核酸的体外扩增(PCR)概述
pcr技术的名词解释
pcr技术的名词解释PCR技术,全称聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),是一种在生物科学领域广泛应用的核酸扩增技术。
PCR技术可以在体外复制、扩增极微量的DNA或RNA片段,从而使其在实验室中进行更详细和准确的研究。
PCR技术是由美国科学家凯瑟琳·穆利斯(Kary Mullis)于1983年发明的,她因此获得了1993年的诺贝尔化学奖。
PCR技术的发明被视为生命科学领域的一项突破性发现,它极大地改变了基因分析和诊断的方式。
PCR技术的核心原理是通过一系列温度变化,使DNA模板序列在DNA聚合酶的作用下反复复制。
PCR技术通常需要以下几个步骤。
首先,从待扩增的DNA样本中提取出目标DNA序列。
提取DNA的方式可以根据实验目的不同而有所差异,常见的方法包括酚氯仿法、磁珠法等。
然后,将DNA样本置于PCR反应管中,并添加聚合酶、DNA引物(primer)以及四种碱基(A、T、C和G),混合均匀。
引物是一对短链的DNA片段,它能够特异性地与待扩增的DNA片段的两端结合。
接下来,将PCR反应管置于热循环仪中,进行一系列温度变化的循环。
通过加热至高温(通常为94-98摄氏度),使DNA双链解离成两条单链。
然后,降温到合适的温度(通常为50-65摄氏度),引物与目标DNA序列的两端结合,作为DNA复制的起始点。
最后,加热至适宜的温度(通常为72摄氏度),聚合酶将新的DNA链片段与引物结合,并复制出新的双链DNA。
上述温度循环通常需要重复20-40次,每一轮都会产生比前一轮更多的目标DNA序列。
因此,PCR技术具有极好的扩增效率。
PCR技术在生物科学中有广泛的应用。
它可以用于基因测序、基因突变检测、基因表达分析、DNA指纹鉴定等多个领域。
此外,PCR技术的快速和高效使其成为了病原体检测、法医学和生物工程等领域的重要工具。
总结来说,PCR技术是一种重要的核酸扩增技术,通过循环反应和温度变化的方式可以在实验室中迅速、准确地复制和扩增DNA或RNA序列。
简述PCR原理及过程的步骤
简述PCR原理及过程的步骤PCR(聚合酶链式反应)是一种用于扩增DNA(脱氧核糖核酸)序列的重要技术。
它在生物医学研究、基因工程以及医学诊断中得到广泛应用。
本文将简要介绍PCR的原理和步骤。
1. PCR原理PCR原理基于DNA的复制机制,在体外繁殖大量DNA分子。
PCR通过将DNA反复加热(解链)、退火(引物结合)和延伸(DNA合成)的循环反应,使得DNA序列倍增。
这一过程包括以下几个主要步骤。
2. PCR步骤2.1 解链(Denaturation)PCR反应开始时,将待扩增的DNA样本加热至高温(通常为94-98摄氏度)。
高温能够打破DNA双螺旋结构,使双链DNA分离成两个单链。
2.2 引物结合(Annealing)在下一个步骤中,PCR反应体系被冷却至较低的温度(通常为50-65摄氏度)。
在这个温度下,由于引物(寡核苷酸片段)的存在,引物会与待扩增DNA的互补序列结合。
2.3 DNA合成(Extension)引物结合后,温度会被升高至大约72摄氏度。
这个温度下,Taq DNA聚合酶(一种特殊的DNA合成酶)会开始合成新的DNA链。
Taq DNA聚合酶能够使用已结合的引物作为起始点,向前方向合成新的DNA分子。
2.4 重复循环一次PCR循环包括了上述三个步骤,通常需要进行20-35次循环,以保证足够的DNA序列倍增。
在每次循环后,DNA的数量会成指数级增加。
3. PCR的应用领域PCR技术在许多领域得到广泛应用,包括:•分子生物学研究:PCR可以扩增特定的DNA序列,用于基因测序、基因突变检测等研究。
•法医学:PCR可用于DNA鉴定,如刑事案件的嫌疑人辨识等。
•医学诊断:PCR可用于检测病原体的DNA,如病毒、细菌等,用于感染病原体的快速诊断。
•遗传学:PCR可用于基因检测、遗传疾病筛查、基因多态性分析等。
总结PCR技术的发展和应用使得科学家们可以在短时间内扩增大量目标DNA序列。
PCR 在许多生物医学研究领域具有重要作用,其简单、高效、可靠的特点使其成为现代生命科学研究中不可或缺的工具。
PCR方法的原理及应用
PCR方法的原理及应用1. PCR方法的简介PCR方法(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链反应)是一种在体外体系中,通过核酸的特异性引物和热稳定DNA聚合酶的作用,对DNA分子进行体外扩增的技术。
该方法具有高效、灵敏、特异性强等特点,因此在分子生物学领域中得到广泛应用。
1.1 PCR方法的步骤PCR方法主要包括以下三个步骤:1.变性(Denaturation):将DNA样本加热至94-98°C,使DNA双链解链并转变为单链。
2.退火(Annealing):将温度降至50-65°C,使引物与目标DNA序列的互补部分结合。
3.延伸(Extension):将温度升至72°C,利用DNA聚合酶酶活性,合成目标DNA序列的互补链。
1.2 PCR方法的原理PCR方法利用DNA聚合酶酶活性的特点,通过循环反应来扩增目标DNA序列。
通过反复进行以上三个步骤,每个循环都会产生新的DNA分子,从而指数级扩增目标DNA序列的数量。
PCR方法中的引物是一对特异性的DNA片段,它们能够与目标DNA序列的两个互补部分结合。
在退火步骤,引物与目标DNA序列结合,为DNA聚合酶提供起始合成新链的位置。
延伸步骤中,DNA聚合酶沿着目标DNA序列合成新的DNA链。
2. PCR方法的应用PCR方法由于其高灵敏度和特异性,广泛应用于以下领域:2.1 分子诊断PCR方法在临床诊断中具有重要的作用。
通过PCR方法可以检测病原微生物的DNA序列,快速准确地进行疾病的检测与诊断。
例如,PCR方法可以用于检测传染病的病原体,如病毒、细菌、真菌等。
此外,PCR方法还可以用于检测基因突变和遗传疾病的相关基因变异。
