SciFinder中的相同化学结构检索

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Scifinder_WEB使用介绍

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SciFinder中的作者检索
SciFinder中的公司名称和组织机构名检索
公司名称和组织机构名检索
一次只能输入一个公司名称 一般来说,想获得宽泛的结果,输入的词语应该
少一些。想获得精确的结果,应该输入多的词语。 词条输入越多,可以让检索变得更加精确 自动的考虑了不同的拼写,首字母缩写,缩写, 以及有关的词条,但是并不考虑合并和收购 自动检索了一系列的有关词条,比方说,输入 "Company"和"Co",得到的结果一致
和所画结构完全一致的物质 立体异构体 互变异构体(包括烯醇和酮之间的变换) 聚合物,混合物,盐类 同位素 配位化合物 离子化合物 自由基和自由基离子
SciFinder结构绘制工具
当使用绘制工具绘制结构时,将您的 浏览器设置为全屏状态,会有很好的 帮助 当鼠标移动到工具上时,可以看到工 具名称以及它的相关描述 一旦选择了工具,相关的信息也会显 示在画图区域 可以通过SciFinder的帮助文件,获 得更多的关于结构绘制和工具使用的 详情
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由于名字的变更或者排版问题而导致的差异 对于复杂的人名,尝试不同的检索后,确定哪个会有最好
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SciFinder物质/反应检索
物质名称, CAS登记号
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➢SciFinder注册及主界面 ➢SciFinder中的文献检索 ➢SciFinder中的物质检索 ➢SciFinder中的反应检索
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在校园网范围内使用搜索引擎(如谷歌、等) 搜索到文献后,如出现可直接下载全文的情况, 也应注意避免使用下载工具下载。因所搜索到的 全文很可能是链接到图书馆已经购买的数据库中 的全文,此时使用下载工具下载全文也会被数据 库公司认定为恶意下载。
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谢谢!
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SciFinder 使用介绍
2015/8/4
scifinder-使用指南
SciFinder是化学文摘( Chemical Abstracts , CA)的网络版。于1994由美国化学学会(ACS) 旗下的化学文摘服务社(Chemical Abstracts Service, CAS)开发成功。SciFinder 包括的内容 几乎涉及了化学家和生物学家感兴趣的所有领 域。 SciFinder 采用各种主题词,人名,化学结构, 反应结构式等的方式让科研人员可方便地检索。
文献

scifinder介绍及使用教程

scifinder介绍及使用教程

Scifinder 的功能和特点
检索功能
Scifinder 支持关键词、化合 物结构、反应式等多种检索 方式,方便用户快速找到所 需信息。
结构绘图
Scifinder 内置了强大的化学 结构绘图功能,用户可以方 便地绘制和修改化学结构。
数据筛选
Scifinder 支持对检索结果进 行筛选,用户可以根据需要 选择符合特定条件的文献和 数据。
如何正确使用相似结构检索功能
总结词
理解相似结构的概念
详细描述
相似结构检索是指通过输入一个化学结构或分子式,在 Scifinder 中查找与之相似的其他分子或化合物。在使用 此功能之前,需要先了解相似结构的定义和判断标准。
总结词
选择合适的相似度阈值
详细描述
在相似结构检索中,需要选择一个合适的相似度阈值来限 定相似度的范围。不同的阈值会导致不同的检索结果,用 户可以根据实际需求选择合适的阈值。
总结词
结合其他检索条件使用
详细描述
在使用相似结构检索功能时,可以结合其他检索条件如关 键词、分子属性等进行综合检索,以获得更精确的结果。
THANKS
03
还可以设置Scifinder的个性化推送和提醒功能,以便更好 地使用Scifinder。
03 Scifinder 检索功能
基本检索
简单易用
Scifinder的基本检索功能为用户提供了一个简单易用的界面,用户只需输入关键词,即可快速检索到相关的科研文献、专利 和化学物质信息。
高级检索
高级筛选
如何解决检索结果为空的问题
总结词
无效的检索条件
详细描述
当检索结果为空时,可能是由于输入的检索条件无效或过 于宽泛所致。请检查检索条件是否正确,并尝试缩小检索 范围或使用更具体的关键词进行检索。

scifinder化学结构式检索

scifinder化学结构式检索

scifinder化学结构式检索Scifinder化学结构式检索引言:Scifinder是一种常用于化学领域的专业检索工具,它能够帮助化学研究人员快速准确地获取所需的化学结构式信息。

本文将介绍Scifinder化学结构式检索的基本原理和使用方法,以帮助读者更好地利用该工具开展化学研究。

一、Scifinder的基本原理Scifinder是一种基于化学结构式的检索工具,它通过分析和识别化合物的结构式,从庞大的化学数据库中提取与其相关的文献、专利和实验数据等信息。

