相互作用蛋白质组学
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1.研究相互作用蛋白质组学的意义?
答:①蛋白质很少单独发挥作用。在所有生物功能中,通常以蛋白质复合物的功能占主导地位。在所有的细胞中,蛋白质是最重要的组成部分,并且在大多数细胞功能中蛋白质之间的相互作用是最基本的。如基因转录、细胞周期控制、信号转导和调控等一些基本的过程都依赖于有着正常功能的蛋白质复合物。②对干扰蛋白质的合成或者扰乱蛋白复合物的组装经常会导致细胞功能失调,并且最终引发疾病。因此,在疾病的病理生理学研究方面对蛋白质之间相互作用的透彻研究已变得非常重要,由此也可以找到新的药物作用靶细胞。
由上述两点可知在全球范围内进行相互作用蛋白(即所谓的相互作用组)的研究,就对现代分子生物学显得尤为重要。
2.相互作用蛋白质组学的研究方法有哪些?
答:一般而言,相互作用蛋白质组学的研究方法包括遗传学方法和生物化学方法。
遗传学方法:①(PCA)蛋白质片段互补分析技术
②(MYTH)膜酵母双杂交技术
③(RET)共振能量传递技术
④(LUMIER)发光标记哺乳动物相互作用组定位技术
⑤(MAPPIT)哺乳动物蛋白质—蛋白质相互作用链和其变异技术
⑥(Phage display)噬菌体展示技术
⑦(Protein microarrays)蛋白质微阵列技术
生物化学方法:①免疫共沉淀法
②串联亲和纯化法
③基于质谱分析的各种生化方法
3与传统蛋白质相互作用研究方法相比,相互作用蛋白质组学的优势在哪里?
答:①(MYTH)膜酵母双杂交技术
:不像传统的酵母双杂交系统,膜酵母双杂交系统不需要蛋白质的相互作用发生在细胞核内,因此某些细胞外蛋白和细胞膜受体蛋白等的研究就不受限制了。系统可以成功地应用于高通量和低通量形式,来确定完整膜和膜相关蛋白的相互作用,这些蛋白可来自不同种类的有机生物体中不同功能、结构和亚细胞定位。
③(RET)共振能量传递技术:能够不改变相互蛋白质所依赖的生理环境,能够在生物体内便可对其进行实时生理监测。
④(LUMIER)光标记哺乳动物相互作用组定位技术:LUMIER可以以自动化高通量的方式研究哺乳动物自然环境中的PPI,对今后哺乳动物的信号转导通路的研究是不可或缺的。
⑤(MAPPIT)哺乳动物蛋白质—蛋白质相互作用链和其变异技术
:MAPPIT在发现新药物和药物作用靶位的分析的中有重要价值。
⑥(Phage display)噬菌体展示技术:特别适用于快速筛查和优化分子间的相互作用,使其成为药物开发的重要工具。
⑦(protein microarrays)蛋白质阵列:检测快速、简便易行、样本用量少、可进行高通量分析, 具有高度并行性、多样性、微型化和
自动化的特点。