2020年(生物科技行业)生化及分子生物学大实验

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分子生物学综合大实验实验报告

分子生物学综合大实验实验报告

分子生物学综合大实验实验报告分子生物学综合大实验实验报告外源基因SOC1的扩增和重组载体的构建与筛选班级姓名学号实验目的通过PCR技术克隆外援基因SOC1的目的片段。

通过质粒提取,酶切和连接技术,把SOC1基因重组进TA克隆载体并完成筛选。

实验用品材料:植物叶片,TA克隆载体试剂:DNA提取液(1L)TE缓冲液;琼脂糖;核酸染料;;DNAmarker;6×上样缓冲液(0.25%溴酚蓝、0.25%二甲苯青FF、30%甘油)、DNA聚合酶、dNTP、上下游引物器材:研钵,恒温水浴,离心机,离心管,PCR仪、生化培养箱、电泳仪、电泳槽、凝胶成像系统,去离子水、超净工作台,低温台式离心机,分光光度计,水浴锅,高压灭菌锅,酒精灯等。

实验原理通过配制DNA提取液,利用研磨法获得DNA模板,然后采用PCR技术扩增基SOC1基因获得目的片段,然后通过酶切和连接方法把SOC1基因连接到TA载体上。

大肠杆菌感受态细胞中加入质粒,则质粒DNA与Ca2+形成的复合物粘附于细胞表面,经过42℃短暂的热激处理后,DNA与Ca2+形成的复合物进入大肠杆菌细胞,在不含抗生素的培养基中短暂培养,使转入大肠杆菌质粒上的抗生素抗性基因表达,在含相应抗生素的选择培养基上可将转化菌(含质粒)与未转化细菌分开,转化细菌经过不断分裂增殖形成菌落,而未转化的细菌则不能。

并通过氨苄抗性筛选获得重组子实验方法步骤1、植物基因组DNA的小量提取(1)剪取新鲜幼嫩的植物叶片1~2片于1.5 mL离心管中.(2)先加入少量的DNA提取液100 μL,用研磨棒充分研磨尽量避免提取液溅出。

(3)再加入600 μL的DNA提取液,使DNA提取液的总体积为700μL,上下颠倒混合均匀。

(4)放入高速离心机4℃条件下12 000 rpm离心15 min。

(5)取上层水相,移入标有相应序号的新的离心管中,加入600 μL的异丙醇(与加入DNA 提取液的总体积相同),上下颠倒混匀。

分子生物学实验报告

分子生物学实验报告

分子生物学实验报告
实验目的:
通过本次实验,我们旨在探究DNA复制、基因表达和蛋白质合成等分子生物学的基本原理,加深对分子水平生物学过程的理解,培养实验操作技能和科学思维能力。

实验材料与方法:
1. 实验材料:大肠杆菌(E. coli)细菌菌斑、DNA提取试剂盒、PCR试剂盒、琼脂糖、琼脂糖电泳试剂、PCR扩增仪、电泳仪等。

2. 实验步骤:
a. DNA提取:取一支含E. coli细菌菌斑的移液管,用DNA提取试剂盒提取DNA。

b. PCR扩增:将提取的DNA加入PCR试剂盒中进行PCR扩增反应。

c. 原核表达:将扩增后的DNA片段转入大肠杆菌进行原核表达。

d. SDS-PAGE电泳:将蛋白质样品加入琼脂糖凝胶,通过电泳进行蛋白质分子量的分离。

实验结果与分析:
1. DNA提取:成功提取到E. coli细菌的DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳观察到DNA的带型。

2. PCR扩增:成功扩增出目标DNA片段,并经过验证测序结果正确。

3. 原核表达:大肠杆菌成功表达了目标蛋白质,通过SDS-PAGE电泳观察到目标蛋白质的条带。

4. SDS-PAGE电泳:观察到蛋白质的分子量差异,验证了蛋白质的分离效果。

结论与讨论:
通过本次实验,我们成功实现了DNA提取、PCR扩增、原核表达和蛋白质分离等分子生物学实验步骤,从而全面了解了分子生物学过程的基本原理。

实验结果表明,实验操作规范,结果可靠,为今后的科研工作和实验基础奠定了坚实的基础。

同时,也发现了实验中的一些不足之处,提出了改进的建议,为进一步的研究工作提供了参考。

参考文献:
无。

2024年《分子生物学实验》课程教学大纲

2024年《分子生物学实验》课程教学大纲

《分子生物学试验》课程教学大纲课程编号: 05030适用专业:生物工程与生物技术试验学时数:36学时试验学分:1教材:主要参考书:《分子生物学试验指导》徐庆华等成栋学院立项教材 2024一、课程说明《分子生物学试验》以介绍分子生物学中的试验方法、试验手段和培育学生试验操作技能为其主要内容。

须要以分子生物学基本理论为基础,其教学目的是为了提高学生在分子生物学技术方面的动手实力,培育学生分析问题和解决问题的实力。

通过试验,要求学生能在原有的相关理论学问基础上较全面和深化理解分子生物学基本原理,驾驭基本的分子生物学试验方法和技巧,初步具备肯定的试验设计实力,以求为以后的学习和科研工作打下良好和扎实的基础。

本试验课在方法上力求经典,试验内容涉及了质粒DNA的提取及限制性内切酶酶切质粒分析;大肠杆菌感受态细胞的制备及质粒DNA转化大肠杆菌;应用多聚酶链式反应(PCR)体外基因扩增及产物鉴定;SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳测定蛋白质分子量等分子生物学的基本理论。

二、学时安排三、教学内容及教学基本要求试验一碱裂解法小量提取质粒DNA及琼脂糖凝胶电泳检测一、试验特点试验类型:综合试验类别:专业基础安排学时:6 每组人数:2二、试验目的1、驾驭碱裂解法小量提取质粒DNA和试剂盒提取质粒DNA的原理和方法。

2、驾驭琼脂糖凝胶的制备及外源DNA的检测原理。

3、了解质粒DNA的粗略定量方法。

三、试验内容提要1、将单菌落接种于3m1含相应抗生素的LB培育基中,37℃摇菌过夜;2、12,000rpm离心30sec,收集菌体;3、加200u1溶液I(含RNaseA 100ug/ml ),振荡悬浮菌体;4、加200ul新配制的溶液II,颠倒混匀;5、溶液澄清后马上加入预冷的200u1溶液III混匀后冰上放置5~10 min;6、4℃、12,000rpm离心15min,取上清,加0.7倍异丙醇混匀,室温静置5min;7、12,000rpm离心10min,70%乙醇洗涤沉淀,抽干后溶于适量水或TE,-20℃保存备用。

