真菌基因组DNA的快速提取
真菌dna提取原理
真菌dna提取原理
真菌DNA提取使用的是脱氧核糖核酸(DNA)的提取和纯化
技术,以获取真菌的基因组DNA。
提取真菌DNA的过程通
常包括以下步骤:
1. 样品准备:收集真菌样品,并将其保存在适当的条件下,以保持其DNA的完整性和质量。
2. 细胞破碎:将真菌样品置于一个离心管中,加入细胞裂解缓冲液,然后使用机械破碎法(如研磨或超声波处理)破坏真菌细胞壁,释放细胞内的DNA。
细胞破碎还可以使用酶或热处
理来增加DNA释放。
3. 核酸沉淀:加入盐溶液和酒精,通过离心将DNA沉淀到管底。
酒精的加入可以使DNA沉淀出来,而其他杂质则被剥离。
4. 洗涤:将沉淀的DNA用乙醇洗涤以去除盐离子和其他污染物,然后用80%的乙醇重悬沉淀。
5. 保存和纯化:将DNA溶解在缓冲液中,并在低温下储存,
以防止降解。
为了纯化提取的DNA,可以使用聚丙烯酰胺凝
胶电泳、硅胶膜或其他DNA纯化方法进行进一步的处理。
在提取真菌DNA的过程中,需要注意细胞壁的破碎、DNA的损伤和杂质的剥离。
通过优化实验条件和使用高质量的试剂,可以最大程度地提高DNA的产量和纯度。
真菌分子生物学鉴定方法
真菌分子生物学鉴定方法
真菌的分子生物学鉴定方法通常包括以下步骤:
DNA 提取:首先需要从真菌样本中提取DNA。
这可以通过商业DNA 提取试剂盒或自制的DNA 提取方法来实现。
PCR 反应:利用聚合酶链反应(PCR)扩增特定的真菌基因片段。
常用的标记基因包括核糖体RNA基因(rRNA)和线粒体DNA等。
对于真菌,常用的靶标基因包括18S rRNA、ITS(内转录间隔区)和28S rRNA等。
测序:对扩增得到的DNA片段进行测序,可以使用Sanger测序或者更先进的下一代测序技术。
序列分析:将测序得到的DNA序列与数据库中的真菌序列进行比对,以确定真菌的物种。
常用的数据库包括GenBank、UNITE等。
构建系统发育树:利用比对后的序列数据构建系统发育树,以了解真菌的亲缘关系和分类位置。
各种DNA提取方法
各种DNA提取方法提取方法提取方法提取方法一,基因组DNA提取方法制备基因组DNA是进行基因结构和功能研究的重要步骤,通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。
在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。
主要是CTAB方法,其他的方法还有1物理方式:玻璃珠法超声波法研磨法冻融法。
2化学方式:异硫氰酸胍法碱裂解法3生物方式:酶法。
根据核酸分离纯化方式的不同有:硅质材料、阴离子交换树脂等试验步骤:1、贴壁细胞用胰酶消化,离心收集。
2、细胞重悬于冰冷的PBS漂洗一次,离心收集。
试验步骤2再重新作一边。
3、加入5mlDNA提取缓冲液,(10mmol/%SDS)混匀。
4、加入25ul 蛋白酶K使终浓度达到100ug/ml 混匀,50℃水浴3h 5、用等体积的酚抽提一次,2500rpm离心收集水相,用等体积的(酚,氯仿,异戊醇)混合物抽提一次,2500r/min离心收集水相6、用等体积的氯仿,异戊醇抽提一次。
加入等体积的5mol/L的LiCL混匀,冰浴,10min.。
7、2500rpm离心10min.转上清于一离心管中。
加入等体积的异丙醇。
室温10min。
2500rpm离心10min。
弃上清。
8、加入倍体积3mol/L乙酸钠与2倍体积-20℃预冷无水乙醇。
-20℃20min。
9、12000r/min室温离心5min。
弃上清。
将DNA 溶于适量TE中。
二,外周血DNA提取技术分离外周血白细胞提取方法:试验步骤:1、取人肘静脉血5ml,EDTA抗凝,2500rpm 离心10min。
2、小心吸取上层血浆,分装到3个离心管中。
3、在血细胞中加入3倍体积的溶血液,摇匀,冰浴15min。
4、2500rpm离心10min,弃上清。
5、加入10ml 溶血液,摇匀,冰浴15min。
