常见限制性内切酶识别序列(酶切位点)
酶切位点汇总
酶切位点汇总
酶切位点，又称为限制性内切酶位点，是指DNA分子上特定的序列，这些序列是限制
性内切酶可以识别和切割的地方。
限制性内切酶是一种在细菌和其它生物中广泛存在的酶，能够切割或切除一个或多个DNA碱基对。
这些限制性内切酶在生物技术领域广泛应用，用
于DNA序列分析、DNA重组、基因工程等方面。
以下是常见的几种酶切位点：
1. EcoRI切割位点是5′-GAATTC-3′，这是一种广泛应用的限制性内切酶，通常用于DNA纯化、制备DNA载体等。
2. BamHI切割位点是5′-GGATCC-3′，BamHI能够切割链间，产生具有黏性末端的DNA 序列。
常被用于制备双链DNA的黏性末端。
4. PstI切割位点是5′-CTGCAG-3′，PstI是一种双切酶，可以切割成不同长度的DNA 序列，适用于构建多种不同长度的DNA分子。
总之，酶切位点及其对应的限制性内切酶在现代生物领域有着广泛的应用和重要的作用。
了解不同的酶切位点是有很大帮助的，它可以为实验设计和分子生物学研究提供基础。
同时，也让我们更好地理解限制性内切酶在DNA分子上的作用，帮助我们在生物技术领域
更加熟练地掌握其应用。
常用限制性内切酶酶切位点汇总情况
Aatll识别位点5；.. G ACGT\；H. .3^ 3•…CJGC AG, , .5JAcc65l识别位点5…G+M K AC …3，3. ..CA KMJG. . 5JAccl识别位点煮…Gl^K AC…3，3J. . CA KMJG. . 5JAcil识别位点5 …(ft GC …3’計…GG空…莎Acll识别位点5 …A A\；GTT .33\ .. T T G C^A A... 5^Acul识别位点5d.. CTG A AG(N)<;\ . . 3J 3d.. GACT TC(N)1<A... 5JAfel识别位点5. .. AGC^CT..,3P3. .. TCGJCGA.. 5JAflll 识别位点5…・C T T T A AG*…3・3：…G A A T T&” …5"Afllll 识别位点5：.. £CR¥(31■…Y &…TGYRqA^.5*Agel识别位点5P. . /fCCGGT ,..3J 3：…TGGCqA .…莎Ahdl识别位点5P. G ACNN F/N NGTC... 3P 3- CTGNI^NNNCAG^.5^Alel识别位点5；. .CACN I T NN GTG 3' 3. ..GTGNI^NNCAC. .. h Alul识别位点5P. .. A(jfcT….3P3…TQSA…hAlwl识别位点5 r,GGATC(N)7「3"3 …CCTAG(N)y £「AlwNl识别位点5：. CAGNNN T CTG..3F3；. GTC^NNNG AC.. .5*Apal识别位点5 .., GGGCtft. ..3P3\., C^CCGGG .ApaLl识别位点5\.. (^TGCAC.. ,3J3 .. CACGTjGApeKl识别位点5P. . . t^CWGC., .3r3\. CGWCjp., .5^Apol识别位点5；,. FLATTY,, ,3J3 , _ Y TTA AJl. T.5"Ascl识别位点5：., GtfCGCGCC. .33 CCGCGCJ J G, .5JAsel识别位点5 . B 4A T't A A T t. , 3J3 . .. T A A TJ A .. 5JAsiSl识别位点5...GCGAl1SGC r. 3r3...CGCJAGCG . .5Aval识别位点可…C TV CGRG…3」3：..GRGCYJ>..hAvall识别位点5：…dfewCC,.,3r3；., CCWG^.. 5JBamHlAvrll识别位点5... C T CT AGG . 3’…GGATCf…5」Bael识别位点5；^(NJACIN^GTAYCCNjJ 3 3.^^NJTGjN^CATRGtN)^ .5^识别位点吕,"・G E AT CC…3’3’…C C T A Gp -.. 5"Banl识别位点吕…G^YRCC^ 33 …CCRYQp^ .5JBanII识别位点5：.. GRGC Y^t …3",C A Y C G R G . ,,Bbsl识别位点5. .,GAAGAC (N)/ . .3r3J. .. 0 T T C T G 减丄…S'BbvCI识别位点5 …C(T T CAGC.”.3*3 …GGAGT A CG.,S JBbvl识别位点5 …GCAGCHN}；…3* 計…CQTCG(N)iar .5^Bccl识别位点5P. . CCATC(N)/,. 33\ , .GGTAG(N). -5rkBceAl识别位点5... ACGGCtNjJ. ,3^3：.. TGCCG(N)F「5*Bcgl识别位点5 . T4N)CGA(NK TGC(N)J . .3J 3；.^(N)GCT(N)；ACG{N)^.b5^BciVl识别位点5. r,GT ATCC (N)J .3F3. ..C AT AGG (N}t^ ..5P Bcll识别位点5... T'feATC A,- 3J 3：…ACT AGJ., 5JBfal识别位点5：.. (?T AG . .3r 苗…GA.C…hBfuAl识别位点5；. . ACCTGC(N)J 3’3. ..TGG ACG(N)^, .5^ Bgll识别位点5；. GCCNNNN^JGGC., 3P 3 . . CGGr^hlNNNCCG. , 5*Bglll识别位点莎…A T G T…3’3：”. TCTAt^A.. 5rBlpl识别位点5•…G(7TN AGO., -3J 3；., CGAN T；CG , .5^Bme1580l识别位点5 . . GKGCWit …才3 . . Q^MCGKG ,5J BmgBl识别位点h…C AC令TC…孑3 . . .GTGJ： AG. . 5*Bmrl识别位点5... ACTGGG(N) T r.3r 3... TGACCC(N)4r..5-Bmtl识别位点h…GCTA(?b …3’3\, C/3 ATCG …5」Bpml识别位点5 .… CTGGAG(N)1P T 3r 3... GACCTC(N)14j...5r BpulOI识别位点5’…CCT T N AGC …*33\., GGAN^CG .. 5BpuEl识别位点5；.. CT TG AG(N)r T,.3'3\.. GAACTC(N)…A...S' BsaAl识别位点5；.. YAC'GTR . .3^BsaBl识别位点5： ..GATNN^NATC , .3^ 3：, ,CTANN/1NTAG,. . 5^ BsaHl识别位点5P. . .GFitG YC . . ,3^3...C YGC^RG.. .5JBsal识别位点5... GGTCTC (N)/. .3^3... C C A G A G (N)^. . . 5' BsaJl识别位点5 c'b NNGG.. 3J3； GGNNC/3,. 5BsaWl识别位点5 . ., w'bCGGW, 3J3•…WGGC即…hBsaXl识别位点5 . ^NjACfN^CTCCtN),；. 3-3r ..(N)TG(N)r GAGG(N). .，& 丄p A BseRl识别位点5…GAG GAG的「…3"3... CTCCTC{N)-A….5PBseYl识别位点5\, CV： CAGC.,. 3J CT…GGGTQ3…可Bsgl识别位点5；.. GTGCAG^N^T. 3J3 ….CACGTC{Nj i4i.. . 5JBsiEI识别位点5, . , CGRY'fcG,, 3r3 . .. GC A YRGC . ,5"BsiHKAI识别位点5；…GWGCW七■…J3：..C^WCGWG.. .5BsiWI识别位点5.C'feT ACG, . 3r 3：…GC A TGJS. 5’Bsll识别位点5' . , CCNNNN I^INGG. , .3r 3；., GGN\NNNNNCC.. ,5J BsmAI识别位点5r ^GTCTC(N)7 .3ri3 . .. C AG AG(N).…h▲BsmBI识别位点5. r,CGTCTC (N)J .3F3. ..GC AGAG (N)s^ ..5BsmFI识别位点覚…GGGAC(N)(D T . 3* 占…CCCTG(N),-A. . .5JBsmI识别位点5 . . . G A A T G C N* . . 