计算化学9-常用计算化学应用软件及资源
物理化学实验中常用的数据处理软件及在化学中常见应用方法
物理化学实验中常用的数据处理软件及在化学中常见应用方法随着计算机技术的不断发展，数据处理软件在物理化学实验中的应用越来越普遍。
这些软件可以帮助实验人员处理实验数据，提高实验效率和准确度。
本文将介绍几种常用的数据处理软件及在化学中常见的应用方法。
一、常用的数据处理软件1. ExcelExcel是微软公司开发的一款电子表格软件，广泛应用于各个领域。
在物理化学实验中，Excel可以用来制作数据图表、计算平均值和标准偏差、进行线性回归等。
对于数据量较小的实验，Excel是一个简单易用的数据处理工具。
2. OriginOrigin是一款专业的科学数据分析和绘图软件，主要应用于科学研究、工程设计和教学等领域。
在物理化学实验中，Origin可以用来制作各种类型的图表、进行数据拟合和统计分析等。
Origin的功能非常强大，但学习起来也比较复杂。
3. MatlabMatlab是一款用于数学计算、数据分析和可视化的软件，被广泛应用于科学研究、工程设计和金融分析等领域。
在物理化学实验中，Matlab可以用来进行数据处理、信号处理和图像处理等。
Matlab的功能非常强大，但学习起来也比较困难。
二、在化学中的应用方法1. 数据图表的制作在物理化学实验中，数据图表是非常重要的，可以帮助实验人员更直观地了解实验结果。
在Excel中，可以选择不同的图表类型，如折线图、柱状图、散点图等，来展示实验数据。
在Origin中，可以制作更复杂的图表，如等高线图、三维图等，以展示更多的信息。
在Matlab中，可以利用其强大的绘图功能，制作各种复杂的图表。
2. 数据拟合和统计分析在物理化学实验中，常常需要对实验数据进行拟合和统计分析。
在Excel中，可以使用函数进行线性回归、非线性拟合和数据统计等。
在Origin中，可以使用各种拟合和统计分析工具，如最小二乘法拟合、方差分析等。
在Matlab中，可以使用其强大的数学计算和统计分析功能，进行各种数据拟合和统计分析。
化学常用软件应用简介(ChemOffice)
➢ 撤销操作，单击 【Undo】
旋转控制点
缩放控制点
• 3.1.3.4 检查结构错误和整理结构式
•3.1.1 主界面
状态栏
• ChemDraw主界面自上而下分为菜单栏、工具 栏和绘图窗口。绘图窗口左侧是垂直工具栏，其 中的工具和模板是化学专用的。有些模板按钮下 面带有 箭头，单击该按钮不松开，会在其右侧 弹出子工具栏。
【询问工具】 【箭头】 【轨道】 【绘图元素】 【括弧】【化学符号】
• 3.1.2 模板
Window】，弹出分析窗口，包含该化合物的分子简式、 摩尔质量、同位素分布图，元素分析组成比例等数据。 【View】/【Show Chemical Properties Window】， 弹出化学性质窗口，包含该化合物的沸点、熔点、临界 温度、临界压力、临街体积、Gibbs自由能、LogP、 MR、Herry’s Law、生成热、ClogP、CMR等。
• 3.1.3.12 快捷菜单和 快捷键
（1）快捷菜单
ChemDraw快捷菜单包 含了多种选项，使用快捷菜 单能完成常用编辑、属性设 置、模板选择等功能。
在选中的结构上单击鼠标 右键，会弹出快捷菜单。
• 3.1.3.6 根据结构得出化合物命名
如果确定了化合物的结构，想知道其系统命名，可 以借助ChemDraw。 ➢ 绘制化合物结构式 ➢ 选中此结构，【Structure】/【Convert Structure to Name】，即可在结构式下面出现系统命名。 ➢ 并非所有的结构式都能给出化合物名称，如果无法由 结构产生系统命名，ChemDraw会弹出窗口给出提示 信息。
化工行业中常用的软件介绍
化工行业中常用的软件介绍1、Chemoffice系列软件Chemoflic。
是一套功能十分强大的化学专业应用软件，它是由ChemDraw, Chem3D和ChemFinder等三个软件组成的一个软件包，按发布时IaJ有2002. 2004,2006等版本，根据功能和专业化程度又分为Std, Pro和Ultra三种版本，Ultra版还包含E-notebook及Chemlnfo 数据库，使其应用性更强。
(1) ChemDraw的应用能够绘制和编辑高质量的化学结构图，识别和显示立体结构，具有化学结构式与化学名称相互转换的功能:由于内建有NMR数据库，能够与Excel数据兼容，能够进行网络数据库信息检索等。
