蛋白质组学与肿瘤
组蛋白修饰与肿瘤发生的关系
组蛋白修饰与肿瘤发生的关系肿瘤是一种极为复杂的疾病，它的产生和演化涉及到多种因素，而其中一个比较重要的因素就是基因组的变化。
研究表明，基因组变化是肿瘤发生的重要驱动力，而组蛋白修饰在这一过程中扮演了重要的角色。
本文将重点讨论组蛋白修饰与肿瘤发生的关系。
组蛋白修饰是指对组蛋白分子上的特定位置进行化学修饰，从而影响其结构和功能。
组蛋白是一种重要的蛋白质，在细胞核中起着支持染色质结构、DNA复制、转录和DNA修复等功能。
组蛋白可以被分为多种类型，其中最为重要的是核心组蛋白（histone）。
核心组蛋白由H2A、H2B、H3和H4四个亚基组成。
核心组蛋白的N端可通过甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化等化学修饰，从而影响其在染色质中的位置和结构，进而影响基因的转录。
组蛋白修饰也包括了非核心组蛋白的化学修饰，比如翻译后修饰，如在乳腺癌细胞中，乙酰化酪氨酸酶P300被启动，通过翻译后修饰使得肿瘤细胞生长并转移。
研究发现，许多与肿瘤相关的基因与组蛋白修饰有密切的关系。
一些肿瘤细胞中的组蛋白修饰失调，从而导致基因表达的改变，甚至改变基因的结构和功能。
比如，一些组蛋白甲基转移酶和乙酰化酶的过度表达或丧失会直接导致肿瘤的发生和进展。
此外，一些肿瘤细胞中的组蛋白修饰也可以影响免疫系统，从而使得肿瘤更难被免疫系统杀死。
特别地，研究发现，H3K27me3和H3K9me3两种特定的组蛋白甲基化修饰在肿瘤发生中起着重要的作用。
H3K27me3的过度沉积被发现与胃癌、黑色素瘤、上皮卵巢癌和肾透明细胞癌等多种癌症相关。
与此类似，H3K9me3的沉积过度被发现与乳腺癌、大肠癌、甲状腺癌和骨髓瘤等癌症相关。
这些发现提示，组蛋白修饰可以作为潜在的肿瘤生物标志物，因为肿瘤细胞中特定的组蛋白修饰模式是与健康细胞不同的。
此外，最近的研究表明，组蛋白甲基化修饰也与肿瘤免疫治疗的效果相关。
近年来，免疫治疗已经成为了治疗某些类型的肿瘤的新方法。
然而，一些肿瘤细胞可以通过减少H3K27me3的甲基化水平来逃避免疫细胞攻击，从而降低了免疫治疗的有效性。
蛋白质组学技术在肝癌诊断中的应用
蛋白质组学技术在肝癌诊断中的应用肝癌是恶性肿瘤的一种，通常是在肝细胞的基础上逐渐发展而来。
由于其隐蔽性和易复发性，导致肝癌的诊断和治疗一直是困扰医学界的难题。
然而近年来，一项被广泛研究的技术，即蛋白质组学技术，为肝癌的早期诊断和治疗提供了新的思路和方法。
1. 蛋白质组学技术的原理蛋白质组学技术是一种基于蛋白质的性质和功能进行研究的生物技术。
其核心原理是使用分离、鉴定、定量和分析等手段来探索生物体内蛋白质的数量和性质。
在疾病领域中，通过对蛋白质的组成、结构、功能和相互作用等方面进行研究，可以发现潜在的体内生物标记物，提高对疾病的诊断和治疗水平。
2. 蛋白质组学技术在肝癌诊断中的应用（1）蛋白质组学技术在肝癌早期诊断中的应用肝癌早期诊断是肝癌治疗的关键。
但是由于肝癌早期症状不明显，并且常常被误诊为其他肝病，因此肝癌的早期诊断一直是医学界面临的难题。
近年来，蛋白质组学技术在肝癌早期诊断方面的研究取得了一定的进展。
研究人员通过对肝癌患者和正常人群血液样本预处理、分离、纯化和定量等措施，发现了许多潜在的蛋白质分子标记物。
这些标记物不仅能够区分肝癌患者和正常人群，而且还可以帮助早期诊断，并预测肝癌的复发情况。
例如，有一种叫做alpha-fetoprotein（AFP）的蛋白质，在肝癌患者中常常高于正常人群水平，可以用来作为肝癌的标志物。
（2）蛋白质组学技术在肝癌治疗中的应用肝癌的治疗方法包括手术、放疗、化疗和靶向治疗等。
然而，由于肝癌的异质性和多样性，不同治疗方法的效果也不同。
因此，在治疗肝癌时选择合适的治疗方案也是非常重要的。
近年来，蛋白质组学技术也被广泛用于肝癌治疗中，可以帮助医生预测治疗效果，提高治疗效果，减少副作用。
例如，研究人员通过对放疗治疗前和治疗后患者的血样进行分析，发现在放疗前患者较高的c-reactive protein（CRP）水平与放疗效果不佳和肝癌再生有关。
因此，改变治疗方案和加强预防措施，有望改善治疗效果，提高肝癌患者的生存率。
蛋白质组学 肿瘤标志物
蛋白质组学肿瘤标志物
蛋白质组学是一种研究组织、细胞和生物体内蛋白质的大规模的技术和方法。
利用蛋白质组学技术，可以对肿瘤标志物进行研究和发现。
肿瘤标志物是一种能够在癌症患者的体液或组织中检测到的特殊分子。
它们可以用于癌症的早期诊断、疾病分级、治疗监测和预后评估。
通过蛋白质组学技术，科学家可以利用质谱、免疫印迹等技术研究肿瘤标志物，并通过生物信息学分析等手段发现新的潜在标志物。
此外，利用蛋白质组学技术还可以深入了解肿瘤细胞的生物学特性、发生机制等，为肿瘤的治疗和预防提供帮助。
蛋白质组学综述
蛋白质组学在肿瘤研究中的应用摘要：随着人类基因组全序列草图的完成，从基因水平向蛋白质水平的深化，已成为生命科学研究的迫切需要和新的任务。
蛋白质组学的建立为研究蛋白质水平的生命活动开辟了更为广阔的前景，提供了新型有效的研究手段。
从蛋白质整体水平上研究肿瘤的发生与转移，寻找与肿瘤发生及转移相关的新的蛋白质、肿瘤特异性的标志物及肿瘤药物治疗的靶标，对肿瘤的诊治将起到重要作用。
本文对肿瘤蛋白质组学的研究进展进行了简要综述。
关键词蛋白质组学蛋白质组肿瘤研究进展人类基因组计划全基因组测序的完成，标志着后基因组时代的到来，其主要任务是分析细胞全部蛋白质的结构、功能和相互作用，即蛋白质组学。
恶性肿瘤是危害人类的主要疾病之一，但其发生发展机制仍不清楚，诊断、治疗效果也不理想，而蛋白质组学方法可望为肿瘤发生机制的研究和防治带来新的突破。
本文将蛋白质组学基本概念、研究技术和肿瘤蛋白质组学研究进展作一综述。
