常用大肠杆菌 (K-12株来源) 的基因型
2023届陕西省高三第一次模拟考试理科综生物试卷(含解析)
2023届陕西省高三第一次模拟考试理科综生物试卷学校:___________姓名：___________班级：___________一、单选题1．茶叶生产在中国已有3000多年的历史，其中信阳毛尖以“细、圆、光、直、多白毫、香高、味浓、汤色绿”的独特风格，盛名传播国内外。
下列关于茶叶的说法，错误的是（）A．采摘的新鲜茶叶的细胞中含量最高的化合物是H2OB．茶叶和人体所含元素种类大致相同，但含量有差异C．制好的成品茶相比新鲜茶叶结合水/自由水的比值低D．新鲜茶叶的细胞内含量最多的有机物化合物是蛋白质2．甜菜素是一种水溶性含氮色素，因最早发现于甜菜根中而得名，酪氨酸酶是甜菜素合成的关键酶，下列图示为有关酪氨酸酶活性的实验研究结果，相关分析正确的是（）A．pH在4.5时，酪氨酸活性很低，后随着pH升高酶的活性先上升后下降B．B组实验时应在最适温度和最适pH条件下进行C．由B组实验可知，Cu2+提高酪氨酸酶活性的最适浓度为0.01mmol/LD．甜菜素可在细胞液中积累，其在细胞液中的积累不利于植物细胞的吸水3．金鱼能在严重缺氧的环境中生存若干天，其肌细胞和其他组织细胞中无氧呼吸的产物不同。
如图表示金鱼在缺氧状态下，细胞中的部分代谢途径。
下列相关叙述错误的是（）A．过程①不需要O2的参与，产生的物质X是丙酮酸，其由3种元素组成B．过程①有能量释放，释放的能量大部分用于合成ATPC．过程②④无氧呼吸产物不同，但在细胞内反应的场所相同D．在肌细胞中将乳酸经③②途径转化成酒精并排出体外，有利于防止酸中毒4．控制小鼠毛色的灰色基因既可以突变成黄色基因，也可以突变成黑色基因，而且基因突变的方向和环境没有明确的因果关系。
这说明了基因突变具有（）A．不定向性B．普遍性C．低频性D．随机性5．2021 年末，新发现的新冠病毒变异毒株奥密克戎比原始毒株的传染力更高，可通过咽拭子检测新冠病毒的感染者，下列叙述正确的是（）A．只有细胞内的核酸才是携带遗传信息的遗传物质B．与原始毒株相比，变异毒株的 RNA 由一条链变为两条链C．咽拭子检测新冠病毒利用了核酸分子具有特异性的原理D．在唾液中能检测到新冠病毒，说明该病毒能在细胞外繁殖6．下列有关生物学实验的描述正确的是（）A．斐林试剂和双缩脲试剂都为NaOH和CuSO4，但浓度和使用方法均无相同之处B．在“土壤中小动物类群丰富度的研究”中，采集的小动物可放入70%的酒精中，也可以放入试管中C．在“性状分离比的模拟”实验中，将抓取的彩球记录并放回原桶后即可进行下一次抓取，如此重复50~100次D．在“探索生长素类似物促进插条生根的最适浓度”实验中，可利用沾蘸法把插条基部在浓度较低的药液中蘸一下（约5s）后扦插，最好在遮阴、湿度高的环境中处理二、综合题7．粮食问题始终是全人类所面临的基本问题。
大肠杆菌基因工程菌常用类型
1、大肠杆菌DH5a菌株DH5a是世界上最常用的基因工程菌株之一。
由于DH5α是DNA酶缺陷型菌株，有利于基因克隆，保存质粒，但该菌株的蛋白酶没有缺陷，表达的蛋白容易被降解，因此通常不作为表达菌株。
E.coli DH5a在使用pUC系列质粒载体转化时，可与载体编码的β-半乳糖苷酶氨基端实现α-互补。
可用于蓝白斑筛选鉴别重组菌株。
基因型：F-，φ80dlacZΔM15，Δ(lacZYA-argF)U169，deoR，recA1，endA1，hsdR17(rk-，mk+)，phoA，supE44，λ-，thi-1，gyrA96，relA12、大肠杆菌BL21(DE3) 菌株该菌株用于高效表达克隆于含有噬菌体T7启动子的表达载体（如pET系列）的基因。
T7噬菌体RNA聚合酶位于λ噬菌体DE3区，该区整合于BL21的染色体上。
该菌适合表达非毒性蛋白。
基因型：F-，ompT，hsdS（rBB-mB－），gal，dcm（DE3）3、大肠杆菌BL21(DE3) pLysS菌株该菌株含有质粒pLysS，因此具有氯霉素抗性。
PLysS含有表达T7溶菌酶的基因，能够降低目的基因的背景表达水平，但不干扰目的蛋白的表达。
该菌适合表达毒性蛋白和非毒性蛋白。
基因型：F-，ompT hsdS（rBB-mB－），gal，dcm（DE3，pLysS ，Camr4、大肠杆菌JM109菌株该菌株在使用pUC系列质粒载体进行DNA转化或用M13 phage载体进行转染时，由于载体DNA产生的LacZa多肽和JM09编码的LacZΔM15进行α-互补，从而显示β-半乳糖苷酶活性，由此很容易鉴别重组体菌株。
基因型：recA1，endA1，gyrA96，thi－1，hsdR17，supE44，relA1，Δ（lac－proAB）/F’[traD36，proAB+，lacIq，lacZΔM15]5、大肠杆菌TOP10菌株该菌株适用于高效的DNA克隆和质粒扩增，能保证高拷贝质粒的稳定遗传。
大肠杆菌基因组
大肠杆菌基因组
大肠杆菌（Escherichia coli）是一种常见的革兰氏阴性菌，广泛存在于自然界中，是人和动物肠道的正常菌群之一。
以下是大肠杆菌的基因组特点：
1. 基因组大小：大肠杆菌的基因组长度约为4.6-5.5百万个碱基对，包含了约4,000-5,500个基因。
2. 基因组结构：大肠杆菌的基因组呈圆形双链DNA分子，有一个单独的起始点和终止点。
3. GC含量：大肠杆菌的基因组GC含量约为50%，属于高GC菌株。
4. 基因功能：大肠杆菌的基因组包含了许多与代谢、运输、感应、合成等生命活动相关的基因，其中约1/3的基因没有已知的生物学功能。
5. 基因编码：大肠杆菌的基因组可以编码出各种蛋白质、RNA 和其他重要分子，如rRNA、tRNA、mRNA等。
6. 基因组变异：大肠杆菌基因组在不同的菌株之间存在着一定程度的变异，包括插入序列、转座子、基因重排等。
大肠杆菌的基因组研究对于了解其代谢、生长和适应环境能力等方面具有重要意义。
目前已经对大肠杆菌进行了多次基因组测序，并建立了完整的大肠杆菌K-12 MG1655基因组数据库，为大肠杆菌的进一步研究提供了强有力的工具。
细菌菌株基因型及基因符号说明
大肠杆菌基因型及遗传符号说明前言：实验室的一般大肠杆菌拥有4288条基因，每条基因的长度约为950bp，基因间的平均间隔为118bp（基因Ⅷ）。
E.coli基因组中还包含有许多插入序列，如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段，这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的，由此表明了基因组具有它的可塑造性。
利用大肠杆菌基因组的这种特性对其进行改造，使其中的某些基因发生突变或缺失，从而给大肠杆菌带来可以观察到的变化，这种能观察到的特征叫做大肠杆菌的表现型(Phenotype)，把引起这种变化的基因构成叫做大肠杆菌的基因型（Genotype）。
具有不同基因型的菌株表现出不同的特性。
分子克隆中常用的大肠杆菌及其遗传标记按Demerec等1966年提出的命名原则，采用的菌株所有的基因都假定处于野生型状态，除非在基因型上另外注明。
大肠杆菌基因型的表示方法（Demerec, et, al. 1966）：一、一般规则：1、根据基因产物或其作用产物的英文名称的第一个字母缩写成3个小写斜体字母来表示。
例如：DNA Adenine Methylase→dam。
2、不同的基因座，其中任何一个突变所产生的表型变化可能相同，其表示方法是在3个小写斜体字母后加上一个斜体大写字母来表示区别。
例如：Recombination→recA、recB、recC。
3、突变位点应通过在突变基因符号后加不同数字表示。
如supE44（sup基因座E的44位突变）。
如果不知道几个等位基因中哪一/几个发生了功能性突变，则用连字符“-”代替大写字母，如trp-31。
4、细菌的基因型中应该包含关于其携带的质粒或附加体的的信息。
这些符号包括菌株携带的质粒或附加体、质粒或附加体上的突变基因座和突变位点。
其基因符号应与基因座的表示符号明显区别，符号的第一个字母大写、不斜体并位于括号内；质粒或附加体上的突变基因座和突变位点的基因符号的表示方法与染色体上突变基因座、突变位点的符号相同。
大肠杆菌的基因型-概述说明以及解释
大肠杆菌的基因型-概述说明以及解释1.引言1.1 概述大肠杆菌是一种常见的革兰氏阴性杆菌，属于肠道菌群中的重要成员。
它在自然界和人体内广泛存在，并且具有广泛的基因型多样性。
这使得大肠杆菌成为了微生物遗传学和进化生物学领域的研究模型。
在大肠杆菌中，基因型是指该菌株拥有的基因组合和基因的分布情况。
大肠杆菌的基因型可以通过不同的方法进行分类和鉴定。
目前主要的分类方法包括单核苷酸多态性分析、基因片段分析和全基因组测序等。
通过这些方法，我们可以更全面地了解大肠杆菌的基因型组成和种群结构。
大肠杆菌的基因型在其功能和特点方面具有重要意义。
大肠杆菌是一种典型的益生菌，它在人体内具有多种有益作用，包括帮助消化吸收、维持肠道稳定性和参与免疫调节等。
不同基因型的大肠杆菌可能具有不同的功能特点，比如某些基因型可能携带耐药基因或致病因子，导致感染和疾病的发生。
因此，对大肠杆菌基因型的研究有助于我们深入了解其功能机制和生态适应能力。
总之，大肠杆菌作为一种常见的菌株，其基因型具有多样性和重要性。
通过研究大肠杆菌的基因型，我们可以深入探索其功能特点和生态适应能力，进一步促进微生物遗传学和进化生物学的研究。
未来，我们可以通过结合多样的研究方法和技术，进一步挖掘和解析大肠杆菌基因型的奥秘，并探索其在人体健康和疾病中的作用。
文章结构是指文章部分之间的逻辑关系和组织，它有助于读者理解文章的内容和思路。
本文的结构如下：1. 引言1.1 概述1.2 文章结构1.3 目的2. 正文2.1 大肠杆菌的基因型分类2.2 大肠杆菌基因型的功能和特点3. 结论3.1 大肠杆菌基因型的重要性3.2 未来研究的方向文章结构部分是为了描述本文的组织结构，它有助于读者了解文章的内容安排和逻辑关系。
