临床分子诊断与个体化治疗模板.pptx
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雅培公司
20感11谢-0你8的观组看织，ALK
FISH
Xalkon (crizotinb)
19
基因突变和表达与肿瘤靶向治疗
肿瘤 结直肠癌
非小细胞肺癌
治疗药物
检测位点
结果判断
西妥腊单抗 （Cetuximab） 帕尼单抗 （Paritumuma b）
古非替尼
特罗氨 （Tarceva）
12号染色体KRAS基因2号外显子的12密码子和 13密码子、3号外显子的61号密码子，其中有7 个突变热点：G12C、G12R、G12S、G12V、 G12D、G12A、G13V/D占到KRAS基因突变的 90%以上
Invitrogen公司
2008-07 组织，HER2
Dako DenmarK A/S 2010-10 组织，HER2
罗氏公司
2011-08 组织，BRAF
免疫荧光 FISH RT-PCR
相关药物
Aripiprazole, Atomoxetine, Carceilor,Cerimeline Chlordiazepoxide, Amitrptyline
2019年6月29
感谢你的观看
6
目前国内临床分子诊断现状
绝大部分用于病原体核酸检测 较少部分用于遗传病的产前诊断 个体化用药的分子诊断正在兴起
2019年6月29
感谢你的观看
7
一些常见的认识误区
临床实验室=检验科 基因（遗传携带、突变等）与病原体核酸检
测完全不同 临床PCR检验在病理科、药剂科或肿瘤科做，
位于IL28b基因下游8kb，与非病毒学应答相关，其中T/T为 保护性基因型，G/T与G/G为非保护性基因型。G等位基因与 乙肝病毒相关的肝细胞损伤密切相关，能提高 SNPrs12979860C/T基因型的非病毒学应答预测价值
肺癌诊断治疗的规范化和个体化PPT课件
发病机制
肺癌的发生与多种基因突变有关，包 括EGFR、KRAS、ALK等基因的突变 。这些基因突变导致细胞生长和分裂 失控，形成肿瘤。
02
肺癌的诊断
肺癌的早期诊断
早期诊断的重要性
肺癌早期诊断可以提高治 愈率，降低治疗难度和患 者的死亡率。
症状观察
持续咳嗽、咳痰、胸痛、 呼吸困难等症状可能是肺 癌的早期表现，应引起重 视。
筛查手段
低剂量螺旋CT是肺癌早期 筛查的有效手段，能够发 现早期肺癌病变。
肺癌的影像学诊断
X线检查
MRI检查
X线胸片是初步筛查肺癌的方法之一， 能够发现肺部异常阴影。
对于某些特定类型的肺癌，如肺鳞癌， MRI检查有助于更准确地判断肿瘤侵 犯的范围。
CT检查
CT能够更准确地显示肺部肿瘤的大小、 形态、位置以及与周围组织的毗邻关 系。
个体化治疗方案制定
根据肺癌患者的肿瘤微环境特点，制定个体化的治疗方案，包括细 胞因子治疗、抗血管生成治疗等。
疗效评估与方案调整
实时监测治疗效果，根据肿瘤微环境的变化及时调整治疗方案，提高 个体化治疗的精准性和有效性。
05
肺癌治疗的未来展望
肺癌的精准医疗和个性化治疗
精准医疗
基于肺癌患者的基因、分子特征和病理类型，制定个性化的 治疗方案，以提高治疗效果和患者的生存率。
表型分型，如免疫阳性和免疫阴性型肺癌。
免疫治疗
02
针对免疫阳性型肺癌，采用免疫检查点抑制剂、CAR-T细胞治
疗等手段，激活患者自身的免疫系统，杀伤肿瘤细胞。
联合治疗
03
将免疫治疗与其他治疗方法（如化疗、放疗）相结合，提高治
疗效果，延长患者生存期。
肺癌的肿瘤微环境和个体化治疗
肺癌的发生与多种基因突变有关，包 括EGFR、KRAS、ALK等基因的突变 。这些基因突变导致细胞生长和分裂 失控，形成肿瘤。
02
肺癌的诊断
肺癌的早期诊断
早期诊断的重要性
肺癌早期诊断可以提高治 愈率，降低治疗难度和患 者的死亡率。
症状观察
持续咳嗽、咳痰、胸痛、 呼吸困难等症状可能是肺 癌的早期表现，应引起重 视。
筛查手段
低剂量螺旋CT是肺癌早期 筛查的有效手段，能够发 现早期肺癌病变。
肺癌的影像学诊断
X线检查
MRI检查
X线胸片是初步筛查肺癌的方法之一， 能够发现肺部异常阴影。
对于某些特定类型的肺癌，如肺鳞癌， MRI检查有助于更准确地判断肿瘤侵 犯的范围。
CT检查
CT能够更准确地显示肺部肿瘤的大小、 形态、位置以及与周围组织的毗邻关 系。
个体化治疗方案制定
根据肺癌患者的肿瘤微环境特点，制定个体化的治疗方案，包括细 胞因子治疗、抗血管生成治疗等。
疗效评估与方案调整
实时监测治疗效果，根据肿瘤微环境的变化及时调整治疗方案，提高 个体化治疗的精准性和有效性。
05
肺癌治疗的未来展望
肺癌的精准医疗和个性化治疗
精准医疗
基于肺癌患者的基因、分子特征和病理类型，制定个性化的 治疗方案，以提高治疗效果和患者的生存率。
表型分型，如免疫阳性和免疫阴性型肺癌。
免疫治疗
02
针对免疫阳性型肺癌，采用免疫检查点抑制剂、CAR-T细胞治
疗等手段，激活患者自身的免疫系统，杀伤肿瘤细胞。
联合治疗
03
将免疫治疗与其他治疗方法（如化疗、放疗）相结合，提高治
疗效果，延长患者生存期。
肺癌的肿瘤微环境和个体化治疗
乳腺癌分子分型与个体化治疗演示精品PPT课件
