gopubmed使用简介
PubMed与GOPubMed
GO 基因本体 MeSH主题词表 PRO 蛋白质本体
这些本体包 括生物医学 所有概念及 其语义关系
利用GoPubMed了解以下四个“W”
W WW W What Who Where When
案例分析
与：AND，或：OR，非：NOT。当一个检索表达式中
含有两个运以上算符时，顺序为从左至右，括号可以改变运
算顺序。
2.截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符， 如：chem*表示用词根进行检索。
3.双引号：“”，表示对引号中的短语进行强迫词组检索。
4.检索字段标识符：[]，[]内为字段名称，如：[ti]，[au]，[so]， [la]，[pt]。
找寻最新文献， 了解研究进展
了解抗病毒药物应用于甲流 的情况
Antiviral Agents [382]
期刊信息 摘要
链接到维基百科
相关的Mesh词
自动同步生成检索式， 点击“Find it”检索即
可
查找中国内地使用达菲
治疗甲流的研究文章
点击知识点选择框 +表示逻辑与AND -表示逻辑非NOT 空白表示无限制
PubMed与GoPubMed
Contents
1 PubMed的简要介绍 2 PubMed的使用 (简介)
3 GoPubMed的简要介绍 4 GoPubMed的使用指南
PubMed是什么？特点？
➢ 美国国立医学图书馆（National Library of Medicine，NLM）下属的美国国立生物技术信息中 心(National Center for Biotechnology Information ， NCBI)开发研制的网络数据库。
➢收录文献范围广：医学、药学、生物、保健、护理、 牙科、中医药、医史
pubmed使用教程
检索语法
• 1.自然语言检索 （topics)
在检索栏中输入一个或多个检索词 (系统默认空格为AND 检索） 如：placenta growth oxygen
布尔逻辑运算式：AND OR NOT (运算符须大写） 如：common cold AND vitamin C 将检索出同时包含感冒和维生素C两个检索词的文献。
检索语法
• 自动扩展检索 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索 输入 “hypertension therapy（高血压治疗）
("hypertension"[MeSH Terms] OR "hypertension"[All Fields]) AND ("therapy"[Subheading] OR "therapy"[All Fields] OR "therapeutics"[MeSH Terms] OR "therapeutics"[All Fields])
检索语法
• 2.著者检索(authors)： 著者姓名,姓在前,名首字母在后 限定加字段符 如: genbacev o[AU] smith ab [AU]
检索语法
• 3.期刊检索(NLM Catlog)： 刊名输全称 new england journal of medicine Medline认可的标准缩写形式 如：clin exp immunol[so] 国际标准期刊号 如：1059-1524
▫ 来源于全世界70多个国家和地区的近5000种生物医学期刊， 这些期刊大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委 员会Literature Selection Technical Review Committee (LSTRC)评估挑选, 以及美国国立医学图书馆和数据协作采集 专家 （各专业协会）推荐。 ▫ 近年数据涉及37种语种，回溯至1950年的数据涉及60种语种。 数据库47%为美国本土出版的文献， 90%为英文文献，79% 的文献有著者撰写的英文文摘。（以上数据根据2007年11月 数据库提供）。
PubMed使用手册
PubMed使用手册【基本查询方法】•一个检索词：一个单词：在文本框中输入检索词，按GO查询。
含两个单词以上的检索词：需要加双引号，注意是英文输入状态下的双引号。
如："ultrasonic diagnosis"是正确的，“ultrasonic diagnosis”是错误的•两个以上的检索词：可使用AND、OR 连接各检索词。
如："three dimensional ultrasound" AND thyroid •可以在“limit”菜单下限制文献出版的时间、语种等等。
【完全手册】PubMed 系统的主要特点1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping）在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。
（1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。
如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘词）进行检索。
例如：键入"Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。
（2）刊名转换表（Journal Tanslation Table），包括刊名全称、MEDLINE 形式的缩写和ISSN号。
该转换表能把键入的刊名全称转换为"MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。
如：在检索提问框中键入："new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。
（3）短语表（Phrase list）。
PubMed的使用
Affiliation [AD] Article Identifier [AID] All Fields [ALL] Author [AU] Comment CorrectionsCorporate Author [CN] Create Date [CRDT] EC/RN Number [RN] Entrez Date [EDAT] Filter [FILTER] First Author Name [1AU] Full Author Name [FAU] Full Investigator Name [FIR] Grant Number [GR] Investigator [IR] Issue [IP] Journal Title [TA] Language [LA] Last Author [LASTAU] Location ID [LID] MeSH Date [MHDA] MeSH Major Topic [MAJR] MeSH Subheadings [SH] MeSH Terms [MH] NLM Unique ID [JID] Other Term [OT] OwnerPagination [PG] Personal Name as Subject [PS] Pharmacological Action MeSH Terms [PA] Place of Publication [PL] PMCID & MIDPublication Date [DP] Publication Type [PT] Secondary Source ID [SI] Subset [SB] Substance Name [NM] Text Words [TW] Title [TI] Title/Abstract [TIAB] Transliterated Title [TT] UID [PMID]Volume [VI]
