模式动物发育生物学实验报告——斑马鱼胚发育背轴节调节因子
斑马鱼胚胎发育阶段相关基因的挖掘与分析
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斑马鱼胚胎发育阶段相关基因的挖掘与分析近年来,斑马鱼成为一种常用的实验室模式生物,其胚胎发育过程十分规律和可控,是研究发育生物学和基因调控机制的重要模型。
随着基因挖掘技术的不断发展,越来越多的基因与斑马鱼胚胎发育阶段相关性得到了发现。
因此,分析斑马鱼胚胎发育阶段相关基因的功能和调控机制对于揭示生命活动的本质有着至关重要的意义。
一、斑马鱼胚胎发育阶段及其分子机制斑马鱼是一种小型热带鱼类,其胚胎发育阶段可分为十几个时期,分别对应着不同的形态和生理特征。
这些不同的发育阶段均是由基因表达的时空调控所驱动的,特定的基因激活和抑制导致了不同的胚胎形态和器官功能的发生。
在斑马鱼的早期发育过程中,主要涉及到卵母细胞的受精和初胚形成。
此阶段的发育主要由母源性基因调控,如 nop5、dead end、Vasa等。
随着器官的逐渐形成,受精卵将发展成为由脑、眼、肌肉等不同组织构成的多细胞胚胎。
这个过程中涉及到神经、视觉、肌肉等多种发育生物学特征,同时也是多个信号通路的交错调节,如 BMP、Wnt、Notch、Hedgehog等。
在胚胎发育的晚期,涉及到器官的成熟和功能细化等生理特征。
这个过程也是多种生化信号和调节因子交错作用下的结果,其主要涉及到细胞增殖、周期、分化等方面的调控,如 Cyclin D1、Nodal、Sox9等。
以上所述只是基础的胚胎发育阶段及其分子机制,实际上与胚胎发育相关的基因非常多且复杂。
因此,对斑马鱼胚胎发育相关基因的挖掘与分析显得尤为重要。
二、斑马鱼胚胎发育相关基因的挖掘通常,对基因的挖掘可以通过多种方式进行。
例如,可以通过对小分子化学物质的筛选和识别来验证潜在的胚胎发育相关基因,或者采用基于全反式PCR和转录组测序技术的方法进行基因调控因子的预测和鉴定。
另外,通过胚胎发育过程中的突变模式和形态,可获得一些具有生物学意义的候选基因,对其功能的研究也是非常重要的。
目前,已经有大量的胚胎发育相关基因在斑马鱼中被发现并得到了鉴定。
斑马鱼的胚胎发育和行为观察
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观察
汇报人:XX
2024-01-11
• 斑马鱼基本概述 • 斑马鱼胚胎形态学观察 • 斑马鱼胚胎生理学观察 • 斑马鱼行为学观察方法与技术 • 斑马鱼行为学观察实例分析 • 总结与展望
01
斑马鱼基本概述
斑马鱼生物学特性
体型特征
食性
斑马鱼体型修长,侧扁,成鱼体长34厘米,呈纺锤形。体色为银蓝色或 银色,有数条黑色纵纹贯穿全身,形 似斑马线。
原肠胚期
原肠胚期是胚胎发育的重要阶段之一。在这个阶段,胚胎 内部细胞进一步分化形成中胚层,并开始形成消化管、神 经管等器官原基。
孵化期
孵化期是胚胎发育的最后阶段。在孵化前,胚胎内部器官 基本发育成形。随着孵化过程的进行,胚胎逐渐破膜而出 ,成为幼鱼。
02
斑马鱼胚胎形态学观察
受精卵形态与结构特点
受精卵呈圆球形,透 明度高,直径约 1mm。
受精卵表面有一层坚 韧的卵壳,保护胚胎 免受外界损伤。
卵黄囊较大,占据受 精卵的大部分体积, 为胚胎发育提供营养 。
卵裂期及囊胚期发育过程
卵裂期
受精卵经过连续多次快速分裂,形成多细胞胚胎。此阶段细胞数量增加,但胚 胎总体积基本不变。
囊胚期
细胞继续分裂并重新排列,形成囊胚。此时胚胎内部出现空腔,即囊胚腔,细 胞开始分化为内细胞团和外层细胞。
02
攻击性
在争夺领地、配偶或食物等资源时,斑马鱼可能会表现出攻击性。攻击
行为包括追逐、撕咬等,旨在将竞争对手赶出领地或获取所需资源。
03
行为影响因素
领域性和攻击性行为受到多种因素的影响,如个体大小、健康状况、环
境压力等。较大的个体通常更具攻击性,而环境压力可能导致斑马鱼的
斑马鱼性腺促熟及早期发育模式
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年月日姓名:专业年级:同组者科目:发育生物学实验题目:斑马鱼性腺促熟及早期发育模式一【目的要求】1、通过实验操作掌握斑马鱼性腺促熟和产卵调控技术2、通过斑马鱼早期发育的观察,巩固对硬骨鱼胚胎发生的认识二【实验材料】(一)器材培养缸、控温棒、解剖镜、显微镜(二)试剂经太阳晒过至少一天的自来水(三)动物斑马鱼(Danio sp.)三【实验内容】(一)亲鱼培育和性腺促熟挑选体长大于4厘米的斑马鱼放养于鱼缸中,水温保持在28℃左右,放养数量根据鱼缸中水体体积而定,密度5尾\L左右。
饲喂亲鱼用的饲料有活性饲料和配合饲料两种,直接购自于观赏鱼市场,要求每天投喂4次,及时清除残饵,隔天换水,快到繁殖季节时将雌雄分养,加强管理。
(三)繁殖繁殖前一天中午,将雌雄合养于繁殖缸里,要求雌雄比例为2:1。
由于斑马鱼有食卵的习性,为防止亲鱼吞噬鱼卵,可用网孔为2-3毫米的网将亲鱼限制在繁殖缸的上半部活动,以防止亲鱼吞吃鱼卵。
一般次日凌晨到中午可以产卵和受精,受精卵便沉降于缸底,将繁殖后的亲鱼及时转移至别的培养缸中,吸取缸底受精卵,剔除异物以及眼观有白色小斑点、畸形异常卵。
(三)斑马鱼胚胎发育模式孵化期间,培养用水温度控制在25-28℃,每天要及时清除败育卵,并换水1-2次。
按时观察记录斑马鱼胚胎的早期发育过程,绘制斑马鱼的胚胎发育模式图。
1、受精卵:斑马鱼的卵呈圆球形,橙黄色、微透明,直径0.8-0.9 mm。
在水中,受精卵卵膜(壳膜)迅速膨胀,出现透明的卵周隙,在壳膜上可以看到呈漏斗状的卵膜孔。
