PubMed检索教程
pubmed高级检索步骤
pubmed高级检索步骤嘿,朋友们!今天咱就来唠唠 PubMed 的高级检索步骤,这可真是个超有用的技能哦!首先呢,你得找到 PubMed 的界面,就像进家门得先找到家门在哪儿一样。
然后呢,在检索框旁边找到那个“高级”按钮,嘿,这就相当于打开了知识宝库的大门啦!进入高级检索界面后,哇哦,各种选项就像琳琅满目的宝贝等你去挑选。
你可以根据关键词、作者、期刊等等来设定条件。
比如说,你想找关于某个特定疾病的研究,那就把疾病的名字输进去呀,这就像在茫茫人海中精准定位到你要找的那个人一样。
接着呢,你还可以设置时间范围。
哎呀呀,这可太重要啦!你总不能想要找几十年前的老古董资料吧,除非你是在研究历史呢!所以根据你的需求,选好合适的时间段,就像在时间的长河里捞出你想要的那一段。
还有哦,你可以通过选择研究类型来进一步缩小范围。
是临床试验呢,还是基础研究呢,或者是综述呀?这就好比你去超市买东西,是要买菜呢,还是买零食呢,或者是生活用品呢,得明确自己的目标呀!另外呀,可别小看了那些筛选条件,就像筛子一样,能把不符合你要求的都筛掉。
比如说,你只想看英文的文献,那就把语言那一栏选成英文呗,多简单呀!在设置这些条件的时候,可别手忙脚乱的,要像个将军一样指挥若定。
每一个选项都是你的小兵,你要让它们为你冲锋陷阵,找到你最需要的信息。
当你把所有的条件都设置好啦,就像搭好了一座稳固的桥梁,然后点击检索按钮,哇塞,一瞬间,大量的相关文献就出现在你眼前啦!这感觉,是不是超级棒?就好像你在知识的海洋里畅游,看到了无数的宝藏在向你招手。
哎呀,学会了 PubMed 的高级检索步骤,那可真是如虎添翼呀!以后不管是写论文、做研究,还是单纯地想扩充自己的知识储备,都能轻松搞定啦!不用再像无头苍蝇一样乱撞啦!所以呀,朋友们,赶紧去试试吧,相信你们一定会爱上这个强大的工具的!加油哦!。
PubMed使用教程指南
引言概述
PubMed是一个公认的医学文献数据库,由美国国家医学图书馆(NLM)开发和维护。
这个教程指南是第二部分,旨在深入介绍如何使用PubMed数据库来检索医学文献,并提供一些高级功能和技巧。
正文内容
一、使用MeSH(医学主题词)进行高级检索
1.了解MeSH的概念和分类体系
2.使用MeSH浏览器来查找和浏览主题词
3.利用MeSH词汇筛选器进行高级检索
4.使用MeSH树进行链式搜索
5.了解MeSH组合词的使用方法
二、使用文献筛选器和高级检索器
1.使用高级检索器来限定检索结果
2.利用文献筛选器进行精确的文献检索
3.使用搜索历史和搜索详情来追踪检索过程
4.利用查询器来创建复杂的检索语句
5.使用MeSH流行趋势来了解当前研究热点
三、利用搜索工具和文献管理器
1.使用索引工具来查找文章的相关信息
2.使用MyNCBI创建和管理文献收藏夹
3.使用单击目录搜索相关文献
4.使用外部工具和来获取全文和其他资源
5.使用CitationMatcher进行文献引用的匹配
四、了解首选项和界面定制
1.个性化设置首选项和搜索界面
2.添加和删除搜索工具和菜单
3.自定义搜索结果的显示格式
4.创建个人帐户并管理订阅邮件和提醒
5.利用网站帮助和文献教育资源进行学习和培训
五、了解常见问题和解决方案
1.如何处理搜索结果过多或过少的情况
2.如何处理重复文献和非相关文献
3.如何使用布尔运算符进行复杂的检索
4.如何处理缺失的全文和报告
5.如何解决其他常见问题和疑问
总结。
pubmed检索教程(课堂PPT)
stroke[ti] thrombolysis[ti]
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2020/8/8
三、PubMed 基本检索规则
著者检索:姓全称在前,名首字母在后,[au]。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
思考题:中国学者的名字该如何转换呢? 如: 闻玉梅 卢正宏
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2020/8/8
三、PubMed 基本检索规则
国际标准期刊号
美国立医学图书馆识别号
20
期刊全称
2020/8/8
最后修订日期
规范词表词
规范词确立日期
系统组织的文摘
版权拥有者
题录提供机构的识别号
病史相关与原始记录
据库检索。
PubMed等文献数据。
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2020/8/8
(二) PubMed的特点
广域网免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取) 提供检索词智能转换匹配 界面简洁,操作简便(须IE7.0以上版本)
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2020/8/8
(三) PubMed收录数据
MEDLINE Indexed
促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。
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2020/8/8
NCBI网站
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NCBI提供的数据库
检索大分子生物学数据
获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列;
获 取 Swiss-port,PIR,PRF,PDB 等 蛋 白 质 序 列 , 从核酸序列翻译到蛋白质的序列;
获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据 及大分子模式(MMDB)等其他生物信息数
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2020/8/8
一、 PubMed简介
开发机构:
pubmed引文检索
pubmed引文检索
在PubMed上进行引文检索(Citation Search)是一种查找特定文献的方法。
这允许你查找引用了或被引用了某一篇文章的其他文章。
以下是在PubMed上执行引文检索的一般步骤:
1.搜索原始文章:进入PubMed,使用文章的标题、作者或PMID(PubMed唯一标识符)等信息,找到你感兴趣的原始文章。
2.进入文章页面:点击文章标题,进入文章的详细页面。
3.找到引文选项:在文章详细页面中,查找引文或相关记录的选项。
通常,这个选项位于页面的右侧或下方。
4.进行引文检索:点击引文或相关记录的链接,这将显示引用了或被引用了原始文章的其他文章列表。