1. 蛋白质组和蛋白质组学概念蛋白质组（proteome）的概念最早是由澳大利亚Macquarie大学的Wilkins等于1994年在意大利的一次科学会议上提出的，他们对蛋白质组的定义：“蛋白质组指的是一个基因组所表达的蛋白质”；即“proteome”是由蛋白质的“prote”和基因组的“ome”字母拼接而成。
它是对应于一个基因组所有蛋白质构成的整体，而不是局限于一个或者几个蛋白质。
由于同一基因组在不同细胞、组织中的蛋白质表达情况各不相同，即使是同一细胞，在不同的发育阶段、不同的生理病理条件下甚至不同的环境影响下，其蛋白质的存在状态也不尽相同。
因此，蛋白质组是一个在时间和空间动态变化着的整体。
蛋白质组学（proteomics）是指以蛋白质组为研究对象，从整体的角度，分析细胞内动态变化的蛋白质组成与活动规律。
蛋白质组学研究主要包括：①表达蛋白质组学(expression proteomics)，研究细胞或组织中蛋白质表达的质和量的变化，以及不同时间基因表达谱的改变；②功能蛋白组学(functional proteomics)，研究在不同生理和病理条件下，细胞中各种蛋白质之间的相互作用关系及其调控网络，以及蛋白质的转录后修饰等；③结构蛋白组学(structure proteomics)，以阐明生物大分子蛋白质的三维结构特性为目的[1]。
单细胞测序和蛋白质组学技术在研究和治疗肿瘤中的应用
单细胞测序和蛋白质组学技术在研究和治疗肿瘤中的应用肿瘤是一种常见的疾病，其病因和病理机制复杂多样。
为了更好地研究和治疗肿瘤，科学家们不断尝试使用新的技术手段，其中单细胞测序和蛋白质组学技术是近年来受到广泛关注的两种技术。
单细胞测序技术的优势在于可以深入了解不同细胞之间的差异和相互作用，从而更好地研究肿瘤的发生、发展和抗药性等问题。
该技术利用高通量测序技术对单个细胞的基因组、转录组和表观组进行测序，从而构建单细胞的分子图谱。
通过对单细胞的研究，科学家们可以了解肿瘤细胞之间的异质性，及其对化疗和免疫治疗等策略的响应情况。
一个肿瘤组织中的细胞可以存在多种异质性，包括不同的细胞亚群和突变。
通过单细胞测序技术，科学家们可以分析肿瘤细胞群体中某一特定子集的基因和表观遗传学的转录组和表观组特征，从而更好地研究肿瘤发展过程中的基因和表观组变化。
此外，单细胞测序还可以确定肿瘤细胞的迁移路线和转移模式，有助于了解肿瘤在身体中的扩散方式，并指导早期诊断和治疗。
蛋白质组学技术也是肿瘤研究和治疗中的重要手段。
与基因组学、转录组学和表观组学不同，蛋白质组学着重于研究蛋白质的表达、结构和功能，因此它可以更深入地了解肿瘤细胞内部发生的变化。
现代蛋白质组学技术主要包括质谱分析、蛋白质互作网络分析和蛋白质组单细胞分析。
质谱分析是一种直接分析蛋白质的方法，通常使用高分辨质谱仪进行蛋白质定量和分析。
通过分析蛋白质的序列、结构和功能，科学家们可以了解蛋白质在肿瘤细胞中的变化，并确定一些关键的蛋白质调节因子和靶点。
这有助于发现新的治疗策略和药物靶点。
蛋白质组单细胞分析是一种新兴的技术，可以对单个细胞进行蛋白质组学分析。
与单细胞测序不同，其主要研究对象为蛋白质，可以更深入地了解肿瘤细胞内部的蛋白质组结构和功能变化。
此外，对于肿瘤细胞分化和转移的研究，蛋白质组学技术也可以提供重要的信息。
通过分析蛋白质互作网络，可以确定肿瘤细胞之间的信号通路，并筛选相关的药物靶点。
蛋白质表达与肿瘤发生发展的关联分析
蛋白质表达与肿瘤发生发展的关联分析蛋白质是生命体内最基本的分子之一，扮演着细胞结构、信号传导、代谢调控等重要角色。
蛋白质异常表达与人类疾病的发生发展密切相关，其中肿瘤的发生发展尤为重要。
本文将分析蛋白质表达与肿瘤发生发展的关联，并探讨相关研究的进展和重要意义。
1. 蛋白质表达与肿瘤发生的关系在肿瘤细胞中，蛋白质异常表达是肿瘤发生发展的重要特征之一。
一方面，某些蛋白质的过度表达可以促进肿瘤细胞的增殖、生存和转移，从而推动肿瘤的发展；另一方面，一些蛋白质的表达缺失或异常下调则会导致细胞自噬、凋亡抑制以及免疫逃逸等肿瘤形态特征的出现。
因此，蛋白质表达的变化在肿瘤发展的各个阶段扮演重要角色。
2. 蛋白质表达与肿瘤早期诊断肿瘤早期诊断对于治疗和预后具有重要意义，而蛋白质表达的变化可以作为肿瘤早期诊断的潜在标志物。
通过检测血液或组织中特定蛋白质的表达水平，可以识别早期肿瘤标记物，提高早期肿瘤诊断的准确性和敏感性。
例如，前列腺特异性抗原（PSA）的检测在早期诊断和监测前列腺癌方面具有重要价值。
3. 蛋白质表达与肿瘤治疗蛋白质的异常表达已经成为靶向治疗的重要靶点。
基于特定蛋白质的表达水平，可以选择性地应用药物来干预肿瘤发展。
例如，表达HER2过度的乳腺癌患者可以通过应用特定的抗HER2药物，如曲妥珠单抗（Trastuzumab），来实现针对性治疗。
蛋白质的表达水平还可以用来预测肿瘤对不同治疗策略的敏感性，从而指导个体化治疗的选择。
4. 蛋白质组学研究的进展蛋白质组学是研究蛋白质表达及其功能的一种重要手段。
随着高通量蛋白质组学技术的发展，研究人员可以同时检测数千种蛋白质的表达水平，从而全面了解肿瘤发生发展过程中蛋白质表达的变化。
蛋白质组学研究有助于发现新的肿瘤标记物、阐明蛋白质相互作用网络以及揭示肿瘤发生发展的机制。
5. 未来展望蛋白质表达与肿瘤发生发展的关联已经成为肿瘤研究的热点领域。
未来的研究将继续探索更多的蛋白质标志物，开发更精准的肿瘤诊断方法，以及设计更有效的靶向治疗策略。
蛋白质表达与肿瘤发生发展的关系
蛋白质表达与肿瘤发生发展的关系肿瘤是指由于体内细胞异常增殖和分化失控而形成的一类疾病。
蛋白质表达是指细胞通过转录和翻译过程将基因编码的信息转化为蛋白质的过程。
蛋白质是生物体中最基本的功能分子，它们在细胞的生命活动中发挥着重要的作用。
1. 蛋白质在肿瘤发生发展中的作用在肿瘤的发生发展中，蛋白质表达异常与多个关键过程相关。