分子生物学实验总结

分子生物学实验总结

分子生物学实验总结分子生物学实验总结分子生物学作为生物科学中的一个重要分支,在现代生物学研究中具有重要的地位。

通过分子生物学实验,可以研究生物分子的结构、功能、调控以及相互作用等方面的问题,对生物学研究具有重要的推动作用。

在本次实验中,我们进行了一系列的分子生物学实验,对于实验原理和方法进行了学习,并实际操作了实验操作步骤。

现将本次实验的主要内容及结果进行总结。

本次实验主要涉及到了分子生物学中的PCR技术、酶切与连接以及基因测序等实验技术。

首先,我们对PCR技术进行了学习和实验操作。

PCR技术是一种人工合成DNA的方法,通过此技术可以对DNA片段进行扩增,从而快速制备大量的特定DNA序列。

在实验中,我们根据给定的DNA模板及引物,按照PCR反应的标准条件,使用热循环仪进行了PCR扩增。

通过观察PCR扩增体系中DNA条带的出现与扩增效果,我们得到了我们所需要的特定DNA片段。

接下来,我们进行了酶切与连接实验。

酶切与连接是分子生物学中的重要实验技术,能够对DNA分子进行精确的酶切,并通过连接酶将不同DNA片段连接在一起。

在实验中,我们选择了限制性内切酶进行酶切,根据选定的酶切位点设计引物,通过PCR扩增获取所需的DNA片段。

然后,我们使用连接酶对目标DNA片段进行连接,连接产物经电泳检测,观察到目标片段已成功连接。

最后,我们进行了基因测序实验。

基因测序是分子生物学中的重要技术,可以获得DNA序列信息,从而揭示基因的变异,研究基因的功能等。

在实验中,我们根据已揭示出的DNA序列设计引物,对特定的DNA片段进行测序。

通过对测序结果的阅读和分析,我们准确地获得了目标DNA片段的DNA序列。

通过本次实验,我们不仅学习了分子生物学的相关理论知识,还亲自操作了PCR、酶切与连接以及基因测序等实验步骤,进一步强化了我们对于分子生物学原理和实验技术的理解。

此外,我们还学习了实验数据的分析和解读,培养了我们科学研究的能力。

分子生物学实验

分子生物学实验

分子生物学实验分子生物学实验是一种研究生物体分子结构、功能和交互作用的实验方法。

本文将介绍分子生物学实验的一般步骤和常用技术,并以DNA提取和PCR扩增为例,详细描述了实验的具体步骤和操作。

分子生物学实验一般包括以下几个步骤:实验前的准备、生物样品的采集和处理、核酸提取、酶切和电泳、PCR扩增、蛋白质表达等。

实验前的准备包括实验设计、试剂的准备和设备的调试。

根据实验目的和问题,确定实验设计和具体操作步骤,选择适当的试剂和设备,并对实验条件进行优化。

生物样品的采集和处理是分子生物学实验的基础。

根据研究对象不同,可以采集细胞、组织、血液等生物样品,并进行预处理,如细胞培养、组织切片、离心等。

核酸提取是从生物样品中分离出核酸的步骤。

核酸提取可以使用化学方法或基于特定原理的商业试剂盒。

其中,常用的方法有酚/氯仿法、骨架蛋白法、磁珠法等。

酶切和电泳是分子生物学实验中常用的技术手段。

酶切是通过限制性内切酶对DNA进行特异性切割,生成特定大小的DNA片段。

电泳是利用电场对DNA片段进行分离和检测,可通过琼脂糖凝胶电泳或聚丙烯酰胺凝胶电泳进行。

PCR扩增是一种重要的分子生物学实验技术。

PCR通过不断循环的变性、退火和延伸过程,在体外扩增DNA序列。

PCR 需要DNA模板、引物、核苷酸和聚合酶等关键试剂。

PCR扩增过程包括初始变性、循环扩增和最终延伸。

扩增产物可通过琼脂糖凝胶电泳进行分析和检测。

蛋白质表达是研究蛋白质功能和结构的重要实验手段。

常用的蛋白质表达系统包括原核表达系统和真核表达系统。

表达载体经过构建和转染后,利用细胞的表达机制使蛋白质在体内合成。

总之,分子生物学实验是研究生物体分子结构和功能的重要方法。

通过实验前的准备、生物样品的采集和处理、核酸提取、酶切和电泳、PCR扩增、蛋白质表达等步骤,可以获得关于生物体分子结构和功能的有价值的信息。

生物技术大实验完整版

生物技术大实验完整版

生命的基本特征:①细胞是生物的基本组成单位(病毒除外)②新陈代谢、生长和运动是生命的基本功能③生命通过繁殖而延续,DNA是生物遗传的基本物质④生物对外界可产生应激反应和自我调节,对环境具有适应性生物学经历的三个阶段:描述生物学阶段、实验~、创造~生物技术:也称生物工程,是以现代化生命科学为基础,运用先进科学原理和工程技术手段按预先的设计来加工或改造生物材料,从而产生出人类需要的产品或达到某种目的生物技术发展三个阶段:作坊式生物技术、工业化~、现代~生物技术内容:基因工程技术、细胞~、酶~、发酵~、蛋白质~细胞工程:指以细胞为对象,应用生命科学理论,借助工程学原理与技术,有目的地利用或改造生物遗传特性,以获得特定的细胞、组织产品或新型物种的一门综合性科学技术蛋白质工程:是以蛋白质结构功能关系的知识为基础,通过周密的分子设计,把蛋白质改造为合乎人类需要的新的突变蛋白质。

蛋白质工程也成为“第二代基因工程”生物技术基本特征:①高效益②高智力③高投入④高竞争⑤高风险⑥高势能透光度t:某一波长的光透过某一物质的溶液时,其入射的角度I0与透过溶液后的强度I相比发生了变化:I与I0的比值(I /I 0)称为透光度实验室常用水的制备:①利息交换法②蒸馏法③反浸法④超纯法消毒灭菌方法:①高压高温灭菌②干热灭菌③滤膜灭菌④化学消毒法⑤紫外线灭菌⑥抗生素灭菌消毒核酸的一级结构:线性结构,核苷酸的排列顺序,也称碱基序列二级结构:双螺旋结构三级结构:超螺旋结构DNA的变形:在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程增色效应:核酸变性后,在260nm处吸收值上升DNA的复性:在适当条件下,变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象减色效应:DNA复性时,OD260值下降影响复性速度的因素:①溶液温度的高低②单链片段的大小③单链片段浓度④溶液离子强度的大小⑤片段内重复序列的多少OD260的应用:OD260=1.0 相当于①50ug/ml 双链DNA ②40ug/ml 单链DNA或RNA③20 ug/ml 寡核苷酸基因(分子生物学概念):基因是DNA双螺旋分子中含有特定遗传信息的一段核苷酸序列管家基因:某些基因是维持细胞基本代谢所必须的基因,其在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达阅读框架:在DNA链上,由蛋白质合成的起始密码开始,到终止密码子为止的一个连续编码序列基因的结构:外显子、内含子、前导区、尾部区、调控区三个关键因素:①自由复制的DNA序列②着丝粒DNA序列③端粒DNA序列原核生物和真核生物染色体的区别:①原核生物的染色体实质上是一个裸露的DNA双螺旋结构,DNA通常呈环状,且与相对少量的蛋白质结合,长度可打达几厘米,DNA复制从单一复制起点开始②真核生物都有许多线状的染色体,且染色体存在于细胞核内,真核生物染色体由DNA、组蛋白、RNA、非组蛋白等成分组成。

分子生物学实验3篇

分子生物学实验3篇

分子生物学实验第一篇:PCR技术在分子生物学中的应用PCR(聚合酶链式反应)是分子生物学中一项广泛应用的技术,被用于DNA的扩增和检测。

PCR技术已经成为了分子生物学和生物医学研究的基础技术之一。

PCR技术被广泛的应用于遗传学、人类学、医学研究、植物学和动物学研究等各领域。

PCR技术的基本原理是:通过提取DNA,将DNA特异性引物与模板DNA相结合,利用热稳定DNA聚合酶和四种脱氧核苷酸为反应体系提供能量,使其在一定条件下循环扩增目标DNA片段。