2.2 基因克隆PCR方法在基因克隆中起到了重要的作用。
通过PCR方法可以从DNA样本中扩增目标基因序列,获得足够的DNA量用于后续的克隆实验。
PCR方法还可以在目标基因的两端引入特定的序列,用于亚克隆、定点突变等操作。
核酸pcr检测原理
核酸pcr检测原理核酸PCR检测原理引言:核酸PCR检测是一种常用的分子生物学技术,广泛应用于医学诊断、病原体检测、基因分型、DNA克隆等领域。
本文将从PCR的基本原理、反应组分、步骤和技术应用等方面进行介绍。
一、PCR基本原理PCR(Polymerase Chain Reaction)是通过体外DNA聚合酶的酶促反应,以DNA为模板,通过酶链反应的方式快速扩增特定的DNA片段。
其基本原理是在适当的反应条件下,通过循环性的温度变化,使DNA的两条链在酶的作用下解旋、复制,从而扩增目标序列。
PCR的基本原理可以概括为三个步骤:变性、退火和延伸。
1. 变性(Denaturation):将待扩增的DNA加热至94-98℃,使DNA双链分离为两条单链。
2. 退火(Annealing):将反应温度降至50-65℃,引入一组特异性引物(寡核苷酸),使其与目标序列的两端互补结合。
3. 延伸(Extension):将反应温度升高至72℃,加入DNA聚合酶,使其在引物的引导下从3'端向5'端合成新的DNA链。
二、PCR反应组分PCR反应体系主要包括DNA模板、引物(前向引物和反向引物)、dNTPs(四种脱氧核苷酸)、缓冲液、DNA聚合酶和稀释水。
其中,DNA模板是待扩增的目标序列,引物是特异性的寡核苷酸序列,dNTPs是四种脱氧核苷酸单体,缓冲液提供适宜的pH和离子强度,DNA聚合酶是PCR反应的关键酶。
三、PCR的步骤PCR反应一般由以下几个步骤组成:预变性、变性、退火、延伸和最终延伸。
1. 预变性:将反应体系加热至94-98℃,使DNA双链变性为两条单链,以便后续的扩增反应。
2. 变性:将反应体系继续加热至94-98℃,使DNA双链彻底分离为两条单链。
3. 退火:将反应体系降温至50-65℃,使引物与目标序列的两端互补结合。
4. 延伸:将反应体系升温至72℃,加入DNA聚合酶,使其在引物的引导下从3'端向5'端合成新的DNA链。
PCR技术的原理及其应用
PCR技术的原理及其应用PCR(聚合酶链反应)是一种体外扩增DNA的技术,它通过复制DNA 的特定片段来产生大量的DNA。
PCR技术的原理基于DNA的复制过程,通过控制核酸模板,酶和引物的加入,可以在体外精确地复制所需的特定DNA序列。
1. Denaturation(变性):加热样本至94-98°C,使DNA分离为两条单链。
2. Annealing(连接):将温度降低至55-65°C,使引物与DNA模板序列特异地结合。
3. Extension(扩增):将温度升高至72°C,用一种特殊的DNA聚合酶(如Taq聚合酶)合成新的DNA链。
以上三个步骤依次重复多个循环,每个循环将产生一个原DNA序列的指数级扩增,使DNA数量呈指数级增加。
1.分子诊断:PCR技术可以在极短的时间内扩增微生物的DNA,从而帮助医生迅速确定病原体,用于诊断病情。
2.法医学:PCR技术可以从受害者和嫌疑人的样本中扩增出特定的DNA序列,用于DNA比较和鉴定,以提供法医学的证据。
3.基因工程:PCR技术可以在短时间内扩增需要大量的DNA序列,以便进行下一步的基因工程实验。
4.基因突变分析:PCR技术可以扩增携带突变的DNA片段,以进行突变检测和分析,从而帮助确定基因突变和遗传病的发病机制。
5.基因组学研究:PCR技术可以扩增整个基因组的特定区域,用于基因组学的研究和分析。
6.环境监测:PCR技术可以从土壤、水样、空气等环境样本中扩增特定的微生物DNA序列,用于环境监测和微生物生态学的研究。
总之,PCR技术以其高效、准确、可靠的优点,成为现代分子生物学和生物医学研究的重要工具之一、通过PCR技术,可以大幅度提高DNA的产量,可以在很短的时间内扩增特定目标DNA片段,为生物医学、基因工程和环境科学等领域研究提供了强大的支持。
核酸体外扩增实验报告
核酸体外扩增实验报告实验目的本实验旨在通过核酸体外扩增技术对特定DNA片段进行放大,以便进一步研究和分析。
实验原理核酸体外扩增是一种基于聚合酶链式反应(PCR)原理的技术,通过不断重复DNA片段的变性、回退、延伸等步骤,可以在体外放大特定的DNA序列。
该技术广泛应用于分子生物学研究中,例如基因测序、基因突变检测、DNA指纹鉴定等。
核酸体外扩增的关键成分包括DNA样本、引物、聚合酶和缩合酶,以及一系列核酸扩增试剂。
在PCR过程中,首先将DNA加热至高温,使其变性形成单链;随后,将温度降低,使引物结合到目标DNA上;最后,通过延伸步骤,聚合酶复制并合成新的DNA链。
重复这个循环反应可以快速放大目标DNA片段。
实验材料和方法材料:- DNA样本:20ng/μL的目标DNA- 引物:前向引物和反向引物,浓度各为10μM- 反应试剂盒:含有聚合酶、缩合酶和其他所需试剂的PCR反应试剂盒实验步骤:1. 准备PCR反应体系:根据试剂盒说明书中的配方,计算出所需反应试剂的体积,并将其加入PCR管中。
2. 加入DNA样本:向PCR管中加入2μL目标DNA样本。
3. 加入引物:向PCR管中加入1μL前向引物和1μL反向引物。
4. 混匀反应液:使用微量移液器轻轻振动反应管,确保反应液充分混合。
5. 放入PCR仪:将反应管放入预热至95C的PCR仪中,开始PCR反应。
6. 反应程序设置:设置PCR仪进行循环反应,常规程序为:95C预变性(3分钟)→(95C变性(30秒)→60C退火(30秒)→72C延伸(1分钟))循环25次→72C延伸(5分钟)→4C保持。
实验结果经过PCR反应,我们成功扩增出了目标DNA片段。
通过琼脂糖凝胶电泳分析,可以看到明显的DNA条带。
结果分析根据电泳结果,我们可以初步判断PCR反应成功扩增出了目标DNA片段。
进一步可以通过测序技术对扩增片段进行后续分析。