其基本原理是通过化学结构式的比对和匹配,寻找具有相似结构和性质的化合物,并提供相关的文献和数据资源。

二、Scifinder的使用方法1. 登录与注册用户需要注册一个Scifinder账号并登录。

用户可以通过所在机构或组织的许可获取登录凭证,并按照要求填写个人信息完成注册。

2. 结构式检索在登录后,用户可以利用Scifinder进行化学结构式的检索。

用户可以输入化合物的结构式或者关键词等信息进行查询。

在输入结构式时,可以使用分子编辑器绘制化合物的结构式,或者直接复制粘贴已有的结构式。

3. 结果筛选与分析Scifinder将根据用户的查询条件,在数据库中检索相关的文献和数据信息,并将结果以列表的形式呈现给用户。

用户可以根据需求对结果进行筛选和排序,以获取最相关的信息。

4. 文献获取与下载在获取到相关的文献信息后,用户可以通过Scifinder提供的链接或DOI获取全文文献。

用户还可以将相关文献保存到个人文件夹或导出到其他文献管理工具进行管理和引用。

5. 数据分析与比较Scifinder不仅提供了文献资源,还包括了大量的实验数据和化学信息。

用户可以通过Scifinder进行数据的分析和比较,以支持其研究工作。

三、Scifinder的优势和应用1. 广泛的数据库资源Scifinder拥有庞大的化学数据库资源,包括了全球范围内的文献、专利和实验数据等。

Science Finder检索技巧

Science Finder检索技巧

1. 进入数据库,选择explore; 如下图:2. 进入prefs, 设置个人喜好, 如下图:3. 选择每篇文献显示一个例子,这个非常重要。

否则每次合符条件的太多,看起来就非常累眼了。

在这里设置这个可以一劳永逸。

如果等搜到结果以后再设置时好像是只针对本次有效。

4. 进入explore, 选择explore reaction:5.进入explore reaction, 以下面化合物的第二步为例。

查一模一样的这反应肯定是没希望的,先简化掉那个醛基,在画图界面里画出反应物和产物,注意产物的二氟甲基上的氢特意画出来了。

如果不画出来的话三氟甲基的产物也会被检索出来。

其它的位置同此。

有时检索出来的结果太多了,就通过把氢都画出来来缩小检索结果数目。

用左下角的锁定功能锁定反应物和产物关键原子。

那两个1表示产物的那个碳原子来源于左边指定的那个碳原子。

这个功能也非常重要。

点击get reactions, 进入检索选择界面。

6. 在这个界面设置:选择只在特定位置可变化还是没指定的地方都可以变;通过几步的转换,如果检索结果中发现很多是多步反应才实现的转化,而你只想要一步转化的结果,就可以退回来,在这里输入1;反应分类,一般我不做任何设置;选择显示结果的类型:只显示专利还是专利以外都显示。

年份设置我一般不设置。

点OK.7. 出来三个结果,点击每一个具体的结构就可以看到和这个化合物相关的信息。

尤其是CAS#, 在这个检索结果中我们发现所用的氟化试剂是氟利昂,这是个气体,购买和使用复杂。

检索结果太少了,选择的余地太小,所以把环戊基换成甲基再查。

8. 点击顶上的back箭头。

回到如下界面:再点击get reactions9. 出来34个检索结果。

一般来说出来20到50个检索结果是比较理想的,有适当的选择性,也看得过来。

点击左上角的那个试剂查出CAS#, 拷贝到Aldrich的网站上,发现这个试剂能买到,价格还可以。

左下角的6 hit reactions in this reference表示这篇文献里有6个反应符合条件。

第三章SciFinder结构图标

第三章SciFinder结构图标

启动结构图标屏幕1点击,切换到物质检索界面。

2 点击结构式面板缩略图。

(1)(2)注意:如果初次使用结构式画图板,需要按照提示下载JA V A插件。

1绘画结构窗口Untitled (未命名)开启。

绘画化学结构工具原子和化学键选择目前的原子选择放大率框New开启新的结构图标窗口。

Import从本地电脑中导入一个已保存的文件。

如果想导入Chem Draw保存的文件必须导入格式为.mol的文件Export 把画板上的结构式保存到本地电脑中。

Save as template 把当前的结构式保存为模板。

Print 打印当前结构式Cut 剪切当前画板上的结构式。

该图标只有在选中了一个结构式之后才可以使用。

Copy 复制画板上已选中的结构式。

该图标只有在选中了一个结构式之后才可以使用。

Past 粘帖已复制的结构式。

该图标只有在复制一个结构式之后才可以使用。

Modification 撤销前一步操作。

Redo 恢复前一步已撤销的操作。

Repaint更新画图面板Check Overlaps 检查面板上是否有重叠的部分。

Preference 结构式画图板板个性化设置。

个性化设置共分为四个部分。

粘贴板(Clipboard),颜色(Color),结构画法(Structure Drawing),工具栏(Toolbars)。

z Clipboard可以设置粘贴板中结构式的格式。

z颜色(Colors)可以设置结构式画图面板键的颜色、原子的颜色。

检查化合价 固定键的长度固定键与键之间的长度显示工具栏提示原子和键显示形式给出原子编号z Toolbars 可以设定面板下方显示的常用原子垂直的工具板提供绘制和修改化学结构的工具。

要使用工具,先点击图标。

再将鼠标点击到结构图标窗口,图标内容便会自动显示。

z铅笔工具(Pencil)这是用来绘制结点和键。

先选择出原子和键,点击铅笔工具图标,鼠标会变成铅笔形状,可以开始绘制。

绘制方法:1. 将鼠标点击在你想开始绘制的位置。

SciFinder使用指南(图示讲解)