gopubmed
Gopubmed1. IntroductionGopubmed is a web-based application that provides a convenient interface to access PubMed, a comprehensive database of scientific publications in the field of biomedicine. Developed using the Go programming language, Gopubmed aims to simplify the search and retrieval of scientific articles by leveraging the extensive capabilities of the PubMed database.2. FeaturesGopubmed offers several key features that enhance the user experience and make it easier to access relevant scientific publications:2.1 Search FunctionalityGopubmed allows users to perform advanced searches across the PubMed database based on various criteria such as author, title, keyword, and publication date. The search results are displayed in a user-friendly format, providing essential details about each publication, including the title, authors, abstract, and publication date.2.2 Article DetailsUpon selecting a specific publication from the search results, Gopubmed retrieves and displays detailed information about the article. This includes the abstract, keywords, MeSH terms (Medical Subject Headings), publication type, and other relevant metadata. This feature helps users gather comprehensive information about an article before deciding to further explore its content.2.3 Saved SearchesGopubmed allows users to save their frequently used searches for future reference. This feature enables users to quickly repeat a search without having tore-enter the search criteria. Saved searches can be easily managed and edited, providing flexibility and convenience to the users.2.4 Export and SharingGopubmed provides the ability to export search results and individual articles in various formats including plain text, CSV, and BibTeX. This feature enables users to save, share, and cite articles according to their requirements. The export function further enhances the utility of Gopubmed as a research tool.2.5 User ManagementGopubmed offers user management capabilities, allowing users to create accounts, log in, and personalize their experience. The user accounts enable features such as saving searches, managing preferences, and organizing collections of articles. This functionality adds a level of customization and personalization to the Gopubmed experience.3. BenefitsGopubmed offers several benefits to users in the scientific community:3.1 Easy Access to PubMedPubMed is a vast and well-respected repository of scientific articles, but navigating and searching through the database can be challenging. Gopubmed simplifies the process by providing a user-friendly interface and advanced search options, making it easier for researchers to access the information they need.3.2 Efficient Retrieval of Relevant ArticlesBy leveraging the advanced search capabilities of the PubMed database, Gopubmed enables users to retrieve the most relevant scientific articles based on their