实时荧光定量PCR技术的原理及应用(RealtimeQuantitative
实时荧光定量PCR的研究进展及其应用
实时荧光定量PCR的研究进展及其应用一、本文概述实时荧光定量PCR(Real-Time Quantitative PCR,简称qPCR)是一种在分子生物学领域广泛应用的分子生物学技术,它能够在PCR 扩增过程中实时监测反应产物的积累,从而精确地定量目标DNA或RNA的初始浓度。
自20世纪90年代诞生以来,qPCR技术以其高灵敏度、高特异性、快速性和定量准确等优点,在基因表达分析、病原体检测、基因型鉴定、基因突变分析、药物研发等多个领域发挥了重要作用。
随着技术的不断发展和完善,实时荧光定量PCR已成为现代生物学研究中不可或缺的工具。
本文旨在全面综述实时荧光定量PCR技术的最新研究进展,包括其原理、方法、技术优化、应用领域的拓展以及面临的挑战等。
文章首先简要介绍qPCR技术的基本原理和常用方法,然后重点论述近年来在技术优化、多重PCR、数字化PCR等方向上的进展。
接着,本文详细探讨实时荧光定量PCR在基因表达分析、病原体检测、基因型鉴定、基因突变分析、药物研发等领域的应用案例和前景。
文章还将讨论实时荧光定量PCR面临的挑战,如引物设计、数据分析等问题,并提出相应的解决方案。
通过本文的综述,读者可以对实时荧光定量PCR技术的最新进展和应用有一个全面的了解,为相关研究提供参考和借鉴。
二、实时荧光定量PCR的基本原理与技术特点实时荧光定量PCR(Real-time Fluorescent Quantitative PCR,简称qPCR)是一种在PCR扩增过程中,通过对荧光信号的实时检测,对特定DNA片段进行定量分析的技术。
其基本原理是利用荧光染料或荧光标记的特异性探针,在PCR反应过程中实时检测PCR产物量的变化,从而得到DNA模板的初始浓度。
实时性:通过荧光信号的实时检测,可以实时了解PCR产物的生成情况,无需PCR结束后进行电泳等后续操作,大大缩短了实验时间。
定量性:通过标准曲线的建立,可以准确地计算出DNA模板的初始浓度,实现了PCR的定量分析。
实时荧光定量PCR技术在细菌检测中的应用
实时荧光定量PCR技术在细菌检测中的应用实时荧光定量PCR技术(Real-time Quantitative Polymerase Chain Reaction)是一种精确、快速的检测方法,广泛应用于生物医学研究和临床诊断中。
本文将讨论实时荧光定量PCR技术在细菌检测中的应用,并介绍其原理和优势。
一、实时荧光定量PCR技术原理实时荧光定量PCR技术基于传统的PCR原理,通过不断复制并扩增DNA片段,然后采用荧光信号检测系统实时监测PCR过程中的DNA合成数量。
在PCR过程中,引物与靶DNA片段结合并引发DNA合成,同时荧光探针与靶DNA片段结合释放出荧光信号。
荧光信号量与靶DNA的初始数量成正比,通过实时监测荧光信号的强度,可以实时定量测量靶DNA的含量。
二、实时荧光定量PCR技术在细菌检测中的应用1. 快速检测细菌的存在:实时荧光定量PCR技术可以在较短的时间内检测出细菌的存在与数量。
传统的培养方法需要一定的时间来培养细菌,而实时PCR技术几乎可以立即提供结果,帮助及时采取相应的措施。
2. 检测细菌的耐药性:实时荧光定量PCR技术可以检测出细菌对抗生素的耐药性。
通过检测细菌的特定基因或突变,可以判断其对不同抗生素的敏感性,为合理使用抗生素提供指导。
3. 检测细菌的毒力:实时荧光定量PCR技术可以检测细菌的毒力相关基因,帮助研究人员判断细菌的致病能力。
4. 监测细菌感染动态:由于实时PCR技术具有快速、准确等优势,可以用于监测细菌感染的动态变化。
在临床诊断中,可以通过实时PCR技术监测患者体内细菌的数量变化,从而评估治疗效果。
三、实时荧光定量PCR技术的优势1. 高灵敏度:实时荧光定量PCR技术可以检测到非常低浓度的细菌。
在样品中只存在几个细菌时,也能够准确检测出来。
2. 高特异性:实时荧光定量PCR技术通过特异性引物和探针的设计,可确保只扩增目标细菌的DNA片段,并排除其他DNA的干扰。
3. 高准确性:实时PCR技术通过实时监测PCR过程中的荧光信号,可以快速、准确地确定细菌的存在与数量。
RQ-PCR技术的原理及临床应用
HBV
(三) HBV-DNA定量检测的临床意义
4. HBV-DNA定量有助于指导怀孕与孕期,哺乳期检查 5. 肝脏移植与HBV-DNA
Mazzaferro等报告:< 103copy /ml 无一例再发肝炎 >105copy /ml 发生了严重HBV再感染
绝对定量:从荧光到拷贝数
标准品
标准品梯度稀释方法
谢谢!
