分子生物学知识重点

分子生物学

一、名词解释

1.ORF

答:ORF是open reading frame的缩写，即开放阅读框架。在DNA链上，由蛋白质合成的起始密码开始，到终止密码为止的一个连续编码列，叫做一个开放阅读框架。

2.结构基因

答：结构基因（structural genes）可被转录形成mRNA,并翻译成多肽链，构成各种结构蛋白质或催化各种生化反应的酶和激素等。3.断裂基因

答：基因是核酸分子中贮存遗传信息的遗传单位，一个基因不仅仅包括编码蛋白质或 RNA 的核酸序列，还包括保证转录所必需的调控序列、位于编码区 5 ' 端与 3 ' 端的非编码序列和内含子。真核生物的结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因（split gene）。

4.选择性剪接

答：选择性剪接（也叫可变剪接）是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点组合）产生不同的mRNA剪接异构体的过程，而最终的蛋白产物会表现出不同或者是相互拮抗的功能和结构特性，或者，在相同的细胞中由于表达水平的不同而导致不同的表型。

5.C值

答：基因组的大小通常以其DNA的含量来表示，我们把一种生物体单倍体基因组DNA的总量成为C值（C value）。

6.生物大分子

答：生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各种分子量达到上万或更多的有机分子。常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、脂类、糖类。

7.酚抽提法

答：酚抽提法最初于1976年由Stafford及其同事提出，通过改良，以含EDTA、SDS及无DNA酶的RNA酶裂解缓冲液破碎细胞，经蛋白酶K处理后，用pH8.0的Tris饱和酚抽提DNA，重复抽提至一定纯度后，根据不同需要进行透析或沉淀处理获得所需的DNA样品。

8.凝胶过滤层析

答：凝胶过滤层析也称分子排阻层析或分子筛层析，利用凝胶分子筛对大小、形状不同的分子进行层析分离，是根据分子大小分离蛋白质混合物最有效的方法之一。

9.多重PCR

答：多重PCR技术是在一个反应体系中加入多对引物，同时扩增出多个核酸片段，由于每对引物扩增的片段长度不同，可用琼脂糖凝胶电泳或毛细管电泳等技术加以鉴别。

10.荧光域值

答：荧光阈值是在荧光扩增曲线上人为设定的一个值，它可以设定在

荧光信号指数扩增阶段任意位置上，一般荧光阈值的设置是基线荧光信号的标准偏差的10倍。

11.退火

答：温度突然降至37-58℃时，变性的DNA单链在碱基互补的基础上重新形成氢键开始复性。

12.基因诊断

答：基因诊断是通过检测基因的结构异常或其表达异常，对人体的健康状态和疾病做出诊断的方法。

13.实时荧光定量 PCR

答：实时荧光定量PCR技术是指在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。

二、问答题

1.什么是SNP？试述研究SNP的意义。

答：真核生物基因组中存在大量的 DNA 多态性。DNA多态性是指DNA 序列发生变异从而导致的个体间核苷酸序列的差异，主要包括单核苷酸多态性（ single nucleotide polymorphism ， SNP ）和串联重复序列多态性（ tandem repeats polymorphism ）两类。研究SNP 的意义：SNP是由基因组DNA上的单个碱基的变异引起的DNA序列多态性。据估计，人类基因组中每 1kp 就存在一个 SNP 位点，共有约300 万个之多，远多于其它类型的 DNA 多态性，是人群中个体差异最具代表性的 DNA 多态性，相当一部分还直接或间接与个体的表型

差异、对疾病的易感性或抵抗能力、对药物的反应性等相关。SNP 被认为是一种能稳定遗传的早期突变。

2.简要介绍质粒并举例说明其在分子生物学中的用途。

答：质粒（ plasmid ）是一类染色体外具有自主复制能力的环状双链 DNA 分子，属染色体外基因组。质粒与致病菌的毒力及耐药性有关，又是基因工程的常用载体，因而具有重要的研究和应用价值。

其在分子生物学中的用途有：1. 质粒 DNA 编码多种蛋白质，有的与质粒自身的复制和稳定性有关，有的控制宿主细胞的各种性状，如各种抗性、代谢能力、致病性、接合转移等。根据宿主的表型可识别质粒的存在，这一性质广泛应用于重组菌的筛选和鉴定。2. 质粒的不相容性常用于质粒的分类。基因工程中以质粒为载体进行基因克隆也是利用了质粒的不相容性原理。

3.请介绍目前蛋白质组学研究中最常用的基本技术流程并简述其原理。

答：蛋白质组学研究需要两条互补的实验工作流程——基于凝胶的工作流程（ Gel-based workflow）和基于液相色谱的工作流程（LC-based workflow）。在这两种流程中，基于凝胶的工作流程是目前使用的较为广泛的、发展最为成熟的工作流程，通过样品制备、样品标记、双向电泳分离、图像获取、图像分析，到抠点、酶切、点靶和 MALDI—TOF 蛋白鉴定等一整套技术手段下来，如果还加上操作自动化，研究人员可以很方便的获得蛋白质性质数据。而基于液相色谱的工作流程则可以对在双向电泳中难以分离鉴定的高相对分子量、低

相对分子量、极酸性、极碱性和疏水性强的蛋白质进行有效的分离鉴定。这两种方法结合起来可以对复杂样品进行预分离、对低丰度蛋白进行富集，还可以完成蛋白酶解后多维液相分离（MDLC）。

4.简述酵母双杂交技术的原理及其用途。

答：酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的，研究活细胞内蛋白质相互作用，对蛋白质之间微弱的、瞬间的作用也能够通过报告基因的表达产物敏感地检测得到，它是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。酵母双杂交系统的建立是基于对真核生物调控转录起始过程的认识。细胞起始基因转录需要有反式转录激活因子的参与。反式转录激活因子，往往由两个或两个以上结构上可以分开，功能上相互独立的结构域（domain）构成，其中有 DNA 结合功能域（DNA binding domain，DNA-BD）和转录激活结构域（activation domain，DNA-AD）。这两个结合域将它们分开时仍分别具有功能，但不能激活转录，只有当被分开的两者通过适当的途径在空间上较为接近时，才能重新呈现完整的 GAL4 转录因子活性，并可激活上游激活序列（upstream activating sequence，UAS）的下游启动子，使启动子下游基因得到转录。

基于酵母双杂交技术平台的特点，它已经被应用在许多研究工作当中：1.利用酵母双杂交发现新的蛋白质和蛋白质的新功能。2.利用酵母双杂交在细胞体内研究抗原和抗体的相互作用。3.利用酵母双杂交筛选药物的作用位点以及药物对蛋白质之间相互作用的影响。4.利用酵母双杂交建立基因组蛋白连锁图（Genome Protein Linkage Map）。