5.筛选和浏览引文:根据需要,你可以使用PubMed提供的筛选选项来缩小结果,例如按日期、文章类型等。
浏览引文列表,找到你感兴趣的文献。
6.查看引文详细信息:点击引文列表中的文献标题,以查看有关该文献的详细信息。
请注意,有时不是所有的引文信息都会在PubMed中显示,这取决于文献的可用性和PubMed数据库的更新。
此外,引文检索的准确性也受到引用格式和文献数据库互操作性的影响。
PubMed检索指南
PubMed检索指南1.PubMed基本检索方式(Basic PubMed Search)进入PubMed基本检索方式主页,在检索框中可以输入任意词,包括文献作者,出版杂志等:∙键入一个或多个检索词(可以为任意词),如protein disulfide isomerase ,也可以输入缩略名如pdi等;输入多个词时,可自动识别成词组;但词数太多时,则以逻辑与的方式识别,如可以将protein disulfide isomerase识别成一个词,也有可能将其识别成“protein AND disulfide AND isomerase”尤其是出现数字等符号时不易识别成词组;∙对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”∙以文献作者方式检索,作者名的输入格式为:姓+名如输入:Freesman DJ ,其中“姓”为全称,“名”则为首字母简写形式(“名”可以省略);∙键入的杂志名称可以是全名,也可以是杂志名的MedLine缩写格式∙或ISSN杂志号(见期刊浏览)。
∙检索时可在词尾加“*”号检索所有具有同样词头的词。
如键入:biolog*可查得biology或biological 等词。
PubMed可将多个词以词组形式查询,对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”将识别成词组“Insight II”以方式查询,若键入:Insight II则有可能分开识别成“Insight” 和“II”两个词,以逻辑与“Insight AND II”的方式进行检索。
词与词间可用AND、OR或NOT逻辑进行连词检索。
键入检索词后,别忘了选择检索年限(30天,10年不等)及选择文献的页面显示数目。
按Enter回车键或鼠标击话界面中的“Search”按钮可得到查询文献提要(document summary page)。
2.PubMed高级检索方式 (Advanced Search)与基本检索方式不同的是增加了检索范围(search fields).和检索模式(search mode)的选择框。
PubMed数据库检索教程培训课件
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直接输检索词,查询 结果是与输入词相关
的主题词,共8个
PubMed数据库检索教程
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主题词/副主题词选择
主题词 副主题词
选择主/副主题词 后,送到检索框
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主要主题词 下位词扩展
加权检索,即查重 点论述的主题, 提高文献相关度
PubMed数据库检索教程
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COMPANY LOGO
PubMed数据库检索教程
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查看邮件
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PubMed数据库检索教程
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邮件保留相关链接
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PubMed数据库检索教程
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期刊网站全文(网页格式)
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PubMed数据库检索教程
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PMC原文
COMPANY LOGO
注意限定条件的使用 与修改
PubMed数据库检索教程
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Summary显示(默认格式)
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题名
作者
出处(刊名、年、卷、期、页)
PMID 相关链接
检索明 细框
PubMed数据库检索教程
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改变显示格式
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PubMed数据库检索教程
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摘要显示及全文链接
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树状结构表
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款目词(同 义词)
系统自动扩展 检索
❖了解同一概念的同义词、近义词,供自由 词检索参考;
❖根据树形结构调整检索词
缩小:不扩展下位词,或选用某个下位词; 扩大:选用上位词,或选用多个同位词;
pubmed检索英文文献的步骤
pubmed检索英文文献的步骤要进行PubMed检索英文文献,可以按照以下步骤进行:1. 访问PubMed网站,打开浏览器,输入"/pubmed",进入PubMed网站的首页。
2. 定义研究主题,明确你感兴趣的研究主题,可以是某个特定的疾病、医学领域或者其他相关主题。
3. 使用关键词进行检索,在PubMed首页的搜索框中输入与你的研究主题相关的关键词。
关键词应该是具体而明确的,以便缩小搜索范围。
4. 高级搜索选项,如果你想进一步精确搜索结果,可以使用高级搜索选项。
点击搜索框旁边的"Advanced"按钮,可以在更多的搜索字段中输入关键词,如作者、期刊、出版日期等。
5. 筛选搜索结果,当你点击搜索按钮后,PubMed将会显示与你关键词相关的文献列表。