SciFinder使用指南(图示讲解)
可视化工具
SCIFinder提供了丰富的可视化工具,如化学结构绘图和3D分子模 型,帮助用户更好地理解化学结构和分子间的相互作用。
02
SCIFinder基本操作
登录与注册
01
打开SCIFinder软件或网页界面。
02 点击“注册”按钮,填写个人信息并设置密码, 完成注册。
03 已注册用户可直接输入用户名和密码进行登录。
合物名称检索中,用户可以选择精确匹配,输入完整的化合物名称以获取精确结果。
化学性质分析
总结词
对检索得到的化合物进行化学性质分析,包括物 理性质、化学性质和光谱数据等。
总结词
支持自定义属性筛选,用户可以根据需要选择特 定的属性进行分析。
详细描述
SCIFinder可以对检索得到的化合物进行全面的化 学性质分析,提供各种物理性质、化学性质和光 谱数据,帮助用户深入了解化合物的性质。
化合物属性分析
SCIFinder提供了一系列化合物属 性,如分子量、熔点、沸点等, 帮助用户了解化合物的物理性质。
SCIFinder的特点
权威数据来源
SCIFinder的数据库来源于权威的学术和工业界数据,确保数据的 准确性和可靠性。
高级搜索功能
SCIFinder提供了多种搜索选项和过滤器,使用户能够精确地找到 所需信息。
04
SCIFinder图示讲解
检索流程图示讲解
总结词
详细展示SCIFinder的检索流程,包括关键词输入、检索选项选择、检索结果展示等步 骤。
详细描述
SCIFinder的检索流程非常直观,用户可以通过关键词输入框输入化学物质名称、分子 式、结构等关键词进行检索。同时,用户还可以通过选择不同的检索选项,如化合物类 型、来源等,进一步缩小检索范围。检索结果会以列表形式展示,包括化合物的名称、

scifinder使用手册

scifinder使用手册

研发工具Scifinder《使用说明书》第一章 Scifinder数据库介绍1.1 Scifinder数据库1.1.1 检索系统支持的检索方式:主题检索、物质名称检索、分子式检索、结构式检索、亚结构式检索、相似结构式检索、反应式检索、类反应式检索、分析与二次检索。

作者、机构名称、杂志名称、专利号、CA号检索结果后处理系统:Scifinder不仅仅包含有分子式、反应式和结构式(包括亚结构检索)等多种检索功能,而且在得到初步检索结果的基础上还可以进一步利用超过20个选项的后处理功能以最快的速度找到最精确的答案。

它已经超越了检索工具的范畴,而成为研发人员不可或缺的研发工具。

包含的信息量:大于2600万条文章记录;3000多万个有机无机物质,5800多万生物序列,1100多万条单步多步反应。

信息时效:1907年-至今1.1.2 原文下载系统Scifinder具有强大的期刊和专利链接,收录了全世界9500多种主要期刊和50多家合法专利发行机构的专利文献中公布的研究成果,占全球化工信息的98%。

其中能直接链接原文的化工类核心期刊1365种,约占全球英文版电子化工类期刊总数的90%,几乎包含了所有高影响因子期刊。

1.2 Scifinder的化学学科覆盖事实上,Scifinder数据库囊括了自20世纪以来所有与化学相关的资料,以及大量生命科学及及其它科学学科方面的信息。

1.2.1 生命科学领域遗传学、基因组学、酶学、蛋白质组学、实验内科学、生物化学、生物技术学、分子生物学、微生物学、细胞生物学、药理学等能够保证将9大主要专利组织2日内发布的与生物加工方法、蛋白质组技术、新遗传学工艺,及其它对现代药品开发至关重要的课题等相关的专利收录进来;通过Scifinder访问遗传学、酶学、生物化学、生物技术学及更多科学信息。

用户可查找:摘自细胞、科学、核酸研究、现代药品开发资料及其它知名期刊的科学信息。

1.2.2 传统化学领域有机化学高分子——聚合物、塑料、纺织、橡胶粘合剂等应用化学和化学工程——加工、工业化学、金属/合金、陶瓷、环境等物理化学、无机化学和分析化学1.3 Scifinder检索路径汇总第二章 Scifinder 检索界面2.1 Scifinder检索界面登录Scifinder 后出现一下界面(默认为新任务窗口):2.2 Scifinder 主检索界面点击新任务(New Task)按钮,出现Scifinder 主检索界面,这是各个检索路径的共同起点,是进入检索的入口。

第四章 SciFinder 相似结构检索 (Similarity Search)

第四章 SciFinder 相似结构检索 (Similarity Search)
3-7
比较: 完全相同结构检索、亚结构检索和相似结构检索 (Differences between Exact Chemical Structure Search,
不同类型的检索、会得到不同的结果
检索类型
能检索得到的结果
Exact Search 完全相同结构检索
Substructure Search 亚结构检索
d可点选 Filters, 来限制检索结果到指定选择。按下 OK 后, Tanimoto 的相似评分会以统计图
表来显示。
选择合适的评分, 然后按 Get Substances 查看相似之结构。
3-6
相似评分会于 CAS 注册号下显示。 用户可作再检索,按下 Analyze/Refine 中的 Refine, 再检索窗口对话框便会出现结果。 注意: 相似结构检索不能直接使用分析功能 (Analyze), 用户必须先以结构进行再检索 (Refine)
不能检索得到的结果 含取代基的物质
两者的结构相似, 但并不是 其亚结构,如乙烷基 (甲基的 结果便不会出现)
结果的结构有较大的取代基 (相似程度低)
三种检索的相互关系
相似结构检索 亚结构检索
相似结构Байду номын сангаас索
完全相同结构检索
3-8
具体例子: 利用不同的检索方法来查询华法林 (Warfarin) 的结构
相似结构检索的参考文件 (Reference Data of
Similarity Search)
z SciFinder Scholar 的 Help (按下 Index 和进入 Similarity Searching)
z P. Willett, J.M. Barnard, and G.M. Downs, “Chemical Similarity Searching”, J. Chem. Inf. Comput. Sci. , 38, 983-996 (1998).

