PCR扩增实验操作步骤

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PCR扩增反应

一、实验原理

PCR:是一种选择性扩增DNA或RNA的方法,其基本原理是依据体内细胞分裂中的DNA半保留复制机理,以及在体外dNTP分子于不同温度下双链和单链可以互相转变的性质,人为地控制体外合成系统的温度,以促使双链DNA变成单链DNA;单链DNA与人工合成的引物退火,以及在dNTP存在下,耐高温的DNA聚合酶使引物沿单链模板延伸成为双链DNA。

PCR反应分3步:①变性:通过加热使DNA 双螺旋的氢键断裂,双链解离形成单链DNA;②退火:当温度突然降低时,由于模板分子结构较引物要复杂得多,而且反应体系中引物DNA量大大多于模板DNA,使引物和其互补的模板在局部形成杂交链,而模板DNA 双链之间互补的机会较少。③延伸:在DNA聚合酶和4 种dNTP底物及Mg2+存在的条件下,5'→3'的聚合酶催化以引物为起始点的DNA链延伸反应,以上3步为一个循环,每一循环的产物可以作为下一个循环的模板,数小时之后,介于两个引物之间的特异性DNA片段得到了大量复制,数量可达2×106~7拷贝。

变性

退火

延伸

图反应历程

二、实验材料

1·模板:细菌DNA 2·TsgDNA聚合酶3·dNTP混合液

4·10倍浓度PCR缓冲液5·2.5mmol/LMgCl2 6·RAPD引物:S14 S15 S18 S66 S74 S88 S97 S103 S110 S115 7·提取细菌DNA的相关试剂

三、操作步骤

1.细菌染色体DNA的提取(见上一组)

3·反应程序:

将RAPD反应试剂加入EP管中

轻混后用100ul石蜡油覆盖于反应混合液之上,防止样品在反复加热-冷却的过程中蒸发,盖好盖子

打开PCR反应仪输入以下反应数据

●94 摄氏度预变性5min

●94摄氏度变性40s

●40摄氏度退火40s

●72摄氏度延伸1min

将EP管放入仪器开始扩增,循环35次;72摄氏度延伸10min

仪器为Model MyGene 25 Plus

三、注意事项

1、PCR反应体系中DNA样品及各种试剂的用量都极少,必须严格注意吸样量的准确性

及全部放入反应体系中。

2、为避免污染凡是用在PCR反应中的Tip尖、离心管、蒸馏水都要灭菌;吸每种试剂

时都要换新的灭菌Tip尖。

3、加试剂时先加消毒三蒸水,最后加DNA模板和Taq DNA聚合酶。

4、置PCR仪进行PCR反应前,PCR管要盖紧,否则使液体蒸发影响PCR反应。

5.引物条件首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物与引物之间避免形成稳定二聚

体或发夹结构,再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应(即错配)。

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