关于多肽合成
多肽的基因工程合成及应用
多肽的基因工程合成及应用多肽是由氨基酸分子连接而成的一种生物大分子，存在于各种生物体内并在生命活动中发挥着重要的作用。
由于多肽具有高效、安全和选择性等优点，因此在医学、食品、化妆品等领域中得到了广泛的应用。
而基于基因工程技术合成多肽，对于提高其生产效率和纯度，降低成本，使得多肽在各个领域的应用更加广泛和具有前景。
一、多肽的基因工程合成1.1 基因工程制备载体在基因工程合成多肽的过程中，必须制备载体。
载体是一种容纳DNA序列的分子，可以提供表达所需的基因和调节表达的元件。
目前常用的载体有质粒、病毒和细胞系等。
其中质粒载体运用最为广泛，是易于制备、操作简单、安全性高的优秀载体。
1.2 选择有效的宿主细胞在合成多肽的过程中，需要选择高效的宿主细胞用于生产。
常用细胞系有大肠杆菌、酵母菌、哺乳细胞等，其中大肠杆菌因其繁殖快、易于培养、受到广泛研究的优点，在基因工程合成多肽中应用最多。
1.3 合成多肽的步骤基因工程合成多肽的步骤包括以下几步：首先，在质粒载体上克隆目标基因序列；其次，将质粒导入宿主细胞内，由系统表达目标基因；接下来，进行多肽的裂解与提取，获得含有多肽的混合物；最后，采用各种分离纯化技术获得纯化的多肽产物。
二、多肽的应用2.1 医药领域多肽药物具有分子量小、生物效应明显、生物半衰期短、毒副作用小等优点。
应用于治疗疾病的药物有胰岛素、生长激素、抗癌药物等。
随着技术的进步，新型多肽药物正在快速发展，如奥美拉唑、阿帕唑等抑酸药，以及唐舌玉络口服液等中药多肽。
2.2 食品领域食品中添加多肽制品可以提高营养价值、增强保健功能，例如乳酸菌多肽、大豆多肽等成为了食品中添加的一种新型营养成分。
此外，多肽也可以被用来用于食品保鲜、防腐、美容等多种方面，如海产品中的胶原蛋白多肽、具有保湿、润肤、抗氧化等保健功效。
2.3 其它领域化妆品、纺织、环境保护等领域中也有多肽的应用。
例如，化妆品中添加多肽成分，可以改善肌肤质地，修复表皮屏障，抗衰老等多种美容功效。
多肽合成详细解说
多肽合成详细解说1．多肽化学合成概述：1963年，R.B.Merrif ield［1］创立了将氨基酸的C末端固定在不溶性树脂上，然后在此树脂上依次缩合氨基酸，延长肽链、合成蛋白质的固相合成法，在固相法中，每步反应后只需简单地洗涤树脂，便可达到纯化目的.克服了经典液相合成法中的每一步产物都需纯化的困难，为自动化合成肽奠定了基础.为此，Merrif ield获得1984年诺贝尔化学奖.今天，固相法得到了很大发展.除了Merr ifiel d所建立的Boc法(Boc:叔丁氧羰基)之外，又发展了Fm oc固相法(Fmoc:9-芴甲氧羰基).以这两种方法为基础的各种肽自动合成仪也相继出现和发展，并仍在不断得到改造和完善.Merrif ield所建立的Bo c合成法［2］是采用TFA(三氟乙酸)可脱除的Bo c为α-氨基保护基，侧链保护采用苄醇类.合成时将一个Boc－氨基酸衍生物共价交联到树脂上，用TFA 脱除Boc，用三乙胺中和游离的氨基末端，然后通过Dc c活化、耦联下一个氨基酸，最终脱保护多采用HF法或TFMS A(三氟甲磺酸)法.用Boc法已成功地合成了许多生物大分子，如活性酶、生长因子、人工蛋白等.多肽是涉及生物体内各种细胞功能的生物活性物质。
它是分子结构介于氨基酸和蛋白质之间的一类化合物,由多种氨基酸按照一定的排列顺序通过肽键结合而成。
到现在，人们已发现和分离出一百多种存在于人体的肽，对于多肽的研究和利用，出现了一个空前的繁荣景象。
多肽的全合成不仅具有很重要的理论意义，而且具有重要的应用价值。
通过多肽全合成可以验证一个新的多肽的结构；设计新的多肽，用于研究结构与功能的关系；为多肽生物合成反应机制提供重要信息；建立模型酶以及合成新的多肽药物等。