实时定量PCR技术:
实时检测PCR扩增,在扩增的指数期对起 始模板进行定量。
荧光阈值是在荧光扩增曲线上人为设定的 一个值,它可以设定在荧光信号指数扩增 阶段任意位置上,一般荧光阈值的设置是 基线(背景)荧光信号的标准偏差的 10 倍。 每个反应管内的荧光信号到达设定的阈值 时所经历的循环数被称为 CT 值 ( threshold value )。
一 二
肝炎病毒定量检测 性病病原体检测
三 结核杆菌及呼吸道病原体检测 四 优生优育(TORCH)相关项目检测
HBV
(二) HBV-DNA与“两对半”
1. “两对半” :机体的免疫反应状态;
FQ-PCR:检测的是HBV本身的遗传物质—DNA,是 病毒存在和复制的最可靠、最直接的指标。
2. “携带者”、“大三阳”、“小三阳”等免疫学指标不 反应体内病毒复制水平与感染程度。
荧光定量PCR化学原理
非特异性荧光标记: 1、SYBR Green
特异性荧光标记: 2、TaqMan
1、SYBR Green 法
SYBR Green 熔解曲线分析
溶解曲线
溶解曲线分析可以用来确定不同的反应产物,包括 非特异性产物。扩增反应完成后,通过逐渐增加温 度同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随 着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状 态导致荧光信号降低,用荧光信号改变的负的一次 倒数与温度作图,在扩增产物的溶解温度上有一特 征峰(Tm,DNA双链解链50%的温度),用这个 特征峰就可以将特异产物与其它产物如引物二聚体 区分开,因为它们在不同的温度溶解.
实时荧光定量PCR的原理及应用
实时荧光定量PCR的原理及应用导读实时荧光定量PCR技术是指在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光集团,利用荧光信号来实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板浓度进行定量分析。
其特点有:(1)用产生荧光信号的指示剂显示扩增产物的量,进行实时动态连续的荧光监测,避免终点定量的不准确性,并且消除了标本和产物的污染,且无复杂的产物后续处理过程。
(2)荧光信号通过荧光染料嵌入双链DNA,或荧光探针特异结合木得检测物等方法获得,打打提高了检测的灵敏度、特异性和精确性。
Real-time O-PCR可以应用于mRNA表达的研究、DNA拷贝数的检测、单核苷酸多态性的测定、细胞因子的表达分析、肿瘤耐药基因表达的研究以及病毒感染的定量监测。
实时荧光定量PCR技术的基本原理在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光基团,这些荧光物质有其特定的波长。
仪器可以自动检出,利用荧光信号积累,实时监测整个PCR进程,在PCR循环中,测量的信号将作为荧光阈值的坐标。
并且引入一个——Ct值(Threshold cycle)概念,Ct值是指产生可被检测到得荧光信号所需的最小循环数,是在PCR循环过程中荧光信号由本底开始进入指数增长阶段的拐点所对应的循环次数。
荧光阈值相当于基线荧光信号的平均信号标准偏差的10倍。
一般认为在荧光阈值以上所测出的荧光信号是一个可信的信号,可以用于定义一个样本的Ct值。
通常用不同浓度的标准样品的Ct值来产生标准曲线,然后计算相对方程式。
方程式的斜度可以用来检查PCR的效率,所有标准曲线的线性回归分析需要存在一个高相关系数(R²>0.99),这样才能认为实验的过程和数据是可信的,使用这个方程式计算出未知样本的初始模板量。
实时荧光定量PCR仪都有软件,可以从标准曲线中自动地计算出未知样本的初始模板量。
实时荧光定量PCR技术的应用1. 基因工程研究领域①基因表达研究:对β地中海贫血症患者β与γ珠蛋白mRNA 水平进行检测,其结果特异性强、定量准确,为了解β地中海贫血的分子病理机制及其临床诊断提供了可靠的检测数据。
简述实时定量pcr的原理和应用
简述实时定量PCR的原理和应用1. 实时定量PCR简介实时定量PCR(quantitative real-time PCR, qPCR)是一种用于检测和定量DNA 或RNA的技术。
相比传统PCR技术,实时定量PCR可以快速、准确、高灵敏地测量靶分子的数量。
该技术广泛应用于生物医学研究、基因表达、疾病诊断等领域。
2. 实时定量PCR原理实时定量PCR基于传统PCR技术,通过引入荧光探针来实时监测PCR反应的进行。