此外,还需对扩增产物进行纯化和浓度检测,以确保后续实验的准确性。
核酸的体外扩增名词解释
核酸的体外扩增名词解释核酸的体外扩增是一种重要的生物学技术,它可以在实验室中大量复制和增加核酸分子的数量。
这项技术在分子生物学、医学诊断、疫苗研究等领域具有广泛的应用。
在本文中,我们将解释核酸的体外扩增相关的名词,深入探讨这项技术的原理和意义。
一、核酸核酸是构成生物体遗传信息的分子。
在细胞中,核酸可以分为两种类型:DNA (脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)。
DNA是双螺旋结构,携带着细胞的遗传信息,而RNA则起着转录和翻译的作用,帮助完成基因表达。
核酸的结构和序列决定了细胞和个体的遗传特征。
二、体外扩增体外扩增,也称为聚合酶链反应(PCR),是一种能够在实验室中快速复制核酸的技术。
它是由美国科学家基里尔·穆利斯 (Kary B. Mullis) 在1983年发明的。
体外扩增可以通过复制少量的核酸模板,生成大量相同的DNA或RNA分子。
这项技术具有高度敏感性、高效性和广泛适用性,被广泛应用于基因分型、疾病诊断和遗传研究等领域。
三、聚合酶链反应(PCR)聚合酶链反应是体外扩增的核心步骤。
它包括三个主要步骤:变性、退火和扩增。
在变性步骤,核酸模板被暴露在高温下,使其双链解开成单链。
然后,在退火步骤中,引物(两个短的DNA片段)与目标DNA模板的两端结合,为DNA复制提供起始点。
在扩增步骤中,DNA聚合酶通过循环反应,将两个引物延伸并合成新的DNA链。
这个过程会不断重复,使得目标DNA的数量迅速增加。
四、引物引物是PCR中的关键组成部分。
它是一段较短的DNA或RNA序列,能够与目标DNA模板的特定序列互补结合。
设计合适的引物是PCR扩增的关键,因为它决定了特定目标DNA被复制的区域。
引物的选择需要考虑到目标序列的长度、碱基组成和互补性,以确保扩增过程的特异性和效率。
五、热循环仪热循环仪是PCR实验中所使用的仪器。
它可以控制反应体系的温度,并且根据PCR的步骤需要自动改变温度。
热循环仪的主要作用是在不同的温度条件下,促进DNA的变性、引物的结合和DNA聚合酶的活性。
PCR扩增
PCR扩增PCR是一种体外DNA 扩增技术,是在模板DNA、引物和4种脱氧核苷酸存在的条件下,依赖于DNA聚合酶的酶促合反应,将待扩增的DNA片段与其两侧互补的寡核苷酸链引物经“高温变性——低温退火——引物延伸”三步反应的多次循环,使DNA片段在数量上呈指数增加,从而在短时间内获得我们所需的大量的特定基因片段。
在环境检测中,靶核酸序列往往存在于—个复杂的混合物如细胞提取液中,且含量很低,对于探测这种复杂群体中的特异微生物或某个基因,杂交就显得不敏感。
使用PCR技术可将靶序列放大几个数量级,再用探针杂交探测对被扩增序列作定性或定量研究分析微生物群体结构。
PCR技术常与其他技术结合起来使用,如RT-PCR、竞争PCR、槽式P CR、RAPf)、ARDRA等。
RT-PCR不仅能检测出不能培养微生物,还能测量mRNA基因的转录水平。
竞争性PCR是一种定量PCR,通过向PCR反应体系中加入人工构建的带有突变的竞争模板、控制竞争模板的浓度来确定目的模板的浓度,对目的模板作定量研究。
将PCR技术和限制酶切技术结合使用,用限制酶酶切目的基因的PCR扩增产物,通过对酶切产物的分析,探测该基因的多态性。
RAPD(randomly amplified polymorphic DNA, RAPD)也是应用比较广泛的一项技术。
RAPD是用那些对某—特定基因的非特异性的引物来扩增某些片段。
RAPD分析用于探测含有混合微生物种群的各种生物反应器中的微生物多样性。
用RAPD分析所得到的基因组指纹图谱在比较一段时间内微生物种群的变化以及比较小试规模和中试规模的反应器方面是有用的,但还不足以用来估测群落的生物多样性。
PCR反应常见问题汇总1.PCR产物的电泳检测时间一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。
2.假阴性,不出现扩增条带PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及,④PCR循环条件。
核酸的体外扩增概述
核酸的体外扩增概述核酸体外扩增,也称为聚合酶链式反应(PCR),是一种重要的分子生物学技术,用于扩增和复制特定DNA或RNA序列。
PCR技术的广泛应用和成功应用于许多领域,例如基因检测、疾病诊断、法医学、基因工程等。
本文将对PCR技术进行概述。
PCR技术的原理是依靠DNA的双链结构,通过循环变性、引物结合和DNA合成三个步骤,实现对特定DNA序列的放大。
这三个步骤分别是变性步骤、退火步骤和延伸步骤。
变性步骤:PCR反应开始时,DNA双链被加热至95°C以上,使两个DNA链分离,并形成两个单链DNA(ssDNA)。
高温对DNA的作用是破坏氢键,导致核苷酸碱基对之间的结合断裂。
退火步骤:PCR反应降温至50°C-60°C,引物(primer)结合到目标DNA的末端,引物是DNA聚合酶所需要的模板以及DNA链延伸的起始点。
延伸步骤:PCR反应在60°C-75°C下进行,加入了一种DNA聚合酶,如热稳定的Taq聚合酶。
该酶识别引物,并根据引物上的信息开始合成新的DNA链。
在延伸步骤中,引物结合到目标DNA的3'末端,DNA聚合酶沿着模板链合成新的DNA链,通过碱基配对法则,以模板链作为基础合成新的互补链。
这个过程重复多次,每次延伸都以新合成的DNA链的3'末端为起始点,最终在特定的PCR循环中产生大量的复制DNA。
PCR技术可分为传统PCR和实时定量PCR两种方法。
传统PCR是利用热循环PCR仪进行多个PCR循环,每个循环包括变性、退火和延伸步骤。
由于PCR是在反应管中进行的,所以扩增产物只能通过凝胶电泳进行检测,不能实时监测。
实时定量PCR是在PCR反应中添加一种荧光信标,通过检测荧光信号的强度来实时监测扩增过程。