和Ki-67）进行乳腺癌近似分子分型，特称为“临床病理分类”。
存在问题
几乎所有过去的临床试验均不是根据分子分型设计的，所 有结果均来自于回顾性的亚组分析。
IHC虽有诸多优点，如简单实用、敏感性与特异性高，但 其最大问题是因检测的准确性受诸多因素影响致实验差异 性大。
目前尚缺乏统一的Ki-67检测和评估的方案。
LuminalB型（HER2 阳性）
乳腺癌分子分型与个体化治疗
濮阳市油田总院普外一科
背景
相同临床分期或病理类型的乳腺癌患者,采用同一方案治疗, 其治 疗的敏感性及患者预后存在明显的差异。
乳腺癌并非由单一基因导致。 仅按临床特征分类已不能从本质上认识乳腺癌，亦不能适应多种治
疗手段的发展。 单一模式的癌症治疗、预防策略以及生存期规划将被个体化替代。
分子分型的由来
1999年，美国国立癌症研究所(NCI)年提出肿瘤分子分型，通过综合 的分子分析技术使肿瘤的分类基础由形态学转向以分子特征为基础的 新的肿瘤分类系统。
2000年，美国斯坦福大学的Perou等首次提出乳腺癌的分子分型，包 括：管腔型、基底细胞样型、HER2过表达型和正常乳腺样型。
2003年，Sorlie等人又将管腔型分为A型和B型/C型。 2011年，《St．Gallen早期乳腺癌初始治疗国际专家共识》将Ki-67
靶向药物 －与化疗策略结合 AC → PH(TH) TCH
辅助化疗在过去40年对患者总生 存的改善情况
化疗+曲妥珠单抗
2006 紫杉类方案 6% 获益
2000 蒽环类方案 5.1% 获益
CMF方案
无化疗 1970
1980 4.3% 获益
4.2% 获益
化疗持续地改善了早期乳腺癌的预后,在早期乳腺癌的治疗中扮演了非常重要的角色
存在问题
几乎所有过去的临床试验均不是根据分子分型设计的，所 有结果均来自于回顾性的亚组分析。
IHC虽有诸多优点，如简单实用、敏感性与特异性高，但 其最大问题是因检测的准确性受诸多因素影响致实验差异 性大。
目前尚缺乏统一的Ki-67检测和评估的方案。
LuminalB型（HER2 阳性）
乳腺癌分子分型与个体化治疗
濮阳市油田总院普外一科
背景
相同临床分期或病理类型的乳腺癌患者,采用同一方案治疗, 其治 疗的敏感性及患者预后存在明显的差异。
乳腺癌并非由单一基因导致。 仅按临床特征分类已不能从本质上认识乳腺癌，亦不能适应多种治
疗手段的发展。 单一模式的癌症治疗、预防策略以及生存期规划将被个体化替代。
分子分型的由来
1999年，美国国立癌症研究所(NCI)年提出肿瘤分子分型，通过综合 的分子分析技术使肿瘤的分类基础由形态学转向以分子特征为基础的 新的肿瘤分类系统。
2000年，美国斯坦福大学的Perou等首次提出乳腺癌的分子分型，包 括：管腔型、基底细胞样型、HER2过表达型和正常乳腺样型。
2003年，Sorlie等人又将管腔型分为A型和B型/C型。 2011年，《St．Gallen早期乳腺癌初始治疗国际专家共识》将Ki-67
靶向药物 －与化疗策略结合 AC → PH(TH) TCH
辅助化疗在过去40年对患者总生 存的改善情况
化疗+曲妥珠单抗
2006 紫杉类方案 6% 获益
2000 蒽环类方案 5.1% 获益
CMF方案
无化疗 1970
1980 4.3% 获益
4.2% 获益
化疗持续地改善了早期乳腺癌的预后,在早期乳腺癌的治疗中扮演了非常重要的角色
【优秀文档】个体化医学的临床应用PPT
单检检(3)位测测可提 结 结选供果论择个：：分体糖该子已化皮患量药质者2基5物激携0~因治素带3疗相股2检0会关骨Da测诊基头的服因坏为双务位死磷。点风酸险盐基，因如，依糖替皮磷质酸激二素钠大(2剂50量D使a)用或或唑长来期磷使酸用(29导0致Da股)；骨头坏死的风险较高。 MWTHHOF：R2（00607年7主C提>的出T, ，r技s211术8世01纪支13步3撑）入“3P”时代—预防（preventive），预测（predictable)和个体化（personal）
+ 1+1+1 ≥ 3 个B、体山化东药3物0家治医疗院在申风请湿，免安疫徽领2域4家的医应院用申请，云南13家医院申请，湖北12家医院申请、江苏20家医院申请
一举旦例出 ：现关，于死CY亡P率2D高6的达表26型%判。断，CYP2D6属于细胞色素P450酶 举年例，： 全关国于40C余Y家P2三D甲6的医表院型设判立断“，个C体YP化2药D6物属治于疗细中胞心色”素。P450酶
个体化用药—主要潮流，大势所趋
• WHO：2000年提出，21世纪步入“3P”时代—预防 （preventive），预测（predictable)和个体化（personal）
• FDA：2006全美3600万份用药记录中，880万份（24.3%） 使用了说明书中有基因组生物标记信息的药物。
年，“个体化医学中国论坛（第一届）”将于10月举办，由人民卫生出版社和中国健康促进 会共同发起，论坛主席团：陈竺院士、王
辰院士、巴德年院士、黄洁夫副部长等 ，将设各病种分论坛，以及药学分论坛。
根据CYP2D6基因型选择剂量
检测项目：糖皮质激素用药指导的基因检测
药物治疗的个体差异现象
另有数据显示，中国人群中，其频率为8.
