团的假设→生成药效团模型→数据库搜寻（虚拟筛选）

6、Lipinski的类药五倍律是什么？什么情况下该方法不适合预测药物的类药性？

①相对分子质量＜500（5×100）；

②氢键供体数＜5个（5×1）；

③氢键受体数＜10个（5×2）；

④lgP＜5（若使用ClgP）或＜4.15（若使用MlgP）(5×1)

⑤分子内可旋转键数RB≤8或分子中环的数目rings≤4

⑥化合物极性分子表面积PSA≤120A2

当违反上述任意两个或多个规则时，化合物出现口服生物利用度差或代谢分布差的可能性就很大（大于百分之九十）对于抗生素、抗真菌药、维生素及强心苷等具有主动转运特征的药物不适用

2、药物设计分三个不同的筛选途径是（基于功能途径、基于症状途径、基于机制途径）。18．举例说明软药设计原理

设计原理为：

(1)以某种药物的已知无活性的代谢物作为先导物。

(2)将这种代谢物进行结构修饰，以获得无活性代谢物的结构类似物。

(3)新的软类似物的结构设计应是经一步代谢就能产生原来无活性的代谢物，而不经过有毒中间体阶段。

(4)对活化阶段的分子进行修饰，控制所设计的软药的转运、结合的性质以及代谢速率和药动学行为。

泼尼松龙等在体内可发生17位的羟乙酮基氧化成无活性羧基，它是设计软药的良好先导物。将泼尼松龙酸与氯代甲醇成酯得软药氯替泼诺，则成为较少副作用的软药，用作滴眼剂，治疗炎性和过敏性眼疾患。氯替泼诺吸收入血液循环后，迅速代谢成预期无活性的代谢物，自尿和胆汁排出。治疗指数与氢化可的松比提高20倍。

19．举例说明生物电子等原理。

生物电子等排（bio-isosterism）：当分子或基团的外层电子相似、或电子密度有相似的分布，分子的大小或形状相似，均可认为是生物电子等排体，它们的理化性质可能有较大的差异，但对同一受体发生相互作用，产生大致相似或相关的生物效应。

双氢麦司昔摩和硫代麦司昔摩都是γ－氨基丁酸的环状类似物。环中的C＝N部分是GABA 分子中C＝O的生物电子等排体，环中的S是环中O的等排体。两者在GABA-A受体上都有很强的激动作用。

神经递质γ-氨基丁酸具有降低血压,安神,促进脑部血流,增进脑活力,健肝利肾,改善更年期综合症等作用.

25．设计“Me Too 药物”主要有哪些策略和方法？

现在所说的me too药物，通常是指基于已经发现的药物的结构骨架，通过取代基团或侧链的变化，使得活性、生物利用度等提高或毒性降低，并绕开专利的药物。本质上是一类化学创新药，但与全新结构的新化学实体（new chemical entity，NCE）相比，创新性略低。Me Too 药物的研究设计中，使用的主要技术手段多为生物电子等排原理。一般可以从以下几个方面进行Me Too药物的设计。

1．经常进行知识的追踪与更新，关注新出现的突破性新药，运用生物电子等排等理论，对新出现的化合物进行结构修饰和改造，希望以此能找到作用机制形同、相似甚至

相反的新化学实体，用于疾病的治疗。

2．在追踪新药的过程中，如发现尚无专利保护的NCE，要尽快进行结构改造和修饰，若能找到活性更优的化合物，要尽快申请专利，形成自己的知识产权保护。