在本文中，我们首先介绍引言部分，包括概述、文章结构和目的。
在概述中，我们简要介绍了大肠杆菌的基因型。
在文章结构中，我们明确了本文的结构和章节安排，帮助读者理解文章的整体框架。
细菌基因型及其基因符号1102
大肠杆菌基因型及遗传符号说明前言：实验室的一般大肠杆菌拥有4288条基因，每条基因的长度约为950bp，基因间的平均间隔为118bp（基因Ⅷ）。
E.coli基因组中还包含有许多插入序列，如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段，这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的，由此表明了基因组具有它的可塑造性。
利用大肠杆菌基因组的这种特性对其进行改造，使其中的某些基因发生突变或缺失，从而给大肠杆菌带来可以观察到的变化，这种能观察到的特征叫做大肠杆菌的表现型(Phenotype)，把引起这种变化的基因构成叫做大肠杆菌的基因型（Genotype）。
具有不同基因型的菌株表现出不同的特性。
分子克隆中常用的大肠杆菌及其遗传标记按Demerec等1966年提出的命名原则，采用的菌株所有的基因都假定处于野生型状态，除非在基因型上另外注明。
大肠杆菌基因型的表示方法（Demerec, et, al. 1966）：一、一般规则：1、根据基因产物或其作用产物的英文名称的第一个字母缩写成3个小写斜体字母来表示。
例如：DNA Adenine Methylase→dam。
2、不同的基因座，其中任何一个突变所产生的表型变化可能相同，其表示方法是在3个小写斜体字母后加上一个斜体大写字母来表示区别。
例如：Recombination→recA、recB、recC。
3、突变位点应通过在突变基因符号后加不同数字表示。
如supE44（sup基因座E的44位突变）。
如果不知道几个等位基因中哪一/几个发生了功能性突变，则用连字符“-”代替大写字母，如trp-31。
4、细菌的基因型中应该包含关于其携带的质粒或附加体的的信息。
这些符号包括菌株携带的质粒或附加体、质粒或附加体上的突变基因座和突变位点。
其基因符号应与基因座的表示符号明显区别，符号的第一个字母大写、不斜体并位于括号内；质粒或附加体上的突变基因座和突变位点的基因符号的表示方法与染色体上突变基因座、突变位点的符号相同。
大肠杆菌基因型说明
大肠杆菌基因型及遗传符号说明前言：实验室的一般大肠杆菌拥有4288条基因，每条基因的长度约为950bp，基因间的平均间隔为118bp（基因Ⅷ）。
E.coli基因组中还包含有许多插入序列，如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段，这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的，由此表明了基因组具有它的可塑造性。
利用大肠杆菌基因组的这种特性对其进行改造，使其中的某些基因发生突变或缺失，从而给大肠杆菌带来可以观察到的变化，这种能观察到的特征叫做大肠杆菌的表现型(Phenotype)，把引起这种变化的基因构成叫做大肠杆菌的基因型（Genotype）。
具有不同基因型的菌株表现出不同的特性。
分子克隆中常用的大肠杆菌及其遗传标记按Demerec等1966年提出的命名原则，采用的菌株所有的基因都假定处于野生型状态，除非在基因型上另外注明。
大肠杆菌基因型的表示方法（Demerec, et, al. 1966）：一、一般规则：1、根据基因产物或其作用产物的英文名称的第一个字母缩写成3个小写斜体字母来表示。
例如：DNA Adenine Methylase→dam。
2、不同的基因座，其中任何一个突变所产生的表型变化可能相同，其表示方法是在3个小写斜体字母后加上一个斜体大写字母来表示区别。
例如：Recombination→recA、recB、recC。
3、突变位点应通过在突变基因符号后加不同数字表示。
如supE44（sup基因座E的44位突变）。
如果不知道几个等位基因中哪一/几个发生了功能性突变，则用连字符“-”代替大写字母，如trp-31。
4、细菌的基因型中应该包含关于其携带的质粒或附加体的的信息。
这些符号包括菌株携带的质粒或附加体、质粒或附加体上的突变基因座和突变位点。
其基因符号应与基因座的表示符号明显区别，符号的第一个字母大写、不斜体并位于括号内；质粒或附加体上的突变基因座和突变位点的基因符号的表示方法与染色体上突变基因座、突变位点的符号相同。
常用大肠杆菌感受态的区别
常用大肠杆菌感受态JM109，DH5a，BL21等的区别1：DH5a菌株DH5a是一种常用于质粒克隆的菌株。
E.coli DH5a在使用pUC系列质粒载体转化时，可与载体编码的β－半乳糖苷酶氨基端实现α－互补。
可用于蓝白斑筛选鉴别重组菌株。
基因型：F-，φ80dla cZΔM15，Δ(lacZYA-argF)U169，deoR，recA1，endA1，hsdR17(rk-，mk+)，phoA，supE44，λ-，thi-1，gyrA96，relA12：BL21(DE3) 菌株该菌株用于高效表达克隆于含有噬菌体T7启动子的表达载体（如pET系列）的基因。
T7噬菌体R NA聚合酶位于λ噬菌体DE3区，该区整合于B L21的染色体上。
该菌适合表达非毒性蛋白。
基因型：F-，ompT，hsdS（rBB-mB－），gal，dcm（DE3）3：BL21(DE3) pLysS菌株该菌株含有质粒pLys S，因此具有氯霉素抗性。
PLysS含有表达T7溶菌酶的基因，能够降低目的基因的背景表达水平，但不干扰目的蛋白的表达。
该菌适合表达毒性蛋白和非毒性蛋白。
基因型：F-，ompT hsdS（rBB-mB－），gal，dcm（DE3，pLysS，Camr4：JM109菌株该菌株在使用pUC系列质粒载体进行DNA转化或用M13 phage载体进行转染时，由于载体DN A产生的L acZa多肽和JM09编码的L acZΔM15进行α－互补，从而显示β－半乳糖苷酶活性，由此很容易鉴别重组体菌株基因型：recA1，endA1，gyrA96，thi－1，hsdR17，supE44，relA1，Δ（lac－proAB）/F’[traD36，proAB+，lacIq，lacZΔM15]5：TOP10菌株该菌株适用于高效的DN A克隆和质粒扩增，能保证高拷贝质粒的稳定遗传。
大肠杆菌克隆菌株TOP10和DH5α的比较
大肠杆菌克隆菌株TOP10和DH5α的比较大肠杆菌克隆菌株是一种经过基因工程改造的细菌，可以用于转化和扩增外源DNA，如质粒、文库或表达载体。
不同的克隆菌株具有不同的特性，如转化效率、抗性、突变、表达水平等。
本文将比较两种常见的大肠杆菌克隆菌株：TOP10和DH5α，分析它们的优缺点和价格。
TOP10的优缺点TOP10是一种来源于大肠杆菌K12的菌株，具有mcr/mrr突变，可以克隆甲基化的DNA，如真核基因组DNA。
它的基因型如下：•Top10：F- mcrA Δ(mrr-hsdRMS-mcrBC) φ80lacZΔM15 ΔlacX74 recA1 araD139 Δ(ara-leu)7697 galU galK rpsL (StrR) endA1 nupGTOP10的优点主要有以下几个方面：•高转化效率：TOP10具有高达10^9 cfu/µg DNA的转化效率，这意味着它可以获得更多的重组菌株，提高克隆的成功率。
•低突变率：TOP10具有recA1突变，可以抑制同源重组，保持质粒的序列完整性。
•高稳定性：TOP10具有endA1突变，可以阻断内切核酸酶的表达，减少质粒DNA的降解。
它还可以在不含抗生素的培养基中维持质粒的复制。
•广泛的耐药性：TOP10具有多种抗性基因，如rpsL (StrR)、nupG等，可以使用多种抗生素进行筛选。
•高数据一致性：TOP10具有高度的基因组稳定性和质粒保留性，可以保证实验的可重复性和可靠性。
TOP10的缺点主要有以下几个方面：•高成本：TOP10的价格相对较高，可能超出一些实验室的预算。
•低表达水平：TOP10不适合用于蛋白表达，因为它缺乏一些必要的表达因子，如DE3溶原菌、T7 RNA聚合酶等。
•低兼容性：TOP10不适合用于一些特殊的载体，如含有重复序列的慢病毒载体和其它逆转录病毒载体，因为它可能会发生质粒的重组或缺失。
DH5α的优缺点DH5α是一种由Messing在1975年从大肠杆菌K12菌株中构建而成的菌株，具有mcr/mrr突变，可以克隆甲基化的DNA，如真核基因组DNA。
大肠杆菌基因型及遗传符号说明
大肠杆菌基因型及遗传符号说明前言：实验室的一般大肠杆菌拥有4288条基因，每条基因的长度约为950bp，基因间的平均间隔为118bp（基因Ⅷ）。
E.coli基因组中还包含有许多插入序列，如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段，这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的，由此表明了基因组具有它的可塑造性。
利用大肠杆菌基因组的这种特性对其进行改造，使其中的某些基因发生突变或缺失，从而给大肠杆菌带来可以观察到的变化，这种能观察到的特征叫做大肠杆菌的表现型(Phenotype)，把引起这种变化的基因构成叫做大肠杆菌的基因型（Genotype）。
具有不同基因型的菌株表现出不同的特性。
分子克隆中常用的大肠杆菌及其遗传标记按Demerec等1966年提出的命名原则，采用的菌株所有的基因都假定处于野生型状态，除非在基因型上另外注明。
大肠杆菌基因型的表示方法（Demerec, et, al. 1966）：一、一般规则：1、根据基因产物或其作用产物的英文名称的第一个字母缩写成3个小写斜体字母来表示。