通过PCR扩增后的DNA片段可以进行进一步的分析和检测。

PCR技术的扩增具有明显的优势,可同时扩增不同长度的DNA片段,扩增时间短,扩增的精度和重复性高,且所需的样本量小。

PCR技术在分子诊断、基因组学和分子系统学等领域的应用不断扩展和深化。

随着PCR技术的不断发展,PCR在分子生物学研究中的应用越来越广泛,成为分子生物学研究的重要工具。

第二篇:RNA干扰技术在分子生物学中的应用RNA干扰(RNAi)是分子生物学中一种重要的现象,其中小分子RNA片段通过RNAi途径参与靶基因的沉默和调节。

RNAi技术是人类基因功能研究中最具前途的一种技术之一。

RNA干扰技术的基本原理是通过利用RNAi分子的特异性配对功能,引导RNAi分子与靶基因mRNA相结合,导致mRNA的降解和翻译的抑制,实现对基因表达的调控。

RNA干扰技术在分子生物学研究中有广泛的应用,如:功能基因的筛选、基因表达调节、基因功能验证等。

RNA干扰技术具有多种优点,如高效性、特异性强、节约时间、资源和成本等方面的优势,逐步成为生命科学研究中的重要工具。

在研究过程中,RNA干扰技术常用于寻找分子病理学中新的治疗靶点,鉴定靶点基因和靶点蛋白,为新药物的开发和临床治疗提供了重要的理论和实验基础。

第三篇:基因克隆技术在分子生物学中的应用基因克隆技术始于20世纪70年代,是指将DNA分子导入到载体中,使其在细胞中进行表达的过程。

现代分子生物学实习报告

现代分子生物学实习报告

一、实习背景随着生物科技的飞速发展,分子生物学已成为生命科学领域的重要分支。

为了提高自己的专业素养和实际操作能力,我有幸参加了为期一个月的现代分子生物学实习。

实习期间,在导师的悉心指导下,我深入了解了分子生物学的基本原理和实验技术,并对相关实验操作有了较为全面的掌握。

二、实习内容1. 基本原理学习实习期间,我学习了分子生物学的基本原理,包括DNA、RNA和蛋白质的结构、功能及相互作用。

通过学习,我对基因表达调控、蛋白质合成、基因克隆等基本概念有了深入理解。

2. 实验操作训练(1)DNA提取:我学习了从细胞中提取DNA的方法,包括酚-氯仿法、柱式法等。

通过实际操作,我掌握了DNA提取的技巧,并学会了检测DNA质量。

(2)PCR扩增:我学习了聚合酶链反应(PCR)技术,掌握了PCR仪的使用方法和反应体系配置。

在导师的指导下,我独立完成了目的基因的扩增。

(3)凝胶电泳:我学习了琼脂糖凝胶电泳技术,掌握了电泳仪的使用方法和电泳操作。

通过电泳,我观察到了目的基因条带。

(4)DNA连接:我学习了DNA连接技术,掌握了连接酶的使用方法和反应体系配置。

在导师的指导下,我成功完成了质粒与目的基因的连接。

(5)转化:我学习了转化技术,掌握了大肠杆菌感受态细胞的制备和转化方法。

在导师的指导下,我成功将质粒转化到受体细胞中。

3. 结果分析在实习过程中,我积极参与实验,对实验结果进行了认真分析。

通过比较不同实验条件下的结果,我总结出以下规律:(1)DNA提取过程中,酚-氯仿法提取的DNA质量较好,但操作繁琐;柱式法提取的DNA质量略逊于酚-氯仿法,但操作简便。

(2)PCR扩增过程中,温度梯度PCR可以提高扩增效率;优化引物设计可以提高扩增特异性。

(3)凝胶电泳过程中,适当增加电压可以提高电泳速度。

(4)DNA连接过程中,连接酶的用量和连接时间对连接效率有显著影响。

(5)转化过程中,感受态细胞的制备和转化条件对转化效率有重要影响。

2020年(生物科技行业)分子生物学考题

2020年(生物科技行业)分子生物学考题

(生物科技行业)分子生物学考题综合练习壹、单项选择题(共25小题,1分/题,共25分)1、真核生物的TATA盒是()A、DNA合成的起始位点B、RNA聚合酶和DNA模板稳定结合处C、RNA聚合酶的活性中心D、翻译起始点E、转录起始点2、下列哪中杂交方式不属于核酸分子杂交()?A、原位杂交;B、斑点杂交;C、Southern杂交;D、Northern杂交;E、Western杂交。

3、指导合成蛋白质的结构基因大多数为()A、高度重复序列;B、回文序列;C、单拷贝序列;D、中度重复序列4、下列关于大肠杆菌DNA聚合酶Ⅲ的叙述哪壹项是正确的?()A、具有3’→5’核酸外切酶活性B、不需要引物C、需要4种不同的三磷酸核苷D、dUTP是它的壹种作用物E、能够将二个DNA片段连起来5、下列不属于真核生物基因表达调控的反式作用因子是()A、GC岛;B、亮氨酸拉链;C、同源异形域蛋白;D、HLH蛋白P S:Zincfinger、Leuzipper(亮氨酸拉链)、HTH、bHLH6、真核细胞中的mRNA帽子结构是()A、7-甲基鸟嘌呤核苷三磷酸;B、7-甲基尿嘧啶核苷三磷酸;C、7-甲基腺嘌呤核苷三磷酸;D、7-甲基胞嘧啶核苷三磷酸7、下列是几种DNA分子的碱基组成比例,哪壹种DNA的Tm值最高()。

A、G+C=35%B、G+C=25%C、G+C=40%D、A+T=80%E、A+T=15%8、真核生物中,存在于核仁的RNApol是()A、RNApolⅢ(核质---tRNA\5srRNA\Alu序列和部分snRNA);B、RNApolⅡ(核质---hnRNA\snRNA);C、RNApolⅠ(核仁---rRNA)9、在DNA复制时,下列所有因子对DNA链解旋和解链都是必需的,但()除外A、负超螺旋傾向解旋B、通过解旋酶解开不稳定的碱基对C、需要拓扑异构酶的作用D、SSB蛋白酶的活性E、需要以ATP的形式供应能量10、连接酶作用是()A、催化DNA俩条链间形成磷酸二酯键B、将螺旋解链C、催化DNA链俩段间形成磷酸二酯键D、去除引物,填补空缺E、催化DNA俩条链间形成氢键11、可作为重组DNA的目的基因的是()A、mRNAB、tRNAC、rRNAD、基因组DNAE、mRNA和基因组DNA12、DNA的二级结构是()A、α-螺旋;B、β-折叠;C、双螺旋结构;D、三叶草结构13、σ因子专壹性表当下()A、识别启动子的特异序列;B、和核心酶结合;C、属于RNA聚合酶的壹个亚基;D、参和三元复合物的形成。