SCIFINDER相似结构搜索教程

SCIFINDER相似结构搜索教程

在相似结构的检索中, SciFinder会用Tanimoto程序来进行检索与查询物质相似的结构,并给予相似评分。

相似结构评分相似结构检索能找出与查询结构最为相似的结构,其2-D小分子的相似度会以Tanimoto程序来计算。

以下是Tanimoto的计算公式,评分是以CAS的结构描述子为基本:100 x CTanimoto Score =(QS + FS) – CC = 代表检索结构和结果结构相同的描述子数目QS = 代表在检索结构中的描述子数目FS =代表在结果结构中的描述子数目结构描述子的介绍y原子数y环数y原子排列y键排列y周边原子y相连原子数y元素成份y环类型相似性的计算中并不考虑以下因素y氢原子的数目y离子y同位素标识y立体结构多元物质的处理y每一个多元物质的成份,都会被给予相似评分 (Tanimoto score)。

最高评分的成份物质,将会在分析相似的结果中显示。

y用户检索单一物质时,点击Get Substance后,按下Filter中的Structure components 即可。

注意事项y相似检索并不适用于R 基团、可变的原子、重复单元和可变的取代位置工具。

y分析不适用于相似结构检索。

y在限定结果时,相似评分将不会显示。

y相似评分不能保存(只适用于SciFinder) 。

相似评分的显示y以整数显示,不设小数点。

系统限制y只会显示60分以上的相似结构结果。

y最多只能显示20,000 个相似结构。

例子:检索以下的相似结构有关绘制结构图的详情,请参阅第三章。

绘制工具的使用及解释也可在第三章找到。

当你完成绘图,便会像下图所示一样。

在绘制结构后,选择Similarity Search ,然后点击确定,将结构导入检索界面。

若绘制的结构含有R 基团或可变原子 (X, Ak), 按下确定后,便会出现以下的结构绘图错误窗口。

续修改后才能导入,导入成功后如下图所示:可通过若要缩小检索范围至特定类型,可通过Characteristic(s),Classes,Studies等过滤选项设定,限制检索结果至指定类型,点击Search,Tanimoto的相似评分会以统计图表来显示。

第四章SciFinder相似结构检索

第四章SciFinder相似结构检索
例子:
检索以下的相似结构
当绘制完结构后, 点击 Get Substance。 Get Substance 对话窗口框将会出现。
c 选择 Similarity Search 开始进行相似结构检索。
若绘制的结构含有 R 基团或 OK 后,便会出现以下的结构
3-5
可变原子 (X, Ak), 按下 绘图错误窗口。
相似评分的显示
z 以整数显示, 不设小数点。
系统限制
z 只会显示 60 分以上的相似结构结果。 z 最多只能显示 20,000 个相似结果。
系统只能显示相似评分 60 分以上, 最多 20,000 个相似结构结果。
3-4
进行相似结构检索(Performance of Similarity Search)
检索的结果包括以下的数据。 z 物质基本数据 (如名称、结构、CAS 注册号) z 实验物性和计算物性 z 摘要、相关参考和书目数据 z 供货商目录数据 z 物质管制和注册数据 z 物质的反应数据 (只适用于有 SSM 账号的用户)
用户可以用再检索(Refine) 的功能令检索的结果更加精确。而只有在以结构再检索相似结构结果后,才 能使用分析 (Analyze) 的功能。 预览 (Preview) 和 自动提示 (Keep me posted – 只适用于 SciFinder 的用户) 的功能不能在此使用。
以下是 Tanimoto 的计算公式, 评分是以 CAS 的结构描述子为基本:
Tanimoto Score =
100 x C (QS + FS) – C
C = 代表检索结构和结果结构相同的描述子数目 QS = 代表在检索结构中的描述子数目 FS =代表在结果结构中的• 环数 • 原子排列 • 键排列 • 周边原子 • 相连原子数 • 元素成份 • 环类型