例如：DNA Adenine Methylase→dam。
2、不同的基因座，其中任何一个突变所产生的表型变化可能相同，其表示方法是在3个小写斜体字母后加上一个斜体大写字母来表示区别。
例如：Recombination→recA、recB、recC。
3、突变位点应通过在突变基因符号后加不同数字表示。
如supE44（sup基因座E的44位突变）。
如果不知道几个等位基因中哪一/几个发生了功能性突变，则用连字符“-”代替大写字母，如trp-31。
4、细菌的基因型中应该包含关于其携带的质粒或附加体的的信息。
这些符号包括菌株携带的质粒或附加体、质粒或附加体上的突变基因座和突变位点。
其基因符号应与基因座的表示符号明显区别，符号的第一个字母大写、不斜体并位于括号内；质粒或附加体上的突变基因座和突变位点的基因符号的表示方法与染色体上突变基因座、突变位点的符号相同。
MG1655(de3)感受态细胞使用方法
MG1655(DE3) 感受态细胞MG1655(DE3) Chemically Competent CellHuayueyang9982 北京华越洋生物MG1655(DE3) 感受态细胞10x100ul备注:以上包装均含有Compcell Control Plasmid pUC19(0.1ng/ul)5ul(质量控制用)。
储存:-70℃保存六个月。
MG1655(DE3) 感受态细胞介绍:MG1655(DE3)感受态细胞是采用特殊工艺处理得到的感受态细胞，可用于DNA 的化学转化。
基因型为:K12 F入-ilvG-rfb-50 rph-1(DE3)MG1655(DE3) 感受态细胞特点:MG1655(DE3)菌株来源于W1485，是K12 的衍生菌株，是一种经过较少改造、比较接近于“野生型”的大肠杆菌工程菌株。
MG1655(DE3)外观形态标准，既可做为扩增大肠杆菌野生型基因的横板使用也可作为蛋白表达的宿主菌株使用;T7 RNA 聚合酶位于入噬菌体DE3 区，该区域被整合于MG1655 的染色体上，该菌株不含核酸酶endAl 突变。
操作步骤:MG1655(DE3) 感受态细胞以下操作均按无菌条件的标准进行:转化:取感受态细胞置于冰浴中(解冻1-2分钟),加入目的DNA.轻轻混匀,在冰浴中放置30 分钟。
注意:所使用DNA 体积不要超过感受态细胞悬液体积的1/10.■热激:将离心管置于42℃水浴中放置60-90 秒，然后快速将管转移到冰浴中，使细胞冷却2-3分钟,该过程不要摇动离心管。
■复苏:向每个离心管中加入500ul 无菌的SOC 或LB培养基(不含抗生素)，混匀后置于37℃180rpm摇床振荡培养45-60 分钟，目的是使质粒上相关的抗性标记基因表达，使菌体复苏。
口涂板:根据实验要求(质粒，重组连接产物转化)，吸取适量体积已转化的感受态细胞加到含相应抗生素的SOC 或LB 固体琼脂培养基上，将细胞均匀涂开。
甘露醇磷酸化酶基因的敲除对D-甘露醇合成的影响
甘露醇磷酸化酶基因的敲除对D-甘露醇合成的影响赵雅童;何光明;瓮茹茹;石爱琴;路福平;李玉【摘要】为了探究甘露醇分解利用途径对甘露醇合成的影响,在重组菌株R1(K-12/pTrc99a-mdh)的基础上,通过CRISPR/Cas9敲除E.coli PTS系统中的cmtA、cmtB、mtlA基因,阻断了E.coli K-12中甘露醇的分解途径,获得了重组菌株R3(K-12/△cmtA△cmtBmdh+)和R5(K-12/△cmtA△cmtB△mtlAmdh+).与出发菌株R1相比,R3的生长速率没有降低,而R5的生长速率明显下降.并且R5在以甘露醇为唯一碳源的培养基上已无法生长,说明cmtA、cmtB、mtlA三个基因全部敲除后,菌株已无法再利用甘露醇作为碳源进行生长.最后,构建的重组菌株R5,测得MDH酶活力为258 U/mL,用高效液相色谱对胞外产物进行检测,可检测到少量的甘露醇,为进一步探究大肠杆菌合成甘露醇的调控机制奠定基础.【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2019(035)005【总页数】7页(P118-124)【关键词】基因敲除;甘露醇;甘露醇脱氢酶;NADH【作者】赵雅童;何光明;瓮茹茹;石爱琴;路福平;李玉【作者单位】省部共建食品营养与安全国家重点实验室工业微生物教育部重点实验室天津科技大学生物工程学院,天津300457;省部共建食品营养与安全国家重点实验室工业微生物教育部重点实验室天津科技大学生物工程学院,天津300457;省部共建食品营养与安全国家重点实验室工业微生物教育部重点实验室天津科技大学生物工程学院,天津300457;省部共建食品营养与安全国家重点实验室工业微生物教育部重点实验室天津科技大学生物工程学院,天津300457;省部共建食品营养与安全国家重点实验室工业微生物教育部重点实验室天津科技大学生物工程学院,天津300457;省部共建食品营养与安全国家重点实验室工业微生物教育部重点实验室天津科技大学生物工程学院,天津300457【正文语种】中文甘露醇作为一种功能性糖醇，因其甜度和生理热量值均较低，且生理代谢不需要胰岛素等优点，可作为甜味剂供糖尿病人使用，也可防止牙齿龋变、可用作矫味剂和用于烘烤食品等［1-2］。
国家批准的菌株号
国家批准的菌株号国家批准的菌株号是指经过中国科学院微生物文化集中分发管理中心或其他相关部门正式批准并登记的微生物菌株编号。
该编号通常由两部分组成：前缀部分（以字母或数字表示菌株类型或来源）和后缀部分（以数字表示该菌株在编号体系中的序号）。
菌株是指从自然界或人工选育中获得的、具有明显特征和遗传基础的微生物单体。
菌株在微生物学研究中具有重要的作用，可用于基础科学研究、生产与应用、环境监测等领域。
国家批准的菌株号作为微生物菌株的唯一标识符，具有以下几个重要特点：1.准确性：国家批准的菌株号是由专业机构或相关部门负责管理和维护的，保证了菌株号的准确性和稳定性。
2.可追溯性：菌株号能够追溯到具体的微生物文化集中分发管理中心或相关部门，确保了菌株来源和性质的可靠性。
3.规范性：菌株号采用标准化命名法，为微生物菌株命名提供了参考和规范，避免了同一菌株出现重复命名的情况。
4.信息共享性：国家批准的菌株号提供了科学家之间信息共享的平台，为微生物学研究提供了便利。
目前，国家批准的菌株号已经广泛应用于微生物学研究的不同领域，如基础研究、生产与应用、环境监测等。
本文将介绍若干具有代表性的国家批准的菌株号。
1. 铜绿假单胞菌 ATCC 13985铜绿假单胞菌菌株 ATCC 13985 是一株可引起人和动物感染的病原菌。
该菌株编号由“ATCC”代表该菌株来自于美国 ATCC（American Type Culture Collection）菌株库，编号为“13985”。
2. 大肠杆菌 K-12 MG16553. 白腐霉 Trichoderma reesei QM6a白腐霉菌株 Trichoderma reesei QM6a 是一种被广泛应用于生产纤维素酶的工业菌株。
该菌株编号由 JCM（Japan Collection of Microorganisms）代表该菌株来自日本 JCM 菌株库，编号为“JCM 6165”。
4. 肝炎病毒 HBV AD38肝炎病毒菌株 HBV AD38 是一种常见的乙型肝炎病毒菌株。
大肠杆菌基因型解读
⼤肠杆菌基因型解读E. coli genotypesContents[hide]1 Nomenclature & Abbreviations2 Methylation Issues in E. coli3 Commonly used strains3.1 AG13.2 AB11573.3 BL213.4 BL21(AI)3.5 BL21(DE3)3.6 BL21 (DE3) pLysS3.7 BNN933.8 BNN973.9 BW26434, CGSC Strain # 76583.10 C6003.11 C600 hflA150 (Y1073, BNN102)3.12 CSH503.13 D12103.14 DB3.13.15 DH13.16 DH5α3.17 DH10B (Invitrogen)3.18 DH12S (Invitrogen)3.19 DM1 (Invitrogen)3.20 E. cloni(r) 5alpha (Lucigen)3.21 E. cloni(r) 10G (Lucigen)3.22 E. cloni(r) 10GF' (Lucigen)3.23 E. coli K12 ER2738 (NEB)3.24 ER2566 (NEB)3.25 ER2267 (NEB)3.26 HB1013.27 HMS174(DE3)3.28 High-Control(tm) BL21(DE3) (Lucigen) 3.29 High-Control(tm) 10G (Lucigen)3.30 IJ11263.31 IJ11273.32 JM833.33 JM1013.34 JM1033.35 JM1053.36 JM1063.37 JM1073.38 JM1083.39 JM1093.40 JM109(DE3)3.41 JM1103.42 JM2.3003.43 LE3923.44 Mach13.45 MC10613.46 MC41003.47 MG16553.48 OmniMAX23.49 OverExpress(tm)C41(DE3) (Lucigen)3.50 OverExpress(tm)C41(DE3)pLysS (Lucigen) 3.51 OverExpress(tm)C43(DE3) (Lucigen)3.52 OverExpress(tm)C43(DE3)pLysS (Lucigen) 3.53 Rosetta(DE3)pLysS3.54 