其基本原理如下:•步骤1:DNA样本的准备与处理。
从待检测的样本中提取DNA,并对其进行纯化和定量。
•步骤2:引物设计和荧光探针制备。
根据目标DNA序列设计特异性引物和荧光探针。
•步骤3:PCR反应的进行。
将DNA模板与引物、荧光探针和PCR反应液混合,通过一系列的温度循环对DNA进行扩增。
•步骤4:荧光信号检测与分析。
在PCR反应过程中,荧光探针与目标DNA结合,并发出荧光信号。
荧光信号的强度与目标DNA的数量成正比,通过荧光信号的实时监测和分析,可以推断出DNA的起始量。
3. 实时定量PCR的应用实时定量PCR广泛应用于许多领域,包括:3.1 基因表达分析实时定量PCR可以定量检测基因在不同组织、不同时期、不同条件下的表达水平变化。
通过相对定量和绝对定量分析,可以研究基因的功能、调控机制及调控因子。
3.2 病原体检测实时定量PCR对病原体的检测具有高度灵敏性和特异性。
通过特异性引物和荧光探针的设计,可以快速、准确地检测病毒、细菌、真菌等病原体。
3.3 疾病诊断实时定量PCR在疾病诊断方面有广泛应用。
例如,它可以检测癌症相关基因的突变、染色体重排等变异,从而为癌症的早期诊断和治疗提供重要参考。
3.4 转基因检测实时定量PCR可以用于转基因生物的快速检测。
利用特异性引物和荧光标记的转基因探针,可以检测食品、农作物中是否存在转基因成分。
3.5 环境监测实时定量PCR可以用于环境中微生物的监测和定量分析。
实时荧光定量PCR的原理、操作及其应用PPT课件
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它利用荧光染料或荧光探针标记特异性引物,在PCR反应过 程中,随着DNA或RNA的扩增,荧光信号被逐渐释放,通过 检测荧光信号的强度,可以实时监测DNA或RNA的扩增量。
实时荧光定量PCR的原理概述
实时荧光定量PCR的基本原理是在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光探针,这些荧光物质 与DNA或RNA结合后,在特定波长光的激发下产生荧光信号。
环介导等温扩增技术
在恒温条件下进行核酸扩增,具有快速、特异性强和灵敏度高等优 点。
纳米材料与PCR的结合
利用纳米材料的特性,提高PCR的检测效率和灵敏度。
提高检测灵敏度与特异性
信号放大技术
通过使用信号放大系统,提高检测信号,从而提高检测灵 敏度。
特异性引物和探针的设计
针对目标基因设计特异性引物和探针,降低非特异性扩增 和交叉污染的风险。
选择合适的内参基因
选择稳定的内参基因
01
内参基因应具有稳定的表达水平,不受实验处理的影响。
验证内参基因的稳定性
02
通过实时荧光定量PCR技术,对候选内参基因进行稳定性评估。
使用多个内参基因参基因进行数据校正。
数据解读与报告
标准化处理
对原始数据进行标准化处理,消 除不同样本间的差异。
样本处理
对样本进行破碎、离心、 提取核酸等处理,以获得 待测的DNA或RNA。
浓度和纯度测定
使用紫外分光光度计等设 备测定核酸浓度和纯度, 确保符合实验要求。
引物设计与选择
引物设计
根据目标基因序列,利用 引物设计软件进行引物设 计。
引物筛选
根据实验需求,筛选出特 异性好、扩增效率高的引 物。
实时荧光定量PCR技术详解和总结
实时荧光定量PCR技术详解和总结
一、什么是实时荧光定量PCR
实时荧光定量PCR(Real-Time Quantitative Polymerase Chain Reaction,简称RT-qPCR)是一种PCR扩增技术,具有灵敏度高、重复性好等特点,可以在实时监测PCR扩增过程中特定片段DNA的产生。
它可以用来检测细胞中其中一特定基因mRNA的表达水平,从而揭示基因活动和表达情况,同时用于特定基因检测,如非病毒性疾病的病原检测以及芯片高通量分析等。
二、实时荧光定量PCR的基本原理
实时荧光定量PCR其基本原理就是利用PCR技术,在特定温度、适当时间内,将少量的模板 DNA 放大成数十亿倍以上。
实时荧光定量PCR的一大特点就是,它能够在实时监测PCR的扩增过程中,随时得知扩增物(amplicon)的数量。
根据扩增的量,从而确定所检测样本中的特定片段DNA的数量,即“定量”。
实时荧光定量PCR可实现定量检测,是因为它引入了一种特殊的参考基因,即“内参基因”,其用来抵消PCR条件、酶种类、反应液等的影响,从而测定量结果的准确性。
三、实时荧光定量PCR的实验步骤
(一)模板提取和核酸纯化:根据实验材料,提取DNA或RNA模板,进行核酸纯化,获得纯度较高的核酸。