SciFinder的使用 物质检索与反应检索-供参考

SciFinder的使用 物质检索与反应检索-供参考

③选择Exclude isotope‐containing substances ④确认
限定后得到756个返回结果
如何想了解更多关于结果的修饰情况,如何操作?
①点击Refine ①点
②选择Atom Attachment(原子附属) ③确认
显示该位点修饰情况 选择想要查看的位点 Refine下的Atom Attachment工具,可以量化分析各 个位点的修饰情况
OH O HO OH OH
Cl
OEt
Cl Br
OEt Br
Cl + COOH
OEt
如何检索这个反应? 如何检索 个
选择变化只适用于指定的结构的位置(Variable only at the specified positions)精确反应检索
选择为复杂结构中的亚结构(Substructures of more complex structures)亚结构反应检索
进一步筛选得到3条反应
反应检索小结
. 画出完整的或部分的反应式进行检索 . 可进行精确检索或亚结构检索 . 通过Analyze/Refine功能来分析反应条件或限定收率等 . 可以获取相似反应信息及附加反应信息
三种类型检索的比较
检索类型
Exact Search 完全相同结构检索 (精确结构检索?) Substructure Search 亚结构检索
能检索得到的结果
与检索的结构完全相同,以及其多元 物质 (盐、聚合物、 化合物) 互变异构体 (Tautomers T Tautomers) ) 与检索的结构完全相同,以及其多元 物质 (盐、聚合物、化合物) 互变异构体 (Tautomers Tautomers) ) 含取代基的物质 与检索的结构完全相同,以及其多元 物质 (盐、聚合物、化合物) (盐 聚合物 化合物) 有相似结构的物质, 但其元素成份、 取代基和其位置与检索的结构不同两 者的结构相似,但并不是其亚结构, 如乙基 (甲基的结果便不会出现) 物质含有的环数目和检索的结构不同 (输入 6 – 5 环时, 有可能获得 6 – 6 环的结果)

scifinder使用教程

scifinder使用教程

14
A division of the American Chemical Society
2013年9月13日
原文的摘要
SciFinder的摘要
The title freeze-dried powder for injection contains reduced glutathione, pH regulator, supporter and antioxidant. Reduced The invention discloses a reduced-type glutathione is identified by (1) dissolving the freeze-dried powder in glutathione freeze dried injection and making sodium hydroxide soln., adding sodium nitroprusside, shaking for technique, which is characterized by the following: displaying deep red, standing for displaying yellow, and shaking for displaying red again, and (2) testing the content of reduced loading 95.0%-105.0% reduced-type glutathione glutathione by HPLC at 210 nm on C18 column with mobile phase of phosphate (pH 3.0)-methanol (97:3). The content of reduced (C10H17N3O6S) to display white block and glutathione must be 95.0%-105.0% of amt. marked. The freezepowder; testing nitrosoferric sodium cyanide to dried powder has pH value in soln. of 5.0-6.5, drying wt. loss not more than 5.0%, impurities content not more than 4%, and bacterial display red; keeping the consistent reserving time endotoxin content less than 0.125 EU. The pH regulator comprises of main peak of sample solution as comparison sodium hydroxide, potassium hydroxide, sodium carbonate, potassium carbonate, sodium hydrogen carbonate, sodium phosphate, sample solution with pH value at 5.0-6.5; making potassium phosphate, disodium hydrogen phosphate. The supporter dried weight not over 5.0% and the content of comprises mannitol, glucose, sorbitol, sodium chloride, dextran, lactose, hydrolytic gelatin, polyethylene glycol and glycine. The relative material not more than 4%; limiting the antioxidant comprises sodium hydrogen sulfite, sodium thiosulfate, content of bacterial endotoxin less than 0.125EU; Me p-hydroxybenzoate, Et p-hydroxybenzoate, Pr phydroxybenzoate, sodium pyrosulfite or thiourea. The freeze-dried making other items satisfy the standard. powder for injection possesses stable controllable quality, and improved drug safety for patients.

最新Scifinder检索方法

最新Scifinder检索方法
-
例二 得到具备一定条件的结构信息
问题: ➢存在多少种环结构 ➢X= F,Cl, Br,I 分别有多少种物质 ➢R1=H,OH,X分别有多少物质
R1= H,OH,X R2= O,S
-
检索物质的途径
主题检索 Explore
Research Topic
文献链接物质。Get Related
Substance
如果存储为sfr文件,要 在scifinder中查看,文献 数量要≤10000
存储文件名称, 所属文件夹都要 为英文
-
索引词
查看 摘要
链接 全文
物质索引
人工编写 的摘要
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-
引用的文章 被引用的情况 文章当中涉及的物质 文章中涉及的反应 Internet上其他的资源
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反应物为非硫醇的缩硫醛化反应
-
反应物中没有硫 醇的缩硫醛化反 应共330个
-
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-
对1,4,5,8-萘四酰二亚胺的修饰
物质的盐,同位素,混合物,聚合物 查询物质是目标物质的一部分
环锁定工具
结构与查询物质相似,但不相同
原子锁定工具,被锁定的原子不允许接取代基
A代表氮原子链接除氢原子外的任何基团
-
符合检索条件的物质共有2013个
-
反应信息 管制信息
商品来源信息 文献的信息
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环骨架分析
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可变基团分析
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R基团分析
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• 例三 检索酰卤化合物转化为醛的反应
-
官能团之间的反应
原子锁定工具
反应位置标记工具 反应官能团列表
环锁定工具 反应原子标记工具
-