首先，蛋白质可以参与细胞信号传导途径的调控，从而影响细胞增殖和凋亡等过程。
例如，细胞周期调控蛋白质如p53和Rb蛋白质在癌症中的异常表达与肿瘤细胞的过度增殖相关。
此外，转录因子和细胞凋亡相关蛋白质的异常表达也参与了肿瘤发生发展过程。
其次，蛋白质的异常表达还与肿瘤的侵袭和迁移相关，相关蛋白质如增殖和转移相关蛋白质-1（EMMPRIN）可促进肿瘤细胞的侵袭和转移。
因此，蛋白质表达异常对于肿瘤的发生发展具有重要的影响。
2. 蛋白质表达调控机制的研究为了深入了解蛋白质表达与肿瘤发生发展的关系，科学家们开展了很多研究，并揭示了一些蛋白质表达调控机制。
其中包括转录调控、翻译调控和蛋白质降解等。
转录调控是指通过调节基因的转录活性来控制蛋白质表达水平。
转录因子是参与这一过程的关键蛋白质，它们能够结合到基因启动子区域，促进或抑制基因的转录。
研究发现，许多转录因子的异常表达与肿瘤的发生发展密切相关。
例如，转录因子MYC在多种癌症中常常被过度表达，从而促进肿瘤细胞的增殖。
翻译调控是指通过调控翻译过程中的转座因子和启动子结合因子等分子来控制蛋白质的合成。
研究发现，蛋白质合成启动子mTOR在多种肿瘤中过度活化，导致肿瘤细胞的持续增殖。
蛋白质降解是细胞调控蛋白质表达水平的另一个重要机制。
它主要通过泛素和蛋白酶体等分子来参与，异常的蛋白质降解会导致蛋白质的累积和异常表达。
研究发现，在某些肿瘤中，蛋白质降解的通路异常活化，从而导致一些抑癌蛋白质的异常降解和肿瘤相关蛋白质的异常积累。
3. 蛋白质表达与肿瘤治疗研究由于蛋白质表达异常与肿瘤的发生发展密切相关，科学家们开始探索利用蛋白质表达调控的方法来治疗肿瘤。
蛋白质组学在消化系统肿瘤中的研究进展
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箜！！鲞箜！塑！坐』里运望！！Ｑ！！！ｂ笪；！！！！业：Ｙ！！：垫！丝！：！
・综述・
蛋白质组学在消化系统肿瘤中的研究进展
丁 莺 吕 宾
摘要：蛋白质组学是系统研究分子体系、亚细胞系、细胞、组织、器官乃至整体等生物体系内蛋白质组成 及其活动规律的科学。近些年来，它已成为全面分析蛋白质表达变化的有力研究工具，并被广泛应用到各 种疾病研究之中。此文旨在介绍蛋白质组学的相关研究技术及其在消化系统肿瘤中的应用。 关键词：蛋白质组学；消化系统肿瘤；生物标志物 蛋白质组学是一门以全面蛋白质性质研究（如 表达水平、转录后修饰、细胞内定位、相互作用等） 为摹础，在蛋白质整体水平对疾病机制、细胞模式、 功能联系等方面进行探索的科学。２００１年，国际人 类蛋白质组组织（ＨＵＰＯ）成立，提出了人类蛋白质 组计划（ＨＰＰ），使其在人类疾病方面的应用迅速
Ａ、
Ｅｂｅｒｔ等［６］用单克隆上皮特异性抗体（ＢｅｒＥＰ４ 直接针对上皮细胞黏附分子）与磁珠相连来分别纯 化１０例胃癌患者的原发肿瘤与正常组织，获得１９１ 个差异表达的蛋白质。经ＭＳ鉴定，组织蛋白酶８
（ｅａｔｈｅｐｓｉｎ
Ｇ）在６０％的胃癌患者中表达上调。
Ｗｅｓｔｅｒｎ ｂｌｏｔ证实，ｃａｔｈｅｐｓｉｎｌ３以活性形式在胃癌细
突变位点。
蛋白质组学作为肿瘤研究的新平台，通过从整 体水平研究蛋白质间的网络调控，对食管癌、胃癌、 肝癌、胰腺癌、结直肠癌等消化系统肿瘤的早期诊 断，寻找新标志物，治疗以及药物开发的新靶点等 方面具有重要意义。 １蛋白质组学的研究技术
１．１
一些新的技术不断涌现也更加丰富和完善了 传统技术。例如，在蛋白质分离方面激光捕获显微 切割技术和多维强离子交换一阵列式毛细管高效液 相色谱技术［１］被运用到其中。在蛋白质鉴定方面还
蛋白质表达与肿瘤癌细胞中蛋白质表达的变化与治疗策略
蛋白质表达与肿瘤癌细胞中蛋白质表达的变化与治疗策略肿瘤是一种异常细胞增殖的疾病，其发展与细胞内蛋白质的表达密切相关。
蛋白质表达的变化与肿瘤的发展、预后以及治疗策略密切相关。
本文将探讨蛋白质表达与肿瘤癌细胞中蛋白质表达的变化，并分析其在肿瘤治疗中的潜在应用。
一、蛋白质表达的变化与肿瘤1.1 蛋白质表达的基本概念蛋白质是生物体中最为重要的大分子有机化合物之一，扮演着细胞内信号传导、结构支持、代谢调控等重要角色。
蛋白质的表达水平直接反映了细胞功能状态，包括细胞增殖、细胞凋亡、细胞迁移等过程。
1.2 蛋白质表达的变化与肿瘤发展与正常细胞相比，癌细胞的蛋白质表达往往发生显著变化。
癌细胞中表达上调的蛋白质可以促进细胞增殖、抑制细胞凋亡、增强细胞侵袭能力，从而推动肿瘤的发展。
同时，癌细胞中抑制表达的蛋白质可以导致细胞凋亡、抑制细胞周期进程，从而抑制肿瘤的发展。
1.3 蛋白质组学在肿瘤研究中的应用蛋白质组学技术的发展为深入研究肿瘤中蛋白质的表达变化提供了有力工具。
通过蛋白质组学技术可以全面分析肿瘤细胞中蛋白质表达的差异，发现潜在的治疗靶点以及预测患者的预后。
二、肿瘤癌细胞中蛋白质表达的变化2.1 肿瘤抑制基因的失活与蛋白质表达下调癌细胞中常见的肿瘤抑制基因如P53、PTEN等的失活常常导致蛋白质表达的下调。
这些蛋白质的下调会增加癌细胞的增殖能力、减少细胞凋亡，从而促进肿瘤的发展。
2.2 肿瘤促进基因的激活与蛋白质表达上调癌细胞中常见的肿瘤促进基因如MYC、HER2等的激活往往导致蛋白质表达的上调。
这些蛋白质的上调会增加癌细胞的增殖能力、增强细胞周期进程，从而推动肿瘤的发展。
2.3 蛋白质修饰与肿瘤发生蛋白质修饰指的是蛋白质在翻译后发生的化学修饰，如磷酸化、乙酰化等。
这些修饰可以改变蛋白质的功能和表达水平，进而影响肿瘤的发生和发展。
三、蛋白质表达与肿瘤治疗策略3.1 靶向治疗根据肿瘤细胞中蛋白质表达的差异，可以针对特定的靶点进行靶向治疗。
蛋白质组学在肿瘤研究中的应用
药性 有密切 的相关 性 ， 现在仍需 临床试 验证 明 ， 但 该蛋 白可 以