3J3. . CT T AC^SN ..5JBsoBI识别位点5P. ..CVCG AG. .,3P3 . ^GRGCY^C . .5^Bsp1286l识别位点5 ….GDGC“b_・F 3〔…qHCGDG …5’BspCNI识别位点5\. CTCAG(N)/ . .3 3：…G AGTC (叽…BspDI识别位点5\ . A T T C G A T , , . 3"3：…T A G qj A「SBspEI识别位点5 …T T CCGGA. . ,3J3 . r AGGCCJ- . 5JBspHI识别位点5 ... T T C ATGA3’…A G T A CJ…翼BspMI识别位点5. ACC TGC (N)/. r. 33. .. TGG ACGBspQI识别位点5 . GCTCTTClNjJ .33LXGAGAAGtN)*^ r MiBsrBI识别位点5 . . . CCdtTC, . .3r3 GGC^pAG. . .5^BsrDI识别位点5；. . GC AATGNN*, .3r3 ：…C G T T A QN N …乳BsrFI识别位点5；, .R^ CGG Y . .. 3"3 ., YGGCC^R …5“BsrGI识别位点5 . lIST ACA .3…AC ATGJ…创BsrI识别位点5：.. ACTGGN T, r孑3：. . TG ACJDN .,. 5^BssHII识别位点5P.., G*CGCGC .. ,3P3.,.CGCGqp.,5^BssKI识别位点5 . . .'tCNGG . .3：.. GGNCq…hBssSI识别位点5 .(T A CGAG ,, .3"3F GTGCTJC .. .5^BstAPI识别位点5..GCANNNIS T NTGCCGT\NNNNACG8G5 阴BI识别位点5 . k. T T'b G A A t, 3J3. . AAGCJ T T5JBstEII识别位点5：.. G'fe T N A C C .. . 3^3 ... CCAhl TGJS.. .5^BstNI识别位点5：..cd\VGG. . . 3P3 . ..GGWCC . . 55：..CTCAG(N)tt^-BstUI识别位点5：.. CG'faG,. .3^3 . .. GCJ3C.. .5^BstXI识别位点5 ANNNNI S T N TGG.,3J3 . f.GGTN A NNNNNACC (5)BstYI识别位点5…R先ATdS3\, YCTAG^R.. .5JBstZ17l识别位点5…GT fT AC…卽3\. CA T^ATG.. .5-Bsu36l识别位点5.…CC?TN AGG. . . 3r3-…G G A N T& C. 5"Btgl识别位点5；,. C?bHYGG,. .33；, GG YRC^C , ,5JBtgZI识别位点5…GCGATG㈣「…3」3；..CGCTAC(N),4J...5,BtsCI识别位点5；. .GCAGTG N N T33：.. C G T C A (^N N ... 5'BtsI识别位点5.,,GC AGTG N N T.3P3；.. C G T C A <^N N ...Cac8l识别位点GCN T NGC . 3J3：…CGN/ICG…密ClaI识别位点ATfcGAT.. . 3J3 …T AGCJ A T. 5CspCI识别位点5 :的CAA (N>( GTGG (N)^.,33：・+严JN) GTT (M), CACC(N}^1V，,5J CviAII识别位点5…C T G…:T3 r.. G T A^C . . S PCviKI-1 识别位点5...RG T C Y (3)才…¥C#GR…5’CviQI识别位点S'-.J J TAC ,.3J3：5枣…5’Ddel识别位点5；-. C^TNAG.. .3J3；, G AN\C.Dpnl识别位点Ch,5 G A T C 3 3；. CT AG 5’DpnII识别位点5；r T GATC..33：r, CT AG^ . 5JDral识别位点5；.. T T T^AA …3’3\Rt A A A/TT . , 5JDralll 识别位点5；h CACNNN'bTG. . ,3“3…GT砂Nhl SC…5」Drdl识别位点5 . , GACNNNN T NWGTC, ,3 3：. . CTGNN^NNNNCAG., .5^Eael识别位点5“…gGCCR …;T3 . ..RCCGG/ .. 5JEael识别位点5, ^YfeGCCR, . 3J..RCCGG/ .Eagl识别位点5... C^SGCCG .3 .. GCCGGf. .Earl识别位点5 …CTCTTC (N)t\ .r3... GAGA AG (N)^. ..5PEcil识别位点5. . .GGCGGA(N)J . .3^GCCT (N)S A.., 5JEcoNI识别位点5： . . CCTNt/NNNAGG 33 . . GG ANNN^NNTCC . 5E CO O 109I识别位点5P. . R(jfeNCC Y …:TS^.YCCNG/SR . . .5EcoP15l识别位点5 r C AGCAG(N)/ . P3r3 …GTCGTC(Wy 5EcoRI识别位点5 . ., A T T C ... 3 r 3；. . CTT AEcoRV识别位点5.GAT^TC -,3*3：.. CT AJ AG.. .5JFatl识别位点5：・先ATG…3」3\t GTAC^ .. 5’Faul识别位点5J CCCGC (N}J.. .3' 3；.. GGGCG (N)#A. . ,5J Fnu4HI识别位点昭…GC’NGC…朝3... CGN&G -SFokl识别位点5\L.GGATG(N)；1T3J3... CCTACtN),^ .5Fsel识别位点5 …GGCCGG'tc, .33 . CC/3GCCGG . . 5J Fspl识别位点5；,. TGC^bC A .. .3P3 ； ,. A C GJC G T (5)Haell识别位点5 RGCGC T Y. . .33 …LCGCGR …5，HaelllHgal识别位点5 . . .GACGC^N}/. 3... CTGCG<N}1(W. . 5" Hhal识别位点5 …GCdt …3" 宙…中CG…5，Hindi识别位点5：f GT Y T R AC.. .3r3\ .. CAR A YTG fHin dlll 识别位点5；. , A'A G C T T .…3" 3... TTCGA^A., .5JHi nfl识别位点5’ …GklMTC …3 3\., CT NAJG., .5* HinPII识别位点亦…dtGC…:r3 ... CGCp . . 5* Hpal识别位点5. .. GTT> AC.. .T3.., C A AJTG. _5J Hpall识别位点5“...cffeGG (3)3. GGC A C. 5JHphl识别位点51 …GGTGA (N)/.,.3, 3；.. CC AC T (N)7i,., 5" Hpy188l识别位点5 …T G “G A「3A0J CT …£Hpy188lll识别位点5.,TtfNNGA. ..3^3.,AGNN^CT. , ,5JHpy99l识别位点5；.. CGWCG T3：F i GCWGC.. ,5^HpyA V识别位点5.h CCTTC(N)J,3-3：. GGAAG(Nk ...5*%HpyCH4III识别位点h…A C N’G T …3"3 .,. T G^N C A … .5 HpyCH4IVHpyCH4Vm别位点5；., Tdt A., .33\,. A(^3T, . .5JKasl识别位点5.., G^J CGCC.,3P3r.^CCGCG^,..5J Kpnl识别位点5.,, GGT AC't... 3^3■…QCATGG …5，Mbol识别位点5P. .^3ATC .3^ 3P.. CT AG^. .5^Mboll识别位点5；., GA AGA (N「…3* 3；,, C T T C T (N)J A，. .5* Mfel识别位点5；.. C'X ATTG. ..3^3；T . GTT A Ajp . . 5JMlul识别位点5... /T CGCGT.,，3r3 ：.. T G C G C^A ... 5JMlyl识别位点5 …GAGTC(N, 一33\. .CTCA G (N) . 