Pubmed中常用检索字段及简写列表
Pubmed检索
7
MEDLINE
是美国国立医学图书馆MEDLARS 系统中最大的生物医学数据库，收 录1966年以来70多个国家4000种左 右生物医学期刊的书目信息和著者 文摘，每周更新。每条记录均带有
[PubMed--Indexed for MEDLINE] 标志。
8
PreMedline
收集未正式给予 MeSH 词、出版类型等 深度标引信息的一个临时库。NLM每天 把最新记录加入到 PreMedline 库中，每 条记录均带有[PubMed--in Process]标志。 工作人员在一周内将这些记录标引，然 后转入 MEDLINE ，同时从 PreMedline 中删去。
2
数据库检索 A P44
3
一、PubMed数据库简介
PubMed 是美国国家医学图书馆(NLM) 下属的 国家生物技术信息中心 (NCBI) 开发的、基于 WWW的医学数据库查询系统。 网址： http://www. /pubmed
h1n1[All Fields] AND ("influenza, human"[MeSH Terms] OR ("influenza"[All Fields] AND "human"[All Fields]) OR "human influenza"[All Fields] OR "influenza"[All Fields])
18
Байду номын сангаас
PubMed主页:
h1n1 influenza
19
结果显示
结果处理
结果筛选
检索表达式
20
21
22
PubMed基本检索
如何使用pubmed进行 文献检索
一、PubMed简介
• 很多医务工作者宁可在每次检索时 都花上成倍的时间，却不愿花上几个小 时去认真研究一下PubMed。"君欲善其事， 必先利其器"，PubMed就好像一把功能强 大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动 扳机就可以发射子弹，更重要的是，你 要知道如何利用准星瞄准，如何把这把 枪的功能发挥到及至。
• 回溯年代：1948年至今 • 每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记
MEDLINE数据库简介
学科范围：
• 基础生命科学 临床生命科学
• 生物科学
解剖学
• 组织学
化学与药物
• 心理学
社会医学
• 农业
医技设备学
• 医技工业学
医学信息学
使用词表：MeSH（医学主题词表）
4.2 PreMEDLINE
1998/03[dp]; 1998[dp]; 1996:1998[dp]; 1998/01:1998/04 [dp]
• Publication Type[PT]：出版类型 review[pt]
• Title[TI] ：文章题名 • Text Words[TW]：文本词
包括Title, Abstract, MeSH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段
检索规则
1、自动转换匹配
PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。 对于输入检索框的检索词，PubMed按4个转换表 进行对照、匹配和转换，然后进行检索。 ① MeSH表：包括MeSH的主题词、副主题词、款目 词。 ②期刊刊名表： 所收录的刊名全称、缩写和ISSN ③短语表：文献篇名或文摘中出现的短语。 ④著者索引表： PubMed所收录的的作者姓名组成。
pubmed检索技巧
1 检索词的类型
（3 ）刊名检索：在检索框中键入刊名简称或 MEDLINE 形式的
简写、ISSN号。例如，“Molecular biology reports”,或“Mol Biol Rep”,然后点击检索，系统将在刊名字段检索，并显示检索 结果。 （4）日期或日期范围检索：可以在检索框中键入日期和日期范围， 然后点击检索，系统会按日期检索，日期输入格式为 YYYY/MM/DD,也可以只输入年代或月份，如2000或2005/12 （ 5 ） 检 索 带 文 摘 的 记 录 ： 检 索 的 格 式 为 “ 检 索 词 and has Abstrat ”。注意 MEDLINE 数据库 1975 年出版的文章没有摘要。 （6）布尔逻辑检索：Pubmed系统允许使用布尔逻辑检索，其使 用方法和MEDLINE
二 PUBMED检索方法
（一）PubMed简单检索 1 检索词的类型 （1）词语（主题）检索：在PubMed主页的检索框中 键入英文单词或短语，然后点击检索，PubMed即用其 自动转换功能进行检索。 （2）著者检索：在检索框中键入著者姓氏全部和名字 的首字母缩写，格式为“著者姓、名字（首字母缩 写）”，如“Smith JA”,然后点击搜索，系统会自动 到著者字段去检索，并显示检索结果。
PUBLISHER SUPPLIED CITATIONS
Publisher Supplied Citations 是 出 版 商 直 接 向 Pubmed 递 送 的 电 子 记录。每条记录都标有 “Pubmed as supplied by publisher”,该记录一旦被 PreMEDLINE收录，则改为“Pubmed in process”, 经标引后改为“Pubmed indexed for Medline”。出 版商提供的所有文献记录， MEDLINE并非每篇记录 都收录，若不属于收录范围，记录一直保留“Pubmed as supplied by publisher”
Pubmed基本的检索知识