6、3000rpm离心10min,弃上清。
7、倒置离心管,去掉残液。
8、得白细胞,-80℃冻存。
Col-D0601 真菌DNA快速提取试剂盒
真菌DNA快速提取试剂盒Col-D0601试剂盒应用本试剂盒针对真菌特征开发的裂解液DF能够在10分钟内将真菌裂解,10分钟完成真菌的提取和纯化。
提取的基因组DNA完整性高,适合PCR、qPCR、酶切、克隆、Southern杂交、文库构建等。
本试剂盒仅供研究使用,不可用于临床、食品、化妆品等领域。
试剂盒组成组分Col-D0601(50T)编号裂解液DF50mL Col-D0601A洗涤液DFW125mL Col-D0601B洗涤液DFW210mL Col-D0601C 洗脱液F5mL玻璃珠 2.5g Col-D0601DDNA纯化柱50套Col-D0601E备注:第一次使用前,在洗涤液DFW2中加入48mL无水乙醇,并标记“√”,避免重复加入。
保存条件室温保存一年。
自备材料水浴锅或金属浴、无水乙醇、无DNase无RNase离心管、β-巯基乙醇、RNaseA(货号QR0101)使用方法1.真菌培养液1-3mL,12,000rpm离心1分钟,弃培养液。
或收集菌斑100mg。
2.加入1mL裂解液DF和50mg玻璃珠,涡旋震荡5分钟。
3.加入20μLβ-巯基乙醇,65℃孵育2分钟。
4.12,000rpm离心1分钟,取上清。
5.(选做)加入5μL RNase A(10mg/mL),室温静置5-10分钟。
6.加入0.5倍体积无水乙醇,充分混匀。
7.全部加到DNA纯化柱中,12,000rpm离心30秒,倒掉收集管中废液。
8.向DNA纯化柱中加入500μL洗涤液DFW1,12,000rpm离心1分钟,倒掉收集管中废液。
9.向DNA纯化柱中加入500μL洗涤液DFW2,12,000rpm离心30秒,倒掉收集管中废液。
10.重复步骤9一次。
11.12,000rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。
12.将吸附柱放入无DNase无RNase离心管中,加入30-50μL洗脱液F,室温放置1分钟。
13.12,000rpm离心2分钟,得到DNA溶液,-80℃保存。
实验七 真菌DNA的提取
实验七:真菌基因组DNA的提取(CTAB法)一、实验目的:1.初步掌握DNA的粗提取和鉴定的方法。
2.观察提取出来的DNA物质二、实验原理:CTAB法原理CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。
在高离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸。
通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。
CTAB提取缓冲液的经典配方Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA 螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;NaCl 提供一个高盐环境,使DNP(2,4-二硝基苯酚)充分溶解,在于液相中;CTAB 溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除氯仿:加速有机相与液相分层。
异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。
异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。
另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
异丙醇:沉淀DNA。
最后用两个梯度酒精冲洗DNA。
