核酸的化学组成课件
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C2’-endo(2E)
4’
O 2’ 1’
C3’- endo(3E)
C5’
N
O 4’ 3’
C2’-exo(E2)
1’ 2’
C5’
N
O
4’
2’ 1’
3’
C3’-exo(E3)
(2)扭转式 糖环的C2’和C3’都偏离平面而且偏离方向相反称 为扭转式折叠(Twist,简写为T )。如C2’-endo C3’-exo(23T), C2’-exo-C3’- endo(3T2) 。上述几种构 象可分别以侧视简图表示:
O
H3C
N
NH
O
N
O
H
N
O
H
2-氧-4-氨基嘧啶 5-甲基-2,4-二氧嘧啶
C
T
组成核酸的稀有碱基
核酸中除了5类基本的碱基外,还有一些含量甚 少的碱基,称为稀有碱基。
O
NH2
N
N
N
—CH3
NN
ON
I
DHU m5C
碱基的结构特征
碱基都具有芳香环的结构特征。嘌呤环和嘧啶 环均呈平面或接近于平面的结构。
H
H
OH OH
HOCH2 O OH HH
H
H
OH H
D-核 糖
D-2-脱 氧 核 糖
糖环的折叠构象
核酸中糖环的折叠形式是一个构象问题。
所谓构象是指化合物中可以自由转动的单键上的原子 或基团绕单键旋转或随单键扭转时产生的若干种不同 的空间排列形式;构象的改变不伴随着共价键的破坏。 构型是指共价键化合物分子中各原子在空间的相对排 列关系。由于共价键具有方向性,所以每一分子具有 一定的几何构型,如乳酸的D和L型、单糖的α和β型。 构型的改变涉及共价键的破坏。 核酸中的戊糖只有一种构型,即β- D型,但它们的构 象却有许多种。
C5’
2’ N
O
4’
1’
3’
C2’-endo -C3’-exo(32T)
C5’
3’
N
4’
O
1’
2’
C2’-exo-C3’- endo(3T2)
3.核苷 (nucleoside)
核苷由戊糖和碱基缩合而成,嘌呤的N9或嘧啶的 N1与戊糖C-1’-OH以C-N糖苷键相连接。 O
NH2 N
N
N
9 NN
核酸中戊糖的五元糖环不呈一个平面,其中的 C1’-O-C4’这3个原子一般在一个平面上,而C2’和 C3’偏离平面0.05~0.06nm,这种偏离就使糖环具 有不同的构象。若C2’或C3’偏离平面的方向与C5’ 同向,则称为内式(endo)构象;若与C5’反向, 则称为外式(exo)构象。
综合C2’和C3’偏离平面的情况,糖环的折叠形 式有两大类:
碱基的芳香环与环外基团可以发生酮式—烯醇 式或胺式—亚胺式互变异构。
胺 式 亚 胺 式 互 变 异 构
酮 式 烯 醇 式 互 变 异 构
已公认:氢原子在碱基上有固定的位置
2.戊糖
组成核酸的戊糖有两种。DNA所含的戊糖 为β-D-2-脱氧核糖;RNA所含的戊糖则 为β-D-核糖。
HOCH2 O OH HH
一、核酸的一般化学组分
DNA、RNA中主要的碱基、核苷和核苷酸
RNA DNA
戊糖 碱基
D-核糖
A
G
C
U
D-2-脱氧核糖 A G C T
核苷
腺苷A 鸟苷G 胞苷C 尿苷U 脱氧腺苷dA 脱氧鸟苷dG 脱氧胞苷dC 脱氧胸苷dT
核苷酸
5’-腺苷酸(AMP) 5’-鸟苷酸(GMP) 5’-胞苷酸(CMP) 5’-尿苷酸(UMP) 5’-脱氧腺苷酸(dAMP) 5’-脱氧鸟苷酸(dGMP) 5’-脱氧胞苷酸(dCMP) 5’-脱氧胸苷酸(dTMP)
(1)信封式 糖环的C2’和C3’中只有一个原子偏离平面则称为 信封式折叠(Envelope,简写为E )。如C2’-endo (2E),C2’-exo(E2),C3’- endo( 3E) ,C3’-exo( E3 )。上 述几种构象可分别以侧视简图表示:
C5’
2’ N
Fra Baidu bibliotek
C5’
3’
N
O
4’ 3’
1’
O-
NN OCH2 O
HH
H
H
OH OH 三磷酸腺苷 (ATP)
(2) GTP (鸟嘌呤核糖核苷三磷酸)
(3)环化核苷酸cAMP 和 cGMP
cAMP(3’,5’- 环腺嘌呤核苷一 磷酸)和 cGMP( 3’,5’-环鸟嘌 呤核苷一磷酸)的主要功能是 作为细胞之间传递信息的信使。
cAMP 和 cGMP 的环状磷酯键 是一个高能键。在 pH 7.4 条 件下, cAMP 和 cGMP 的水解 能约为43.9 kj /mol,比 ATP 水解能高得多。
一、核酸的一般化学组分 二、核酸的修饰组分 三、核酸及其组分的化学反应 四、核酸组分的分离鉴定
二、核酸的修饰组分
1948年Hotchkiss在小牛胸腺DNA中检测到 5-甲基胞嘧啶脱氧核苷,这使人们认识到, 除了基本组分外,核酸中还有一些特别的组分 存在。
到目前为止,核酸中发现了近80种特别的 组分,它们绝大多数是基本组分的衍生物,即 在碱基或核糖的某些位置上附加或取代掉某些 基团。把这些特别的组分称为修饰组分(也称 稀有组分或附加组分)。
HOCH2 O
HH
H H
OH H
dA
O
1 N
HOCH2 O
HH
H H
OH O H
U
假尿苷
胸腺嘧啶核糖核苷
稀有核苷(tRNA)
4.核苷酸 (nucleotide)
核苷酸是核苷的磷酸酯。作为DNA或RNA结构单元的核苷 酸分别是5′-磷酸-脱氧核糖核苷和5′-磷酸-核糖核苷。
O
HO P OH2C O B OH
O
HO P OH2C O B OH
OH OH
OH
核糖核苷酸
脱氧核糖核苷酸
B=腺嘌呤 ,鸟嘌呤 ,胞嘧啶 ,尿嘧啶 或胸腺密 啶
核苷酸的衍生物
(1) ATP (腺嘌呤核糖核苷三磷酸)
• ATP是生物体内分布最广和最重要的一种核苷酸衍生物。它的 结构如下:
NH2
N
N
O O- P
O-
O O- P
O-
O O- P
1.组成核酸的碱基
嘌呤
腺嘌呤 Adenine
鸟嘌呤 guanine
6
1N
5
7 N
2 N4N 8 39
NH 2 N
N
N H
N
A
O
N NH
N H
N
NH 2
G
1.组成核酸的碱基
尿嘧啶 胞嘧啶 胸腺嘧啶
嘧啶
4 3N 5
2
6
N
1
uracil
O
NH
N H
2,4-二氧嘧啶
U
cytosine thymine
NH 2
5.核苷酸的生物学作用
(1)参与DNA、RNA的合成、蛋白质的合成、糖 与磷脂的合成。
(2)在能量转化中起重要作用,ATP是生物体内 能量的通用货币。
(3)是构成多种辅酶的成分:NAD、NADP、FAD、 FMN和CoA。
(4)参与细胞中的代谢与调节(cAMP、cGMP)。
第一章 核酸化学组分的结构和性质