第十三章 微生物的系统发育及分类鉴定

第十三章.微生物的分类和鉴定
Chapter 13 Microbial Taxonomy
第一节
通用分类单元
一、种以上的系统分类单元
（一）七级分类单元：
界、门、纲、目、科、属、种。
（二）种的概念： 是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、 与同属内的其他物种有明显差异的一大群菌株 的总称。以一典型菌株为模式种。
第一节
通用分类单元
二、学名（另有俗名）
(一)双名法(binominal nomenclature) (二)三名法(trinominal nomenclature)
三、亚种以下的几个分类名词
亚种（subspecies,subsp,ssp）、变种 (variety)、型(form)、菌株(strain)
3、rRNA寡核苷酸编目分析
4、微生物全基因序列测定
二、微生物分类鉴定中的现代方法
（二）细胞化学成分用作鉴定指标
1、细胞化学成分：肽聚糖肽尾第三位氨基酸； 肽桥结构；与临近肽尾交联的位置。 2、全细胞水解液的糖型：如放线菌可分四种类型。
3、磷酸类脂成分的分析：不同属，有所不同。
（三）ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ值分类法（统计分类法）
一、Berggey氏原核生物分类系统纲要
1、《伯杰氏手册》简介
2、《系统手册》提要
古生菌界：2门、5组、8纲、11目、17科、 63属、
208个种。
细 菌 界 ： 1 6 门 、 2 6 组 、 2 7 纲 、 6 2 目 、 163科、814属、4727个种。
二、菌物分类系统纲要（《安•贝氏菌物词典》）
第二节 微生物在生物界的地位
一、生物的界级分类学说
两界、 六界、 三界、 四界、 五界
三总界五界系统
二、三域学说及其发展

三域：细菌域、古生菌域、真核生物域 内共生假说： 古生菌细胞吞噬a朊细菌和蓝细菌，发生内共生， 进化成线粒体和叶绿体，宿主成了个类真核生物。
第三节 各大类微生物的分类系统纲要
真核生物域：原生动物界，假菌界，真菌界。
第四节 微生物分类鉴定的方法
一、微生物分类鉴定中的经典方法
指标：形态；生理生化反应；生态特性；生活史； 血清学反应；噬菌体敏感性。
二、微生物分类鉴定中的现代方法
（一）通过核酸分析鉴定微生物遗传型 1、DNA碱基比例的测定 2、核酸分子杂交法 用人工方法对两条不同来源的单链核酸进行复性（退火），以 构建新的杂合双链核酸，测定核酸分子同源程度和不同物种间亲缘 关系。