5-Mmel识别位点5； . .TCC RAC(N)M T.3' 3： . ,AG G YTG(NJ ia>. ..5*MnII识别位点5 ….CC「C (N}/ . 3 3…GGAG㈣立,5-Mscl识别位点5 , F TG(?fc：C A t,3P 3"…ACC^J GT.+J5JMsel识别位点5... f*T A A.. 3P3；T. A A TJ .. . 5^Msll识别位点5 …CAYNNV IN RYG. .,3J3 ...GTRNN^NNYAC (5)MspAII识别位点5P. . . CMCSfcKG, . .3 3•…GKYMC…扩Mspl识别位点5；F. dfcGG …3’3；. . GGqp …5’Mwol识别位点5 . . G C N N N N NVj N G C.. . 3\_ CGNN^NNN NNCG., Nael识别位点5 ... GCC\3GC,. .3r 3：…GGG&GG-.hNarl识别位点5 …GG^t GCC.. .3 3…CCGQGG …5“Ncil识别位点5 .C(7SGG,. ,3r 肚…GGS&C…・h Ncol识别位点5. ,,C T CATGG,. .3*3\ ,. G G T A CJ3 ... 5JNdel识别位点5； ., C /T T A T G ,. 3^ 3... GT A\AC…hNgoMlV识别位点5 . _ (itCGGC,. 3^ 3•…CGGCC^G. . 5Nhel识别位点5 . • T AGO . .,3"3 …GGATqp …hNlalll 识别位点亍…CATCf…3’AG…hNlalV识别位点5\,. GGt/NCC-.3 .. CCN^NGG.. .5JNmeAlll识别位点5：.. GCCGAG{N—G 3 ...CGGCTC(N)ia.^.^5rNotl识别位点5〔GdtGCCGC …;r3 ...CGCCGtyCG (5)Nrul识别位点5 . BT TCG^GA …3J3 …MCFCT …hNsil识别位点5 .ATGC^T T .. .3^ 3... I^ACGTA .. ,5JNspl识别位点5 . RCATG T Y. . 3J 3；.，X h GTACR.,.5rPacl识别位点5...TTAAf r TAA...3-3：+ , A ATJ A ATT T J+5JPaeR7l识别位点5；.. CG AG . ,3P. +G AGCTJC , . 5JPcil识别位点5：…A%島TGT….3*3* . . TGT A CA.. .S,APfIFl识别位点5；, .GAChiVlNGTC .…扩3 . . . C T G N N A N C A G ... 5* PflMI识别位点5； .. C C A N N N wTl T G G.. . 3^ 3；^GGTN A NNNNACC., .5^ Phol识别位点5：...GGfcC (3)3：. CCjjG.. 5JPlel识别位点5\.. GAGTC .3* 3：. CTCAG (N),,. hMiPmel识别位点5：. GTTT^AAC. . .3J3；.T C AAAJ T TG.T 5JPmll识别位点5；,, C AC^TG.. .33P.. GTGJ：AC- .5HPpuMI识别位点5 , h RdTj W c C Y ・”，3“3；_ YCC WGJ3R ., 5J PshAI识别位点5；ACNl7NNGTC . +.3J3 , . .CTGNNJNNC AG . .5'Psil识别位点5；., TT^T A A…X .. A A T A T T ... S HJLPspGl识别位点5 …1tC WGG …3“3；r,GG WCC^ ,.5PspOMI识别位点5；,. (fGGCCC.,. 3 3：…CCCGGJ3…5’PspXl识别位点5 V(7T CGAGB . b3J3. 8GAGC\CV.. .5* Pstl识别位点5 …CTGC 屆.33；. . G^ACGTC-. S-Pvul识别位点5 …CG ATEG …3" 3；.. GCJ AGC. . . 5JPvull识别位点5；…CAtSfcTG…富. . G T CJ3 A C ... 5^Rsal识别位点5...GT^C (3)3... CAJG.. .5*Rsrll识别位点5；, ,C(?fewCCG.. .3' 3：…GGC W枣C…hSacl识别位点5 GAGCT^ ,3J3；CJCGAG, . 5JSacll识别位点热…CCGC七G 23 .. GGjpGCC . 5JSall识别位点5 G T TCGAC,. 3J 3…CAGCT^S …hSapl识别位点5； .-GCTCTTCtN)^ ,3J 3 . r,CGAGAAG(N)(j.TJ5JSau3AI识别位点5 .. 7G A T c .,. 3^ 3：.. CT AG^..5JSau96l识别位点5... G^SNCC . . 33 …CCNGa ・hSbfl识别位点TGCA T GG.,y 3.., GG/CGTCC , 5’Seal识别位点5：.. A G T鼻C T ...甞3\,. TC AJGA . _5JScrFI识别位点5 ... CCT N GG.. 33\. GGNJSC , . 5JSexAl识别位点5 , .rfbCWGGT., ,3r3 …TGGWCqA. - SSfaNI识别位点5.., GC ATC (N)/ ,.. 3* 3J.,. CGT AG (N)9A，.. 5*Sfcl识别位点5：…(?TR¥AG …;T 3：. .GAYRT^C. . ,5Sfil识别位点5…GGCCNNNhTNGGCC .,3 3. ,CCGGN/tNNNCCGG .5'Sfol识别位点5；., GGC^CC ... 3J 3：…CCGfGG …5，SgrAI识别位点5 …C R’C CG G ¥ G …3"3. ,.G YGGCC jt AC,,,5HSmal识别位点5；., CCC^GG. . 3r3 …GEGfCC 一5"Smll识别位点S^.C T T Y R AG (3)3"…GARY .C …/SnaBI识别位点5 …T Ad A …3’3P r. A T G^： A T .. S HSpel识别位点5；. . zTCJ AGT . ,3r 3：…TGATC^A …hSphl识别位点5.GCATG'fe.. 3J3... CpT ACG . 5Sspl识别位点5 . A AT^TT 3P3. . . T T AJ AA . .5*Stul识别位点5. R1AGdtCT . ,.3f 3：…TCCJSGA. .5HStyD4l识别位点5 .. T CCNGG.,.『3’…GGNCq…5“Styl识别位点5仁C T CWWG G.. ,3r3；, GGWWC A C..Swal识别位点5 . , , A T T TV A A T ・・33 . h. T A A A J T T A ... 5^Taq a l识别位点5：.. T^G A . . ,33：…AGCJ ., 5JTlil识别位点5... <T T CGAG,,. 3J 3…GAGC"…5"Tsel识别位点5 …gfcwGC …3，3 …CGWQG …Tsp45l识别位点5；, ^STS AC.. 33\. .C ASTG^ . 5JTsp509l识别位点5….V A T T… 3-于…TT A. 5“TspMI识别位点C T CCGGG…3’3’…GGGCCf •…5’TspRI识别位点5 .NNCASTGNN T. ,3J3 .. ^NNGTSACNN., .5*Tth111l识别位点5P. . .GACN T NNGTC..3P3'…GTGN 叫NGAG-hXbal识别位点ftT AGA .3’…A G A T GJ…亍Xcml识别位点ANNNN N T J NNNTGG. 33. . .GGTNN N N^NNNNNACC. . 6Xhol识别位点占…C T TCGAG- 33 …GAGC T& …5"Xmal识别位点5：…CtCGGG…計3；.. GGGCqC . . .5*Xmnl识别位点5..,GA ANNVlN T TC . . 3r 3\ .. C T T N NJM N A A G .,.Zral识别位点5：. ,G AC T GTC■…孑3；, CTG A CAG...5-Tfil识别位点5 , . .G^WTC., .3 3 , . XT W .5。