2、卵裂:卵子受精后,细胞质迅速向动物极流动,并集中形成帽状的胚盘。
卵裂即在胚盘范围内进行,卵裂属于不全裂,盘状卵裂。
第一次分裂为经裂,分裂沟自上而下,但不到达底部,结果分为两个相等的不完整分裂球。
第二次分裂仍为经裂,分裂面与第一次垂直,仍是不完全分裂,于是分成大小相似的四个分裂球。
第三次分裂亦为经裂,两个分裂面在第一次分裂面两侧,并与第一次分裂面平行,形成两排,每排四个,共八个分裂球。
研究斑马鱼的胚胎发育及其关键期发育
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研究斑马鱼的胚胎发育及其关键期发育斑马鱼作为实验室中常用的模式生物之一,其相对简单的生殖和发育过程使得它成为了人们研究胚胎发育的重要对象之一。
斑马鱼的生殖过程非常规律,整个胚胎发育周期为24小时左右,孵化出的幼鱼期只有3天时间,因此研究斑马鱼胚胎发育的关键期是极为重要的。
1.斑马鱼的繁殖周期按照斑马鱼的繁殖周期,胚胎发育可分为四个阶段:受精卵期、原肠胚期、中胚层期和胚胎期。
在受精卵期,由于胚胎的细胞数量较少,细胞分化还未开始,因此对于实验研究比较有利。
而原肠胚期则是胚胎细胞分化的关键时期,不同类型的细胞开始出现,胚胎的体轴形成也在这一时期完成。
中胚层期则是各个器官的形成时期,器官原基逐渐形成并开始发育。
胚胎期则是细胞分化和器官形成的阶段,各种器官开始具备其特定的功能。
2.斑马鱼的胚胎发育与研究方法在研究斑马鱼的胚胎发育过程中,有两种经典的实验方法:一种是观察胚胎的形态,另一种则是分子遗传学方法。
观察胚胎形态的方法包括显微镜观察、形态学分析、各种染色法和微剖检查等。
分子遗传学方法则包括DNA微注射、利用Tol2系统进行基因转染、利用Morphant植入进行基因敲除和利用各种转录因子进行基因表达调控等。
这些方法能够全面深入地研究斑马鱼发育过程中的各个细节,为发育生物学研究提供了成熟的基础。
3.斑马鱼的胚胎发育关键期胚胎发育关键期即是指在这些时期,斑马鱼胚胎发育过程中出现了大量的关键分化事件,从而对胚胎发育产生了决定性的影响。
比如,在受精卵期,精卵和精子合并形成的原始受精卵很快分裂成数千个相同大小的细胞,进入囊胚阶段,随后囊胚开始对细胞进行分化。
在这个时期,实验研究可以利用形态和分子生物技术,来全面了解斑马鱼胚胎发育基本的细胞分化过程。
原肠胚期则是一个重要的发育关键期,这时各个器官开始发育,形成胃肠道和脊髓,并且产生了一些重要的基因表达调控。
中胚层期和胚胎期是一个比较综合和复杂的发育时期,不同器官之间紧密联系和相互影响,分化程度和细胞命运已经初步确定,此时的特定基因已经被表达并进入各个器官的形态调控中。
斑马鱼早期胚胎背腹发育中ripply1的作用论文
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斑马鱼早期胚胎背腹发育中ripply1的作用论文斑马鱼早期胚胎背腹发育中ripply1的作用论文胚轴(embryonic axes)形成是多细胞生物躯体模式(body plan)建立的一个重要过程,主要包括前- 后轴(anterior-posterior axis )、背 - 腹轴( dorsal-ventral axis)和左 - 右轴( left-right axis) .对两栖动物胚胎的研究发现背 - 腹轴早在受精后即可观察到,如爪蛙胚胎皮层转动形成的灰色新月区在后期发育成背部。
德国发育生物学家 Hans Spemann 和他的学生 Hilde Mangold 将原肠早期蝾螈胚胎的背部组织移植到另一种蝾螈胚胎的腹部,得到了形成双体轴的胚胎,次级体轴的脊索来自于供体胚胎,而神经管和体节多数来自于受体,这说明该背部组织能诱导周围受体胚胎的细胞形成神经管,首次提出了胚胎诱导的概念并称该背部组织为组织者( or-ganizer) .ripply 家族蛋白在 2005 年被发现并揭示了其部分功能[1],研究发现 ripply1 和 ripply2 特异表达于体节,其中 Ripply1 蛋白与转录辅抑制因子 Groucho 结合,能够终止分节基因的表达,维持体节的前后极性。
之后对 ripply1 的研究都集中在其在体节时期对体节发生的作用,而其在早期胚胎模式发生的作用却研究甚少。
但最近在爪蛙中的研究发现ripply家族蛋白能通过其WRPW 区域结合多梳蛋白( Polycomb group proteins)起转录去抑制的作用,并且在背 - 腹轴形成过程中起重要作用[2].然而,rip-ply 家族基因在胚胎发育早期的.表达图式和调节方式还不清楚。
并且,ripply3 是人的唐氏综合征关键区域基因 6( Down syndrome critical region gene 6,dscr6)的同源基因[3].因此,研究 ripply 家族基因的功能和作用机制能为人类遗传疾病的致病机理提供信息。
斑马鱼胚胎发育基因与功能的研究进展
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斑马鱼胚胎发育基因与功能的研究进展斑马鱼是一种常见但又极其特殊的小型观赏鱼类,它们不仅长得漂亮,而且拥有极强的再生能力,因此成为了生物科学研究的重要模式生物。
通过对斑马鱼进行基因编辑和遗传学实验,科学家们逐渐发现其胚胎发育过程中涉及的各种基因以及它们的功能,这不仅可以加深我们对斑马鱼胚胎发育的认识,而且可以为其它生物的研究提供指导和借鉴。
一、斑马鱼基因组的研究斑马鱼的基因组非常小、简单,但也很特殊,与人类和小鼠基因组存在较高的相似性,这让斑马鱼成为了研究发育生物学、基因调控和疾病模型等领域的绝佳模式生物。