scifinder web版

scifinder web版
计算物性数据 (Calculated Properties)
保留物质 (Keep Substances)
分析和再检索结果 (Analysis / Refine)
物质的相关文件 (Reference Information related to Substances) 检索更多的相关资料 (Get Related...)
Reverse Shortcut 倒转已选的快捷方式表示 (如:COOH Æ HOOC)
Flip Horizontal
水平地翻转已选的结构图
Flip Vertical
垂直地翻转已选的结构图
Fuse Fragments
融合两个已选的结点或碎片
EБайду номын сангаасit Preferences…
Database Settings…
分析取代原子 (Analyzing Substitution Atom)
P. 1 – 1 P. 1 – 2 P. 1 – 8 P. 1 – 21 P. 1 – 23 P. 1 – 26 P. 1 – 26
P. 2 – 1 P. 2 – 2 P. 2 – 6 P. 2 – 6 P. 2 – 7 P. 2 – 7 P. 2 – 8 P. 2 – 9 P. 2 – 10 P. 2 – 11 P. 2 – 12 P. 2 – 13 P. 2 – 14
多步反应显示 (Display Multi-steps Reaction)
有关化学反应之文件 (References of Reaction)
反应分析 (Analyze)
再检索反应式 (Refine)
指定反应物/试剂和产物的化学反应 (Define the Reaction Roles) 以官能团检索 (Search by Functional Group)

scifinder web使用

scifinder web使用

检索途径
Note:初次使用结构检索时需要安装java插件
SciFinder物质检索——物质标识符检索
帕拉米韦,是一个新颖的环戊烷类抗流感病毒药物,临床数据证明其对甲型和乙型流感有效, Peramivir; CAS No: 330600-85-6
输入物质名称、 CAS号等
检索到帕拉米韦
物质涉及的文献 物质涉及的反应 物质的商业来源信息
密码: 必须包含 7-15 个字符,并且至少包含三个以下字符: 字母 数字 混合的大小写字母 非字母数字的字符(例如 @、#、%、&、*) 密码设置小技巧: 1:不要和账号中有重复的字符 2:密码格式最好是abc@123
您所注册用的邮箱中会收到CAS的确 认邮件,点击完成注册过程

SciFinder Web文献检索-主题检索
功能高分子材料的合成相关的文献 synthesis of functional polymer materials
输入关键词
各个关键词之间可以用介词连接,如of with 等
文献检索的候选项
“Concept”表示做了同意词的扩展 “Closely associated with one another” 表示同时出现在一个句子中 “were present anywhere in the reference” 表示同时出现在一段话中
负电子
常见环,多元环工具
SciFinder物质检索——精确结构检索( Exact search )
如果想检索帕拉米韦这个具体物质,可以使用Exact Structure检索,点击确定后,可以在原java界面看 到对应的结构
精确结构获取物质的本身,盐,混合物,聚合物等
选择立体匹配
物质本身、水合物、盐等

scifinder介绍及使用教程

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A division of the American Chemical Society
SciFinder Scholar
SciFinder 包含 六大数据库
CAplus:
Part of The Process TM
大于2600万条文章记录,包含CA纸本和光盘的所有内容,同时 还收录1907年以前的上万条记录 Medline: 大于1600万条文章记录 CAplus+Medline=世界上最大的文摘数据库 Registry: 3000多万个有机无机物质,5800多万生物序列, 世界上最大的物质数据库 Chemcats:1200万条化合物商品信息 世界上最大的化学品商业数据库 Chemlist: 近24万条管制品信息
Agenda
• 什么是SciFinder -背景介绍 • 为什么要用SciFinder -功能介绍
• SciFinder 与机构作者检索
• 如何使用SciFinder-在线演示
A division of the American Chemical Society
SciFinder Scholar
Part of The Process TM
Part of The Process TM
CA on CD
1977 一个多月 √ × √ × × ×
SciFinder Scholar 1907(上万条记录回溯到 1900年以前)
一天 √ √ √ √ √ √
反应式检索
类反应式检索 分析与二次检索 检索效率 检索速度
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× × 低 慢
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× × 不高 尚可
Agenda
• 什么是SciFinder -背景介绍 • 为什么要用SciFinder -功能介绍

SciFinder化学反应检索

SciFinder化学反应检索

检索例子检索左面结构的相关反应•产物•有一个卤原子连接苯环•没有环取代请参考第一章的说明,有关怎样绘制结构和绘制结构工具的功能。

用户可从文件菜单中的按下开启旧档,开启之前保存的结构文件。

绘图方法:•用苯环工具绘制苯环。

•点击环戊烷环工具,将鼠标移至已绘制的苯环的左边并加以点击,将苯环和环戊烷连合。

•点击X菜单工具(选择X: Any halogen任何卤原子),在环结构以外的地方点击。

•点击可变的取代位置工具。

•点击及拖曳X取代基至取代位置。

取代基将和其位置将显示为红色。

在取代基和取代位置之间会出现一条虚线。

•最后,点击锁定环取代工具。

在绘制结构之后,点击反应角色工具和要设定的结构,反应角色对话框将会出现,请设定物质在反应式中的角色。

产物 反应物 试剂反应物或试剂 任何角色选取产物,点击OK,然后在绘制板中点击Get Reaction 。

反应检索窗口会出现如下。

Reaction Steps 反应步骤 限制反应步骤Reaction classification 反应分类 限制反应类型• Biotransformation 生物转化 • Catalyzed 催化 • Chemoselective 化学选择 • Combinatorial 组合• Electrochemical 电气化学 • Gas-phase 气相 • Non-catalyzed 无催化 • Photochemical 光化学 • Radiochemical 放射化学 • Regioselective 区域选择性 • Stereoselective 立体选择性Patents 专利 限制专利交件Publication year 出版年份 限制出版年份(1)... (2) (3)请选择任何一个检索方法:(1) 变化只适用于指定的结构的位置 (2) 为复杂结构中的亚结构在这个例子中选择 (2) substructures of more complex structures ,点击OK 。