2020年(生物科技行业)浙大生物化学试题

2020年(生物科技行业)浙大生物化学试题

(生物科技行业)浙大生物化学试题浙江大学2001年攻读硕士学位研究生入学考试题考试科目:生物化学,编号555注意:答题必须写在答题纸上,写在试卷或草稿纸上均无效壹是非题1/301酶反应的专壹性取决于其辅助因子的结构2肽酰转移酶在蛋白质合成中催化肽键的生成和酯键的水解3E.coli连接酶摧化俩条游离单链DNA分子形成磷酸二酯键4通过柠檬酸途径将乙酰辅酶A转移至胞液中,同时可使NADH上的氢传递给NADP生成NADPH5亮氨酸的疏水性比缬氨酸强6必需氨基酸是指合成蛋白质必不可少的壹些氨基酸7脯氨酸是α螺旋破坏者8维系蛋白质三级结构最重要的作用力是氢键9在DNA变性过程中总是G-C对丰富区先解链10真核细胞中DNA只存在于细胞核中11DNA双螺旋的俩条链方向壹定是相反的12酶影响其催化反应的平衡13酶促反应的米氏常数和催化的底物无关14维生素E是壹种天然的抗氧化剂15维生素B1的辅酶形式是TPP16ATP是体内能量的储存形式17糖酵解过程无需氧气的参和18胆固醇是生物膜的主要成分,可调节生物膜的流动性19蛋白质的生理价值主要取决于必需氨基酸的种类,数量和比例20磷酸吡哆醛只作为转氨酶的辅酶起作用21DNA复制时,后滞链需多个引物22绝缘子和增强子壹样都属于顺式作用元件23PCR是包括变性,复性和延伸三个步骤的循环反应24Sanger曾俩获诺贝尔奖25核糖体上有三个和tRNA有关的位点:A位点,P位点,E位点26生长激素释放抑制因子是壹个14肽27脂肪酸合成酶催化的反应是脂肪酸-β氧化反应的逆反应28镰刀型贫血症患者血红蛋白和正常人的血红蛋白在氨基酸组成上只有2个残基有差别29地球上所有生物中存在的蛋白质和核酸的种类总数都超过1亿种30中国科学家在今年完成了人类基因组1%的测序任务二写出下列物质的分子结构式1/61Thr2D-核糖3A4GSH5尼克酰胺6丙酮酸三名词解释4/241反密码子2操纵基因3多肽核酸(peptidenucleicacid)4折叠酶5共价调节6HumenGenomeProject四综合题10/401试表述Glu经脱氨基,有氧氧化等途径彻底分解成NH3,CO2,和H2O时的代谢路线,要求用箭头表示所经过的主要中间产物.计算1摩尔Glu共可产生多少摩尔的NH3,CO2,ATP? 2以血红蛋白为例说明蛋白质四级结构的含义,比较血红蛋白和肌红蛋白结构和功能的异同3请对中心法则加以阐述4凝胶过滤是分离蛋白质混合物最有效的方法之壹,请说明其工作原理且简述用该法分离蛋白质的实验操作步骤浙江大学2002年攻读硕士学位研究生入学考试题考试科目:生物化学,编号570注意:答题必须写在答题纸上,写在试卷或草稿纸上均无效壹是非题1/201所谓肽单位就是指组成蛋白质的氨基酸残基2在竞争性抑制剂存在的情况下,即使加入足够量的底物,酶仍不能达到其催化的最大反应速度3壹级结构决定空间结构,所以蛋白质合成中新生肽链的折叠无须其他蛋白质的帮助.4Sanger反应(二硝基氟苯法)用以鉴定多肽链羧基末端氨基酸,而Edman反应(苯异硫氰酸酯法)则用以鉴定多肽链氨基末端氨基酸.5和胆固醇的化学结构最相近的维生素是维生素B12.6在某些生物中,RNA也能够是遗传信息的基本携带者7生长激素释放抑制因子是壹个14肽8维生素B1的辅酶形式是TPP9地球上所有生物中存在的蛋白质和核酸的种类总数都超过1亿种10肾上腺素和胰高血糖素都通过cAMP很快地对机体组织发挥作用11呼吸链电子载体是按照其标准势能逐步下降而氧化仍原电势逐步增加的方向排列的12CO对氧化磷酸化的影响主要是抑制ATP的形成过程,但不抑制电子传递过程13花生四烯酸广泛存在和植物中,它是哺乳动物的必需脂肪酸14即使在饥饿状态下,肝脏也不利用酮体作为燃料分子,而大脑组织在血糖供应不足时会利用酮体作为燃料分子供能15不同生物对氨基氮的排泄方式不同,如鱼类以氨的形式直接将氨基氮排出体外;鸟类以尿酸形式,植物和动物以尿素形式将氨基氮排出体外16紫外辐射引起的DNA损伤可通过光复活作用修复.光复活酶虽然在生物界分布很广,从低等单细胞生物直到鸟类都有,但高等哺乳类中却没有17逆转录酶存在和所有RNA病毒中,在RNA病毒复制中起作用18遗传密码字典在生物界且非完全通用,像原生动物纤毛虫就有例外19糖基化是真核生物蛋白质修饰的壹种重要方式,内质网和高尔基体俩种亚细胞器都能对蛋白质进行糖基化修饰20真核生物中同壹转录单位能够通过不同的拼接而产生不同的蛋白质合成模板mRNA 二用化学结构式完成下列酶促反应4/201异柠檬酸裂解酶2丙酮酸羧化酶3磷酸戊糖异构酶4烯脂酰辅酶A水化酶5丙氨酰tRNA合成酶三综合题10/601什么是蛋白质的二级结构?稳定二级结构的主要作用力是什么?多肽链中存在的脯氨酸对α螺旋的形成有何影响,为什么?哪种蛋白质完全由α螺旋构成?2电泳是分离生物大分子的主要方法之壹,简述其原理;SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳能够测定蛋白质的分子量,其原理是什么?分子量不同的蛋白质在SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳中的迁移率和其分子量有什么关系?3何谓酶促反应动力学?底物浓度,温度和PH值对酶促反应速度各有什么影响?试分析之. 如果希望反应初速度达到其最大速度的90%,底物浓度应为多大?4何谓核酸变性?引起核酸变性的因素有哪些?何谓DNA的熔解温度(Tm)?其大小和哪些因素有关?5从结构和功能俩大方面比较E.coliDNA聚合酶III和RNA聚合酶6Jacob和Monod在上个世纪60年代初提出乳糖操纵子模型,开创了基因表达调节研究的新领域,具有划时代意义.请你试述乳糖操纵子理论.浙江大学2003年攻读硕士学位研究生入学考试题考试科目:生物化学注意:答题必须写在答题纸上,写在试卷或草稿纸上均无效壹是非题1/201氧化磷酸化作用是ATP的生成基于和相偶联的磷酸化作用.()2酶的化学本质是蛋白质.()3多肽链结构中,壹个氨基酸残基就是壹个肽单位.()4FMN和FAD的组成中有核黄素.()5在细菌的复制中起主要作用的是DNA聚合酶I()6DNA变性后其粘度增大()7乙醛酸循环在所有的高等植物中都存在.()8EMP途径本身只产生仍原剂,而不产生高能中间产物.()9酶促反应的能量效应是降低反应的活化能.()10和胆固醇的化学结构最相近的维生素是维生素B12.()11CoQ只能作为电子传递的中间载体.()12DNA双螺旋结构的稳定性主要来自碱基对之间的氢键()13组成蛋白质的所有氨基酸中,由于含有的α-碳原子属于不对称碳原子,因此都具有旋光性.()14mRNA的3`端polyA结构是由DNA的非编码区转录的.()15糖酵解的限速酶为丙酮酸激酶.()16乙酰辅酶A是进入TCA循环仍是生成酮体,主要由草酰乙酸浓度调控.()17E.coliRNA聚合酶的σ亚基和转录的终止识别有关.()18氧化仍原电对中,电子从电势较低的电对流向电势较高的电对,这是自由能降低的现象.()19葡萄糖和果糖都具有仍原性.()20如果加入足够量的底物,即使有竞争性抑制剂存在,酶催化的最大反应速度Vmax是能够达到的()二写出下列物质的结构式2/101Ser2U3草酰乙酸4ATP5D-glucose三写出下列酶催化的生化反应式(不要求写结构式)3/301磷酸果糖激酶2磷酸甘油变位酶3丙酮酸脱氢酶系4顺乌头酸酶5异柠檬酸裂解酶6脂酰辅酶A脱氢酶7谷丙转氨酶8鸟氨酸转氨甲酰酶9DNA合成酶10氨酰tRNA合成酶四综合题15/901简述SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳的基本原理,你使用该技术分离和检测过何种物质?主要操作步骤有哪些?2质粒是基因工程中最常用的载体,为获得某质粒(如pUC18)DNA,请你设计壹个简单的实验过程(步骤).3谈谈你所了解的生物化学近年来的新进展.4DNA双螺旋模型是哪年由谁提出的?简述其基本内容.为什么说该模型的提出是分子生物学发展史上的里程碑,具有划时代的贡献?5何谓变性,那些因素能够引起蛋白质的变性?何谓别构(变构)?举壹例说明.6试述三羧酸循环是如何沟通糖类,脂类和蛋白质三大有机物的代谢的?浙江大学2004年攻读硕士学位研究生入学考试题考试科目:生物化学名词解释50)1埃德曼降解2抗体3诱导契合学说4热力学第二定律5补救途径6荷尔蒙7竞争性抑制8细胞膜9DNA聚合酶10基因表达问答题:1根据国际分类法将酶分成哪几大类,分别叙述它们的酶反应特征(15)2对生物体转录和复制的特征进行说明比较(15)仍有几份数学试卷,可不知道怎么上传压缩文件,如果想要,望告之方法3叙述基因文库和cDNA文库的制作步骤且进行它们的特征比较(20)4用图表示说明生物体内三羧酸循环ATP产生的途径和它们的调控机理(20)5比较说明SDS-PAGE(SDS-聚丙烯酰胺电泳)和琼脂糖凝胶电泳的物质分离原理和特点(30)2004浙江大学分子试题1阐述PCR技术原理(15)2描述壹种研究基因表达的方法(15)3阐述蛋白质生物合成途径(25)4阐述壹条真核细胞信号转导途径(从信号接受到调控基因表达)(25)5阐述壹条反向遗传克隆功能基因的途径(20)6A,B和C三个基因都决定矮牵牛花的花色,当基因型为A-B-C-时表型为红色,其余为白色.AaBbCc的个体和三种纯系(系1系2和系3)杂交.分别的红色:白花1:3,1:7和1:1的分离比.问:系1和系2杂交,F1基因型和表型如何,F2的基因型和表型如何系3和系2杂交,F1基因型和表型如何,F2的基因型和表型如何(要写出分离比)(25)7什么是染色体重排和基因重排它们在发育中有和作用它们在进化中有和作用(25)06浙江大学分子生物学试卷壹、名词解释:(25%)1、RFLP:限制性片段长度多态性,是由DNA变异(产生新的酶切位点或消除原有的酶切位点)导致在限制性核酸内切酶酶切时产生不同的长度片段。