研究发现,斑马鱼基因组含有大约2.7亿个碱基对,并且有约7万个基因,其中的大部分基因与人类或小鼠的基因存在功能上的相似性。
这让斑马鱼成为了研究发育生物学、基因调控和疾病模型等领域的绝佳模式生物,因为它们的生长和发育具有很高的可塑性,而且在成年后生命周期较短,其胚胎的早期发育过程更是完全透明,让科学家可以清晰地观察到其中的过程。
二、斑马鱼胚胎发育过程中的基因调控斑马鱼胚胎发育过程一般分为不同的阶段,通过对各个发育阶段的斑马鱼胚胎进行基因调控和功能研究,科学家们逐渐揭示了许多重要的发现。
一些基因负责斑马鱼的胚胎发育,如胚胎发育第一阶段的基因nrdp1,其担负着细胞核中的degradation保持during cell division的任务,同时nrdp1和内质网脱落调节蛋白p58温度缺陷包装的方式也有关系。
另一些基因则负责胚胎的器官发育,如在体育的鳍环投射被关键结构点抑制基因和smoothened 等基因,这些基因在斑马鱼胚胎发育过程中扮演着重要的角色,它们的异常活动会造成发育异常或者致病。
而在斑马鱼胚胎发育到一定的时期以后,神经系统的快速发育就成为了重点,这时候一些特异性的基因将会被表达,如gap43和omp等,这些基因机制是重要的神经信息人员通道的生物标志,此时会刺激生长锻炼和神经系统之间的联系,指导树突和神经纤维的生长与导向,如此就可以构建功能区域内的神经网络。
斑马鱼相关实验操作
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斑马鱼人工繁殖、受精和胚胎发育一、实验目的了解斑马鱼的生活和繁殖习性,掌握斑马鱼人工繁殖技术,了解斑马鱼受精、胚胎发育过程和形态模式形成的特点。
二、斑马鱼的生活和繁殖习性斑马鱼(Danio rerio)为热带鱼类,可在一年内多次产卵。
在合适的养殖条件下,4月龄的斑马鱼即性成熟;性成熟后每1-2周可以产卵一次,一条雌鱼一次可以产出数百颗卵子。
斑马鱼产卵受温度和光照长度的调节。
最适产卵水温为28.5℃,产卵的光调节周期为光照14小时,黑暗10小时。
为防止自然产卵,性成熟的雌、雄斑马鱼必须分开养殖。
斑马鱼具有下列特点:1、繁殖周期短,不受季节限制,容易获得所需要的精子、卵子和胚胎材料。
2、小型鱼类,可在实验室高密度养殖,饲养成本低。
3、是脊椎动物,具有和人类相似的器官和组织。
4、体外受精、体外发育,胚胎培养条件简单。
5、胚胎透明,可以在活体上直接观察器官的发育。
6、发育周期短,在28.5℃温度下培养,受精后24小时即可以形成个体的基本结构。
因此,斑马鱼现在选择作为发育生物学研究的模式动物。
三、实验器材和材料斑马鱼养殖系统,大塑料盆(直径约58cm)两个,塑料筛框(直径约36cm)一个,中号塑料盆(直径约36cm)1个,加热棒,加气泵,12cm培养皿若干,9cm培养皿若干,数个胶头滴管。
曝气水10L。
性成熟雌、雄性斑马鱼。
四、实验内容和程序实验前一天的准备:1、在实验前一天的早上向2个大塑料盆中放大半盆干净的自来水,放入气泵和加热棒,将加热棒温度调整至28℃(每个加热棒都有差异,需要放入温度计,根据温度计指示的实际温度调节和校准温度计),以供斑马鱼催产繁殖时使用。
2、曝气水将干净的自来水烧开后冷却,将气泵放入其中进行曝气,以为培养胚胎之用。
3、斑马鱼的选取和催产雌雄鱼的鉴别:性成熟的雄鱼体型修长,腹部较小,而雌鱼腹部较大。
选鱼的时间在实验前一天的晚上,在选取斑马鱼之前需要喂食红虫,喂食后1小时才开始选鱼。
斑马鱼作为模式生物在发育生物学和遗传学研究中的应用
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斑马鱼作为模式生物在发育生物学和遗传学研究中的应用自从19世纪开始,科学家们一直在通过选定某些模式生物,如斑马鱼、小鼠、果蝇等来深入研究生命的奥秘。
这些模式生物被广泛用于从发育生物学到遗传学的研究领域。
其中,斑马鱼由于拥有发育速度快,透明度高,繁殖周期短等优点,为科学家们提供了理想的实验材料。
本文将详细探讨斑马鱼在发育生物学和遗传学研究中的应用。
一、斑马鱼在发育生物学方面的应用1.1 受精和胚胎发育斑马鱼的成熟期很短,仅需3个月,且在水中繁殖,雄鱼和雌鱼在不经过人工干预的情况下会自行交配,产下千万个卵子。
这些特点使得斑马鱼成为了研究受精和胚胎发育的理想模式生物。
斑马鱼发育周期短,且在受精后仅需数小时即可胚胎发育,科学家们可以直观地观察到受精的过程和胚胎早期的变化过程。
这为我们对于生命的起源和胚胎形成等领域提供了独特的视角和参考。
1.2 器官发育斑马鱼器官发育过程也是发育生物学领域的一个重要研究方向。
研究人员可以通过基因改造,观察到不同基因表达出来对器官发育的影响。
例如,一项研究表明,在一个发育的胰腺中,Pdx1基因是发展为稳定胰岛细胞所必不可少的基因。
通过改变Pdx1的表达模式,科学家们成功地发现Pdx1对稳定胰岛细胞数量的影响,加深了我们对器官发育的了解。
1.3 神经发育斑马鱼神经系统发育与脊椎动物的其他模式生物非常相似,与小鼠等模式生物相比,斑马鱼生长速度快,且在早期神经系统发育阶段仍较为简单,因此可以更好地研究这些阶段中神经系统的构建和运作。
在神经发育领域中,斑马鱼的应用包括但不限于研究神经元的分布序列、神经细胞的形态和运动状态、神经元的自发活动等方面。
二、斑马鱼在遗传学方面的应用2.1 遗传显微镜在斑马鱼遗传学领域,另一个被广泛使用的是遗传显微镜。
这个显微镜是一个用于斑马鱼早期胚胎研究的特殊显微镜。
这个显微镜可以放大数倍,帮助科学家在斑马鱼胚胎中发现突变。