可以根据自己的需要使用筛选选项来缩小搜索结果的范围,如出版日期、文章类型、文献来源等。
6. 阅读摘要和全文,在搜索结果中,你可以点击文章标题或摘要以获取更多信息。
摘要通常提供了文章的简要概述,帮助你判断是否与你的研究主题相关。
有些文章可能提供免费全文,可以直接阅读,而有些文章可能需要付费或订阅才能获取全文。
7. 下载文献,如果你找到了感兴趣的文献,可以选择下载或保存文献的选项。
这样你就可以在离线状态下阅读或打印文献。
8. 引用和相关文献,在每篇文献的页面上,你可以找到该文献的引用和相关文献。
这些引用和相关文献可能对你的研究有帮助,可以进一步扩展你的文献检索范围。
9. 检索历史和搜索提醒,PubMed还提供了检索历史和搜索提醒的功能。
检索历史可以帮助你回顾之前的搜索记录,搜索提醒可以让你及时获取最新的相关文献。
总结起来,PubMed检索英文文献的步骤包括访问PubMed网站、定义研究主题、使用关键词进行检索、使用高级搜索选项、筛选搜索结果、阅读摘要和全文、下载文献、查找引用和相关文献,以及利用检索历史和搜索提醒功能。
pubmed高级检索方法
pubmed高级检索方法一、pubmed高级检索基础1.1 首先呢,pubmed是个超棒的医学文献宝库。
它的高级检索功能就像一把神奇的钥匙,能让你更精准地找到你想要的东西。
咱别小看这个功能,它就像一个隐藏的宝藏地图,要是会用,那可真是如鱼得水。
1.2 你得知道,pubmed高级检索界面有很多选项。
就好比一个大超市,每个货架都有不同的东西。
这里的选项就是那些货架,你得清楚每个货架放的是啥,才能快速找到你需要的“商品”,也就是文献啦。
二、检索字段的运用2.1 比如说作者字段。
这就像找人一样,你知道作者是谁,那就直接在作者字段里输入作者的名字。
这就好比你在人群里找一个熟人,直接喊他名字就好啦。
不过有时候作者名字可能有多种写法,你得像个侦探一样,把可能的写法都试试,可不能一根筋。
2.2 还有标题字段。
如果一个文献的标题里有你想要的关键词,那在标题字段检索就像瓮中捉鳖一样容易。
标题可是文献的招牌,往往包含了核心内容。
你要是想找关于某种疾病特定治疗方法的文献,在标题里搜这个治疗方法的名字,很可能就一击即中。
2.3 期刊字段也不能忽视。
你要是对某个期刊特别感兴趣,或者知道你要找的文献大概率发表在某个期刊上,那就在期刊字段里输入期刊名。
这就像你知道一个人住在某个小区,直接去那个小区找他就对了,省得满世界乱找。
三、布尔逻辑运算符的使用3.1 AND这个运算符啊,就像是交朋友里的“志同道合”。
你输入两个关键词,中间用AND连接,那搜索出来的文献就是同时包含这两个关键词的。
比如说你搜“糖尿病 AND 胰岛素”,那找出来的文献就是既和糖尿病有关,又提到胰岛素的,这样就把范围缩小得很精准了。
3.2 OR这个运算符呢,有点像广撒网。
当你输入两个关键词,中间用OR连接,搜索出来的文献只要包含其中一个关键词就会被显示。
比如“感冒 OR 流感”,那只要是关于感冒或者流感的文献都会出来。
这在你不确定具体用词或者想扩大搜索范围的时候很有用,就像你想找水果,苹果或者香蕉都可以满足你吃水果的愿望,这里的苹果和香蕉就相当于不同的关键词啦。
pubmed检索方法与技巧
pubmed检索方法与技巧Pubmed是生命科学领域最重要的文献检索工具之一、它提供了广泛的生命科学文献库,包括医学、生物学、药学和健康科学等领域的文献。
Pubmed的检索方法和技巧对于有效地和获取相关文献非常重要。
以下是一些常用的Pubmed检索方法和技巧:1. 关键词检索:使用关键词是Pubmed检索的基本方法。
关键词应该准确描述你所感兴趣的主题。
你可以使用与主题相关的单词、短语和术语进行检索。
同时注意使用同义词和近义词来扩大检索范围。
2. 语法:Pubmed支持使用逻辑运算符来组合多个词和短语。
常用的逻辑运算符包括AND(交集)、OR(并集)和NOT(排除)。
例如,使用"lung cancer AND smoking"将会检索到包含这两个关键词的文章。
3. MeSH主题词检索:MeSH(Medical Subject Headings)是Pubmed特有的主题词索引系统。
使用MeSH主题词可以更精确地检索相关文献。
你可以在Pubmed网站上找到MeSH数据库,然后主题词并将其添加到检索中。
4. 过滤结果:在Pubmed中,你可以使用多种筛选器来缩小结果范围。
例如,你可以使用年份范围、文章类型(如临床试验、回顾性研究等)、出版物类型(如期刊文章、综述等)和语言等来过滤结果。
5. 设置提醒:Pubmed提供设置提醒的功能,这样你可以根据自己的兴趣和需求定期获取最新的相关文献。
你可以创建保存结果或使用特定的词或主题来设置提醒。
6. 利用专业数据库:除了Pubmed之外,还有其他一些专业数据库也可以用于文献检索。
例如,Scopus、Embase和Web of Science等都是重要的文献检索工具,可以在组合使用它们与Pubmed一起使用以获取更全面和准确的文献信息。
8.限制范围:如果你想获取特定类型的文献,可以使用限制器来缩小范围。
例如,你可以限制文章类型为临床试验、人类研究或动物研究等来获取特定类型的文献。
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法【原创版4篇】目录(篇1)I.检索PubMed的意义II.PubMed的检索方法III.PubMed检索结果的展示和筛选IV.检索PubMed的注意事项正文(篇1)I.检索PubMed的意义PubMed是全球最大的生物医学数据库之一,提供了大量的生物医学文献资源。
对于研究人员、医学专业人士和学生来说,了解和掌握PubMed的检索方法,可以帮助他们快速找到所需的文献。
II.PubMed的检索方法1.打开PubMed网站,输入网址:https:///2.在页面左侧导航栏中选择“Search”按钮,进入检索页面。
3.在检索页面中,可以选择不同的检索方式,如关键词、作者、出版日期等。
4.输入检索词后,点击“Search”按钮,即可得到相关的检索结果。
III.PubMed检索结果的展示和筛选1.检索结果会按照相关度排序,用户可以选择不同的排序方式。
2.每个检索结果都包含标题、摘要、作者、出版日期等信息。
3.对于需要进一步阅读的文献,可以点击“Open”按钮,查看全文。
4.可以通过筛选条件,如主题、关键词、学科领域等,缩小检索范围。
IV.检索PubMed的注意事项1.避免使用过于具体的检索词,以免得到过多的无关结果。
2.对于复杂的检索需求,可以使用逻辑运算符和短语检索等方式进行组合检索。