限制性内切酶酶切位点汇总
限制性内切酶酶切位点汇总限制性内切酶（Restriction Endonuclease）是一类存在于细菌体内的酶，它能够识别特定的酶切位点，并在该位点上切割DNA链。
限制性内切酶起源于细菌，原本作为细菌对抗噬菌体感染的防御机制，但现在被广泛应用于分子生物学和基因工程领域。
限制性内切酶的分类和命名依据它们发现的第一个类型的噬菌体。
如EcoRI是从大肠杆菌中分离出的内切酶，与T4噬菌体相关；HindIII是与T4噬菌体有关的内切酶等。
酶名中的缩写首字母通常是酶切位点的首字母，比如EcoRI是指E.coli的RY粘性末端的切点。
现在限制性内切酶已被发现有超过3000多个类型。
下面是一些常见的限制性内切酶的切割位点汇总：1. EcoRI：切割位点为G↓AATTC（↓表示切割位点），产生的切割后的两个DNA片段是G-AATTC和CTTAA-G。
2. HindIII：切割位点为A↓AGCTT，产生的切割后的两个DNA片段是A-AGCTT和TTCGA-A。
3. SmaI：切割位点为CCC↓GGG，产生的切割后的两个DNA片段是CCC-GGG和GGG-CCC。
4. BamHI：切割位点为G↓GATCC，产生的切割后的两个DNA片段是G-GATCC和CCTAG-G。
5. XhoI：切割位点为C↓TCGAG，产生的切割后的两个DNA片段是C-TCGAG和GAGCT-C。
6. NotI：切割位点为GC×GGCCGC，产生的切割后的两个DNA片段是GC-GGCCGC和CGC-GC。
7. EcoRV：切割位点为GAT↓ATC，产生的切割后的两个DNA片段是GAT-ATC和TAC-TAG。
8. KpnI：切割位点为GGTAC↓C，产生的切割后的两个DNA片段是GGTAC-C和CCATG-G。
9. SalI：切割位点为G↓TCGAC，产生的切割后的两个DNA片段是G-TCGAC和CAGCT-G。
10. PstI：切割位点为CTGCA↓G，产生的切割后的两个DNA片段是CTGC-AG和GACG-T。
常用限制性内切酶酶切位点总结
常用限制性内切酶酶切位点总结————————————————————————————————作者：————————————————————————————————日期：Acc65I识别位点AccI识别位点AciI识别位点AclI识别位点AcuI识别位点AfeI识别位点AflII识别位点AflIII识别位点AgeI识别位点AhdI识别位点AleI识别位点AluI识别位点AlwI识别位点AlwNI识别位点ApaI识别位点ApaLI识别位点ApeKI识别位点ApoI识别位点AscI识别位点AseI识别位点AsiSI识别位点AvaI识别位点AvaII识别位点AvrII识别位点BaeI识别位点BamHI识别位点BanI识别位点BanII识别位点BbvCI识别位点BbvI识别位点BccI识别位点BceAI识别位点BcgI识别位点BciVI识别位点BclI识别位点BfaI识别位点BfuAI识别位点BglI识别位点BglII识别位点BlpI识别位点Bme1580I识别位点BmgBI识别位点BmrI识别位点BmtI识别位点BpmI识别位点Bpu10I识别位点BpuEI识别位点BsaAI识别位点BsaBI识别位点BsaHI识别位点BsaI识别位点BsaJI识别位点BsaWI识别位点BsaXI识别位点BseRI识别位点BseYI识别位点BsiEI识别位点BsiHKAI识别位点BsiWI识别位点BslI识别位点BsmAI识别位点BsmBI识别位点BsmFI识别位点BsmI识别位点BsoBI识别位点Bsp1286I识别位点BspCNI识别位点BspDI识别位点BspEI识别位点BspHI识别位点BspMI识别位点BspQI识别位点BsrBI识别位点BsrDI识别位点BsrFI识别位点BsrGI识别位点BsrI识别位点BssHII识别位点BssKI识别位点BssSI识别位点BstAPI识别位点BstBI识别位点BstEII识别位点BstNI识别位点BstXI识别位点BstYI识别位点BstZ17I识别位点Bsu36I识别位点BtgI识别位点BtgZI识别位点BtsCI识别位点BtsI识别位点Cac8I识别位点ClaI识别位点CspCI识别位点CviAII识别位点CviKI-1识别位点CviQI识别位点DdeI识别位点DpnI识别位点DpnII识别位点DraI识别位点DraIII识别位点DrdI识别位点EaeI识别位点EaeI识别位点EagI识别位点EarI识别位点EciI识别位点EcoNI识别位点EcoO109I识别位点EcoP15I识别位点EcoRI识别位点EcoRV识别位点FatI识别位点FauI识别位点Fnu4HI识别位点FokI识别位点FseI识别位点FspI识别位点HaeII识别位点HaeIIIHgaI识别位点HhaI识别位点HincII识别位点HindIII识别位点HinfI识别位点HinP1I识别位点HpaI识别位点HpaII识别位点HphI识别位点Hpy188I识别位点Hpy188III识别位点Hpy99I识别位点HpyAV识别位点HpyCH4III识别位点HpyCH4IV HpyCH4V识别位点KasI识别位点KpnI识别位点MboI识别位点MboII识别位点MfeI识别位点MluI识别位点MlyI识别位点MmeI识别位点MnlI识别位点MscI识别位点MseI识别位点MslI识别位点MspA1I识别位点MspI识别位点MwoI识别位点NaeI识别位点NarI识别位点NciI识别位点NdeI识别位点NgoMIV识别位点NheI识别位点NlaIII识别位点NlaIV识别位点NmeAIII识别位点NotI识别位点NruI识别位点NsiI识别位点NspI识别位点PacI识别位点PaeR7I识别位点PciI识别位点PflFI识别位点PflMI识别位点PhoI识别位点PleI识别位点PmeI识别位点PmlI识别位点PpuMI识别位点PshAI识别位点PsiI识别位点PspGI识别位点PspOMI识别位点PspXI识别位点PstI识别位点PvuI识别位点PvuII识别位点RsrII识别位点SacI识别位点SacII识别位点SalI识别位点SapI识别位点Sau3AI识别位点Sau96I识别位点SbfI识别位点ScaI识别位点ScrFI识别位点SexAI识别位点SfaNI识别位点SfcI识别位点SfiI识别位点SfoI识别位点SgrAI识别位点SmaI识别位点SmlI识别位点SnaBI识别位点SpeI识别位点SphI识别位点SspI识别位点StuI识别位点StyD4I识别位点StyI识别位点SwaI识别位点TaqαI识别位点TfiI识别位点TseI识别位点Tsp45I识别位点Tsp509I识别位点TspMI识别位点TspRI识别位点Tth111I识别位点XbaI识别位点XcmI识别位点XhoI识别位点XmaI识别位点XmnI识别位点ZraI识别位点。
常见限制性内切酶识别序列
常见限制性内切酶识别序列(酶切位点)（BamHI、EcoRI、HindIII、NdeI、XhoI等）Time：2009-10-22 PM 15:38Author:bioer Hits: 7681 times在分子克隆实验中，限制性内切酶是必不可少的工具酶。
无论是构建克隆载体还是表达载体，要根据载体选择合适的内切酶（当然，使用T 载就不必考虑了）。
先将引物设计好，然后添加酶切识别序列到引物5' 端。
常用的内切酶比如BamHI、EcoRI、HindIII、NdeI、XhoI等可能你都已经记住了它们的识别序列，不过为了保险起见，还是得查证一下。
下面是一些常用的II型内切酶的识别序列，仅供参考。
先介绍一下什么是II型内切酶吧。