作为抗乳腺癌药物潜在靶点 。 ２ ． ２ 在癌症早期诊 断 中的应用 癌症早 期诊断 的意义超 过了任何 一种 癌症 的治疗方法 ， 它对延长 患者 生命 和癌症的治 疗都有着很 大的帮助 ， 蛋 白质组 学为癌症 的早期诊断提供 了可 靠的方法 。对 正常细胞 和肿瘤细胞的蛋 白组进行 比较 ， 从 中发
（ 南华大学药物药理研究所 ， 湖南 衡阳 ４ ２ １ ０ ０ １ ）
肿瘤是现今全世界发病率和病死率增长最快 的疾病 ， 近几 年 的统计 表 明 因肿瘤 而死 亡 的人 数 大约 占所 有死 亡 因素 的 １ ２ ％。过去生物学和 医学对于癌症的研究主要集 中在基 因水平 和转录水平 ， 而肿瘤是 由环 境和遗传因素相互作用 的有多种基
现特异性的肿 瘤标记蛋 白， 可以作为肿瘤早期诊断 的标准 。
在可以运用高效液相色谱技术来弥补这些缺点 ， 并对低丰度蛋
白进行检测 。
世界 范围 内 ， 男 性 患膀胱 癌在 有实体 肿瘤 的癌 症 中排第 ４位。Ｌ ｅ ｉ ｔ 等运用 ２ Ｄ电泳技术对正常膀胱癌 细胞 和膀胱癌细 胞进行 比较 ，发 现有 １ ４中蛋 白发生表达差 异 ，如 Ｂ 微球蛋 白、 ａ ｐ ｏ Ａ 。 、 前列腺 素合 成酶 Ｄ 、 Ⅱ型细胞骨架 １ 等 。其 中 ａ ｐ ｏ Ａ
要指标之一。
蛋 白质组（ Ｐ ｒ ｏ ｔ ｅ ｏ ｍ ｅ ） 是１ ９ ９ ４年澳大利亚 Ｍ ａ ｃ ｑ ｕ ａ ｒ ｉ ｅ 大学 的
Ｗｉ ｌ ｋ ｉ ｎ ｓ 和 Ｗｉ ｌ ｌ ｉ ａ ｍｓ 提出的［ ３ １ 。蛋 白质组是 指一 个组织 、 细胞或
Ａ ｋ ｉ ｋ ｏ 【 １ １ 等用 差异 蛋 白组 学研究 了结直肠 癌细胞 Ｄ Ｌ Ｄ 一 １ 和用
蛋白质组学技术及其在消化系统肿瘤中的应用
蛋 白质 组学研 究 主要 依 赖 三大 技 术 ， 即分离 技 术、 鉴定 技术 和利 用 蛋 白质 信 息 学进 行 蛋 白质结 构
和功 能预测技 术 。
１ １ 蛋 白质 的分 离技 术 ．
生 物体 内蛋 白质种 类 繁 多 ， 将样 本 中蛋 白质 组 分 离是 开展 蛋 白质组学 研究 的基础 。 目前最 常用 的 方法是 双 向凝 胶 电泳 技 术 （ｗ ｉ ｅ ｓ ｎｌ ｅ ｅｅ． ｔｏｄｍ ｎ ｉ ａ ｇｌ ｌ ｏ ｃ
ｓｅｔ ｍ ｔ ， Ｓ— ／ ） ｐ ｃ ｏ ｅｒ Ｅ ＩＭＳ ＭＳ 。前 者可 以得 到酶 解肽 段 ｒ ｙ
一
５ 一 ８
中华内分泌外科 杂志 ２ ０ ０９年 ２月第 ３卷第 １期
Ｃ ｉ ＪＥ ｄ ｃ Ｓｒ，Ｆｂｕ ｒ ２ ０ ， ｏ． ， ｏ１ ｈｎ ｎ ｏｒ ｕｇ ｅ ｒａｙ ０ ９ Ｖ １３ Ｎ ．
・
综述 ・
蛋 白质 组 学 技 术 及 其 在 消化 系统 肿 瘤 中 的应 用
上 ， 用等 电聚焦 电泳 和 十二 烷 基磺 酸 钠 聚 丙烯 酰 应
胺 凝胶 电泳 ， 该技 术 主要 用 于 构 建 特定 组 织 或 细胞
程 等 发生 发展 规律 。在 消化 系 统 肿瘤 中 ， 白质 蛋 组 学在 寻找新 标志 物 、 期 诊 断 、 导 分 型 、 为治 早 指 作
疗 和药物 开发 的靶 点 、 随访 等方 面 为我 们 带来 了新
蛋 白质 “ 二维 电泳 图谱 ” 并 分 析特 定 条件 下 蛋 白质 ，
的表达 情 况 ， 行 蛋 白质 组 差 异 比较 。但 ２ Ｄ 进 － Ｅ技
术也存 在着 一些 不 足之 处 如 对 膜蛋 白 ， 酸 极碱 性 极
蛋白质组学在疾病诊断中的应用
蛋白质组学在疾病诊断中的应用随着科技的发展，蛋白质组学在医学领域中的应用越来越广泛。
蛋白质组学是一门综合性的学科，它可以探索蛋白质的丰富功能，并寻找蛋白质分子与疾病发生发展的关系。
下面就让我们来探讨一下蛋白质组学在疾病诊断中的应用。
一、蛋白质组学在病因研究中的应用疾病的发生发展是一个复杂的过程，它通常涉及到多个蛋白质分子的变化。
蛋白质组学技术可以帮助科学家发现引起疾病的关键因素。
例如，研究人员可以通过分离和鉴定病人和健康人群之间的蛋白质差异，找到与该疾病相关的蛋白质分子，并对这些蛋白质分子进行进一步的研究分析，以揭示疾病的发生机制。
二、蛋白质组学在疾病诊断中的应用蛋白质组学技术可以帮助医生对病人进行快速、准确的诊断。
举个例子，当病人出现肝功能异常时，医生可以通过分离和鉴定血液中的蛋白质，以确定是否存在肝病。
传统的检测方法需要进行多次检测和观察，而蛋白质组学技术可以在短时间内提供准确的答案，并且有更高的灵敏度和特异性。
三、蛋白质组学在药物研发中的应用蛋白质组学技术可以帮助研发人员识别药物的作用靶点，并进一步确定药物的作用机制。
例如，研发人员可以通过分析药物与蛋白质结合后产生的变化，确定药物对哪些蛋白质产生作用，并进一步了解药物的作用机制，有助于开发更加有针对性的药物。
四、蛋白质组学在肿瘤诊断和治疗中的应用在肿瘤治疗中，选择合适的治疗方法对病人的生存和康复至关重要。
蛋白质组学技术可以帮助医生识别出肿瘤类型、肿瘤分期以及患者的预后情况。
同时，蛋白质组学技术还可以帮助医生选择更加有效的治疗方法，例如靶向治疗和免疫治疗。
例如，通过分析肿瘤细胞的蛋白质分布和表达情况，医生可以选择针对特定蛋白质的药物，提高治疗的效果和精准度。
总之，蛋白质组学技术在疾病的诊断、治疗和预防中起着不可替代的作用。
未来，随着技术的进一步发展，蛋白质组学技术将会更加广泛应用于医学领域，为患者的康复和健康提供更加有效的支持和保障。
蛋白质组学技术及其在消化系统肿瘤中的应用
从 组 织样 品 中获取 特 异 细 胞 群 的技 术 ， 技 术 对 双 该 向 电泳 的标本 制备 具 有 重 要 作 用 ， 以精 确 地 从 组 可 织 切 片 中取 出研究 者感 兴 趣 的细 胞 类 型 ， 而 获 得 从
供 了新 方 法 ， 肿 瘤 的诊 断及 治 疗 提 供 了新 途 径 。 为
的研究 ， 尤其 是 在致 癌 机 制 方 面 ， 得 了显 著 的 进 取