(二)制备PCR反应液:制备由dNTPs、PCR酶、聚合酶等试剂组成的PCR反应液,根据所要检测的基因。
QRT-PCR(荧光定量PCR)
它的作用在于你提取的RNA逆转录成cDNA时, 加入的浓度可能会不一致,即使用分光广度计测其 浓度,也会有仪器误差,跑出的条带要进行灰度分 析。用目的基因的积分光密度比上内参的光密度就 是你这个基因实际表达的量。
加入体积 (μL)
2.5 2.5 4 -6 0.5 - 1 0.3 – 0.5 0.3 5 μL 补足 25 μL
为了定量和比较的方便,在实时荧光定量 PCR 技 术中引入了几个重要的概念:
• 基线(Baseline):是指在PCR扩增反应的最初 数个循环里,荧光信号变化不大。接近一条直线, 这样的直线即是基线。
实时定量PCR (real-time quantitative PCR)
报告人:杨霞 时间:2012-5-11
目录
一、实验原理 二、实验优点 三、实验缺点 四、实验应用 五、实验简介
一、实验原理
• 实时定量PCR (real-time quantitative PCR)是指在PCR指 数扩增期间通过连续监测荧光信号强弱的变化来即时测定 特异性产物的量,并据此推断目的基因的初始量,不需要 取出PCR产物进行分离。
• 反应要求:荧光定量对扩增片段有较高的要求,一般为 100-300bp;普通定量可以扩增长的片段。如果不需要检 测产物分子量大小,荧光定量可以不进行电泳就对产物进 行定量分析,普通pcr必须电泳。
• 结果:荧光定量可以实现精确定量,普通pcr则不行。荧 光定量体现可以看到整个扩增过程,可以看到扩增效率, 溶解温度,直接得到的标准曲线等,这些是普通pcr无法 实现的。
一个循环,收集一个荧光强度信号,这样我们就
可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从而 得到一条荧光扩增曲线图 ( 如下图) 。
实时荧光定量pcr原理
实时荧光定量pcr原理实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR)是一种用于检测和定量DNA或RNA的技术。
它结合了PCR技术和荧光探针技术,能够实时监测PCR反应过程中的荧光信号变化,从而实现对目标核酸的定量分析。
本文将介绍实时荧光定量PCR的原理及其在科研和临床中的应用。
实时荧光定量PCR的原理基于PCR技术,PCR是一种体外扩增DNA的方法,通过DNA聚合酶酶链反应(PCR)使目标DNA序列在体外得到扩增。
而实时荧光定量PCR则在PCR反应中引入了荧光探针,利用荧光信号的变化来监测PCR反应的过程。
在实时荧光定量PCR中,通常使用的荧光探针包括SYBR Green和TaqMan探针。
SYBR Green是一种DNA结合染料,它能够与PCR反应中产生的双链DNA结合并发出荧光信号,因此可以用来监测PCR反应的进程。
TaqMan探针则是一种双标记探针,包括一个荧光素和一个荧光淬灭器,它能够在PCR反应中特异性结合目标DNA序列并发出荧光信号,因此可以用来定量PCR反应中的目标DNA。
实时荧光定量PCR的原理可以简单概括为,首先,将待扩增的DNA样品与引物和荧光探针一起加入PCR反应体系中;然后,利用热循环装置对PCR反应体系进行多次循环加热和降温,使目标DNA序列得到扩增;在PCR反应过程中,荧光探针与目标DNA结合并发出荧光信号,这些信号会被实时监测和记录下来;最后,通过分析监测到的荧光信号的变化,可以计算出PCR反应体系中目标DNA的起始量,并进行定量分析。
实时荧光定量PCR在科研和临床中有着广泛的应用。
在科研领域,实时荧光定量PCR可以用于基因表达分析、病原微生物检测、基因型分析等方面,其高灵敏度和高特异性使其成为了研究人员进行生物学研究的重要工具。
在临床诊断中,实时荧光定量PCR可以用于疾病的早期诊断、疾病的病原体检测、药物代谢酶基因型分析等方面,其快速、准确和可靠的特点使其成为了临床诊断中不可或缺的手段。
实时荧光定量pcr的原理及应用
实时荧光定量PCR的原理及应用1. 简介实时荧光定量PCR(Real-time quantitative polymerase chain reaction,简称qPCR)是一种强大的分子生物学技术,能够在同一反应体系中完成DNA扩增和定量,具有高灵敏度、高特异性和高精确性的优势。
本文将介绍实时荧光定量PCR 的原理和应用。
2. 原理实时荧光定量PCR基于传统PCR技术的基础上,引入荧光染料或探针来实时监测PCR反应过程中产生的增量扩增DNA量。
