GaussView5基础教程
高斯软件-基础教程
GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview就是一个专门设计于高斯配套使用得软件,其主要用途有两个:构建高斯得输入文件;以图得形式显示高斯计算得结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem与晶体数据等诸多格式得文件.从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围.开启GaussView会瞧到一大一小两个窗口,后面灰色背景得窗口为选择窗口,在里面选择要输入得分子或基团;前面紫色得窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制得图形。
菜单栏▪【File】主要功能就是建立,打开,保存与打印当前得文件▪【Edit】完成对分子得剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关得都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后得结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会瞧到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制得元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只就是这里提供得都就是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用得R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用得基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次就是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面得所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏就是最常用得,几乎所有软件都有得新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
GaussView高斯软件教程
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View 这里面的选项都是于分子的显示有关的,如显示氢原子,显示键,显示 元素符号,显示坐标轴等
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可从Gview中直接向高斯提交计算。这是Gview作为高斯软件配套功能的重要体现。 从所给的对话框中可以选择工作类型Job Type(如优化,能量或频率等);计算方法 Method(如半经验方法,HF方法,DFT方法,MP方法等,还可以选定组);Title(对所 要做的计算给一个说明,以备以后的查看) Link 0(给检查点文件命名,还可以在此用 RWF命令设置临时数据交换文件的大小); General,Guess,(这两个选项主要是给出体 系中各原子的连接关系及如何给出初始猜测);NBO(可在此设定NBO计算),PBC (可在此设定晶体的有关计算), Solvation(可在此设定溶液中的计算,除了选择溶剂 外,还要选择模拟溶剂的理论模型)
GaussView使用简介
Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其 主要用途有两个构建高斯的输入文件以图的形式显示 高斯计算的结果除了可以自己构建输入文Байду номын сангаас外, Gview还可读入CHEM3D,HYPERCHEM和晶体数据 等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连 用,大大拓宽了使用范围(详见下图)
GaussView基础教程
GaussView教程【1】——界面介绍Gview就是一个专门设计于高斯配套使用得软件,其主要用途有两个:构建高斯得输入文件;以图得形式显示高斯计算得结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview 还可读入Chem3D,HyperChem与晶体数据等诸多格式得文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会瞧到一大一小两个窗口,后面灰色背景得窗口为选择窗口,在里面选择要输入得分子或基团;前面紫色得窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制得图形。
菜单栏▪【File】主要功能就是建立,打开,保存与打印当前得文件▪【Edit】完成对分子得剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关得都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后得结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会瞧到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制得元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只就是这里提供得都就是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用得R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用得基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次就是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面得所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏就是最常用得,几乎所有软件都有得新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
gaussview使用简介PPT课件
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(3).在当前工作窗口(打开Gview时程序自动打开一个工作窗口,如下图)也可通过 File-new 路径 新建一个工作窗口
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在这个窗口中点鼠标左键窗口中就会出现苯分子,见下图
将鼠标放在分子上,按左键左右或前后移动,可以调节分子的角度将鼠标放在分子上, 前后移动,可以将分子放大或缩小Shift+Alt+鼠标左键组合可以在窗口内平移分子
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(8).单击Gview界面上 图标。然后点击与乙烷正对的苯上的C原子和H原子选择 “None”,乙烷上的C-H键作类似处理然后单击Gview上的 图标,点选工作窗口中的 两个氢原子,即将它们删去
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至此分子构建已完成。
