药物基因组学-赵用
FDA对药物基因组学早期临床研究的建议_赵德恒
◇综述与讲座◇中国临床药理学与治疗学中国药理学会主办ＣＮ ３４－１２０６／Ｒ，ＩＳＳＮ １００９－２５０１ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃｊｃｐｔ．ｃｏｍ２０１５Ｆｅｂ；２０（２）：２０８－２１２２０１３－０７－０２收稿 ２０１４－０３－１４修回赵德恒，男，主任药师，主要从事药品审评工作。
Ｔｅｌ：０１０－６８５８５５６６ Ｅ－ｍａｉｌ：ｚｈａｏｄｈ＠ｂｄｅ．ｏｒｇ．ｃｎＦＤＡ对药物基因组学早期临床研究的建议赵德恒，萧惠来国家食品药品监督管理总局药品审评中心，北京１０００３８摘要 药物基因组学是当前一个热点话题。
ＦＤＡ于２０１３年发布了“临床药物基因组学指导原则：早期临床研究的上市前评价和对说明书的建议”，本文介绍其中第ＩＶ部分基因组学的临床评价。
我国还没有类似的指导原则，期待本文对我国这方面的研究和监管有益。
关键词 ＦＤＡ；指导原则；药物基因组学；早期临床研究；研究设计中图分类号：Ｒ９６９文献标志码：Ａ文章编号：１００９－２５０１（２０１５）０２－０２０８－０５药物基因组学（ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ，ＰＧｘ）是与药物反应相关的ＤＮＡ和ＲＮＡ特征变异的研究，药物反应包括药物吸收和处置［例如，药动学（ｐｈａｒｍａｃｏｋｉｎｅｔｉｃｓ，ＰＫ）］、药物效应［例如，药效学（ｐｈａｒｍａｃｏｄｙｎａｍｉｃｓ，ＰＤ）以及药物疗效和不良反应］［１］。
由于药物基因组学在新药研发和临床合理用药中有重要价值，近年来发展迅速。
ＦＤＡ于２０１３年１月份发布了有关药物开发早期临床研究中药物基因组学研究的指导原则［２］。
在药物开发期间基因组学方法的应用，是从药物发现开始到整个临床有效性和安全性结果确认过程中，一个持续逐步发展的过程。
然而，该指导原则的重点是对Ⅰ期和Ⅱ期临床试验中药物基因组学研究设计的一般原则、数据收集和数据分析提出建议，而不是提供支持药物批准所需的安全性和有效性的最终证据。
该指导原则主要包括：Ｉ前言、ＩＩ背景、ＩＩＩ预期的ＤＮＡ样品的收集、ＩＶ基因组学的临床评价、Ｖ说明书中包括的药物基因组学资料。
2015年国家自然科学基金优秀青年科学基金获批项目
182 钢结构 施刚 清华大学
183 建筑结构抗爆分析 师燕超 天津大学
184 有机功能分子设计合成及组装 邵向锋 兰州大学
185 纳米结构的压印成形机理与控制 邵金友 西安交通大学
186 服务运营优化 荣鹰 上海交通大学
187 纳米尺度下离子束与固体相互作用 任峰 武汉大学
2015年国家自然科学基金优秀青年科学基金获批项目
序号 项目名称 项目负责人 依托单位
1 数学地质 左仁广 中国地质大学（武汉）
2 认知与协作无线网络 邹玉龙 南京邮电大学
3 非线性水波及其与海洋结构物的相互作用 邹丽 大连理工大学
4 函数空间与非光滑分析 周渊 北京航空航天大学
5 昆虫病毒学 周溪 武汉大学
80 肝癌血管转移相关肿瘤微环境 杨鹏远 中国科学院生物物理研究所
81 代数组合学 杨立波 南开大学
82 神经退变的分子机制 杨竞 北京大学
83 动态投融资与资产定价 杨金强 上海财经大学
84 发育生物学 杨辉 中国科学院上海生命科学研究院
85 环境地球化学 晏宏 中国科学院地球环境研究所
86 染色质重塑子影响转录调节的机制研究 颜光玗 南方医科大学
87 计算机图像与视频处理 颜波 复旦大学
88 生物分子组装 闫学海 中国科学院过程工程研究所
89 人类胚胎早期发育机制 闫丽盈 北京大学
90 海工钢筋混凝土结构 闫东明 浙江大学
91 金属催化材料 鄢俊敏 吉林大学
92 RNA结合蛋白的转录和表观遗传调控功能机制 薛愿超 中国科学院生物物理研究所
93 具有尖峰孤立子的可积浅水波方程 薛波 郑州大学
四川大学2018生物治疗国家重点实验室硕士研究生专业目录_四川大学考研网
科学学
位
①101 思想政治理论 复试：医
②201 英语一 学生物学基
③708 医学生物学 础和前沿或
④802 生物化学（医学） 生物学基础
或 或细胞生物
①101 思想政治理论 学
②201 英语一 学制：3 年
③656 生物学 学 费 ： 8000
学 费 ： 8000
元/生.年
科学学 位
①101 思想政治理论
复试：医
②201 英语一
学生物学基
③656 生物学
础和前沿或
④939 生 物化 学 ( 自 主命 细胞生物学
程平 陈县城
0805Z4 纳米材料与纳米技术
01(全日制)纳米靶向药物制 剂
02(全日制)纳米生物活性材 料
03(全日制)纳米医学分子诊 断与治疗
复试：医 ③708 医学生物学
学生物学基 ④802 生物化学（医学）
础和前沿或 或
细胞生物学 ①101 思想政治理论
学制：3 年 ②201 英语一
学 费 ： 8000 ③656 生物学
元/生.年 ④939 生 物化 学 ( 自 主命 题)
03(全日制)衰老的细胞分子 机制
04(全日制)神经分子细胞生 物学
01(全日制)功能基因组学/ 疾病相关基因克隆与功能研究
林硕 肖波 李涛
科学学 位
①101 思想政治理论
复试：高
②201 英语一
等有机化学
③613 无机及分析化学（含 实验
仪器分析）
学制：3 年
④829 有机及物理化学（含 学 费 ： 8000
产学研一体化药学人才培养创新实验区建设成果-医药化学教学团队
产学研一体化药学人才培养创新实验区建设成果（2010-2013）一、联合用人单位参与人才培养方案的修订和课程体系的完善，形成适应性强、特色鲜明的药学特色专业人才培养方案，调整和完善课程体系，完成45门课程教学大纲修订工作。
二、课程建设实验区已建省级精品课程1门“天然药物化学”；校级精品课程2门“医学化学”、“药物分析”；校级双语教学示范课程2门：“药剂学”、“医学化学”；校级药学实验教学示范中心。
三、教材建设2010年至今，共主编、副主编、参编教材9部，其中主编教材5部，教材4部，其中国家级规划教材3部。
四、完成多媒体课件、教材、教学模型、教学资料建设，网络实验室的初步构建医药化学教学视频资源建设，。
五、教学比赛获奖14项：1. 2010年，喻芳获“昆明医学院首届青年教师教学基本功大赛”三等奖2. 2010年，黎唯获“昆明医学院首届青年教师教学基本功大赛”优秀奖3. 2010年，黎唯获“昆明医学院首届青年教师教学基本功大赛”教案讲稿比赛优秀奖4. 2010年，章小丽获“昆明医学院首届青年教师教学基本功大赛”伯乐奖5. 2011年，喻芳获“昆明医学院第三届双语教学讲课比赛”三等奖6. 2011年，李美红获“昆明医学院第三届双语教学讲课比赛”优秀奖7. 2011年，何波获“昆明医学院第三届双语教学讲课比赛”优秀奖8. 2011年，章小丽获“昆明医学院第三届双语教学讲课比赛”伯乐奖9. 2012年，李美红获“昆明医科大学2012年青年教师普通话课堂教学比赛”三等奖10. 2012年，陈亚娟获“昆明医科大学2012年青年教师普通话课堂教学比赛”三等奖11. 2012年，范雅婷获“昆明医科大学2012年青年教师普通话课堂教学比赛”三等奖12. 2012年，章小丽获“昆明医科大学2012年青年教师普通话课堂教学比赛”伯乐奖13. 2012年，鲁卫东获“昆明医科大学2012年青年教师普通话课堂教学比赛”伯乐奖14. 2012年，沈志强获“昆明医科大学2012年青年教师普通话课堂教学比赛”伯乐奖六、教研教改共发表教改论文15篇，负责校级教改项目5项，并参与了教育部2项“高等学校教改项目”子项目的研究。
基因芯片技术在中药基因组学研究中的应用
基 因芯 片技 术在 中药 基 因组 学 研 究 中 的应 用
唐 先 明 ，王振 月 ，赵 海 鹏 王 宗权 ，陈 智 岩 ，
（． １黑龙 江 中医药大学 药学 院 ， 黑龙 江 哈尔 滨
２ 河北 以岭 医药研究 院 ， ． 河北 石家庄
１０４ ５００；
００３ ） ５ ０ ５
摘要： 该文基ｆＪ￣基因组学特别是功能基因组学及一些生物技术手段的研 究进展及发展趋势， ｆＥ － 从一个新的视角提出
２ ｉｎ ｄ ａ ｓｔｔ．Ｙｌ ｇ， ＿ｅ Ｏ ０ ３ ， ｈｎ ） ．Ｙｌ ｇＭｅ ｉ ｌ ｎｔｕｅ ｉｎ ｅ ５ ｏ ５ Ｃ ｉ ｉ ｃ Ｉ ｉ ｉ ６ ａ
Ａｂｓｒ ｃ ：ｎｔｉ ｐ ｐ ｒａｎ ｗ ｒｓａｃ ｔ ｔｇ ｆ“ ＣＭ ｅ ｏ ｃ ’ ｓｐ ｏ ｏｅ ｎ ｔｅ ｂ ｓｓｏ ｃ ｉｖｍｅ ｔ ａ ｄ ａ ｖ ｃ ｓｉ ｔ ａ ｔ Ｉ ｈｓ ａ ｅ ｅ ｅｅ ｒｈｓｒ ｅ ｙｏ Ｔ ａ Ｇ ｎ ｍｉｓ’ ｒｐ ｓｄ ｏ ｈ ａｉ ｆａ ｈｅｅ ｎｓ ｎ ｄ ａ ｅ ｎ ｉ ｎ
了开展 “ 中药基 因组 学（ Ｃ ｅｏ ｍ ｃ） 研究 的策略。认为 当前 中药 的现代 化研 究应 集 中体现 于 中药基 因组 学， Ｔ Ｍ Ｇ ｎｍ ｉｓ ” 并将
以基 因芯片等为核 心的基 因技术 引入 中药基 因组 学和现代 中药研究。将 中药的作用机理 或功 能利 用能代表其功 能的一
组基 因表 达的影响来诠释 。
关键词 ： 基因芯片； 中药基因组学； 中药现代化 中图分 类号 ： ２一 ３ Ｒ Ｏ 文献标 识码 ： 文章 编号 ：０ ８０ ０ （ ０ ７ ０ — ９ － Ａ １０ －８ ５ ２ ０ ） ５ １ ７ ３ ０ ０
Ａｐｐ ｉａ ｉ ｎ ｏ ｎｅ Ｃｈ ｐ Ｔｅ ｈ ｌ ｇ ｏ Ｔｒ ｄ ｔｏ ａ ｉ ｎｅ ｅ Ｍ ｅ ｉ ｉ ｅ Ｇｅ ｍｍ ｉｓ ｌｃ ｔｏ ｆＧｅ ｉ ｃ ｎｏ ｏ ｙ ｔ ａ ｉｉ ｎ ｌＣｈ ｓ ｄ ｃｎ ｎｏ ｃ
药物基因组学与个体化给药
Ｂ ｏｅ ｇ４ ０ ０ ， ｈｎ ） ａ ｆ ５ ０ ４ Ｃ ｉａ ｎ
【 ｂｔ ｃ］ Ｔ ｒｍｏｅｔｅ ｅｅ ｐ ｎ ｆ ｅ ｏａ ｚｄｍｅｉｉ ，ｈ ｕｈｒｅｐ ｕｄ ｄｔｅｇｎｒｔ ｎａ ｄｐｅ Ａ ｓｒ ｔ ａ ｏｐｏ ｔ ｈ ｖｌ ｍｅｔ ｒ ｎｌｅ ｄｃ ｅ ｔｅａ ｔｏ ｘ ｏ ｎ ｅ ｅ ｅ ｉ ｎ ｒ— ｄ ｏ ｏｐ ｓ ｉ ｎ ｈ ａｏ
薛梅， 周静 ． 味子 多糖 的提取及 含量 测定 ［ ］ 陕西 中 医， 五 Ｊ．
２ ０ ， ４ ３ ：６ ．６ ． ０ ３ ２ （ ） ２ ７２ ８ 张 兰 杰 ． 维 华 ． 珊 红 ． 五 味 子 果 实 中 多 糖 的 提 取 与 纯 张 赵 北
究［］ 制剂研究，０ ３ ２ （ ）５ ． Ｊ． ２ ０ ，０ ４ ：０ 周 庆华， 范卓文， 杨莲 荣 ． 五味 子提取物 超临 界 Ｃ 萃取工 Ｏ 艺的研究［ ］制剂工艺，０ ３ ３ （ ）４ ．５ Ｊ． ２ ０ ， １ ３ ： ４４ ． 刘 本， ｅｎＪ 超临 界 Ｃ ２流体提 取五 味子 中的五 味子 甲 Ｄ ａ Ｒ． Ｏ 素 ［］ 中 国 医 药 工 业 杂 志 ，０ ０ ３ （ ） ｉ １１ ３ Ｊ． ２ ０ ， １３ ：０ ．０ ． 刘本 ， ａ Ｒ， ｒｅＲ． ＤｅｎＪ Ｐｉ ｃ 法多索溶剂 提取五 味子 中的五 味子 甲素［］ 中成 药，０ ０ ２ （ ）５ ７５ ９ Ｊ． ２ ０ ，２ ７ ：０ ．０ ． 李晓宁 ， 崔卉， 宋又群 ， ． 等 辽五 味子果实 挥发油成分 的鉴定 ［］药 学 学报 ，０ １３ （ ）２ ５２ ９ Ｊ． ２ ０ ，６ ３ ：１ ．１ ． 王炎， 王进 福， 尤宏 ， ． 五味子 种子 挥发油 的 ＧＣＭＳ分 等 北 ． 析 ［］ 中 国药 学 杂志 ，０ １ ３ （ ）９ ．２ Ｊ． ２ ０ ，６ ２ ：１９ ．
