医学培训资料—丝状真菌的鉴定
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丝状真菌的鉴定
北京大学第一医院皮肤科
主讲人:余进
⏹北京大学第一医院
⏹教授、博士生导师
⏹中国微生物学会临床微生物学委
员会青年委员会副主任委员及真
菌学组副组长
⏹中国微生物学会医学微生物学与
免疫学专委会真菌学组副组长余进
主任医师
01
0504 02
03
目录
丝状真菌形态鉴定
丝状真菌MALDI-TOF MS鉴定丝状真菌DNA测序鉴定
常见丝状真菌鉴定
总结
丝状真菌形态鉴定01
⏹培养基、培养时间、温度
⏹菌落:平皿培养
颜色:正面、背面、产色素
质地:粉末状、颗粒状、羊毛样、天鹅绒样、棉毛样、绒毛样等 生长:限制性生长、扩展性生长
双相真菌
⏹菌丝
有隔菌丝、无隔菌丝、透明菌丝、暗色菌丝
螺旋菌丝、结节状菌丝、鹿角样菌丝
⏹孢子
无性期孢子:大分生孢子、小分生孢子、关节孢子、孢囊孢子、厚壁孢子
有性期孢子:子囊孢子、接合孢子
⏹孢子发生
产孢结构、孢子排列
如何观察显微镜下形态
⏹选择易于产孢的培养基:皮肤癣菌(SDA或OA)、子囊菌(OA)、其他真菌(PDA)
⏹制作可供观察的玻片
挑片法
胶带法
小培养法
⏹染色:乳酸酚棉兰染色
丝状真菌MALDI-TOF MS鉴定02
直接转移法
甲酸提取法—推荐
⏹数据库
商业数据库
补充数据库
⏹其他影响因素
黑色素抑制
沙氏葡萄糖液体培养基旋转培养
使用布鲁克丝状真菌库
v1.0
联合布鲁克和BMU数据库鉴定得分≥2.0≥1.7<1.7错误≥2.0≥1.7<1.7错误
数量及
百分比(%)
55
(49.5)
67
(60.4)
37
(33.3)
7
(6.3)
90
(81.1)
104
(93.7)
(0)
7
(6.3)
111株毛霉:根霉属(48),毛霉属(41),横梗霉属(11),根毛霉属(4),小
克银汉霉属(5),共头霉属(2)
Shao J, Wan Z, Li R, Yu J. J Clin Microbiol. 2018, 26;56(4): e01886-17.
MALDI-TOF MS-
毛霉目真菌的鉴定
03
丝状真菌DNA测序鉴定
核糖体基因SSU 5.8S ITS2LSU ITS1D1/D2IGS2IGS1
5S -通用基因-不编码蛋白质,无进化压力,相对保守
-多拷贝-无基因家族-具有可变区和保守区
•rRNA(rDNA)gene -Small Subunit (SSU) rDNA (18S)-Large Subunit (LSU) rDNA (26S, 28S)-Internal Transcribed Spacer (ITS)-Intergenic Spacer (IGS)
常选用的目的基因
多基因(位点)分析
⏹ITS
⏹18s or 28srDNA D1/D2
⏹β-tubulin (β-TUB)
⏹elongation factor (EF-1α)
⏹calmodulin ( CAL)
⏹RNA polymerase II second largest subunit (RPB2)⏹actin
⏹IGS
数据库
•GenBank(hppt://)
•European Molecular Biology Laoratory nucleotide sequence database
( hppt:///embl/)•Centraalbureau voor Schimmelcultures
(hppt://www.cbs.knaw.nl)
常见丝状真菌鉴定04
曲霉-直接镜检
曲霉-分生孢子头
分生孢子
瓶梗
顶囊
分生孢子柄
足细胞
梗基
烟曲霉Aspergillus fumigatus