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接，Entrez将这些数据库有机地结合在 一起，可以进行序列、结构、生物分类 及文献数据的相关交叉检索。
注意
All Databases 在NCBI主页） 的搜索框中（输入presenilin 1）搜 索的结果是一致的。
二、数据库资源
(一) Nucteotide (核苷酸序列数据库)
• 所有已知的核苷酸序列 • 与之相关的生I物L6 学信息 • 参考文献
用accession number，作者姓名， 物种，基因/蛋白名字，还有许多其 他的文本术语来查询。
例如：用基因/蛋白名字查找IL6
NG 011640
页面右侧
dian1 dian2
下拉
1
dian3
2
(二) Genome (基因组数据库)
等等数据库。（数值型、工具型） （看主页）。
一、Entrez 系统
All Databases
Entrez系统(All Database)是NCBI建立的 基于Internet网生物医学数据库的集成检索 系统（搜索引擎）。涉及核酸序列、蛋白 序列、大分子结构、基因组图、基础医学 及临床医学等内容数据库。包括 Nucleotide，Protein，Genome， Structure，OMIM，PopSet，Taxonomy 以及PubMed在内的35个数据库。
收集了多个来源核酸序列的数据库，包 括来自美国GenBank，英国EMBL (欧洲分 子生物实验室)，DDBJ(日本)，RefSeq（参 考序列数据库） ，的序列。每日NCBI的工 作人员将世界各地实验室提交的核酸序列数 据以及与国际其他核酸数据库等交换获得的 核酸序列数据加入到数据库中，其数据量呈 指数增长。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/ gquery主页
使用方法是选择好检索词输 入到for 后面的 框里，按go就可以了。（例1）以presenilin 1为 搜索词。
作业：自己选一个搜索词回去试一试
Entrez系统现已改为All Databases 新的Entrez检索界面为用户检索这些数 据库提供了很大的方便。因其最大的特 色在于所有的数据库可在同一个检索界 面进行检索，其结果之间建有超级链接，
NCBI是NIH（National Institutes of Health，美国国立卫生研究院 ）的NLM
（National Library of Medicine）美
国国立医学图书馆的一个分支
NCBI主要任务
• 美国国立医学图书馆（NLM）于1988年11月4 日建立国家生物技术信息中心（NCBI）。
基因map view
向 下 找
15显示结果
(四) EST (表达序列标签数据库)
expressed sequence tags
• 表达序列标签是指从不同组织来源的cDNA文库中 随机挑选的克隆进行5’或3’端测序后得到的部分 cDNA序列,长度一般为200～500bp
• 表达序列标签(EST)在基因组作图、克隆基因、新 基因的识别、蛋白质组研究等许多方面具有重要 的用途. <<生物技术通讯>>2003年 第14卷 第01 期，题目：表达序列标签及其应用 作者: 陈红歌, 贾新成,本文介绍了EST的制备方法, 以及构建均一化cDNA文库的方法,并介绍了EST 在以上各方面的应用.
• 数据库网址： http://gdb.mirror.edu.cn/gdb/
主页
IL6
点主页真核细胞进入此页
• (三) Protein (蛋白序列数Leabharlann Baidu库) • 该数据库的蛋白质序列数据包
括来自GenBank，EMBL，DU， BJ数据库的DNA序列的翻译编 码产物，以及向PIR (蛋白信息 资源)，SWISS-PROT(蛋白质序 列注释知识数据库)，PRF (蛋白 研究基金数据库)，PDB (蛋白数 据库)等数据库提交的蛋白序列 数据。
目前，该库包括以下多种内容：
人类基因组，包括基因、克隆、断裂点、细 胞遗传标记物、易断位点，重复片段等。人类基 因组示意图, 包括细胞遗传图关联图，辐射杂交图、 综合图等。人类基因组内的变异, 包括基因突变和 基因多态性，还有等位基因发生频次等数据资料。 该数据库为文理中心和北京大学生命科学学院国 家蛋白质重点实验室联合引进，在北京大学图书 馆设立了镜像服务器，面对 CALIS所有成员馆免 费开放，用户免付国际网通讯费。
NCBI分子生物学数据库 应用简介
佳木斯大学基础医学院生物教研室 朱金玲 2009/3
NCBI简介
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
NCBI(National Center of Biotechnology Information,简称NCBI) 。美国国立生物 技术信息中心
NCBI的主要任务是：
• 为储存和分析分子生物学、生物化学和遗传 学知识创建自动化系统。
• 从事研究基于计算机的信息处理过程的高级 方法，用于分析生物学上重要分子和化合物 的结构和功能。
• 促进生物技术研究者和医药治疗人员应用数 据库和软件。
• 努力协作以获取世界范围内的生物技术信息。
NCBI简介
• 主页网址 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
NCBI首先创建GenBank数据库，在重点开发GenBank 的同时，又于1991年开发了Entrez 数据库检索系统。 该系统整合了GenBank、EMBL、PIR和SWISS-PROT等 数据库的序列信息以及MEDLINE有关序列的文献信息， 并通过相关链接，将他们有机地结合在一起。NCBI 还提供了其它数据库，包括在线人类孟德尔遗传 (OMIM)、三维蛋白结构的分子模型数据库(MMDB)、 人类基因序列集成(UniGene)、生物门类(Toxonomy)
包括各种基因组、全部染色 体、序列图及集成的遗传与物理 图谱。可通过该数据库浏览人类 全部基因组序列数据的图像。
• 该数据库1990年初建于美国霍普金斯大学，是一个专门汇 集存储人类基因组数据的数据库，其中包括了全球范围内 致力于人类 DNA结构和100，000种人类基因序列研究的 分析成果。对从事相关领域的研究人员具有重要的参考作 用。