其原理如下:1.DNA模板的变性:通过加热将DNA模板的双链DNA变性成两个单链。
2.引物结合:待扩增的特定DNA序列的引物(Forward primer和Reverse primer)与模板DNA的互补序列结合。
3.DNA聚合酶扩增:DNA聚合酶沿着模板DNA链酶解附近的单链DNA,并将新的DNA链合成。
4.荧光信号监测:引入特定的荧光染料(如SYBR Green)或探针(如TaqMan探针),实时监测PCR反应体系中DNA扩增量的变化。
5.数据分析:使用特定的PCR仪器记录和分析荧光信号,根据荧光信号的变化量确定目标DNA序列的起始量。
3. 应用实时荧光定量PCR技术在许多领域中有广泛的应用,主要包括以下方面:3.1 疾病诊断与检测实时荧光定量PCR可以用于快速检测和诊断各种疾病,例如:•新型冠状病毒(COVID-19)检测•癌症标志物的检测•细菌和病毒感染的检测•遗传性疾病的检测3.2 基因表达分析实时荧光定量PCR可以用于研究基因的表达水平,包括:•基因表达差异分析•基因调控网络的研究•基因表达谱的分析•转录因子的研究3.3 环境监测实时荧光定量PCR可以应用于环境监测领域,用于检测和量化环境中的微生物和污染物,例如:•水质监测中细菌和病毒的检测•土壤中污染物降解菌的鉴定和定量•空气中微生物的检测3.4 遗传学研究实时荧光定量PCR在遗传学研究中也有广泛的应用,包括:•DNA定量和质量检测•突变检测和鉴定•群体遗传学分析•基因组学研究4. 总结实时荧光定量PCR技术是一种准确、高效、灵敏的分子生物学技术,广泛应用于医学、生物学、环境科学和农业等领域。
实时荧光定量PCR的原理操作及其应用
实时荧光定量PCR的原理操作及其应用实时荧光定量PCR的基本原理是在PCR反应体系中添加一种或多种荧光标记的探针,它与目标序列的特定区域互补,当探针与目标序列结合时,荧光信号被激发,产生荧光发射。
随着PCR反应的进行,目标序列的数量增加,荧光信号也随之增强。
通过实时监测PCR扩增过程中的荧光信号强度的变化,可以推断出起始模板的数量。
操作上,实时荧光定量PCR主要分为两个步骤:反转录和PCR。
首先,反转录将RNA逆转录合成cDNA,得到DNA模板。
然后,在PCR反应中,将DNA模板与荧光标记的探针、引物和核酸酶混合,开始PCR扩增。
PCR反应体系中的荧光探针在PCR扩增过程中的特定温度下与目标序列结合,产生荧光信号。
荧光信号被特定的光学设备检测和记录,得出PCR产物的数量。
实时荧光定量PCR具有广泛的应用领域。
在基因表达分析方面,qPCR可以用来定量测量特定基因的转录水平,研究基因的表达模式和差异。
在病原微生物检测方面,qPCR可以快速、准确地检测和鉴定细菌、病毒和寄生虫等病原体。
在遗传疾病诊断和监测方面,qPCR可以检测一些突变、插入或缺失等遗传变异,并进行遗传病的筛查与诊断。
此外,qPCR还可以用于检测和定量分析环境样品中的微生物、植物和动物等生物种群,了解物种多样性、群落结构和生态系统功能。
实时荧光定量PCR的优点包括高灵敏度、高特异性、高准确性和高重复性。
与传统PCR方法相比,qPCR不需要进行凝胶电泳分析,减少了实验操作的时间和手动操作的误差。
另外,荧光定量PCR还可以采用多通道检测不同靶标,提高实验的高通量性。
然而,实时荧光定量PCR也有一些局限性。
首先,荧光标记的探针需要根据目标序列的特点设计,设计不当可能会导致假阳性或假阴性结果。
其次,荧光信号的准确性受到反应物质的浓度和质量的影响,需要进行严格的实验操作和数据分析。
此外,实时荧光定量PCR的设备和试剂比传统PCR更昂贵,需要专业的实验室设施和经验。
QRT-PCR(荧光定量PCR)
实用文档
CT 值( threshold value ):每个反应管内的 荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数被称 为 CT 值。 研究表明,各模板的CT值与该模板的起始拷贝数 的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,CT值越 小。反之亦然。 利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线, 其中横坐标代表起始拷贝数的对数。纵坐标代表 CT值。因此,只要获得未知样品的CT值,即可从 标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。