specific criteria. This saves time and effort by filtering out irrelevant publications and delivering focused results.3.3 Enhanced Organization and CollaborationWith features such as saved searches, export options, and user accounts, Gopubmed allows users to efficiently organize their research, collaborate with colleagues, and share findings. This promotes knowledge sharing and facilitates collaboration within the scientific community.3.4 Customization and PersonalizationThrough user accounts, Gopubmed enables users to personalize their search experience, save preferences, and create collections of articles. This customization feature enhances usability and tailors the application to the specific needs and interests of individual users.4. ConclusionGopubmed is a powerful web application designed to simplify access to the PubMed database, offering advanced search options, article details, and export capabilities. With its user-friendly interface and personalized features, Gopubmed aims to enhance the research workflow, enabling users to efficiently find and retrieve relevant scientific publications. Whether you are an academic researcher,medical professional, or science enthusiast, Gopubmed can be a valuable tool in your journey for knowledge discovery.Note: This document is a fictional representation and does not describe an actual product or service.。
科研必备工具GoPubMed使用方法详解
GoPubmed
GO+MeSH 知识挖掘工具
GoPubmed
❖ GoPubMed是德国Transinsight公司和德国德累斯顿大学 合作，利用生物信息学相关知识开发的一个可以对 PubMed检索结果进行探索、分析的工具。
小结
GoPubMed是一个对PubMed进行智能检索、分类导 航的理想工具。
检索者可以快速了解检索到的文献概貌和本研究 领域的研究态势,如作者的研究轨迹、论文的年度 分布、全球核心作者及核心期刊、合著者可视化 关系网络图等。
Gopubmed的功能还有许多，等待大家去 挖掘和探索……
PreMedline
未加工、标引(尚 未规范化处理） 的新收文献，这 部分每日更新一 次。
OLDMEDLINE
PubMed
1951-1965年 生物医学文献， 无文摘、未经 主题词标引。
Publisher Supplied Citations
由出版商直接 传输的电子型 文献，每日都 有新加入文献
利用Mesh主题检索，将大量不相关文献剔除
发生频率 哪一天 发生格式 每次发生条目数
PubMed的困惑
Pubmed的海量数据相关但 无序，需要大量阅读后筛选， 怎么办？
PubMed检索缺点
❖为PubMed以布尔逻辑为基础、基于关键词 的检索模型以及检索结果输出的线性排序 机制有两个缺点：
❖（1）要想选择能够产生较好的检索结果的 关键词，用户需要非常熟知检索策略“W”
W WW W What Who Where When
Gopubmed界面
GoPubMed用于医学科技查新的信息分析
预期 达 到 的 目标 为 ：确 定 茶 多 酚是 否 具有 抑 制 实 验性 肿瘤血 管 生成 效 应 ，评 估 临床 应 用 的 可能 性
与前景 ；从抑 制 肿瘤 血 管 生成 角 度 ，探 索 与 发现 茶
多酚抗肿瘤作用新机制 ；为使用肿瘤血管生成抑制
剂 提供 合理 给药途 径 。
期 刊 有 ５０ ０余 种 ， Ｇ Ｐ ｂ ｄ 是 一 个 免 费 的 对 ０ ｏ ｕ Ｍｅ
［ 摘要］ 采用 Ｇ Ｐ ｂ ｅ 在 线信 息分析软件将 医学科技 查新课题 的相 关文献进行统计分析 ， ｏｕ Ｍ ｄ
包括 文献 的研 究主 题 、著者 、期 刊 、年代 、城 市和 国 家的分 布 。 医学科 技 查新 中对相 关文 献进行 定 性 与定量 相 结合 的分析 方 法 ，以保证 科技 查新 更 为全 面 、客观 、准确 。 ［ 关键 词 ］ Ｇ Ｐｂ ｅ 医学科 技 查新 医学信 息分 析 ｏｕ Ｍ ｄ
２ Ｇｏ ｕ Ｍｅ 与 Ｓ Ｉ 息 分 析 功 能 比 较 Ｐｂ ｄ Ｃ 信
《 学 引文 索 引》 （ ｃ ｎｅＣｔ ｉ ｎ ｅ ， Ｃ ） 科 Ｓ ｉ ｃ ｉｔ ｎＩｄ ｘ Ｓ Ｉ ｅ ａｏ
部 注射 三种 途径抗 肿瘤新 生血 管生成 效应 。 ２ ２ 研 究 目标 ．
是 由美 国科 学 信 息 研 究 所 （ｓ） １６ ＩＩ ９ １年 创 办 出版
GoPubMed简介与使用指南
用户反馈机制不完 善
目前gopubmed缺乏有效的用户 反馈机制，使得用户在遇到问题 时难以寻求帮助或提出建议。建 议设立专门的用户支持渠道，如 在线客服、用户论坛等，以便更 好地收集用户意见和改进服务。
07
CATALOGUE
总结与展望
对gopubmed的总结评价
学术资源集成
gopubmed成功地将多个学术数据库和资源集成在一个平台上，为用 户提供了便捷的一站式学术搜索体验。
年份等信息。
筛选与排序
用户可以根据需要选择筛选条件（如 发表年份、研究领域等）对检索结果
进行进一步筛选和排序。
高级检索技巧
布尔运算符
使用AND、OR、NOT等布尔运算符可以组合多个关键词进行更精 确的检索。
通配符与短语检索
使用通配符（*）可以进行模糊匹配，而使用双引号（" "）可以进 行短语检索。
药物研发与设计
gopubmed的药物研发与设计功能可以帮助研究者了解药物的作 用机制、靶点预测和药物设计原理，为新药研发提供有力支持。
其他领域应用
01 02
科技项目查新与立项