目录(篇2)I.引言A.为什么需要pubmed文献检索方法B.pubmed简介II.pubmed文献检索方法A.如何使用pubmed1.输入关键词2.选择检索结果3.查看文献详情B.pubmed的优点1.方便快捷2.检索结果全面3.文献质量较高C.pubmed的不足1.检索结果可能不全面2.文献质量可能较低3.检索结果可能存在误导III.结论A.pubmed文献检索方法的重要性和实用性B.如何利用pubmed进行有效的文献检索正文(篇2)pubmed文献检索方法是一种非常实用的工具,可以帮助科研人员快速、准确地检索到所需的文献。
PubMed使用教程指南
2024/9/21
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一、基本检索
6.期刊检索
2024/9/21
发送至检索恇
点击选中
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一、基本检索
6.期刊检索
2024/9/21
点击执行检索
21
一、基本检索
6.期刊检索
2024/9/21
检索成果
22
二、辅助检索区
1.Limit (限定检索) 2.Preview/index(预览/索引) 3.History(检索史) 4.Clipborard(剪贴板) 5.Detail(检索式详览)
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2024/9/21
环节1 点击预览和索引
环节2 输入待选词
环节4 拟定与检索栏中 检索提问旳逻辑关系
环节3 索引选词
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3.History(检索史)
▪ 检索式回忆 ▪ 编辑检索式 ▪ 如#3 AND child
2024/9/21
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检索历史回忆
2024/9/21
检索式
检索时间 检出篇数
检索式编号可替代检索式进行输入检索
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2024/9/21
点击有关规范词
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2024/9/21
选择检索 选择副主题词
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执行检索
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检索成果 题录:著者、篇名、刊名
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2.阿司匹林治疗心肌梗死
2024/9/21
首先,将概念切提成2个面: Aspirin/治疗应用 心肌梗死/药物治疗
然后,分别进行规范词选择检索
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2024/9/21
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2024/9/21
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2024/9/21
PubMed中文使用手册 (PDF)
PubMed中文使用手册Jeffrey Wu(一)PubMed简介:PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。
PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
(二)页面介绍:(更新很快,但其内容变化一般不大)在你的浏览器中的URL地址框中健入/pubmed/并单击回车键后,你将进入Pubmed的主页面。
如图:1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby和tutorial为最新加入的)MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
Old PubMed (使用以前的PubMed查询方式)关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。
Related ResourcesOrder Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。
pubmed检索方法
4.1 字段选择
可选择:所有字段(All Fields)、作者地址、作者姓名、期刊名、ISSN号码、语种、MeSH词、副主题词、页码、出版日期、自由词、标题词、期刊卷号、数据库更新代码、物资名称等22个选项,默认选项为All Fields。
4.2必须有摘要的文献(Only Items with Abstracts )
4.9 文献进入MEDLINE的时间
有30天、60天、90天、180天、1年、2年、5年和10年选择。
4.10 出版或进入MEDLINE的时间段
应输入时间范围。按照年/月/日的格式。
5. 利用预览/索引(Preview/Index)检索
使用预览/索引可以:预览检索出的文献数量,加快显示速度、一次性地增加检索词来精确检索、增加检索词来检索某些特殊领域、从索引中查看和选择检索词。例如:要检索以"chickenpox"为头的MeSH词,先选择在下拉式菜单的MeSH Terms,在检索框内输入chickenpox,再点击Index按钮。滚动索引Index窗,高亮显示"chickenpox vaccine",点击AND按钮,"Chickenpox vaccine" 就会出现在检索提问框内。 注意: Preview/Index 只能显示最近三次检索的预览结果。而历史(History)窗口能显示多达过去100次的检索请求。
为复选框,选中后检索出的文献均有摘要。注意1975年前的文献是没有摘要的。
4.3 出版形式(Publication Types)
包括: Clinical Trial 临床试验;Editorial 编辑按语;Letter 读者来信;Meta-Analysis 荟萃分析 ;Practice Guideline 实践指南 ;Randomized Controlled Trial 随即对照试验 ;Review 综述
pubmed检索教程
三、PubMed 基本检索规则
著者检索:姓全称在前,名首字母在后,[au]。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
思考题:中国学者的名字该如何转换呢? 如: 闻玉梅 卢正宏
17 大家好
三、PubMed 基本检索规则