Pubmed基本的检索知识Pubmed是医学专业常用的数据库，对于医学科研工作至关重要，但是对于Pubmed最基本的检索知识你都了解吗？下面介绍了Pubmed三种检索方式，检验一下你都get到了吗？Pubmed主界面1基本检索引文状态标记值分为：[PubMed-indexed for MEDLINE]、[PubMed-in process]、[PubMed-OLDMEDLINE]、[PubMed – as supplied by publisher]四种状态。
[PubMed-indexed for MEDLINE]：被MEDLINE所收录并被标引MeSH主题词，具有完整的书目题录信息，检索此类文章方法:在检索框输入medline [sb]。
[PubMed-in process]：每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据，该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、每星期当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时转入MedLine一次，而被处理前的数据从该数据库中删除。
检索此类文章方法:在检索框输入inprocess [sb]。
[PubMed-OLDMEDLINE]：含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。
OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要。
检索此类文章方法:在检索框输入oldmedline [sb] [PubMed –as supplied by publisher]：是由出版商提供的电子文献MEDLINE收录范围的文献，每日被添加到In Process Citation中去，换上[PubMed – in process]的标记，并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI；不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID 而没有MEDLINE UI。
布尔逻辑运算符（检索时需大写）AND可用来表示其所连接的两个检索项的交叉部分，也即交集部分。
PubMed检索规则与语法
PubMed检索规则与语法①布尔运算符AND，OR，NOT必须大写，例如，vitaminc OR zinc；②PubMed从左至右进行布尔运算。
不过，你可以通过加圆括符改变运算顺序，如commoncoldAND(vitamincORzinc)。
③指定文献记录字段名称检索，如dna［mh］ANDcrick［au］and1993［dp］。
下面列出常用字段名称缩写：DP——出版日期采用YYYY/MM/DD［DP］格式，如1998/03/06［DP］。
输入日期范围则用冒号连接，如1996：1998［DP］，1998/01：1998/04［dp］AD——第一作者机构名称、地址、资助号如LM05545/LM/NLM［ad］AU——作者姓名如o’brienj［au］TA——期刊名称包括期刊名全称、简称、ISSN。
jbiolchem［ta］或0021-9258［ta］LA——文献出版语言Chinese［la］MH-Mesh主题词neoplasms［mh］或neoplasms/dt［mh］PT——出版类型review［pt］TW——自由词AA001794［tw］T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma［ti］PubMed 检索PubMed系统检索范围：MEDLINE数据库和PreMEDLINE数据库。
1.词语（主题）检索在PubMed主页的提问框中键入英文单词或短语（大写或小写均可后回车或点击“Go”，PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。
例如：键入“vitamin c common cold”后回车或点击“Go”，PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
如果检索结果不符合要求，可以在提问框中增加或删除词语，或者在Details状态下（参见Details键的用法）来修改检索式，也可使用“Limits”（参见Limits的用法）选择限定条件后再进行检索。
此外，用户可根据需要使用通配符“*”或双引号进行截词检索或强制检索。
第三章 PUBMED检索
OldMedline：含1950～1965年期间发表的生物医学文献，
记录中没有MeSH字段和摘要字段，记录标识[PubMedOLDMEDLINE for Pre1966]。
YOUR SITE HERE
1．PubMed的数据来源
LOGO PreMedline（In-process citations）：未经主题词标引，
PubMed数据库文献记录数已经超过了1900万条。其中部分 文献提供免费的全文链接服务。
YOUR SITE HERE
二、PubMed概况
LOGO
特点：
主题加工规范 检索方式灵活多样
免费提供题录和文摘
提供与原文的网址链接(部分免费获取） 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷
YOUR SITE HERE
第三节 PubMed的使用
LOGO
一、检索机制和规则
1．单词、词组检索 2．短语检索
3．截词检索
4．布尔逻辑运算 5．MeSH检索（主题词检索） 6．限定检索 7．序号检索