SciFinder_Scholar检索系统

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分析手段——机构分析
核心研究 机构
分析手段——来源数据库分析
3575篇文献来源于 CAPLUS
1887篇文献来源于 MEDLINE
分析手段——文献类型分析
期刊论文最多
分析手段——索引词分析
Aspirin用的最 多,选择正确
分析手段——来源期刊分析
刊载该领 域文献最 多的期刊
分析手段——语种分析
物质检索方法一——化学结构检索
2.选择羧基
1.选择苯环工具
3.画出乙酰氧基
物质检索方法一——化学结构检索
精确结构检索 亚结构检索
相似结构检索
过过滤功能 小检索范围
物质种类
结构组份
是否有商业来源 是否有参考文献
研究类型的选 择
精确结构检索
能检索到:
• 与已绘制的结构完 全相同的物质 • 同位素化合物 • 配位化合物 • 单体组成的聚合物 • 混合物 • 物质的盐
美国国立医学图书馆制作 世界上最权威的生物医学文献数据库 收录范围:1949 至今全世界 70多个国家 4800余种期刊 现有文献数据1700余万篇,每周更新五次
物质数据库:REGISTRY
世界上最大,最全面的物质数据库 包含4100多万个有机及无机化合物(合金、 配位化合物、矿物质、混合物、聚合物、盐类) 及6000多万基因序列 1957 至今的全部数据,其中部分物质回溯至 1900 可得到物质的各方面数据:同义词、分子式、 环分析数据、立体结构、实验特性数据及计算 特性数据及核酸及蛋白质序列 数据每日更新
物质信息
反应信息
SciFinder Scholar的检索方法
主检索界面
检索:适用于不确 定信息的查询 定位检索:适用于 确定信息的查询
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第二章 SciFinder 的相同化学结构检索 (Exact Chemical Structure Search)
当绘画好结构后,用户可用相同化学结构检索查询有关物质,并且分析其结构结果。使用这个检索可搜寻以下的物质。 与已绘画的化学结构相同:
• 构造异构体 • 互变异构(包括酮-烯醇互变异构) • 配位化合物 • 离子化合物 • 原子基和离子基 • 含同位素的物质 • 单体组成之聚合物 用户可从物质记录文件中,取得以下的数据。 • 物质基本数据 (如名称、结构、CAS 注册号) • 实验物性和计算物性 • 摘要、相关参考和书目数据 • 供货商目录数据 • 物质管制和注册数据 • 物质的反应资料
显示与物质相关的参考文件。(也可以使用 Get References 键取得文件)。 显示物质的立体结构模型 。 显示物质的供货商数据 。 显示物质管制和注册数据 。 显示物质的反应数据。(也可以使用 Get Reactions 键)(只限于有亚结构 SSM 的账号 。)
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先点击物质记录右边的显微镜图像 。然后,物质的详细数据 Detail of Substance 的窗口将会出现。 物质记录通常了包括 CAS 注册号、化学结构、分子式、名称、物质物性、和相关数据。
2-8
检索更多的相关资料 (Get Related...)
用户可以检索更多的相关数据。先点击结果页中的 Get Related…。然后,Get Related Information 对话框便会出现,便可以开始检索以下的数据。
引用文件 被引用文件 文件收录之物质 文件收录之反应 网络上的数据
SciFinder 只能显示最多500条的引用和被引用文件,1000个有关的物质和反应式。如果数目太多, 会出现以下的窗口讯息。请按OK,先回到结果页减少结果数目。然后,再尝试点击Get Related…。
Preparation)。最后, 点击 OK。
所选的物质文件资料会在 SciFinder 的窗口上显示。
可以使用 Preference Editor 中的 Display 键改变字体和 排列显示。
你可以使用文件中的 Save As… 或 Save As Answer Set…去保存结果,并且选择 Print…以不同的格式打印。
Substance classes 物质分类 Structure components 结构组分 Commercial availability 是否有商业来源 References 参考文件 Studies 有关研究
选择以下其中一项。 (1) 相同化学结构检索或相关结构检索。 (2) 亚结构检索。(参见第三章) 。 (3) 相似结构检索。(参考第四章) 。 在此,选择 (1) 的 Exact Search。 检索已绘制的结构,找出相同物质。得出的结果会包含以下各类型的化合物。
当检索结果出现后,用户可用 SciFinder 的后处理功能去分析和再检索结果。分析结果让用户了解检 索结果的结构,而分析其环构造、原子取代和键等,有助找出理想结构。再检索功能让用户有效地 缩小结果范围,可限定其结构、同位素、文件类等数据 (请参考第 3 章) 。
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物质的相关文件 (Reference Information related to Substances)
要限制物质现有的参考数据,在Get Substances对话框中,点击Substances associated with: 键, 然后选择研究课题。最后,点击OK。
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物质立体结构模型(3D Structure Model of Substances)
要显示立体结构,必先安装Discovery Studio Viewer Pro或Viewer Lite (只适合Windows使用) 。
在记录中,可以找出世界各地供货商所提供的化学物质供应数据,例如目录名称、目录日期、化 学品名称、商品名称、和CAS的注册号等。 除此之外,点击记录旁的放大镜图像 ,便显示价格、结构、供货商名称、地址、联系信息和 网址。资料会因应不同供货商而有所不同。