刊名检索:全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如:Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
11 大家好
(三) PubMed收录数据
MEDLINE Indexed
1966 to prensent 的MEDLINE已标引数据,有MeSH字段和 摘要,每条记录标有: [PubMed-indexed for MEDLINE]
OldMEDLINE
1949-1965年间的MEDLINE数据,无MeSH字段和摘要,每 条记录标有: [PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]
促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。
促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。
8
大家好
NCBI网站
9
大家好
NCBI提供的数据库
检索大分子生物学数据 获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列; 获 取 Swiss-port,PIR,PRF,PDB 等 蛋 白 质 序 列 ,
13 大家好
二、PubMed的检索功能
高级检索 检索指南
基本检索输入框
检索工具: 特定文献检索
临床查询 专题查询
个人空间
其他资源: 规范词数据库
期刊数据库 临床试验等
14 大家好
三、PubMed 基本检索规则
pubmed检索教程
获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据 及大分子模式(MMDB)等其他生物信息数 据库检索。
PubMed等文献数据。
10
复旦大学图书馆文献检索教研室
2021/2/4
(二) PubMed的特点
广域网免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取) 提供检索词智能转换匹配 界面简洁,操作简便(须IE7.0以上版本)
2021/2/4
PubMed数据库
7
复旦大学图书馆文献检索教研室
2021/2/4
一、 PubMed简介
开发机构: NCBI(美国国立生物技术信息中心)
任务:
利用计算机信息处理技术,建立分子生物学、生物化 学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关 先进方法的研究。
促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。
NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。
近年数据涉及37种语种,回溯至1949年的数据涉 及60种语种。47%为美国本土出版文献,90%为 英文文献,79%的文献有文摘。
3
复旦大学图书馆文献检索教研室
(以上由2009年7月数据库提供)
2021/2/4
二、 MEDLINE的检索平台
广域网免费平台:NCBI-PubMed(含非 MEDLINE数据)
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2021/2/4
三、PubMed 基本检索规则
检索栏可输入布尔逻辑运算式:(运算符须大写)如: asthma AND (therapy OR treatment)
字段限定符:[ ],空格按词组匹配
试比较:
stroke AND thrombolysis[ti]
stroke thrombolysis[ti]
pubmed检索教程PPT课件
文献相关注释
基金编号
基因符号
期编号
资助调研者
资助调研单位
国际标准期刊号
美国立医学图书馆识别号
美国医学文献数据库
1
.
2013.4
2020/5/19
一、数据库概况
(一)编制单位:美国国立医学图书馆(NLM)
(二)收录学科内容:
主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文 献。
包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺 学、基础研究;临床、护理、公共卫生、卫生政 策发展或相关教育活动的内容。
三、PubMed 基本检索规则
刊名检索:全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如:Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
输入刊名检索发表在该刊上 的文献(限定出处字段SO)
18 .
2020/5/19
PubMed记录字段说明
MEDLINE 收录,逐步转为In Process, Indexed状态。
Not MEDLINE:PubMed 收录,MEDLINE不收录,一
直标注[PubMed-as supplied by publisher]或[PubMed]
13 .
2020/5/19
二、PubMed的检索功能
高级检索 检索指南
stroke[ti] thrombolysis[ti]
16 .
2020/5/19
三、PubMed 基本检索规则
著者检索:姓全称在前,名首字母在后,[au]。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
思考题:中国学者的名字该如何转换呢? 如: 闻玉梅 卢正宏
pubmed文献检索基础教程
• PubMed数据库收录生物医学权威期刊最多,检索途径多,更新频率快,数据库免费使用并提供强大的链 接功能,PubMed最大的特点是主题词自动转换功能,检索质量较高
基础篇
文献检索
2021.02
CONTENTS
ki数据库 2.pubmed数据库 3.全文下载
中文三大数据库
cnki数据库检索
cnki高级检索
cnki高级检索
可视化分析
检索结果导出
检索结果下载
pubmed数据库
PubMed数据库(https:///) • PubMed数据库是美国国家医学图书馆(NLM)所属 的国家生物技术信息中心(NCBI)于1997年开发的,是基于互联网的生物医学文献检索系统,是NCBI Entrez数 据库检索系统的重要组成部分
pubmed检索规则
pubmed字段标识符 红色为常用
pubmed数据库界面介绍
pubmed的检索模式
pubmed主题词检索
主题词检索页面简介
pubmed数据库临床资料查询
单篇引文匹配器
pubmed数据库文献管理
设置推送
PMC下载文献
SCI-HUB下载文献
Thanks
And Your Slogan Here.