三、实验材料和仪器用具:材料:板栗疫病病原菌(Cryphonectria parasitica子囊菌亚门、核菌纲、球壳目、间座壳科、内座壳属的栗疫菌)仪器和试剂:离心机、微量移液器、水浴锅、冰箱、石英砂、CTAB、β-巯基乙醇、氯仿/异戊醇(24:1)、异丙醇、70%酒精、95%酒精四、试验方法和步骤:(1)在超净工作台上刮取2mg菌丝于滤纸,吹干,装于灭菌的离心管中;(2)加入500ul经65℃水浴充分溶解的CTAB、2ulβ-巯基乙醇充分混匀;(3)加入石英砂用研磨棒充分研磨;(4)置于65℃水浴锅中水浴一小时,每十分钟颠倒摇匀一次;(5)加入500ul氯仿/异戊醇(24:1),颠倒混匀;(6)室温下,11000rpm离心10min;(7)取上清液,加入0.5×V上清液异丙醇,颠倒混匀;(8)-20℃保存2.5h(9)将离心管从-20℃取出室温12000rpm离心10min;(11)弃去上清,加入70%乙醇750ul,12000rpm离心1min;(12)弃去上清,加入95%乙醇750ul,12000rpm离心1min弃去上清;(13)在超净工作台中吹干。
菌落pcr技术操作流程
菌落pcr技术操作流程菌落PCR技术是一种用于检测微生物菌落中的特定基因或序列的方法。
通过这种技术,可以快速、准确地鉴定微生物菌落中的细菌、真菌或其他微生物种类,为微生物学研究和临床诊断提供了重要的工具。
菌落PCR技术的操作流程如下:1. 菌落提取:首先,需要从培养基上的菌落中提取DNA。
可以使用商业提取试剂盒或自制提取试剂进行提取。
将菌落取出并加入提取试剂,经过离心、洗涤等步骤,最终得到纯净的DNA。
2. PCR反应准备:准备PCR反应体系,包括DNA模板、引物、dNTPs、酶和缓冲液等。
引物是用于扩增目标基因的特异性引物,需要根据目标基因的序列设计。
将这些成分混合均匀,放入PCR仪中。
3. PCR扩增:将PCR反应体系放入PCR仪中,进行扩增反应。
PCR反应通常包括变性、退火和延伸等步骤,通过循环反复进行,最终得到目标基因的扩增产物。
4. 凝胶电泳:将PCR扩增产物进行凝胶电泳分析,可以检测扩增效果和目标基因的大小。
将PCR产物加入琼脂糖凝胶槽中,进行电泳分离,通过紫外光照射观察凝胶中的DNA条带。
5. 测序分析:对PCR扩增产物进行测序分析,可以确定目标基因的序列。
将PCR产物送至测序机进行测序,得到目标基因的序列信息。
6. 数据分析:对测序结果进行数据分析,可以鉴定微生物菌落中的种类和数量。
通过比对数据库中的序列信息,可以确定目标基因的来源和特征。
通过菌落PCR技术,可以快速、准确地鉴定微生物菌落中的细菌、真菌或其他微生物种类,为微生物学研究和临床诊断提供了重要的工具。
这种技术操作简单、快速,可以应用于各种微生物学研究领域。
霉菌提取DNA方法
CTAB法提取真菌基因组DNA1. 取100mg菌体至预先装有300mg石英沙的1.5ml离心管中;2.在离心管中加入500ul 2X的CTAB裂解液(2% CTAB W/V,100mmol/L Tris·Cl, pH8.0, 20mmol/L EDTA, 1.4mol/L NaCl);3.用专用塑料槌充分研磨得到均一的浆状物;4. 60℃水浴 1 小时(10分钟翻转离心管一次);5. 加入2/3体积的苯酚/氯仿/异戊醇溶液(25:24:1), 颠倒混匀(需带手套, 防止损伤皮肤),室温下静置5-10分钟, 使水相和有机相分层(必要时可重新混匀)。
6. 室温下13000rpm离心30分钟;7. 仔细移取上清液至另一1.5ml离心管,重复5-7步骤3-5次,直到两个界面没有沉淀;8.小心加入2倍体积的100%的冷乙醇(-20度);9.-20度放置3个小时或者过夜;10.4度,13000rpm离心30分钟;11.小心倾去上清,将离心管压在干净吸水纸上吸干;12.沿离心管内壁缓慢加入200ul 70%的冷乙醇(4度),尽量把壁上的沉淀洗入管底;13.11000rpm,4度离心20分钟;14.倾去上清,晾干;15.加入50-100ul TE(10mmol/L Tris·Cl, pH8.0, 1mmol/L EDTA,300ug Rnase)到离心管中;16.37℃水浴30分钟, 除去RNA;17.重复5-13步骤,加入100ulTE溶解, -20贮存。