科研人员和项目管理人员可以利用gopubmed进行科技项目查新和立 项分析，了解相关领域的研究现状和发展趋势，为项目申请和决策提供 重要参考。
个性化设置
用户可以根据自己的需求对导出格式、排序 方式等进行个性化设置，提高使用效率。
05
CATALOGUE
gopubmed应用场景
学术研究与论文写作
文献检索与筛选
gopubmed提供强大的文献检索功能，支持关键词、作者、期刊等多种检索方式，帮助研究者快速找 到相关领域的学术文献。
学术趋势分析
通过gopubmed的学术趋势分析功能，研究者可以了解某一研究领域的发展趋势、研究热点和前沿动 态。
pubmed使用指南
4、布尔逻辑检索：系统允许使用布尔逻辑检索，布尔逻 辑运算符要大写（AND、OR或NOT）。 5、剪贴板：使用“send to Clipboard”,可把检索结果存入 剪贴板，剪贴板最多可存放500条记录。只要剪贴板中有 记录，就可点击Clipboard查看其中的记录（记录为 summary格式），粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录 题录。 6、当前页显示篇数默认为20篇，如果需要可调整当前页 的篇数“5、10、20、50、100、200、500”篇。检索结果 默认summary格式（题录格式），可以选择display下拉菜 单中的Abstract（文摘），以文摘格式显示。 练习题： 1、检索AIDS（2008年）英文综述文献 2、查找PUBMED收录我院的论文数量
PubMed简介与使用
3.1.2-Citation Matcher
★ Batch Citation Matcher 批量引文匹配
“ ▫ 输入格式： journal_title|year|volume|first_page|author_name|your_ key|
▫ 例： proc natl acad sci u s a|1991|88|3248|mann bj|P320221| proc natl acad sci u s a|1999|89|3271|gould se|P262611| res microbiol|1992|143|467|ivey dm|P259661| science|1987|235|182|palmenberg ac|P122962| eschatology|1993|12|22|public jq|C122332| virology|1993|193|492|hardy me|Q029451|
通配符 *
Examples-使用检索技巧
精确检索 “”
2.2-特定检索 （单一检索条件）
作者检索 期刊检索 日期检索
1 2 3
2.2.1-作者检索
2002年以后收 录的文章可以 作者全名检索
在基本检索框 直接输入： 姓（全称） □ 名（首字母）
使用Tags： “作者姓 名”[au]
使用高级检 索下拉菜单
Info
Retrieval
PubMed简介与使用
认识PubMed PubMed检索 PubMed辅助
1
认识PubMed
1.1-什么是PubMed
Public 面向公众的，免费的
Medline 联机医学文献分析和 检索系统
1.1-什么是PubMed
PUBMED部分介绍
主题检索：在PubMed主页的检索框中键入英文单词或短语（大写或小写均可），PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。
例如：键入“vitamin c common cold”后回车或点击“Go”，PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
著者检索：当所要查询的是著作者时，在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写，格式为“著者姓空格名字首字母缩写”，例如smith ja，系统会自动到著者字段去检索，并显示检索结果。
刊名检索在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号，例如：molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524，系统将在刊名字段检索，并显示检索结果。
日期或日期范围检索可以在检索框中键入日期或日期范围，系统会按日期段检索，并将符合条件的记录予以显示。
日期的录入格式为YYYY/MM/DD；如：1999/09/08。
也可以不录月份和日子，如：2000或1999/12。
检索期刊子集（辑）检索的格式为：检索词AND jsubseta（或jsubsetd，或jsubsetn），如：neoplasm AND jsubseta。
可供检索的期刊子库有3种：Abridged Index Medicus（有120种重要核心期刊）、Dental和Nursing。
分别使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn进行限定。
检索带文摘的记录检索的格式为：检索词AND has abstract, 如：liver cancer AND has abstract。
要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLINE记录中没有文摘。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务，MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
Pubmed全攻略使用教程
PubMed检索系统简介PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。
MEDLINE是美国国立医学图书馆（U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。
收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。
PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。
它每天都在不断地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。
PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据，这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明，并标有[Record as supplied by publisher]的标识。
这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送，但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代，例如在综合性的科学杂志（Science 或Nature）上发表的地理学文章等。
PubMed 系统的主要特点1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping）在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。