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物质管制和注册数据 (Regulatory Information of Substances)
2-5
实验物性数据 (Experimental Properties)
点击 Experimental Properties,便会显示其物质的物性数据。在这里可以看到 CAS 的注册号、化学结 构、分子式、名称、物性和相关数据。由 2005 年 11 月起,用户可以看到大约 27 万条的实验物性 数值。另外,用户可在参考文件的原文中,找到大约 180 种物性数据 (如以光谱、 计算图、 图表、 数值等来显示) ,500 万条多参考文件数值。从前因这些数值是在原文内,用户很难检索得到,但 现在只需检索在 SciFinder 的物质记录,便能很快地找到其实验数值(详情请参考附录 B) 。
Process Reactant or Reagent
过程 反应物或试剂
Spectral Properties
光谱
Uses
应用
在c,选择取得所有物质的文件数据 All substances 或只选取已选物质 Selected substances 的文
件资料。在d,当点击 References associated with:键,指定文件数据的课题范围 (如:制备
• 与已绘制的结构相同物质 • 同位素化合物 • 配位化合物 • 单体组成的聚合物 • 离子化合物 • 原子基和离子基 • 异构体 • 互变异构体(包括酮-烯醇) 若要缩小检索范围至特定类型,可改变 (4) 的 Filters 过滤选项设定。点击 OK 继续检索。
2-3
SciFinder 的检索所得出的结果,是以智能检索 Smartsearch 为基础,一个由 CAS 建立的检索方法, 并且通常将 ”相同化学结构检索”的结果数目扩至最大,令用户得到最全面的检索结果,减少遗漏。 例如,酮-烯醇互变异构、同位素、和单体组成的聚合物也被包括在检索结果中。用户可按着个人的 研究方向和兴趣改变过滤选项 Filters 的设定,便可缩小结果范围至理想结果。有关智能检索 Smartsearch 的详细资料,请参考附录 A。 点击在窗口的右下方的停止 Stop 键以取消检索。结果将在 SciFinder 的窗口上显示出来。
在检索亚结构的结果中,亚结构的部分会被突出显示成红色,让用户很容易地便能辨认出亚结构部 分。要改变结果的显示格式,选择主工具列的 Option (简单 Compact,标准 Standard, 摘要 Summary, 全部 Full)或用在菜单中 Preference Editor 的 Display 键改变默认设定。 当点击物质记录左上方的显微镜图像 ,你可以看到物质的详细数据。 还有, 当点击物质纪录上方任何一个图像标,便会显示相关数据。
当你点击Get References,这些反应式的文件亦会被显示。 有关反应检索的详情,请参见第五章。
结束相同化学结构检索(Ending Exact Chemical Structure
若要开始新的检索,点击主工具列的New Task,或从文件菜单中选择New Task。在Confirm New Task对话框中点击New Task即可。在此时,小心未被存盘之答案结果会被删去。
2-6
保留物质 (Keep Substances)
用户可使用 Keep Substances 选项,选择留下有兴趣之物质,作进一步的查阅或检索。点击位于在显 微镜上方的选框。然后, 从主工具菜单中选择 Keep Substances,保留的物质便会出现在窗口中。
分析和再检索结果 (Analysis / Refine)
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相同化学结构检索 (Exact Chemical Structure Search)
绘好化学结构后,便可以随时开始结构检索。你能使用 SciFinder 工具中的绘制功能或引用由其它应 用程序所制备的结构文件。
检索例子 检索结构如下
预览功能只限于有亚结构检索 SSM 账号 2-2
点击 Get Substances 开始检索。如果你的账号是有 SSM 亚结构检索,会看到以下的对话框出现。 (*如果你的账号没有包括 SSM 亚结构检索,请参考构检索过滤设定。)
CAS 注册号 化学结构 分子式 名称 实验物性 计算物性
和相关资料
物质的详细资料会以默认设定的格式排列显示。可以用 Preference Editor 的 Display 键改变设定。 当点击 Experimental Properties 和 Calculated Properties,其实验物性和计算物性将被显示在新的窗口 上。 使用文件的 Print…打印出所显示的记录,或可以用 Save As… 保存文件。 要返回到 SciFinder 的窗口, 点击 Close。
2-14
从主工具列中点击Exit,或选择File菜单中的Exit SciFinder,以结束SciFinder。在Confirm Exit对 话框中点击Exit。
2-15

图像。
当反应角色Reaction Roles对话框出现后,从2-13Retrieve reaction for: 选择取得所有物质 All
substances之反应数据,或只选择已选之物质Selected substances的反应数据 。然后,从Select a reaction role选择反应之角色。 在此选择Reactant并点击OK。反应式便会显示出 来。
Analytical Study
分析研究
Biologicaludy
复合研究
Crystal Structure
晶体结构
Formation, nonpreparative
形成
Miscellaneous
其它
Occurrence
发生
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