LY
• PubMed数据库涵盖了基础医学、临床医学、生命科学、解剖学、口腔医学、预防医学、药理和药剂学、卫 生管理、医疗保健、护理学等众多生命科学和医学领域相关文献
PubMed使用教程指南
PubMed使用教程指南PubMed使用教程指南1:简介1.1 PubMed概述1.2 文档目的和范围1.3 文档结构2:注册和登录2.1 注册过程2.2 登录步骤2.3 用户账户管理3:检索和筛选文献3.1 关键字检索3.2 高级检索3.3 检索结果筛选和排序3.4 收藏和导出文献4:文献详细信息和摘要4.1 文献详细信息页4.2 文献摘要和关键词4.3 相关文献推荐5:全文获取途径5.1 免费全文获取5.2 付费全文获取5.3 图书馆访问6:文献浏览和阅读工具6.1 在线阅读器6.2 PDF和打印6.3 标注和笔记7:数据库交互和导出选项7.1 搜索历史和搜索警报设置7.2 保存和导出搜索结果7.3 数据库交互和集成8: PubMed Central (PMC) 8.1 PMC概述8.2 PMC文献访问和8.3 PMC作者和机构信息9:其他功能和资源9.1 科学计量指数和引用分析9.2 转录本数据库和序列检索9.3 生物医学主题词(MeSH)搜索附录:附件1: PubMed常见问题解答 (FAQs)附件2: PubMed搜索示例附件3: PubMed用户指南(官方文档)法律名词及注释:1:版权(Copyright):著作权法所规定的权利,授予创作者对其所创作作品的独占权利。
2:公共领域(Public Domn):指作品的版权保护期已经过去,不再受版权法保护,可以自由使用。
3:开放获取(Open Access):指文献免费并可自由获取的出版模式,通常由作者或资助机构支付出版费用,以使文献对全球范围内的读者免费开放。
4:数据共享(Data Sharing):研究数据的共享原则,将研究数据公开存档并向其他研究人员开放,促进科学研究的可重复性和透明度。
5:版权许可(Copyright License):版权持有者授权他人使用、复制或再分发作品的许可证。
6:存取策略(Access Policy):指特定出版物的访问规则和限制,如开放获取、订阅制度等。
PubMed使用指南(二):高级检索
【原】PubMed使用指南(二): 高级检索2021-12-23之前我们介绍了关于 PubMed 里面关键词检索的注意事项,以及使用PubMed 检索的三个方法, 具体可见。
今天对高级检索进行一下说明。
在 PubMed 中点击Advanced就可以进行高级检索。
在整个高级检索的界面,主要包括了两个部分:检索栏和历史记录基本操作在检索栏当中,分成上下两个部分,上面可以输入检索关键词,下面则可以查看具体的检索式。
具体的步骤主要分成五步。
假如我们想要检索在Nature 当中和在题目中提到突变的文献。
那么首先选择杂志类别然后输入Nature2021-12-20 10-04-27.2021-12-20 10_05_19点击ADD之后下面就有了检索式。
进一步,选择在题目当中检索突变。
这个时候会让选择两个检索式的关系 (AND, OR, NOT)。
这里我们选择 AND 的关系。
2021-12-20 10-09-09.2021-12-20 10_11_35选择之后,就有了这样的一个检索式最后就可以进行检索。
高级检索中提供了两种检索方式:“检索”和“添加到历史记录”•“检索”: 直接跳转到具体的文献结果页面•"添加到历史记录": 不会返回文献内容而是在历史记录当中显示具体的检索结果 (检索式以及检索到的文献个数)。
高级检索类别说明高级检索中有很多类别。
对于其中一些比较常用的,这里就进行一下简单的说明。
方便使用。
如果想要检索某一个作者的相关的文章,可以使用Author检索条目。
Pubmed 提供了多个和作者有关的检索条目,例如:作者检索[au],第一作者[1au],最后一个作者[lastau] 等等。
作者检索当中需要注意的是。
在 2002 年之前的文献, Pubmed 记录的作者只有名,没有姓。
如果要检索名称的全名的话,只能得到2002 年之后的文献。
最后需要注意的是:如果真的要关注某一个作者发表的文章的话,除非世界上上这个人的名字是唯一的,不然的话,只是通过作者检索还是没有的。
PubMed检索步骤
PubMed检索步骤1、PUBMED 词汇自动转换功能:例如:在键入“Vitamin c",点击"Go",再点击"Details"显示("ascorbic acid"[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word]),看一下主题词是什么?所用词汇是否合适?然后点击“Preview/Index”显示你所用的检索词、检中的篇数、所用时间。
也可点击“limit"进行检索。
检索时可以使用通配符"*"进行截词检索或用双引号进行强制检索词检索。
2、著者强制检索:作者用双引号括起来"zhang y" [au];比较一下分别输入zhang yun ;yun zhang,zhang y; zhang y [au];"zhang y" [au] 检索结果的区别。
3、刊名检索:可用刊名全称或缩写、ISSN号,再加上刊名子段限定符,如:输入J Tradit Chin Med [ta] ,然后敲回车或点击Go,系统将在刊名子段中检索,并显示检索结果。
点击“History”可以查看检索历史。
4、布尔逻辑检索:系统允许使用布尔逻辑检索,布尔逻辑运算符要大写(AND、OR或NOT)。
5、剪贴板:使用"send to Clipboard",可把检索结果存入剪贴板,剪贴板最多可存放500条记录。