多肽合成的书
多肽合成的书1. 引言多肽是由氨基酸通过肽键连接而成的生物大分子，具有广泛的生物活性和应用潜力。
多肽合成是一项重要的研究领域，它涉及到多种化学技术和方法。
本书将介绍多肽合成的原理、方法和应用，旨在为读者提供全面、详细且深入的知识。
2. 多肽合成的原理多肽合成是通过将氨基酸分子中的羧基与氨基反应形成肽键，将多个氨基酸连接在一起而实现的。
常用的多肽合成方法包括固相合成法、液相合成法和化学合成法等。
2.1 固相合成法固相合成法是最常用且高效的多肽合成方法之一。
它利用聚苯乙烯或聚酰胺树脂等固相材料作为载体，在其表面上固定一个保护了氨基酸羧基的功能基团，然后通过反复进行去保护-偶联循环反应，逐步扩大多肽链长度。
固相合成法具有高纯度、高效率和高自动化程度的优点，适用于合成中等长度（10-50个氨基酸）的多肽。
然而，固相合成法在合成长链多肽时面临一些挑战，如副反应的产生和耐受性差等问题。
2.2 液相合成法液相合成法是通过在溶液中进行多肽合成的方法。
它与固相合成法相比，更适用于合成短链多肽。
液相合成法通常采用保护-偶联策略，即先保护氨基酸羧基和氨基，然后将它们连接起来形成肽键。
液相合成法具有操作简便、灵活性高和耐受性好的优点，但由于产物分离和纯化困难，其应用范围受到一定限制。
2.3 化学合成法化学合成法是通过化学反应直接构建多肽链的方法。
它不依赖于生物体内酶类催化反应，可以在无需特殊条件下实现多肽的快速合成。
化学合成法具有反应条件温和、选择性好和适用范围广的优点，但需要对每个氨基酸进行独立的保护和偶联，反应步骤较多，合成过程复杂。
3. 多肽合成的方法多肽合成的方法包括固相法、液相法和化学法等，下面将对每种方法进行详细介绍。
3.1 固相法固相法是通过将氨基酸固定在载体上，然后在其表面上进行反应来合成多肽。
具体步骤如下：1.载体选择：选择适宜的聚合物材料作为载体，如聚苯乙烯或聚酰胺树脂。
2.活化载体：将载体活化，使其表面具有反应活性基团。
多肽合成原料
多肽合成原料多肽合成是一种重要的合成技术，它能够从多种原料中对蛋白质进行复杂的合成。
多肽的原料包括脂质、蛋白质、核酸、酶、糖、营养物质、金属离子等。
脂质是合成多肽的费用最低的原料之一。
它们在多肽生物学中起着关键的作用，能够改变多肽的结构，从而影响它们的活性和可用性。
蛋白质是多肽合成的主要原料之一。
它们对多肽合成具有重要作用，能够改变多肽的性质，使其具有立体活性和生物活性。
细菌蛋白质是一种常用的多肽合成原料，因其稳定性高，毒性小，具有良好的生物活性和覆盖性，可以有效解决多肽合成中的问题。
核酸是多肽合成过程中的另一种核心原料，它可以通过多种不同的方法进行合成，从而对多肽的活性和稳定性产生重要影响。
酶是某种生物分子，具有专门的酶功能，但可能具有独特的特性，如可以泛化多种不同的活性位点，活性可以持续一段时间，从而改变组成多肽的结构，或从潜在的多肽序列中删去一些结构特性和活性位点。
糖是另一种重要的原料，它可以作为调节剂影响蛋白质和多肽的结构与性质，从而影响其活性和稳定性。
营养物质是合成多肽过程中的另一种关键原料，它们可以用于调节多肽的活性和稳定性，从而保证多肽的有效表达和质量。
金属离子是合成多肽过程中的另一种重要原料，它可以影响多肽的活性和稳定性，例如铜离子可以调节多肽折叠，使其能够维持稳定的三维构象和活性。
总之，多肽合成是一门复杂的技术，其材料也十分多样。
上述只是其中的一些，但所有这些原料都具有重要的作用，是合成多肽的基础条件。
只有在合理使用这些原料的基础上，才能够得到好的效果，提高多肽的合成质量。
多肽液相合成操作步骤
多肽液相合成操作步骤多肽是由两个或多个氨基酸残基通过肽键连接而成的生物大分子。