该显微镜的广泛使用在突变分析方面取得了重大成果,帮助我们在独特的水平上研究生命的启动机制。
实验模式动物--斑马鱼
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Chuck Kimmel
3
斑马鱼作为模式动物逐渐受到关注 Turn Eyes to Fish
• Christiane Nü sslein-Volhard
Wolfgang Driever
• 1995 诺贝尔奖获得者
was able to identify and classify a small number of genes that are of key importance in determining the body plan and the formation of body segments, turned eyes to fish and find a wide range of mutations
20
2.方法:实验前一天禁食。取成体斑马鱼分别臵 于含有30~ 50mL溶液的瓶中, 保持瓶中溶液温 度恒定在25℃,随机分为空白对照, 溶剂对照及 各药物浓度给药组, 每组含15条。分别给予纯净 水, 含不同浓度药物的纯净水。
记录不同浓度药液中斑马鱼在24h内的死亡数量 (只), 计算死亡率(% )。根据实验结果, 采用Bliss 法计算LC50值。
21
3.结果:雷公藤甲素、苦参碱和大黄素对于斑马 鱼的LC50值依次为5.02 x10-3、113.2和1.18 x103 ug /mL, 毒性大小顺序与12
心脏切除后心室肌的再生
Regeneration of ventricular myocardium in the resected zebrafish heart
13 DECEMBER 2002 VOL 298 SCIENCE
13
斑马鱼在药物评价中的应用
1.一般毒性评价 2.发育毒性评价 3.心血管毒性评价 4.肝脏毒性评价 5.神经毒性评价 6.肾毒性评价 7.肠胃毒性评价 8.视觉毒性评价 9.耳毒性评价 10.软骨毒性评价
斑马鱼研究报告
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斑马鱼研究报告(Zebrafish,Danio rerio)目录一﹑斑马鱼二﹑斑马鱼基因与人类极为相似三﹑利用斑马鱼作为模式动物四﹑斑马鱼的心生五﹑突变斑马鱼及转基因斑马鱼表現类似人类疾病六﹑斑马鱼胚胎研究七﹑研究者在活的斑马鱼身上直接观看器官的发育与病变八﹑解开人与体內活菌共生秘密九﹑斑马鱼胚胎基因有助研究癌症、阿滋海默和帕金森症十﹑视网膜有自我修复潜能十一﹑培育变种斑马鱼可望用于人脸整型十二﹑基因決定人类肤色十三﹑斑马鱼的运动情形肌肉的发育及肌肉与运动神经的调控机制十四﹑细胞如何储存脂肪有助減肥新疗法十五﹑类固醇荷尔蒙的功能与调控十六﹑中神经细胞形成之分子调控机制十七﹑斑马鱼基因调控网路十八﹑干扰斑马鱼基因的技术十九﹑培育环保转基因斑马鱼二十﹑改造斑马鱼基因來试水质二十一﹑利用斑马鱼作为人类疾病模型及药物节选二十二﹑药物节选二十三﹑抗癌药物节选斑马鱼原产于东印度恒河流域,亦分布于巴基斯坦、尼泊尔、缅甸。
斑马鱼成鱼体长约4~5公分,体呈纺锤形,稍侧扁。
体侧从头至尾布满多条蓝色条纹,酷似斑马,故得名斑马鱼。
1.斑马鱼是研究发育生物学的新兴模式动物。
2.斑马鱼由于具有饲育容易、胚胎透明、体外受精、突变种多、遗传学工具成熟等诸多优点,近年来已成为研究脊椎动物发育与人类遗传疾病的新兴模式动物。
3.与其他脊椎动物相较下,斑马鱼最大的优点就是具有多达6000多种的遗传突变种,这些突变种的建立大致上是利用X射线、ENU或反转录病毒的感染造成基因组的突变,之后再经由多次的子代筛选所得。
4.突变种的表征包含如胚层分化,器官发育,生理调适与行为表现等多方面,所以可提供研究人员极佳的正向遗传学材料来进行发育机制上的研究。
5.在斑马鱼系统中也开发出阻断基因功能的工具-Morpholino,可快速以逆向遗传学手法来验证基因的功能。
所以正向遗传学与逆向遗传学的巧妙利用,可以正确推导出斑马鱼遗传发育途径,也是目前斑马鱼成为研究人类疾病新兴模式动物的主要原因。
斑马鱼研究报告
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斑马鱼研究报告(Zebrafish,Danio rerio)目录一﹑斑马鱼二﹑斑马鱼基因与人类极为相似三﹑利用斑马鱼作为模式动物四﹑斑马鱼的心生五﹑突变斑马鱼及转基因斑马鱼表現类似人类疾病六﹑斑马鱼胚胎研究七﹑研究者在活的斑马鱼身上直接观看器官的发育与病变八﹑解开人与体內活菌共生秘密九﹑斑马鱼胚胎基因有助研究癌症、阿滋海默和帕金森症十﹑视网膜有自我修复潜能十一﹑培育变种斑马鱼可望用于人脸整型十二﹑基因決定人类肤色十三﹑斑马鱼的运动情形肌肉的发育及肌肉与运动神经的调控机制十四﹑细胞如何储存脂肪有助減肥新疗法十五﹑类固醇荷尔蒙的功能与调控十六﹑中神经细胞形成之分子调控机制十七﹑斑马鱼基因调控网路十八﹑干扰斑马鱼基因的技术十九﹑培育环保转基因斑马鱼二十﹑改造斑马鱼基因來试水质二十一﹑利用斑马鱼作为人类疾病模型及药物节选二十二﹑药物节选二十三﹑抗癌药物节选斑马鱼原产于东印度恒河流域,亦分布于巴基斯坦、尼泊尔、缅甸。
斑马鱼成鱼体长约4~5公分,体呈纺锤形,稍侧扁。
体侧从头至尾布满多条蓝色条纹,酷似斑马,故得名斑马鱼。
1.斑马鱼是研究发育生物学的新兴模式动物。
2.斑马鱼由于具有饲育容易、胚胎透明、体外受精、突变种多、遗传学工具成熟等诸多优点,近年来已成为研究脊椎动物发育与人类遗传疾病的新兴模式动物。