只要剪贴板中有记录,就可点击Clipboard查看其中的记录(记录为summary格式),粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录题录。
6、当前页显示篇数默认为20篇,如果需要可调整当前页的篇数“5、10、20、50、100、200、500”篇。
检索结果默认summary格式(题录格式),可以选择display下拉菜单中的Abstract(文摘),以文摘格式显示。
(一)基本检索1. 检索2000年以来收录我院孙保亮老师作为第一作者的论文数量2.检索PubMed收录山东大学姓王的作者所有的文献3. 字段限制检索:检索作者Jone W Smith发表的论文标题中含癌症治疗方面的文献。
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Index(索引)中选择搜索词
使用索引按钮可以从特定域中选择以索引的 单词,并把他们加入查询方案之中。Index (索引)中可以查看某一个特定搜索域中词 语列表。 举例:选择“Title/Abstract Word”作为搜索 域,键入搜索词gene therapy (图5),点击 Index按钮,PubMed以字母顺序显示所选 定搜索域中相关的词语,使用滚动条或 “Up, Down” 来上下移动列表。选择 “gene therapy”。 (图6) 使用“AND”关系,继续Preview,得出检索 结果(图7)
(3)短语表(Phrase list)。该表中的短语来自MeSH、含有 同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统和补充概 念(物质)名称表。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表 中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短语表。
(4)著者索引(Author Index)。如果键入的词语未在上述各 表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母 的短语,PubMed即查著者索引。
存储检索策略--URL键的用法
在PubMed Query状态下,点击URL键,检索策略将会显 示在提问框中并作为URL的一部分保存起来。然后用浏览 器的书签功能把URL收藏为一个书签,最后用浏览器的编 辑功能为其重命名即可。
PubMed 系统的主要功能
词汇自动转换功能 截词检索功能 强制检索功能 链接功能
系统允许从索引词表中词表中同时选择多个 词(按下Ctrl键点击每个词即可),当需要 的词全部点亮后,点击运算符号可以将其加 到提问框中。然后点击Preview键,系统显 示新检索结果数。 还可以从其他检索字段中选择词汇,不断增 加到检索提问框中,直到满意为止。最后点 击Preview查看检索结果记录数,或点击Go 显示检索结果。
MEDLINE
MEDLINE是美国国立医学图书馆( U.S.National Library of Medicine)最重要的书 目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科 学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全 世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期 刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自 1966年。虽然是世界范围的,但是大多数记录 是从英语资料(87%)或有英文摘要(72%)的文献 中获得的。 每一个MEDLINE的记录包含一个PubMed unique identifier (PMID)以及[PubMed indexed for MEDLINE] MEDLINE引文示例
1. 在对话框中输入查询词。比如我们这次输入的是TNF,然后单击 “go”按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相 关条目显示在屏幕上。
2. 你可以随时向查询框输入查询词,点击“go”按钮开始新的查询。 “clear”按钮可以帮你清除查询框中的内容,然后开始一个新的查询 。 3. 在查询框前search提示后有一个下拉式菜单,你可以在这里选择其他 的信息资源或NCBI的数据库。
•Overview-PubMed数据库的覆盖范围和刊物信息。 New/Noteworthy-关于PubMed系统更新和未来发展。 •Journal Browser-通过标题,关键词,标题缩写,或者 ISSN号,在PubMed和其他Entrez数据库中检索期刊标题, 还可以察看提供全文的刊物的列表。MeSH Browser-可以 在分层结构中浏览MeSH的词汇表。Citation Matcher-是 一个填空式的表格,允许用户通过输入刊物的引文信息来 定位特定文章,特定一期内容,或者整个刊物的内容。 Clinical Queries-为临床医生准备,关注于四个领域:疗 法,诊断,病因,和预后。Cubby-为注册用户(免费注册 )提供的检索策略存储空间,可以生成检索历史信息,并 可以及时更新。 •Order Documents-购买原文(大约$5/篇)。Grateful Med-连接到NLM提供的其他服务。包括对MEDLINE,PreMEDLINE和其他NLM数据库(例如:AIDSLINE, HealthSTAR等)的访问。Consumer Health-提供与 MEDLINEplus的链接,是与消费者健康信息相关的国家医 学图书馆的网络节点。Clinical Alerts-迅速公布由NIH资助 的,会显著影响发病率和死亡率的临床研究结果。Clinical Trials-对公众提供临床科研的当前信息。PubMed Central-可免费提供全文的生命科学文献。