接，Entrez将这些数据库有机地结合在 一起，可以进行序列、结构、生物分类 及文献数据的相关交叉检索。
注意
All Databases 在NCBI主页） 的搜索框中（输入presenilin 1）搜 索的结果是一致的。
二、数据库资源
(一) Nucteotide (核苷酸序列数据库)
• 所有已知的核苷酸序列 • 与之相关的生I物L6 学信息 • 参考文献
用accession number，作者姓名， 物种，基因/蛋白名字，还有许多其 他的文本术语来查询。
例如：用基因/蛋白名字查找IL6
NG 011640
页面右侧
dian1 dian2
下拉
1
dian3
2
(二) Genome (基因组数据库)
等等数据库。（数值型、工具型） （看主页）。
一、Entrez 系统
All Databases
Entrez系统(All Database)是NCBI建立的 基于Internet网生物医学数据库的集成检索 系统（搜索引擎）。涉及核酸序列、蛋白 序列、大分子结构、基因组图、基础医学 及临床医学等内容数据库。包括 Nucleotide，Protein，Genome， Structure，OMIM，PopSet，Taxonomy 以及PubMed在内的35个数据库。
收集了多个来源核酸序列的数据库，包 括来自美国GenBank，英国EMBL (欧洲分 子生物实验室)，DDBJ(日本)，RefSeq（参 考序列数据库） ，的序列。每日NCBI的工 作人员将世界各地实验室提交的核酸序列数 据以及与国际其他核酸数据库等交换获得的 核酸序列数据加入到数据库中，其数据量呈 指数增长。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/ gquery主页
使用方法是选择好检索词输 入到for 后面的 框里，按go就可以了。（例1）以presenilin 1为 搜索词。
作业：自己选一个搜索词回去试一试
Entrez系统现已改为All Databases 新的Entrez检索界面为用户检索这些数 据库提供了很大的方便。因其最大的特 色在于所有的数据库可在同一个检索界 面进行检索，其结果之间建有超级链接，
NCBI是NIH（National Institutes of Health，美国国立卫生研究院 ）的NLM
（National Library of Medicine）美
国国立医学图书馆的一个分支
NCBI主要任务
• 美国国立医学图书馆（NLM）于1988年11月4 日建立国家生物技术信息中心（NCBI）。
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15显示结果
(四) EST (表达序列标签数据库)
expressed sequence tags
• 表达序列标签是指从不同组织来源的cDNA文库中 随机挑选的克隆进行5’或3’端测序后得到的部分 cDNA序列,长度一般为200～500bp
• 表达序列标签(EST)在基因组作图、克隆基因、新 基因的识别、蛋白质组研究等许多方面具有重要 的用途. <<生物技术通讯>>2003年 第14卷 第01 期，题目：表达序列标签及其应用 作者: 陈红歌, 贾新成,本文介绍了EST的制备方法, 以及构建均一化cDNA文库的方法,并介绍了EST 在以上各方面的应用.
• 数据库网址： http://gdb.mirror.edu.cn/gdb/
主页
IL6
点主页真核细胞进入此页
• (三) Protein (蛋白序列数Leabharlann Baidu库) • 该数据库的蛋白质序列数据包
括来自GenBank，EMBL，DU， BJ数据库的DNA序列的翻译编 码产物，以及向PIR (蛋白信息 资源)，SWISS-PROT(蛋白质序 列注释知识数据库)，PRF (蛋白 研究基金数据库)，PDB (蛋白数 据库)等数据库提交的蛋白序列 数据。
目前，该库包括以下多种内容：
人类基因组，包括基因、克隆、断裂点、细 胞遗传标记物、易断位点，重复片段等。人类基 因组示意图, 包括细胞遗传图关联图，辐射杂交图、 综合图等。人类基因组内的变异, 包括基因突变和 基因多态性，还有等位基因发生频次等数据资料。 该数据库为文理中心和北京大学生命科学学院国 家蛋白质重点实验室联合引进，在北京大学图书 馆设立了镜像服务器，面对 CALIS所有成员馆免 费开放，用户免付国际网通讯费。
NCBI分子生物学数据库 应用简介
佳木斯大学基础医学院生物教研室 朱金玲 2009/3
NCBI简介
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
NCBI(National Center of Biotechnology Information,简称NCBI) 。美国国立生物 技术信息中心
NCBI的主要任务是：
• 为储存和分析分子生物学、生物化学和遗传 学知识创建自动化系统。
• 从事研究基于计算机的信息处理过程的高级 方法，用于分析生物学上重要分子和化合物 的结构和功能。
• 促进生物技术研究者和医药治疗人员应用数 据库和软件。
• 努力协作以获取世界范围内的生物技术信息。
NCBI简介
• 主页网址 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
NCBI首先创建GenBank数据库，在重点开发GenBank 的同时，又于1991年开发了Entrez 数据库检索系统。 该系统整合了GenBank、EMBL、PIR和SWISS-PROT等 数据库的序列信息以及MEDLINE有关序列的文献信息， 并通过相关链接，将他们有机地结合在一起。NCBI 还提供了其它数据库，包括在线人类孟德尔遗传 (OMIM)、三维蛋白结构的分子模型数据库(MMDB)、 人类基因序列集成(UniGene)、生物门类(Toxonomy)
包括各种基因组、全部染色 体、序列图及集成的遗传与物理 图谱。可通过该数据库浏览人类 全部基因组序列数据的图像。
• 该数据库1990年初建于美国霍普金斯大学，是一个专门汇 集存储人类基因组数据的数据库，其中包括了全球范围内 致力于人类 DNA结构和100，000种人类基因序列研究的 分析成果。对从事相关领域的研究人员具有重要的参考作 用。