Rosetta-gami(DE3)pLysS3.55 RR13.56 RV3083.57 SOLR (Stratagene)3.58 SS320 (Lucigen)3.59 STBL2 (Invitrogen)3.60 STBL3 (Invitrogen)3.61 STBL43.62 SURE (Stratagene)3.63 SURE2 (Stratagene)3.64 TG1 (Lucigen)3.65 TOP10 (Invitrogen)3.66 Top10F' (Invitrogen)3.67 W31103.68 XL1-Blue (Stratagene)3.69 XL1-Blue MRF' (Stratagene)3.70 XL2-Blue (Stratagene)3.71 XL2-Blue MRF' (Stratagene)3.72 XL1-Red (Stratagene)3.73 XL10-Gold (Stratagene)3.74 XL10-Gold KanR (Stratagene)4 Other genotype information sources5 ReferencesNomenclature & AbbreviationsA listed gene name means that gene carries a loss of function mutation, a Δ preceding a gene name means the gene is deleted. If a gene is not listed, it is not known to be mutated. Prophages present in wt K-12 strains (F, λ, e14, rac) are listed only if absent. E. coliB strains are naturally lon- and dcm-.F- = Does not carry the F plasmidF+ = Carries the F plasmid. The cell is able to mate with F- through conjugation.F'[ ] = Carries an F plasmid that has host chromosomal genes on it from a previous recombination event. This cell can also mate with F- through conjugation. Chromosomal genes carried in the F plasmid are listed in brackets.r B/K+/- = The (B/K) defines the strain lineage. The +/- indicates whether the strain has or hasn't got the restriction system. m B/K+/- = The (B/K) defines the strain lineage. The +/- indicates whether the strain has or hasn't got the modification (methylation) system.hsdS = Both restriction and methylation of certain sequences is deleted from the strain. If you transform DNA from such a strain into a wild type strain, it will be degraded.hsdR = For efficient transformation of cloned unmethylated DNA from PCR amplificationsINV( ) = chromosomal inversion between locations indicatedahpC = mutation to alkyl hydroperoxide reductase conferring disulfide reductase activityara-14 = cannot metabolize arabinosearaD = mutation in L-ribulose-phosphate 4-epimerase blocks arabinose metabolismcycA = mutation in alanine transporter; cannot use alanine as a carbon sourcedapD = mutation in succinyl diaminopimelate aminotransferase leads to succinate or (lysine + methionine) requirementΔ( ) = chromosomal deletion of genes between the listed genes (may include unlisted genes!)dam = adenine methylation at GATC sequences exist; high recombination efficiency; DNA repair turned ondcm = cytosine methylation at second C of CCWGG sites exist. dam & dcm are the default properties and always elided, while dam- or dcm- should be declare explicitlydeoR = regulatory gene that allows constitutive expression of deoxyribose synthesis genes; permits uptake of largeplasmids. See Hanahan D, US Patent 4,851,348. ***This has been called intoquestion, as the DH10B genome sequence revealed that it is deoR+. See Durfee08, PMID 18245285.dnaJ = one of the chaparonins inactivated; stabilizes some mutant proteinsdut1 = dUTPase activity abolished, leading to increased dUTP concentrations, allowing uracil instead of thymine incorporation in DNA. Stable U incorporation requires ung gene mutation as well. endA1 = For cleaner preparations of DNA and better results in downstream applications due to the elimination of non-specific digestion by Endonuclease I(e14) = excisable prophage like element containing mcrA gene; present in K-12 but missing in many other strainsgalE = mutations are associated with high competence, increased resistance to phage P1 infection, and 2-deoxygalactose resistance. galE mutations block the production of UDP-galactose, resulting in truncation of LPS glycans to the minimal, "inner core". The exceptional competence ofDH10B/TOP10 is thought to be a result of a reduced interference from LPS in the binding and/or uptake of transforming DNA. galE15 is a point mutation resulting in a Ser123 -> Phe conversion near the enzyme's active site. See van Die, et al. PMID 6373734, Hanahan, et al. PMID 1943786, and EcoSal ISBN 1555811647. --Dcekiert 16:56, 23 January 2008 (CST)galk = mutants cannot metabolize galactose and are resistant to 2-deoxygalactose. galK16 is anIS2 insertion ~170bp downstream of the galK start codon. See EcoSal ISBN 1555811647. --Dcekiert 16:56, 23 January 2008 (CST)galU = mutants cannot metabolize galactosegor = mutation in glutathione reductase; enhances disulphide bond formationglnV = suppression of amber (UAG) stop codons by insertion of glutamine; required for some phage growthgyrA96 = mutation in DNA gyrase; conveys nalidixic acid resistancegyrA462 = mutation in DNA gyrase; conveys resistance to ccdB colicin gene producthflA150 = protease mutation stabilizing phage cII protein; high frequency of lysogenization by λΔ(lac)X74 = Deletion of the entire lac operon as well as some flanking DNA (complete deletion is Δcod-mhpF; seeMol.Micro., 6:1335, and J.Bact., 179:2573)lacI q or lacI Q = overproduction of the lac repressor protein; -35 site in promoter upstream of lacI is mutated from GCGCAA to GTGCAAlacI Q1 = overproduction of the lac repressor protein; contains a 15 bp deletion to create optimal -35site in promoter upstream of lacIlacY = deficient in lactose transport; deletion of lactose permease (M protein)lacZΔM15 = partial deletion of the lacZ gene that allows α complementation of the β-galactosidase gene; required forblue/white selection on XGal plates. Deletes the amino portion of lacZ (aa 11-41). leuB = requires leucineΔlon = deletion of the lon proteasemalA = cannot metabolize maltosemcrA = Mutation eliminating restriction of DNA methylated at the sequence C m CGG (possiblym CG). Carried on the e14 prophage (q.v.)mcrB = Mutation eliminating restriction of DNA methylated at the sequence R m CmetB = requires methioninemetC = requires methioninemrr = Mutation eliminating restriction of DNA methylated at the sequence C m AG or G m ACmtlA = cannot metabilize mannitol(Mu) = Mu prophage present. Muδ means the phage is defective.mutS - mutation inhibits DNA repair of mismatches in unmethylated newly synthesized strands nupG = same as deoR ompT = mutation in outer membrane protein protease VII, reducing proteolysis of expressed proteins(P1) = Cell carries a P1 prophage. Cells express the P1 restriction system.(P2) = Cell carries a P2 prophage. Allows selection against Red+ Gam+ λ(φ80) = Cell carries the lambdoid prophage φ80. A defective version of this phage carryinglacZM15 deletion (as well as wild-type lacI, lacYA, and flanking sequences) is present in some strains. The φ80 attachment site is just adjacent to tonB.pLysS = contains pLysS plasmid carrying chloramphenicol resistance and phage T7 lysozyme, effective at attenuating activity of T7 RNA polymerase, for better inhibition of expression under non-induced conditions. The sequence can be found here.proA/B = requires prolinerecA1 = For reduced occurrence of unwanted recombination in cloned DNA; cells UV sensitive, deficient in DNA repair recA13 = as for recA1, but inserts less stable.recBCD = Exonuclease V; mutation in RecB or RecC reduces general recombination by a factor of 100; impaired DNA repair; UV sensitive, easier propagation of inverted repeatsrecJ Exonuclease involved in alternate recombinationrelA = relaxed phenotype; permits RNA synthesis in absence of protein synthesisrha = blocked rhamose metabolismrnc = encodes RnaseIII (rnc-14 is a common null mutant)rne = encodes RnaseE (rne-3071 is a common temperature sensitive mutant)rpsL = mutation in ribosomal protein S12 conveying streptomycin resistance; also called strA sbcBC = ExoI activity abolished; usually present in recBC strains; recombination proficient, stable inverted repeatssr1 = cannot metabolize sorbitolsupE = glnVsupF = tyrTthi = requires thiaminethyA = requires thymidineTn10 = transposon normally carrying Tetracycline resistanceTn5 = transposon normally carrying Kanamycin resistancetonA = Mutation in outer membrane protein conveying resistance to phage T1 and phage T5 traD = Mutation eliminating transfer factor; prevents transfer of F plasmidtrxB = mutation in thioredoxin reductase; enhances disulphide bond formation in the cytoplasm tsx = outer membrane protein mutation conveying resistance to phage T6 and colicin KtyrT = suppression of amber (UAG) stop codons by insertion of tyrosine; needed for some phage infection such as λgt11. ung1 = allows uracil to exist in plasmid DNAxyl-5 = blocked xylose metabolismSm R = Streptomycin resistanceMethylation Issues in E. coliType I methylation systems:E. coli K-12 restricts DNA