展 。然而 ，临床 检 测 及 治 疗 上 的 进 展 却 相 对 缓 慢 。 蛋 白质组 学 的引入 ，通过 提供 大规 模 高通 量 的蛋 白 质分 析 的技术 手段 ，为肿 瘤 蛋 白质 标 志 物 的检 测 提
１ 蛋 白质 组 学概 述及 其相 关 技术
１９ ９ ４年 ， 大 利 亚 科 学 家 Ｗｉ ｉｓ和 Ｗｉｉ 澳 ｌｎ ｋ ｌａ ｌ ｍｓ
首 次提 出 了蛋 白质 组学 （ ｒｔｏ ｃ ） 念 ， 白质 组 ｐｏ ｍｉ 概 ｅ ｓ 蛋
ｐ ｏｅｉ， Ｄ Ｐ Ｇ ｈ ｒｓ ２ —Ａ Ｅ）仍 是 获得 蛋 白质 图谱 的 主要 手 ｓ 段， 其原 理是 根 据 蛋 白质 等 电点 和 分 子 量 的不 同将
复杂 生命 活 动 的机制 。蛋 白质组 学 的核心 技术 包括 样 品制 备 、 离 、 分 鉴定 和 生物 信息 分析 等 。 １ １ 样 品制 备 ． 样 品 制备 是 蛋 白质 组 分 析成 功 与 否 的关 键 ， 应 具有 良好 重 复性 ， 与后 续分 离 和鉴定 方 法相 匹配 。 并 与核 酸 不 同 ， 目前 没 有 一 种 通 用 的方 法 适 用 于所 有 的蛋 白质 ， 同来 源 的样 本 需 要 不 同的 提 取 和裂 解 不 技术 。近几 年 发 展 起 来 的激 光 捕 获 显 微 切 割 技 术
基于蛋白质组学技术的肿瘤标志物筛选研究
基于蛋白质组学技术的肿瘤标志物筛选研究肿瘤标志物是指肿瘤患者体内可检测到的信号分子，如血清中的蛋白质、DNA、RNA等。
肿瘤标志物在深入了解肿瘤的发病机理、诊断、治疗和预后方面扮演着重要的角色。
在现代医学中，通过基因组学、蛋白质组学等高通量技术的发展，提高了对肿瘤标志物的检测水平。
在这些技术中，基于蛋白质组学技术的肿瘤标志物筛选研究成为了目前的一个热点和难点。
蛋白质组学技术的发展蛋白质质谱分析技术是目前蛋白质组学研究的核心技术，而其不断的发展为肿瘤标志物筛选研究提供了有力支持。
质谱分析技术已经成为了其它技术手段如液相色谱、二维电泳、同位素标记等的重要辅助手段。
通过蛋白质质谱分析技术结合肿瘤患者和正常人的比较，可以发现许多与肿瘤有关的蛋白质。
研究这些蛋白质的变异能够揭示出肿瘤生长、发展、转移、侵袭等重要信息，从而发现新的肿瘤标志物。
蛋白质组学技术在肿瘤标志物的筛选中的应用蛋白质组学技术在肿瘤标志物的筛选研究中具有不可替代的优势。
其首先在于蛋白质组学技术可以实现几千个肿瘤标志物的同时分析，从而提高了对肿瘤标志物的发现概率。
其次，蛋白质组学技术可以更加精准地鉴定肿瘤标志物，从而大大降低了假阳性的概率。
最后，蛋白质组学技术可以结合蛋白质功能和分子及基因组学信息，从而更加全面、深入地了解肿瘤的特征。
蛋白质组学用于肿瘤标志物筛选实例以胃癌为例，蛋白质质谱技术在肿瘤标志物的筛选中发挥了重要作用。
胃癌是世界上最常见的癌症之一，其晚期诊断率很高，因此胃癌早期诊断非常重要。
通过使用蛋白质质谱技术对胃癌和正常组织进行对比分析，一些新的临床诊断标志物，如GPC3（胃癌转移蛋白）、ATP1B1/3（胃癌抑制蛋白）、FADD（胃癌相关蛋白）、TFF3（胃癌细胞增殖和浸润蛋白）等被鉴定出来。
另外，使用蛋白质质谱技术还在胃癌微小灶的检测方面取得了重要进展。
通过对小鼠模型鼻腔喷鼻炎的方法，获得胃癌微小灶的局部组织标本并进行组学分析，软骨样瘤灶蛋白（CHI3L1/4）被证实为一种新的胃癌微小灶标志物，该标志物可以提高胃癌微小灶的检测准确度，在胃癌早期诊断方面具有重要意义。
蛋白质表达与肿瘤了解蛋白质表达与肿瘤发生发展的关系
蛋白质表达与肿瘤了解蛋白质表达与肿瘤发生发展的关系肿瘤是一种常见的疾病，对人类健康造成了严重威胁。
在近年来的研究中，科学家们发现了蛋白质表达与肿瘤发生发展之间的密切关系。
本文将探讨蛋白质表达与肿瘤的关系，并分析其在肿瘤研究和治疗中的重要性。
蛋白质是生物体内最基本的分子单位，它们参与了几乎所有的生物过程，包括细胞信号传导、基因表达、代谢调控等。
在正常细胞中，蛋白质的表达水平是严格调控的，以维持细胞的正常功能。
然而，当细胞发生突变或DNA损伤时，蛋白质的表达会受到影响，导致细胞功能失常，甚至引发肿瘤的发生。
肿瘤的发生与发展是一个复杂的多步骤过程，其中蛋白质的表达异常是关键因素之一。
肿瘤细胞中的蛋白质表达模式与正常细胞存在差异，其中一些蛋白质的过度表达或失活与肿瘤的发生密切相关。
例如，癌基因的突变或过度表达往往导致细胞增殖信号的异常激活，从而促进肿瘤的生长。
此外，肿瘤细胞还可以通过改变蛋白质的翻译后修饰来增强其生存能力和转移能力，从而进一步促进肿瘤的发展。
了解蛋白质表达与肿瘤之间的关系对于肿瘤的研究和治疗具有重要意义。
首先，通过对肿瘤细胞中蛋白质表达的研究，科学家们可以发现新的肿瘤标志物，用于肿瘤的早期筛查和诊断。
例如，人乳头状瘤病毒（HPV）感染可导致宫颈癌的发生，而检测HPV相关蛋白质的表达可以提高早期宫颈癌的诊断准确性。
其次，蛋白质表达的异常也可用于预测肿瘤的预后和治疗反应。
通过分析肿瘤细胞中关键蛋白质的表达水平，医生可以预测肿瘤的侵袭性和转移能力，并制定个体化的治疗方案。
最后，针对蛋白质表达异常的肿瘤细胞，研究人员可以开发新的药物和治疗策略。
以靶向蛋白质为基础的抗肿瘤药物已经在临床上取得了一定的成功，如靶向HER2蛋白的治疗药物Herceptin，用于治疗HER2阳性乳腺癌。
在蛋白质表达与肿瘤的研究中，有几种常用的技术和方法。
例如，蛋白质组学可以通过对肿瘤细胞中蛋白质的定性和定量分析，揭示肿瘤发生和发展的分子机制。
基于蛋白质组学的肿瘤标志物发现研究报告
基于蛋白质组学的肿瘤标志物发现研究报告一、前言癌症作为全球范围内严重威胁人类健康的疾病之一，其早期诊断和有效治疗一直是医学研究的重点和难点。
肿瘤标志物在癌症的诊断、治疗监测和预后评估中发挥着重要作用。