• 评估基因表达水平等方面的工作,并在不需要构建和筛选 cDNA的前提下,完成对cDNA片段的克隆
实用量的飞跃,而 且与常规PCR相比,它具有特异性更强、有效解 决PCR污染问题、自动化程度高等特点。 在实时荧光定量 PCR 反应中,引入了一种荧光 化学物质,随着 PCR 反应的进行, PCR 反应产 物不断累计,荧光信号强度也等比例增加。每经 过一个循环,收集一个荧光强度信号,这样我们 就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从 而得到一条荧光扩增曲线图 ( 如下图) 。
实用文档
荧光定量PCR化学原理
1、SYBR Green (荧光染料掺入法) 在PCR反应体系中, 加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入 DNA双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的SYBR染料 分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR产物的增加完全同步。
2、TaqMan (探针法) PCR扩增时在加入一对引物的同时 加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端 分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完 整时,报告基 团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩 增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使报 告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可 接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光 分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同 步。
RT-qPCR(实时荧光定量PCR)
• 2、Molecular Beacon 分子信标。标记荧光的发夹
探针,环与目标序列互补,茎由互补配对序列组成 。变性过程:产生非特异性荧光;延伸过程:不产 生荧光;退火过程:产生特异性荧光,检测荧光信 号。
• 3、Amplisensor 双链信号引物,进行半巢式扩增
;随着PCR循环的重复进行,信号引物的双链结构 被破坏,其中一条链参与到产物的合成中,荧光消 失,产物量与荧光成反比。
4. 反应Buffer体系的优化
5. 反应温度和时间参数:由酶和引物决定
6. 其他与常规PCR相同
优 点
对DNA模板没有选择性 ----适用于任何DNA 使用方便 -----不必设计复杂探针 非常灵敏 便宜
缺 点
容易与非特异性双链DNA结合,产 生假阳性,但可以通过融解曲线的分
1
RT-qPCR 原理----绝对定量
R2为相关系数:R2>0.99时,认为 两数值之间相关性好。 E为扩增效率:一般认为在90%110%之间数据可用。 Logo
1
2.相对定量
RT-qPCR 原理----相对定量
病人内参 基因 Ct a
病人目的 基因 b
对照内参 基因 c
对Байду номын сангаас目的 基因 d
������−∆∆������������ = ������−(∆������������������−∆������������������) = ������−[
������−������ −(������−������)]
结果表示病人的目的基因的表达是对照组目的基因表达的多少倍。
Logo
RT-qPCR 原理----融解曲线
荧光强度
实时荧光定量PCR技术的原理及应用
缺点
实时荧光定量PCR 原理-------标准曲线
绝对定量的标准样品:
已知拷贝数的质粒DNA
相对定量中的内标
• 内标通常是β -actin、GAPDH基 因等看家基因. • 在细胞中的表达量或在基因组 中的拷贝数恒定,受环境因素 影响小. • 内标定量结果代表了样本中所 含细胞或基因组数量.
,是对未知样品
的绝对量(拷贝数)进行测 定的方法; 应用于病毒病原菌定量检 测,转基因拷贝数分析等
相对定量,并不是测定基 因的绝对量,而是分别测 定目的基因和参比基因的 量,再求出对于参比基因 的目的基因的相对量,最 后再进行样品间相对量的 比较 应用于mRNA表达量解析.