多肽液相合成是一种常用的多肽合成方法，它通过在液相中依次添加氨基酸残基来合成多肽链。
本文将介绍多肽液相合成的操作步骤。
一、材料准备1. 氨基酸：根据所需合成的多肽序列，准备好需要的氨基酸。
可以选择市售的氨基酸，也可以自行合成。
2. 溶剂：选择适合的溶剂来溶解氨基酸。
常用的溶剂包括二甲基亚砜(DMSO)、二甲基甲酰胺(DMF)等。
二、合成步骤1. 保护基的引入：如果需要保护某些特定的氨基酸残基，可以在合成开始前引入保护基。
常用的保护基有丙酰基、苯乙酰基等。
2. 激活剂的选择：选择适合的激活剂来促进氨基酸的连接。
常用的激活剂有DCC、HATU等。
将激活剂按照一定的摩尔比例加入到氨基酸溶液中。
3. 催化剂的添加：为了加快反应速度，可以添加催化剂。
常用的催化剂有二甲基氨基咪唑(DIPEA)、三乙胺(TEA)等。
4. 反应条件的调节：根据不同的氨基酸和反应需求，调节反应的温度、时间等条件。
一般情况下，反应温度在室温至60℃之间。
5. 反应监测：可以使用氨基酸分析仪或者高效液相色谱仪(HPLC)来监测反应的进程，确保反应的完全性。
6. 反应结束与纯化：当反应结束后，可以用酸性溶液将保护基去除，得到纯净的多肽产物。
纯化的方法包括逆流层析、高效液相色谱等。
7. 验证与分析：通过质谱分析或者氨基酸序列分析等方法验证合成的多肽是否与设计一致，并进行纯度分析。
三、注意事项1. 操作环境要保持干燥和无菌，以防止多肽的降解或受到污染。
2. 操作过程中要注意安全，避免接触有害物质。
3. 每一步反应的时间和温度要根据具体情况进行调节，以保证反应的有效性。
4. 在纯化过程中，要选择合适的纯化方法和条件，以获得高纯度的多肽产物。
5. 合成多肽的过程中可能会出现副反应或者氨基酸残基之间的错误连接，需要通过合适的分析方法进行鉴定和排除。
总结：多肽液相合成是一种常用的多肽合成方法，通过在液相中依次添加氨基酸残基来合成多肽链。
多肽合成方法
多肽合成中肽键形成的基本原理一个肽键的形成（生成一个二肽），从表面上看是一个简单的化学过程，它指两个氨基酸组分通过肽键（酰胺键）连接，同时脱去水。
在温和反应条件下，肽键的形成是通过活化一个氨基酸（A）的羧基部分，第二个氨基酸（B）则亲核进攻活化的羧基部分而形成二肽（A－B）。
如果羧基组分（A）的氨基未保护，肽键的形成则不可控制，可能开有成线性肽和环肽等副产物，与目标化合物A－B混在一起。
所以，在多肽合成过程中，对不参与肽键形成的所有官能团必须以暂时可逆的方式加以保护。
因此，多肽合成－即每一个肽键的形成，包括三个步聚：第一步，需要制备部分保护的氨基酸，氨基酸的两性离子结构不再存在；第二步，为形成肽键的两步反应，N－保护氨基酸的羧基必须先活化为活性中间体，随后形成肽键。
这一耦合反应既可作为一步反应进行，也可作为两个连续的反应进行。
第三步，对保护基进行选择性脱除或全脱除。
尽管全部脱除要等到肽链全部组装完成后才能进行，但为了继??? 续肽合成，选择性脱除保护基也是必需的。
由于10个氨基酸（Ser、Thr、Tyr、Asp、Glu、Lys、Arg、His、Sec和Cys）含有需要选择性保护的侧链官能团，使肽合成变得更加复杂。
因为对选择性的要求不同，所以必须区分临时性和半永久性保护基。
临时性保护基用于下一步要反应氨基酸的氨基或羧基官能团的暂时保护，在不干扰已经形成的肽键或氨基酸侧链的半永久性保护基才脱除，有时也在合成过程中脱除。
在理想状态下，羧基组分的活化和随后的肽键形成（耦合反应）应为快速反应，没有消旋或副产物形成，并应用等摩尔反应物以获得高产率。
但遗憾的是，还没有一种能满足这些要求的化学耦合方法相比，适用于实际合成的方法很少。
