分子生物学重点汇总

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分子生物学重点汇总

Central dogma(中心法则):遗传信息从DNA向RNA再向蛋白质传递的规律。

Genome(基因组):是指来自一个生物体的一整套遗传信息,也就是一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套基因。

transcriptome(转录组):一个细胞、组织或有机体在特定条件下的一组完整基因。

proteome (蛋白质组):在大规模水平上研究蛋白质特征,获得蛋白质水平上的关于疾病的发生、细胞代谢等过程的整体而全面的认识。Metabolome(代谢组):对生物体内所有代谢物进行定量分析并寻找代谢物与生病理变化的相关关系的研究方法。

Gene(基因):是位于染色体上的遗传基本单位,负载特定遗传信息的DNA片段,可以编码单个具有生物功能的产物,包括RNA和多肽链。Epigenetics(表观遗传学现象):DNA结构上完全相同的基因,由于处于不同染色体状态下具有不同的表达方式,进而表现出不同的表型。

Cistron(顺反子):即结构基因,编码一个多肽的遗传单位。

Muton(突变子):顺反子中有若干个突变单位,最小的突变单位被称为突变子。

recon(交换子):意同突变子。

Z DNA(Z型DNA):DNA的一种二级结构,由两条核苷酸链反相平行左手螺旋形成。

Denaturation(变性):生物大分子的天然构象遭到破坏导致其生物活性丧失的现象

Renaturation(复性):在一定的条件下,变性的生物大分子恢复成具有生物活性的天然构象的现象。

negative superhelix(负超螺旋):双链DNA在空间以双螺旋链旋转方向相反的方向形成的扭曲。

C value paradox (C值矛盾):生物体的大C值与小c值不相等且相差非常大。

overlapping gene(重叠基因):不同的基因公用一段相同的DNA序列。

repetitive gene(重复基因):染色体上存在的多数拷贝基因。

interrupted gene(断裂基因):真核生物的结构基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌,去除非编码区再连接后,可翻译出连续氨基酸组成的完整蛋白质。这些基因称为断裂基因。

splitting gene(间隔基因):意思与断裂基因相同。

Intron(内含子):真核生物中隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。

Exon(外显子):真核生物中在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟RNA的核酸序列。

jumping gene(跳跃基因):可从一个染色体位点转移到另一位点的分散重复序列,也就是能发生转座的DNA。

Transposon(转座子):与跳跃基因意思相同。

Transcription(转录):转录是生物体以DNA为模板合成RNA的过程

sense strand(有意链):基因的双链结构中,用来转录的链叫反义链,不用来转录的叫有意链

coding strand(编码链):双链DNA中,不能进行转录的那一条DNA链,该链的核苷酸序列与转录生成的RNA的序列一致(在RNA中是以U取代了DNA 中的T),又称有义链(sense strand)。

antisense strand(反义链):基因的DNA双链中,转录时作为mRNA合成模板的那条单链叫做模板链或反义链(template or antisense strand)。Promoter(启动子):是RNA聚合酶结合的、在转录起始点上游的DNA序列。如不受阻遏,RNA聚合酶与之结合后即可启动转录。

-35 sequence (-35区):细菌基因起始位点上游35bp处的保守序列,在RNA聚合酶起始识别中起作用。

Terminator(终止子)转录结束后所代表的DNA 序列,能够引起RNA 聚合酶终止转录。

transcriptional unit(转录单位):RNA的合成是由RNA聚合酶(RNA polymerase)催化的。当RNA聚合酶结合到基因起始处时,即为启动子(promoter)的特殊序列上时,转录开始进行。

RNA polymerase(RNA聚合酶):以一条DNA链或RNA为模板催化由核苷-5ˊ-三磷酸合成RNA的酶。

S.D. Sequence(S.D序列):mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列。(真核生物是kozak序列)

hnRNA(heterogenuous nuclear RNA)(核内不均一RNA):在真核细胞核内可以分离到一类含量很高,分子量很大但不稳定的RNA,称为核内不均一RNA Enhancer(增强子):是能够结合特异基因调节蛋白,促进临近或远处特定基因表达的DNA序列。增强子距转录起始点的距离变化很大,但总是作用于最近的启动子。