18. 取2μl DNA样品在0.7% Agarose胶上电泳, 检测DNA的分子大小。
同时取15μl稀释20倍, 测定OD260/OD280, 检测DNA含量及质量。
丝状真菌组织DNA的提取
生物技术 9 (6) :38 - 41 ,1999 Biotechnology
丝状真菌组织 DNA 的提取
韩利刚
(第二军医大学南京军医学院病原学教研室 ,南京 ,210099)
袁 毅 王 罡
(解放军农牧大学农学系 ,长春 ,130062)
用 CTAB 法直接从丝状真菌的新鲜菌丝中提取 DNA ,并将所提取 DNA 进行随
40
生 物 技 术 9 卷 5 期
图 2 引物 OPB08 - P4 的扩增图谱 (左一为分量标记λ - DNA/ EcoR Ⅰind Ⅲ) , 注 :各加样孔的加样顺序见表 1 。
模板 DNA 50ng , Taq 酶 215U 。程序如下 : 94 ℃2min ; 然后 35 个循环 , 94 ℃2min , 72 ℃ 1min ,36 ℃1min ;72 ℃延时 10min 。表面 20μl 石蜡油覆盖 。对照不加模板 DNA ,其它条件 均相同 。
11214 RAPD : 以所提丝状真菌的 DNA 为 模板 ,进行 RAPD 扩增 。 1121411 引 物 : OPB08 - P4 ( GTCCA2 CAC GG) ; OPC07 - P8 ( GTCCC GAC GG) ,均 购自上海细胞所癌基因研究室 。 1121412 RAPD 反应条件 : 反应体积 25μl : dN TP 0. 25mM , MgCl2 310mM ,引物 40ng ,
机引物多态性扩增 ( RAPD) ,得到了较清晰的扩增图谱 ,证明该法为提取真菌 DNA
以用于分子生物学研究的一种有效方法 。
关键词 :DNA 提取 ,丝状真菌 ,RAPD
目前已有多种提取丝状真菌 DNA 的方 法见诸报道 ,如 CTAB 法及氯化苄法等[1 ] 。
一种适合于PCR扩增的真菌基因组DNA提取方法
t f 2 0 A 8 n 1 i o 6 / 2 0a d1 0~10 g・ 一1D A w r ba e o vr rm cl ( e e h)f ieet o A 7  ̄ g N eeo t n df m e eyga mye a w t i to f rn i r i w g df
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真菌提取试剂盒
真菌基因组DNA快速抽提试剂盒试剂盒组成组分SK8229,50次SK8230,100次Buffer Digestion24 ml48 mlBuffer PF12 ml24 mlTE Buffer (pH 8.0)10 ml20 ml操作手册1份1份保存方法及注意事项本试剂盒于常温运输,室温(15-25°C)保存,有效期为一年,4°C保存时间更长。
Buffer Digestion中含有刺激性化合物,操作过程中应穿上实验服,戴好乳胶手套,避免沾染皮肤、眼睛和衣服,防止吸入口鼻。
沾染皮肤或眼睛后,请立即用清水或生理盐水冲洗,必要时寻求医生的帮助。
产品介绍本试剂盒是生工生物工程(上海)有限公司最新研制成功的一种真菌基因组DNA快速抽提试剂盒。
无需使用苯酚、氯仿等有毒试剂。
从100 mg新鲜大型真菌(如蘑菇)样品中可以获得10-20 µg DNA,OD260/OD280比值一般为1.7-1.9。
抽提获得的DNA可用于酶切、PCR、文库构建、Southern blot等相关实验。
标准抽提步骤自备材料:水浴锅、小型高速离心机(最大离心力 ≥12,000 × g)、1.5 ml离心管、75%乙醇、异丙醇、β-巯基乙醇等。
Buffer Digestion在低温下可能产生沉淀,使用前请检查,如有沉淀,请于65°C溶解后使用。
提前将水浴锅调至65°C备用。