实时荧光定量技术的应用
实时荧光定量PCR定义
在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧
光信号累积实时监测整个PCR进程,最后
通过标准曲线对未知模板进行定量分析的
方法
实时荧光定量PCR 原理----------实时原理
常 规 PCR技术: 对PCR扩增反应的终点产 物进行定量和定性分析。 实时定量PCR技术: 利用荧光信号的变化实时 检测PCR扩增反应中每一
PCR的反应的三个主 要步骤
变性,将双股的DNA加热 后转为单股DNA以做为复 制的模板. 复性 是令引物于一定的 温度下附着于模板DNA两 端。 延伸 在DNA聚合酶的作用 下进行引物的延长及另一 股的合成。
• 合成的原料及水。
实时荧光定量PCR原理
实时荧光定量PCR的几种方法介绍
绝对定量
绝对定量的方法相对简单.
未知浓度的样品与标准品同时进行反应,将扩增曲 线得到的Ct值代入标准曲线,就可以得到未知样品 的绝对量。
实时荧光定量pcr技术原理与应用
实时荧光定量pcr技术原理与应用
实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction, qPCR)是一种可以快速、准确测量靶基因拷贝
数目的分子生物学技术。
它结合了传统的PCR技术与荧光探
针技术,利用荧光信号的强弱来反映目标基因的表达水平。
实时荧光定量PCR的原理是,首先通过PCR技术对目标基因
进行放大,然后在PCR反应过程中添加一种含有荧光探针的
试剂。
荧光探针通常由两个部分组成,一个是与目标基因特异性结合的引物,另一个是带有荧光染料与荧光信号猝灭基团的探针序列。
当荧光探针与目标基因的引物结合时,荧光信号被猝灭;当探针与目标基因的模板序列结合并被PCR酶依次截
断时,荧光信号被释放出来。
荧光信号的强弱正比于目标基因在PCR过程中的拷贝数目。
实时荧光定量PCR广泛用于基因表达分析、疾病诊断、基因
突变检测等领域。
通过该技术可以定量测量目标基因的表达水平,比较不同条件下基因表达的差异,研究基因调控机制。
此外,实时荧光定量PCR还可以应用于微生物检测,如检测细菌、病毒、真菌等的数量和变异情况。
这项技术具有快速、高灵敏度、高特异性、高重复性等优点,因此在生命科学研究和临床应用中得到广泛应用。
总之,实时荧光定量PCR技术通过结合PCR和荧光探针技术,可以实现对目标基因拷贝数目的快速、准确测量。
它在基因表达研究、疾病诊断和微生物检测等领域发挥着重要作用。
实时定量pcr原理
实时定量pcr原理实时定量PCR原理。
实时定量PCR(Real-time Quantitative PCR,qPCR)是一种用于检测和量化DNA或RNA的技术,它结合了传统PCR技术和荧光探针技术,能够实现对靶基因的快速、准确和高灵敏度的定量分析。
实时定量PCR的原理基于传统PCR技术,但是在PCR反应过程中通过荧光信号实时监测靶基因的扩增情况,从而实现对靶基因的定量分析。
在实时定量PCR中,常用的荧光探针包括SYBR Green和TaqMan探针。
在实时定量PCR反应中,首先是DNA或RNA的反转录和前PCR扩增,然后在PCR反应过程中,荧光信号与靶基因的扩增量成正比。
通过检测荧光信号的增加,可以实时监测靶基因的扩增情况,并且可以根据荧光信号的增加来计算出靶基因的起始量。
实时定量PCR的优势在于其快速、准确和高灵敏度的特点。
相比于传统PCR技术,实时定量PCR无需等待PCR反应结束后再进行结果分析,而是可以在PCR反应过程中实时监测靶基因的扩增情况,从而能够更快速地得到定量分析结果。
同时,实时定量PCR的荧光信号检测系统能够实现对靶基因的高灵敏度检测,能够检测到极低浓度的靶基因。
另外,实时定量PCR还具有高度的准确性。
通过荧光信号的实时监测,可以避免了传统PCR技术中可能出现的内源性荧光干扰,从而能够更准确地进行靶基因的定量分析。
总的来说,实时定量PCR技术是一种快速、准确和高灵敏度的DNA或RNA定量分析技术,它在基因表达分析、病原体检测、基因突变分析等领域具有广泛的应用前景。