The Type II restriction systems typically contain individual restriction enzymes and modification enzymes encoded by separate genes. The Type II restriction enzymes typically recognize specific DNA sequences and cleave at constant positions at or close to that sequence to produce 5-phosphates and 3-hydroxyls. Usually they require Mg 2+ ions as a cofactor, although some have more exotic requirements. The methyltransferases usually recognize the same sequence although some are more promiscuous. Three types of DNA methyltransferases have been found as part of Type II R-M systems forming either C5-methylcytosine, N4-methylcytosine or N6-methyladenine.酶类型识别序列ApaIType II restrictionenzyme5'GGGCC^C 3'BamHIType II restrictionenzyme5' G^GATCC 3'BglIIType II restrictionenzyme5' A^GATCT 3'EcoRIType II restrictionenzyme5' G^AATTC 3'HindIIIType II restrictionenzyme5' A^AGCTT 3'KpnIType II restrictionenzyme5' GGTAC^C 3'NcoIType II restrictionenzyme5' C^CATGG 3'NdeIType II restrictionenzyme5' CA^TATG 3'NheIType II restrictionenzyme5' G^CTAGC 3'NotIType II restrictionenzyme5' GC^GGCCGC 3'SacIType II restrictionenzyme5' GAGCT^C 3'SalIType II restrictionenzyme5' G^TCGAC 3'SphIType II restrictionenzyme5' GCATG^C 3'XbaIType II restrictionenzyme5' T^CTAGA 3'XhoIType II restrictionenzyme5' C^TCGAG 3'要查找更多内切酶的识别序列，你还可以选择下面几种方法：1. 查你所使用的内切酶的公司的目录或者网站；2. 用软件如：Primer Premier5.0或Bioedit等，这些软件均提供了内切酶识别序列的信息；3. 推荐到NEB的REBASE数据库去查（网址：/rebase/rebase.html）当你设计好引物，添加上了内切酶识别序列，下一步或许是添加保护碱基了，可以参考：NEB公司网站提供的关于设计PCR引物保护碱基参考表下载（也可见图片）双酶切buffer的选择（MBI、罗氏、NEB、Promega、Takara）再给大家推荐一种新的不需要连接反应的分子克隆方法，优点包括：①设计引物不必考虑选择什么酶切位点；②不必考虑保护碱基的问题；③不必每次都选择合适的酶来酶切质粒制备载体；④而且不需要DNA连接酶；⑤假阳性几率低（因为没有连接反应这一步，载体自连的问题没有了）。
史上最全限制性内切酶酶切位点汇总
专业资料分享A系列Aatll识别位点…G ACGT匕…一丁3：.. CJGC AG,, .5^Acc65l识别位点5…GFMK AC …3，3一. CA KMJG. . 5JAccl识别位点5…Gl\lK AC …丁3J. . CA KMJG. . 5JAcil识别位点5 …dtGC …3’ 宙…GG空…莎Acll识别位点5 …A A\；GTT .33\ .. T TG* A (X)Acul识别位点5；. CTG A AG(N). \ . . 3J 3d.. ,GACTTC(N)U A... 5J Afel识别位点5\.. AGC^CT..,3,3 …TCGJCGA..,5JAflll 识别位点5 …(fTT A AG…3，3：…G A A T T& …5"Afllll 识别位点5；.. ^CRYGT , ,3 3：…TGYRqA. . ,5Agel识别位点5P. . /fCCGGT , . .3J3；. . TGGCC^A. , .5^ Ahdl识别位点5P. G ACNN F/N NGTC... 3P 3- CTGNI^NNNCAG^.S^ Alel识别位点5；. .CACNt/NNGTG 3' 3. ..GTGNI^NNCAC, .. h Alul识别位点5 . .. A(jfcT….3P 3…TQSA-SAlwl识别位点5 r,GGATC(N)7「3"3. .. CCTAGIN)^..^AlwNl识别位点5：. CAGNNN T CTG..3F 3；. GTC^NNNG AC.. .5*Apal识别位点5 .., GGGCtft. ..3P3\., C^CCGGG .ApaLl识别位点5\.. (^TGCAC.. ,3J3 .. CACGTjGApeKl识别位点5P. . . t^CWGC., .3r3\. CGWCjp., .5^Apol识别位点5；,. FLATTY,, ,3J3 , _ Y TTA AJl. T.5"Ascl识别位点5：., GG^bGCGCC, .33 CCGCGCJ J G, .5JAsel识别位点5 . B 4A T't A A T t. , 3J3 . .. T A A TJ A .. 5JAsiSl识别位点5...GCGAl1SGC r. 3r3...CGCJAGCG . .5Aval识别位点可…C TV CGRG…3」3：..GRGCYJ>..hAvall识别位点5：…dfewCC,.,3r3；., CCWG^.. 5JAvrll识别位点5... C T CT AGG .3’…GGATCf…5」Bael识别位点5；^(NJACIN^GTAYCCNjJ 33.^^NJTGjN^CATRGtN)^ .5^识别位点吕,"・G E AT CC…3’BamHl专业资料分享3’…C C T A Gp -.. 5"Banl识别位点吕…G^YRCC^ 33 …CCRYQp^ .5JBanII识别位点5：.. GRGC Y^t …3",C A Y C G R G . ,,Bbsl识别位点5. .,GAAGAC (N)/ . .3r3J. .. 0 T T C T G 减丄…S' BbvCI识别位点5 …C(T T CAGC.”.3*3 …GGAGT A CG.,S JBbvl识别位点5 …GCAGCHN}；…3* 計…CQTCG(N)iar .5^Bccl识别位点5P. . CCATC(N)/,. 33\ , .GGTAG(N). -5rkBceAl识别位点5... ACGGCtNjJ. ,3^3：.. TGCCG(N)F「5*Bcgl识别位点5 . T4N)CGA(NK TGC(N)J . .3J 3；.^(N)GCT(N)；ACG{N)^.b5^BciVl识别位点5. r,GT ATCC (N)J .3F3. ..C AT AGG (N}t^ ..5PBcll识别位点5... T'feATC A,- 3J3：…ACT AGJ., 5JBfal识别位点5：.. (?T AG . .3r苗…GA.C…hBfuAl识别位点5；. . ACCTGC(N)J 3’3. ..TGG ACG(N)^, .5^Bgll识别位点5；. GCCNNNN^JGGC., 3P3 . . CGGr^hlNNNCCG. , 5*Bglll识别位点莎…A T G T…3’3：”. TCTAt^A.. 5rBlpl识别位点5•…G(7TN AGO., -3J3；., CGAN T；CG , .5^Bme1580l识别位点5 . . 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C AG AG(N).…h▲BsmBI识别位点5. r,CGTCTC (N)J .3F3. ..GC AGAG (N)s^ ..5BsmFI识别位点覚…GGGAC(N)(D T . 3* 占…CCCTG(N),-A. . .5JBsmI识别位点5 . . . G A A T G C N* . . 3J3. . CT T AC^SN ..5JBsoBI识别位点5P. ..CVCG AG. .,3P3 . ^GRGCY^C . .5^Bsp1286l识别位点5 ….GDGC“b_・F 3〔…qHCGDG …5’BspCNI识别位点5\. CTCAG(N)/ . .3 3：…G AGTC (叽…BspDI识别位点5\ . A T T C G A T , , . 3"3：…T A G qj A「SBspEI识别位点5 …T T CCGGA. . ,3J3 . r AGGCCJ- . 5JBspHI识别位点5 ... T T C ATGA3’…A G T A CJ…翼BspMI识别位点5. ACC TGC (N)/. r. 33. .. TGG ACGBspQI识别位点5 . GCTCTTClNjJ .33LXGAGAAGtN)*^ r MiBsrBI识别位点5 . . . CCdtTC, . .3r3 GGC^pAG. . .5^BsrDI识别位点5；. . GC AATGNN*, .3r3 ：…C G T T A QN N …乳BsrFI识别位点5；, .R^ CGG Y . .. 3"3 ., YGGCC^R …5“BsrGI识别位点5 . lIST ACA .3…AC ATGJ…创BsrI识别位点5：.. ACTGGN T, r孑3：. . TG ACJDN .,. 5^BssHII识别位点5P.., G*CGCGC .. ,3P3.,.CGCGqp.,5^BssKI识别位点5 . . .'tCNGG . .3：.. GGNCq…hBssSI识别位点5 .(T A CGAG ,, .3"3F GTGCTJC .. .5^BstAPI识别位点5..GCANNNIS T NTGCCGT\NNNNACG8G5 阴BI识别位点5 . k. T T'b G A A t, 3J3. . AAGCJ T T5JBstEII识别位点5：.. G'fe T N A C C .. . 3^3 ... CCAhl TGJS.. .5^BstNI识别位点5：..cd\VGG. . . 3P3 . ..GGWCC . . 55：..CTCAG(N)tt^-专业资料分享BstUI识别位点5：.. CG'faG,. .3^3 . .. GCJ3C.. .5^BstXI识别位点5 ANNNNI S T N TGG.,3J3 . f.GGTN A NNNNNACC (5)BstYI识别位点5…R先ATdS3\, YCTAG^R.. .5JBstZ17l识别位点5…GT fT AC…卽3\. CA T^ATG.. .5-Bsu36l识别位点5.…CC?TN AGG. . . 3r3-…G G A N T& C. 5"Btgl识别位点5；,. C?bHYGG,. .33；, GG YRC^C , ,5JBtgZI识别位点5…GCGATG㈣「…3」3；..CGCTAC(N),4J...5,BtsCI识别位点5；. .GCAGTG N N T33：.. C G T C A (^N N ... 5'BtsI识别位点5.,,GC AGTG N N T.3P3；.. C G T C A <^N N ...Cac8l识别位点GCN T NGC . 3J3：…CGN/ICG…密ClaI识别位点ATfcGAT.. . 3J3 …T AGCJ A T. 5CspCI识别位点5 :的CAA (N>( GTGG (N)^.,33：・+严JN) GTT (M), CACC(N}^1V，,5J CviAII识别位点5…C T G…:T3 r.. G T A^C . . S PCviKI-1 识别位点5...RG T C Y (3)才…¥C#GR…5’CviQI识别位点S'-.J J TAC ,.3J3：5枣…5’Ddel识别位点5；-. C^TNAG.. .3J3；, G AN\C.Dpnl识别位点Ch,5 G A T C 3 3；. CT AG 5’DpnII识别位点5；r T GATC..33：r, CT AG^ . 5JDral识别位点5；.. 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限制性内切酶酶切位点_方便搜索(word版本)
常用NOT1和Sbf1识别位点(正向引物前加NOT1;反向引物前加sbf1.)AatII 识别位点GACGTCCTGCAGAcc65I 识别位点GTMKACCAKMTGAccI 识别位点GTMKACCAKMTGAciI 识别位点CCGCGGCGAclI 识别位点AACGTTTTGCAAAcuI 识别位点CTGAAGGACTTCAfeI 识别位点AGCGCTTCGCGAAflII 识别位点CTTAAGGAATTCAflIII 识别位点ACRYGTTGYRCAAgeI 识别位点ACCGGTTGGCCAAhdI 识别位点GACNNNNNGTCCTGNNNNNCAGAleI 识别位点CACNNNNGTGGTGNNNNCACAluI 识别位点AGCTTCGAAlwI 识别位点GGATCCCTAGAlwNI 识别位点CAGNNNCTGGTCNNNGACApaI 识别位点GGGCCCCCCGGGGTGCACCACGTGApeKI 识别位点GCWGCCGWCGApoI 识别位点RAATTYYTTAARAscI 识别位点GGCGCGCCCCGCGCGGAseI 识别位点ATTAATTAATTAAsiSI 识别位点GCGATCGCCGCTAGCGAvaI 识别位点CYCGRGGRGCYCAvaII 识别位点GGWCCCCWGGCCTAGGGGATCCBaeI 识别位点NACNGTAYCNBamHI 识别位点GGATCCCCTAGGBanI 识别位点GGYRCCCCRYGGBanII 识别位点GRGCYCCYCGRGBbsI 识别位点GAAGACCTTCTGBbvCI 识别位点CCTCAGCGGAGTCGBbvI 识别位点GCAGCCGTCGCCATCGGTAGBceAI 识别位点ACGGC TGCCGBcgI 识别位点CGANTGNGCTNACGBciVI 识别位点GTATCCCATAGGBclI 识别位点TGATCAACTACTBfaI 识别位点CTAGGATCBfuAI 识别位点ACCTGCTGGACGBglI 识别位点GCCNNNNNGGCCGGNNNNNCCGAGATCTTCTAGABlpI 识别位点GCTNAGCCGANTCGBme1580I 识别位点GKGCMCCMCGKGBmgBI 识别位点CACGTCGTGCAGBmrI 识别位点ACTGGGNTGACCCNBmtI 识别位点GCTAGCCGATCGBpmI 识别位点CTGGAGNGACCTCNBpu10I 识别位点CCTNAGCGGANTCGCTTGAGNGAACTCNBsaAI 识别位点YACGTRRTGCAYBsaBI 识别位点GATNNNNATCCTANNNNTAGBsaHI 识别位点GRCGYCCYGCRGBsaI 识别位点GGTCTCNCCAGAGNBsaJI 识别位点CCNNGGGGNNCCBsaWI 识别位点WCCGGWWGGCCWBsaXI 识别位点NACNCTCCNNTGNGAGGNGAGGAGNCTCCTCNBseYI 识别位点CCCAGCGGGTCGBsgI 识别位点GTGCAGCACGTCBsiEI 识别位点CGRYCGGCYRGCBsiHKAI 识别位点GWGCWCCWCGWGBsiWI 识别位点CGTACGGCATGCBslI 识别位点CCNNNNNNNGGGGNNNNNNNCCBsmAI 识别位点GTCTCNCAGAGNCGTCTCNGCAGAGNBsmFI 识别位点GGGACCCCTGBsmI 识别位点GAATGCNCTTACGNBsoBI 识别位点CYCGRGGRGCYCBsp1286I 识别位点GDGCHCCHCGDGBspCNI 识别位点CTCAGN GAGTCNBspDI 识别位点ATCGATTAGCTABspEI 识别位点TCCGGAAGGCCTTCATGAAGTACTBspMI 识别位点ACCTGCNTGGACGNBspQI 识别位点GCTCTTCNCGAGAAGNBsrBI 识别位点CCGCTCGGCGAGBsrDI 识别位点GCAATGNNCGTTACNNBsrFI 识别位点RCCGGYYGGCCRBsrGI 识别位点TGTACAACATGTBsrI 识别位点ACTGGNTGACCNGCGCGCCGCGCGBssKI 识别位点CCNGGGGNCCBssSI 