中国青藓科(Brachytheciaceae)植物分子系统学研究
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中国青藓科(Brachytheciaceae)植物分子系统学研究
【摘要】:青藓科(Brachytheciaceae)是侧蒴藓类中最大的科之一,其形态特征变化较大,在很大程度上表现出平行演化的特征,而且易受环境的影响,因此,青藓科的属间、属内种间在分类上一直存在很多争议。本研究共收集2000余份青藓科新鲜标本,根据向国外主要标本馆借阅的近百份模式标本,确定中国青藓科植物59种,其中《中国苔藓志》未报道的有3种(Rhynchostegiumpatulifolium,R.celebicum,Eurhynchiumpulchellum),中国特有种15种。在收集标本的基础上,通过分子系统学的研究,运用叶绿体基因片段trnL-F和psbT-H以及核基因片段ITS2序列,按照NJ、MP、ML、BI法则分别构建中国青藓科植物的系统发育树,并结合形态学特征对青藓科在分类中存在的问题进行深入的讨论,在此基础上提出中国青藓科新的分类系统,研究的主要结论如下:1.分子数据所构建的系统树显示,大多数Brachythecium种类分成2个分支,因此根据系统树的结构可以把青藓属分成两个属:Sciurohypnum和Brachythecium,前者包括Sciurohypnumplumosum,S.reflexum,S.populeum,S.moriense,S.amnicolum,S.viridefactum等;后者主要包括其他Brachythecium 种类。同时提出新组合:Sciurohypnummoriense(Besch.)LiuetY.F.Wang、S.amnicolum(C.Muell.)LiuetY.F.Wang、S.viridefactum(C.Muell.)LiuetY.F.Wang。2.分子证据证明了
Oxyrrhynchium作为属的地位的确立,并提出3个新组合:Oxyrrhynchiumfiliforme(C.Muell.)LiuetY.F.Wang;Oxyrrhynchiumpatulifolium(CardotTher.)LiuetY.F.Wang;Oxyrrhynchiumcelebicum(Lac.)LiuetY.F.Wang。至此,中国Oxyrrhynchium种类有:O.savatieri、O.hians、O.filiforme、O.laxirete、O.patulifolium、O.celebicum、O.vegans7个种。3.Rhynchostegiumriparioides(Platyhypnidiumriparioides)始终在Rhynchostegium分支中,并且具有很高的支持率,不支持Platyhypnidium作为属的地位处理。4.Bryhnia是一个多系类群,Bryhnianovae-angliae和B.trichomitria构成了Bryhnia的核心类群。分子证据证明,Bryhniaserricuspis应作为Kindbergiapraelonga的异名。5.Tomentypnumnitens始终聚在外类群中,因此,本研究支持Heden(?)s 的观点,将Tomentypnum从青藓科中调出。6.Okamuraea和Rhynchostegiella、Cirriphyllum聚在一个分支中,该结果和Ignatov,Huttunen,Tsubota等的研究结果一致,支持Okamuraea调回青藓科的观点。7.Rhynchostegiellalaeviseta在系统树中始终聚在Brachythecium分支中,因此,将该种调到Brachythecium中,提出Brachytheciumlaeviseta(Broth.)LiuetY.F.Wang新组合。8.在系统树中Rozea、Isothecium、Duthiella的种类,毫无例外地聚到了外类群中,因此分子证据证明这三个属不应放到青藓科中。根据本项研究的结果,提出中国青藓科植物有14个属:Brachythecium,Bryhnia,Sciurohypnum,Kindbergia,Myuroclada,Camptothecium,
Oxyrrhynchium,Cirriphyllum,Okamuraea,Rhynchostegiella,Rhynchostegium,Palamocladium,Eurhynchium,Homalothecium;在《中国苔藓植物志(第七卷)》记录的属的基础上新增加4个属:Sciurohypnum、Oxyrrhynchium、Okamuraea、Kindbergia。提出Tomentypnum不属于青藓科。认为Rhynchostegium,Palamocladium,Homalothecium种类是青藓科的基部类群。本研究结果不支持HuttunenIgnatov将青藓科分成4个亚科的观点。对鼠尾藓Myurocladamaximowiczii形态及遗传多样性的研究表明,鼠尾藓具有较高的多样性水平。不同居群间的遗传距离和它们的地理距离在一定范围内存在相关性。鼠尾藓的叶细胞的大小及叶尖长短在居群间具有一定程度的变异,因此,推测这些形态特征是受环境因素影响,代表了种下水平的差异;而叶片的形态在居群间变异较小,则很好地代表了这个种的特征。该部分研究还探讨了形态变异和遗传多样性的关系,为种、亚种或变种的界定提供了参考。本研究利用trnL-F、psbT-H 基因片段以及核ITS2序列,结合形态学特征,对中国青藓科植物(包括中国特有种15种)进行全面系统的研究和分析,提出7个新组合,将1个属排除在青藓科之外,同时在现有记录的基础上,新增加4个属。通过分子系统学研究指出了青藓科分类系统中的一些问题,为青藓科及其相关科属的系统研究提供翔实的分子资料。【关键词】:青藓科侧蒴藓类系统发育遗传多样性trnL-FpsbT-HITS2新组合
【学位授予单位】:华东师范大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2007
【分类号】:Q941
【目录】:摘要6-8Abstract8-13第一章青藓科系统学研究进展13-391.1青藓科植物简介13-191.1.1青藓科(Brachytheciaceae)的主要分类特征13-171.1.2青藓科在藓类植物中的系统位置17-191.2世界青藓科研究历史19-251.2.1种级水平分类研究19-201.2.2属级水平分类研究20-231.2.3科级水平分类研究23-251.3我国青藓科的研究现状和存在的问题25-261.4研究方法及意义26-391.4.1研究目的和意义26-281.4.2系统发育分析方法及原理28-341.4.3研究方法34-381.4.4技术路线38-39第二章青藓科植物的系统发育分析39-942.1实验材料和方法39-532.1.1实验材料39-472.1.2实验方法47-532.1.2.1标本的鉴定472.1.2.2总DNA的提取47-502.1.2.3特定基因片段的扩增及测序50-512.1.2.4数据分析51-532.2结果和分析53-712.2.1序列的特点53-572.2.2数据分析57-582.2.3系统发育分析58-712.2.3.1基于ITS2+trnL-F合并数据集的系统发育分析58-652.2.3.2基于ITS2+trnL-F+psbT-H合并数据集的系统发育分析65-712.2.3.3总结712.3讨论71-942.3.1分析方法71-722.3.2青藓科分类问题探讨72-922.3.3尚需进一步研究的内容92-94第三章燕尾藓属(Bryhnia)主要种类的系统发育分析及其与邻近属的关系94-1103.1前言94-953.2