“预览/索引”(Preview/Index)用 法 Preview(预览)可以在显示条目之前显示所查到
的文献数。在输入框中键入搜索词,单击 Preview,PubMed返回的信息是文献条目的数 量,而非内容。(图1) 通过增加一个或多个单词来修改查询方案。可 以继续向框中加入多个词语,点击Preview直到 得到希望的内容。 向下滚动Preview/Index找到“Add to Query or View Index”部分,使用下拉菜单确定一个搜索 域(图2),向文本框中加入词语,单击Preview 可以看到查询结果。(图3) Preview自动使用“AND”运算符来将单词合为 一体,即要求同时查询包含两个词的文献。(图 4)
如果仍然找不到匹配词,PubMed就会把该词断开后再重复上 述转换过程,直到找到为止。若仍然没有匹配词,单个词会被 用AND连在一起,在全部字段中检索。如:"single cell",系统 就会自动将其分成两个词:“single“和“cell”检索,其检索表 达式为:“single AND cell”。要查验检索词的转换情况,可点 击“Details”键。
1) Limits (条件限定)
2) Preview/Index(预览/索引)
3) History(检索史)
4) Clipboard(粘贴板) 5) Details(详细策略)
“条件限定”(Limits)的用法
Limits图解
注意事项
注意事项
选择了“出版物类型”、“年龄”、“性别”、 “人或动物”中的任何一项,检索将限制在 MEDLINE数据库中进行,PreMEDLINE则被排除 在外。因为这些特征限制只有MEDLINE中才有。 PreMEDLINE中的条目尚未完成标引,未含这些 数据。 “Subsets”下拉菜单允许做如下限制:“AIDS” 限制在艾制滋病文献库;“AIM”限制在AIM( Abridged Index Medicus)引用的120种重点核心 期刊文献库;“Dental”限制在牙科学文献库; “MEDLINE”限制在MEDLINE数据库; “Nursing”限制在护理学文献库; “PreMEDLINE”限制在PreMEDLINE数据库; “Publisher”限制在出版商提供的文献数据库
Pre-MEDLINE引文示例
布尔逻辑运算符 (Boolen Operators)
逻辑与 AND smoking AND lungneoplasms 逻辑或 OR Hyperphagia OR Obesity 逻辑非 NOT Dyslexia NOT Child
A
C
c
B
PubMed页面介绍
Details的用法
Details用于查看PubMed的检索策略。使用 Details键还可以对检索策略进行编辑,然后再一 次检索。 在PubMed Query框内显示的是PubMed实际使用 的检索策略和语法。该框下有四个区域:Result 区显示检索结果的记录总数,点击这个数字,可 回到检索结果显示屏。Translation区显示检索词 转换的详细情况。Database区显示检索的数据库 。User Query区显示用户键入的检索词或检索表 达式。 对检索策略进行编辑可直接使用鼠标点击PubMed Query框中的检索策略,将其增加、删除或修改后 点击Search键。如:在其后加上“AND 2000[dp]“,再点击Search键。
New Data
Collect
Pre-Medline
Process
Medline
PubMed
Pre-MEDLINE
Pre-MEDLINE是一个临时性医学文献数据 库。它每天都在接受新数据,可为用户提 供基本的文献条目和文摘,其文献条目在 标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 记录除被赋予一个PMID(PubMed unique identifier -- PMID)。而且Pre-MEDLINE的 记录还带有一个记号,[PubMed - in process]。 一旦引文被移动到MEDLINE,它们就从 Pre-MEDLINE中被删除、替换为已检索化 的MEDLINE记录。
“检索史”(History)的用法
History主要用于查看检索策略,也可用于 查看检索结果记录数量。点击History,显 示检索史:检索号、检索策略、检索时间和 检索结果数。要查看检索到的记录,直接点 击检索结果数即可。 在History状态下,可以将检索ND #2 。在检索史(History)被删除后也会随之 丢失。 要清除检索史,请点击Clear History键。 注意:PubMed最多可保留100个检索式, 超过100个时自动删除最早的检索式。
总览
上方数据库栏
左侧导航栏 检索查询栏 特征栏
PubMed在其主页上与NCBI的7个数据库建立了超链接。这些数据 库包括: Nucleotide(DNA序列)数据库。Protein[氨基酸(蛋白质 )序列]数据库。Genome(基因组序列)数据库,提供所有基因与 染色体纪录与图片的查询服务,这个库中数以百万的基因序列是由 庞大的基因排序工作得来的。Structure(分子结构模型)数据库, 这个数据库保存的是由X线晶体成像、NMR分光光度法建立的三维 分子结构。Popset(种群、种系发生或突变序列)数据库,是由相关 种族、人类发展、突变研究得来的人类进化与人种差异的结果。 Taxonomy(微生物类别)数据库和OMIM(人类孟德尔遗传学)在线 数据库等。Books(相关图书)可链接到相关参考书籍的文摘页。