YOUR SITE HERE
1．单词、词组检索
直接输入检索词，不 加任何限定
没有录入Medline中的数据，每天更新。标识为[PubMed- in
process]。 Publisher-Supplied Citation：出版商直接提供的电子文
献，标识为[PubMed-as supplied by publisher]。
此外，PubMed还提供NCBI开发的其他综合性分子生物学数据 库链接服务，包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据、人类 孟德尔遗传在线等。
内容涉及基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医
PubMed检索
大分子模式（MMDB）等其他生物信息数据库检 索。 • PubMed等文献数据。
二、PubMed数据范围
PubMed收录的文献包括4个数据库： (1).Medline (2).In Process Citations (3).Publisher-Supplied Citations (4).OldMedline
通Байду номын сангаас如下方式强制将其作为一个词组进行检索：
1.加双引号：“single cell” 2.加标段标识[tw]: single cell[tw] 3.使用短横线“-”将两词连接起来：single-cell 4.使用截词符*：single cell*
基本检索
例1:检索2010年至2015年有关肾衰(renal failure)诊断 (diagnosis)方面的文献。要求：英文、综述
主题词检索
它以主题词为检索标识，是一种特性检索。 主题词（subject,subject headings),又称叙词（discriptor),
指经过规范化处理的检索词或词组。
如：艾滋病 主题词：获得性免疫缺陷综合征
• 主题词来源于美国国家医学图书馆编制的《医学主题词表》 又称MeSH表。
美国国家医学图书馆（National Library of Medicine,NLM） 研制的用于标引、编目和检索生物医学文献的英文受控词表 。它是对生物医学文献进行主题标引以及检索生物医学文献 数据库的指导性工具，对提高查全率及查准率具有十分重要 的意义。
PubMed
天津医科大学图书馆 孟艳丽
2015.9.21.
一.PubMed数据库简介 二.PubMed数据范围 三.PubMed特点 四.检索途径与使用方法 基本检索、高级检索、主题词检索 期刊检索、题录检索、定题检索 基本检索规则
PubMed 基本检索
一
PubMed 概 况
二
PubMed简单检索区
PubMed辅助检索区 PubMed结果处理区
三
四
PubMed 概 况
Best-known
Biomed Official database
特点：
书目数据 免费使用 时效性强 智能检索 界面友好
收录范围：
1950年～ 70国家地区 37种语言 5千种期刊 40万篇／年
三、辅助检索(1)： Limits
功能：
将搜索范围设定在一个特定的域 将搜索限定在某一语种出版的某一特定的文献类型 设定只搜索包含标题／摘要的文献
设定搜索范围为PubMed的一个子数据库
将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类等
辅助检索区：预检（ Preview/Index ）
预 检 索
Preview/Index
All: 733
child*aids nursing
Review
Title/Abstract
All: 22
last 5years 8
三、辅助检索区(1)： Limits
常用的域：
1 2 3 4 Search by Author （著者检索） Search by Journal （期刊检索） Links to free full text （免费全文链接） Published in the Last: （时间限定） Added to PubMed in the Last: 5 Subsets ( journal groups) （子库） 6 Type of Article （文献类型） 7 Default Tag （字段限定）
四、PubMed结果处理
PUBMED检索
▪主题词(Mesh Heading)，又称叙词Descriptor,从信息内容中抽取出来的、能表达信息实质内容的规范化专业名词或术语▪款目词，又称入口词，entry word,主题词的同义词或近义词▪副主题词（Subheading）, 又称为限定词（Qualifiers）, 对主题词进一步限定的规范化用词▪缩小检索范围，获取最专指的文献▪举例：茶碱治疗哮喘▪哮喘asthma（指"asthma"[MeSH Terms] OR asthma[Text Word]）99696 asthma[mesh]（指"asthma"[MeSH Terms] ）81824▪哮喘的药物治疗asthma/drug therapy19695▪茶碱（theophylline)治疗哮喘(2352)theophylline/TU7366Medline：是PubMed的主体部分。
[PubMed--Indexed for MEDLINE]。
OldMedline：含1950-1965年期间发表的200万篇生物医学文献。
OldMedline的记录中没有MeSH字段和摘要字段，记录的标记是[PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966]。