在肽合成过程中，参与多种反应的官能团常常与一个手性中心相连（甘氨酸是唯一的例外），存在发生的消旋的潜在危险。
多肽合成循环的最后一步，保护基要全部脱除。
除了在二肽的合成中需要全脱保护以外，选择性脱除保护基对于肽链延长具有非常重要的意义。
多肽的化学合成
多肽的化学合成一、多肽的概述多肽是由多个氨基酸通过肽键连接而形成的一类化合物，通常由10~100个氨基酸分子组成，其连接方式与蛋白质相同，相对分子质量低于。
多肽普遍存在于生物体内，迄今在生物体内发现的多肽已达数万种，其广泛参与和调控机体内各系统、器官、组织和细胞的功能活动，在生命活动中发挥重要作用。
二、多肽的化学合成多肽的化学合成主要是在有机合成方法的基础上发展起来的，该方法合成的多肽种类及数量远较生物学方法为多。
通过化学合成，可以获得自然界中不存在的多肽，以适应人类生产和生活对多肽的需求；可以获得生理活性强、药理作用显著的多肽药物；可以获得高纯度、单一组分、结构明确的多肽，为研究多肽的结构与功能打下基础。
多肽的化学合成可分为固相合成和液相合成两大类。
1、固相合成固相合成是在固相载体上完成多肽的合成。
固相载体是一种带有化学基团的硅胶微球，具有较高的比表面积和较好的稳定性，同时方便后续的纯化，是使用最广泛的多肽合成方法。
其优点主要表现在操作简便、反应条件温和、适用于各种氨基酸及多肽合成，同时可以合成较大规模的多肽及蛋白质。
缺点是固相载体不易回收，会造成环境污染，而且合成的多肽不易进行结构修饰。
固相合成法又分为液一固相合成法和固一固相合成法。
液一固相合成法是利用液相法和固相法的结合，先将预保护的氨基酸在液相中缩合为“肽段”，再通过固相法将这些肽段连接起来生成长链多肽。
固一固相合成法是利用不同大小的固相载体进行多级反应，将小片段逐渐连接成完整的多肽。
2、液相合成液相合成是在液态有机介质中完成多肽的合成。
该方法主要利用氨基保护及羧基保护法来完成，主要有以下几种方法：分段合成法、缩合生成法和循环合成法等。
液相合成的优点在于没有载体分离过程，环境污染小，可以合成大片段及较长的多肽；缺点是反应步骤多且繁琐，产率较低。
（1）分段合成法：此法是将多肽分子中全部氨基酸根据其性质分成若干组，分别制备其相应的预保护氨基酸溶液，然后在各组氨基酸溶液中选择适当的氨基酸进行“缩合”反应。
多肽的化学合成
保护基可以在钠、液氨作用下除去。
（二）肽键的形成方法
具有游离氨基的组分称为氨基组分，具有游离羧基的组 分称为羧基组分。 肽键生成的原理是：将N-保护氨基酸或肽的羧基转化 成活化型的RCOX，使得羰基碳原子带有较强的正电性而有 利于氨基组分对它进行亲核反应生成肽键。
RCOOH—— RCO－X ——— RCONHR’＋ HX R’-NH2
（一）氨基酸常用的保护方法
多肽合成必须解决下面四个问题
1.氨基保护 2. 羧基保护 3. 侧链保护 4. 接肽方法
保护基必须具备的条件
易在预定的部位引入，在接肽时能起保护作用； 在某特定的条件下，保护基很易除去； 引入和除去保护基时，分子中的其它部位 不会受到影响，特别是已接好的肽键。
1、氨基的保护
1、羧基活化法
• 羧基的羟基不是一个好离去的基团； • 羧基本身不是一个最好的酰基化剂； • 羧基的活化是将羧基转变成一个活泼的羧基衍生物，提 高羧基的酰化能力。
• 叠氮法、混合酸酐法和活化脂法均是温和的方法，已经 被广泛应用于肽的合成
（1）酰氯法
• 最早使用的方法；
• 氨基酸的酰氯容易与氨基作用形成肽键；
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3、侧链的保护
氨基酸