3.与其他脊椎动物相较下,斑马鱼最大的优点就是具有多达6000多种的遗传突变种,这些突变种的建立大致上是利用X射线、ENU或反转录病毒的感染造成基因组的突变,之后再经由多次的子代筛选所得。
4.突变种的表征包含如胚层分化,器官发育,生理调适与行为表现等多方面,所以可提供研究人员极佳的正向遗传学材料来进行发育机制上的研究。
5.在斑马鱼系统中也开发出阻断基因功能的工具-Morpholino,可快速以逆向遗传学手法来验证基因的功能。
所以正向遗传学与逆向遗传学的巧妙利用,可以正确推导出斑马鱼遗传发育途径,也是目前斑马鱼成为研究人类疾病新兴模式动物的主要原因。
斑马鱼胚胎发育中的基因表达和动态调节机制
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斑马鱼胚胎发育中的基因表达和动态调节机制斑马鱼是一种非常常见的观赏鱼类,它具有非常高的观赏价值。
不过除了这种独特的外貌,斑马鱼在科学研究中也扮演着非常重要的角色。
因为斑马鱼的胚胎发育过程非常短,只需要几天时间就能在卵黄中进行整个体系的发育,这使得研究人员可以非常方便地对斑马鱼的胚胎发育过程进行研究和观测。
通过对斑马鱼胚胎发育中基因的表达和动态调节机制的研究,我们能够更好地理解动物胚胎发育过程中的机制,同时也能够为后来的生物医学研究奠定基础。
在斑马鱼的胚胎发育过程中,基因表达和动态调节机制起着非常重要的作用。
在胚胎发育的过程中,基因编码的信息会被转录成RNA分子,RNA分子再被翻译成蛋白质。
这些蛋白质随后会参与到各种生物化学反应以及细胞信号传递中,最终构建出斑马鱼的体系。
因此,研究人员可以利用斑马鱼胚胎发育中基因的表达和调节机制来推导它所合成的蛋白质,以及它所参与的反应和细胞信号传递。
在斑马鱼的胚胎发育过程中,基因表达和动态调节机制发挥着非常复杂的作用。
斑马鱼的卵子中充满了各种各样的RNA分子,这些RNA分子可以参与到胚胎发育的过程中。
同时,斑马鱼的胚胎细胞中也充满了各种各样的转录因子和调控蛋白质。
这些转录因子和调控蛋白质都可以对基因的表达和调节产生影响。
通过对这些基因表达和调节机制的研究,研究人员可以逐步地揭示出斑马鱼在胚胎发育过程中所使用的机制。
例如,在斑马鱼的胚胎发育过程中,存在着一类非常关键的基因,它们被称为是胚胎轴形成基因。
这些基因可以控制胚胎发育过程中的体轴向形成。
研究人员发现,这些基因的表达和调节机制是非常精密的。
在斑马鱼的胚胎发育初期,这些基因会被不同的信号通路所调控,使它们能够被精确地表达在体轴向形成需要的位置。
在后来的发育过程中,这些基因的表达和调节机制还会发生相应的变化,以应对斑马鱼在不同发育阶段所需要的不同的身体结构。
除了基因表达和调节机制外,斑马鱼胚胎发育过程中的其他机制也是非常关键的。
斑马鱼遗传和发育生物学
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斑马鱼遗传和发育生物学斑马鱼是一种常见的实验动物,在遗传和发育生物学研究中被广泛使用。
它们的透明胚胎和易于培养的特点使得科学家们可以轻松地观察胚胎发育过程并进行基因操作。
本文将介绍斑马鱼的遗传和发育生物学方面的研究进展。
一、斑马鱼基因组斑马鱼基因组已经被完整测序,包括四组染色体,共有约2.7亿个碱基对。
与人类基因组相比,斑马鱼有很多基因是双倍体,这使得它们成为研究基因功能和基因互作的理想实验动物。
另外,斑马鱼的基因序列也为研究同源基因在不同物种之间的保守性提供了便利。
在斑马鱼基因组中,有很多基因与人类疾病相关。
例如,斑马鱼中的缺氧诱导因子1α基因与心脏病相关。
通过研究这些基因,我们可以更好地理解这些疾病的发病机制和猝死风险等问题。
二、斑马鱼的发育过程斑马鱼的发育过程可以分为四个阶段:受精、卵裂、胚胎形态发生和器官发育。
斑马鱼的卵精细胞很大,并且在受精后会形成球形胚胎。
在接下来的几天里,胚胎会不断分裂,最终形成一个长约2毫米的斑马鱼幼虫。
斑马鱼的发育速度非常快,只需要两天就可以从受精卵变成成熟的斑马鱼。
这使得科学家们可以在短时间内观察多代斑马鱼的发育过程,从而更好地理解发育中的生物学问题,例如细胞分裂、组织形态、器官发育等。
三、斑马鱼的基因操作技术基因编辑技术是现代生命科学的核心工具之一。
通过基因编辑技术,科学家们可以精准地改变一个或多个基因,从而研究基因在发育和疾病中的功能。
斑马鱼是一个理想的基因编辑模型,因为它们的受精卵非常透明,可以轻松地将DNA和RNA注入卵细胞内,或通过转基因方法将外源基因导入受精卵。
目前,常用的斑马鱼基因编辑技术包括CRISPR/Cas9系统和锌指核酸技术。
这些技术已经成功地用于改变斑马鱼基因,包括使其发生突变、生成新的融合蛋白和标记蛋白等。
四、斑马鱼的疾病模型斑马鱼可以被用作人类疾病的研究模型,例如癌症、心脏病、神经疾病等。
斑马鱼和人类之间有很多相似之处,例如生命早期阶段的肌肉和神经系统的形成、免疫系统的发育等。
斑马鱼早期内胚层发育及其分子调控机制
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斑马鱼早期内胚层发育及其分子调控机制
钱林溪;钟涛;宋后燕
【期刊名称】《生命的化学》
【年(卷),期】2005(25)4
【摘要】斑马鱼已成为研究脊椎动物胚胎发育的理想模式生物,它具有体外受精、发育周期快、胚体透明等优点,此外其胚胎发育过程中的信号通路与哺乳动物有很高的同源性。
该文阐述了斑马鱼早期内胚层发育的过程及其分子调控机制。
【总页数】3页(P297-299)
【关键词】斑马鱼;内胚层;分子调控机制;胚胎发育