实时定量PCR具有高效、快速、准确的优点,能够定量测量样本中起始模板的数量。
同时,实时定量PCR还具有多样性,可用于各种样品,包括基因型分析、基因表达分析、病原体检测等。
PCR原理及检测方法
PCR检测对标本采集及保存、 运输的要求
• • • • • 咽拭子、粪便、疱疹液、脑脊液等。 用于病毒分离和核酸检测的标本尽早采集。 病毒储存液保存。 冷链运输,尽快送至实验室进行检测。 -20℃长期保存,但是流感样病例标本应于 -70℃长期保存
新型甲型H1N1流感 检测
核酸提取
使用试剂: 核酸提取试剂盒QIAGEN RNeasy mini kit(74104); 预冷的70%乙醇溶液(无RNase水配制) (自备); β-巯基乙醇(自备) 基本步骤: 裂解组织,释放核酸; 除去蛋白杂质; 最后获得核酸产物
5 5
25~30 次循环后,模板DNA的含量 可以扩大100万倍以上。
目录
PCR扩增的特异性是由一对寡核苷酸引物所
决定的。反应初期,原来的DNA担负起使模板的
作用,随着循环次数的递增,由引物介导延伸的
片段急剧增多而成为主要模板,最终的扩增产物
是介于两种引物5’ 端之间的DNA片段。
三、PCR的成分和作用:
优点:敏感度高、特异性强、产率高、重复性
好以及快速简便等,广泛应用于微生物学、考古学、
法医学及体育等领域,并已普及到许多普通实验室,
大大简化了传统的分子克隆技术,从而比较容易地
对目的基因进行分析、鉴定。
Kary Mullis 本人因此获1993年诺贝尔化学奖。
二、PCR的原理:
用于扩增位于两段已知序列之间的DNA片段,
⑶ 延伸温度和时间:
一般位于Taq酶最适作用温度70 ~ 75 ℃之间。 引物小于16个核苷酸时,过高的延伸温度不利于引 物与模板的结合,可以缓慢升温到70 ~ 75 ℃。 延伸反应时间,可根据待扩增片段的长度而定, < 1Kb,1分钟足够;> 1Kb需加长延伸时间,10Kb 片段延伸时间可达15分钟。
PCR技术概述
9
Taq DNA聚合酶(thermus aquaticus)
100
酶 80 活 性 60
40 20 40 50 60 70 80 90 100
(%)
温度(℃)
10
二、PCR技术的原理
1 PCR技术的基本原理
在微量离心管中,加入适量的缓冲液, 微量的模 板DNA,四种脱氧单核苷酸,耐热性多聚酶, 一对合成 DNA的引物,通过高温变性、低温退火和中温延伸三 个阶段为一个循环,每一次循环使特异区段的基因
35
(3)循环参数
Ⅰ变性的时间与温度
不同的DNA解链温度不同,由于DNA中
GC与AT的比例不同引起的。GC比例越大,
解链温度越高。
一般GC含量每增加1%,解链温度就增加
0.4℃。
典型的变性条件是95 ℃30s或97 ℃15s。
36
过高使聚合酶失去活性,过低DNA变性不完
全。
变性温度在90-95 ℃时,既能保证使DNA双
拷贝数放大一倍,一般样品是经过30次循环,最终使
基因放大了数百万倍; 扩增了特异区段的DNA带。
11
知识点回顾
5’ 3’ 解旋酶类 dNTP DNA聚合酶 引物
体内DNA的复制
12
加热或强酸、碱性作
用可以使 DNA双螺旋 加热
变 性
的氢键断裂,双链解离, 形成单链DNA,这称为 DNA的变性。 解除变性的条件后, 变
7
1988年初,Keohanog改用T4 DNA聚合
酶进行PCR,其扩增的DNA片段很均一, 真实性也较高,只有所期望的一种DNA 片段。但每循环一次,仍需加入新酶。
8
1988年Saiki 等从温泉中分离的一株水生嗜热杆菌(thermus aquaticus) 中提取到一种耐热DNA聚合酶。 此酶特点:①耐高温,在70℃下反应2h后其残留活性大于原来 的90%,在93℃下反应2h后其残留活性是原来的60%,在95℃ 下反应2h后其残留活性是原来的40%。②在热变性时不会被钝 化,不必在每次扩增反应后再加新酶。③大大提高了扩增片段特 异性和扩增效率,增加了扩增长度(2.0Kb)。由于提高了扩增的 特异性和效率,因而其灵敏性也大大提高。 为与大肠杆菌多聚酶I Klenow片段区别,将此酶命名为Taq DNA多聚酶(Taq DNA Polymerase)。此酶的发现使PCR广泛的 被应用。
核酸体外扩增技术综述
核酸体外扩增技术研究进展摘要体外核酸快速扩增技术是一种可使微量核酸在体外高效快速扩增的技术,自问世以来,被广泛应用于分子生物学、医学和法理鉴定等领域,并被不断改进,以使其功能和适应性更为广泛。
核酸体外扩增是分子生物学研究的基础。
随着生物技术的发展,出现了越来越多的核酸体外扩增技术。
就现有的核酸扩增技术的原理、特点及应用进行介绍。
关键词核酸体外扩增聚合酶链式反应(PCR)等温扩增核酸是由许多核苷酸聚合成的生物大分子化合物,为生命的最基本物质之一。
核酸广泛存在于所有动物、植物细胞、微生物内。
核酸大分子可分为两类:脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),在蛋白质的复制和合成中起着储存和传递遗传信息的作用。
核酸不仅是基本的遗传物质,而且在蛋白质的生物合成上也占重要位置,蛋白质是生命活动的表达物质,基因则是编码蛋白质的特异的核苷酸序列,因而核酸在生长、遗传、变异等一系列重大生命现象中起决定性的作用。
而在1983年人类第一次能够在体外扩增DNA之后,对核酸的操作和利用进入了一个全新的革命性的阶段,直到现在,体外核酸扩增技术仍然在不断地改进和完善,新的核酸扩增模式也不断涌现[1]。
一、聚合酶链式反应(PCR)PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚合酶链式反应,是指在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以特定引物为延伸起点,通过变性、退火、延伸等步骤,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA的过程。