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9).Gview存储个人常用分子的功能。Gview中只有常用的一些环状分子和链状分子, 远不能满足研究特定体系的特殊需要。不过Gview有一个功能可以弥补这个缺憾:可 以把常用的分子或官能团存在制定的文件夹内。在需要时可以直接调用。双击view上 的 图标,在下面的对话框中键入相关项目,保存即可
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Result :显示计算的结果,包括电荷,静电势表示的表面,振动,频率,核磁,势能面 扫描,优化等。注意有些结果只能 用检查点文件才能显示。
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常用功能键的介绍
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GaussView使用简介
Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其 主要用途有两个构建高斯的输入文件以图的形式显示 高斯计算的结果除了可以自己构建输入文件外, Gview还可读入CHEM3D,HYPERCHEM和晶体数据 等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连 用,大大拓宽了使用范围(详见下图)
GaussView5 基础教程
GaussView教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
菜单栏▪【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件▪【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
1、开启Gview2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。
GaussView讲解
Z表示时内坐标,C表示直角坐标。可以在里面对坐标做适当的调整
(12).向Gauss递交计算。点Gview界面上Calculation 会出来一个递交计算的对话框。从所给的对话框中可以选择工作类型Job Type(如优化, 能量或频率等);计算方法Method(如半经验方法,HF方法,DFT方法,MP方法等, 还可以选定基组);Title(对所要做的计算给一个说明,以备以后的查看) Link 0(给检查 点文件命名,还可以在此用RWF命令设置临时数据交换文件的大小); General, Guess,(这两个选项主要是给出体系中各原子的连接关系及如何给出初始猜测); NBO(可在此设定NBO计算),PBC(可在此设定晶体的有关计算), Solvation(可在 此设定溶液中的计算,除了选择溶剂外,还要选择模拟溶剂的理论模型)的Gaussian
错误的判断。
(8).单击Gview界面上 图标。然后点击与乙烷正对的苯上的C原子和H原子选择 “None”,乙烷上的C-H键作类似处理然后单击Gview上的 图标,点选工作窗口中的 两个氢原子,即将它们删去
高斯软件-基础教程
GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
菜单栏?【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件?【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等?【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等?【Calculate】直接向Gaussian提交计算?【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果?【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等?【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
gaussview软件使用手册 ()
G a u s s v i e w软件使用手册GaussView是一个被设计来帮助准备输入进入高斯软件的文档以及以图形的形式来检验高斯软件完成并输出的结果的图形化的用户界面。
GaussView是不在高斯软件的计算模块中,而是以前端/后端的模式来协助高斯软件的运行。
GaussView为高斯用户提供了三种主要的便利。
首先,通过它先进的可视化工具,GaussView使得用户可以很快的做出大分子的结构图甚至是很大的分子,然后旋转,在这些分子的基础上经过简单的搜寻操作来编译和放大。
它同样可以载入例如PDB类型的标准的分子结构文档。
第二,GaussView使得建立多种形式的高斯计算变得容易。
它使得准备为普通工作模式以及如ONIOM,QST2/OST3转变结构优化方法,CASSCF计算方法,周期边缘状态计算方法(PBC)以及其他的许多前沿方法的复杂的载入更加简单。
如果高斯软件被安装在了同一台电脑上的话,用户同样可以使用GaussView来进行工作。
最后,GaussView使得用户可以通过多种的图形技巧来检验高斯计算的结果。
高斯的计算结果中可以用图形来表示的有下列几种:1.经过优化的分子结构;2.分子轨道3.任何估算密度的电子密度表面;4.静电潜在表面;5.原子价;6.与振动频率相符的一般模型;7.IR,Raman,NMR,VCD以及其他的频谱;8.结构优化,IRC反应途径的后续,能级表面的扫描以及ADMP和BOMD轨道的模拟;9.整体能量的小部分以及其他来自于相同工作类型的数据;这本书为所有的GaussView结构提供了一个参考。
该软件的每一个程序的结构都被详细记录。
将项目按照一般目的分类。
在每一个分类中,项目是按照逻辑结构来排列的,开始于最简单的项目,然后是引用最广泛的项目,最后是更加复杂和不经常使用的项目。
为了找出用户感兴趣的特殊信息,可以通过索引来打开有关主题或者是特殊的对话框。
颜色收集以及对话在索引中的主题菜单下(下面直接中英语)显示了出来。
高斯软件基础教程
高斯软件基础教程高斯软件基础教程Revised by BLUE on the afternoon of December 12,2020.GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
菜单栏【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等【Calculate】直接向Gaussian提交计算【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
高斯软件-基础教程
高斯软件-基础教程GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview就是一个专门设计于高斯配套使用得软件,其主要用途有两个:构建高斯得输入文件;以图得形式显示高斯计算得结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChe m与晶体数据等诸多格式得文件.从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围.开启GaussView会瞧到一大一小两个窗口,后面灰色背景得窗口为选择窗口,在里面选择要输入得分子或基团;前面紫色得窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制得图形。