识别位点CACGAGGTGCTCBstAPI 识别位点GCANNNNNTGCCGTNNNNNACGBstBI 识别位点TTCGAAAAGCTTBstEII 识别位点GGTNACCCCANTGGBstNI 识别位点CCWGGGGWCCBstUI 识别位点CGCGGCGCCCANNNNNNTGGGGTNNNNNNACCBstYI 识别位点RGATCYYCTAGRBstZ17I 识别位点GTATACCATATGBsu36I 识别位点CCTNAGGGGANTCCBtgI 识别位点CCRYGGGGYRCCBtgZI 识别位点GCGATGCGCTACBtsCI 识别位点GCAGTGNNCGTCACNNBtsI 识别位点GCAGTGNNCGTCACNNGCNNGCCGNNCGClaI 识别位点ATCGATTAGCTACspCI 识别位点NCAANGTGGNNGTTNCACCNCviAII 识别位点CATGGTACCviKI-1识别位点RGCYYCGRCviQI 识别位点GTACCATGDdeI 识别位点CTNAGGANTCDpnI 识别位点GATCCTAGGATCCTAGDraI 识别位点TTTAAAAAATTTDraIII 识别位点CACNNNGTGGTGNNNCACDrdI 识别位点GACNNNNNNGTCCTGNNNNNNCAGEaeI 识别位点YGGCCRRCCGGYEagI 识别位点CGGCCGGCCGGCEarI 识别位点CTCTTCGAGAAGEciI 识别位点GGCGGACCGCCTCCTNNNNNAGGGGANNNNNTCCEcoO109I 识别位点RGGNCCYYCCNGGREcoP15I 识别位点CAGCAGGTCGTCEcoRI 识别位点GAATTCCTTAAGEcoRV 识别位点GATATCCTATAGFatI 识别位点CATGGTACFauI 识别位点CCCGCGGGCGFnu4HI 识别位点GCNGCCGBCGGGATGNCCTACNFseI 识别位点GGCCGGCCCCGGCCGGFspI 识别位点TGCGCAACGCGTHaeII 识别位点RGCGCYYCGCGRHaeIIIHgaI 识别位点GACGCCTGCGHhaI 识别位点GCGCCGCGHincII 识别位点GTYRACCARYTGHindIII 识别位点AAGCTTTTCGAAGANTCCTNAGHinP1I 识别位点GCGCCGCGHpaI 识别位点GTTAACCAATTGHpaII 识别位点CCGGGGCCHphI 识别位点GGTGACCACTHpy188I 识别位点TCNGAAGNCTHpy188III 识别位点TCNNGAAGNNCTHpy99I 识别位点CGWCGGCWGCCCTTCGGAAGHpyCH4III 识别位点ACNGTTGCCAHpyCH4IVHpyCH4V 识别位点TGCAACGTKasI 识别位点GGCGCCCCGCGGKpnI 识别位点GGTACCCCATGGMboI 识别位点GATCCTAGMboII 识别位点GAAGACTTCTMfeI 识别位点CAATTGGTTAACACGCGTTGCGCAMlyI 识别位点GAGTCCTCAGMmeI 识别位点TCCRACAGGYTGMnlI 识别位点CCTCGGAGMscI 识别位点TGGCCAACCGGTMseI 识别位点TTAAAATTMslI 识别位点CAYNNNNRTGGTRNNNNYACMspA1I 识别位点CMGCKGGKCGMCCCGGGGCCMwoI 识别位点GCNNNNNNNGCCGNNNNNNNCGNaeI 识别位点GCCGCCGGCCGNarI 识别位点GGCGCCCCGCGGNciI 识别位点CCSGGGGSCCNcoI 识别位点CCATGGGGTACCNdeI 识别位点CATATG GTATACNgoMIV识别位点GCCGGC CGGCCGGCTAGCCGATCGNlaIII 识别位点CATGGTACNlaIV 识别位点GGNNCCCCNNGGNmeAIII 识别位点GCCGAGCGGCTCNotI 识别位点GCGGCCGC CGCCGGCGNruI 识别位点TCGCGAAGCGCTNsiI 识别位点ATGCAT TACGTANspI识别位点RCATGY YGTACRTTAATTAA AATTAATTPaeR7I识别位点CTCGAG GAGCTCPciI 识别位点ACATGT TGTACAPflFI识别位点GACNNNGTC CTGNNNCAGPflMI 识别位点CCANNNNNTGGGGTNNNNNACCPhoI 识别位点GGCCPleI识别位点GAGTCN CTCAGNPmeI 识别位点GTTTAAAC CAAATTTGPmlI识别位点CACGTG GTGCACRGGWCCYYCCWGGRPshAI 识别位点GACNNNNGTCCTGNNNNCAGPsiI 识别位点TTATAAAATATTPspGI 识别位点CCWGGGGWCCPspOMI 识别位点GGGCCCCCCGGGPspXI 识别位点VCTCGAGBBGAGCTCVPstI 识别位点CTGCAGGACGTCPvuI 识别位点CGATCGGCTAGCCAGCTGGTCGACRsaI 识别位点GTACCATGRsrII 识别位点CGGWCCGGCCWGGCSacI 识别位点GAGCTCCTCGAGSacII 识别位点CCGCGGGGCGCCSalI 识别位点GTCGACCAGCTGSapI 识别位点GCTCTTCNCGAGAAGNSau3AI 识别位点GATCCTAGGGNCCCCNGGSbfI 识别位点CCTGCAGGGGACGTCCScaI 识别位点AGTACTTCATGAScrFI 识别位点CCNGGGGNCCSexAI 识别位点ACCWGGTTGGWCCASfaNI 识别位点GCATCNCGTAGNSfcI 识别位点CTRYAGGAYRTCSfiI 识别位点GGCCNNNNNGGCCCCGGNNNNNCCGGGGCGCCCCGCGGSgrAI 识别位点CRCCGGYGGYGGCCRCSmaI 识别位点CCCGGGGGGCCCSmlI 识别位点CTYRAGGARYTCSnaBI 识别位点TACGTAATGCATSpeI 识别位点ACTAGTTGATCASphI 识别位点GCATGCCGTACGSspI 识别位点AATATTTTATAAStuI 识别位点AGGCCTTCCGGAStyD4I 识别位点CCNGGGGNCCStyI 识别位点GCWWGGGGWWCCSwaI 识别位点ATTTAAATTAAATTTATaqαI 识别位点TCGAAGCTTfiI 识别位点GAWTCCTWAGTliI 识别位点CTCGAGGAGCTCTseI 识别位点GCWGCCGWCGTsp45I 识别位点GTSACCASTGTsp509I 识别位点AATTTTAATspMI 识别位点CCCGGGGGGCCCTspRI 识别位点NNCASTGNNNNGTSACNNTth111I 识别位点GACNNNGTCCTGNNNCAGXbaI 识别位点TCTAGAAGATCTXcmI 识别位点CCANNNNNNNNNTGGGGTNNNNNNNNNACCXhoI 识别位点CTCGAGGAGCTCXmaI识别位点CCCGGG GGGCCCXmnI识别位点GAANNNNTTC CTTNNNNAAGZraI识别位点GACGTC CTGCAG与大家共享（非原创）。
常用限制性内切酶酶切位点保护残基
酶切位点保护碱基-PCR引物设计用于限制性内切酶发布: 2010-05-24 20:19| 来源:生物吧| 编辑:刘浩| 查看: 161 次本文给出了分子克隆中常用限制性内切酶的保护碱基序列，如AccI，AflIII，AscI，AvaI，BamHI，BglII，BssHII，BstEII，BstXI，ClaI，EcoRI，HaeIII，HindIII，KpnI，MluI，NcoI，NdeI，NheI，NotI，NsiI，PacI，PmeI，PstI，PvuI，SacI，SacII，SalI，ScaI，SmaI，SpeI，SphI，StuI，XbaI，XhoI，XmaI，为什么要添加保护碱基？在分子克隆实验中，有时我们会在待扩增的目的基因片段两端加上特定的酶切位点，用于后续的酶切和连接反应。
由于直接暴露在末端的酶切位点不容易直接被限制性核酸内切酶切开，因此在设计PCR引物时，人为的在酶切位点序列的5‘端外侧添加额外的碱基序列，即保护碱基，用来提高将来酶切时的活性。