which is not protected by adenine methylation at sitesAA*C[N6]GTGC or GCA*C[N6]GTT, encoded by the hsdRMS genes(EcoKI). Deletions in these genes removes either the restriction or methylation or both of these functions.E. coli B derivative strains contain an hsdRMS system (EcoBI) restricting and protectiing thesequence TGA*[N8]TGCT or AGCA*[N8]TCA.The mcrA gene (carried on the e14 prophage) restricts DNA which is methylated in C m CWGG or m CG sequences (methylation by the dcm gene product).The mcrBC genes restrict R m C sequences.The mrr gene product restricts adenine methylated sequences at CAG or GAC sites.E. coli methylates the adenine in GATC (and the corresponding A on the opposite strand) with thedam gene product.M.EcoKII methylates the first A at the palindromic site ATGCAT (as well as the corresponding A on the opposite strand), see (Kossykh VG (2004) J. Bact 186: 2061-2067 PMID 15028690) Note that this article has been retracted; the retraction appears to center on textual plagarism, notexperimental results. The homology to AvaIII is real. I think I believe it. tk 20:28, 9 December 2005 (EST). Rich Roberts reports: "We have tried ourselves to detect activity with this gene product and cannot detect any methyltransferase activity. In our case we used antibodies able to detect N6-methyladenine or N4 methylcytosine in DNA. The ones we have are very sensitive and should have been able to detect 5 methyl groups in the whole E. coli chromosome. Nothing was detected in an over expressing strain."For additional information see E. coli restriction-modification system and the NEB technicalinformation on methylation.Commonly used strainsAG1endA1 recA1 gyrA96 thi-1 relA1 glnV44 hsdR17(r K- m K+)AB1157thr-1, araC14, leuB6(Am), Δ(gpt-proA)62, lacY1, tsx-33, qsr'-0, glnV44(AS), galK2(Oc), LAM-, Rac-0, hisG4(Oc), rfbC1, mgl-51, rpoS396(Am), rpsL31(strR), kdgK51, xylA5, mtl-1, argE3(Oc), thi-1Bachmann BJ: Derivation and genotypes of some mutant derivatives of Escherichia coli K-12.Escherichia coli and Salmonella typhimurium. Cellular and Molecular Biology (Edited by: F C Neidhardt J L Ingraham KB Low B Magasanik M Schaechter H E Umbarger). Washington, D.C., American Society for Microbiology 1987, 2:1190-1219. See CGSC#1157BL21E. coli B F- dcm ompT hsdS(r B- m B-) gal [malB+]K-12(λS)The "malB region" was transduced in from the K-12 strain W3110 to make the strain Mal+λS. See Studier et al. (2009) J. Mol. Biol. 394(4), 653 for a discussion of the extent of the transfer.Stratagene E. coli Genotype StrainsBL21(AI)F– ompT gal dcm lon hsdS B(r B- m B-) araB::T7RNAP-tetAan E. coli B strain carrying the T7 RNA polymerase gene in the araB locus of the araBAD operon q.Transformed plasmids containing T7 promoter driven expression are repressed until L-arabinose induction of T7 RNA polymerase.Derived from BL21.See the product page for more information.Brian Caliendo (Voigt lab) reported trouble getting the Datsenko and Wanner (2000) plasmid pCP20 to transform into this strain, when other strains transformed fine. Cause is unknown.BL21(DE3)F– ompT gal dcm lon hsdS B(r B- m B-) λ(DE3 [lacI lacUV5-T7 gene 1 ind1 sam7 nin5])an E. coli B strain with DE3, a λ prophage carrying the T7 RNA polymerase gene and lacI qTransformed plasmids containing T7 promoter driven expression are repressed until IPTG induction of T7 RNA polymerase from a lac promoter.Derived from B834 (Wood, 1966) by transducing to Met+.See the original Studier paper or the summary in Methods in Enzymology for more details.Whole genome sequence available [1]BL21 (DE3) pLysSF- ompT gal dcm lon hsdS B(r B- m B-) λ(DE3) pLysS(cm R)pLysS plasmid chloramphenicol resistant; grow with chloramphenicol to retain plasmidChloramphenicol resistantThe pLysS plasmid encodes T7 phage lysozyme, an inhibitor for T7 polymerase which reduces and almost eliminates expression from transformed T7 promoter containing plasmids when not induced.see Moffatt87 for details of pLysS and pLysE plasmidsBNN93F- tonA21 thi-1 thr-1 leuB6 lacY1 glnV44 rfbC1 fhuA1 mcrB e14-(mcrA-) hsdR(r K-m K+) λ-Some C600 strains are really BNN93BNN97BNN93 (λgt11)A λgt11 lysogen producing phage at 42CBW26434, CGSC Strain # 