菜单栏【File】主要功能就是建立,打开,保存与打印当前得文件【Edit】完成对分子得剪贴、拷贝、删除、抓图等【View】与显示分子相关得都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等【Calculate】直接向Gaussian提交计算【Results】接收并显示Gaussian计算后得结果【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会瞧到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制得元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只就是这里提供得都就是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用得R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用得基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次就是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面得所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏就是最常用得,几乎所有软件都有得新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
高斯软件基础教程
高斯软件基础教程 Revised by BLUE on the afternoon of December 12,2020.GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
菜单栏【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等【Calculate】直接向Gaussian提交计算【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
GaussView5 基础培训教材
GaussView教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
菜单栏▪【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件▪【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
1、开启Gview2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。
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除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
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快速工具栏
【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;
【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等
【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸
【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处
这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】
这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏
这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具
GaussView教程【2】——构建分子
这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
1、开启Gview
2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环
在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。
单击左键,可以将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口;
按上下左右键,或者左键单击不放移动鼠标,可以调节分子的角度;
滚动鼠标滚轮,可以放大缩小分子;
按住shift键,左键单击不放移动鼠标,可以移动分子;
当工作窗口内有多个分子时(在构建大的分子时,这种情况很容易出现)
用Shift+Alt+鼠标左键组合,移动想要移动的分子;
用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子的角度;
双击图标(或者左键不放),在元素周期表中选择【F】元素,回到工作窗口在苯的任意一个【H】上单击,使之变成【F】
双击图标,从链烃库中选择【乙基】(第一个),然后点击间位上的【H】即可
至此,分子式已经构建完成,Gview存储个人常用分子的功能,双击view上的图标,在下面的对话框中键入相关项目,保存即可。
(注:我的程序此项功能不行,用户自定义基团)
查看分子坐标:单击Gview界面的图标,查看分子的坐标。
至此,我们保存一下我们构建好的间氟苯乙烷分子,在绘图界面右键单击【File】——【Save】然后选择保存路径即可。
GaussView教程【3】——向Gaussian提交计算
上一讲我们已经构建好了一个间氟苯乙烷分子,现在打开间氟苯乙烷分子。
点击Gview界面上的【Calculate】——【Gaussian Calculate Setup】
从对话框中我们可以选择许多参数,下面依次选择一下
【Job Type】工作类型:
【Energy能量】|【Optimization优化】|【Frequency频率】|【Opt+Freq 优化+频率】|【Scan扫描】|【Stability稳定性】|【NMR核磁】,
这里我们选择【NMR】核磁
【Method】方法:每种计算模式都提供了若干种方法,这里选择默认值即可
【Title】题目:这项可以根据自己的项目自行命名
【Link 0】给检查点文件命名
其它选择默认即可
选好后点击【Submit】提交至Gaussian,并保存。
(最好存到安装文件所在磁盘)
系统会询问是否提交至Gaussian,选择【OK】,Gaussian会自动开启并计算,计算时间因硬件配置而异
计算完毕后系统会提示关闭Gaussian,点击【是】
计算完毕后会生成两个文件,.log的是系统日志,便于查看计算结果。
这里我们选择.chk文件【Ok】
接下来我们又一次看到了刚才绘制的那个分子,表面上没什么不同,但这次我们可以预言它的许多性质了,在GView的主界面点击【Results】——【Summary】可以看到刚才的计算总结,点击【View File】可以看到日志文件。
因为我们刚才选择计算模式是【NMR】核磁,所以我们点击【Results】——【NMR】,随即我们看到了很熟悉的核磁图谱,但似乎很乱,因为这是所有元素的核磁谱图,在左下方【Element】右方选择【H】,即H谱,旁边【Reference】选择【TMS HF/6-31G(d)】,这次我们就可以看到间氟苯乙烷分子理论计算的核磁谱图了。
在绘图界面右击【View】——【Labels】可以看到每个H原子对应场中的位置。
(注:文档可能无法思考全面,请浏览后下载,供参考。
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