其次，在分子克隆实验中选择载体的酶切位点时，相临的两个酶切位点往往不能同时使用，因为一个位点切割后留下的碱基过少以至于影响旁边的酶切位点切割。
该如何添加保护碱基？添加保护碱基时，最关心的应该是保护碱基的数目，而不是种类。
什么样的酶切位点，添加几个保护碱基，是有数据可以参考的。
添加什么保护碱基，如果严格点，是根据两条引物的Tm值和各引物的碱基分布及GC含量。
如果某条引物Tm值偏小，GC%较低，添加时多加G或C，反之亦反。
为了解不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求，NEB采用了一系列含识别序列的短双链寡核苷酸作为酶切底物进行实验。
实验结果对于确定双酶切顺序将会有帮助（比如在多接头上切割位点很接近时），或者当切割位点靠近DNA末端时也很有用。
在本表中没有列出的酶，则通常需在识别位点两端至少加上6个保护碱基，以确保酶切反应的进行。
实验方法：用γ-[32P]ATP在T4多聚核苷酸激酶的作用下标记0.1A260单位的寡核苷酸。
常用限制性内切酶酶切位点保护残基
酶切位点保护碱基-PCR引物设计用于限制性内切酶发布: 2010-05-24 20:19| 来源:生物吧| 编辑:刘浩| 查看: 161 次本文给出了分子克隆中常用限制性内切酶的保护碱基序列，如AccI，AflIII，AscI，AvaI，BamHI，BglII，BssHII，BstEII，BstXI，ClaI，EcoRI，HaeIII，HindIII，KpnI，MluI，NcoI，NdeI，NheI，NotI，NsiI，PacI，PmeI，PstI，PvuI，SacI，SacII，SalI，ScaI，SmaI，SpeI，SphI，StuI，XbaI，XhoI，XmaI，为什么要添加保护碱基？在分子克隆实验中，有时我们会在待扩增的目的基因片段两端加上特定的酶切位点，用于后续的酶切和连接反应。
由于直接暴露在末端的酶切位点不容易直接被限制性核酸内切酶切开，因此在设计PCR引物时，人为的在酶切位点序列的5‘端外侧添加额外的碱基序列，即保护碱基，用来提高将来酶切时的活性。
其次，在分子克隆实验中选择载体的酶切位点时，相临的两个酶切位点往往不能同时使用，因为一个位点切割后留下的碱基过少以至于影响旁边的酶切位点切割。
该如何添加保护碱基？添加保护碱基时，最关心的应该是保护碱基的数目，而不是种类。
什么样的酶切位点，添加几个保护碱基，是有数据可以参考的。
添加什么保护碱基，如果严格点，是根据两条引物的Tm值和各引物的碱基分布及GC含量。
如果某条引物Tm值偏小，GC%较低，添加时多加G或C，反之亦反。
为了解不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求，NEB采用了一系列含识别序列的短双链寡核苷酸作为酶切底物进行实验。
实验结果对于确定双酶切顺序将会有帮助（比如在多接头上切割位点很接近时），或者当切割位点靠近DNA末端时也很有用。
在本表中没有列出的酶，则通常需在识别位点两端至少加上6个保护碱基，以确保酶切反应的进行。
实验方法：用γ-[32P]ATP在T4多聚核苷酸激酶的作用下标记0.1A26单位的寡核苷酸。
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3. 推荐到NEB的REBASE数据库去查（网址：/rebase/rebase.html） 当你设计好引物，添加上了内切酶识别序列，下一步或许是添加保护碱基了，可以参考： NEB公司网站提供的保护碱基参考表下载 NEB公司网站上关于计PCR引物保护碱基的参考 双酶切buffer的选择（MBI、罗氏、NEB、Promega、Takara）
这里再给大家推荐一种新的不需要连接反应的分子克隆方法，优点包括： ①设计引物不必考虑选择什么酶切位点； ②不必考虑保护碱基的问题； ③不必每次都选择合适的酶来酶切质粒制备载体； ④而且不需要DNA连接酶； ⑤假阳性几率低（因为没有连接反应这一步，载体自连的问题没有了）。 另外，还有一个经济问题：如果一次性制备一批载体（小提一次质粒约80μL），并将之线性化（可双酶 切亦可单酶切），然后每次做分子克隆实验时用一点，大约可以做约40次转化，管上一年没问题，呵呵。
百联网
LYbslF4pcCai
The Type II restriction systems typically contain individual restriction enzymes and modification enzymes encoded by separate genes. The Type II restriction enzymes typically recognize specific DNA sequences and cleave at constant positions at or close to that sequence to produce 5-phosphates and 3-hydroxyls. Usually they require Mg 2+ ions as a cofactor, although some have more exotic requirements. The methyltransferases usually recognize the same sequence although some are more promiscuous. Three types of DNA methyltransferases have been found as part of Type II R-M systems forming either C5-methylcytosine, N4-methylcytosine or N6-methyladenine.
ApaI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5'GGGCC^C 3' BamHI（类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' G^GATCC 3' BglII （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' A^GATCT 3' EcoRI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' G^AATTC 3' HindIII （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' A^AGCTT 3' KpnI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' GGTAC^C 3' NcoI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' C^CATGG 3' NdeI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' CA^TATG 3' NheI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' G^CTAGC 3' NotI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' GC^GGCCGC 3' SacI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' GAGCT^C 3' SalI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' G^TCGAC 3' SphI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' GCATG^C 3' XbaI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' T^CTAGA 3' XhoI （类型：Type II restriction enzyme ） 识别序列： 5' C^TCGAG 3'