（1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。
如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord 词（题名词和文摘词）进行检索。
例如：键入“Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。
PubMed资料库使用介绍
全文取得途徑
PubMed Fulltext 電子資源
(.tw/ele-resource/index.html)
館藏目錄
(.tw/catalog/webpac/webpac.asp)
全國館際合作系統
(http://140.113.39.185/)
Feature Bar
Limits Preview/Index History Clipboard Details
Feature Bar -Limit
使用者可設定查詢的欄位、附摘要的文獻、出版品的類 型、 語文、主題類別、研究對象年齡層、研究對象、性別、 系 統最近更新時間、出版時間等。
Feature Bar –Preview/Index
Journals Database MeSH Brower Single Citation Clinical Queries
PubMed Services—Journals Brower
可從「題名」、「ISSN」、「刊名縮寫」查詢期刊的出版資訊。 如下：
PubMed Services—Single Citation Matcher
Introduction—Homepage
資料庫選擇 輔助說明 PubMed服務項目 檢索 Feature Bar功能快捷 列
About Entrez
Entrez是一Web-base檢索系統，用以檢索下圖所示各資料庫，只 要從 其中一個資料庫出發，可在檢索結果中進行相關資料庫的檢索。
Introduction—Boolean Logic
每次檢索步驟，系統都會產生一個檢索號碼，本區可看到所有的檢索 步驟歷史紀錄，如要運用先前檢索的策略，可直接輸入檢索號碼並以 布林邏輯加以運算，如：#1 AND #5。但此紀錄在系統未運作一小時 後將被系統消除。
PubMe简介及使用说明
PubMed简介及使用说明壹、简介PubMed为美国国家医学图书馆的美国国家生技资讯中心(NCBI)所制作之生物医学相关文献的书目索引摘要型资料库，目前收录1950年以来约1400多万笔生物医学相关书目资料，并提供部分免费及付费全文连结服务，需要收费的全文，读者可自行与出版社接洽。
较之于MEDLINE资料以生物医学、生命科学、生化学、行为科学为主，PubMed 资料库范围更涵盖了如下内容：1. 对于超出学科范围(如：资讯科学、航太科学) 的特定生命科学、医学、化学相关之期刊文章都会收录于本资料库中；2. 收录即将出版的医学论文；3. 已由NLM审核通过并已由PubMed Central典藏的全文文献亦收录之。
美国国家生技资讯中心(NCBI)制作了一系列的生物医学资料库如下：1.PubMed：生物医学文献书目索引摘要资料库。
2.Nucleotide：包含GenBank、RefSeq、PDB资料库中的人类基因序列资料。
3.Protein：整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq资料库中的资料，并可参照Taxonomy资料库，了解特定种类的蛋白质的在资料库中分类状况的相关说明。
4.Structure：分子构造资料库。
5.Genome：基因组合序列资料库。
6.PopSet：可查询某族群的基因序列，了解该族群演进之相关资料。
7.OMIM：遗传学资料库。
8.Taxonomy：在NCBI基因资料库中提及的微生物的核酸或蛋白质序列的分类状况之相关说明。
9.Books：收录C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology. 4th ed.、Retroviruses.等六本书。
PubMed使用指南
PubMed使用指南PubMed使用指南介绍PubMed是一个免费的生物医学文献数据库，由美国国立卫生研究院（NIH）的国家医学图书馆（NLM）开发和维护。
本文档旨在为用户提供对PubMed的全面指南，以帮助他们更有效地搜索和浏览相关文献。
1. 注册和登录1.1 注册PubMed账户1.1.1 访问PubMed官方网站（）。
1.1.2 页面右上角的“Sign In”按钮。
1.1.3 在弹出的对话框中选择“Create an Account”选项。
1.1.4 填写所需信息，如姓名、电子邮件地址和密码，并完成注册流程。
1.2 登录PubMed账户1.2.1 访问PubMed官方网站。
1.2.2 页面右上角的“Sign In”按钮。
1.2.3 输入您在注册过程中设置的电子邮件地址和密码，然后“Sign In”。
2. 搜索和过滤2.1 基本搜索2.1.1 在PubMed主页的搜索栏中输入关键词或短语，并“Search”按钮。
2.1.2 在搜索结果页面上，您可以浏览与搜索词相关的文献列表。
2.2 高级搜索2.2.1 PubMed主页搜索栏右侧的“Advanced”。
2.2.2 在高级搜索页面上，您可以输入更多的搜索条件来限定您的搜索结果。
2.2.3 “Search”按钮进行搜索。
3. 浏览和筛选结果3.1 结果列表3.1.1 在搜索结果页面上，您可以看到搜索词相关的文献标题和作者信息。
3.1.2 文献标题可查看文献的详细信息。
3.2 结果过滤3.2.1 使用左侧的过滤器栏来筛选搜索结果，如出版日期、文献类型、作者、免费全文等。
3.2.2 过滤器栏下方的“Show additional filters”以展开更多过滤选项。
4. 查看文献详细信息4.1 摘要信息4.1.1 在文献详细信息页中，您可以查看该文献的摘要信息，包括背景、目的、方法、结果和结论。
4.1.2 “Abstract”标签以查看完整的摘要内容。
PubMed检索基础专题知识
惯用文件类型：DOC.XLS、PPT、PDF、RTF 5、双引号“” 表示准确搜索
例：搜索糖尿病饮食治疗，假如不加双引号，搜索结果被 拆分，效果不是很好，但加上双引号后，“糖尿病饮食治 疗”，取得结果就全是符合要求了。
部分功效能够经过搜索引擎高级搜索来实现
PubMed检索基础专题知识
第13页
PUBMED中医药内容检索技巧
❖ 1、中医词汇首选对应Mesh词，重视Mesh词与自由词结合，并配合自由词 不一样拼写方法。(推拿、气功)
❖ 2、中药名称首选药材拉丁名配合英文名与汉语拼音，同时需要注意中药上 位概念如Drug,Chinese Herbal 、Plant Roots
PUBMED反馈与加强
PubMed检索基础专题知识
第1页
主要问题
❖ 没有应用到PUBMED筛选功效, 也就是特征词 ❖ 对于副主题词作用不了解 ❖ 未从detail转化情况来反思检索结果 ❖ 未能了解主题标引概念 ❖ 欠缺思索、太敷衍
PubMed检索基础专题知识
第2页
PUBMED基础与提升
基础 提升
PubMed检索基础专题知识
第29页