Silencer(沉默子):真核顺式作用元件中的负性调节元件,当其结合特异蛋白因子时,对转录起阻遏作用。

Insulater(绝缘子):真核生物基因组的调控元件之一,亦为一种边界元件。

Rho-independent terminator(不依赖于p因子的终止子):DNA上能够引起大肠杆菌聚合酶在没有p因子的情况下终止转录的序列。

Rho-dependent terminator(依赖于p因子的终止子):

Zinc finger(锌指):一种常出现在DNA结合蛋白质中的一种结构基元。是由一个含有大约30个氨基酸残基的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys 和2个His配位的Zn2+构成,形成的结构象个手指状。

lucine zipper(亮氨酸拉链):出现在DNA结合蛋白质和其它蛋白质中的一种结构基元(motif)。当来自同一个或不同多肽链的两个两性的α-螺旋的疏水面(常常含有亮氨酸残基)相互作用形成一个圈对圈的二聚体结构时就形成了亮氨酸拉链。

RNA processing; (RNA加工)将一个RNA原初转录产物转换成成熟RNA分子的反应过程。加工包括从原初转录产物中删除一些核苷酸,添加一些基因没有编码的核苷酸,和对某些碱基进行共价修饰。

RNA splicing;(RNA剪接)从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去内含子,并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。spliceosome;(剪接体)由大的蛋白质-RNA复合体催化内含子从mRNA前体中除去的反应的整体。

cis-splicing;(顺式剪接)RNA剪接发生在同一条RNA分子上。

trans-splicing(反式剪接)RNA旳剪接发生在两条不同来源的前体RNA底物,在剪接体中完成(在成熟的RNA引导序列中拼接成一外来的小外显子,发生在两条前体RNA间的选择性剪接)

constitutive splicing;(组成型剪接)从5’向3‘端对内含子进行逐一的剪接称为组成型剪接。

alternative splicing(选择性剪接)对内含子以及外显子进行选择性的剪接。

RNA editing(RNA编辑)将该基因与其转录物比较,发现转录物在移码突变附近有4个额外的尿苷酸,这4个尿甘酸是在转录中或转录后由酶催化加进去的,并将这改变RNA编码序列的加工方式称为RNA编辑。

Translation:翻译,蛋白质生物合成,是生物细胞以mRNA为模板,按照mRNA分子中核苷酸的排列顺序所组成的密码信息合成蛋白质的过程。Messenger RNA:mRNA用作蛋白质合成模板的RNA(负载同一氨基酸,但是别不同密码子的tRNA)

GGC(general genetic codon):广义密码,密码子中第二位核苷酸决定氨基酸性质的特点。也叫密码中的密码(codon in codon)

Paracodon(副密码子):

I soacceptingtRNA:同工受体tRNA:能解读同工密码子的不同tRNA。

AARS:氨酰tRNA合成酶:催化特定的氨基酸准确负载于与其对应的tRNA上的专化性酶类。

cis action element(顺式作用元件):在转录起始点上游参与转录调控的DNA序列,由启动子、增强子和沉默子构成。

trans action factor(反式作用因子):能特异识别并结合顺势作用元件,激活另一基因转录的真核转录调节蛋白。

operon;(操纵子):转录是不连续进行的。每一转录区段可视为一个转录单位,称为操纵子。操纵子包括若干个结构基因及其上游的调控序列。

RBS (Ribosome binding site)(核糖体识别结合位点):

inducer;(诱导物):通过与调控蛋白结合激活基因转录的小分子。

regulon;(调节子):在操纵子调控中,有时一个调控基因可调控多个操纵子的表达,将受控于同一个调节蛋白的多个操纵子,称为调节子。

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