几种常用生物活性测试方法简介[优质ppt]
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surface plasmon resonance , SPR
表面等离子共振原理
光在棱镜与金属膜表面上发生全反射 现象时,会形成消逝波进入到光疏介 质中与介质中存在一定的等离子波相 遇时可能会发生共振。当消逝波与表 面等离子波发生共振时,检测到的反 射光强会大幅度地减弱。
SPR角:反射光完全消失的角。 SPR角随金属表面wk.baidu.com射率变化而变化,
Journal of Molecular Recognition.2008, 21, 289.
Isothermal Titration Calorimetry (ITC)
ITC独特之处: 样品用量小,方法灵敏度和精确度高。最小可检测热效应0.125uJ,生物样品最
小用量0.4ug,滴定池体积1.43 ml 实验时间较短。典型的ITC实验只需30-60分钟,并加上几分钟的响应时间。 操作简单。整个实验由计算机控制,使用者只需输入实验的参数,如温度、注
surface plasmon resonance , SPR 表面等离子共振(SPR)原理
消逝波:当入射光到达界面时并不是直 接产生反射光,而是先透过光疏介质约 一个波长的深度,再沿界面流动约半个 波长再返回光密介质,透过光疏介质的 波被称为消逝波。
等离子波:当金属受电磁干扰时,金属内部 的电子密度分布会变得不均匀。因为库仑力 的存在,电子不会在引力与斥力的平衡位置 停下而向前运动一段距离,之后电子间存在 的斥力会迫使已经聚集起来的电子再次离开 该区域。由此会形成一种整个电子系统的集 体震荡,而库仑力的存在使得这种集体震荡 反复进行震荡,并以波的形式表现。
Methods In Cell Biology, 2008, 84,79.
Isothermal Titration Calorimetry (ITC) ITC数据图
左图: 横坐标:时间 纵坐标:热功率 峰底与峰尖之间的峰面积为每次注射时释放或吸收的总热量。 右图: 横坐标:滴定物与样品溶液的摩尔比 纵坐标:滴定产生的总热量 反应过程的结合等温曲线
J.Pharmaceut.Biomedical.2008,11,28.
surface plasmon resonance , SPR
SPR的优点:
可以实时、连续监测反应的动态过程, 灵敏度较高 。
可实时记录反应的结合与解离过程。 每次检测结束后,结合在金属膜芯片
上的反应物可以用洗脱液洗脱使芯片 再生,可重复使用,节约耗材。 可以得到高通量数据。
ITC是一种热量连续变化的量热器。主 要由隔热夹套包裹着的样品池(反应池) 和参比池、注射器和一台计算机组成, 注射器同时具有搅拌作用,计算机控 制温度控制装置和信息反馈系统。
受体-配体复合物的形成伴随着能量的释放或吸收,导致样品池温度的变化,参比池 始终保持在实验温度,反馈系统提供热或降低热量来补偿样品池的温度变化,每注 射一次后系统恢复至平衡状态再进行下一滴滴定。结果以峰的形式表示平衡温度偏 移所需要的能量,峰的面积相当于反应释放或吸收的热量。
SPR的缺点:
待测物在金属薄膜表面的固定:由于生物大分子本身理化性质的复杂性,空间 结构的特殊性,偶联结果可能导致偶联物特异作用位点的失活。
分析物在金属薄膜表面的结合:难以区分非特异性结合,若分析物在芯片表面 是非特异性结合, 会给整个实验带来干扰,造成错误的结论。
待测物的分子大小:适用于生物大分子,小分子的质量变化对折射率变化不明 显, 因此会给小分子待测物的检测造成困难。
基本原理:
Q = △Ho x V x [H.G]
= △Ho x V x
Ka [G] 1+Ka [G]
x [H]o
△Go = -RT ln K a
△Go = △Ho - T△So
注:H 为受体(主体),G为配体(客体),Ka为结合常数 △Go为Gibbs自由能变化,△Ho 为焓变,△So 为熵变
Isothermal Titration Calorimetry (ITC) ITC仪结构示意图
(如酶活力(Kcat)、酶促反应米氏常数(Km)) 。
可以应用于蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质折叠/去折叠、蛋白质-小分子相互作用、 酶-抑制剂相互作用、酶促反应动力学、药物-DNA/RNA相互作用、RNA折叠、蛋 白质-核酸相互作用、核酸-小分子相互作用、核酸-核酸相互作用、生物分子-细胞 相互作用等方面。
而折射率的变化又与金属表面结合的 分子质量成正比。 可通过 SPR 角的变化捕获生物反应过 程中生物分子之间相互作用的特异信 号,对待测物质进行测定直接测量反 应平衡常数 Ka,解离平衡常数 Kd 等。
surface plasmon resonance , SPR
将待测分子键合在生物传感芯片表面,使其形成分子敏感膜, 再将分析物分子溶液 注入,使其以恒定流速流过芯片表面,如果两者通过相互作用而结合,则将引起生 物传感器表面质量的增加, 导致传感器表面折射率的变化,从而引起SPR角的改变。 SPR被广泛应用于分析生物分子如蛋白质-蛋白质、药物-蛋白质、蛋白质-核酸、核 酸-核酸之间的相互作用,所涉及的研究领域包括免疫学、蛋白质组学及药物筛选等。
几种常用生物活性 测试方法简介
CONTENTS
1
分子水平活性测试方法
2
细胞水平活性测试方法
3
总结
Isothermal Titration Calorimetry (ITC)
等温滴定量热法(Isothermal Titration Calorimetry, ITC)是近年来发展起来的一种 研究生物热力学与生物动力学的重要方法,它通过高灵敏度、高自动化的微量 量热仪连续、准确地监测和记录一个变化过程的量热曲线,原位、在线和无损 伤地同时提供热力学和动力学信息。
射次数、注射量等,计算机就可以完成整个实验,再由软件分析ITC得到的数据。 量热实验完毕的样品未遭破坏,还可以进行后续生化分析。
ITC的用途: 获得生物分子相互作用的完整热力学参数,包括结合常数(Ka)、结合位点数(n)、摩 尔结合焓(△H)、摩尔结合熵( △S)、摩尔恒压热容( △ Cp),和动力学参数