系统生物学在中药研究中的应用
系统生物学在中药研究中的应用宋挺【摘要】我国中药的体内作用过程一直不明确，近年来随着生命科学的发展，将中药的研究与系统生物学相结合，有可能从系统的角度诠释中医药多靶点、平衡调理和标本兼治的治病机制和分子机制，为中药的研究提供新的思路。
%The action process of Traditional Chinese Medicine in the body is not clear. In recent years, with the development of life science, it is possible to explain the cure mechanism and molecular mechanism of traditional Chinese medicine features with multi-target, balance regulating, taking measures both from its root cause and symptoms from perspective of system by combining the research of Traditional Chinese Medicine with systems biology, offering some new thoughts for Traditional Chinese Medicine research.【期刊名称】《合肥师范学院学报》【年(卷),期】2011(000)006【总页数】3页(P86-88)【关键词】系统生物学;中药研究;基因组学;蛋白质组学;代谢组学【作者】宋挺【作者单位】合肥师范学院医院,安徽合肥230061【正文语种】中文【中图分类】R28中药（traditional Chinese medicine）即传统中国药，在我国已有二千多年的发展历史，在广大人民群众中具有深刻影响。
国家自然科学基金委员会生命科学部3面上项目资料
第25卷第12期2013年12月V ol. 25, No. 12Dec., 2013生命科学Chinese Bulletin of Life Sciences文章编号：1004-0374(2013)12-1161-62国家自然科学基金委员会生命科学部2013年度面上项目项目名称申请人依托单位1微生物学含羞草beta-根瘤菌共生固氮基因分子进化及菌植互作分子基础的初步研究刘晓云河北大学"万年生"野生稻内生菌多样性及分子系统进化研究谭志远华南农业大学中国芽胞杆菌属资源分类及系统发育研究刘 波福建省农业科学院共生细菌在象白蚁木质纤维素降解过程中的作用与机理研究杨 红华中师范大学内蒙古黏细菌资源多样性及其抗马铃薯晚疫病活性分析刘惠荣内蒙古农业大学海洋与内陆盐环境嗜盐古菌比较分类学研究崔恒林江苏大学产甲烷条件下互营烃降解菌Syntrophus sp.的定向分离及其烃降解基因研究承 磊农业部沼气科学研究所Myroides属模式种的比较基因组学、种的分化及其与环境适应的关系秦启龙山东大学海洋拟杆菌的多样性分析、分离鉴定及拟杆菌纲分类体系的整理与重构杜宗军山东大学基于DNA-稳定同位素探针对腾冲酸性温泉甲烷氧化菌群的宏基因组学研究贺治国中南大学泥河湾古遗址原核微生物的分子勘探及放线菌物种分离和系统分类张利平河北大学盐生植物中华补血草内生放线菌资源及其盐胁迫下的促生作用机制研究秦 盛江苏师范大学中国黑星菌科真菌的系统分类研究张 英北京林业大学中国粉褶蕈属分子系统学研究李泰辉广东省微生物研究所南岭国家级自然保护区大型真菌多样性研究宋 斌广东省微生物研究所黏菌个体发育与黏菌内细菌关系的研究王 琦吉林农业大学横断山区大型地衣特有种及其内生真菌遗传多样性研究郭守玉中国科学院微生物研究所金沙江干热河谷地衣的物种组成及生物地理学研究王立松中国科学院昆明植物研究所被孢霉科的形态、生理和分子系统发育学研究刘小勇中国科学院微生物研究所全球广义粉孢牛肝菌属的系统学与分类学研究李艳春中国科学院昆明植物研究所药用真菌大团囊虫草菌异黄酮关键合成酶基因CoCHS1的克隆及功能研究陈新爱浙江大学基于食菌动物粪便的高通量测序分析隐孢真菌多样性与分布于富强中国科学院昆明植物研究所宝天曼自然保护区甲虫肠道酵母菌多样性研究惠丰立南阳师范学院中国巨孢衣科地衣系统分类学研究任 强山东师范大学人腺病毒分型标准和重组进化机制研究曲章义哈尔滨医科大学食品级细菌双精氨酸信号肽的分泌机制研究高 强天津科技大学地衣芽孢杆菌耐热性的遗传基础王正祥天津科技大学Vc混合菌发酵伴生菌活性蛋白基因克隆表达及其对产酸菌作用机制吕淑霞沈阳农业大学结合组学技术进行安丝菌素生产的发酵工程研究钟建江上海交通大学专性化能自养嗜酸性氧化亚铁硫杆菌亚铁氧化和硫氧化代谢的基础研究刘相梅山东大学硫碱弧菌(Thialkalivibrio sp.) D301硫醌氧化还原酶表达调控机制与进化研究邢建民中国科学院过程工程研究所LAL家族转录因子对莫能菌素生物合成途径的调控机理研究赵广荣天津大学海洋真菌多糖生物合成途径及其关键合成酶性质研究宋勇春南京大学大肠杆菌合成5-氨基乙酰丙酸的调控机制研究祁庆生山东大学∙基金∙生命科学第25卷1162乙酰异戊酰泰乐菌素转化菌株可控式分化的RNAi调控系统的构建和分析财音青格乐天津大学寡发酵链球菌抗氧胁迫的分子机制佟卉春中国科学院微生物研究所天蓝色链霉菌孤立应答调控蛋白OrrA参与次级代谢全局调控的信号传导机制研究芦银华中国科学院上海生命科学研究院大肠埃希氏菌S-腺苷高半胱氨酸核苷酶的作用机制及其作为抗菌药物靶点的探究谷劲松济南大学恶臭假单胞菌NCIMB9869降解芳烃污染物3,5-二甲基苯酚的代谢途径研究许 楹中国科学院武汉病毒研究所依赖Na+的新型HCT家族转运蛋白SdmlT的功能鉴定及其重要氨基酸残基的功能分析姜巨全东北农业大学单体可控的新型短链PHA的古菌合成及材料性能分析韩 静中国科学院微生物研究所苏云金芽胞杆菌控制溶源性噬菌体关键因子的功能和作用模式彭东海华中农业大学长双歧杆菌新的LuxS/AI-2依赖的QS系统及其调控机制的研究袁 静中国人民解放军军事医学科学院宏基因组学方法发掘新颖I型聚酮化合物研究冯治洋南京农业大学液体静置培养灵芝酸生物合成的表观遗传调控研究章文贤福建师范大学链霉菌GB-2中西索米星与新霉素共合成的代谢机制研究陈义华中国科学院微生物研究所抗肿瘤药物链黑菌素生物合成的后修饰过程及其代谢过程研究邓子新上海交通大学在分枝杆菌中从简单碳源自给自足合成雄甾烯酮的研究王风清华东理工大学利用ΔSRP抑制子挖掘蛋白转运新途径的基础研究张大伟中国科学院天津工业生物技术研究所FluG-BrlA途径参与斜卧青霉分生孢子生成和糖苷水解酶合成调控的功能研究秦玉琪山东大学圈卷产色链霉菌隐性次级代谢基因簇的调控机制田宇清中国科学院微生物研究所一种新型蛋白酶在耐辐射球菌电离辐射抗性中的作用机制华跃进浙江大学海洋细菌漆酶Lac15嗜卤素离子机制研究肖亚中安徽大学堆囊菌木聚糖酶Xyn11B特征序列对其膜定位和酶学性质的影响吴志红山东大学构巢曲霉形态建成调节网-SIN途径反向调节子(Suppressor)对于胞质分裂的调控机制陆 玲南京师范大学糖苷水解酶GH5亚家族活性中心架构及其功能快速演化的相关机理研究王禄山山东大学TetR家族调控因子AtrA调节达托霉素生物合成的转录调控机制研究毛旭明浙江大学裂殖酵母多胺代谢途径中新型核糖开关的研究陈东戎复旦大学黑曲霉糖代谢途径中关键酶与小分子相互作用的系统研究孙际宾中国科学院天津工业生物技术研究所酶动力学稳定性机制及其分子设计冯 雁上海交通大学近平滑假丝酵母立体选择性(R)-和(S)-羰基还原酶的催化机制与理性设计张荣珍江南大学单细胞尺度上解析厌氧微生物相互作用的分子机制张卫文天津大学细菌胞外蛋白酶C末端PPC结构域吸附功能的多样性及其分子机制何海伦中南大学I型聚酮手性中心形成的分子机制研究郑舰艇中国科学院过程工程研究所茎瘤固氮根瘤菌中参与趋化作用的受体蛋白Mcp5的功能机理研究解志红中国科学院烟台海岸带研究所苏云金芽胞杆菌L-赖氨酸2,3-氨基变位酶与杀虫晶体蛋白形成的关系及调控作用机制研究丁学知湖南师范大学白念珠菌Wor1介导的调控网络在白灰形态转换中的作用机制陈江野中国科学院上海生命科学研究院黏细菌生物膜中基于核酸-多糖相互作用的复合型胞外基质的生物学特性和构建机理胡 玮山东大学Sop1和Sop2的功能及其在DNA损伤应答中的作用王 瑜中国农业大学必需调控系统PhoPQ快速起源及与细菌有丝分裂的调控关系钱 韦中国科学院微生物研究所酮古龙酸菌醌酶－呼吸链电子传递系统的研究和原位重构张怡轩沈阳药科大学DNA甲基化在寡孢节丛孢捕器形成过程中的作用及功能研究孙 昌云南大学耐辐射奇球菌表面S层蛋白的生化功能及其在吸附转化重金属中的作用机制研究田 兵浙江大学一块重金属污染土壤中的链霉菌染色体外遗传因子的进化关系研究覃重军中国科学院上海生命科学研究院国家自然科学基金委员会生命科学部2013年度资助项目第12期1163基于特殊多肽序列的新型SOD嗜热机制解析及耐高温工业酶改造王 威南开大学氧化胁迫诱导白腐真菌漆酶基因高效表达的分子机制及其生物学意义研究杨 洋华中科技大学埃博霉素与其核心生物合成基因簇邻近基因关系研究黎志凤山东大学自噬降解通路对产油酵母油脂积累的影响及其分子机制张素芳中国科学院大连化学物理研究所高通量测序技术筛选真菌紫杉醇合成相关基因及其功能研究张 鹏湖北省农业科学院酿酒酵母极性生长关键调控分子Rho3的新调控因子、下游效应分子及功能的鉴定高向东武汉大学耐辐射异常球菌转录调控蛋白CarD参与辐射氧化胁迫反应调控机制的研究陈 明中国农业科学院生物技术研究所高通量异源表达激活链霉菌沉默抗生素生物合成途径陶美凤上海交通大学大肠杆菌合成黄酮类化合物关键前体丙二酰辅酶A的代谢调控陈 坚江南大学丙酮丁醇梭菌碳代谢物调控蛋白CcpA的功能域鉴定和结构优化姜卫红中国科学院上海生命科学研究院瑞氏木霉内质网相关蛋白降解途径(ERAD)在蛋白合成分泌中的调控机理钟耀华山东大学大肠杆菌异丁醇合成途径中还原力调控的机制研究张学礼中国科学院天津工业生物技术研究所谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)生产L-缬氨酸的代谢工程研究王小元江南大学基因组变构改进酵母胁迫耐性等复杂表型的分子机理吴雪昌浙江大学内生真菌紫杉醇的生物合成及机制解析赵 凯黑龙江大学部分革兰氏阴性细菌耐药普遍规律的数字化研究丁 凡东北农业大学谷氨酸棒杆菌新型高效基因表达及打靶系统的构建徐大庆河北农业大学利用定向演化探索LuxI及其同源酶的底物特异性孙连宏中国科学技术大学喜温硫杆菌硫代谢双组份调节系统基础研究林建强山东大学发酵草本能源植物产甲烷菌群的宏基因组与宏蛋白质组学研究刘 斌福建农林大学微生物共代谢降解烟碱类杀虫剂吡虫啉的关键酶及其调控机制研究戴亦军南京师范大学海拔梯度变化对高寒草甸土壤N2O功能微生物的影响张于光中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所苜蓿中华根瘤菌P-type ATPase介导的铜抗性机制及其调控机理研究韦革宏西北农林科技大学丛枝菌根共生体中碳、氮相互“对话”及其调控机制的研究田春杰中国科学院东北地理与农业生态研究所富营养化湖泊中浮游病毒控制藻类生产力和调节细菌死亡率的生态功能研究赵以军湖北工业大学水-沉积物界面细菌种群协作规律及可培养性研究屈建航河南工业大学SXT/R391元件在华南沿海溶藻弧菌中的分布、分子特征及水平转移能力研究罗 鹏中国科学院南海海洋研究所细菌VI型分泌系统抗环境胁迫新功能研究及其作用机制解析王 瑶西北农林科技大学电极活性微生物原位合成纳米钯及催化难降解污染物定向还原机制王爱杰中国科学院生态环境研究中心重金属矿业废弃物酸化过程中的微生物群落动态研究黄立南中山大学Rhodococcus jialingiae djl-6-2降解多菌灵的途径及分子机制研究洪 青南京农业大学溢油沉积物中微生物功能种群演替及其与石油降解进程耦合机制吕镇梅浙江大学嗜热盐碱厌氧菌Natranaerobius thermophilus独特的多极端环境适应机理赵百锁中国农业科学院研究生院可安全稳定高效降解环境雌激素的假单胞菌的研制与应用梁如冰上海交通大学短命植物抱茎独行菜内生菌多样性与共生抗旱研究安登第新疆师范大学一株中度嗜盐嗜碱菌Na+/H+逆向转运蛋白转运机制研究杨春玉山东大学婴儿肠道分节丝状菌(SFB)的培养与免疫调控机理研究王 欣浙江省农业科学院一个新的双组分系统RhpRS调控III型分泌系统的信号转导途径研究贾燕涛中国科学院微生物研究所磷酸二酯酶PdeR调控水稻白叶枯病菌毒性的分子机制研究何晨阳中国农业科学院植物保护研究所病原细菌与线虫互作的感知信号通路黄晓玮云南大学维氏气单胞菌tmRNA和Bvgs-RR介导的致病信号通路的作用机制研究刘 柱汕头大学环丙沙星诱导下大肠杆菌sRNA的表达变化及其在耐药中的作用付英梅哈尔滨医科大学一种与金葡菌天然耐药相关的新的调节性RNA (RNA-V)生物学功能研究杨 光中国人民解放军军事医学科学院铜绿假单胞菌 ExoS 毒素蛋白诱导的细胞凋亡信号通路研究金守光南开大学铜绿假单胞菌SuhB对三型分泌系统调控机理的研究吴卫辉南开大学生命科学第25卷1164三型分泌系统开关蛋白SepD调控效应蛋白输出的分子机制王 岱厦门大学毒素-抗毒素系统SzeTA对高致病性2型猪链球菌89K毒力岛的稳定作用及其机制研究李 明中国人民解放军第三军医大学铜绿假单胞菌中参与急-慢性感染转化的Ⅲ分泌系统调控途径及机理研究段康民西北大学稻瘟病菌附着胞形成阶段代谢组学研究林福呈浙江大学稻瘟病菌cAMP-PKA信号途径下游基因调控网络及其功能研究王政逸浙江大学低毒病毒侵染对板栗疫病菌线粒体机能的影响陈保善广西大学转录因子Sfu1和Sef1调控白色念珠菌共生-致病转化的分子机制研究陈昌斌中国科学院上海巴斯德研究所白念珠菌二氧化碳感应关键基因和信号通路研究黄广华中国科学院微生物研究所低温增强甜菜黑色焦枯病毒致病性的分子机制研究王献兵中国农业大学中国番茄黄曲叶病毒和烟草曲茎病毒Rep蛋白介导卫星DNAβ复制选择性的分子机制研究钱亚娟浙江大学烟草花叶病毒RNA发生poly(A)-rich型多聚腺苷酸化的研究李为民中国农业科学院生物技术研究所一种病毒诱导的RNA沉默在植物细胞间转运机制的研究洪益国杭州师范大学烟草丛顶病毒不依赖帽子翻译机制的RNA结构基础解析原雪峰山东农业大学MicroRNA与NBS-LRR类受体蛋白在SMV-大豆互作过程中的作用研究哈 达内蒙古大学细胞及病毒microRNA在杆状病毒复制中的作用钟 江复旦大学白纹伊蚊细胞凋亡通路及其对蚊媒病毒感染的影响刘青珍武汉大学基于单细胞分析技术探讨口蹄疫病毒持续感染机制郑从义武汉大学IRF-1抑制原型泡沫病毒复制机制研究乔文涛南开大学无囊膜病毒诱导细胞融合机制的研究郭 洪中国科学院武汉病毒研究所TLR3、TLR7配体增强猪繁殖与呼吸综合征疫苗细胞免疫应答的机制研究王金宝山东省农业科学院家蚕核型多角体病毒基因组复制受宿主分子伴侣HSC/HSP70调控的机制郭忠建江苏大学KCTD1介导朊蛋白与泛素连接酶E3相互作用的功能研究孙桂鸿武汉大学宿主细胞因子Integrin在杆状病毒入侵哺乳动物细胞中的功能及其作用机理研究王曼丽中国科学院武汉病毒研究所38K磷酸酶亚家族在杆状病毒衣壳装配中的分子机理研究杨 凯中山大学EV71感染所引起的CNS中免疫反应与神经内分泌系统相互作用在病毒致病过程中的机理研究李琦涵中国医学科学院医学生物学研究所人SR-BI基因多态性调控的脂质代谢对HCV入侵和感染的影响任 浩中国人民解放军第二军医大学朊病毒致病过程中细胞自噬和凋亡的相互串扰杨怀义中国科学院微生物研究所基于适配子靶向病毒蛋白的策略研究HCV导致肝癌的机制与规律章晓联武汉大学疱疹病毒丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与激活潜伏感染Epstein-Barr病毒(EBV)的分子机制研究彭 涛中国科学院广州生物医药与健康研究院登革病毒RNA结合宿主RBP的新发现及其在病毒基因组复制中的分子机制雷迎峰中国人民解放军第四军医大学嗜肝DNA病毒聚合酶新功能区的结构和功能研究王勇翔复旦大学我国新发现的14、55型腺病毒的生物学特性与基因组重组机制的研究张其威南方医科大学乙型脑炎病毒非结构蛋白NS5的晶体结构研究龚 鹏中国科学院武汉病毒研究所乙型流感病毒M1的核穿梭机理及其在复制中的作用曹 帅中国科学院微生物研究所肠道病毒71型神经细胞中复制中心形成机制的研究田 波中国科学院微生物研究所人3型腺病毒感染小动物模型的建立和体内应答特点研究周 荣广州医科大学基于小鼠与雪貂模型研究甲型H1N1流感病毒基因组多态性对致病性的影响及机制许黎黎中国医学科学院铜绿假单胞菌中噬菌体感染必需基因的筛选及功能研究杨洪江天津科技大学铜绿假单胞菌噬菌体PaP3的ORF48通过RpoD“关闭宿主”功能的分子机制研究谭银玲中国人民解放军第三军医大学猪肺炎支原体感染相关毒力因子的挖掘邵国青江苏省农业科学院生殖支原体MgPa受体的鉴定及其结构与功能研究曾焱华南华大学衣原体噬菌体Vp1黏附沙眼衣原体后的抑制效应及其机制的研究刘全忠天津医科大学沙眼衣原体新的免疫优势抗原CT143生物学特性研究王 洁中南大学第12期1165国家自然科学基金委员会生命科学部2013年度资助项目GrgA在衣原体生长发育过程中的基因转录调控机制的研究包小峰南通大学2植物学应用单分子技术研究细胞膜微区调节水通道蛋白活性的机制李晓娟北京林业大学卫矛科植物假种皮形态发生、发育及演化研究赵良成北京林业大学钙离子对微囊藻细胞壁合成及群体集聚状态影响机理的研究李建宏南京师范大学水稻着丝粒DNA变异及其影响植株生长发育机制研究龚志云扬州大学ZFP5家族基因调控拟南芥根毛细胞形成和发育的分子作用机制甘银波浙江大学远志结构发育过程中主要药用成分积累及诱导研究滕红梅运城学院高秆水稻茎秆细胞壁和组织构建的微观力学研究王太霞河南师范大学景天科植物三种无性苗的形态发生祝 建同济大学拟南芥根表皮细胞分化模式形成过程中组蛋白去乙酰化酶HDA19的调控机制研究陈文倩北京大学安息香科的系统发育基因组学和花形态发生研究王恒昌中国科学院武汉植物园转录抑制子AtOFP1调控拟南芥器官形态发生的机制常 缨东北农业大学OsELF3介导的泛素化途径调控水稻抽穗期的研究吴昌银华中农业大学中国及泛喜马拉雅地区滇紫草属(广义)的分类学研究刘全儒北京师范大学中国鸢尾兰属(兰科)植物的分类修订邢福武中国科学院华南植物园风毛菊属雪莲亚属和雪兔子亚属的分类学研究陈又生中国科学院植物研究所中国鼠尾草属(唇形科)的分类修订向春雷中国科学院昆明植物研究所中国木蓝属(豆科)的系统亲缘及分类修订高信芬中国科学院成都生物研究所马兜铃属对药马兜铃亚属的分类学与系统学研究马金双中国科学院上海生命科学研究院西南边境董棕林调查和研究，兼论河流与山脉的阻隔效应税玉民中国科学院昆明植物研究所半蒴苣苔属的分类修订和系统发育研究李振宇中国科学院植物研究所橐吾属(菊科-千里光族)的分类学研究杨亲二中国科学院华南植物园世界蓑藓属植物的分类修订与系统学研究郭水良上海师范大学世界角鳞苔属的分类修订和分子系统发育朱瑞良华东师范大学毛锦藓科的分类和分子系统学研究贾 渝中国科学院植物研究所中国复叶耳蕨属植物的分类订正研究陆树刚云南大学中国缺齿藓科(Mielichhoferiaceae, Musci)的分类研究赵建成河北师范大学海链藻属硅藻的形态分类和分子系统研究李 扬华南师范大学东亚叶苔科植物的系统分类研究李 微中国科学院沈阳应用生态研究所鳞盖蕨属(碗蕨科)的分类学研究严岳鸿上海辰山植物园中国弯枝藻目的分类修订及分子系统学研究谢树莲山西大学东亚特有植物水青树的谱系地理学研究李建强中国科学院武汉植物园茜草科北温带重要类群的生物地理演化聂泽龙中国科学院昆明植物研究所合头菊复合群植物的进化和生物地理学研究张建文中国科学院昆明植物研究所热带环太平洋间断分布格局的成因探讨-以樟科樟属为例李 捷中国科学院西双版纳热带植物园滇藏交界独龙江上游地区种子植物区系与生物多样性保护研究李 嵘中国科学院昆明植物研究所基于RAD tags方法的生物地理学研究：解析东亚岛屿特有植物舟山新木姜子地理分布格局形成与谱系分化机制邱英雄浙江大学东亚特有类群苍术属系统发育和物种分化及栽培药材白术的起源研究傅承新浙江大学中华猕猴桃复合体及其近缘种的分子谱系地理学研究李作洲中国科学院武汉植物园基于系统发育基因组学方法探讨适应不同宿主的肉苁蓉属植物水平基因转移王玉国复旦大学裸子植物线粒体基因组的进化研究冉进华中国科学院植物研究所利用比较基因组学的FISH技术研究5种猕猴桃种间亲缘关系刘 虹中南民族大学基于转录组测序的葡萄属欧亚支系系统发育和生物地理研究刘秀群华中农业大学横断山地区红豆杉属植物杂交物种形成与适应性进化高连明中国科学院昆明植物研究所广义李属植物的系统发育及分类学修订崔大方华南农业大学。
生物信息学参考书籍(入门级)
生物信息学参考书籍（入门级）1、David W.Mount 《Bioinformatics sequence and genome analysis》影印本，科学出版社,20022、Durbin R,Eddy S,Krogh A,et al.生物序列分析,蛋白质和核酸的概率论模型[M].北京清华大学出版社,20023、帕夫纳，计算分子生物学算法逼近，化学工业出版社，20044、(巴西) J.塞图宝，J.梅丹尼斯著，朱浩等译，计算分子生物学导论，科学出版社，20035、Masatoshi Nei（根井正利）Sudhir Kumar. 译者：吕宝忠，钟扬，高莉萍，高等教育出版社，20026、[美][巴森文尼斯]Andreas D.Baxevanis,[美]B.F.Francis Ouellette著；李衍达,孙之荣等译，生物信息学基因和蛋白质分析的实用指南,，清华大学出版社, 20007、鲍尔迪，DNA芯片和基因表达从实验到数据分析与模建，科学出版社，20038、（美）利布莱尔，蛋白质组学导论：生物学的新工具，科学出版社，20059、张亮，M.谢纳[美] ，生物芯片分析，科学出版社，200410、卢因，基因VⅢ，科学出版社，200511、(英)D.R.韦斯特海德(D.R. Westhead)等著；王明怡等译, 生物信息学，科学出版社200412、（法）皮埃尔·巴尔迪（Pierre Baldi），(丹)索恩·布鲁纳克（Soren Brunak）著；张东晖等译，生物信息学：机器学习方法，中信出版社，200313、(美）Cyntbia Gibas,Per Jambecks著；孙超等译《生物信息学中的计算机技术》中国电力出版社，200214、(美) Dan E. Krane, Michael L. Raymer著, 孙啸，陆祖宏，谢建明等译，生物信息学概论, 清华大学出版社200415、(加)S.米塞诺, (美)S.A.克拉维茨著；欧阳红生, 阮承迈, 李慎涛等译,生物信息学方法指南，科学出版社，200516、孙之荣主译探索基因组学、蛋白质组学和生物信息学（中译版），科学出版社，2004年8月出版17、哈特尔，遗传学基因与基因组分析，科学出版社,200218、生物信息学若干前沿问题的探讨：中国科协第81次青年科学家论坛论文集／黄德双等主编, 中国科学技术大学出版社200419、胡松年，薛庆中主编，《基因组数据分析手册》浙江大学出版社, 200320、胡松年，基因表达序列标签（EST）数据分析手册，浙江大学出版社, 200521、李敏强，寇纪淞，林丹，李书全，遗传算法的基本理论与应用. 科学出版社. 2002年4月22、孙啸, 陆祖宏, 谢建明编著,生物信息学基础, 清华大学出版社200523、李霞主编，《现代生物信息学理论与实践》，科学出版社，2005年11月出版生物信息学参考书籍（入门级）页码，12httpebook7.htm 20158624、袁建刚等主译《基因组》科学出版社，200225、黄韧等《生物信息学网络资源与应用》中山大学出版社，200326、郝柏林等编《生物信息学手册》第2版，上海科学技术出版社，200227、蒋彦等编《基础生物信息学及应用》清华大学出版社，科学出版社，200328、张继仁（译）蛋白质组学导论：生物学的新工具，科学出版社，2004年12月出版29、夏其昌，白质化学与蛋白质组学，科学出版社，2004年30、蒋华良、钟扬、陈国强、罗小民等译药物基因组学——寻找个性化治疗，科学出版社，2005年7月出版31、David W.Mount 著钟扬，王莉，张亮主译，生物信息学，高等教育出版社，200332、张阳德编，《生物信息学》科学出版社，200433、沈世镒著，生物序列突变与比对的结构分析，科学出版社200434、赵国屏等编《生物信息学》科学出版社，200235、郑珩王非，药物生物信息学，化学工业出版社，200436、Minoru Kanehisa著；孙之荣等译,后基因组信息学, 清华大学出版社, 200237、赵雨杰主编，医学生物信息学，人民军医出版社，200238、李桂源,钱骏主编,基于WWW的生物信息学应用指南，中南大学出版社200439、李巍主编,生物信息学导论，郑州大学出版社，200440、钱小红、贺福初等译蛋白质组学：从序列到功能. 科学出版社，2002年9月41、钱小红，贺福初主编.蛋白质组学理论与方法，科学出版社，200342、张阳德，纳米生物技术学，科学出版社，200543、李越中闫章才高培基，基因组研究与生物信息学，山东大学出版社，2003网络资料：（很多，简单举例）国内mainCourseFurtherReading.htmchenyuanxsunBioinformaticsInternetStudyBioinformaticsInternetStudy Ebook_bioinfo.htm国外bioinformaticsbioinf03_courses.htm。
中国的生物各领域牛人
中国的生物各领域牛人（导师简介~）中国生物学优秀研究生导师金颖教授研究单位：中科院上海生命科学研究院健康科学研究所研究方向：胚胎干细胞推荐理由：学术水平高，可能是国内在胚胎干细胞领域最有才华的导师之一，已发表JBC，Humangenetics 等多篇文章。
对人诚恳，开朗大方，对学生非常好！有口皆碑！陈国强教授研究单位：中科院上海生命科学研究院健康科学研究所/上海交通大学医学院病理生理系研究方向：白血病的分化与治疗推荐理由：年轻有为，学术水平高，是将来院士的必然人选！近两年发表Blood 等多篇文章，学生非常多，但是从不缺Idea ，因此学生毕业时都非常优秀，而且一直奉行：只有导师不行，没有学生不行的原则。
无论人品，还是学术水平，均有口皆碑！曹雪涛院士研究单位：上海第二军医大学免疫教研室研究方向：免疫推荐理由：原本应该是中国最年轻的院士！是一个学术奇才！虽然一直在国内，但其一系列成果和发现都是国际级的，学术水平非常高！去年刚刚获评院士。
其人品，学术均佳。
程和平(peace)职称：NIH 研究员，北大长江特聘教授单位：北京大学分子医学研究所研究方向：calciumspark ，mitochondria推荐理由：北京大学生物医学研究领域万人景仰的peace 老师是calciumspark( 钙火花)领域的奠基者之一，1993 年Science 的一作文章已经成为calciumspark 领域的经典之作，目前已关闭了NIH 的实验室，全职回国；对专业领域的进展有深层的理解，对学生教导有方。
曾益新院士研究单位：中山大学肿瘤医院研究方向：癌基因、抑癌基因及基因治疗研究推荐理由：年轻有为，学术水平高，平易近人，谦虚勤奋！2002 年他的团队成功地把鼻咽癌易感基因定位在4 号染色体4p15.14q12区域，这是该领域研究上的突破。
曹晓风研究员研究单位：中国科学院遗传与发育研究所研究方向：DNA 甲基化建立及维持的分子机制；小分子RNA 在基因沉默和发育调控的作用研究推荐理由：1988 年毕业于北京大学生物系应用生化专业。
东北林业学院2017年博士研究生拟录取名单
安旆其
曹丽娜 郭梦杰 李萌 刘彩霞 刘中原 王希刚 魏明 于颖 曾栋 王建军 王世新 张健 刘忠玄 马晓乾 狄贵秋 黎文建 赛牙热木. 哈力甫 王博文 王晓梅 于泽洋 张婷婷 朱自民 王楠 罗斯生 赵威成 王君杰 王涛 王有助 张凌宇 张俊 高国强
001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 001 林学院 002 园林学院 002 园林学院 002 园林学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院 003 动资学院
森林培育 森林培育 森林培育 森林植物资源学 森林植物资源学 森林植物资源学 生态学 生态学 生态学 生态学 生态学 生态学 生态学 魏罡 郭阳 刘帆 王春光 罗丹丹 肖湘 刘宁 李海霞 陈菲 鞠雅莉 冷岳阳 闫国永 赵翔
999 999 999 68 70 999 69 67 56 55 52 62 999 999 999 999 999 63 66 54 66 999 999 999 999 68 999 999 66 73 58 52 67 63 61 999 999 999 59 999 73 63 59 66 62 90 89 88 82 79 90 87 89 84 88 87 83 82 80 79 76 83 75 80 77 86 87 78 69 73 90 89 83 85 85 82 70 81 81 79 79 79 73 69 85 87 82 92 91 93 72 87 82 84 81 84 82 81 74 83 78 75 77 78 67 88 88 88 77 77 83 82 80 76 73 72 72 84 80 90 88 83 81
药物基因组学应用的研究进展
因此 对 不 同 人 群 的 药 物 选 择 应 根 据 基 因 差 别 来 决 定 ， 据 每 根 患 者对 特 定 药 物 的 代 谢 、 应 等 过 程 的 遗 传 特 性 来 选 择 药 反
盖 药 物 遗 传 学 研究 范 畴 外 ， 包 括 与 药 物 反 应 有 关 的所 有 遗 还 传 学 标 志 ， 物 代 谢 靶 受 体 或 疾 病 发 生 链 等 多 个 环 节 Ｊ 早 药 。 在２ ０世 纪 ５ 代 人 们 就 发 现 ， 同 的 遗 传 背 景 会 导 致 药 物 ０年 不
一
但 对 于 血 药 浓 度 与 药 效 不 一 致 的药 物 ， 如何 达 到 个 体 化 给 药 ，
目前 尚 无 可 靠 的 方 法 ［ 。但 如 果 通 过 药 物基 因组 学对 患 者 做 ６ Ｊ 基 因检 测 ， 可 以 区别 不 同 人 群 的 基 因差 异 ， 到 真 正 的 “ 就 达 用 药 个 体 化 ”从 而使 患 者得 到最 佳 治疗 效 果 。 ， 目前 ， 物 基 因 组 学 知 识 已越 来 越 多 地 应 用 于 临 床 合 理 药 化 用 药 上 。如 出 ， 刘 指 已发 现 的 原 发 性 高 血 压 相 关 基 因 已超 过 ７ ０个 ， 同基 因 可导 致 对 高 不 血 压 药 物 不 同 的 疗 效 。 同 一 药 物 也 可 能 在 某 些 人 群 中 疗 效 差 ， 副作 用少 ， 在 另 外 一 些 人 群 中 的疗 效 好 ， 良反 应 多 。 毒 而 不
随着 对 基 因 组 学 、 子 遗 传 学 与 分 子 药 理 学 等 相 关 学 科 的 深 分
入研 究 ， 们 逐 渐 地 认 识 到 不 同 个 体 对 同 一 药 物 的 不 同反 应 ， 人 除 了药 代 动 力 学 方 面 造 成 的差 异 ， 多 的 是 药 效 学 方 面 的原 更 因造 成 的差 异 ， 药 效 学 差 异 则 大 多 源 于 基 因 的差 异 。 那 么 而 药 物 基 因 组 学 的 研 究 就 是 以人 类 基 因 组 学 为 基 础 ， 用 了 日 利 益 完 善 的 基 因 分 析 方 法 ， Ｄ Ａ 测 序 、 因定 位 等 ， 究 影 响 如 Ｎ 基 研 药 物 吸 收 、 运 、 谢 、 除 等 过 程 中 存 在 的 个 体 差 异 的基 因 转 代 消 特性 ， 以此 为 平 台 开 发 新 药 、 导 合 理 用 药 ， 而 达 到 提 高 并 指 从 药 物疗 效 ， 全 性 及 经 济 性 的 目的 ［ 。 同时 ， 为 患 者 或 特 定 安 ２ Ｊ 也 人 群 在 寻 找 合 适 的药 物 及 临床 个 体 化 用 药上 开 辟 新 途径 。 １ 药 物 基 因 组 学 的 发 展 简 史 药 物 基 因组 学 是 药 物 遗 传 学 （ ｈｒ ｃｇｎｔ ｓ的 发 展 和 Ｐ ａｍａｏｅｅｉ ） ａ 延 伸 。 药 物遗 传 学 主 要 集 中 于 研 究 单 基 因 的 变 异 ， 别 是 药 特 物 代 谢 酶 基 因 变 异 对 药 物 作 用 的影 响 。而 药 物 基 因 组 学 除 覆
基因芯片技术在中药基因组学研究中的应用
收稿日期:2006-12-01; 修订日期:2007-02-02基金项目:黑龙江省自然科学基金重点项目(ZJ Y005006-02);黑龙江省研究生创新科研资金项目作者简介:唐先明(1978-),男(汉族),黑龙江哈尔滨人,现为黑龙江中医药大学2004级硕士研究生,学士学位,主要从事抗肿瘤中药药理研究工作.*通讯作者简介:王振月(1956-),男(汉族),黑龙江哈尔滨人,黑龙江中医药大学教授,学士学位,主要从事中药资源与开发、生物技术、新药开发研究工作.基因芯片技术在中药基因组学研究中的应用唐先明1,王振月1*,赵海鹏1,王宗权1,2,陈智岩1(1.黑龙江中医药大学药学院,黑龙江哈尔滨 150040;2.河北以岭医药研究院,河北石家庄 050035)摘要:该文基于现代基因组学特别是功能基因组学及一些生物技术手段的研究进展及发展趋势,从一个新的视角提出了开展/中药基因组学(TC M G enomm ics)0研究的策略。
认为当前中药的现代化研究应集中体现于中药基因组学,并将以基因芯片等为核心的基因技术引入中药基因组学和现代中药研究。
将中药的作用机理或功能利用能代表其功能的一组基因表达的影响来诠释。
关键词:基因芯片; 中药基因组学; 中药现代化中图分类号:R2-03 文献标识码:A 文章编号:1008-0805(2007)05-1097-03Application of G ene Chip Technology to Traditional Chinese M edicine G eno mm icsTANG X ian-m ing 1,WANG Z hen -yue1*,Z HAO H a-i peng 1,W ANG Z ong -quan 2,C H E Z h-i yan 1(1.College of Phar macy,H eilongjiang University o f T rad itional Chinese M edicine ,H arbin 150040,China;2.Yiling M ed ical Instit u te ,Yili n g,H ebei 050035,China )Abst ract :In t h is paper a new research strategy o f /TC M G enom ics 0is proposed on the basis of ach i eve m ents and advances i nthe fi e l ds o fHG P ,b i ochip pro teom i cs ,biotechnology andm odern analytic techno log ies .In o rder to e l uc i date the action or functi on o f TC M w ith its regulation to a group o f genes tha t represent t h i s ac ti on or functi on .W e presume thatm ode rniza ti on of TC M shou l d focus on TC M G enomm i cs and apply g ene techno l ogy cen tred upon gene ch i p to TC M G enomm ics and m odern research of TCM.K ey w ords :G ene chip ; TC M G enomm i cs ; M oderniza tion o f TC M化学曾经在中药研究与开发领域扮演了极为重要的角色,但今天药物研究与开发的基础已经由化学转变为生物学,尤其是分子生物学、基因组学和生物信息学。
复旦大学生命科学学院2016年推免生复试通过名单(3)
86.0 84.0 85.0 86.0 89.0 86.0 86.0 85.0 87.0 85.0 87.0 89.0 87.0 90.0 85.0 88.0 87.0 87.0 87.0 88.0 87.0 86.0 85.0 89.0 88.0 84.0 89.0 85.0 86.0 86.0 93.0 87.0 90.0 83.0 78.0 90.0 90.0 86.0 88.0 80.0 75.0 72.0 85.0 92.0 82.0 88.0学 植物遗传学 植物遗传学 遗传工程学 遗传工程学 基因载体与靶向给药系统 基因载体与靶向给药系统 模式动物遗传学 模式动物遗传学 发育遗传分析方法 发育机理与疾病动物模型 蛋白质化学、蛋白质组学和基因表达调控 蛋白质化学、蛋白质组学和基因表达调控 蛋白质化学、蛋白质组学和基因表达调控 表观遗传学 表观遗传学 表观遗传学 植物分子生物学，生物信息学和生物工程 植物分子生物学，生物信息学和生物工程 分子细胞生物学 植物发育与细胞生物学 代谢组学 蛋白质结构生物学 蛋白质结构生物学 蛋白质结构生物学 蛋白质结构生物学 计算生物学和理论生物物理 比较基因组学 疾病遗传信息分析 疾病遗传信息分析 疾病遗传信息分析 历史人类学 湿地生态学 湿地生态学 土壤生态学 土壤生态学 景观生态学 动物生态学 理论生态学 理论生态学 生物入侵生态学 生物统计的理论与方法学研究 生物技术 生物技术 生物信息
复旦大学生命科学学院2016年推免生复试通过名单 现将我院2016年拟接收推荐免试研究生名单公示如下。请有意报考我院研究生的同学根据已发 布的招生目录上的招生名额数和拟接收推免生数决定报考意向。 姓名 复试专业 复试研究方向 复试成绩 备注 毛云子 微生物学 微生物遗传与代谢 89.0 直博生 王岑 神经生物学 神经疾病的基因机制 94.0 直博生 刘晓瑜 遗传学 人类和医学分子遗传学 90.0 直博生 曾炜佳 遗传学 人类和医学分子遗传学 86.0 直博生 晏紫君 遗传学 多基因疾病研究(群体与数量遗传学) 91.0 直博生 武子涵 遗传学 动物分子遗传学 90.0 直博生 张国梁 遗传学 植物细胞分子遗传学 90.0 直博生 缪朗曦 遗传学 植物细胞分子遗传学 92.0 直博生 王渊 生物化学与分子生物学 植物分子生物学、生物工程和基因组学 92.0 直博生 彭叶青 生物化学与分子生物学 代谢组学 92.0 直博生 宰云菡 生物化学与分子生物学 蛋白质组学 91.0 直博生 金斐 生物物理学 蛋白质结构生物学 95.0 直博生 俞杰超 生物信息学 比较基因组学 90.0 直博生 曹文华 生态学 生物多样性与保护生物学 92.0 直博生 杨晶 生态学 进化生态学 93.0 直博生 汪智 植物学 基因资源的利用与保护 89.0 王丹其 微生物学 微生物生理代谢和遗传 86.0 张轩 微生物学 微生物生理代谢和遗传 86.0 董丽 微生物学 微生物系统分类、进化和生态学 87.0 罗梓田 微生物学 微生物感染与分子免疫学 80.0 罗华灶 微生物学 微生物感染与分子免疫学 85.0 相慢玉 微生物学 微生物感染与分子免疫学 86.0 沈潮 微生物学 病毒学 84.0 潘宇寅 神经生物学 神经疾病的基因机制 89.0 李冠鸾 神经生物学 听觉、触觉的分子转导机制 88.0 刘庆卓 神经生物学 突触传递调控及可塑性 87.0 杨熙 遗传学 人类和医学分子遗传学 89.0 人才工程 唐淑妍 遗传学 人类和医学分子遗传学 88.0 侯卓然 遗传学 人类和医学分子遗传学 88.0 任路瑶 遗传学 人类和医学分子遗传学 89.0 武舫伊 遗传学 人类和医学分子遗传学 83.0 何凡 遗传学 人类和医学分子遗传学 88.0 何懿 遗传学 人类和医学分子遗传学 87.0 潘晗雨 遗传学 人类和医学分子遗传学 92.0 王贝 遗传学 人类和医学分子遗传学 86.0 周舟 遗传学 人类和医学分子遗传学 86.0 丁冬 遗传学 人类和医学分子遗传学 85.0 吉一凡 遗传学 人类和医学分子遗传学 86.0 赵晗 遗传学 人类和医学分子遗传学 87.0 常越 遗传学 人类和医学分子遗传学 86.0 王鹤 遗传学 人类和医学分子遗传学 85.0 施天仿 遗传学 微生物分子遗传学 81.0 范辰韵 遗传学 微生物分子遗传学 85.0 刘自伦 遗传学 发育遗传学 82.0 杨丽 遗传学 发育遗传学 84.0 杨丝雨 遗传学 发育遗传学 90.0 黄柳琪 遗传学 发育遗传学 88.0 张妍 遗传学 发育遗传学 85.0 宿可 遗传学 群体与数量遗传学 88.0 孙浩杰 遗传学 植物遗传学 82.0
生物信息学参考书籍(入门级)
生物信息学参考书籍（入门级）1、David W.Mount 《Bioinformatics sequence and genome analysis》影印本，科学出版社,20022、Durbin R,Eddy S,Krogh A,et al.生物序列分析,蛋白质和核酸的概率论模型[M].北京清华大学出版社,20023、帕夫纳，计算分子生物学算法逼近，化学工业出版社，20044、(巴西) J.塞图宝，J.梅丹尼斯著，朱浩等译，计算分子生物学导论，科学出版社，20035、Masatoshi Nei（根井正利）Sudhir Kumar. 译者：吕宝忠，钟扬，高莉萍，高等教育出版社，20026、[美][巴森文尼斯]Andreas D.Baxevanis,[美]B.F.Francis Ouellette著；李衍达,孙之荣等译，生物信息学基因和蛋白质分析的实用指南,，清华大学出版社, 20007、鲍尔迪，DNA芯片和基因表达从实验到数据分析与模建，科学出版社，20038、（美）利布莱尔，蛋白质组学导论：生物学的新工具，科学出版社，20059、张亮，M.谢纳[美] ，生物芯片分析，科学出版社，200410、卢因，基因VⅢ，科学出版社，200511、(英)D.R.韦斯特海德(D.R. Westhead)等著；王明怡等译, 生物信息学，科学出版社200412、（法）皮埃尔·巴尔迪（Pierre Baldi），(丹)索恩·布鲁纳克（Soren Brunak）著；张东晖等译，生物信息学：机器学习方法，中信出版社，200313、(美）Cyntbia Gibas,Per Jambecks著；孙超等译《生物信息学中的计算机技术》中国电力出版社，200214、(美) Dan E. Krane, Michael L. Raymer著, 孙啸，陆祖宏，谢建明等译，生物信息学概论, 清华大学出版社200415、(加)S.米塞诺, (美)S.A.克拉维茨著；欧阳红生, 阮承迈, 李慎涛等译,生物信息学方法指南，科学出版社，200516、孙之荣主译探索基因组学、蛋白质组学和生物信息学（中译版），科学出版社，2004年8月出版17、哈特尔，遗传学基因与基因组分析，科学出版社,200218、生物信息学若干前沿问题的探讨：中国科协第81次青年科学家论坛论文集／黄德双等主编, 中国科学技术大学出版社200419、胡松年，薛庆中主编，《基因组数据分析手册》浙江大学出版社, 200320、胡松年，基因表达序列标签（EST）数据分析手册，浙江大学出版社, 200521、李敏强，寇纪淞，林丹，李书全，遗传算法的基本理论与应用. 科学出版社. 2002年4月22、孙啸, 陆祖宏, 谢建明编著,生物信息学基础, 清华大学出版社200523、李霞主编，《现代生物信息学理论与实践》，科学出版社，2005年11月出版生物信息学参考书籍（入门级）页码，12httpebook7.htm 20158624、袁建刚等主译《基因组》科学出版社，200225、黄韧等《生物信息学网络资源与应用》中山大学出版社，200326、郝柏林等编《生物信息学手册》第2版，上海科学技术出版社，200227、蒋彦等编《基础生物信息学及应用》清华大学出版社，科学出版社，200328、张继仁（译）蛋白质组学导论：生物学的新工具，科学出版社，2004年12月出版29、夏其昌，白质化学与蛋白质组学，科学出版社，2004年30、蒋华良、钟扬、陈国强、罗小民等译药物基因组学——寻找个性化治疗，科学出版社，2005年7月出版31、David W.Mount 著钟扬，王莉，张亮主译，生物信息学，高等教育出版社，200332、张阳德编，《生物信息学》科学出版社，200433、沈世镒著，生物序列突变与比对的结构分析，科学出版社200434、赵国屏等编《生物信息学》科学出版社，200235、郑珩王非，药物生物信息学，化学工业出版社，200436、Minoru Kanehisa著；孙之荣等译,后基因组信息学, 清华大学出版社, 200237、赵雨杰主编，医学生物信息学，人民军医出版社，200238、李桂源,钱骏主编,基于WWW的生物信息学应用指南，中南大学出版社200439、李巍主编,生物信息学导论，郑州大学出版社，200440、钱小红、贺福初等译蛋白质组学：从序列到功能. 科学出版社，2002年9月41、钱小红，贺福初主编.蛋白质组学理论与方法，科学出版社，200342、张阳德，纳米生物技术学，科学出版社，200543、李越中闫章才高培基，基因组研究与生物信息学，山东大学出版社，2003网络资料：（很多，简单举例）国内mainCourseFurtherReading.htmchenyuanxsunBioinformaticsInternetStudyBioinformaticsInternetStudy Ebook_bioinfo.htm国外bioinformaticsbioinf03_courses.htm。
2014年重庆市研究生科研创新项目立项名单(硕士研究生)
附件22014年重庆市研究生科研创新项目立项名单（硕士研究生）项目编号学校名称项目名称项目负责人所属学科CYS14001 重庆大学投资者情绪与交叉上市公司股票定价——来自中国AH股市场的经验证据吴琴琴应用经济学CYS14002 重庆大学敏感时期群体性突发事件的网络舆论引导与应对陈秋月新闻传播学CYS14003 重庆大学高温高压作用下核电用材料性能退化理论模型及实验方法研究杜伟奇机械工程CYS14004 重庆大学基于肿瘤干细胞特性构建核壳结构靶向联合给药系统的研究李宗生物医学工程CYS14005 重庆大学基于离散窄带频谱的宽带无线接入技术研究贺渊信息与通信工程CYS14006 重庆大学碳纳米管电极增强电化学/臭氧耦合降解有机药物周宇土木工程CYS14007 重庆大学分布式智能微网协调运行与容错控制理论研究陈晨控制科学与工程CYS14008 重庆大学基于L-LDA的代码检测到代码质量的映射研究傅颖计算机科学与技术CYS14009 重庆大学人口结构变化与中国经常项目顺差：理论与实证研究刘铠豪应用经济学CYS14010 重庆大学高校参与传统技艺非物质文化遗产保护与传承的效用研究—————以重庆市为例孔德祥艺术学CYS14011 重庆大学SnO2基薄膜的气敏性能及敏感机理研究张鹤材料科学与工程CYS14012 重庆大学变电站接地网循环测量及腐蚀故障诊断方法研究刘凯电气工程CYS14013 重庆大学基于美丽乡村的宁夏回族传统聚落营建模式研究范银典建筑学CYS14014 重庆大学理性回归与视觉狂欢：当下国产片喜剧性研究宗伟刚艺术学CYS14015 重庆大学高压水射流破碎煤岩机理研究薛永志环境科学与工程CYS14016 重庆大学高炉渣离心粒化及余热回收性能研究吴君军动力工程及工程热物理CYS14017 重庆大学特殊蛋白质内电子传递电子转移中继站的研究孙维超化学工程与技术CYS14018 重庆大学分布式约束优化算法研究何振计算机科学与技术CYS14019 重庆大学激进清教与革命的乌托邦：弥尔顿研究陈彦法学CYS14020 重庆大学非直接正则化的变分水平集图像分割模型刘阳数学CYS14021 重庆大学基于FPGA的实时全高清裸眼3D播放系统黄振伟信息与通信工程CYS14022 重庆大学基于气敏传感器肺癌呼出气体检测系统的研究赵师贤生物医学工程CYS14023 重庆大学体外血管-血流-支架三者相互作用的模拟实验系统的构建符美灵生物学CYS14024 重庆大学智能机器宠物创意设计研究赵佳妮艺术学CYS14025 重庆大学消防员应急三维室内定位与导航乔自士信息与通信工程CYS14026 重庆大学汽车驾驶员疲劳检测系统设计李震海信息与通信工程CYS14027 重庆大学基于图像的燃气指数自动检测手机软件的研发高明琦计算机科学与技术CYS14028 重庆大学基于数字图像处理的钢轨裂纹检测方法彭玲仪器科学与技术CYS14029 重庆大学快递员智能型便携扫描式取货提醒终端研制王晓旭电气工程CYS14030 重庆大学小型智能四旋翼飞行器赵俊波信息与通信工程CYS14031 重庆大学基于行为识别的跌倒检测仪研究戴真信息与通信工程CYS14032 重庆大学基于电子鼻技术的空气质量监测云终端谢鑫信息与通信工程CYS14033 重庆大学基于DeepLearning的汽车辅助设计系统研究陈卓计算机科学与技术CYS14034 重庆大学基于云计算的大数据视频摘要系统赵晨丘计算机科学与技术CYS14035 重庆大学仿生微流控表皮的传热效应研究蔡永超生物医学工程CYS14036 重庆大学基于增强现实技术（AR）的手持式房屋互动展示系统李骁管理科学与工程CYS14037 重庆大学基于Android的智能插板家居电源控制系统任浩控制科学与工程CYS14038 重庆大学基于单片机与GSM模块的智能晾衣装置开发杨仲升机械工程CYS14039 重庆大学基于无线传感网络的光谱水质监测系统刘娟光学工程CYS14040 重庆大学连接式土工袋边坡的工作机理研究郑斌土木工程CYS14041 西南大学棉纤维特异启动子(GhTUB7P)的功能鉴定和调控机制曾志锋生物学CYS14042 西南大学桑树内生成团泛菌SWg2菌株在桑树中定殖规律及其对桑疫病生防机理的研究舒平生物学CYS14043 西南大学水稻剑叶发育相关基因TFL1的图位克隆和功能分析张孝波作物学CYS14044 西南大学结核分枝杆菌基因组DNA甲基化调控基因表达的机理曾洁生物学CYS14045 西南大学柑桔CHS家族基因对类黄酮生物合成的遗传调控王志彬植物学CYS14046 西南大学对西方迷园与中国假山在空间特征上的比较研究杨琪瑶风景园林学CYS14047 西南大学柑橘多甲氧基黄酮（PMFs）合成特异OMT基因家族成员的克隆及鉴别张秋云果树学CYS14048 西南大学家蚕血液免疫黑化的分子机制研究李田生物学CYS14049 西南大学金、银纳米簇(碳量子点)用于肿瘤细胞的标记及肿瘤标志物的检测卓艳医学CYS14050 西南大学专业能力视野下，研究生社会实践现状调查及其对策研究——以重庆地区为例任伟教育学CYS14051 西南大学人体营养健康角度的中国果蔬发展趋势预测与战略研究马恋统计学CYS14052 西南大学方形孔径平面微透镜阵列对微图形阵列莫尔显示的衍射原理张宝昊物理学CYS14053 西南大学基于递归神经网络求解连续非凸优化问题车杭骏信息与通信工程CYS14054 西南大学紫色土农耕地细沟侵蚀输沙过程研究罗帮林林学CYS14055 西南大学姜科作物连作抗病土壤微生态的特征分析刘晓姣植物保护CYS14056 西南大学季节性冰雪融水对岩溶地下水水质的影响于正良第四纪地质学CYS14057 西南大学猪传染性胃肠炎病毒M蛋白在病毒样颗粒组装中功能域的初步鉴定代先进预防兽医学CYS14058 西南大学不同产羔类型大足黑山羊胎盘血管形态的比较及差异基因的筛选管代禄畜牧学CYS14059 西南大学高阻燃超亲水涤纶纤维改性研究徐芳纤维材料与工程CYS14060 西南大学低维BxCyNz超硬材料的第一性原理研究焦丽娜材料科学CYS14061 西南大学立式铣削刀具与土壤的作用机理研究赵华慧农业工程CYS14062 西南大学基于多源信息融合的跨膜蛋白拓扑预测研究李美竹计算机科学与技术CYS14063 西南大学基于语义技术的农村农业信息化示范城市综合门户建设王国栋软件工程CYS14064 西南大学红色在不同社会情境下对时间知觉的影响史嘉鑫心理学CYS14065 西南大学农村留守儿童主观幸福感和社会适应的横断研究徐文健心理学CYS14066 西南大学抗战时期中央研究院内迁与西部开发邓怡迷历史学CYS14067 西南大学微时代大学生主流意识形态教育研究——以重庆市高校为例宋斌马克思主义理论CYS14068 西南大学小额贷款公司的金融产品创新及风险防范研究王汉杰应用经济学CYS14069 西南大学契约机制在我国农村治理中的运用研究潘晨法学CYS14070 西南大学NGO参与乡村治理的路径研究：基于重庆市的实证研究柳小琴社会学CYS14071 西南大学《全唐文补遗》斠诠与研究罗顺中国语言文学CYS14072 西南大学纳西东巴经称谓词用字研究马跃中国语言文学CYS14073 西南大学码头文化与重庆文学（1891—1945）向玲霜中国现当代文学CYS14074 西南大学微课在中小学翻转课堂教学模式中的研究张沥韦教育学CYS14075 西南大学唐代关中诗文用韵研究柏雪汉语言文字学CYS14076 西南大学步态分析在跨栏技术教学中的应用研究裴希俊运动人体科学CYS14077 西南大学反讽话语的相关事件电位研究程和奔外国语言文学CYS14078 西南大学中国20世纪80年代“校园电影”的矛盾冲突研究周蓁涵艺术学CYS14079 西南大学歌唱嗓音共鸣声效与声向控制关系张耀月人文学科CYS14080 西南大学中国台湾新诗生态调查及文体研究王觅中国语言文学CYS14081 西南政法大学上海自贸区模式推广的法律困境及其出路——兼评负面清单制度杨晨民商法学CYS14082 西南政法大学自贡盐业契约文化创新与传承杨惠嘉民商法学CYS14083 西南政法大学微信平台转载的侵权责任郑燕燕知识产权法CYS14084 西南政法大学四川省甘孜藏族自治州一妻多夫现象实证调查研究泽绒拥珍民商法学CYS14085 西南政法大学规制与发展：公益组织的法人化研究周芙蓉民商法学CYS14086 西南政法大学非法营运治理的法律对策研究——以未来取得经营权为视角罗开红宪法学与行政法学CYS14087 西南政法大学法治指数定量问题研究王裕根法学理论CYS14088 西南政法大学创业网络混合治理机制的构成、机理及其绩效影响作用研究杨婉毓管理学CYS14089 西南政法大学非市场经济国际地位条款在2016年后的效力研究——兼论重庆出口企业的对策刘俊杰国际法CYS14090 西南政法大学融媒体时代的媒介环境权研究李英男新闻传播学CYS14091 西南政法大学边疆民族自治县政府治理体系和治理能力现代化研究——基于三个民族自治县的调查陆杨洁政治学CYS14092 西南政法大学提案型公共服务——民营化运作创新模式张奇公共管理学CYS14093 西南政法大学重庆两江新区重大行政决策风险评估机制优化研究刘白公共管理学CYS14094 西南政法大学利率市场化对中国商业银行盈利影响的实证分析王亚军应用经济学CYS14095 西南政法大学退休终止劳动合同制度研究：基于重庆主城区人民法院相关裁判文书的实证分析魏超洲经济法学CYS14096 西南政法大学土地承包经营权权利结构研究李兴宇环境资源法CYS14097 西南政法大学优先股股东权益保护的法律制度研究钟颖经济法学CYS14098 西南政法大学食品安全“黑名单”制度法律问题研究杨扬经济法学CYS14099 西南政法大学违反法定讯问程序收集的口供证据能力问题研究张春利诉讼法学CYS14100 西南政法大学补充赔偿责任的诉讼形态研究—以《公司法司法解释（三）》为中心熊建华诉讼法学CYS14101 西南政法大学简易程序要件事实表格化的实证研究令狐宇珊诉讼法学CYS14102 西南政法大学行刑反制量刑：死刑控制的第三条路径严海杰刑法学CYS14103 西南政法大学义务冲突的立法证成与司法实践：以拒不支付劳动报酬罪为例宋亚君刑法学CYS14104 西南政法大学政法类大学生思想政治教育有效性研究刘小春马克思主义理论CYS14105 西南政法大学毒品案件侦查中冰毒快速检测方法研究祁堃法庭科学CYS14106 重庆医科大学纳米增效剂在HIFU表面消融模式中的研究陈飞影像医学与核医学CYS14107 重庆医科大学包裹金纳米棒-液态氟碳联合光声成像靶向对动脉粥样硬化斑块治疗的初步研究夏琼影像医学与核医学CYS14108 重庆医科大学miR-21对子宫内膜基质细胞增殖与凋亡调控机制的研究杨源遗传学CYS14109 重庆医科大学利福平对大鼠全脑缺血的保护作用及机制探讨谌贝贝神经病学CYS14110 重庆医科大学CMS刺激致青少年期大鼠抑郁样行为的海马蛋白质组学研究张玉清神经病学CYS14111 重庆医科大学探索肠球菌利奈唑胺低水平耐药的新机制高睿临床检验诊断学CYS14112 重庆医科大学大肠埃希菌碳青霉烯类抗生素异质性耐药分子机制探索马维佳临床检验诊断学CYS14113 重庆医科大学DNA分子自组装用于MicroRNA的检测张晔临床检验诊断学CYS14114 重庆医科大学基于T7核酸外切酶循环放大策略用于肝癌细胞miRNA-21检测李胜强临床检验诊断学CYS14115 重庆医科大学探讨携NPM突变白血病的糖酵解表型特征及其调控机制鲜敬荣临床检验诊断学CYS14116 重庆医科大学表观遗传调控ZNF382在乳腺癌中的作用及机理研究李舒曼肿瘤学CYS14117 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重庆邮电大学复杂体制组合BOC直扩信号的检测与估计周杨信息与通信工程CYS14141 重庆邮电大学面向 5G 基于负载感知的 HetNets 增强型小区干扰管理优化设计黄晨信息与通信工程CYS14142 重庆邮电大学基于鲁棒统计的大规模点云数据处理算法研究孙颖计算机科学与技术CYS14143 重庆邮电大学基于博弈论的5G移动通信网中功率控制和资源分配研究杨和林信息与通信工程CYS14144 重庆邮电大学CO-OFDM通信系统中新颖LDPC码型的构造方法研究周光香电子科学与技术CYS14145 重庆邮电大学桥墩支座仿人自适应隔震控制与小尺度台架实验研究周虹利控制科学与工程CYS14146 重庆邮电大学基于社交网络的用户行为建模与应用算法研究马晶信息与通信工程CYS14147 重庆邮电大学基于人眼视觉感知的移动终端上显示增强技术的研究闫亚星计算机科学与技术CYS14148 重庆邮电大学基于IPv6技术的电力载波通信网络路由技术研究文成亮控制科学与工程CYS14149 重庆邮电大学CRSNs中基于认知与源感知节点分离的MAC协议研究孙泽华信息与通信工程CYS14150 重庆邮电大学手写签名智能鉴定系统颉小凤计算机科学与技术CYS14151 重庆邮电大学FBG传感网络在海洋平台冲击定位与漏油点预警的研究杨凯控制科学与工程CYS14152 重庆邮电大学可调控单一基质白光荧光粉的研究吴冰物理学CYS14153 重庆邮电大学新媒体环境下大学生媒介素养的培养田红超法学CYS14154 重庆邮电大学蛋白质组质谱大数据存储架构与核心算法研究冯晓东生物医学工程CYS14155 重庆交通大学相变材料在建筑屋面保温隔热层中的应用研究祝文允材料工程CYS14156 重庆交通大学融雪抑冰型保水降温半柔性路面的开发与性能研究邹孟秋材料工程CYS14157 重庆交通大学山区高填方机场沉降监测数据智能化处理与评估系统研究李灵爱测绘科学与技术CYS14158 重庆交通大学纳米TiO2掺杂改性及路表光降解NOx机理研究刘晓凤交通运输工程CYS14159 重庆交通大学贵州省喀斯特地区城市水安全时空动态分异模拟及其评价研究苏印地理学CYS14160 重庆交通大学大比降卵砾石河流中扭王字块的消能机理及稳定性研究田蜜水利工程CYS14161 重庆交通大学PPP模式下城市轨道交通廓道效应外部性分析及补偿机制研究胡明洋管理科学与工程CYS14162 重庆交通大学重载精密机械手复合关节传动机理与控制技术研究陈才机械工程CYS14163 重庆交通大学脉冲复数神经网络稳定性分析与控制闫欢计算机科学与技术CYS14164 重庆交通大学钢筋混凝土桥梁——受弯构件疲劳破坏试验研究单爱成土木工程CYS14165 重庆交通大学双排桩多层土拱传力特性与试验研究赵波交通运输工程CYS14166 重庆交通大学粘性土剪切断裂破坏性状及机理研究胡骏峰水利工程CYS14167 重庆交通大学边坡复合锚固技术研究延兆奇水利工程CYS14168 重庆工商大学重庆农民集中居住障碍研究——以合川、江津、忠县等新村为例邓雪霜应用经济学CYS14169 重庆工商大学酉阳与彭水地区经济社会发展对比分析研究王傲雪应用经济学CYS14170 重庆工商大学工作价值取向视角的主客观职业成功关系研究黄霞工商管理CYS14171 重庆工商大学都市青年手机依赖现象的社会心理研究贾悦社会学CYS14172 重庆工商大学黑色(BiO)2CO3光催化与常温催化协同高效去除大气中NOx的机制熊婷环境工程CYS14173 重庆工商大学柑橘皮渣厌氧发酵专用青贮剂研究潘小梅环境科学与工程CYS14174 重庆工商大学净化网络信息环境的法律规制研究夏治禹法学CYS14175 四川外国语大学现代英语兼类词释义策略研究——以《牛津高阶英语词典》（第8版）为例王端外国语言文学CYS14176 四川外国语大学认知翻译观视角下莫言作品译介研究聂榆倚外国语言文学CYS14177 四川外国语大学宋代川渝地区禅宗思想对日本禅宗的影响梁樱紫外国语言文学CYS14178 四川外国语大学重庆地区韩国独立运动家创作作品考察孙雪婷外国语言文学CYS14179 四川外国语大学文化语言学的认知拓展冯军外国语言文学CYS14180 四川外国语大学重庆市媒体融合发展调查研究与策略思考翟乐遥新闻传播学CYS14181 四川外国语大学中俄两河流域合作内部协调机制路线图研究赵健哲政治学CYS14182 四川美术学院以学院为主体的青年艺术家帮扶计划--四川美术学院青年艺术家驻留计划学理研究与实践符周阳美术学CYS14183 四川美术学院基于可持续发展战略下的绿色设计行业标准制定与实施经验研究梁婷设计学CYS14184 四川美术学院大足石刻石门山造像的图像学研究未小妹艺术学理论CYS14185 四川美术学院动漫文化背景下的中国西部本土绝灭动物科普类动漫衍生产品开发研究钟崇瑶戏剧与影视学CYS14186 四川美术学院后三峡时期梁平地区非物质文化遗产代表性传承人口述史研究--以木板年画为例王晗设计学CYS14187 重庆理工大学云会计下AIS可信需求变化影响分析模型构建研究徐云云工商管理CYS14188 重庆理工大学汽车变速器试验台动态载荷谱加载方法研究季云龙机械工程CYS14189 重庆理工大学光场式时栅位移传感器行波形成新方法的研究姜林言仪器科学与技术CYS14190 重庆理工大学家庭农场土地经营权抵押融资行为的决策研究——基于系统动力学的研究方法孙权应用经济学CYS14191 重庆理工大学SIRT1新型小分子抑制剂的设计合成及抗肝癌活性的初步研究丁雪垒微生物与生化药学CYS14192 重庆理工大学齿轮双面啮合综合误差检测方法及软件系统张洪利机械制造CYS14193 重庆理工大学强韧化类金刚石碳基复合薄膜的多层/多界面结构可控与性能关联性张思远材料科学与工程CYS14194 重庆科技学院水平井钻井钻柱减阻降扭工具设计与分析刘洪伟石油与天然气工程CYS14195 重庆科技学院基于数据驱动的超低能耗铝电解槽况诊断应用研究黄迪安全科学与工程CYS14196 第三军医大学长链非编码RNA H19在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞促炎中的作用及调节机制吕细林生物学CYS14197 第三军医大学端粒酶逆转录酶上调Cdx2表达的分子机制及其在胃黏膜肠上皮化生中的作用研究万晗星临床医学CYS14198 第三军医大学HIF-1α经GLS2/GSH途径介导结肠癌奥沙利铂耐药的机制研究李妮临床医学CYS14199 第三军医大学核黄素活体追踪肺癌启动细胞的纳米显像技术廖星芸公共卫生与CYS14200 第三军医大学ERK-Myc-ATG4B信号通路的鉴定及其在细胞自噬发生中的作用研究吴亚冉生物学CYS14201 后勤工程学院人工淹没空化水射流技术与应用研究雷传超石油与天然气工程CYS14202 后勤工程学院表面亲水改性下管式海水淡化性能研究于涛环境科学与工程CYS14203 重庆通信学院加密域图像压缩技术及其在云计算中的应用季晓勇信息与通信工程CYS14204 重庆通信学院基于短波通信的MIMO-OFDM关键技术研究康瑞琪信息与通信工程CYS14205 市委党校党政领导干部选拨作用中的投票博弈研究王超公共管理。
生物信息学在生物学研究领域的应用
生物信息学在生物学研究领域的应用作者：杜会龙来源：《城市建设理论研究》2013年第02期摘要：生物信息学是80年代兴起的一门新的交叉学科，随即应用在广泛的领域。
本文主要讲述了生物信息学在生物芯片，药物研发，能源领域的应用，农作物基因分析，疾病检测等方面的应用。
生物信息学对生物数据进行收集，整理与服务，并从中发现规律指导研究，是当今生物信息学研究不可或缺的重要工具。
关键词：生物信息学；生物芯片；药物开发；疾病检测Abstract: Bioinformatics was emerged in the 1980s,which is a new cross- discipline and then was applicated in the wide range of areas. Bioinformatics in biochips, drug development, energy fields, crop genetic analysis, disease detection are introduced in the context . Bioinformatics focuses on the collection, collation and services of biological data to discover laws guiding research,which is an indispensable tool for bioinformatics research.Keywords: Bioinformatics；Biochip；Drug development；Disease detection现代生物信息学是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学和化学等学科相互参透而形成的交叉学科，是应用计算机技术和信息论方法研究蛋白质及核酸序列等各种信息的采集、存储、传递、检索、分析和解读，以帮助了解生物学和遗传学信息的科学[1]。
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药物无效造成财力巨大浪费
Ineffective Therapies Waste Money Major Drug
ῲ Hypertension Drugs
ACE Inhibitors ῲ Heart Failure Drugs
Cost of Ineffectiveness to Healthcare System
(为重复序列基因多态性); 全无功能: CYP2D6*3, *4, *5, *6, *7, *8, *11, *12, *13, *14, *15, *16, *18, *19, *20, *21, *38, *40, *42, *44,*56 , *62
18
2D6等位基因在不同人群中的分布
Variant CYP2D6*2xN Phenotype UM Caucasian 1-5% Asian 0-2% African 2% Ethiopian/ Saudi 10-16%
+
10
药物基因组学与药物基因学的区别
Pharmacogenetics: the study of how genetic
differences among individuals cause varied responses to a drug Pharmacogenomics: Study of the effect of variation in multiple genes, or Is the Whole Genome Application of Pharmcogenetics. 目前已将二者统一称为PGx.
22
关于药酶的基因多态性
P450酶的基因多态型（Genetic polymorphism）使药 物代谢存在着种族和个体差异,目前分为4种表型： 正常代谢型 (EM),又称快代谢型 （Extensive Metabolizer，占75-85%）; 活性缺乏型 (PM),又称慢代谢型 （Poor Metabolizer,占5-10%）; 超速代谢型( UM)（Ultrarapid Metabolizer,占1-10%); 中间代谢型( IM)（Intermediate Metabolizer,占1015%)(此型介于EM与PM之间） 。
2
为什么药物疗效不一样?
3
抗高血压药疗效的种族差异
*注:负值表示黑人效果更好;正值表示白人效果更好
Circulation 2008:118:1383~1393
为什么药物的无效率如此之高?
Disease Drug Class Poor/Non Responders(%)
70 – 100 25 – 50 Cancer (breast, lung, brain) Various Diabetes Sulfonylureas Asthma OA/RA Duodenal Ulcer Hypertension
From Pharmacogenomic:Social, Ethical and Clinical Dimensions, M. Rothstein, ed. 8
PGx—实现用药的Fine Tuning
个体化给药的热点:氯吡格雷(波立维)
9
什么是药物基因组学?
Pharmacogenomics = drug therapy + genetic diagnostic test
$560 million – $1.0 billion
6
近60%药物的不良反应与基因相关
分析1991~2000年18个药物ADR报告,发现发生 率最高的27个药物中(包括Carbamazepine, fluoxetine, Ibuprofen, Imipramine, Isoniazid, Naproxen, Rifampin, Teophylline, Phenytoin, Verapamil , Warfarin等),有16个(~60%)药物的ADR发生至少与一 种药酶基因多态性(主要与poor metabolism)有关;反 之,随机抽查药物中,也有7~12%的药物与基因相关,提 示我们,如依据患者个体的基因多态性给药即可大大 减少ADR的发生!
$390 million – $1.2 billion
Beta Blockers
ῲ Anti Depressants SSRIs ῲ Cholesterol Drugs Statins ῲAsthma Drugs Beta-2-agonists
$345 million – $575 million
$2.3 billion – $5.8 billion $3.8 billion – $8.8 billion
21
美托洛尔说明书明确提示
—确受到PGx的影响 Metoprolol tartrate is extensively metabolized by the cytochrome P450 enzyme system in the liver. The oxidative metabolism of Lopressor (metoprolol tartrate) is under genetic control with a major contribution of the polymorphic cytochrome P450 isoform 2D6 (CYP2D6). There are marked ethnic differences in the prevalence of the poor metabolizers (PM) phenotype. Approximately 7% of Caucasians and less than 1% Asian are poor metabolizers.
CYP2D6*4
CYP2D6*10 CYP2D6*17
PM
IM IM
12-21%
1-2% 0%
1%
51% ND
2%
6% 34%
1-4%
3-9% 3-9%
CYP450 allele nomenclature committee database: http://www.imm.ki.se/cypalleles
11
基因(组)决定药物的效应
基因组 基因 基因多态性
药物代谢酶
药物转运体
药物靶点
药物代谢动力学
药物效应动力学
药物疗效和毒性差异
12
药物基因组学的优越性
―新世纪再也不是一个药包打天下了! 1,研发更有效的药物; 2,治疗开始就选用更好、更安全的药物; 3,准确的确定用药剂量; 4,早期筛查疾病; 5,生产更有效、更安全的疫苗; 6,改进药物发现及其审批过程; 7,减少总医疗费用。
2D6的抑制剂
From Wikipedia, the free encyclopedia
17
CYP2D6s的等位基因与功能
(2010年统计共>100个) 正常功能: CYP2D6*1、*2、*33、*35; 降低功能: CYP2D6*9、*10、*17、*36、*41; 增强功能: CYP2D6*1ⅹN、 *2ⅹN、 *35ⅹN, N= *1、*2、*33 、*41
药物基因组学与β受体阻滞剂的安全性
Pharmacogenomics and Safety of beta-blockrs
海军总医院
孙忠实 2012,5,12.北京
317号2011年9月
★心血管病是全球范围造成死亡的最主要原因:与其 它任何原因相比,心血管病每年造成的死亡最多。 ★2008年估计有1730万人死于心血管病，占全球死亡的 30%;中,估计有730万死于冠心病,620万 死于中风 。 ★80%以上的心血管病死亡发生在低收入和中等收入国 家,男性和女性的发生率几乎持平。 ★到2030年,几乎有2360万人将死于心血管病,主要死于心 脏病和中风。预计它们将继续成为死亡的一个主 要原因。
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两类药物经酶代谢的不同结果
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β-受体阻滞剂应用广泛但风险却很大
• Blockers are among the most widely prescribed of all drug classes, with more than 120 million prescriptions in the United States in 2004; • Are recommended as a first-line agent for various diseases, including heart failure, hypertension, and angina, as well as after myocardial infarction. However, β-blocker therapy often produces variable responses among patients. Genetic differences may contribute to this variability in responses to β-blockers.
JAMA 2001; 286: 2270-22797
不良反应与药酶变异相关最多的药物
Drug Treatment Enzyme Genotype Frequency
Fluoxetine antidepressant Imipramine antidepressant Isoniazid antituberculosis Metoprolol Beta-blocker Naproxen NSAID Phenytoin Anticonvulsant Piroxicam NSAID S-Ibuprofen NSAID S-Warfarin Anticoagulant Theophylline Brochodilator
Hyperlipidemia Depression Migraine BPH