【作者】钱林溪;钟涛;宋后燕
【作者单位】复旦大学分子医学教育部重点实验室
【正文语种】中文
【中图分类】R394.1
【相关文献】
1.斑马鱼早期内胚层发育及分子调控 [J], 王淏
2.文昌鱼内胚层发育相关核心调控基因的表达 [J], 何春鹏;管锐;田田;陆祖宏
3.斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育分子调节机制研究进展 [J], 黄勇;蔡正旺
4.典型酚类污染物内分泌干扰效应研究
——对斑马鱼发育及核受体介导基因调控的分子影响 [J], 宋静文;靳亚茹;刘红玲5.斑马鱼外胚层早期发育及其某些调控机制 [J], 高广文;钟涛;宋后燕
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实验三 斑马鱼促性腺成熟机器早期发育模式
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第10次卵裂 中期囊胚转换
囊胚早期
囊胚中期 囊胚晚期
囊胚早期 囊胚中期
50%下包
囊胚晚期
Gastrula Period (5.3-10 h)
50%下包
Segmentation Period (10-24 h)
Pharyngula Period (24-48 h)
Hatching Period (48-72点
➢ 斑马鱼胚胎发育时期的记录【选取6个以上 不 同 时 期 的 胚 胎 照 片 , 并 注 明 时 间 hours post-fertilization (hpf)、温度,并对发育过程 做一简单描述,如卵裂类型,原肠作用中的 细胞运动】
实验二 环境因子对斑马鱼胚胎发育的影响(
自主设计实验)
1. 每组选取以下其中一种环境因子
酒精, 洗衣粉,重金属离子(ZnSO4或GuSO4) 葡萄糖,阿斯匹林等
2。稀释到不同浓度(建议3-5个浓度梯度), 以正常发育为对照,观察对斑马鱼胚胎发育的
影响。
提供如下母液:
• 洗衣粉:3%母液 • 酒精:20% • 重金属:1g/L • 阿司匹林1g/L • 葡萄糖:10g/L
Zygote Period (0-.75h)
——卵质向动物极流动,形成胚盘
2-cell
Cleavage Period (0.75-2.2 h)
—— 6次卵裂,15-20 min间隔分裂一次
4-cell
8-cell
Blastula Period (2.25-5.25 h) ——卵黄合胞体层(yolk syncytial layer, YSL) 、表胚层(enveloping layer, EVL)、深层细胞(deep cells)
斑马鱼胚胎发育中内脏器官形成的调控机制
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斑马鱼胚胎发育中内脏器官形成的调控机制斑马鱼是一种常见的实验动物,因其发育迅速,胚胎发育透明,受精卵易获取,能够自然产卵等特点,成为了生物学的重要研究模式之一。
斑马鱼在生物学实验中应用非常广泛,包括内脏器官形成的研究。
本文将简要介绍斑马鱼内脏器官形成的调控机制。
从受精卵到器官形成斑马鱼的受精卵发育经过一系列分裂,最终形成一个球形胚胎。
在胚胎发育的早期阶段,斑马鱼胚胎中没有形成明显的器官结构。
这时,胚胎主要由外胚层、内胚层和中胚层三层结构组成,它们将为斑马鱼的各个器官提供不同的组织结构基础。
随着斑马鱼胚胎的发育,胚胎中逐渐出现了不同的器官结构,呈现出明显的器官分化状态。
内脏器官的发育也是在这个时期开始。
内脏器官包括肝脏、胰腺、肺、肾等,它们各自形成的过程可能不尽相同,但都受到一定的调控。
内源性分子参与内脏器官形成内脏器官的发育需要受到一系列内源性分子的参与。
这些分子在受精卵早期已经被激活,随着发育的进行而逐渐发挥作用。
其中,转录因子是控制内脏器官形成的重要分子。
在斑马鱼胚胎早期,多种转录因子参与调控内脏器官形成的早期过程。
例如,FOXA和GATA等因子参与早期内脏器官前体细胞的特化。
转录因子Nkx2.5在心脏形成中也有重要的作用。
此外,一些 signaling pathway也对内脏器官形成产生调控作用。
例如,Wnt/beta-catenin signaling pathway是控制胆囊和肠道上皮刻画的重要分子。
Notch和Hh signaling pathway参与胰腺beta细胞分化。
外源性环境对内脏器官形成的调控除了内源性因素,外界环境也会对斑马鱼内脏器官的形成产生影响。
例如,一些药物可以激活或抑制内脏器官形成的过程。
环境因素,如温度、营养物质、化学物质等,对胚胎的形成也有影响。
另外,行为环境也可能对斑马鱼内脏器官的形成产生影响。
例如,斑马鱼胚胎在母鱼叶牙对其进行保卫行为时,其形成的肾脏功能会变得更加完善。
斑马鱼实验报告
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斑马鱼胚胎发育实验报告斑马鱼(zebra fish),体长约4公分,具暗蓝与银色纵条纹,由于其基因与人类87%相似,因此广泛应用与生命科学的研究。
对水质要求不高,孵出后约3个月达到性成熟,成熟鱼每隔几天可产卵一次。
卵子体外受精,体外发育,胚胎发育同步且速度快,胚体透明。
发育温度要求在25-31℃之间。
斑马鱼的繁殖周期约7天左右,受精卵经2-3天可孵出仔鱼,一年可连续繁殖6-7次,而且产卵量高。
斑马鱼的胚胎发育分为7个阶段:1.合子期;2。
分裂期;3.囊胚期;4.原肠胚期;5.体节期;6.咽囊期;7.孵化期。