是一项DNA体外合成放大技术,能快速特异地在体外扩增任何目的DNA。
可用于基因分离克隆,序列分析,基因表达调控,基因多态性研究等许多方面[2]。
聚合酶链式反应技术(PCR)自1985年问世以来,以其灵敏性、特异性和快速性在医学和分子生物等领域得到广泛的应用,由此可见核酸扩增技术的重要性。
近年来随着分子生物学的飞速发展以及生物物理技术的大量应用,新的核酸扩增模式也不断涌现。
已经建立起来的方法大体可分为两大类,靶核酸的直接扩增与信号放大扩增。
PCR技术(环境微生物)
PCR的三个反应步骤反复进行,使DNA扩增量呈指数上
升。反应最终的DNA 扩增量可用Y=(1+X)n计算。Y代表 DNA片段扩增后的拷贝数,X表示平(Y)均每次的扩增效率, n代表循环次数。平均扩增效率的理论值为100%,但在实 际反应中平均效率达不到理论值。
反应初期,靶序列DNA片段的增加呈指数形式,随着
三、PCR的成分和作用: 1. 缓冲液: 10 ~ 50 mM Tris- Cl (三氨基甲烷)(pH8.4) 维持 Taq 酶作用环境的偏碱性 25 ~ 50 mM KCl 促进引物退火,>50 mM 会抑制 Taq 酶的活性。
100μ g / ml 牛血清白蛋白 (BSA)
对酶有一定的保护性,如质量不好将起相反的作 用,建议使用乙酰化的 BSA。明胶、Tween-20、 二硫 苏糖醇 (DTT) 也有类似作用。
的目的片段;用于DNA杂交技术中DNA探针的制备;用于环
境生物多态性的分析。 • DNA探针是用生物素、荧光素等物质进行标记的能够与 待测基因进行特异性互补产生杂交信号的DNA片段。荧光 探针、寡聚核苷酸探针等已被应用于监测水中的大肠杆菌, 取得了很好的结果。为了更灵敏、快速的检测水中大肠杆 菌,目前DNA探针技术多于PCR技术结合使用。
扩增的特异性取决于引物与模板DNA的特异结合,基本反 应步骤分三步: 1. 变性 (Denaturation):
加热使模板DNA双链间的氢键断裂而形成两条单链。
94℃ 30″ 2. 退火 (复性) (Annealling): 突然降温后模板DNA与引物按碱基配对原则互补结 合,也存在两条模板链之间的结合,但由于引物的高浓度,结 构简单的特点,主要的结合发生在模板与引物之间。55 ℃ 30 ″
PCR的原理3
核酸扩增技术
• 核酸扩增技术概述 • 主要核酸扩增技术 • 核酸扩增技术的优缺点 • 核酸扩增技术的实验操作流程 • 核酸扩增技术的应用案例
01
核酸扩增技术概述
定义与原理
定义
核酸扩增技术是一种分子生物学 技术,通过特定的酶促反应,将 核酸片段在体外进行指数级扩增 ,以便进行后续的检测和分析。
原理
潜在的交叉污染风险
在实验过程中,如果操作不慎或仪器清洁不到位,可能导致交叉污染, 影响实验结果。
成本较高
虽然核酸扩增技术所需仪器设备和试剂已经逐渐标准化,但仍相对较 高,对于一些资源有限的地区和实验室来说可能存在经济压力。
04
核酸扩增技术的实验操作流程
样本处理
01
02
03
样本收集
采集具有代表性的样本, 确保样本质量。
qPCR技术
总结词
实时荧光定量聚合酶链式反应是一种在PCR反应过程中加入荧光标记,通过荧光信号的 积累实时监测PCR进程的技术。
详细描述
qPCR技术通过在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光探针,利用荧光信号的积累实时 监测PCR进程,最后通过标准曲线法对未知模板进行定量分析。该技术具有高灵敏度、 高特异性和可定量等优点,广泛应用于基因表达分析、突变检测和病毒载量测定等领域。
2000年代以后
随着测序技术的发展,新一代核酸 扩增技术如高通量测序、数字PCR 等逐渐崭露头角,广泛应用于生命 科学、医学等领域。
应用领域
01
02
03
04
基础研究
用于基因克隆、基因组测序、 基因表达分析等基础研究领域
。
临床诊断
用于检测和诊断遗传性疾病、 感染性疾病、肿瘤等疾病,如 HPV检测、HCV基因分型等
PCR技术原理与过程
PCR技术原理与过程PCR(Polymerase chain reaction,聚合酶链反应)是一种体外扩增DNA(脱氧核糖核酸)的技术,可以快速、高效地产生大量特定DNA序列。
其原理是通过反复性的DNA复制,扩增目标DNA片段。
PCR技术的原理基于DNA复制的自然过程,但在体外进行了精确控制和放大。
简单来说,PCR技术可以分为三个主要步骤:变性(denaturation),引物结合(annealing),和扩增(extension)。
1. 变性(denaturation):PCR首先通过升高温度将反应管中的DNA两链分离,使得两条DNA链变为单链。
这一步一般在94-98°C的高温下进行,DNA的高温变性使DNA链中的氢键断裂,使两条链分离。
2. 引物结合(annealing):在下一个步骤中,反应温度被降低至48-65°C的合适温度,使引物(primers)能够与目标DNA序列的特定部分配对结合。
引物是两段具有20-30个碱基的DNA片段,它们的序列与目标DNA序列的两个末端互补。
这样的引物结合可以使引物定向选择性地结合到目标DNA的两侧。
这是决定PCR中目标序列准确性的一个关键步骤。
3. 扩增(extension):一旦引物与目标DNA配对结合,扩增步骤就会开始。
在这一步骤中,反应温度升高至72°C,这是大多数DNA聚合酶的活性适宜的温度。
此时,酶复合物会沿着DNA模板链进行多轮DNA扩增,通过合成新的DNA链。
在这个过程中,DNA聚合酶依据模板链上的碱基进行DNA合成,并走向模板链的末端。
这样,生成了两条新的DNA链,每一条都是目标序列的镜像复制。
整个反应会多次循环进行,每一次循环都会产生指数级增加的DNA复制产物。
通过PCR技术的多个循环,可以产生大量目标DNA的复制产物。
理论上,PCR技术可以在几小时内从一份DNA样本中扩增成百上千倍的目标DNA序列。