PreMedline：是Medline的前期数据库，收录的是那些正在等待标引的文献，其作用在于缩短文献报道时差。
[PubMed--in Process] Publisher-Supplied Citations：出版商提供的电子期刊中有一些属于选择性收录期刊。
[PubMed - as supplied by publisher]PubMed主页上提供与NCBI的7个数据库建立了超链接Nucleotide：DNA序列数据库Protein：氨基酸（蛋白质）序列数据库Genome：基因组序列数据库Structure：分子结构模型数据库Popset：种群、种系发生或突变序列数据库Taxonomy：生物分类数据库OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库Books：相关图书注：在检索提问框内输入的检索词若不用字段限定，系统依次到下列3个表中进行词语的核对、转换和检索：①MeSH转换表(MeSH Translation Table)、②刊名转换表(Journals Translation Table)、③著者索引(Author Index)。
PubMed检索系统
二、 PubMed主页简介
PubMed主页
二、 PubMed主页简介
主页分检索区、主要功能区及辅助功能区三部分。
检索区：基本检索、高级检索和帮助。
主要功能区：使用介绍、 PubMed工具及更多资源。
二、 PubMed主页简介
辅助功能区：指南、其他数据库、常用数据库、特色 数据库及相关信息
三、 PubMed主要特点
字段标识符及释义?adaffiliation第一著者单位地址?allallfields所有字段?auauthor著者?dppublicationdate文献出版日期?edatentrezdate文献被pubmed收录日期?lalanguage语种?majrmeshmajortopic主要mesh主题词?mhmeshtermsmesh主题词?ptpublicationtype文献类型?rnecrnnumber酶代码化学物质登记号?sbsubsetpubmed数据库子集?shmeshsubheadingmesh副主题词?tajournaltitle期刊全称缩写或issn号字段标识符及释义?tajournaltitle期刊全称缩写或issn号?tititle文献的题名?twtextword文本词?vivolume期刊的卷号录入格式
㈠ 基本检索（Basic Search）
㈠ 基本检索（Basic Search）
㈠ 基本检索（Basic Search）
㈠ 基本检索（Basic Search） 2. 著者检索 姓（全称)+名 (缩写）+[AU] 例： Smith J [AU] Smith JG, Smith JR 姓（全称） 例：Smith 若限定某一作者, “作者”+[AU] 例：“Smith J” [AU]
PUBMED部分介绍
主题检索：在PubMed主页的检索框中键入英文单词或短语（大写或小写均可），PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。
例如：键入“vitamin c common cold”后回车或点击“Go”，PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
著者检索：当所要查询的是著作者时，在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写，格式为“著者姓空格名字首字母缩写”，例如smith ja，系统会自动到著者字段去检索，并显示检索结果。
刊名检索在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号，例如：molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524，系统将在刊名字段检索，并显示检索结果。
日期或日期范围检索可以在检索框中键入日期或日期范围，系统会按日期段检索，并将符合条件的记录予以显示。
日期的录入格式为YYYY/MM/DD；如：1999/09/08。
也可以不录月份和日子，如：2000或1999/12。
检索期刊子集（辑）检索的格式为：检索词AND jsubseta（或jsubsetd，或jsubsetn），如：neoplasm AND jsubseta。
可供检索的期刊子库有3种：Abridged Index Medicus（有120种重要核心期刊）、Dental和Nursing。
分别使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn进行限定。
检索带文摘的记录检索的格式为：检索词AND has abstract, 如：liver cancer AND has abstract。
要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLINE记录中没有文摘。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务，MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
关于pubmed的字段的描述
关于pubmed的字段的描述Pubmed是一个由美国国立卫生研究院（NIH）开发并维护的大型生命科学文献数据库。
该数据库覆盖了生物医学领域的各个方面，包括医学、生物学、健康科学等多个子领域。
在Pubmed中，用户可以使用各种搜索条件来检索相关领域的文献，这些搜索条件和字段可以帮助用户更快地找到所需的信息。