Ala(A) Arg(R) Asn(N) Asp(D) Cys(C) Gln(Q) Glu(E) Gly(G) His(H) None Pbf, Mtr, Pmc Trt, Mebh, Tmob OtBu, OAI° Trt, Acm°,tBu°,Stbu Trt, Mbh, Tmob OtBu, OAI° None Trt, Boc
多肽的化学合成
多肽的化学合成
• 多肽的化学合成，是按照设计的氨基酸顺序，通过定向形成 酰胺键方法得到目标多肽分子； • 氨基酸之间形成酰胺键的反应相当复杂； • 要成功的合成具有特定氨基酸顺序的多肽，必须采用定向形 成酰胺键方法，即对暂时不参予形成酰胺键的氨基和羧基， 以及侧链活性基团进行保护。同时还要对羧基进行活化。
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关于多肽合成1．多肽化学合成概述：1963年，R.B.Merrifield［1］创立了将氨基酸的C末端固定在不溶性树脂上，然后在此树脂上依次缩合氨基酸，延长肽链、合成蛋白质的固相合成法，在固相法中，每步反应后只需简单地洗涤树脂，便可达到纯化目的.克服了经典液相合成法中的每一步产物都需纯化的困难，为自动化合成肽奠定了基础.为此，Merrifield获得1984年诺贝尔化学奖.今天，固相法得到了很大发展.除了Merrifield所建立的Boc法(Boc:叔丁氧羰基)之外，又发展了Fmoc 固相法(Fmoc:9-芴甲氧羰基).以这两种方法为基础的各种肽自动合成仪也相继出现和发展，并仍在不断得到改造和完善.Merrifield所建立的Boc合成法［2］是采用TFA(三氟乙酸)可脱除的Boc为α-氨基保护基，侧链保护采用苄醇类.合成时将一个Boc－氨基酸衍生物共价交联到树脂上，用TFA脱除Boc，用三乙胺中和游离的氨基末端，然后通过Dcc活化、耦联下一个氨基酸，最终脱保护多采用HF法或TFMSA(三氟甲磺酸)法.用Boc法已成功地合成了许多生物大分子，如活性酶、生长因子、人工蛋白等.多肽是涉及生物体内各种细胞功能的生物活性物质。
它是分子结构介于氨基酸和蛋白质之间的一类化合物,由多种氨基酸按照一定的排列顺序通过肽键结合而成。
到现在，人们已发现和分离出一百多种存在于人体的肽，对于多肽的研究和利用，出现了一个空前的繁荣景象。
多肽的全合成不仅具有很重要的理论意义，而且具有重要的应用价值。
通过多肽全合成可以验证一个新的多肽的结构；设计新的多肽，用于研究结构与功能的关系；为多肽生物合成反应机制提供重要信息；建立模型酶以及合成新的多肽药物等。
多肽的化学合成技术无论是液相法还是固相法都已成熟。
近几十年来，固相法合成多肽更以其省时、省力、省料、便于计算机控制、便于普及推广的突出优势而成为肽合成的常规方法并扩展到核苷酸合成等其它有机物领域。
本文概述了固相合成的基本原理、实验过程，对其现状进行分析并展望了今后的发展趋势。
从1963年Merrifield发展成功了固相多肽合成方法以来，经过不断的改进和完善，到今天固相法已成为多肽和蛋白质合成中的一个常用技术，表现出了经典液相合成法无法比拟的优点。
其基本原理是：先将所要合成肽链的羟末端氨基酸的羟基以共价键的结构同一个不溶性的高分子树脂相连，然后以此结合在固相载体上的氨基酸作为氨基组份经过脱去氨基保护基并同过量的活化羧基组分反应，接长肽链。
重复（缩合→洗涤→去保护→中和及洗涤→下一轮缩合）操作，达到所要合成的肽链长度，最后将肽链从树脂上裂解下来，经过纯化等处理，即得所要的多肽。
其中α-氨基用BOC（叔丁氧羰基）保护的称为BOC固相合成法，α-氨基用FMOC（9-芴甲氧羰基）保护的称为FMOC固相合成法，2．固相合成的基本原理多肽合成是一个重复添加氨基酸的过程，固相合成顺序一般从C端（羧基端）向 N端（氨基端）合成。
过去的多肽合成是在溶液中进行的称为液相合成法。