1.合子期:合子是一个包括卵黄和细胞质的半透明混合物,在动物极存在一个小的清晰的细胞质断层,即细胞泡的残余。
2.卵裂期:该时期的特点是细胞分裂间期短;细胞变小;不等裂。
斑马鱼的受精卵为端黄卵,卵裂局限于胚盘部分,为不完全卵裂。
斑马鱼受精后40分左右卵裂开始,平均约每隔15分卵裂一次。
3.囊胚期:从第八次卵裂开始,就进入囊胚期,与其他真骨鱼不同的是,斑马鱼的囊胚期不形成囊胚期腔,只在胚盘的下层细胞的一些小的细胞形成一些细胞外间隙;同时细胞分裂周期开始延长,标志着中胚囊转换开始。
4.原肠胚期:原肠作用是指囊胚细胞有规则的移动,在此时期斑马鱼的生殖层开始形成,斑马鱼的原肠运动主要为外包。
5.体节期:最显著的特征是近轴中胚层节律性分节形成体节。
此外,还有眼原基和耳原基开始出现:脑神经外胚层变厚;脊索细胞开始延展到胚胎尾部6.咽囊期:体轴从原来的弯曲变为伸直;鳍条开始发育7.孵化期:完成基本器官系统的快速形态发生。
以下是对各时期鱼卵的观察记录:左上和左下示未分裂情况合子期右下示1细胞时期示1细胞时期示64至1000细胞时期示。
斑马鱼实验报告
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实验方法:控制变量法(探究其他条件相同时,不同温度对斑马鱼胚胎发育的影响)
培养液编号
1
2
3
4
5
水温/摄氏度
5
15
25
35
45
发育速度
参考:/view/48428.htm#2
/news/P1P44I6045195.html
体长4~6厘米。体呈纺锤形。背部橄榄色,体侧从鳃盖后直伸到尾未有数条银蓝色纵纹,臀鳍部也有与体色相似的纵纹,尾鳍长而呈叉形。雄鱼柠檬色纵纹;雌鱼的
蓝色纵纹加银灰色纵纹。
斑马鱼
2、斑马鱼的分类地位
动物界
脊索动物门
脊椎动物亚门
硬骨鱼纲
辐鳍亚纲
真骨鱼总目
鲤科
短担尼鱼属
3、设计实验
斑马鱼的胚胎发育经过受精卵、卵裂、囊胚、原肠胚、神经胚、胚层分化及出膜几个时期。
斑马鱼实验预习报告
一、实验目的
1、了解斑马鱼形态结构特点
2、掌握斑马鱼的分类地位
3、掌握斑马鱼胚胎发育过程并探究其胚胎发育的影响因素
二、实验内容
1、斑马鱼的外部形态观察
2、写出斑马鱼的分类地位
3、设计实验探究斑马鱼胚胎观察斑马鱼的形态
斑马鱼(zebra fish),又名蓝条鱼、花条鱼、斑马担尼鱼(Brachydanio rerio),原产于印度、孟加拉国。斑马鱼(B. rerio),是淡水水族箱观赏鱼,原产於亚洲,体长约4公分(1.5吋),具暗蓝与银色纵条纹。
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山东大学模式动物发育生物学实验报告
斑马鱼体节发育调节因子对胚胎发育的影响
姜政 2012/10/4 实验目的:
练习用显微注射法向斑马鱼受精卵中注射体节发育调节因子的mRNA,观察两种体节调节因子过表达作 用下斑马鱼胚胎发育的形态特点和规律,了解两种调节因子作用于斑马鱼体节发育的机理。 实验方法:
3
Antivin(Lefty)是TGF-β(Transforming Growth Factor-β)超家族中的一个子家族,Antivin的过表达会阻 碍斑马鱼头部和躯干中胚层的发育。Activin的表达与体节调节过程并存,主要作用是减弱原肠期体节信号通 路,是体节调节通路中Cyc和Sqt的拮抗剂,因此Antivin与Sqt等组成了原肠期体节发生的正、负反馈调节因子。 Antivin过表达使斑马鱼体节调节控件Cyc、Sqt作用降低,反过来,Antivin的影响也可以被Cyc和Sqt的过表达 消除。体节分化过程中反馈调节的大致过程是:上游的调节因子启动Sqt、Cyc等的表达,并形成正反馈循环, 同时起始Antivin在中胚层的表达形成体节调节的负反馈循环(图3,右)。Antivin作为拮抗剂可能的机理是阻 断了体节调节受体与Sqt等配体的结合,使受体无法被激活[7]。通常,Antivin过表达的胚胎仅仅由前脑和眼 睛构成[6],而实验观察发现,多数胚胎最终并没有发育出完整的眼睛,而且Nodal通路的受阻也彻底破坏了 胚胎的血液循环系统(图2)。在胚胎发育的体节期晚期,Lefty家族蛋白(Lefty1、Lefty2等)分别在胚胎左 侧的中脑和基板不对称表达,这显示了Lefty家族蛋白在胚胎左右轴决定(图4)中的作用[8]。
体节信号通路(Nodal Signaling)是斑马鱼中内胚层分化的最初步骤。Squint(Sqt)是一种在中胚层形成 和分化过程中与体节调节相关的生长因子[1]。通常,Sqt与其同系物cyclops(Cyc)共同在体节通路上发挥作 用(图3,左)。Cyc和Sqt都在囊胚期末期的中内胚层胚盘边缘处表达,其中Sqt在卵黄合胞体层(YSL)表达, 两者都是中胚层分化的诱导信号。Cyc和Sqt的同时缺失会导致原肠期中胚层的退化并进一步导致大部分中胚 层和内胚层的缺失,表现为头部、躯干缺失以及胚环不能形成[2, 3, 4]。
图3. 斑马鱼体节调节通路示意图(左)和正、负反馈调节模型(右)(引自Malcolm Whitman 2001)。 2
模式动物发育生物学实验报告——体节调节因子对斑马鱼胚胎发育的影响
通常,Sqt的过表达会导致背侧中胚层的异位和扩增,一些胚胎甚至形成副轴[5]。实验观察(图1)证明 了这一表型。在神经的早期发育过程中,Sqt和bozozok(Boz)是β-环连蛋白下游相互平行的调节蛋白,共 同促进神经前体的发育,Boz和Sqt同时缺失会导致胚胎端脑缺失[6]。