本文将逐步回答关于Pubmed字段的描述，帮助读者更好地理解和使用这一重要的科研工具。
第一步：理解PubmedPubmed是一个免费的在线数据库，由美国国立卫生研究院的国家医学图书馆（NLM）开发并维护。
其目的是为医学和生命科学领域的研究人员提供全面的文献资源，以促进科学研究和信息交流。
Pubmed的数据库中包含了数百万条来自全球各地的期刊文章、学术论文和会议摘要等。
第二步：探索Pubmed字段Pubmed提供了各种字段和搜索条件，以帮助用户精确地检索所需的文献。
以下是Pubmed中一些常用的字段和它们的描述：1. 标题（Title）：文章的标题，通常反映了研究的主题和目的。
在搜索时，用户可以将关键词放在标题字段中，以获得与该关键词相关的文献。
2. 摘要（Abstract）：文章的摘要部分，通常是一段简短的文字，总结了研究的背景、目的、方法、结果和结论。
在搜索时，用户可以将关键词放在摘要字段中，以获得包含该关键词的文献。
3. 作者（Author）：文章的作者，通常是研究的负责人或合著者。
在搜索时，用户可以将作者的姓名放在作者字段中，以获得该作者相关的文献。
4. 期刊（Journal）：文章发表的期刊，通常反映了研究的学术水平和可信度。
在搜索时，用户可以将期刊的名称放在期刊字段中，以获得该期刊上发表的文献。
5. 关键词（Keyword）：文章的关键词，通常是作者为了帮助他人更好地理解和搜索他们的研究而提供的一些术语或短语。
在搜索时，用户可以将关键词放在关键词字段中，以获得包含该关键词的文献。
6. 出版日期（Publication Date）：文章的发表日期，通常是一个重要的参考指标，以确定文献的新旧程度。
pubmed检索方法
11
工具与资源
• Single Citation Matcher-单篇引文 • MeSH Database -主题词库
匹配器
• Journal Database-期刊库
• Batch Citation Matcher-多篇引文 • Clinical trails-对公众提供临床科研
匹配器
的当前信息
18 18
（一）基本检索
检索规则：
著者检索(authors)： - 姓全称在前，名首字母在后 - 以AU作为限定字段 如：Cooper SL[au] wen ym[au]
- 2002年以后的文章可以查著者全名，字段名为FAU 如：Cooper sheldon lee [FAU]
整理课件
19
（一）基本检索
检索规则：
期刊检索（journals）： - 刊名全称检索 例：New England Journal of Medicine[TA]
- MEDLINE认可的标准刊名缩写检索 例：N Engl J Med[so]
- 国际标准期刊号检索 例：0028-4793[ta]
整理课件
20
例1：检索Joseph Leventhal研究干细胞移植的文献
17 17
整理课件
作为主题词的个人姓名
出版状态 文献类型 出版模式（纸张或电子） 参考文献数 已撤回的文献
酶或化学物质代码 正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的 分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码
标准期刊缩写
文献标题 翻译标题 更新文献 文献正在更新 期刊卷号
整理课件
7
（三）PubMed与MEDLINE
文献检索pubmed讲解资料
PubMed基本检索
bacter*[TI]
截词检索可以 扩大检索范围 提高查全率。
PubMed基本检索
字段限制检索
采用字段限制方式进行检索，其规则是： 检索词1[字段标识] 逻辑运算符 检索词2[字段标识] 如：查找作者为crick在1993年发表的有关DNA方面的文献. 检索式： crick[au] AND 1993[dp] AND DNA
/pubmed
检索词输入框
Welcome to PubMed
使用帮助
常用工具
更多服务
认识PubMed文献
Summary 篇名TI 作者AU
出处SO
文献类型(状态)
认识PubMed文献
调整显示设置 可改变显示模 式，显示数量 及检索结果排 序
显示设置 排序模式 显示摘要 显示数量
PubMed基本检索
smith j
作者姓名检索 按照姓(全写) +名(缩写)， 之间不用标点 键入作者姓名
PubMed基本检索
"smith j"[au]
精确检索避免 PubMed自动 词汇转换，实 现精确查找
PubMed基本检索 期刊检索
在检索框中键入期刊名，如：European journal of immunology，系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成"Eur J Immunol"[Journal] OR "european journal of immunology"[All Fields]进行检索。 也可以直接输入Medline的期刊标准缩写形式，如： Eur J Immunol ，或者是输入刊物的ISSN（国际标准出版物代码）进 行检索，如：0014-2980。 如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：cancer， science，cell等，PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表中 的主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标准化处理，即在 杂志名后面加[TA]。如："cell"[ta]