+ 1+1+1 ≥ 3 个B、体山化东药3物0家治医疗院在申风请湿，免安疫徽领2域4家的医应院用申请，云南13家医院申请，湖北12家医院申请、江苏20家医院申请
一举旦例出 ：现关，于死CY亡P率2D高6的达表26型%判。断，CYP2D6属于细胞色素P450酶 举年例，： 全关国于40C余Y家P2三D甲6的医表院型设判立断“，个C体YP化2药D6物属治于疗细中胞心色”素。P450酶
个体化用药—主要潮流，大势所趋
• WHO：2000年提出，21世纪步入“3P”时代—预防 （preventive），预测（predictable)和个体化（personal）
• FDA：2006全美3600万份用药记录中，880万份（24.3%） 使用了说明书中有基因组生物标记信息的药物。
年，“个体化医学中国论坛（第一届）”将于10月举办，由人民卫生出版社和中国健康促进 会共同发起，论坛主席团：陈竺院士、王
辰院士、巴德年院士、黄洁夫副部长等 ，将设各病种分论坛，以及药学分论坛。
根据CYP2D6基因型选择剂量
检测项目：糖皮质激素用药指导的基因检测
药物治疗的个体差异现象
另有数据显示，中国人群中，其频率为8.
乳腺癌分子分型与个体化辅助化疗策略ppt课件
ER+/PR+/HER2-/Ki67低表达的pCR率低
ER状态
阴性
阳性
PR状态
阴性
阳性
HER2状态
阴性
阳性
Ki67
低
高
全组
198 (35.9%)
354 (64.1%)
259 (46.9%)
293 (53.1%)
445 (81.4%)
从分子分型与新辅助化疗效果关系分析的中得到的启示
可手术乳腺癌新辅助化疗后的pCR是长期生存的有效预测指标。 Luminal A型和正常乳腺型对化疗不敏感，pCR率明显低于其他亚型患者，可能不能从新辅助化疗中获益。 对于Luminal A型患者，pCR对预后的预测价值不大 Ki67高表达患者的pCR率显著高于Ki67低表达患者， Luminal B型(Ki67高表达)可能从新辅助化疗中获益。 三阴(基底样)与HER2+亚型乳腺癌新辅助化疗pCR率高（尤其对含紫杉类联合蒽环类），能从新辅助化疗中获益。
年龄<35岁
淋巴结阳性(1-3个淋巴结受累)和ER和/或PR阳性且无HER2/neu过表达或扩增
淋巴结阳性(1-3个淋巴结受累)和ER和PR阴性或HER2/neu过表达或扩增
淋巴结阳性(4个或4个以上淋巴结受累)
脏断锐篆滚挝淡唆巾讼输拎诱个铭雨轿哉伞缴届京河漱袁剿邑虏瓜铅骚始乳腺癌分子分型与个体化辅助化疗策略乳腺癌分子分型与个体化辅助化疗策略
ER+
HER2+
TN
全组
ER/PR
+
+
+/-
+/-
+/-
+/-
-
-
+/-
ER状态
阴性
阳性
PR状态
阴性
阳性
HER2状态
阴性
阳性
Ki67
低
高
全组
198 (35.9%)
354 (64.1%)
259 (46.9%)
293 (53.1%)
445 (81.4%)
从分子分型与新辅助化疗效果关系分析的中得到的启示
可手术乳腺癌新辅助化疗后的pCR是长期生存的有效预测指标。 Luminal A型和正常乳腺型对化疗不敏感，pCR率明显低于其他亚型患者，可能不能从新辅助化疗中获益。 对于Luminal A型患者，pCR对预后的预测价值不大 Ki67高表达患者的pCR率显著高于Ki67低表达患者， Luminal B型(Ki67高表达)可能从新辅助化疗中获益。 三阴(基底样)与HER2+亚型乳腺癌新辅助化疗pCR率高（尤其对含紫杉类联合蒽环类），能从新辅助化疗中获益。
年龄<35岁
淋巴结阳性(1-3个淋巴结受累)和ER和/或PR阳性且无HER2/neu过表达或扩增
淋巴结阳性(1-3个淋巴结受累)和ER和PR阴性或HER2/neu过表达或扩增
淋巴结阳性(4个或4个以上淋巴结受累)
脏断锐篆滚挝淡唆巾讼输拎诱个铭雨轿哉伞缴届京河漱袁剿邑虏瓜铅骚始乳腺癌分子分型与个体化辅助化疗策略乳腺癌分子分型与个体化辅助化疗策略
ER+
HER2+
TN
全组
ER/PR
+
+
+/-
+/-
+/-
+/-
-
-
+/-
《分子诊断与临床》PPT课件
自动化测序---常规应用
精品医学
22
链末端终止法测序原理 精品医学
化学降解法测序原理23
自动化测序
充分体现DNA序列自动化分析技术的简单、
安全、精确、并行和高效等特点
目前，自动化测序已成为DNA序列分析的
主流，几乎完全取代了手工测序
类型：
➢ 基于单一荧光染料标记的自动化测序系统 ➢ 基于多种荧光染料标记的自动化测序系统
精品医学
40
中国生物信息数据库
中国国家生物医学数据库 中国核酸序列数据库
➢ 中国核酸序列数据库 ➢ 中国人核酸序列统计数据库
精品医学
41
三、分子诊断在临床的应用
1. 单基因疾病的分子诊断 2. 多基因疾病的分子诊断 3. 肿瘤的分子诊断与预测 4. 感染性疾病的分子诊断 5. 在耐药性研究中的价值 6. 在个体化治疗中的应用 7. 分子诊断在临床的其他应用
➢ 随机测序法 （鸟枪法、人工转座子法 ） ➢ 定向测序法 （引物测序法、互套缺失法 ） ➢ 全基因组测序策略
精品医学
21
DNA测序常用技术
链末端终止法（ Sanger法） 化学降解法 测序新技术
➢ MALDI-TOF MS ➢ 杂交测序法 ➢ 焦磷酸测序技术 ➢ 原子探针显微镜法 ➢ 单分子测序技术
精品医学
42
1、单基因疾病的分子诊断
血红蛋白病的分子诊断 肌营养不良症的分子诊断 血友病的分子诊断
α1抗胰蛋白酶缺乏症的分子诊断
Leber`s遗传性视神经病变的分子诊断 其他单基因疾病的分子诊断
精品医学
43
谷氨酸(GAN) HbA
缬氨酸(GUN) HbS
镰状红细胞贫血患者基因组的限制性酶切分析
精品医学
22
链末端终止法测序原理 精品医学
化学降解法测序原理23
自动化测序
充分体现DNA序列自动化分析技术的简单、
安全、精确、并行和高效等特点
目前，自动化测序已成为DNA序列分析的
主流，几乎完全取代了手工测序
类型：
➢ 基于单一荧光染料标记的自动化测序系统 ➢ 基于多种荧光染料标记的自动化测序系统
精品医学
40
中国生物信息数据库
中国国家生物医学数据库 中国核酸序列数据库
➢ 中国核酸序列数据库 ➢ 中国人核酸序列统计数据库
精品医学
41
三、分子诊断在临床的应用
1. 单基因疾病的分子诊断 2. 多基因疾病的分子诊断 3. 肿瘤的分子诊断与预测 4. 感染性疾病的分子诊断 5. 在耐药性研究中的价值 6. 在个体化治疗中的应用 7. 分子诊断在临床的其他应用
➢ 随机测序法 （鸟枪法、人工转座子法 ） ➢ 定向测序法 （引物测序法、互套缺失法 ） ➢ 全基因组测序策略
精品医学
21
DNA测序常用技术
链末端终止法（ Sanger法） 化学降解法 测序新技术
➢ MALDI-TOF MS ➢ 杂交测序法 ➢ 焦磷酸测序技术 ➢ 原子探针显微镜法 ➢ 单分子测序技术
精品医学
42
1、单基因疾病的分子诊断
血红蛋白病的分子诊断 肌营养不良症的分子诊断 血友病的分子诊断
α1抗胰蛋白酶缺乏症的分子诊断
Leber`s遗传性视神经病变的分子诊断 其他单基因疾病的分子诊断
精品医学
43
谷氨酸(GAN) HbA
缬氨酸(GUN) HbS
镰状红细胞贫血患者基因组的限制性酶切分析
分子诊断与个体化治疗精品PPT课件
种或者两种以上的颜色才能进行比较。
8
任何颜色都有它的正面影响和负面影响。其实我们每个人都有自己的代表色， 颜色能看出每个人的心理特征，但这个世界是不可能有百分百纯色系的人存在，因 为每个人的心理都是错综复杂的。 西方心理学家中有人提出，常见的赤橙黄绿青 蓝紫等颜色对人的生理有不同的影响。
红色：刺激和兴奋神经系统，增加肾上腺素分泌和增进血液循环。 橙色：诱发食欲，帮助恢复健康和吸收钙。 黄色：可刺激神经和消化系统。 绿色：有益于消化和身体平衡，有镇静作用。 蓝色：能降低脉搏、调整体内平衡。 靛蓝：调和肌肉、止血、影响视听嗅觉。 紫色：对运动神经和心脏系统有压抑作用。 黑色：精神压抑。导致疾： 光线→角膜→瞳孔→晶状体（折射光线）→玻璃体（固定眼
球） →视网膜（形成物像）→视神经（传导视觉信息）→大脑视觉 中枢（形成视觉）
6
三种椎体细胞
• 在人眼视网膜中有 三种对颜色敏感的 椎体细胞，它们分 别对红、绿、蓝3种 颜色最敏感。
• -第一种椎体细胞专 门感受红光
随着时间的推移延长逐渐变的暗淡。 4. 闪光盲：指由于高强度的光刺激而引起暂时性眼睛的敏感度下降。
在低照度下一适应的眼睛，如果突然暴露在极亮的环境下，若在太 强的光线照耀下，可能照成视觉功能的短暂丧失。
17
色彩的错觉
• 色彩的错视是指视觉中主管感受的色彩与客观颜色不一致。 • 造成这种现象的原因是由于色彩的对比产生的。 • 在色彩进行对比研究中，一种颜色是无法进行比较的，必须选用两
13
三、文化环境的熏陶
• 人一生下来就会被动地、无可选择地生活在一定的社会文化环境中。 例如，宗教环境、民族、家庭背景等等。各种不同的社会文化、对 色彩的好恶、偏爱、禁忌、追求、所赋予的意义、审美情趣所联系 的事件、器物和行为也各有差异，因而对于个人的心理影响也不同。 各种不同文化环境对人的色彩心理感受性的影响，除了有共同的方 面以外，大多造成心理感觉差异性的一面
8
任何颜色都有它的正面影响和负面影响。其实我们每个人都有自己的代表色， 颜色能看出每个人的心理特征，但这个世界是不可能有百分百纯色系的人存在，因 为每个人的心理都是错综复杂的。 西方心理学家中有人提出，常见的赤橙黄绿青 蓝紫等颜色对人的生理有不同的影响。
红色：刺激和兴奋神经系统，增加肾上腺素分泌和增进血液循环。 橙色：诱发食欲，帮助恢复健康和吸收钙。 黄色：可刺激神经和消化系统。 绿色：有益于消化和身体平衡，有镇静作用。 蓝色：能降低脉搏、调整体内平衡。 靛蓝：调和肌肉、止血、影响视听嗅觉。 紫色：对运动神经和心脏系统有压抑作用。 黑色：精神压抑。导致疾： 光线→角膜→瞳孔→晶状体（折射光线）→玻璃体（固定眼
球） →视网膜（形成物像）→视神经（传导视觉信息）→大脑视觉 中枢（形成视觉）
6
三种椎体细胞
• 在人眼视网膜中有 三种对颜色敏感的 椎体细胞，它们分 别对红、绿、蓝3种 颜色最敏感。
• -第一种椎体细胞专 门感受红光
随着时间的推移延长逐渐变的暗淡。 4. 闪光盲：指由于高强度的光刺激而引起暂时性眼睛的敏感度下降。
在低照度下一适应的眼睛，如果突然暴露在极亮的环境下，若在太 强的光线照耀下，可能照成视觉功能的短暂丧失。
17
色彩的错觉
• 色彩的错视是指视觉中主管感受的色彩与客观颜色不一致。 • 造成这种现象的原因是由于色彩的对比产生的。 • 在色彩进行对比研究中，一种颜色是无法进行比较的，必须选用两
13
三、文化环境的熏陶
• 人一生下来就会被动地、无可选择地生活在一定的社会文化环境中。 例如，宗教环境、民族、家庭背景等等。各种不同的社会文化、对 色彩的好恶、偏爱、禁忌、追求、所赋予的意义、审美情趣所联系 的事件、器物和行为也各有差异，因而对于个人的心理影响也不同。 各种不同文化环境对人的色彩心理感受性的影响，除了有共同的方 面以外，大多造成心理感觉差异性的一面
最新-分子诊断的临床应用-PPT文档资料
HPV DNA的检测方法 实时定量PCR (Real time PCR) 核酸杂交捕获（Hybrid CaptureⅡ，HCⅡ）
HC Ⅱ可一次检测所有致癌的13种高危型HPV。 敏感度：对CIN Ⅱ、Ⅲ和癌的检出率为 98%。 阴性预期值：对高度鳞状上皮细胞病变或更高度 病变的阴性预期值99.9%
鼻、咽拭子中含有的病毒RNA显著少于痰液， 提示不适合作为标本（有可能漏检）。
SARS相关冠状病毒基因检测 必须注意的问题
必须在范的基因扩增实验室中进行。
应采取必要的质控规程，包括阳性对照和阴 性对照。
阳性结果时必须对原始样本重复检验： 或者扩增另一个基因片段 或在另一个实验室对同一样本进行检测。
1990年人类基因组计划正式启动。
2001年2月科学家宣布完成人类基因组的全 部序列图。
DNA重组技术(DNA recombination) 转基因技术(transgenic technique) 基因组学(genomics) 蛋白组学(proteomics) 基因治疗(genotherapy) 生物芯片(biochip)等技术 已应用到医学领域，对疾病机理的认识、疾 病的诊断、预防和治疗产生了深刻的影响。
用分子生物学技术通过检测基因而达 到诊断疾病的目的是生物学者在分子生物 学技术发展的最初阶段就有的设想。
上世纪70年代人们开始在实验室进行 研究，80年代以来，基因检测在许多国家 已成为常规检验项目，主要用于感染性和 遗传性疾病等的诊断。
1953年Watson 和Crick 提出脱氧核糖核酸 的双螺旋结构模型。
有报道显示，在可能SARS病人中病毒的 检出率为100%。
在疑似SARS病人中的检出率为23%。 所有健康接触者中未检测到病毒。
临床分子诊断及个体化医疗
2. 靶向剂量
华法林(Wafarin) - CYP2C9, VKORC1 6-巯基嘌呤(6-Mercaptopurine) -巯嘌呤甲基转移酶
3. 预后
乳腺癌 -乳腺癌基因表达分析 (Oncotype霉素，MammaPrint等) 心脏移植的排异反应 – AlloMap分子表达检测
4. 疾病易感性
预警(Predictive)
疾病概率史-DNA序列 定期体检和血液带白参数检测
预防(Preventive)
生活方式的改变和避免危险因素 疫苗 重点在疗养
个体化治疗(Personalized therapy)
根据个体的独特遗传变异, 选择合适药物和治疗方案 开发针对独特遗传变异人群的药物
《鹖冠子·世贤》
引言
安吉丽娜 朱莉
主演《古墓丽影》、 《功夫熊猫》、《坚强 的心》等，好莱坞“金 球奖”得主。
集性感、美丽、野性、 温柔、特立独行、骜桀 不训、坚强的女人—— 安吉丽娜.茱莉
引言
《我的医疗选择》
——安吉丽娜·朱莉致纽约时报的信
时间：2013年5月14日
内基容因：检测用于疾病预防：“朱莉效应”——在美国，
亲脂性药物
生物转化 亲水性代谢产物
肝脏
药物重吸收
排泄
药物代谢
A B C D E F G H
•0% •10% •20% •30% •40% •50% •60% •70% •80% •90% •100%
基因
环境
药物重吸收
A: 保泰松 B: 安替比林 C: 阿司匹林
D: 双香豆素
E:异戊巴比妥 F: 水杨酸钠 G: 锂盐
脏器功能
肝, 肾, 心
个体化用药的发展
基因组 基因变异 (单核苷酸多态性)
华法林(Wafarin) - CYP2C9, VKORC1 6-巯基嘌呤(6-Mercaptopurine) -巯嘌呤甲基转移酶
3. 预后
乳腺癌 -乳腺癌基因表达分析 (Oncotype霉素，MammaPrint等) 心脏移植的排异反应 – AlloMap分子表达检测
4. 疾病易感性
预警(Predictive)
疾病概率史-DNA序列 定期体检和血液带白参数检测
预防(Preventive)
生活方式的改变和避免危险因素 疫苗 重点在疗养
个体化治疗(Personalized therapy)
根据个体的独特遗传变异, 选择合适药物和治疗方案 开发针对独特遗传变异人群的药物
《鹖冠子·世贤》
引言
安吉丽娜 朱莉
主演《古墓丽影》、 《功夫熊猫》、《坚强 的心》等，好莱坞“金 球奖”得主。
集性感、美丽、野性、 温柔、特立独行、骜桀 不训、坚强的女人—— 安吉丽娜.茱莉
引言
《我的医疗选择》
——安吉丽娜·朱莉致纽约时报的信
时间：2013年5月14日
内基容因：检测用于疾病预防：“朱莉效应”——在美国，
亲脂性药物
生物转化 亲水性代谢产物
肝脏
药物重吸收
排泄
药物代谢
A B C D E F G H
•0% •10% •20% •30% •40% •50% •60% •70% •80% •90% •100%
基因
环境
药物重吸收
A: 保泰松 B: 安替比林 C: 阿司匹林
D: 双香豆素
E:异戊巴比妥 F: 水杨酸钠 G: 锂盐
脏器功能
肝, 肾, 心
个体化用药的发展
基因组 基因变异 (单核苷酸多态性)
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卡培他滨、氟尿嘧啶乳膏外用液
拉布立酶、氨苯矾、伯氨喹、氯喹 利福平、异烟肼、吡嗪酰胺
硫唑嘌呤、硫鸟嘌呤、6-巯基嘌呤 华法林
谢谢阅读
21
IL28b基因多态性与丙型肝炎治疗 及预后
基因多态性 rs12979860 rs8099917 rs12980275
2020-5-28
结果判断
邻近IL28b基因，位于IFN-r3编码基因上游3kb处，是目前 已知的与HCV感染者的持续病毒应答（SVR）相关，其中 C/C与SVR相关联，C/T和T/T与非病毒应答（NVR）相关。 SNPrs12979860T基因型也与应用PEG-IFN/RBV治疗引起 的初相病毒载量的下降显著关联，但仅与1型慢性HCV患者的 二相病毒载量下降有关。
治愈率<10%, 五年生存率23%。低于欧美 国家31%、57%,低于日本27%和43%
主要原因： 1）早期诊断低 2）缺乏规范化治疗 3）经济状况差
2020-5-28
谢谢阅读
12
较早期诊断（Ⅰ和Ⅱ）提高治愈率和五年生 存率46%， 72%
分子诊断为肿瘤早期诊断提供技术支撑！
2020-5-28
曲妥珠单抗）
Her2/neu表达 者效果较好
2020-5-28
谢谢阅读
20
基因多肽性与药物治疗
基因
药物
CYP2C19
CYP2C9 CYP2D6
DPYD G6PD NAT TPMT VKORC1
2020-5-28
伏立康唑、奥美拉唑、 泮托拉唑、艾美拉唑、雷贝拉唑、地西洋、那非那韦
塞来考替，华法林
阿托西丁、文拉法辛、利哌利酮、塞托溴胺、他莫普芬、 噻吗洛尔、氟西叮、奥氮平、西维美林、托特罗定、特 比萘酚、曲马多、啊立哌唑、美托洛尔、卡维地洛、普 罗帕酮、硫利达嗪、普罗替林，可待因
谢谢阅读
13
个体差异与个体化医疗
个体差异：基础
个体化医疗（Personalized medicine）
这个名词最早由Gibson提出，其意义是家 庭医生独立行医的意思。现代意义的个体化 医学概念于1999年由Langreth和 Waldholz在《Oncologist》杂志上首次提 出，其意义是根据病人的遗传学背景，结合 生物信息学和高端成像技术进行诊断，从而 合理选择药物进行治疗。
Herceptin (Trastuzumab) Lapatinib
Ivacaltor
Indacaterol, Irinotecan, Nilotinib Herceptin (Trstuzmab)
Herceptin (Trstuzmab)
Zeiboraf (vemurafenib)
VFIyS2sHi0s 2PAr0LoK-b5eB-rK2ei8at k Apart
临床分子诊断与个体化治疗
xx 暨南大学附属珠海/珠海市人民医院
2020-5-28
谢谢阅读
1
分子诊断
狭义分子诊断：应用分子生物学方法检测患者体内 遗传物质的结构或表达水平的变化而做出诊断的技 术，称为分子诊断，包括肿瘤分子诊断、传染病分 子诊断、产前诊断等。
广义分子诊断：指应用分子生物学方法，对受检者 体内各类生物分子（包括DNA、RNA、蛋白质等） 进行定性和定量分析，确定其结构或表达水平，从 而为个性化预防、治疗提供依据的一种诊断技术， 包括肿瘤分子诊断、传染病分子诊断、产前诊断、 单基因诊断、易感基因检测以及天赋基因检测等。
谢谢阅读
22
个性化检测的局限性
一些疾病是由一个或多个基因突变引起 基因检测方法确实能对这些疾病的患病风险、
确诊和治疗起指导作用 大多数疾病发生、发展及预后可能涉及更多
的基因以及这些基因和环境因素相互作用 仅通过基因检测盒基因表达谱的检测有很大
局限性
2020-5-28
谢谢阅读
23
CLIA：分子检测有关的主要质控要求
2020-5-28
谢谢阅读
6
目前国内临床分子诊断现状
绝大部分用于病原体核酸检测 较少部分用于遗传病的产前诊断 个体化用药的分子诊断正在兴起
2020-5-28
谢谢阅读
7
一些常见的认识误区
临床实验室=检验科 基因（遗传携带、突变等）与病原体核酸检
测完全不同 临床PCR检验在病理科、药剂科或肿瘤科做，
A comprehensive treatment could improve survial aquality another one-third of pattients with cancer
2020-5-28
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11
华南肿瘤国家重点实验室，中山大学肿瘤防治中心-钱朝南教授
中国肿瘤治疗现状
雅培公司
2011谢-0谢8阅读组织，ALK
FISH
Xalkon (crizotinb)
19
基因突变和表达与肿瘤靶向治疗
肿瘤 结直肠癌
非小细胞肺癌
治疗药物
检测位点
结果判断
西妥腊单抗 （Cetuximab） 帕尼单抗 （Paritumuma b）
古非替尼
特罗氨 （Tarceva）
12号染色体KRAS基因2号外显子的12密码子和 13密码子、3号外显子的61号密码子，其中有7 个突变热点：G12C、G12R、G12S、G12V、 G12D、G12A、G13V/D占到KRAS基因突变的 90%以上
对于每一个检测系统，实验室由此又控制程序的责任——监控整个分析过程的准确性和精 密度。(42 CFR 493.1256（A）)控制程序必须是：
罗氏公司
2004-12
血CYP4502D6
Dakocytomention Her2 FISH pharm OX kit
Dakocytomenation Denmark A/S
2005-05 组织
检测方法 基因芯片
FISH
Tag-lt Cystic Fibrosis kit Invader Molecular Assay
Number of articles per yea谢r f谢ro阅m读1999 to 2011 that included
15
the term “personalized figures on Pubmed ”
个体化医学
2020-5-28
谢谢阅读
16
GWAS分析方法
1）基因组规模微阵列基因分型平台，确定SNP和插入/缺 失和拷贝数变异区域（copy number variation,CNVS）
改进
质理管理的习惯养成需要时间。
2020-5-28
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9
几个策略比较
家族病史研究与基因研究相比较 说法不一，孰优孰劣？各有所长。 肿瘤早期诊断带来的真正收益有没有我们所
希望的那么大？
2020-5-28
谢谢阅读
10
国家自然科学基金委医学部主任、国家肝癌科学中心主任—王红阳院士，
WHO has developed three principles for cancer issues
人类染色体7p13-q22区，第19位外显子的缺失、 L858R、T790M、G719X、L861Q、S7681、 第20位外显子的插入等，以前两者居多，占所有 突变的90%
KRAS突变
野生型治疗效果 较好 突变型治疗效果 差
野生型治疗效果 较差 突变型治疗效果 好
乳腺癌
核赛叮
Her2/neu表达
（Herceptin，
焦磷酸测序法
HRM ARMS
优点
缺点
可以检测所有突变 不灵敏，操作繁琐，易污染
无特殊设备、价廉 不能定量、不能确定特殊突变
无特殊设备、简便、 快捷、灵敏
准确，可以检测质量 的样本
可以检测所有突变
不能对突变精确定位 测序长度短、易污染 复杂，操作繁琐
灵敏度高，周期短
需要特殊探针，每次只能检 测一种突变
2020-5-28
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14
个体化医学的发展趋势
280 260 240 220 200 180 160 140 120 100 80 60 40 20
1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011
2020-5-28
Current prevention strategies could block up to one-third of all new cancer
Improved early sreening could result in the detection of one-third of cancer at an early stage。
2020-5-28
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4
2010年:
《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办 法》（卫办医政发【2010】194号）
《医疗机构临床基因扩增检验室工作导则》 （卫办医政发【2010】194号）
2020-5-28
全国按照所制定的标准 通过验收的临床基因扩增检验实验室共 2670余家。采用所编写的培训教材和培训 模式共举办了培训班280多期，培训实验室 技术人员21000多人。涉及全国28个省、 直辖市和自治区。
2）比较基因组杂交芯片（comparative genomic hybridization arry,CGH array）检测染色体拷贝数 变化
3）转录水平的基因表达平台(检测mRNA表达水平) 4）大型数据集分析软件
2020-5-28
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17
常用的基因突变检测方法优缺点比较
检测方法 直接测序法 RFLP SSCP
2020-5-28
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18
拉布立酶、氨苯矾、伯氨喹、氯喹 利福平、异烟肼、吡嗪酰胺
硫唑嘌呤、硫鸟嘌呤、6-巯基嘌呤 华法林
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IL28b基因多态性与丙型肝炎治疗 及预后
基因多态性 rs12979860 rs8099917 rs12980275
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结果判断
邻近IL28b基因，位于IFN-r3编码基因上游3kb处，是目前 已知的与HCV感染者的持续病毒应答（SVR）相关，其中 C/C与SVR相关联，C/T和T/T与非病毒应答（NVR）相关。 SNPrs12979860T基因型也与应用PEG-IFN/RBV治疗引起 的初相病毒载量的下降显著关联，但仅与1型慢性HCV患者的 二相病毒载量下降有关。
治愈率<10%, 五年生存率23%。低于欧美 国家31%、57%,低于日本27%和43%
主要原因： 1）早期诊断低 2）缺乏规范化治疗 3）经济状况差
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12
较早期诊断（Ⅰ和Ⅱ）提高治愈率和五年生 存率46%， 72%
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曲妥珠单抗）
Her2/neu表达 者效果较好
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基因多肽性与药物治疗
基因
药物
CYP2C19
CYP2C9 CYP2D6
DPYD G6PD NAT TPMT VKORC1
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伏立康唑、奥美拉唑、 泮托拉唑、艾美拉唑、雷贝拉唑、地西洋、那非那韦
塞来考替，华法林
阿托西丁、文拉法辛、利哌利酮、塞托溴胺、他莫普芬、 噻吗洛尔、氟西叮、奥氮平、西维美林、托特罗定、特 比萘酚、曲马多、啊立哌唑、美托洛尔、卡维地洛、普 罗帕酮、硫利达嗪、普罗替林，可待因
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13
个体差异与个体化医疗
个体差异：基础
个体化医疗（Personalized medicine）
这个名词最早由Gibson提出，其意义是家 庭医生独立行医的意思。现代意义的个体化 医学概念于1999年由Langreth和 Waldholz在《Oncologist》杂志上首次提 出，其意义是根据病人的遗传学背景，结合 生物信息学和高端成像技术进行诊断，从而 合理选择药物进行治疗。
Herceptin (Trastuzumab) Lapatinib
Ivacaltor
Indacaterol, Irinotecan, Nilotinib Herceptin (Trstuzmab)
Herceptin (Trstuzmab)
Zeiboraf (vemurafenib)
VFIyS2sHi0s 2PAr0LoK-b5eB-rK2ei8at k Apart
临床分子诊断与个体化治疗
xx 暨南大学附属珠海/珠海市人民医院
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1
分子诊断
狭义分子诊断：应用分子生物学方法检测患者体内 遗传物质的结构或表达水平的变化而做出诊断的技 术，称为分子诊断，包括肿瘤分子诊断、传染病分 子诊断、产前诊断等。
广义分子诊断：指应用分子生物学方法，对受检者 体内各类生物分子（包括DNA、RNA、蛋白质等） 进行定性和定量分析，确定其结构或表达水平，从 而为个性化预防、治疗提供依据的一种诊断技术， 包括肿瘤分子诊断、传染病分子诊断、产前诊断、 单基因诊断、易感基因检测以及天赋基因检测等。
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22
个性化检测的局限性
一些疾病是由一个或多个基因突变引起 基因检测方法确实能对这些疾病的患病风险、
确诊和治疗起指导作用 大多数疾病发生、发展及预后可能涉及更多
的基因以及这些基因和环境因素相互作用 仅通过基因检测盒基因表达谱的检测有很大
局限性
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CLIA：分子检测有关的主要质控要求
2020-5-28
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6
目前国内临床分子诊断现状
绝大部分用于病原体核酸检测 较少部分用于遗传病的产前诊断 个体化用药的分子诊断正在兴起
2020-5-28
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7
一些常见的认识误区
临床实验室=检验科 基因（遗传携带、突变等）与病原体核酸检
测完全不同 临床PCR检验在病理科、药剂科或肿瘤科做，
A comprehensive treatment could improve survial aquality another one-third of pattients with cancer
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11
华南肿瘤国家重点实验室，中山大学肿瘤防治中心-钱朝南教授
中国肿瘤治疗现状
雅培公司
2011谢-0谢8阅读组织，ALK
FISH
Xalkon (crizotinb)
19
基因突变和表达与肿瘤靶向治疗
肿瘤 结直肠癌
非小细胞肺癌
治疗药物
检测位点
结果判断
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古非替尼
特罗氨 （Tarceva）
12号染色体KRAS基因2号外显子的12密码子和 13密码子、3号外显子的61号密码子，其中有7 个突变热点：G12C、G12R、G12S、G12V、 G12D、G12A、G13V/D占到KRAS基因突变的 90%以上
对于每一个检测系统，实验室由此又控制程序的责任——监控整个分析过程的准确性和精 密度。(42 CFR 493.1256（A）)控制程序必须是：
罗氏公司
2004-12
血CYP4502D6
Dakocytomention Her2 FISH pharm OX kit
Dakocytomenation Denmark A/S
2005-05 组织
检测方法 基因芯片
FISH
Tag-lt Cystic Fibrosis kit Invader Molecular Assay
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15
the term “personalized figures on Pubmed ”
个体化医学
2020-5-28
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16
GWAS分析方法
1）基因组规模微阵列基因分型平台，确定SNP和插入/缺 失和拷贝数变异区域（copy number variation,CNVS）
改进
质理管理的习惯养成需要时间。
2020-5-28
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9
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家族病史研究与基因研究相比较 说法不一，孰优孰劣？各有所长。 肿瘤早期诊断带来的真正收益有没有我们所
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2020-5-28
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10
国家自然科学基金委医学部主任、国家肝癌科学中心主任—王红阳院士，
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人类染色体7p13-q22区，第19位外显子的缺失、 L858R、T790M、G719X、L861Q、S7681、 第20位外显子的插入等，以前两者居多，占所有 突变的90%
KRAS突变
野生型治疗效果 较好 突变型治疗效果 差
野生型治疗效果 较差 突变型治疗效果 好
乳腺癌
核赛叮
Her2/neu表达
（Herceptin，
焦磷酸测序法
HRM ARMS
优点
缺点
可以检测所有突变 不灵敏，操作繁琐，易污染
无特殊设备、价廉 不能定量、不能确定特殊突变
无特殊设备、简便、 快捷、灵敏
准确，可以检测质量 的样本
可以检测所有突变
不能对突变精确定位 测序长度短、易污染 复杂，操作繁琐
灵敏度高，周期短
需要特殊探针，每次只能检 测一种突变
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个体化医学的发展趋势
280 260 240 220 200 180 160 140 120 100 80 60 40 20
1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011
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Current prevention strategies could block up to one-third of all new cancer
Improved early sreening could result in the detection of one-third of cancer at an early stage。
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4
2010年:
《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办 法》（卫办医政发【2010】194号）
《医疗机构临床基因扩增检验室工作导则》 （卫办医政发【2010】194号）
2020-5-28
全国按照所制定的标准 通过验收的临床基因扩增检验实验室共 2670余家。采用所编写的培训教材和培训 模式共举办了培训班280多期，培训实验室 技术人员21000多人。涉及全国28个省、 直辖市和自治区。
2）比较基因组杂交芯片（comparative genomic hybridization arry,CGH array）检测染色体拷贝数 变化
3）转录水平的基因表达平台(检测mRNA表达水平) 4）大型数据集分析软件
2020-5-28
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17
常用的基因突变检测方法优缺点比较
检测方法 直接测序法 RFLP SSCP
2020-5-28
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