1.取50-100 mg新鲜大型真菌(如蘑菇)或20 mg干燥的子实体或菌丝用液氮研磨成粉末,加入到1.5 ml离心管中。
加入400 µl Buffer Digestion和4 µl β-巯基乙醇,震荡混匀。
65°C水浴1 h至细胞完全裂解。
2.加入200 µl Buffer PF,充分颠倒混匀,-20°C冰箱放置5 min。
3.室温10,000 rpm离心5 min,将上清液(500-550 µl)转移到新的1.5 ml离心管中。
真菌dna提取步骤
真菌dna提取步骤
真菌DNA提取是一项重要的实验技术,它可以用于研究真菌的遗传学特性,如基因组结构、功能基因的表达和调控等。
下面将介绍真菌DNA提取的步骤。
步骤一:样品准备
首先需要准备真菌样品,可以是培养物或者从自然环境中采集的真菌菌丝。
如果是培养物,需要在生长期内收集菌丝,如果是野生真菌,需要在采集后尽快处理样品。
步骤二:细胞破碎
将真菌样品放入离心管中,加入适量的研磨珠和研磨缓冲液,使用高速震荡器或者研磨器将样品破碎。
破碎后离心管中的混合物应该是均匀的悬浮液。
步骤三:细胞裂解
将破碎后的真菌悬浮液转移到离心管中,加入适量的裂解缓冲液和蛋白酶K,混合均匀后在60℃水浴中孵育30分钟。
这一步可以使真菌细胞壁和细胞膜破裂,释放DNA。
步骤四:DNA纯化
将裂解后的真菌悬浮液转移到离心管中,加入等体积的酚/氯仿/异丙醇混合液,混合均匀后离心分离。
上层的DNA溶液可以通过吸管转移到新的离心管中,加
入等体积的异丙醇混合液,混合均匀后离心分离。
上层的DNA沉淀可以用70%乙醇洗涤,最后用去离子水溶解DNA。
步骤五:DNA浓度和质量检测
使用分光光度计或者凝胶电泳等方法检测提取的DNA浓度和质量。
DNA的浓度应该在50-100 ng/μL之间,质量应该高,没有明显的降解或污染。
综上所述,真菌DNA提取的步骤包括样品准备、细胞破碎、细胞裂解、DNA 纯化和DNA浓度和质量检测。
这些步骤需要严格控制条件,以确保提取的DNA 质量高、纯度高、浓度适宜,从而保证后续实验的成功进行。
(完整版)新型植物基因组DNA快速提取试剂盒使用说明书
◆新型植物基因组DNA快速提取试剂盒◆目录号DN15◆使用手册◆实验室使用,仅用于体外新型植物基因组DNA快速提取试剂盒目录号:DN15目录编号包装单位DN1501 50次DN1502 100次DN1503 200次❖适用范围:适用于快速提取植物组织、细胞、真菌基因组DNA❖试剂盒组成、储存、稳定性:试剂盒组成保存50次100次200次RNaseA(10mg/ml)-20℃250 μl500 μl 1 ml 缓冲液AP1 室温25 ml 50 ml 100 ml 缓冲液AP2 室温10 ml 20 ml 40 ml缓冲液AP3/E 室温15 ml 25 ml 50 ml 第一次使用前按说明加指定量乙醇漂洗液WB 室温15 ml 25ml 50ml 第一次使用前按说明加指定量乙醇洗脱缓冲液EB 室温15 ml 20 ml 40 ml吸附柱AC 室温50个100个200个收集管(2ml)室温50个100个200个本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。
储存事项:1.裂解液AP1、AP3/E低温时可能出现析出和沉淀,可以在65℃水浴几分钟帮助重新溶解(AP3加入乙醇前可加热,加入乙醇后不可加热),恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。
2.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
❖产品介绍:该试剂盒采用DNA吸附柱和新型独特的溶液系统,适合于从含酚类、多糖类和酶抑制物的植物样品中快速简单地提取基因组DNA。
可在30分钟内完成一个或多个100mg新鲜或20mg干燥的植物样品DNA的纯化工作。
提取过程不需要用到有毒的酚氯仿等有机物抽提,也不需要用到耗时的异丙醇或乙醇沉淀,并能快速高效地去除多糖类、酚类和酶抑制物等杂质,纯化的DNA可直接用于PCR、酶切和杂交等实验。