然而，传统的肿瘤标志物存在特异性和敏感性不足等问题，限制了其在临床实践中的应用。
蛋白质组学作为一种新兴的生物技术，为肿瘤标志物的发现提供了新的机遇和方法。
二、蛋白质组学技术概述蛋白质组学是研究一个细胞、组织或生物体在特定时间和条件下所表达的全部蛋白质的组成、结构、功能和相互作用的科学。
其技术主要包括蛋白质分离、鉴定和定量分析等。
常用的蛋白质分离技术有双向凝胶电泳（2-DE）和液相色谱（LC）。
2-DE 可以根据蛋白质的等电点和分子量进行分离，但存在分辨率低、重复性差等缺点。
LC 则具有更高的分离效率和灵敏度，包括反相高效液相色谱（RPHPLC）、离子交换色谱（IEC）和尺寸排阻色谱（SEC）等多种模式。
蛋白质鉴定技术主要有质谱（MS），包括基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDITOFMS）和电喷雾电离质谱（ESIMS）。
MS 可以通过测定蛋白质的分子量和肽段序列来实现蛋白质的鉴定。
定量蛋白质组学技术包括同位素标记相对和绝对定量（iTRAQ）、细胞培养稳定同位素标记（SILAC）和无标记定量等方法，能够比较不同样本中蛋白质的表达水平差异。
三、基于蛋白质组学的肿瘤标志物发现流程（一）样本收集首先需要收集肿瘤组织和对照组织样本，同时还可以收集患者的血清、血浆、尿液等体液样本。
样本的收集应遵循严格的标准和规范，以确保样本的质量和一致性。
（二）蛋白质提取和分离采用适当的方法从样本中提取蛋白质，并利用上述蛋白质分离技术对其进行分离。
（三）蛋白质鉴定和定量分析运用质谱等技术对分离得到的蛋白质进行鉴定和定量，获取蛋白质表达谱。
（四）数据分析通过生物信息学方法对蛋白质表达谱数据进行分析，筛选出在肿瘤组织和对照组织中表达差异显著的蛋白质。
蛋白质组学技术在医学中的应用
蛋白质组学技术在医学中的应用随着生物科技的不断发展，蛋白质质谱学已经成为了生命科学研究的重要手段，也被广泛应用于医学研究领域。
蛋白质组学技术能够研究细胞和组织中的所有蛋白质，在癌症、心血管疾病、神经系统疾病等多种疾病的诊断和治疗方面具有重要的应用价值。
一、蛋白质组学技术在癌症诊断和治疗中的应用癌症是世界各国普遍面临的健康难题。
蛋白质组学技术能够发现和鉴定癌症标志物，并在癌症的早期诊断和治疗中发挥重要作用。
研究表明，在人体癌症细胞中，许多蛋白质的表达与正常细胞不同，这为蛋白质组学技术在癌症诊断和治疗中提供了基础。
例如，通过分析肿瘤组织中的蛋白质表达谱，可以发现一些具有生物学意义的蛋白质，例如HER-2在乳腺癌中的高表达、NF-κB在胃癌中的高表达等。
这些蛋白质可以作为特异性的肿瘤标志物，用于癌症早期检测和监测治疗的效果。
此外，许多肿瘤同时表达多个蛋白质，这些蛋白质的相互作用与信号转导网络密不可分。
蛋白质组学技术可以通过发现这些蛋白质的相互作用关系，揭示信号通路中的调节机制，进而深入解析肿瘤发生和发展的分子机理，指导肿瘤的靶向治疗。
二、蛋白质组学技术在心血管疾病中的应用心血管疾病是全球范围内的一个重大健康问题。
蛋白质组学技术能够研究心肌细胞中的蛋白质组成，为疾病的诊断和治疗提供关键信息。
心肌细胞的蛋白组成是心脏功能的重要基础，因此研究心肌细胞中的蛋白质组成对于心血管疾病的诊断和治疗具有重要价值。
例如，通过蛋白质质谱技术分析心肌梗死患者的血浆样本，可以发现一些与心肌梗死相关的蛋白质，例如肌红蛋白、肌钙蛋白和肌酸激酶等，这有助于对心肌梗死进行早期诊断和分子机制的深入探究。
此外，蛋白质组学技术还可以揭示心肌细胞中的信号传导通路和蛋白质互作关系，为心血管疾病的病理机制研究和治疗提供重要依据。
三、蛋白质组学技术在神经系统疾病中的应用神经系统疾病是一个复杂的领域，包括帕金森病、阿尔茨海默病等多种疾病。
蛋白质组学技术能够研究神经系统中的蛋白质组成，发现和鉴定一些与神经系统疾病相关的蛋白质，为疾病的诊断和治疗提供依据。
蛋白质组学研究及其在肿瘤诊断和治疗中的应用
ｘ ａｙｃ／。 ｐｓ．ｈ） ２ 蛋 白质 组学 在 肿瘤 研 究 中 的应 用
２ １ 泌 尿 系统肿 瘤 ．
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常 用 的 技 术 有 Ｅ ｍａ 降 解 法 和 质 谱 分 析 法 。 ｄ ｎ Ｓ ｅｃ ｅ ｋ ｈ ｖ ｈ ｎ ｏ等 应用 一 种 ＭＡＬ 离 子 源 与 高 效 串联 ＤＩ 质谱 仪 结合 的新 型质 谱 仪 研 究 蛋 白质 组 ， 通 过 一 步 只 进 行 质谱 分 析 。 生物 信息 已经 成 为 当代 生物 学 和 医药 学 的组 成 部 分 ， 于 巨量 生 物 信 息 资 源 的收 集 、 储 、 用 存
维普资讯
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国外 医学肿 瘤 学 分 册
２０ ０ ２年 ６月 第 ２ ９卷
第 ３期
蛋 白质 组 学 研 究 及 其 在 肿 瘤 诊 断 和 治 疗 中 的应 用
郭俊 超综述 赵 玉沛 审校
（ 国协和 医科 大 学 中国 医学科 学 院 北 京协 和 医院普 通 外科 ， 京 １０ ３ ） 中 北 ０ ７ ０
蛋 白质组 学 是 指通 过 生化 方 法 对蛋 白质 进 行 大规
模研 究 的科学 。蛋 白质 组 指 的是 由一个 基 因组 表 达 的
全部 蛋 白质 。 由 澳 大 利 亚 Ｍａｑ ａｉ 学 的 Ｗ ｉ ｉｓ ｃｕｒ ｅ大 ｌ ｎ ｋ 于 １９ ９ ４年 最 早 提 出 ， 首 次 在 １ ９ 并 ９ ５年 ７月 的 “ ｌ — Ｅｅ ｃ ｔ ｐ ｏｅｉ 上发 表 。蛋 白质组 学 的研 究 领 域 包 括 以下 ｒ ｈ ｒｓ ” ｏ ｓ ３个方 面 ： 蛋 白质 大 规 模 鉴 定 和 转 录 后 修 饰 的微 特 ①
肿瘤中的蛋白质表达这篇文章将介绍肿瘤中的蛋白质表达包括如何通过蛋白质表达来诊断和治疗恶性肿瘤
