DNA拷贝数的计算方法

DNA拷贝数的计算方法

1 A260 吸光度值= ds DNA 50 ug/ml= ss DNA 33 ug/ml= ss RNA 40 ug/ml

核酸浓度=（OD260）×（dilution factor）×（33/40/50）= ng/ul

平均分子量（MW）代表克/摩尔，单位道尔顿（dolton），即1dolton=1g/mol

1摩尔=6.02×1023

平均分子量（MW）:

dsDNA=(碱基数) x (660 道尔顿/碱基)

ssDNA=(碱基数) x (330 道尔顿/碱基)

ssRNA=(碱基数) x (340 道尔顿/碱基)

拷贝数计算公式:

(6.02 x 1023次拷贝数/摩尔) x (浓度g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml.

(6.02 x 1023次拷贝数/摩尔) x (浓度g/ml) / (DNA长度×660) = copies/ml.

(6.02 x 1023次拷贝数/摩尔) x (ng/ul×10-9) / (DNA长度×660) = copies/ul.

例：3000 碱基质粒，浓度100 ng/ml ，MW = 3000 bp x 660 dalton/bp = 1.98 x 106 daltons，1 mol = 1.98 x 106g.

(6.02 x 10的23次拷贝数/摩尔) x (1x10的-7次克/微升) / (1.98 x 10的6次克/摩尔) = 3 x 1010次copies/ml.

梯度配制方法：低浓度使用胎盘DNA 20ng/ul；高浓度使用灭菌水配制，

20ng 基因组DNA所包含的拷贝数：6.02×3 x 1023 x20ng/2.91 x109 x660=6289个拷贝数。