7658Δ(araD-araB)567, Δ(lacA-lacZ)514(::kan), lacIp-4000(lacI q), λ-, rpoS396(Am)?, rph-1, Δ(rhaD-rhaB)568, hsdR514This information is from a printout sent by the E. coli Genetic Stock Center with the strain.B.L. Wanner strainrph-1 is a 1bp deletion that results in a frameshift over last 15 codons and has a polar effect on pyrE leading to suboptimal pyrimidine levels on minimal medium. (Jensen 1993 J Bact. 175:3401)Δ(araD-araB)567 was formerly called ΔaraBAD AH33 by Datsenko and WannerAm = amber(UAG) mutationReference: Datsenko and Wanner, 2000, PNAS, 97:6640NOTE:This promoter driving the expression of lacI was sequenced in this strain using a primer in mhpR (upstream of lacI) and a primer in the opposite orientation in lacI. The lac promoter was found to be identical to wildtype. Thus, the -35 sequence was GCGCAA not GTGCAA as expected with lacI q.Therefore this strain (or at least the version obtained from the E. coli Genetic Stock Center) does NOT appear to be lacI q. According to Barry Wanner, this is an unexpected result. -Reshma 13:19, 5 May 2005 (EDT)"We have now confirmed that BW25113, BW25141, and BW26434 are all lacI+, and not lacI q. We thank you for alerting us to the error with respect to BW26434. Apparently, the lacI region was restored to wild-type in a predecessor of BW25113." (from Barry Wanner November 18, 2005) The genotype has been corrected at the CGSCC600F- tonA21 thi-1 thr-1 leuB6 lacY1 glnV44 rfbC1 fhuA1 λ-There are strains circulating with both e14+(mcrA+) and e14-(mcrA-)General purpose hostSee CGSC#3004References: Appleyard, R.K. (1954) Genetics 39, 440; Hanahan, D. (1983) J. Mol. Biol. 166, 577.C600 hflA150 (Y1073, BNN102)F- thi-1 thr-1 leuB6 lacY1 tonA21 glnV44 λ- hflA150(chr::Tn10)host for repressing plaques of λgt10 when establishing cDNA librariesReference Young R.A. and Davis, R. (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 1194.Tetracycline resistance from the Tn10 insertionCSH50F- λ- ara Δ(lac-pro) rpsL thi fimE::IS1See CGSC#8085References: Miller, J.H. 1972. Expts.in Molec.Genetics, CSH 0:14-0; Blomfeld et al., J.Bact. 173: 5298-5307, 1991.D1210HB101 lacI q lacY+DB3.1F- gyrA462 endA1 glnV44 Δ(sr1-recA) mcrB mrr hsdS20(r B-, m B-) ara14 galK2 lacY1 proA2rpsL20(Sm r) xyl5 Δleu mtl1useful for propagating plasmids containing the ccdB operon.gyrA462 enables ccdB containing plasmid propagationstreptomycin resistantappears to NOT contain lacI (based on a colony PCR) --Austin Che 16:16, 18 June 2007 (EDT)1. Bernard-JMolBiol-1992 pmid=13243242. Miki-JMolBiol-1992 pmid=1316444。
escherichia coli k12名词解释微生物
escherichia coli k12名词解释微生物
Escherichia coli K12（大肠杆菌K12）是一种常用的微生物，属于Escherichia coli（大肠杆菌）的种。
它是一种革兰氏阴性菌，属于肠杆菌科。
由于其相对简单的基因组和易于培养的特性，大肠杆菌K12常被用作基因工程和分子生物学研究的基础工具。
在生物工程领域，大肠杆菌K12是第一个完成全基因组测序的微生物，也是第一个被广泛用于基因克隆和表达的微生物。
它的基因组相对较小，只有约4.6万个碱基对，这使得研究者可以相对容易地分离、克隆和操作其基因。
大肠杆菌K12被广泛用于蛋白质表达、基因敲除、转录分析和其他基因工程技术的研究中。
它的基因组中包含许多用于基因克隆和表达的标记基因，如lacZ、ompA、trp等，这些标记基因可以被用于基因表达的检测和调控。
此外，大肠杆菌K12还被用于生产各种生物制品，如抗生素、酶和其他蛋白质药物。
由于其容易培养和生产效率高的特性，大肠杆菌K12已成为生物工程领域的重要微生物。
以上内容仅供参考，建议查阅关于Escherichia coli K12的专业文献或咨询相关领域的专家以获取更准确和全面的信息。
常用大肠杆菌 (K-12株来源) 的基因型
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大肠杆菌基因型及遗传符号说明
整理by raimiDICP-1816 菌株管理档案1——细菌菌株基因型及基因符号说明 1大肠杆菌基因型及遗传符号说明前言：实验室的一般大肠杆菌拥有4288 条基因，每条基因的长度约为950bp，基因间的平均间隔为118bp（基因Ⅷ）。
E.coli 基因组中还包含有许多插入序列，如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段，这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的，由此表明了基因组具有它的可塑造性。
利用大肠杆菌基因组的这种特性对其进行改造，使其中的某些基因发生突变或缺失，从而给大肠杆菌带来可以观察到的变化，这种能观察到的特征叫做大肠杆菌的表现型(Phenotype)，把引起这种变化的基因构成叫做大肠杆菌的基因型（Genotype）。
具有不同基因型的菌株表现出不同的特性。
分子克隆中常用的大肠杆菌及其遗传标记按Demerec 等1966 年提出的命名原则，采用的菌株所有的基因都假定处于野生型状态，除非在基因型上另外注明。
大肠杆菌基因型的表示方法（Demerec, et, al. 1966）：一、一般规则：1、根据基因产物或其作用产物的英文名称的第一个字母缩写成3 个小写斜体字母来表示。
例如：DNA Adenine Methylase→dam。
2、不同的基因座，其中任何一个突变所产生的表型变化可能相同，其表示方法是在3 个小写斜体字母后加上一个斜体大写字母来表示区别。
例如：Recombination→recA、recB、recC。
3、突变位点应通过在突变基因符号后加不同数字表示。
如supE44（sup 基因座E 的44 位突变）。
如果不知道几个等位基因中哪一/几个发生了功能性突变，则用连字符“-”代替大写字母，如trp-31。
4、细菌的基因型中应该包含关于其携带的质粒或附加体的的信息。
这些符号包括菌株携带的质粒或附加体、质粒或附加体上的突变基因座和突变位点。
其基因符号应与基因座的表示符号明显区别，符号的第一个字母大写、不斜体并位于括号内；质粒或附加体上的突变基因座和突变位点的基因符号的表示方法与染色体上突变基因座、突变位点的符号相同。
大肠埃希氏菌K-12糖代谢的外膜蛋白质组学研究的开题报告
大肠埃希氏菌K-12糖代谢的外膜蛋白质组学研究的开题报告一、研究背景和意义大肠杆菌（Escherichia coli）是一种广泛存在于自然界中的革兰氏阴性菌。