肿瘤中的蛋白质表达这篇文章将介绍肿瘤中的蛋白质表达包括如何通过蛋白质表达来诊断和治疗恶性肿瘤肿瘤中的蛋白质表达肿瘤是一种严重影响人类健康的疾病，而蛋白质表达在肿瘤的发展过程中起着重要作用。
本文将就肿瘤中的蛋白质表达进行介绍，并探讨如何通过蛋白质表达来诊断和治疗恶性肿瘤。
一、蛋白质与肿瘤蛋白质是生命体中最为重要的分子之一，对维持生命活动起着至关重要的作用。
在肿瘤中，蛋白质的表达常常发生异常变化，这些异常表达的蛋白质往往与肿瘤的发展和转移密切相关。
因此，研究肿瘤中的蛋白质表达对于了解肿瘤的发病机制以及发展更有效的诊断和治疗方法具有重要意义。
二、蛋白质表达的诊断意义1.标志物的发现肿瘤特异性标志物是指在肿瘤组织或体液中常见的具有肿瘤特异性的蛋白质，对肿瘤的早期诊断和疗效监测具有重要的临床意义。
通过研究肿瘤中特异性的蛋白质表达水平的变化，可以发现新的肿瘤标志物，为肿瘤的早期诊断提供更为可靠的依据。
2.肿瘤分型和分级肿瘤的分型和分级对于选择适当的治疗方案具有重要意义。
通过检测肿瘤中不同蛋白质的表达水平，可以帮助确定肿瘤的类型和分级，从而指导个体化的治疗策略。
三、蛋白质表达的治疗意义1.靶向治疗蛋白质通过调控细胞的信号传导途径和转录调控网络，参与调节细胞的生长、分化、凋亡等生物过程。
因此，通过干扰肿瘤中异常表达的蛋白质，可以破坏肿瘤细胞的正常功能，达到治疗的效果。
2.免疫治疗肿瘤细胞往往能够逃避机体的免疫监视，通过改变蛋白质的表达水平，控制细胞的凋亡和增殖等功能，从而逃避免疫系统的攻击。
通过研究肿瘤中蛋白质的表达情况，可以发现新的免疫治疗的靶点，为免疫治疗的有效性提供依据。
四、未来发展方向目前，蛋白质表达在诊断和治疗肿瘤中已经取得了显著的进展。
然而，仍然存在许多挑战，如检测技术的灵敏度和特异性仍待提高，个体化的治疗策略仍需进一步研究。
未来的发展方向包括基因组学、蛋白质组学、代谢组学等多学科交叉研究的发展，旨在揭示肿瘤发生发展的复杂机制，并提供更为准确有效的肿瘤诊断和治疗方法。
基因组学和蛋白质组学在肿瘤研究中的应用
基因组学和蛋白质组学在肿瘤研究中的应用随着科技的不断发展，人类对于疾病的了解也在逐步深入。
其中，肿瘤的研究一直备受关注。
基因组学和蛋白质组学作为现代生命科学的两个重要分支，在肿瘤研究中发挥着越来越重要的作用。
一、基因组学在肿瘤研究中的应用肿瘤的发生与基因异常密切相关，而基因组学正是以基因为研究对象的学科。
因此，基因组学在肿瘤研究中有着重要的应用。
1. 肿瘤基因组测序肿瘤基因组测序是指将癌细胞和正常细胞的基因组进行比对，以发现癌细胞中的所有突变。
通过比对，可以揭示肿瘤基因的突变情况以及是否存在潜在的致癌基因。
这可以为相关的治疗提供重要依据。
2. 肿瘤基因的序列分析肿瘤基因的序列分析是对肿瘤基因进行全面检索的过程。
这种方法可以用于寻找突变和异常基因，也可以用于测定这些基因与其他相关基因的相互作用。
3. 肿瘤基因组的分类和预测通过对肿瘤基因组的深入研究，可以为现实的疗法制定和效果监测提供重要依据。
例如，基于某些基因的表达，可以将癌症分类为“高风险”和“低风险”类型，这有助于治疗方案的制定和治疗效果的预测。
二、蛋白质组学在肿瘤研究中的应用在肿瘤研究中，蛋白质组学被广泛用于探索肿瘤蛋白的结构、功能和代谢途径。
1. 肿瘤蛋白的识别和检测蛋白质组学技术可以用于肿瘤蛋白的识别和检测。
研究员可以采用质谱法或免疫生物化学等技术，寻找癌症标志物或检验癌症治疗中的药物效果。
2. 蛋白质修饰的研究蛋白质修饰是指一系列非氨基酸序列的化学修饰。
在很多情况下，肿瘤的发生与蛋白质的异常修饰有关。
学者们通过分析肿瘤蛋白的修饰情况，为肿瘤的治疗提供了重要思路。
3. 代谢途径的研究肿瘤生长和代谢途径的研究表明，肿瘤代谢向糖、脂肪、氨基酸和核苷酸等方向转变，通过对这些途径的研究，可以为癌症的治疗提供重要依据。
三、基因组学和蛋白质组学在肿瘤研究中的互补应用基因组学和蛋白质组学在肿瘤研究中有着互补的作用。
基因组学揭示癌症基因的突变和表达变化，为蛋白质组学提供了基础数据，而蛋白质组学则揭示了肿瘤代谢和蛋白质修饰等生物学机制。
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蛋白质组学与肿瘤研究
一 什么是蛋白质组学 二 肿瘤产生的相关机理 三 蛋白质组学在肿瘤研究中的应用 四 前景与展望
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技术与平台 样品制备 ↓
蛋白质分离 ↓
蛋白质鉴定 ↓
生物信息学
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，蛋白质组学与肿瘤研究
（一）蛋白质组学
蛋白质组（proteome）一词由Wilkins于1994年首 次提出，意指一个细胞或一个组织的基因组所表达 的全部蛋白质。它是一个在空间和时间上动态变化 着的整体。蛋白质组学（proteomics）是指应用各种 技术手段来研究蛋白质组的一门新兴学科，其目的 是从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成 成分，表达水平与修饰状态，了解蛋白质之间的相 互作用与联系，揭示蛋白质功能与细胞生命活动规 律
（1）比较蛋白质组学：运用蛋白质组学研究技术，比较肿 瘤组织（细胞）与其起源的正常组织（细胞）或肿瘤发展 不同阶段组织中蛋白质在表达数量、表达水平和修饰状态 上的差异，可以发现与癌变相关的特异蛋白质，这些肿瘤 相关的特异蛋白质不仅可为研究肿瘤发病机理提供线索， 而且可作为肿瘤诊断和治疗的生物标志物[7 例如将肿 瘤相关基因转染细胞，制备肿瘤相关基因转基因小鼠、基 因敲除小鼠或利用RNA干扰技术封闭其表达，再应用蛋白 质组学技术分析相应模型蛋白质组的变化，有可能发现肿 瘤相关基因所调控的蛋白质，为揭示其功能和致瘤机理提 供线索