PubMed检索基础专题知识
第30页
❖ Science Links Japan--日本科技门户类网站: 将 日本各类科学技术在线信息源搜集后给予分类， 并用英语向日本国外进行介绍综合性网页。主要 目标是向日本国外科研人员，科技政策研究人员 等提供便利日本科技信息。
❖ 人类和动物
年纪组
❖ 性别
时代特征词
❖ 妊娠
出版类型特征词
❖ 详细动物名称特征词
Pubmed的使用方法(全)
PubMed完全攻略第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。
尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。
"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。
从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。
我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。
尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。
还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。
无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed 所给你带来的无穷便利。
俗话说，喝水不忘掘井人。
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。
有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed 前都感谢NCBI呢？PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。
其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。
当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。
而最新的文献几乎就在此时此刻。
与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。
所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。
Pubmed及Endnote使用参考
PubMed基本检索
逻辑与（AND） --检出记录中同时含有检索词A和检索词B. 如：A AND B
A
B
布尔逻辑组合 检索，常用的 逻辑关系词有 AND，OR， NOT等
逻辑或（OR） --检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。 如：A OR B
A
B
逻辑非（NOT） --在含检索词A的记录中，去掉含检索词B的记录。 如：A NOT B
例如：检索肿瘤 (cancer)方面的文章。 在检索框中输入：“cancer”，再点击“Go”按钮。
PubMed将自动地利用它的“自动词汇匹配”功能将重要的 词语结合在一起，并将不规范的词语转换成MeSH词表中规范的用 词进行检索，比如，检索“cancer” 将自动转换为：
"neoplasms"[MeSH Terms] OR "neoplasms"[All Fields] OR "cancer"[All Fields]
文献管理工具 大大提高我们科的研信科息研管效理率工具 End3n0ote X4
一、Endnote基本原理
个人专题文献数据库 Library *.enl
Output Style FilterFilter
期
Author
刊 模
论
Year
板
文
文 献
Title Journal
参
写
考
作
PDF、图、表……
文 献
5
PubMed基本检索
强制检索功能
PubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索。 如：在PubMed主页的检索提问框中键入“single cell”，并用双 引号引起来。点击“GO”按钮，系统会将其作为一个不可分割的词 组在数据库的全部字段中进行检索。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
Alkaline Phosphatase: 52 papers
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
Effects of alkaline phosphatase and its inhibitor Levamisole…
10
GoPubMed Example
Phosphofructokinase
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
2
GoPubMed and beyond: Rules and reasoning for ontology-based literature search
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
3
Problem
GoPubMed and beyond:
Rules and reasoning for ontology-based literature search
Michael Schroeder
BioTechnological Center TU Dresden ms@mpi-cbg.de http://www.biotec.tu-dresden.de
In PubMed the article is listed at position 84! And hence unlikely to be read
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
13
GoPubMed and beyond: Rules and reasoning for ontology-based literature search
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
5
PubMed Example
A keyword search for levamisole inhibitor produces well over 100 hits in PubMed. To find out about specific functions, we have to go through all these papers! We are interested in the relevant enzymatic functions. A refined search for Levamisole inhibitor enzymatic activity produces only 5 hits - a lot of relevant papers have been dropped.