它存在于大部分生物体内，包括人体肠道中。
大肠杆菌K-12在比较基因组学的研究中是一个重要的模式菌株。
大肠杆菌K-12是已知最好的微生物模型之一，广泛用于生物化学、遗传学、生物物理学和分子生物学的研究中。
因此，大肠杆菌K-12的研究对于我们理解生命基本过程和发展新型治疗方法具有重要意义。
糖代谢是维持生命活动的重要过程之一，大肠杆菌K-12在糖代谢过程中起着重要的作用。
外膜蛋白质是外露在大肠杆菌K-12胞外的一类重要蛋白质，它们在细菌细胞质膜的合成、通透性等方面起到至关重要的作用。
因此，揭示大肠杆菌K-12糖代谢相关的外膜蛋白质谱组学特征，有助于深入了解大肠杆菌K-12的糖代谢过程及其调节机制，为开发针对大肠杆菌K-12的治疗方法提供理论依据。
二、研究内容和方法本研究旨在通过外膜蛋白质组学的方法，揭示大肠杆菌K-12的糖代谢相关外膜蛋白质的谱组学特征，具体研究内容包括以下几个方面：1. 确定大肠杆菌K-12在糖代谢过程中相关外膜蛋白质的表达情况。
2. 应用蛋白质组学技术，进行大肠杆菌K-12糖代谢相关的外膜蛋白质的筛选和鉴定。
3. 进行外膜蛋白质的定量和定位分析，以确定不同条件下外膜蛋白质的表达量变化以及它们在细菌胞外的分布情况。
4. 对蛋白质组学数据进行生物信息学分析，全面解析糖代谢相关外膜蛋白质的功能、亚细胞定位和代谢途径。
本研究将结合DNA微阵列、蛋白质组学技术、定量PCR等方法，筛选大肠杆菌K-12在糖代谢过程中的相关外膜蛋白质、分析它们的表达情况和分布特征、揭示它们在大肠杆菌K-12代谢途径中的功能及其调节机制。
三、研究期望和创新点本研究旨在揭示大肠杆菌K-12糖代谢过程中涉及的外膜蛋白质的表达情况和分布特征，为深入理解大肠杆菌K-12糖代谢过程提供全面的信息。
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supE44,hsdR17,recA1,endA1,gyrA96,thi-1,relA1
DH5α
supE44, ΔlacU169 (φ80lacZΔM15), hsdR17,recA1,endA1,gyrA96,thi-1,relA1
DP50supF
supE44,supF58,hsdS3 (rB-mB-) ,dapD8,lacY1,glnV44, Δ (gal-uvrB) 47,tyrT58,gyrA29,tonA53, Δ (thyA57)
常用大肠杆菌(K-12株来源)的基因型
Strain
Genotype
BB4
supF58,supE44,hsdR514,galK2,galT22 ,trpR55,metB1,tonA, ΔlacU169/F' [proAB+,lac Iq,lacZΔM15 Tn10(tetr) ]
BL21(DE3)
F-,ompT,hsdSB(rB-mB-) , gal (λc I857,ind1,Sam7,nin5,lacUV5-T7gene1) ,dcm(DE3)（B株来源）
K803
F-,lacY1 or Δ (lac Iq-Y) 6 (lac-3) ,supE44,galK2,galT22,mcrA, rfbD,metB1,mcrB1,hsdR3
LE392
supE44,supF58,hsdR514,galK2,galT22,metB1,trpR55,lacY1
MC1061
hsdR, mcrB,araD139, Δ (araABCห้องสมุดไป่ตู้leu) 7679, ΔlacX74,galU, galK, rpsL, thi
MV1184
ara, Δ (lac-proAB) ,rpsL, thi(φ80lacZΔM15) , Δ (srl-recA) 306∷Tn10(tetr) /F' [traD36,proAB+,lac Iq,lacZΔM15]
RR1
supE44,hsdS20,ara-14,proA2,lacY1,galK2,rpsL20,xyl-5,mtl-1
TAP90
supE44,supF58,hsdR, pro, leuB, thi-1,rpsL, lacY1,tonA1,recD1903∷mini-tet
TG1
supE, hsdΔ5,thi,Δ (lac-proAB) /F' [traD36,proAB+,lac Iq,lacDΔM15]
C-la
Awild type strain (C strain)（C株来源）
C600
supE44,hsdR,thi-1,thr-1,leuB6,lacY1,tonA21
CJ236
dut1,ung1,thi-1,relA1/pCJ105 (F'camr)
DH1
supE44,hsdR17,recA1,endA1,gyrA96,thi-1,relA1
MV1193
Δ (lac-proAB) ,rpsL, thi, endA1,sbcB15,hsdR4, Δ (srl-recA) 306∷Tn10(tetr) /F' [traD36,proAB+,lac Iq,lacZΔM15]
NovaBlue
endA1,hsdR17, (rK-mK+) ,supE44,thi-1,gyrA96,relA1,lac, recA1/F', [proAB+,lac IqZΔM15, Tn10(tetr) ]
BM25.5
F-, λimm434kanr, (P1) ,cmr, rk-mk+,tetr
BMH71-18mutS
Δ (lac-proAB) ,supE, thi, mutS215∷Tn10 (tetr) /F' (traD36,proAB+,lac Iq,lacZΔM15)
BW313
HfrKL16PO/45 [lys(61-62) /dut1,ung1,thi-1,relA1]
JM110
dam,dcm,supE44,hsdR17,thi, leu, rpsL1,lacY, galK, galT,ara, tonA, thr, tsx,Δ(lac-proAB) /F' [traD36,proAB+,lac Iq,lacZΔM15]
K802
F-,lacY1 or Δ (lac Iq-Y) 6 (lac-3) ,supE44,galK2,galT22,mcrA, rfbD,metB1,mcrB1,hsdR2
Y-1088
F-, ΔlacU169,supE, supF, hsdR, metB, trpR, fhuA21,proC∷Tn5/pMC9*
Y-1089
F-, ΔlacU169,lon-100,araD139,rpsL, hflA150 [chr∷Tn10/pMC9*]
Y-1090
F-, ΔlacU169,lon-100,araD139,rpsL, supF, mcrA, trpC22∷Tn10/pMC9*
XL1-Blue
hsdR17,supE44,recA1,endA1,gyrA46,thi, relA1, lac/F' [proAB+,lac Iq,lacZΔM15∷Tn10(tetr)]
x1776
F-,thuA53,dapD8,minA1,minB2,rfb-2,glnV44 (supE44) , Δ (gal-uvrB) 47,tyrA142,gyrA29,oms-2,metC65,osm-1 (tte-1) , Δ (bioH-asd) 29,cycA1,cycB2,hsdR2
JM101
supE, thi,Δ(lac-proAB) /F' [traD36,proAB+,lac Iq,lacZΔM15]
JM105
endA1,supE, sbcB15,thi, rpsL,Δ(lac-proAB) /F' [traD36,proAB+,lac Iq,lacZΔM15]
JM106
TG2
supE, hsdΔ5,thi, Δ (lac-proAB) Δ (srl-recA) 306∷Tn10(tetr) /F' [traD36,proAB+,lac Iq,lacZΔM15]
TH2
supE44,hsdS20 (rB-mB-) ,recA13,ara-14,proA2,lacY1,galK2,rpsL20,xyl-5,mtl-1,thi-1,trpR624
F-,recA1,endA1,gyrA96,thi, hsdR17,supE44,relA1, Δ(lac-proAB)
JM109
recA1,endA1,gyrA96,thi, hsdR17,supE44,relA1, Δ(lac-proAB) /F' [traD36,proAB+,lac Iq,lacZΔM15]
F-,endA1,gyrA96,thi, hsdR17,supE44,relA1, Δ(lac-proAB)
JM107
endA1,gyrA96,thi, hsdR17,supE44,relA1, Δ(lac-proAB) /F' [traD36,proAB+,lac Iq,lacZΔM15]
JM108
ED8654
supE, supF, hsdR, metB, lacY, gal, trpR
ED8767
supE44,supF58,hsdS3(rB-mB-) ,recA56,galK2,galT22,metB1
ER1647
F-,trp-31,his-1,rpsL104 (strr),fhuA2, Δ (lacX)r1,supE44,xyl-7,mtl-2,metB1,recD1014,mcrA1272∷Tn10, Δ (mcrB, hsdRMS, mrr) 102∷Tn10(tetr)
HB101
supE44,hsdS20 (rB-mB-) ,recA13,ara-14,proA2,lacY1,galK2,rpsL20,xyl-5,mtl-1,leuB6,thi-1
HMS174
recA1,hsdR,ritr
JM83
F-,ara,Δ (lac-proAB) ,rpsL(φ80lacZΔM15)