PCR技术在基因工程、医学诊断、法医学和生物研究等领域具有广泛的应用。
简述pcr的原理特点及主要应用
简述PCR的原理、特点及主要应用1. PCR的原理PCR(聚合酶链式反应)是一种体外扩增DNA的技术,通过核酸酶的反应周期性产生的大量DNA分子,从而实现对特定DNA片段的扩增。
PCR的原理主要包括以下几个步骤:•Denaturation(变性):将DNA样本加热至95°C,使双链DNA变为单链。
•Annealing(退火):将温度降至50-60°C,使引物与DNA模板序列结合。
•Extension(延伸):将温度升至72°C,加入DNA聚合酶和碱基,合成新的DNA链。
•重复Denaturation、Annealing和Extension步骤,每次循环会使DNA数量翻倍。
通过多次循环,可以在短时间内扩增特定的DNA序列。
2. PCR的特点PCR具有许多独特的特点,使其成为现代分子生物学和遗传学研究的重要工具:•高度特异性:引物序列能够选择性地与目标DNA序列结合,减少非特异性扩增的可能性。
•高度灵敏性:PCR可以从极小的DNA样本中扩增特定序列,使其可用于DNA检测和分析。
•快速和高效:PCR反应时间短,扩增速度快,能够在几小时内扩增数百万个目标DNA分子。
•可靠性和重复性:PCR结果的可靠性高,重复性好,可以精确地扩增特定的DNA序列。
•多样性和灵活性:PCR可以用于不同类型的DNA样本,包括基因组DNA、RNA、血液、组织等。
3. PCR的主要应用由于PCR技术的独特优势,它在许多领域得到广泛应用,主要包括以下几个方面:3.1 分子诊断和疾病检测PCR可以用于检测和诊断许多疾病,包括感染病、癌症和遗传病等。
它能够从患者的体液、组织或细胞中扩增特定的病原体DNA或突变基因,为病理诊断和个体化治疗提供重要信息。
3.2 法医学和人类遗传学PCR被广泛应用于法医学和人类遗传学的研究中。
它可以用于DNA指纹鉴定,确定个人的身份或亲子关系。
此外,PCR还可以用于检测遗传病变、进行基因组学研究以及解决亲子关系和家族血统等问题。
简述PCR技术的原理和步骤及特点
简述PCR技术的原理和步骤及特点前言PCR(Polymerase Chain Reaction),即聚合酶链反应,是一种用于在体外大规模扩增DNA片段的核酸技术,也是分子生物学、遗传学和生物医学研究中最重要和常用的实验技术之一。
它具有高效、快速、敏感、特异性强等特点,广泛应用于基因重排、突变检测、基因表达分析、遗传疾病诊断等领域。
PCR技术的原理PCR技术的原理基于DNA的双链结构及DNA聚合酶的酶活性。
其中,PCR反应体系主要包含模板DNA、引物、dNTPs(脱氧核苷酸三磷酸盐)、DNA聚合酶和缓冲液。
具体步骤如下:1.变性:将PCR反应体系中的DNA在高温下(95℃)变性,使DNA双链解开成两个单链。
2.引物结合:将PCR反应体系温度降低(通常为50-55℃),使两个引物与模板DNA结合。
3.延伸:将PCR反应体系温度升高至DNA聚合酶的最适工作温度(通常为72℃),DNA聚合酶按照引物的序列导向,从引物的3’端开始延伸,合成新的DNA链。
4.重复步骤:重复以上步骤,不断进行DNA的变性、引物结合和延伸,形成指数级增加的DNA复制产物。
PCR技术的原理就是通过不断的循环变性、引物结合和延伸,使目标DNA片段在体外被扩增。
PCR技术的步骤PCR技术的具体步骤由一系列温度变化的PCR循环组成。
标准PCR循环通常包含以下几个温度阶段:1.变性:将PCR反应混合溶液加热至95℃,使DNA变性。
此步骤通常持续15-30秒。
2.引物结合:将PCR反应体系温度降至50-60℃,使引物与目标DNA片段结合。
此步骤通常持续20-30秒。
3.延伸:将PCR反应体系温度升至72℃,DNA聚合酶在此温度下最活跃,开始合成新的DNA链。
此步骤的时间由目标DNA片段的长度决定,通常为1分钟/千碱基。
重复以上循环,每个PCR循环会使目标DNA片段的数量翻倍,最终达到指数级的扩增。
PCR技术的特点PCR技术具有以下几个显著的特点:1.高效快速:PCR技术能在几个小时内扩增目标DNA片段,远远快于传统的DNA复制方法。
核酸扩增的原理
核酸扩增的原理核酸扩增是一种重要的分子生物学技术,用于在体外复制DNA或RNA的方法。
它是通过扩增目标序列的DNA或RNA分子量来分析其结构和功能,也是生物学研究、遗传病诊断、DNA指纹鉴定等领域的基础技术。
核酸扩增的原理主要包括选择适当的扩增方法、设计引物、选择适当的酶和酶的特性、反应条件的优化等。
核酸扩增的方法有多种,其中最常用的是聚合酶链式反应(PCR)。
PCR是一种体外扩增DNA的技术,它可以迅速复制少量DNA片段,从而在实验室中产生大量可用于分析的DNA。
PCR反应基于DNA的链式扩增原理,包括三个主要步骤:变性、引物结合和扩增。
变性是PCR反应的第一步,它是将DNA模板中的双链DNA分离为单链DNA 的过程。
这一步通过在高温下使DNA解离来实现。
当反应混合物中的DNA模板处于高温时,双链DNA的氢键会断裂,分离成两条单链DNA。
在扩增中,通常需要将反应混合物加热至94-98摄氏度。
引物结合是PCR反应的第二步,它是使引物与目标序列特异性结合的过程。
在这一步中,反应混合物降温,使引物与目标序列互补配对。
引物通常是由DNA 合成的寡核苷酸,具有与目标序列末端互补的核酸碱基序列。
一条引物是朝一个特定方向扩增目标序列的,而另一条引物是朝相反方向扩增目标序列的。
扩增是PCR反应的第三步,它是通过DNA聚合酶在引物的引导下合成新的DNA链的过程。
在这一步中,反应混合物升温至DNA聚合酶的最适温度(通常为55-72摄氏度),以使酶能够在引物的引导下合成新的DNA链。
DNA聚合酶首先会结合到引物的末端,然后向引物的反向方向移动,并合成与目标DNA 互补的新的DNA链。
这个过程会在每一轮循环中重复,每一轮都会产生新的DNA链。
PCR反应循环通常包括变性、引物结合和扩增三个步骤,并在一个反应体系中进行多次循环。