分子生物学实验

分子生物学实验

分子生物学实验分子生物学实验I. 实验概述分子生物学是生物学的一个重要分支,主要研究生物分子的结构、功能及其在生命过程中的作用。

在现代生命科学研究中,分子生物学技术的应用越来越广泛,包括基因克隆、基因表达、蛋白质结构、信号转导等多个方面。

本实验将介绍几种基本的分子生物学实验操作,包括DNA的提取、PCR扩增、电泳检测和蛋白质的SDS-PAGE分析,旨在提高学生对分子生物学基础知识和实验技能的掌握。

II. 实验材料及设备1. 细菌培养基、磷酸盐缓冲液、EDTA、裂解液等试剂;2. 离心管、洗涤管、PCR管、电泳槽等设备;3. 离心机、PCR仪、电泳仪等设备。

III. 实验步骤1. DNA的提取(1) 收集细胞收集需要提取DNA的细胞,如细菌、白细胞等。

将细胞转移到1.5mL离心管中。

(2) 细胞裂解加入200μl裂解液,轻轻摇晃离心管,使细胞充分裂解。

离心管可置于65°C水浴中处理10分钟,使DNA完全裂解。

(3) DNA提取加入500μl磷酸盐缓冲液和10μl EDTA,混匀后离心5分钟。

取上清液转移至新的离心管中,加入等体积的异丙醇,并轻轻倒置,使DNA在异丙醇界面上结团。

放置室温下10分钟,使用洗涤管将DNA结团转移到另一离心管中。

加入70%乙醇溶液洗涤2-3次,最后去除乙醇,用无菌水溶解DNA。

2. PCR扩增(1) 设计引物、制备PCR反应液按照所需扩增的DNA序列设计引物,制备PCR反应液,包括所需模板DNA、引物、Taq聚合酶、MgCl2等。

(2) PCR条件将PCR反应管放置PCR仪中,经过若干个循环,达到最终PCR产物的扩增。

PCR条件通常应选择对应引物特异性、Tm温度适中,并根据Taq聚合酶的活性和反应体系的最适条件优化所得。

常用的PCR条件为95℃预变性5min,94℃变性30s,Tm温度退火30s,72℃延伸1min,循环30-35次,最后72℃加延伸10min。

分子生物学实验方法与步骤

分子生物学实验方法与步骤

分子生物学实验方法与步骤表达蛋白的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析一、原理细菌体中含有大量蛋白质,具有不同的电荷和分子量。

强阴离子去污剂SDS与某一还原剂并用,通过加热使蛋白质解离,大量的SDS 结合蛋白质,使其带相同密度的负电荷,在聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)上,不同蛋白质的迁移率仅取决于分子量。

采用考马斯亮兰快速染色,可及时观察电泳分离效果。

因而根据预计表达蛋白的分子量,可筛选阳性表达的重组体。

二、试剂准备1、30%储备胶溶液:丙烯酰胺(Acr)29.0g,亚甲双丙烯酰胺(Bis)1.0g,混匀后加ddH2O,37O C溶解,定容至100ml, 棕色瓶存于室温。

2、1.5M Tris-HCl(pH 8.0:Tris 18.17g加ddH2O溶解, 浓盐酸调pH至8.0,定容至100ml。

3、1M Tris-HCl(pH 6.8:Tris 12.11 g加ddH2O溶解, 浓盐酸调pH至6.8,定容至100ml。

4、10% SDS:电泳级SDS 10.0 g加ddH2O 68℃助溶,浓盐酸调至pH 7.2,定容至100ml。

5、10电泳缓冲液(pH 8.3:Tris 3.02 g,甘氨酸18.8 g,10% SDS 10ml加ddH2O溶解, 定容至100ml。

6、10%过硫酸铵(AP): 1gAP加ddH2O至10ml。

7、2SDS电泳上样缓冲液:1M Tris-HCl (pH 6.82.5ml,-巯基乙醇1.0ml,SDS 0.6 g,甘油2.0ml,0.1%溴酚兰1.0ml,ddH2O 3.5ml。

8、考马斯亮兰染色液:考马斯亮兰0.25 g,甲醇225ml,冰醋酸 46ml,ddH2O 225ml。

9、脱色液:甲醇、冰醋酸、ddH2O以3∶1∶6配制而成。

二、操作步骤采用垂直式电泳槽装置(一)聚丙烯酰胺凝胶的配制1、分离胶(10%的配制:ddH2O 4.0ml30%储备胶 3.3ml1.5M Tris-HCl2.5ml10% SDS 0.1ml10% AP 0.1ml取1ml上述混合液,加TEMED(N,N,N’,N’-四甲基乙二胺10μl 封底,余加TEMED4μl ,混匀后灌入玻璃板间,以水封顶,注意使液面平。

2020年(生物科技行业)生物信息学实验

2020年(生物科技行业)生物信息学实验

(生物科技行业)生物信息学实验生物信息学实验BioinformaticsExperiment【课程编号】1411010【课程类别】专业方向课【学分数】1学分【适用专业】生物技术、生物科学【学时数】32学时【编写日期】2007年6月壹、教学目标本课程旨在使学生了解生物信息学基本知识,掌握生物信息学的基本思路和方法。

把最基本的生物信息学计算技术进行联机学习,突出基础性和实用性,让每个同学通过实际操作来体验复杂的生物学数据及其相关的分析手段。

通过本课程的学习,能够深化学生理解和使用由高通量技术所产生的大量生物信息的生物学背景及其分析方法;同时本课程和专业的需求紧密结合,通过学习,使学生能够快速检索网上信息,从而了解本学科的前言知识;通过学习使学生能够和生物信息大型数据库建立连接,取得已有的数据,从而为自己的研究服务。

二、教学内容和学时分配实验壹、GenomicDatabases4学时基础性主要内容:UCSCGenome,BrowserNCBIMap,ViewerEnsembl教学要求:了解当前全球三个主要的基因组数据库:UCSC、NCBI和Ensembl。

了解三个数据库共有的特点,以及在可视化、提供的信息、所用到的序列比对工具等方面的不同之处。

以人类胰岛素基因Insulin为例,理解三个数据库是如何注释geneduplication、EST、SNP等基因组信息的。

结合三个数据库的各自特点,掌握如何从数据库中获取和基因相关的序列、三维结构、功能、遗传变异等信息。

重点、难点:三个数据库都涵盖了几乎所有的基因组信息,因此从众多信息中如何获得自己所感兴趣的是本次试验课的重点,也是难点。

其它教学环节:实验课刚开始,授课老师结合ppt,以人类胰岛素基因Insulin为例,讲授本次实验课的主要内容,且布置本次实验作业。

门为生物信息学试验课设计的)发表自己的见解、交流学习心得。

实验二、NCBIPubMed4学时基础性主要内容:NCBIPubMed:综合的文献检索数据库,包含了>1600万篇生物化学文章的引文,这些文章来源于MEDLINE和其他生命科学学领域的期刊。