新鲜或干燥的植物组织(细胞)磨碎后经裂解液裂解;蛋白质、多糖、细胞残片被沉淀去除;然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 进一步将多糖,多酚和细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。
基因组DNA的分离纯化提取方法综述
基因组DNA的分离纯化提取方法综述
1.高盐法:
高盐法是最常用的基因组DNA提取方法之一、该方法利用高浓度盐水(如NaCl)沉淀DNA,同时去除蛋白质和其他污染物。
步骤包括细胞破碎、蛋白质沉淀和DNA沉淀。
此方法简便、廉价,适用于大多数细胞类型。
2.酚酚氯仿提取法:
酚酚氯仿提取法是另一个常用的基因组DNA提取方法。
该方法利用酚
酚提取细胞组织中的DNA,并通过氯仿的添加分离DNA和蛋白质。
此方法
适用于多样的生物标本,如细菌、真菌、植物等。
3.环硅酸盐法:
环硅酸盐法基于DNA与硅颗粒间的结合原理。
在此方法中,细胞裂解后,DNA与硅颗粒结合形成复合物,复合物通过离心和洗涤步骤获得纯化
的DNA。
该方法适用于基因组DNA的高通量纯化。
4.硅基附着法:
硅基附着法也是一种利用硅颗粒的DNA分离纯化方法。
此方法常利用
硅基膜滤板或硅颗粒填充的柱子,使DNA与硅基结合,然后通过洗涤和离
心步骤分离纯化DNA。
该方法适用于小样本量或少量目标DNA的纯化。
5.磁珠吸附法:
磁珠吸附法是一种快速高效的DNA提取方法。
通过特定的磁珠与DNA
的结合,可将DNA快速提取纯化。
该方法通常结合磁力分离和洗涤步骤,
使DNA与磁珠结合,然后通过磁力将DNA分离。
此方法适用于高通量或高
效率DNA提取。
酵母菌DNA提取方法
1.将种子液接入100mL液体YPD培养基中培养48h。
2.离心获取湿菌体,用蒸馏水多次洗涤,放在60℃烘箱中烘干备用。
3.选用Eeup柱式真菌基因组DNA抽提试剂盒对DNA进行提取。
(1)取50-100mg新鲜大型真菌(如蘑菇)或20mg干燥的子实体或菌丝用液氮研磨成粉末,加入1.5mL离心管中。
加入200µL Buffer Digestion 和2µLβ-巯基乙醇,再加入20µL Proteinase K液体,震荡混匀。
56℃水浴1h至细胞完全裂解。
(2)加入100µL Buffer PF,充分颠倒混匀,-20℃冰箱放置5min。
(3)室温10000rpm离心5min,将上清转移到新的1.5mL离心管中。
(4)加入200µL Buffer BD,充分颠倒混匀。
(5)加入200µL的无水乙醇,充分颠倒混匀。
(6)将吸附柱放入收集管中,用移液器将溶液和半透明纤维状悬浮物全部加入吸附柱中,静置2min,再10000rpm温室离心1min,倒掉收集管中的废液。
(7)将吸附柱放回收集管,加入500µL PW Solution,10000rpm离心30s倒掉收集管中的废液。
(8)将吸附柱放回收集管,加入500µL Wash Solution,10000rpm离心30s倒掉收集管中的废液。
(9)将吸附柱重新放回收集管中,于12000rpm室温离心2min,离去残留的Wash Solution。
(10)取出吸附柱,放入一个新的1.5mL离心管中,加入50µL TE Buffer静置3min,12000rpm室温离心2min,收集DNA溶液。
提取的DNA可立即进行下一步实验或-20℃保存。
4.对提取的DNA进行PCR扩增。
5.对提取到的DNA进行琼脂糖凝胶电泳实验,检测DNA的提取情况。
真菌dna提取注意事项
真菌dna提取注意事项以真菌DNA提取注意事项为标题的文章一、引言真菌是一类广泛存在于自然界的微生物,具有重要的生态和经济价值。
研究真菌的基因组结构和功能,对于理解其生物学特性、开发新的药物和农业生物技术具有重要意义。
而要进行真菌基因组研究,首先需要进行真菌DNA的提取。
下面将介绍一些真菌DNA提取的注意事项。
二、样品的选择和预处理1. 样品的选择:应选择新鲜、健康的真菌菌丝体或孢子作为提取DNA的样品,确保样品中DNA的完整性和纯度。
2. 样品的处理:在提取DNA之前,需要对样品进行适当的处理,如去除杂质、洗涤等,以确保提取到的DNA质量优良。
三、DNA提取试剂的选择1. 试剂的纯度:选择高纯度的试剂,以减少杂质对DNA提取的干扰。
2. 试剂的稳定性:确保所选试剂的稳定性,避免试剂在提取过程中发生降解或变质。
四、提取条件的优化1. 细胞破碎方法的选择:根据不同真菌的特性,选择合适的细胞破碎方法,如机械破碎、化学破碎或酶解等。
2. 提取缓冲液的配制:根据真菌细胞壁的特性,选择适宜的提取缓冲液,以实现高效的DNA提取。
3. 温度和时间的控制:在细胞破碎和DNA纯化过程中,控制好温度和时间的条件,以充分溶解细胞膜和去除杂质,确保提取到高质量的DNA。
五、DNA质量的评估1. 浓度的测定:使用比色法或荧光法等方法,准确测定提取到的DNA的浓度,以确保后续实验的需要。
2. 纯度的评估:通过比较DNA的吸收光谱,评估提取到的DNA 的纯度,避免样品中的蛋白质、RNA等杂质的干扰。
六、存储和保存1. 存储条件的选择:将提取到的DNA溶液保存在-20℃的冰箱中,避免DNA的降解和变性。
2. 容器的选择:选择无酶、无细菌的无菌离心管或冻存管,避免DNA的污染和降解。
3. 保存时间的控制:根据实际需要和实验进展,控制好DNA样品的保存时间,避免长时间保存导致DNA的降解和变性。
七、结论通过合理的样品选择和预处理、合适的试剂选择、优化的提取条件、准确的DNA质量评估以及合理的存储和保存,可以获得高质量的真菌DNA样品。
真菌dna提取步骤
真菌dna提取步骤真菌是一类广泛存在于自然界中的生物,它们具有多样的形态和功能,有些真菌可以用于食品加工和药物制备,而另一些真菌则会对人类和动物造成危害。
为了更好地了解真菌的生物学特性和分类,科学家们需要对真菌的DNA进行提取和分析。
本文将介绍真菌DNA提取的步骤和注意事项。
一、样品的准备在进行真菌DNA提取之前,需要准备好真菌样品。
通常情况下,真菌样品可以是培养物、菌丝体、孢子或者组织样品。
在收集样品时,需要注意避免污染和损伤,以免影响后续的实验结果。
二、细胞破碎真菌细胞壁比较坚硬,需要通过破碎来释放DNA。
破碎的方法有多种,可以使用机械破碎、化学破碎或者冻融法。
其中,机械破碎是最常用的方法,可以使用高速离心机或者超声波破碎仪来破碎真菌细胞。
三、DNA提取破碎后的真菌细胞中含有大量的DNA,但是还需要进行提取和纯化。
提取的方法有多种,可以使用有机溶剂法、离心柱法或者磁珠法。
其中,有机溶剂法是最常用的方法,可以使用酚/氯仿或者酚/异戊醇来提取DNA。
提取过程中需要注意避免DNA的降解和污染。
四、DNA纯化提取出来的DNA中可能会含有其他杂质,需要进行纯化。
纯化的方法有多种,可以使用酚/氯仿提取、离心柱纯化或者磁珠纯化。
其中,离心柱纯化是最常用的方法,可以使用硅胶柱或者离子交换柱来纯化DNA。
纯化过程中需要注意避免DNA的降解和污染。
五、DNA浓度和质量检测提取和纯化出来的DNA需要进行浓度和质量检测。
浓度检测可以使用分光光度计或者荧光素检测仪来进行。
质量检测可以使用凝胶电泳或者生物分析仪来进行。
检测结果可以帮助科学家们了解DNA 的纯度和完整性,以便后续的实验操作。
六、DNA保存提取和纯化出来的DNA需要进行保存,以便后续的实验操作。
保存的方法有多种,可以使用冰箱、冷冻干燥机或者液氮保存。
其中,液氮保存是最常用的方法,可以将DNA样品冷冻在液氮中,以便长期保存。
总结:真菌DNA提取是一项重要的实验操作,可以帮助科学家们了解真菌的生物学特性和分类。
真菌DNA提取的六种方法
真菌DNA提取方法方法一:取出约0.1 g 菌丝体,加入1 mL 裂解缓冲液( Tris-HCl 100 mmol/L (p H 9.0) ; EDTA 100 mmol/ L ;NaCl 400 mmol/L ;2 %SDS) ,加入少许石英砂,在研钵中将菌丝进行充分研磨。