现在多采用固相合成法，从而大大的减轻了每步产品提纯的难度。
为了防止副反应的发生，参加反应的氨基酸的侧链都是保护的。
羧基端是游离的，并且在反应之前必须活化。
化学合成方法有两种，即Fmoc和tBoc。
由于Fmoc比tBoc存在很多优势，现在大多采用Fmoc 法合成，如图：具体合成由下列几个循环组成：一、去保护：Fmoc保护的柱子和单体必须用一种碱性溶剂（piperidine）去除氨基的保护基团。
二、激活和交联：下一个氨基酸的羧基被一种活化剂所活化。
活化的单体与游离的氨基反应交联，形成肽键。
在此步骤使用大量的超浓度试剂驱使反应完成。
循环：这两步反应反复循环直到合成完成。
三、洗脱和脱保护：多肽从柱上洗脱下来，其保护基团被一种脱保护剂（TFA）洗脱和脱保护。
2.1 树脂的选择及氨基酸的固定将固相合成与其他技术分开来的最主要的特征是固相载体，能用于多肽合成的固相载体必须满足如下要求：必须包含反应位点（或反应基团），以使肽链连在这些位点上，并在以后除去；必须对合成过程中的物理和化学条件稳定；载体必须允许在不断增长的肽链和试剂之间快速的、不受阻碍的接触；另外，载体必须允许提供足够的连接点，以使每单位体积的载体给出有用产量的肽，并且必须尽量减少被载体束缚的肽链之间的相互作用。
用于固相法合成多肽的高分子载体主要有三类：聚苯乙烯-苯二乙烯交联树脂、聚丙烯酰胺、聚乙烯-乙二醇类树脂及衍生物，这些树脂只有导入反应基团，才能直接连上（第一个）氨基酸。
根据所导入反应基团的不同，又把这些树脂及树脂衍生物分为氯甲基树脂、羧基树脂、氨基树脂或酰肼型树脂。
BOC合成法通常选择氯甲基树脂，如Merrifield树脂；FMOC合成法通常选择羧基树脂如王氏树脂。
氨基酸的固定主要是通过保护氨基酸的羧基同树脂的反应基团之间形成的共价键来实现的，形成共价键的方法有多种：氯甲基树脂，通常先制得保护氨基酸的四甲铵盐或钠盐、钾盐、铯盐，然后在适当温度下，直接同树脂反应或在合适的有机溶剂如二氧六环、DMF或DMSO中反应；羧基树脂，则通常加入适当的缩合剂如DCC或羧基二咪唑，使被保护氨基酸与树脂形成共酯以完成氨基酸的固定；氨基树脂或酰肼型树脂，却是加入适当的缩合剂如DCC后，通过保护氨基酸与树脂之间形成的酰胺键来完成氨基酸的固定。
氨基、羧基、侧链的保护及脱除要成功合成具有特定的氨基酸顺序的多肽，需要对暂不参与形成酰胺键的氨基和羧基加以保护，同时对氨基酸侧链上的活性基因也要保护，反应完成后再将保护基因除去。
同液相合成一样，固相合成中多采用烷氧羰基类型作为α氨基的保护基，因为这样不易发生消旋。
最早是用苄氧羰基，由于它需要较强的酸解条件才能脱除，所以后来改为叔丁氧羰基（BOC）保护，用TFA（三氟乙酸）脱保护，但不适用含有色氨酸等对酸不稳定的肽类的合成。
1978年，chang Meienlofer和Atherton等人采用Carpino报道的Fmoc(9-芴甲氧羰基)作为α氨基保护基，Fmoc基对酸很稳定，但能用哌啶-CH2CL2或哌啶-DMF脱去，近年来，Fmoc合成法得到了广泛的应用。
羧基通常用形成酯基的方法进行保护。
甲酯和乙酯是逐步合成中保护羧基的常用方法，可通过皂化除去或转变为肼以便用于片断组合；叔丁酯在酸性条件下除去；苄酯常用催化氢化除去。
对于合成含有半胱氨酸、组氨酸、精氨酸等带侧链功能基的氨基酸的肽来说，为了避免由于侧链功能团所带来的副反应，一般也需要用适当的保护基将侧链基团暂时保护起来。
保护基的选择既要保证侧链基团不参与形成酰胺的反应，又要保证在肽合成过程中不受破坏，同时又要保证在最后肽链裂解时能被除去。
如用三苯甲基保护半胱氨酸的S-，用酸或银盐、汞盐除去；组氨酸的咪唑环用2,2,2-三氟-1-苄氧羰基和2,2,2-三氟-1-叔丁氧羰基乙基保护，可通过催化氢化或冷的三氟乙酸脱去。