每一轮循环将产生两倍数量的目标DNA序列。
经过多轮循环后,PCR反应可以迅速产生高浓度的目标DNA序列。
核酸 pcr原理
核酸 pcr原理核酸PCR原理引言:核酸PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种重要的分子生物学技术,可在体外迅速扩增DNA片段或RNA序列。
它的原理是通过反复进行DNA的复制和扩增,使得少量的DNA片段增加到足够数量,以便进行进一步的分析或检测。
本文将详细介绍核酸PCR的原理及其应用。
一、PCR的基本原理PCR的基本原理是通过不断重复的循环反应来扩增目标DNA序列。
该反应主要由以下三个步骤组成:变性、引物结合和延伸。
1.1 变性PCR反应开始时,将PCR混合液中的DNA样本加热至95°C,这一步骤被称为变性。
高温使DNA双链解开,将其分离成两个单链DNA。
1.2 引物结合在变性后,PCR混合液降温至50-60°C,此时引物(寡核苷酸)与目标DNA序列的两个末端互补结合,形成引物-模板DNA复合物。
引物是在PCR反应开始前设计的,其序列与目标DNA序列的两个侧翼序列互补。
1.3 延伸在引物结合后,PCR混合液中加入DNA聚合酶,该酶能在适宜的温度下合成DNA。
聚合酶会在引物的3'端开始合成互补的DNA链,以引物为模板,向3'端延伸合成DNA。
二、PCR的循环反应PCR的循环反应包括多个温度变化步骤,以实现DNA的复制和扩增。
一般情况下,PCR反应会进行30-40个循环。
2.1 变性在每个循环的开始,PCR混合液中的DNA样本会被加热至95°C 进行变性,使DNA双链解开成两个单链。
2.2 引物结合随后,PCR混合液降温至50-60°C,引物与目标DNA序列的两个末端互补结合,形成引物-模板DNA复合物。
2.3 延伸在引物结合后,PCR混合液中的DNA聚合酶会在适宜的温度下合成DNA。
聚合酶以引物为模板,向3'端延伸合成DNA。
三、PCR的应用PCR技术广泛应用于医学、生物学、法医学和疾病诊断等领域,具有以下几个主要应用:3.1 基因检测与分型PCR可用于检测基因突变、基因型分型和基因重组等。
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2018/11/1 11
(三)PCR产物的积累规律
– DNA扩增过程遵循酶促动力学原理。 – 反应初期,目的DNA片段呈指数形式 (2n),随着目的DNA的积累,在引物— 模板与DNA聚合酶达到一定比例时,酶的 催化反应趋于饱和—平台期 。(25个循环)
(四)PCR反应的自动化
第十一章
2018/11/1 12
Байду номын сангаас
三、影响LCR的重要因素
㈠ 引物
基因的突变位点 长度足够
㈡ LCR的反应条件
第十一章
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第三节 RNA的体外扩增
RNA—PCR
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1. 转录依赖的扩增系统(transcript-based
amplification system, TAS)
2. 自主维持序列扩增或再生式序列复制
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一、LCR的基本原理
LCR是以DNA连接酶将某一DNA链的5′磷 酸与另一相邻链的3′羟基连接为基础的 循环反应。
第十一章
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第十一章
2018/11/1 23
二、LCR产物的检测
标记引物:
– 放射性标记 – 荧光素标记 – 地高辛标记
第十一章
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第十一章
底物:dNTP, NTP 模板: 缓冲液:
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二 、产物的检测
三、RNA—PCR技术的特点及应用
特点:
扩增效率极高 特异性强
应用:
第十一章
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检测RNA,RNA测序,临床诊断
31
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变性温度和时间 95℃/30 ~60s 退火温度和时间 45~55℃/30 ~60s 延伸温度和时间 72℃ 循环次数 25~30 不超过35
六、PCR中应注意的事项
PCR反应中可能出现的问题: 假阴性,不出现扩增条带 假阳性 出现非特异扩增带
第十一章
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PCR反应五要素: 引物、酶、dNTP、
模板和Mg2+
Taq DNA聚合酶
来自水生栖热菌 良好的耐热性 Mg2+依赖性 无校正功能
第十一章
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Thermusaquaticus
(二)、以mRNA为模板的反应
mRNA 5 l 5× Buffer 4 l dNTP 2 l(10mmol/L) RNasin 1 l(20u) AMV RTase 1 l(10u) Oligo(dT)12—18(或下游引物) 1 l ddH2O 6l /20 l
五、PCR反应条件的控制
(一)PCR反应的缓冲溶液
提供合适的酸碱度和某些离子
10~50mmol/L Tris-HCl缓冲液 50mmol/L KCl BSA或明胶
(二)镁离子浓度
Taq酶活性需要Mg2+ , Mg2+浓度过高导致非特异扩增。 一般常用1.5mmol/L