2020年(生物科技行业)硕士研究生入学考试生物化学与分子生物学试题

2020年(生物科技行业)硕士研究生入学考试生物化学与分子生物学试题

(生物科技行业)硕士研究生入学考试生物化学与分子生物学试题第四军医大学2000年硕士研究生入学考试生物化学和分子生物学试题壹、请写出下列英文缩写代号的中文全名称(每个1分,共8分)1.IP32.SnRNA3.LTR4.PRPP5.Km6.Ala7.PKC8.IPTG二、名词解释(每题4分,共32分)1.RT-PCR2.结构域3.NerthernBlot杂交4.信号识别颗粒5.CDNA文库6.细胞凋亡7.移框突变8.SD序列三、选择题(选出壹个最佳答案,每题2分,共30分)1.蛋白质的变性伴随有结构上的变化是(A)肽链的断裂(B)氨基酸残基的化学修饰(C)壹些侧链基因的暴露(D)二硫链的打开(E)氨基酸排列顺序的改变2.绝大多数真核生物mRNA5'端有:(A)帽式结构(B)polyA(C)起始密码子(D)启动子(E)SD序列3.端粒酶属于(A)限制性内切酶(B)DNA聚合酶(C)RNA聚合酶(D)DNA连接酶(E)拓扑异构酶4.下列不属于高能磷酸化合物的是(A)AOP(B)磷酸肌酸(C)1.3=磷酸甘油酸(D)1-磷酸葡萄糖(E)磷酸烯醇式丙硐酸5.基因剔除(kncckcut)的方法主要被用来研究(A)基因的结构(B)基因的功能(C)基因的表达(D)基因的调控(E)基因的突变6.下列不属于蛋白激酶的是(A)磷酸化酶b激酶(B)已糖激酶(C)表皮生长因子受体(D)蛋白酪氨酸激酶(E)蛋白激酶C7.用“Nicktranslation”的方法标记DNA探针时需要(A)DNA酶工(B)DNA聚合酶工的5’→3’外切活性(C)DNA聚合酶的5’→3’外切活性(B)(D)+(C)(E)(A)+(B)+(C)8.在电场中,蛋白质泳动速度取决于(A)蛋白质颗粒的大小(B)带净电荷的多少(C)蛋白质颗粒的形状(D)(A)+(B)(E)(A)+(B)+(C)9.造成艾滋病的人免疫缺陷病毒HIV是壹种(A)dsDNA病毒(B)ssDNA病毒(C)dsRNA病毒(D)ssRNA病毒(E)杆状病毒10.在细胞内传递信息的分子不包括:(A)CAMP/CGMP(B)乙酰胆硷(C)Ca++(D)壹氧化氮(No)(E)三磷酸肌醇(IP3)11.表皮生长因子(EGF)的信号转导通路和下列哪种物质有关(A)受体型酪氨酸蛋白激酶(B)G蛋白偶联受体(C)CGMP(D)腺苷酸环化酶(E)离子通道受体12.将外源基因导入培养的哺动物细胞的常用方法不包括(A)脂质体法(B)磷酸钙法(C)氯化钙法(D)电穿孔法(E)病毒载体转染13.Sanger的双脱氧末端终止法DNA序列测定中不需要下列哪种物质(A)ddNTP(B)dNTP(C)[α-32P]dATP(D)[α-32P]ddATP(E)DNA聚合酶14.PCR反应产物的特异性取决于(A)镁离子浓度(B)退火温度(C)引物碱基组成和长度(D)循环次数(E)(A)+(B)+(C)15.反义核酸作用主要要:(A)封闭DNA(B)封闭RNA(C)降解DNA(D)降解DNA(E)封闭核糖体的功能四、问答题:(每题10分,共30分)1.简述分子杂交(核酸,蛋白质等)的种类适用范围及特点2.原核生物和真核生物常用的表达系统有哪些?它们各有什么优点?选择应用的依据是什么?3.真核生物RND转录后加工修饰的方式包括哪些?它们的意义各是什么?中国科学院发育生物学所分子生物学2000年博士研究生入学试题(壹、二、三题为必答题,五和六可任选壹题)壹、请解释下列名词,且写出它们的英文术词:1基因家族2持家基因3同形异位盒4基因沉默5功能基因组学6信号肽7信号传递8细胞编程性死亡二、限制性内切酶是如何发现的?限制性内切酶可分成几类?如何使用限制内切酶进行分子生物学的研究?三、请分别列出用于蛋白质和核酸的电泳分析和分离的技术,且说明这些技术和蛋白质和核酸的性质的关系。

分子生物学实验讲义(2020版-)

分子生物学实验讲义(2020版-)

《分子生物学》实验讲义实验一分子生物学实验基础知识及常用仪器介绍实验二质粒DNA分离纯化实验三琼脂糖凝胶电泳实验四聚合酶链反应(PCR)检测质粒DNA实验五限制酶切鉴定质粒DNA实验一分子生物学实验基础知识及常用仪器介绍一、实验目的了解分子生物学实验特点,了解分子生物学实验室常用设备及基本实验操作。

二、实验内容1.分子生物学实验知识⑴严格操作规程分子生物学实验一般比较复杂,如所用试剂多、操作步骤多、实验时间长等,因此为保证实验效果,在实验室中一定要有整体观念,严格按照操作规程进行。

⑵耐心细致操作实验中不能急于求成,特别是对于初入门者,应反复操作,积累经验。

⑶习惯微量操作在分子生物学实验中,试剂的用量往往很少,常常细到1ul液体、ug或ng固体,这是平常肉眼很难看到的,所以刚刚接触实验的人往往感到不习惯,总是担心要取的东西能否看到、准不准确,操作的样品会不会丢失,总是想加大反应体积,以为越多越好。

这些观念都是错误的。

只有定时定量加入液体,才能保证实验成功,所以平时应加以练习,逐渐建立微量操作的观念才能解决好问题。

⑷防止实验污染分子生物学实验的对象主要是核酸,不同生物材料的DNA和DNA之间,不同的样品之间,核酸酶等蛋白酶与核酸之间,产物与反应物之间都有可能造成污染,最终导致实验的失败。

故要从所用试剂、仪器设备、耗材及操作人员等方面进行防止污染的操作。

⑸正确处理试剂分子生物学实验中对试剂的要求十分严格,包括试剂的等级、配制、除菌储备等各方面均有严格要求。

⑹注意实验安全分子生物学实验中,操作者常会接触一些对人体有害的试剂,必须实验安全要求进行实验操作,否则会给实验室甚至整个人类带来巨大的危害。

2.分子生物学实验常用仪器介绍⑴微量取液器⑵水纯化装置(离子交换器、超纯水装置)⑶离心机(低速、高速、超速)⑷电泳装置(电泳仪、电泳槽)⑸灭菌设备(高压蒸汽灭菌锅、过滤除菌器)⑹超净工作台⑺PCR仪⑻凝胶成像系统(紫外分析仪、核酸凝胶电泳图谱的记录)⑼温度控制设备(冷冻设备、培养箱、水浴箱、烤箱)⑽其它设备(紫外可见分光光度计、微波炉、凝胶干燥器、真空干燥仪)3.分子生物学基本实验操作⑴基因组DNA的分离与纯化(核酸浓度和纯度测定)⑵真核细胞mRNA的分离与纯化⑶质粒DNA的提取⑷PCR基因扩增实验⑸限制性内切酶酶切实验⑹DNA重组技术⑺DNA转移技术⑻DNA测序:化学法、双脱氧链终止法⑼核酸探针的制备技术:末端标记、PCR法制探针、非放射性探针⑽分子杂交技术:Southern印迹、Northern印迹和Western印迹4.微量移液器的使用可调节微量移液器标准操作程序(适用的液体:水、缓冲液、稀释的盐溶液和酸碱溶液):⑴调节数字至所需体积;⑵装上吸嘴(不同规格的移液器用不同的吸头),注意气密性);⑶按到第一档,垂直进入液面几毫米;⑷缓慢松开控制按钮(否则液体进入吸头过速会导致液体倒吸入移液器内部吸入体积减少);⑸停顿1s后将吸嘴提离开液面;⑹平稳按压打出液体。

2020年(生物科技行业)第二章细胞生物学研究方法

2020年(生物科技行业)第二章细胞生物学研究方法

(生物科技行业)第二章细胞生物学研究方法第二章细胞生物学研究方法(theresearchmethodinthecellbiology)教学目的1、了解主要工具和常用方法,侧重掌握基本原理和基本应用;2、认识工具和方法和学科发展的相关性。

教学内容本章从以下5个方面介绍了细胞生物学的研究方法:1.显微成像技术2.细胞化学技术3.细胞分选技术4.细胞工程技术5.分离技术6.分子生物学方法计划学时及安排本章计划3学时。