从分子水平看：肿瘤是由于DNA RNA病毒等生物因素，
亚硝胺类等化学因素，X射线等物理因素引起细胞内蛋白 质等的结构发生改变而引起的，特别是蛋白质的改变，因 此我们研究蛋白质对于抗肿瘤特别有意义。
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肺肿瘤
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（三）蛋白质组学在肿瘤研究中 的应用
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技术与平台
蛋白质组学与肿瘤研究
（1） 样品制备 通常使用蛋白质样品溶解液 或细胞裂解缓冲液从细胞，组织或其他体液中尽 可能完整地将蛋白质以溶解状态提取出来，并将 其他杂质（DNA，糖类，脂类等）去除。
LCM [3]（laser capture microdissection，激光捕 获微切割）技术是最近发展起来的一种提取肿瘤 细胞的技术，成功地解决了组织中的细胞异质性 问题，是提取肿瘤细胞最理想的方法。
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（二）肿瘤产生的相关机理
中医观点：一般正常人的气升降出入，是循环畅通的。
但在内、外因素影响下，致使气的功能失调，引起气的郁 滞。气滞日久，必然血瘀；气滞血瘀，积久成块 。或由于 火毒内蕴，情志化火血遇火则凝结，气血紊乱，堵塞经络， 久则凝结成块。大多数癌瘤，是由于情志郁结，过于劳累， 饮酒过多，或病毒侵袭。或某些特别刺激，致使生理机能 反常，局部组织变形、变性。
蛋白质组学与肿瘤研究
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摘要
肿瘤标志物是细胞在特定疾病状态下的分子信号, 是检测、诊断、治疗、监测肿瘤和判断肿瘤预后 的重要工具。如何发现新的、具有高度特异度和 灵敏度的肿瘤标志物多年来一直是肿瘤研究的热 点之一。蛋白质和蛋白质组学研究的快速发展给 肿瘤标志物研究注入了新的活力。运用比较蛋白 质组学研究揭示肿瘤发病机理，寻找肿瘤诊断和 治疗的靶标，血清蛋白质组学研究寻找肿瘤相关 抗原，是蛋白质组学寻找肿瘤标志物的主要路线。 目前运用蛋白质组学方法已在多种肿瘤如肺癌， 肝癌，胃癌，结直肠癌，膀胱癌，肾癌等中找到 有差异表达的蛋白质，这些蛋白有望成为有效的 肿瘤标志物。
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（4）生物信息学：生物信息学是随着人类 基因组计划、计算机技术、网络技术的发 展而诞生的一门新兴学科，它是蛋白质组 学研究中不可缺少的一部分。生物信息学 在蛋白质组学研究中有两个重要应用： 一 是分析和构建双向凝胶电泳图谱， 二是搜 索与构建蛋白质组数据库。目前应用最普 遍的数据库是NRDB和dbKST数据库。
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（3）蛋白质鉴定 蛋白质鉴定主要包括 氨基酸组成分析，序列分析，肽质量指纹 图分析和肽序列标签分析等。其中，肽质 量指纹图（poptide mass finger print，PMF） 分析是对蛋白质酶解后的多肽混合物进行 质谱分析。质谱鉴定的主要原理是根据样 品电离后样品离子的质量电荷比（m/z）的 差异分离样品
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（2）血清蛋白质组学 从肿瘤
免疫学的观点来看，肿瘤细胞是“非 已细胞”，肿瘤细胞总是或多或少地 表达区别于正常细胞的肿瘤抗原，因 而，在患者血清中极有可能存在其相 应的抗体。 可分为四步：
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（1）首先采用2-DE分离肿瘤组织、癌旁正常组织 的蛋白质
（2）与患者或正常人血清中的某一类免疫球蛋白 建立Western blot反应图谱，通过计算机分析确定 差异反应的蛋白质斑点
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蛋白质组学与肿瘤研究
（2）蛋白质分离： 目前，蛋白质组学研究中蛋白质分离 的主流技术仍然是双向凝胶电泳（two-dimensional gel electrophoreus，2-DE），但是，以2-DE为基础的蛋白质组 学技术存在固有的缺陷：上样量的限制使低丰度蛋白质难 以检测到，低溶解度和极大（＞200 kD）、极小（＜10 kD） 和极端等电点值（pI）蛋白无法进入2-DE技术的有效分离 范围内，故难以通过2-DE技术进行分析。目前多采用多维 色谱技术。在蛋白质组学的定量研究方面，荧光差示电泳 （differential gel electrophoresis，DIGE）技术以及同位素亲 和标签技术（isotope coded-attinity tags，ICAT），可实现对 蛋白质的定量分析[1]。
（3）采用质谱分析和生物信息学方法对平行胶 （replica gel）中相应的差异蛋白质点进行鉴定， 筛选出肿瘤相关抗原
（4）用其他肿瘤组织和正常组织对肿瘤相关抗原 的特异性进行分析
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（3）蛋白质芯片 以蛋白质或多
肽为材料，可以从微量的样品中检测成 千上万个蛋白质或多肽，用于分析差异 表达的蛋白质及药物靶标的筛选和鉴 定 。 目前应用最多的是表面增强激光 解吸离子化（SELDI）蛋白质芯片技术。