随着实时定量PCR技术的不断发展和完善,相信它将在生命科学研究和临床诊断中发挥越来越重要的作用。
实时荧光定量PCR技术在传染病诊断中的应用
实时荧光定量PCR技术在传染病诊断中的应用实时荧光定量PCR技术(Real-Time Quantitative Polymerase Chain Reaction,简称qPCR)是一种高灵敏、高特异的核酸检测技术,在传染病的早期诊断、病原体监测和药物研发中具有广泛的应用前景。
本文将重点探讨qPCR技术在传染病诊断中的应用,并简要介绍其原理和优势。
一、qPCR技术原理qPCR技术基于传统的聚合酶链反应(PCR),通过在PCR过程中引入荧光探针或染料来实时检测PCR反应体系中的DNA扩增产物。
其主要原理包括:1. 反应基质的选择:选择合适的DNA或RNA提取方法,从患者样本中纯化并提取目标核酸。
2. 引物和探针设计:合理设计引物和探针,确保其与目标序列高度特异性结合。
3. 扩增和探针结合:通过PCR反应,扩增目标序列的数量,并使探针与目标序列结合。
4. 荧光信号检测:在PCR反应中,使用特定仪器检测并记录荧光信号的变化,从而实时监测扩增过程。
5. 数据分析:根据荧光信号的变化可以计算出目标序列的起始含量,并通过计算机软件进行数据分析和结果解读。
二、qPCR技术在传染病诊断中的应用qPCR技术在传染病诊断中具有以下几个方面的应用价值:1. 早期诊断:qPCR技术具有高灵敏度和特异性,能够在症状出现之前检测出目标病原体的核酸,从而实现早期诊断。
例如,在流行性感冒的早期诊断中,可通过qPCR技术快速检测出流感病毒的核酸,对患者及时采取措施,避免疾病的进一步传播。
2. 病原体监测:qPCR技术能够准确检测低浓度的病原体核酸,对传染病的发生和传播进行监测。
例如,在疫情暴发期间,通过qPCR技术可以迅速筛查患者样本中的病原体,并及时采取隔离和治疗措施,遏制疫情蔓延。
3. 药物研发:qPCR技术可以用于评估抗微生物药物的疗效,监测病原体对药物的敏感性变化。
通过检测药物作用后病原体核酸的变化,可以对药物的疗效进行定量评估和监测,为临床治疗提供依据。
qpcr原理
qpcr原理qPCR原理。
实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)是一种快速、准确、灵敏的核酸定量技术,广泛应用于基因表达分析、病原微生物检测、基因突变分析等领域。
其原理是在PCR过程中实时监测荧光信号的变化,通过检测荧光信号的强度来定量反应物的含量。
本文将详细介绍qPCR的原理及其应用。
1. PCR反应。
PCR反应是qPCR的基础,其原理是通过DNA聚合酶在不断变性、退火和延伸的循环过程中扩增目标序列。
在qPCR中,PCR反应体系中除了常规的引物和模板DNA外,还需要加入荧光探针。
这种荧光探针通常包括一个荧光素和一个猝灭剂,当探针与目标序列结合时,荧光素被释放,从而产生荧光信号。
2. 实时检测。
与传统的终点检测PCR不同,qPCR是实时检测PCR反应中荧光信号的变化。
在PCR反应过程中,荧光信号随着PCR产物的不断增加而累积,通过检测荧光信号的增加速率和终点荧光信号的强度,可以确定起始模板的含量。
3. 定量分析。
通过构建标准曲线或使用绝对定量方法,可以将实时检测到的荧光信号转化为目标序列的绝对含量。
标准曲线是通过已知浓度的标准品制备一系列稀释液,然后在qPCR中检测这些稀释液的荧光信号,从而建立荧光信号与模板含量之间的关系。
绝对定量方法则是通过已知浓度的标准品直接计算目标序列的绝对含量。
4. 应用领域。
qPCR技术在生物医学研究、临床诊断和食品安全等领域有着广泛的应用。
在基因表达分析中,可以利用qPCR技术快速、准确地检测特定基因的表达水平;在微生物检测中,可以实现对病原微生物的快速、灵敏的检测;在基因突变分析中,可以准确地鉴定目标基因的突变类型和频率。
总之,qPCR技术作为一种快速、准确、灵敏的核酸定量技术,为生命科学研究和临床诊断提供了重要工具。
通过实时监测PCR反应中的荧光信号,qPCR可以快速、准确地定量分析目标序列的含量,广泛应用于基因表达分析、病原微生物检测、基因突变分析等领域。