教学重点和难点生命科学是实验科学,它的很多成果都是通过实验才得以发现和发展的。

许多细胞生物学的重要进展以及新概念的形成,往往来自新技术的应用。

因此,方法上的突破,对于理论和应用上的发展具有巨大的推动作用,这是学习本章应确立的基本思想。

1.显微成像包括直接成像和间接成像。

显微技术是细胞生物学最基本的研究技术,包括光学显微技术和电子显微技术。

在光学显微技术中要掌握几种常用显微镜成像的基本原理,包括普通双筒显微镜、荧光显微镜、相差显微镜、暗视野显微镜、倒置显微镜。

电子显微镜是研究亚显微结构的主要工具,透射和扫描电镜的是俩类主要的电子显微镜,对其基本结构、工作原理和样品制备方法则是学习的重点。

2.细胞化学技术介绍了酶细胞化学技术、免疫细胞化学技术、细胞分选技术,其中流式细胞分选技术是细胞生物学和现代生物技术中的重要技术,应重点掌握。

3.细胞工程技术是细胞生物学和遗传学的交叉领域,主要利用细胞生物学的原理和方法,结合工程学的技术手段,按照人们预先的设计,有计划地改变或创造细胞遗传性的技术。

包括体外大量培养和繁殖细胞,或获得细胞产品、或利用细胞体本身。

主要内容包括:细胞融合、细胞生物反应器、染色体转移、细胞器移植、基因转移、细胞及组织培养。

4.分离技术是壹大类技术的总称,包括细胞组分的分离和生物大分子的分离,应掌握各种分离技术的原理和用途。

本章对分子生物学方法作了简要介绍,为今后的学习奠定基础。

简言之,本章教学重点是仪器方法的基本原理和基本应用;教学难点是电镜制样及分子杂交技术。

分子生物学大实验报告

分子生物学大实验报告

分子生物学实验:专业:学号:目录实验一细菌培养实验二质粒DNA提取实验三琼脂糖凝胶电泳实验四质粒DNA酶切及琼脂糖电泳分析鉴定实验五聚合酶链式反应(PCR)技术体外扩增DNA 实验六地高辛标记的Southern杂交实验一细菌的培养一、目的学习细菌的培养方法及培养基的配置。

二、原理在基因工程实验和分子生物学实验中,细菌是不可缺少的实验材料。

质粒的保存、增殖和转化;基因文库的建立等都离不开细菌。

特别是常用的大肠杆菌。

大肠杆菌是含有长约3000kb的环状染色体的棒状细胞。

它能在仅含碳水化合物和提供氮、磷和微量元素的无机盐的培养基上快速生长。

当大肠杆菌在培养基中培养时,其开始裂殖前,先进入一个滞后期。

然后进入对数生长期,以20~30min复制一代的速度增殖。

最后,当培养基中的营养成分和氧耗尽或当培养基中废物的含量达到抑制细菌的快速生长的浓度时,菌体密度就达到一个比较恒定的值,这一时期叫做细菌生长的饱和期。

此时菌体密度可达到1×109~2×109/mL。

培养基可以是固体的培养基,也可以是液体培养基。

实验室中最常用的是LB培养基。

三、实验材料、试剂与主要仪器(一)实验材料大肠杆菌(二)试剂1. 胰蛋白胨2. 酵母提取物3. 氯化钠4. 1mol/L NaOH5. 琼脂粉6. 抗生素(氨苄青霉素、卡那霉素等)(三)仪器1. 培养皿2. 带帽试管3. 涂布器4. 灭菌锅5. 无菌操作台(含酒精灯、接种环、灭菌牙签等)6. 恒温摇床四、操作步骤(一)LB培养基的配制配制每升培养基,应在950m1去离子水中加入:细菌培养用胰蛋白胨10g细菌培养用酵母提取物5gNaCl 10g摇动容器直至溶质完全溶解,用1mol/L NaOH调节pH位至7.0。

加入去离子水至总体积为lL,在15 lbf/in2 (1.034×105Pa)高压下蒸气灭菌20分钟。

这样得到是LB液体培养基。

LB固体培养基是在其液体培养基的基础上另加琼脂粉15g/L。

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(生物科技行业)生化及分子生物学大实验实验20质粒DNA的提取和鉴定教学内容提要及时间分配:1、实验原理讲解:8分钟碱变性法提取质粒DNA是基于染色体DNA和质粒DNA的变性和复性的差异而达到分离的目的。

在pH值高达12.6的碱性环境中,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开;质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状的俩条链不会完全分离。

当用pH 值4.8的KAc或NaAc高盐缓冲液调节其pH值到中性时,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型,保存在溶液中;而线状染色体DNA则不能复性,形成缠绕的网状物,通过离心,染色体DNA和不稳定的大分子RNA、蛋白质-SDS复合物壹起沉淀下来而被除去,用乙醇或异丙醇将溶于上清液中的质粒DNA沉淀,再用RNase除去RNA,即可获得较纯净的质粒DNA。

2、实验试剂和器材6分钟溶液Ⅰ:50mmol/L葡萄糖,25mmol/LTris.Cl(pH8.0),10mmol/LEDTA(pH8.0)。

高压灭菌15分钟,储存于4℃冰箱。

溶液Ⅱ:0.2mol/LNaOH(临用前用10mol/LNaOH母液稀释),1%SDS(从10%SDS母液中稀释,SDS母液可室温保存),现配现用。

溶液Ⅲ:5mol/LKAc60mL,冰醋酸11.5mL,H2O28.5mL,高压灭菌,4℃冰箱保存。

溶液终浓度为:K+3mol/L,Acˉ5mol/L。

3mol/L醋酸钠(pH5.2):800mL水中溶解408.1gNaAc·3H2O,用冰醋酸调pH至5.2,加水定容至100mL,分装后高压灭菌,储存于4℃冰箱。

STE缓冲液:0.1mol/LNaCl,10mmol/LTris·Cl(pH8.0),1mmol/LEDTA(pH8.0)。

TE缓冲液:10mmo/LTris·Cl(pH8.0),1mmol/LEDTA(pH8.0)。

高压灭菌后储存于4℃冰箱中。

3、实验步骤讲解:6分钟将含有质粒pGFPuv的DH5α菌种划线接种在LB固体培养基(含有100μg/mL Amp)上,37℃培养12-24小时。

用无菌牙签挑取单菌落接种到5mLLB液体培养基(含有100μg/mL Amp)中,37℃振荡培养14~16小时。

取1.5mL培养液加入1.5mL离心管中,室温12,000r/min离心1分钟。

加入500μLSTE,涡旋打匀,室温12,000r/min离心1分钟。

弃上清,将管倒置于纸巾,使液体流尽。

加入100μL溶液Ⅰ重悬菌体,涡旋振荡,冰浴5分钟。

加入新配制的溶液Ⅱ200μL,盖紧管口,快速轻柔颠倒5次,至溶液澄清(千万不要振荡),冰浴5分钟。

加入150μL预冷的溶液Ⅲ,盖紧,管口朝下,轻柔振荡5~10次,冰浴5~10分钟,12,000r/min离心10分钟。

取上清移入干净Eppendorf管中,加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),剧烈振荡20秒。

室温下12,000r/min离心5分钟,可见溶液分三层,上层为质粒DNA溶液,中层为蛋白层,下层为有机相。

取上清,加入400μL氯仿:异戊醇(24:1),剧烈振荡20秒。

12,000r/min离心5分钟。

加入1/10体积3MNaAc,2倍体积无水乙醇,4℃沉淀10分钟或室温沉淀20分钟。

12,000rpm离心10分钟。

去上清,加入1mL75%乙醇,洗涤沉淀以去盐。

12,000rpm离心10分钟。

去上清,吸出痕量剩余乙醇,风干。

将沉淀溶于30μLTE缓冲液(pH8.0,含20μg/mLRNaseA)中,储于-20℃冰箱中。

如直接酶切,可将沉淀溶于30~50μLddH2O(含20μg/mLRNaseA)。

利用比色法测定质粒DNA在260nm和280nm下的光吸收值且计算样品浓度。

用1%琼脂糖凝胶电泳观察质粒DNA的纯度和条带。

实验21RNA的提取及鉴定教学内容提要及时间分配:1、实验原理讲解:12分钟总RNA的提取真核细胞质总RNA主要由rRNA(80-85%)、tRNA和核内小分子RNA(10-15%)、mRNA (1-5%)组成,其中rRNA、tRNA和mRNA位于细胞质中。