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
16
PubMed XML Output
<PubmedArticle> <MedlineCitation Owner="NLM" Status="Publisher"> <PMID>15469972</PMID> <DateCreated> <Year>2004</Year> <Month>10</Month> <Day>7</Day> </DateCreated> <Article> <Journal> <ISSN>0950-1991</ISSN> <JournalIssue PrintYN="N"> <PubDate> <Year>2004</Year> <Month>10</Month> <Day>6</Day> </PubDate> </JournalIssue> <Coden>DEVPED</Coden> <Title>Development (Cambridge, England)</Title> <ISOAbbreviation>Development</ISOAbbreviation> </Journal>…
By Michael Schroeder, Biotec, 2003 7
Байду номын сангаас
GoPubMed Example
Let’s look for some functions: 70 papers including terms, which are enzyme activities
By Michael Schroeder, Biotec, 2003 8
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
18
Code Snippet
%%% XML reading tests :- eval(test_xml1()).
Prolog rules Java objects
evaluate(ChildNode):"Year"=ChildNode.getNodeName(), printout(ChildNode). evaluate(ChildNode):"Initials"=ChildNode.getNodeName(), printout(ChildNode), println([**********************]). evaluate(ChildNode):"FirstName"=ChildNode.getNodeName(), printout(ChildNode). evaluate(ChildNode):"ForeName"=ChildNode.getNodeName(), printout(ChildNode). evaluate(ChildNode):"LastName"=ChildNode.getNodeName(), printout(ChildNode). evaluate(ChildNode):"ArticleTitle"=ChildNode.getNodeName(), printout(ChildNode). printout(ChildNode):ChildNodeName = ChildNode.getNodeName(), DataName = ChildNode.getFirstChild(), StringName = DataName.getNodeValue(), println([ChildNodeName, ": ",StringName]).
Offer a rule-based platform for distributed agent programming.
Expose logic and agent behaviour as rules; Access data sources via wrappers written in Java Make all Java API from available packages directly accessible from rules; Run within the Java runtime; Enable rapid prototyping of applications;
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
17
Output
Year: 2004 ArticleTitle: Developmental potential of defined neural progenitors derived from mouse embryonic stem cells. LastName: Plachta FirstName: Nicolas Initials: N ********************** LastName: Bibel FirstName: Miriam Initials: M ********************** LastName: Tucker FirstName: Kerry Lee Initials: KL ********************** LastName: Barde FirstName: Yves-Alain Initials: YA ****************************************** Year: 2004 ArticleTitle: Eye evolution: a question of genetic promiscuity. LastName: Nilsson ForeName: Dan-E Initials: DE ********************** …
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
14
Prova
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
15
Prova
Rule-based Java scripting for middleware Combination of object-oriented and declarative programming
GoPubMed Example
Transferase Kinase Hydrolase Oxidoreductase Lyase
8 6 58 2 1
9
By Michael Schroeder, Biotec, 2003
GoPubMed Example
…alkaline phosphatase inhibitor levamisole…
Towards a Bioinformatics Semantic Web