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第十一章
第十一章
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PCR反应的特点
特异性强: 2. 灵敏度高:PCR产物的生成量是以指数方式 增加的,能将皮克(pg=10- 12)量级的起始待 测模板扩增到微克(g=-6)水平 3. 简便、快速:PCR反应一般在2~4 小时完 成扩增反应。扩增产物一般用电泳分析,不 一定要用同位素,无放射性污染、易推广。
第十一章
42℃水浴1小时,95 ℃水浴10分钟灭活逆转 录酶。向上述反应体系中添加如下试剂: 2018/11/1
10
10× Buffer 5 l 25mmol/L Mg2+ 3l Taq酶 0.5 l(2.5u) 上游引物 1l ddH2O 20.5l /50 l
按PCR循环参数进行
RT--PCR
注意的事项:
(一)防止污染
试剂小量分装 吸头及EP管一次性使用 器皿及工作区域要分开,无菌操作
(二)设立对照:
阳性对照: 阴性对照: 试剂对照:
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第十一章
阳性模板 阴性模板 除模板外的所有组分
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七、PCR技术的主要类型
㈠ ㈡ ㈢ ㈣ ㈤ 筑巢PCR 多重PCR 不对称PCR 共享引物PCR 锚定PCR ㈥ ㈦ ㈧ ㈨ ㈩ 彩色PCR 原位PCR 定量PCR 差异显示PCR 重组PCR
四、PCR的基本反应
(一)、以DNA为模板的反应:
10×缓冲液 4种dNTP混合物 引物 模板DNA Taq DNA聚合酶 Mg2+ 加双或三蒸水至
第十一章
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10 l 各200 mol/L 各10~100 pmol 0.1~2 g 2.5 u 1.5 mmol/L 100 l
1.
第十一章
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4.对标本的纯度要求低: 不需要分离病毒或细菌及培养细胞, DNA 粗制品及总RNA均可作为扩增模板。 可直接用临床标本如血液、体腔液、洗嗽 液、毛发、细胞、活组织等粗制的DNA 扩增检测。
第十一章
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第二节 连接酶链反应
Ligase chain reaction LCR
(self-sustained sequence replication,3SR) 3. 核酸序列的扩增(nucleic acid sequence-based amplification, NASBA)
第十一章
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一、基本原理
以RNA为模板在体外大量扩增RNA
非循环相
逆转录 转录
循环相
聚合酶链式反应
第十一章
反应体系温度均一 RNA产物以10的指数方式增加
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第十一章
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RNA—PCR反应体系的组成
酶:
逆转录酶,RNase H, T7RNA聚合酶
引物:
引物A—与RNA3′端互补,5 ′端含启动子 引物B—与cDNA第一条链3′端互补
6. 3′端必须互补
第十一章
7.
5′端可游离
6
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三、模板的制备
DNA
1. 从细胞中提取DNA:血细胞、绒毛、尿 样、毛发、精斑、口腔上皮细胞 2. 固定和包埋的组织标本:脱蜡、蛋白酶K 消化
RNA
新鲜组织或细胞 所用器皿和试剂必需经高温灭菌或DEPC处 理
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第十一章
第十一章
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±äÐ Ô
90¡ «95¡ æ
70¡ «75¡ æ
Ñ Ó Éì
Í Ë»ð
40¡ «60¡ æ
第十一章
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二、PCR引物设计
1. 一对引物,与3′端互补 2. 长度:15~30个核苷酸
3. 碱基分布随机
4. 引物内、引物间不应有互补序列
5. 引物与非特异扩增区无同源性
医学分子生物学
盛 德 乔
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1
第十一章 核酸的体外扩增
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2
第一节 聚合酶链式反应
polymerase chain reaction PCR
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3
一、PCR的基本原理
PCR的基本原理 变性、复性、半保留复制 PCR三步曲 – 变性 90~97℃ – 退火 45~55℃ – 延伸 72℃左右
(三)底物浓度
dNTP浓度在20~200 mol/L 四种dNTP必须浓度相等
(四) Taq DNA聚合酶
Taq DNA聚合酶在70~80℃具有最高聚合活 性
第十一章
2018/11/1 14
(五)引物
引物浓度一般为0.1~ 0.5mol/L
(六)反应温度和循环次数
1. 2. 3. 4.
第十一章