精氨酸用金刚烷氧羰基（Adoc）保护，用冷的三氟乙酸脱去。
固相中的接肽反应原理与液相中的基本一致，将两个相应的氨基被保护的及羧基被保护的氨基酸放在溶液内并不形成肽键，要形成酰胺键，经常用的手段是将羧基活化，变成混合酸酐、活泼酯、酰氯或用强的失去剂（如碳二亚氨）形成对称酸酐等方法来形成酰胺键。
其中选用DCC、HOBT或HOBT/DCC的对称酸酐法、活化酯法接肽应用最广。
裂解及合成肽链的纯化 BOC法用TFA+HF裂解和脱侧链保护基，FMOC法直接用TFA，有时根据条件不同，其它碱、光解、氟离子和氢解等脱保护方法也被采用。
合成肽链进一步的精制、分离与纯化通常采用高效液相色谱、亲和层析、毛细管电泳等。
4．固相合成的特点及存在的主要问题固相合成法对于肽合成的显著的优点：简化并加速了多步骤的合成；因反应在一简单反应器皿中便可进行，可避免因手工操作和物料重复转移而产生的损失；固相载体共价相联的肽链处于适宜的物理状态，可通过快速的抽滤、洗涤未完成中间的纯化，避免了液相肽合成中冗长的重结晶或分柱步骤，可避免中间体分离纯化时大量的损失；使用过量反应物，迫使个别反应完全，以便最终产物得到高产率；增加溶剂化，减少中间的产物聚焦；固相载体上肽链和轻度交联的聚合链紧密相混，彼此产生一种相互的溶剂效应，这对肽自聚集热力学不利而对反应适宜。
固相合成的主要存在问题是固相载体上中间体杂肽无法分离，这样造成最终产物的纯度不如液相合成物，必需通过可靠的分离手段纯化。
5．固相合成的研究发展前景固相多肽合成已经有40年的历史了，然而到现在，人们还只能合成一些较短的肽链，更谈不上随心所欲地合成蛋白质了，同时合成中的试剂毒性，昂贵费用，副产物等一直都是令人头痛的问题，而在生物体内，核糖体上合成肽链的速度和产率都是惊人的，那么，是否能从生物体合成蛋白质的原理上得到一些启发，应用在固相多肽合成（树脂）上，这是一个令人感兴趣的问题，也许是今后多肽合成的发展。
在Boc合成法中，反复地用酸来脱保护，这种处理带来了一些问题：如在肽与树脂的接头处，当每次用50%TFA脱Boc基时，有约1.4%的肽从树脂上脱落，合成的肽越大，这样的丢失越严重；此外，酸催化会引起侧链的一些副反应.Boc合成法尤其不适于合成含有色氨酸等对酸不稳定的肽类.1978年，Chang、Meienlofer 和Atherton等人采用Carpino［3］报道的Fmoc(9-芴甲氧羰基)基团作为α-氨基保护基，成功地进行了多肽的Fmoc固相合成.Fmoc法与Boc法的根本区别在于采用了碱可脱除的Fmoc为α-氨基的保护基.侧链的保护采用TFA可脱除的叔丁氧基等，树脂采用90%TFA可切除的对烷氧苄醇型树脂和1%TFA可切除的二烷氧苄醇型树脂，最终的脱保护避免了强酸处理.6.HPLC分析和纯化分析HPLC使用柱子和泵系统，可以经受传递高压，这样可以用极细的微粒（3-10μ m）做填料。
由此多肽要在几分钟内高度被分析。
HPLC分两类：离子交换和反相。
离子交换HPLC依靠多肽和固相间的直接电荷相互作用。
柱子在一定PH范围带有特定电荷衍变成一种离子体，而多肽或多肽混合物，由其氨基酸组成表现出相反电荷。
分离是一种电荷相互作用，通过可变PH，离子强度，或两者洗脱出多肽，通常，先用低离子强度的溶液，以后逐渐加强或一步一步加强，直到多肽火柱中洗脱出。
离子交换分离的一个例子使用强阳离子交换柱。
如sulfoethylaspartimide通过酸性PH中带正电来分离。
反相HPLC条件与正常层析正相反。
多肽通过疏水作用连到柱上，用降低离子强度洗脱，如增加洗脱剂的疏水性。
通常柱子由共价吸附到硅上的碳氢烷链构成，这种链长度为G4-G8碳原子。
由于洗脱是一种疏水作用。