采集斑马鱼受精卵,用显微注射法向三批一定数量的受精卵中分别注射适量Squint配体mRNA、拮抗剂 Antivin (Lefty)mRNA和绿色荧光蛋白mRNA(作为实验对照),注射位置位于卵黄接近胚盘的部分。将 注射之后的受精卵加入ER营养液以28.5℃培养,定时观察胚胎发育情况并做照相记录。 实验结果:
图4. Lefty与Cyclops在斑马鱼胚胎中轴线和对称性形成过程中可能的作用模型(引自Bisgrove B.W. et al. 1999)。
参考文献: 1. Yu Chen, Alexander F. Schier. The zebrash Nodal signal Squint functions as a morphogen. Nature, 411(31): 607-610, (2001). 2. Malcolm Whitman. Nodal Signaling in Early Vertebrate Embryos: Themes and Variations. Developmental Cell, Vol. 1, 605–617, (2001). 3. Alexander F. Schier, Michael M. Shen. Nodal signalling in vertebrate development. Nature, 403(27): 385-389, (1999). 4. Hans Martin Pogoda, Lilianna Solnica Krezel, Wolfgang Driever and Dirk Meyer. The zebrafish forkhead transcription factor FoxH1/Fast1 is a modulator of Nodal signaling required for organizer formation. Current Biology, 10:1041–1049, (2000). 5. Alexander F. Schier and William S. Talbot. Nodal signaling and the zebrafish organizer. Int. J. Dev. Biol. 45: 289-297, (2001). 6. Stephen W. Wilson and John L. R. Rubenstein. Induction and Dorsoventral Patterning of the Telencephalon. Neuron, 28: 641–651, (2000). 7. Meno. C., Gritsman. K., Ohishi. S., Ohfuji. Y., Heckscher. E., Mochida. K., Shimono. A., Kondoh. H., Talbot W.S., Robertson E.J. et al. Mouse Lefty2 and zebrafish antivin are feedback inhibitors of Nodal signaling during vertebrate gastrulation. Mol. Cell, 4: 287–298, (1999). 8. Bisgrove B.W., Essner J.J., Yost H.J.. Regulation of midline development by antagonism of Lefty and Nodal signaling. Development, 126: 3253–3262, (1999).
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图1. 注射Squint配体mRNA的斑马鱼胚胎发育情况。 Squint蛋白过表达的斑马鱼胚胎在原肠期即开始发生形态异常(图1. Sqt 5h),胚层细胞外包时卵黄为
椭球形而不是正常的卵圆形。在体节期,异常主要表现为背部胚层过度发育(类似于锂离子处理32细胞期 胚胎的发育情况),背侧体节排列紊乱(图1. Sqt 18h右图箭头)。30h后,胚胎的畸形更加明显,具体表现 为:躯干背侧细胞增生(图1 Sqt 30h箭头),而同时期正常胚胎背部棱角分明;头部主要器官如眼原基和脑 的大部分缺失,没有明确的器官结构;心包膜与卵黄分离不正常。40h后,胚胎已经有大量黑色素细胞覆盖; 尾部伸展;红细胞开始出现,但心脏部位仍然紧贴腹侧卵黄,且没有心跳和血液循环,心包膜中空透明; 头部缺失,仅能看到耳囊。Squint过表达的胚胎存活率极低,绝大部分停留在了体节期。
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模式动物发育生物学实验报告——体节调节因子对斑马鱼胚胎发育的影响
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图2. 注射拮抗剂Antivin(Lefty)mRNA的斑马鱼胚胎发育情况。 Antivin过表达的斑马鱼胚胎最主要的形态异常是背部发育缺失,这与Squint过表达胚胎的表现相反。在
第5h原肠期时,大部分胚胎形态与图2. Lefty 5h相近,胚层下包不均匀,而不是正常胚胎的50%外包。进入 体节期和咽囊期,多数胚胎表现出了明显的背部缺失,具体表现为背部躯干没有明显的体节特征,且背部 与尾部相连处躯干缺失(图2. Lefty18h、Lefty29h箭头)。此外,上述胚胎还伴有卵黄不规则变形,头部眼原 基发育异常。50h左右进入孵化期的胚胎,躯干扭曲不能随绒膜形状自然伸展;卵黄形状不规则,心包膜缩 小;有红色血液产生但没有心跳和血液循环;眼睛缺失。 讨论: