illumina高通量测序仪汇总介绍
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随着基因领域研究的不断深入,自sanger测序实现对碱基信息的可读取后,更高通量的需求使得二代测序在基因组测序、临床检测和生物制药等领域展现出无与伦比
备注:数据来源于罗氏官网和网络
二、Illumina测序仪——测序界的巨鳄
2006年,Solexa公司推出了Genome Analyzer系统(简称GA),其包括DNA簇(DNA cluster)、桥式PCR(Bridge PCR)和可逆阻断(Reversible terminator)等核心技术,这使得GA系统在高通量、低成本、应用范围广等方面具有明显优点。2007年,Illumina公司收购了Solexa,并在随后几年间发布了多种测序仪,主要包括两类:低通量的桌面式测序仪和高通量台式测序仪,基本覆盖行业内的各种测序应用,目前占据的测序市场份额超8成。
1、Illumina HiSeq系列
HiSeq系列由Illumina公司2010年推出,该系列非常适合全基因组、转录组测序。2014年1月,Illumina宣布推出HiSeq X Ten测序平台,适用于大规模人群分析,包括10个可平行测序的超高通量测序仪,此系统号称为首个将人类全基因组测序成本降至1000美元或更低的测序平台。
测序原理:利用可逆性末端边合
成边测序技术、四通道成像技
术,每轮测序反应中存在4种核
苷酸。
仪器特点:该系列仪器成本低,
灵活性高,通量大。缺点是读长
短和对每个测序反应产生的大量
数据的存储和分析系统不足。
应用领域:Hiseq2500适合大规
模基因组学,Hiseq3000/4000适
合生产级模板的基因组学,
Hiseq X Five 适合生产级规模的
人类全基因组测序,Hiseq X T en
适合群体规模的测序。总体来
说,Hiseq 系列适合全基因组测
序、靶向重测序、全转录组测
序、de nov o 测序、表观遗传调
控等。
2、Illumina MiSeq
M iSeq 系列由Illumina 公司2011年推出,与Hiseq 分享主要的核心技术,但是体积和通量更小、价格低,M iseq 更佳便于扩增子和细菌样本测序,更佳适合临床使用。
测序原理:可逆性末端边合成边
测序技术、四通道成像技术。
仪器特点:易于操作,体积小
巧,可进行双向扩增子测序,样
本制备简易,具有2x300 bp 的读长,实现高达15 Gb 的产出。
缺点是不适合WGS 和WES 测序。
应用领域:MiSeq 系列快速简
约,适合小型全基因组测序(微
生物、病毒)、靶向基因测序
(扩增子、基因集合)、16S 宏
基因组测序、靶向基因表达谱、
长片段扩增子测序、DNA -蛋白
互作分析及miRNA 和小RNA
分析等。
3、Illumina N
e xtseq 500
N e xtseq 500是Illumina 公司于2014年推出的一款高通量台式测序仪,其大小与Miseq
相当,性能却与Hiseq 相当。
测序原理:改良型边合成边
测序(两通道SBS )化学原
理。
仪器特点:运行时间短、测
序质量高,全基因组、外显
子和RNA 测序可在一个平台
完成,改良型技术效率更高。
应用领域:适合大型全基因
组测序(人类、植物、动
物)、小型全基因组测序
(微生物、病毒)、外显子
组测序、靶向基因测序(扩
增子、基因集合)、全转录
组测序、基因表达谱
(mRNA-Seq )、miRNA 和
小RNA 分析、DNA -蛋白互
作分析、甲基化测序和16S
宏基因组测序。
4、Illumina M in iSeq
测序原理:可逆性末端边合成边
测序技术、双通道成像技术。
仪器特点:运行时间短、选择灵
活,测序质量更高。缺点是不适
合WGS 和WES 测序。
应用领域:适合大型全基因组测
序(人类、植物、动物)、小型全基因组测序(微生物、病毒)、外显子组测序、靶向基因测序(扩增子、基因集合)、全
转录组测序、基因表达谱
(mRNA-Seq )、miRNA 和小
RNA 分析、DNA -蛋白互作分
析、甲基化测序和16S 宏基因组
测序。
M in iSeq 是Illumina 公司于2016年1月发布的一款小型桌面式测序仪,体积比Miseq 仪器小44%。
5、Illumina N ova Seq 系列
N ova Seq 系列是Illumina 公司于2017年1月发布的可扩展的高通量测序仪,该系列有5000和6000两种系统,并且具有可选择的不同数量流动槽芯片的测序模式。
测序原理:可逆性末端边合成边测序技术、
整合了图案化流动槽技术。
仪器特点:可扩展、通量高、选择灵活、簇
密度和产出更高。
应用领域:使用范围广,以上4种类型仪器
的测序领域均可覆盖。Array备注:数据来源于Illumina官网
三、Thermo Fisher体系测序仪——测序的联合王国
2008年ABI与Invitrogen合并成为Life technologies公司,2010年8月,Life Technologies将Ion Torrent收购,2013年,Life Technologies被Thermo Fisher收购,借此Thermo Fisher正式入驻测序行业,旗下测序体系包括ABI SOLID和Ion-Proton两种平台。
1、ABI SOLID