将菌体移入1.5 mL 的离心管中,于65℃水浴保温30 min ,每10 min 取出充分混匀1 次。
加入等体积的苯酚∶氯仿∶异戊醇(体积比为24 ∶24 ∶1) ,轻轻混匀5min ,12 000 r/ min 离心10 min 。
吸取上清液,加入等体积氯仿,轻摇5 min ,12 000r/ min 离心10 min 。
收集上清液,加入0.75 倍体积的异丙醇沉淀DNA ,用70 %乙醇冲洗2~3 次后自然风干,加入500μL 1 ×TE 缓冲液溶解DNA 。
加入2 μL RNase( 10 mg/ mL ) , 37 ℃水浴保温30min 。
加入等体积苯酚∶氯仿(体积比为1 ∶1) ,轻摇5 min ,12 000 r/ min 离心10 min 。
取上清液加入等体积氯仿,轻摇5 min ,12 000 r/ min 离心10 min 。
吸取上清液,用2 倍体积的无水乙醇沉淀DNA , -20 ℃短暂放置后,12 000 r/ min 离心。
用70 %的乙醇洗涤沉淀DNA 2 次,自然风干后溶于适量0.1 ×TE缓冲液中,贮存于- 20 ℃备用。
方法二1.实验试剂(1)DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS(2)3M NaAc(3)TE:10 mmol/L Tris-HCl pH8.0,1 mmol/L EDTA(4)酚(pH8.0):氯仿:异戊醇(25:24:1)(5)氯仿:异戊醇(24:1)(6)异丙醇(7)无水乙醇(8)75%乙醇(9)RNaseA2.实验步骤(1)取真菌菌丝0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉(2)加入4mL提取液,快速振荡混匀(3)加入等体积的4mL的氯仿:异戊醇(24:1),涡旋3~5min(此处是粗提没有加酚,可以节约成本)(4)1000rpm,4℃,5min(5)上清用氯仿:异戊醇(24:1)再抽提一次(10,000rpm,4℃离心5min)(6)取上清,加入2/3倍体积的-20℃预冷异丙醇或2.5倍体积的无水乙醇沉淀, 混匀, 静置约30 min (7)用毛细玻棒挑出絮状沉淀,用75%乙醇反复漂洗数次,再用无水乙醇漂洗1次,吹干,重悬于500ul TE中(8)加入1ul RNaseA (10mg/mL),37℃处理1h(9)用酚(pH8.0):氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提1次(10,000rpm,4℃离心5min)(10)取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V体积的无水乙醇,-70℃沉淀30min以上。
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丝状真菌基因组DNA的快速提取
1)取少许石英砂于1.5mL离心管中,用移液枪吸入600μL DNA 提取缓冲液(1M Tris-Cl(pH 8.0) 50mL;0.5M EDTA(pH 8.0) 100mL;20%SDS 100mL;5M NaCl 100mL;650mL无菌水定容至1L);
2)挑取少量酵母培养基上生长的气生菌丝于上述离心管中;
4)加入提前配好的等体积的Tris饱和酚-氯仿溶液(V/V为1:1,约
600ul),涡旋6min,室温静置5min;
5)室温下,13000rpm离心20min;
6)用移液枪小心吸取约350μL的上清液,转移至一新的离心管中,加入2.5倍体积的冰冻无水乙醇(约1ul),上下颠倒混合均匀后,于-20℃中放置
2h;
7)室温下,12000rpm离心10min;
8)弃上清液,用75%乙醇洗沉淀1次;用手弹起沉淀
9)倒去上清,倒扣放置,放于超净台吹10min,使乙醇挥发晾干,加入
80μL无菌水溶解沉淀。