完整RNA的提取和纯化,是进行RNA方面的研究工作,如Nothern杂交、mRNA分离、RT-PCR、定量PCR、cDNA 合成及体外翻译等的前提。

所有RNA的提取过程中都有五个关键点,即1)样品细胞或组织的有效破碎;2)有效地使核蛋白复合体变性;3)对内源RNA酶的有效抑制;4)有效地将RNA从DNA和蛋白混合物中分离;5)对于多糖含量高的样品仍牵涉到多糖杂质的有效除去。

但其中最关键的是抑制RNA酶活性。

RNA的提取目前阶段主要可采用俩种途径,1)提取总核酸,再用氯化锂将RNA沉淀出来;2)直接在酸性条件下抽提,酸性下DNA 和蛋白质进入有机相,而RNA留在水相。

紫外分光光度法测定总RNA浓度及纯度鉴定核酸分子中的碱基含有共轭双键,具有壹定的紫外吸收特性,其最大吸收峰的波长为260nm。

另外,核酸分子在双链向单链形式转化过程中,紫外吸收增加,故单链DNA及RNA分子较双链DNA分子具有更高的紫外吸收能力。

这些物理特性为测定核酸样品浓度提供了基础。

在波长为260nm,光程为1cm,A260=1时,相当于双链DNA浓度为50μg/mL,单链DNA或RNA为40μg/mL,单链核苷酸为20μg/mL。

紫外分光光度法可用于测定浓度大于0.25μg/mL的核酸浓度。

分光光度法不但能测定核酸浓度,仍可通过测定在260nm和280nm的紫外吸收比值(A260/A280)估计核酸的纯度。

纯净的DNA样品的A260/A280为1.8,纯净的RNA制品的A260/A280为2.0。

DNA样品中存在将导致比值升高,而比值降低表明有蛋白质或苯酚等污染。

RNA浓度计算公式:C(μg/mL)=40μg/mL×1/光程×A260×稀释倍数琼脂糖凝胶电泳技术检测总RNA浓度和质量琼脂糖英文名agarose,是由经过挑选、质地较纯的琼脂(agar)作原料制成的。

琼脂化学结构上是由琼脂糖和琼脂胶(agaropectin)组成的复合物。

琼脂胶是壹种含有磷酸根和羟基的多糖,它具有离子交换性质,这种性质将给电泳及凝胶过滤以不良影响。

琼脂糖是壹种直链多糖,它由D-半乳糖和3,6-脱水-L-半乳糖的残基交替排列组成。

琼脂糖和琼脂壹样也能形成凝胶。

形成凝胶主要是由于氢键的缘故。

由于琼脂糖具有亲水性及不含带电荷的基团,因此很少引起敏感的生物化学物质的变性和吸附。

琼脂糖凝胶电泳是实验室中最早得到广泛应用的凝胶电泳,是分离鉴定核酸的常规方法。

因为它具有以下优点:1)琼脂糖凝胶中含有琼脂1.0%-1.5%,在这种凝胶中电泳,近似自由界面电泳,可是样品的扩散度比自由电泳小;2)琼脂糖凝胶电泳支持物均匀,电泳区带整齐,分辨率高,重复性好;3)液相和固相界面无明显界限,电泳速度快;4)琼脂糖凝胶透明而不吸收紫外线,能够直接用紫外检测仪作定量测定;5)区带易染色,样品易回收。

核酸分子在高于其等电点的电泳缓冲液中带负电荷,在电场中向正极移动。

分子大小不同的核酸分子具有各异的电泳迁移率,而在电泳后处于凝胶的不同位置。

影响其电泳迁移率的因素包括电荷效应和分子筛效应。

前者由分子所带的净电荷多少而定,这和电泳时电流强度、电泳缓冲液的pH值和离子强度有关;而后者主要和核酸分子大小和其构象以及所用琼脂糖凝胶的浓度有关。

2、实验试剂和器材2分钟液氮罐、陶瓷研钵、冷冻高速离心机、恒温水浴器、恒温培养箱、高压灭菌锅、紫外线透射仪、吸头、乳胶手套、紫外分光光度计、电泳仪、水平式电泳槽、微波炉、Eppendorf 微量离心管、微量加样器(pipetman)、三角烧瓶、烧杯、量筒。

总RNA提取试剂盒(TRIzol TM试剂)、0.1%焦碳酸二乙酯(DEPC)、75%乙醇、氯仿、异丙醇、无水乙醇、琼脂糖、10mg/mlEB溶液、5×TBE电泳缓冲液(0.45mol/LTris、0.01mol/LEDTANa2、0.45mol/L硼酸,pH8.0)、溴酚蓝指示剂(0.25%溴酚蓝、50%甘油)、DNAmarker。

3、实验步骤讲解:5分钟组织总RNA的提取把液氮冻存的组织放到冰冻的碾钵中碾碎,加入适量的Trizol试剂(1mL/100mg组织)裂解组织,冰上放置5min。

吸入1.5mL离心管中,加入氯仿(0.2mL/mLTrizol),冰上放置5min。

10000×g离心10min,吸取上清于另壹离心管,加入等体积的异丙醇,室温放置10min。

10000×g离心15min,去上清,70%乙醇洗涤沉淀,室温风干,加DEPC 处理的双蒸水(15-20μL)溶解。

4、总结2分钟实验22半定量RT-PCR检测基因的表达差异(设计、创新)教学内容提要及时间分配:1、实验讲解:查阅资料及选题10分钟拟定实验提纲2分钟准备实验2分钟实施实验10分钟以组织或细胞总RNA中的mRNA为模板,在逆转录酶的作用下,以Oligo(dT)或特异的下游引物合成和mRNA互补的cDNA片段。

所有合成cDNA的方法都要用依赖于RNA的DNA聚合酶(反转录酶)来催化反应。

目前商品化反转录酶有从禽类成髓细胞瘤病毒纯化到的禽类成髓细胞病毒(AMV)逆转录酶和从表达克隆化的Moloney鼠白血病病毒反转录酶基因的大肠杆菌中分离到的鼠白血病病毒(MLV)反转录酶。

AMV反转录酶和MLV反转录酶都必须有引物来起始DNA的合成。

cDNA合成最常用的引物是和真核细胞mRNA分子3'端poly(A)结合的12-18核苷酸长的oligo(dT)。

基因表达调控研究及其它研究中,常需要对基因表达的水平进行定量比较,因此在RT-PCR技术的基础上又发展了定量PCR。

这种方法需要选择壹个合适的内对照。

由于PCR 是壹指数扩增过程,逆转录及扩增效率的很小差异就会导致扩增产物量的较大差异,以致定量不准确。

影响逆转录的因素有核苷酸序列的差异、ploy(A)尾的长度、PCR引物和poly(A)尾之间的距离等。

影响PCR扩增效率的因素有模板、引物、dNTP、MgCl2、DNA聚合酶以及循环次数等,这些参数较易控制,另外仍有引物结合效率的问题,不同的引物具有不同的结合效率,它们可相差105倍,因此,进行定量PCR时要选用同壹引物。

实验报告的写作2分钟2、实验试剂和器材2分钟3、总结2分钟实验23大肠杆菌感受态细胞制备教学内容提要及时间分配:1、实验原理讲解:10分钟转化是指质粒或重组质粒被导入受体细胞,得了外源DNA的细胞称为转化子。

质粒在不同的细菌之间转移是微生物世界中壹种普遍的现象,壹个细菌品系通过吸收另壹个细菌品系的质粒DNA而发生了遗传性状的改变,这种现象叫做转化,获得了外源DNA 的细胞称为转化子。

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