虹鳟PDCD6基因cDNA全长的克隆与功能预测

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２．Ｃｏｌｌｅｇｅｏｆ１ｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅ，ＪｉｌｉｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ１３００１２，Ｃｈｉｎａ；
３．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＯｃｅａｎ，ＨｅｂｅｉＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｑｉｎｈｕａｎｇｄａｏ０６６００３，Ｃｈｉｎａ）
１７９Ｉ）ｐｃＤＮＡｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ４８ｂｐ５’ｕｎｔｒａｎｓｌａｔｅｄｒｅｇｉｏｎ，５６７ｂｐ３’ 一ｕｎｔｒａｎｓｌａｔｅｄｒｅｇｉｏｎａｎｄ５６４ｈｐｏｐｅｎｒｅａｄｉｎｇｆｒａｍｅｅｎｃｏｄｉｎｇ１８７ａｍｉｎｏａｃｉｄｓ．Ｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｐｒｏｆｉｌｅａｎａｌｙｓｉｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｔｈｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｓｏｆｔｈｅｇｅｎｅｗｅｒｅｆｏｕｎｄｉｎｓｅｖｅｒａｌｐａｒｔｓｏｒｔｉｓｓｕｅｓｉｎｆｏｕｒｓｐｅｃｉｅｓｏｆｖｅｒｔｅｂｒａｔｅｓ．ＨｏｍｏｌｏｇｙｍｏｄｅｌｉｎｇｏｆｔｅｒｔｉａｒｙＳｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆｔｈｅｐｒｏｔｅｉｎＰＤＣＤ６ｓｈｏｗｅｄｔｈａｔＰＤＣＤ６ｃｏｎｔａｉｎｅｄ８ｍａｉｎａｌｐｈａｈｅｌｉｘ．Ｓｅｑｕｅｎｃｅａｌｉｇｎｍｅｎｔｂｅｔｗｅｅｎｒａｉｎｂｏｗｔｒｏｕｔａｎｄｚｅｂｒａｆｉｓｈ，ｆｒｏｇ，ｃｈｉｃｋｅｎ，ｍｏｕｓｅａｎｄｈｕｍａｎｅｘｈｉｂｉｔｅｄｍｏｒｅｔｈａｎ８５ｉｄｅｎｔｉｔｙｒａｔｅｏｆａｍｉｎｏａｃｉｄ．ＴｈｅｒｅｓｕｌｔｉｎｄｉｃａｔｅｄｔｈｅＰＤＣＤ６ｇｅｎｅｉｓｒｅｌａｔｉｖｅｌｙｃｏｎｓｅｒｖａｌｉｖｅｉｎｔｈｅｐｒｏｇｒｅｓｓｏｆｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｎｄｐｌａｙａｎｉｍｐｏｒｔａｎｔｒｏｌｅｉｎｐｒｏｇｒａｍｍｅｄｃｅｌｌｄｅａｔｈｐｒｏｃｅｓｓ．
ｇｅｎｅ（（ｉｅｎＢａｎｋａｃｃｅｓｓｉｏｎｎｕｍｂｅｒ：ＦＪ５９１１５４）ｆｒｏｍｂｒａｉｎｏｆｒａｉｎｂｏｗｔｒｏｕｔ．Ｓｅｑｕｅｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓｒｅｖｅａｌｅｄａｌ
Ｖ（）１．３ｌＮＯ．６
Ｄｅｃ．２Ｏｌ３
文章编号：１６７１９９６，ｔ（２０ｌ３）０６００３０～０７
ＤＯＩ：１０３９６９／Ｊ．ＩＳＳＮ．１６７卜９９６４．２０ｌ３．０６．００６
，
３．河北农业大学海洋学院，河北秦皇岛０６６００３）
摘
要：程序性死亡因子６（ＰＤＣＤ６）基因编码１个含ＥＦ－ｈａｎｄ结构域的钙离子结合蛋白。应用逆
转录ＰＣＲ及ｃＤＮＡ末端快速扩增（ＲＡＣＥ）技术从虹鳟（Ｏｎｃｏｒｈｙｎｃｈｕｓｍｙｋｉｓｓ）脑组织中克隆了ＰＤＣＤ６基因ｃＤＮＡ的全序列（ＧｅｎＢａｎｋＮｏ：ＦＪ５９１１５４）。序列全长ｌ１７９ｂｐ，其中５ ’ 端非翻译区
白具有８个主要的螺旋结构。虹鳟ＰＤＣＤ６蛋白序列与斑马鱼、非洲爪蟾、人、小鼠和鸡的同源性均高于８５，表明ＰＤＣＤ６基因在进化过程中是高度保守的，在细胞程序性死亡过程中发挥重要
作用。
ｃＤＮＡｏｆＯｎｃｏｒｈｙｎｃｈｕｓｍｙｋｉｓｓ
ＷＡＮＧｄｉａ — ｑｉｎｇ，ＬＩＺｈｅｎｇａｎｇ，ＢＩＡＮＪｉａ，ＬＩＤａｉ — ｚｏｎｇ。，ＭＡＳｈｕａｎｇ，ＮＡＧｕａｎｇ～ｎｉｎｇ
长４８ｂｐ，３ ’ 端非翻译区长５６７ｂｐ，开放性阅读框长５６４ｂｐ，编码１８７个氨基酸。电子表达谱分析
结果表明该基因在４种脊椎动物的多个部位或组织中均有表达。同源模建蛋白三级结构显示该蛋
Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄｃｅｌｌｄｅａｔｈ６（ＰＤ（Ｄ６）ｐｒｏｔｅｉｎｉｓａｎＥＦ — ｈａｎｄｔｙｐｅＣａ一ｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎｉｎｖｏｌｖｅｄｉｎａｐｏｐｔｏｓｉｓｐｒｏｃｅｓｓ．ＲＴ— ＰＣＲａｎｄＲＡＣＥｍｅｔｈｏｄｓｗｅｒｅｕｓｅｄｆｏｒｔｈｅｉｓｏｌａｌｉｏｎｏｆｔｈｅｗｈｏｌｅｃＤＮＡｏｆＰＤＣＤ６
３ｌ眷６期２０１年ｌ２ＪＪ
Fra Baidu bibliotek
上海交通大学学报（农业科学版）
Ｊ（）ＵＲＮＡＩ（）ＦＳＨＡＮＧＨＡＩＪＩＡＯＴＯＮＧＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ（ＡＧＲＩＣＵＩＴＵＲＡＩＳＣＩＥＮＣＦ）
（１．Ｃ＊）ｌｌｅｇｅｏｆＩｉｆｅＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，ＳｈｅｎｙａｎｇＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＦｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｆｕｓｈｕｎ１１３１２２，Ｃｈｉｎａ；
关键词：虹鳟；ＰＤＣＤ６基因；ＲＴＰＣＲ；ＲＡＣＥ
中图分类号：Ｓ９１７
文献标识码：Ａ
ＣｌｏｎｉｎｇａｎｄＦｕｎｃｔｉｏｎＰｒｅｄｉｃｔｉｏｎｏｆＰＤＣＤ６Ｆｕｌｌ — Ｌｅｎｇｔｈ
．
虹鳟ＰＤＣＤ６基因ｅＤＮＡ全长的克隆与功能预测
王家庆，李振刚，边佳，李代宗。，马爽，那广宁
（１．沈阳］：学院生命ｊ＝程学院，辽宁抚顺１１３１２２；２．吉林大学生命科学学院长春１３００１２；