(2) CHem3 D的应用①将2D图形转化为3D图形②利用Chem3D进行化学计算2、数据处理软件OriginOrigin包含高级扫描绘图、C语言和内置300多个数学函数的NAG数值计算库，是一种化学数据的计算软件。
它包含了统计学、信号处理、曲线拟合和峰值分析等高级数据分析工具。
由于具有C程序与数值计算和作图能力综合功能，适合作为化工和高等教育的化学专业人员从事科研和教学时进行数据处理、分析和计算以及制作高质量的图表。
①、Origin的数据分析功能木软件设有专门的移向工具以便审视、读取和屏蔽数据，内置100多种函数可用于数据拟合。
含有的数据分析工具有::(I)统计学工具，描述统计学、拟合比较、多项回归、总体t一试验、残存分析等。
(Z)曲线拟合，非线性最小二乘法拟合NLSF、运用Origin C语言的NLSF、线性回归、多项式回归等。
(3)信号处理，进行卷积法、重叠合法、快速傅里叶变换((FFT i.e.Fast Fourier Transform)、修匀、邻接平均等。
(4)峰值分析，基线和峰值分析、基线工具、采集峰值工具、峰值拟合等组件。
Origin的数据处理应用十分广泛。
②、用Origin软件绘制实验数据曲线(1)打开Origin，在“Datai”列表的A[X]和B[Y]中输入实验数据。
计算化学软件使用经验
� 优先使用当前作业所在文件系统。 � 可以跨文件系统存储读写文件（03不可以）
� 内存并非给得越多越好，需要综合考虑到计算的需要和硬 件水平，最有效率的方法是根据作业类型估算所需要内存 的大小。可以使用
“freqmem natoms nbasis r|u c|d functions”估算内存。 Functions可以使用%kjob=301来得到
� 计算特点： � CPU、内存要求高。特别是内存容量和内存带宽对性能影响较大 � 要求低通信延迟，其磁盘I/O相对较少
软件安装
� 编译器，BLAS，fftw，mpi，vasp&vtst � 步骤：
� 安装包解压 � cd vasp/src � 修改makefile，make 编译出vasp可执行文件
N3
MP4，QCISD(T)
O3V4
N2
N4
O3V4
N4
全CI（CPU）
((O+V)!/O!V!)2
对于小的体系，其计算成本差别是不大的，只有处理大
的体系时，其差别才显现出来。
10
使用经验——计算设置
� Route.Rou修改缺省使用核数，内存大小。 � 节点内采用openmp并行，效率较高。节点间采用Linda并
入比较容易保持对称性 3. 控制输出标准，可以简化输出，节省时间 4. 建立检查点文件 � 关于优化： 1. 先小基组优化，再大基组优化 2. 对于大体系，先固定优化一部分结构，再放开优化 3. 在结构出现震荡时，取出最低能量结构重新计算力场数，往往
很快得到优化结果。 4. 有些体系收敛不要求4个YES，如大体系（势能面比较平缓）只
计算化学软件使用经验
计算化学在化学教学中的应用
计算化学在化学教学中的应用计算化学是指利用计算机模拟和计算方法研究化学问题的一门学科，它通过数值计算、统计分析和模型构建等方法，在研究和预测化学现象和过程中发挥重要作用。
在化学教学中，计算化学的应用既可以提高学生对化学理论的理解，又可以培养学生的计算和实验技能。
本文将介绍计算化学在化学教学中的一些应用。
一、计算化学在分子结构的确定中的应用分子结构是化学研究的基础，确定分子结构对于理解其性质和反应机理至关重要。
传统方法中，通过实验手段进行分析，然而实验方法往往耗时、容易受到条件限制，并且在某些情况下可能难以确定分子的准确结构。
而计算化学通过各种量子化学计算方法，可以对分子结构进行准确、高效的预测和求解。
计算化学在化学教学中的应用之一是帮助学生理解和预测分子结构。
学生可以通过计算化学软件平台，利用分子力学或量子力学方法预测分子的几何结构、能量和振动频率等信息。
通过计算结果，学生可以直观地了解分子中原子的构成和相互作用，从而更好地理解分子性质和反应机理。
这种通过计算化学方法进行分子结构确定的实践操作，不仅提高了学生的计算和操作能力，还增强了他们的探索精神和创新思维。
二、计算化学在反应机理研究中的应用反应机理是指化学反应过程中发生的分子间相互作用和原子间转化的详细过程。
只有深入了解反应机理，才能更好地解释反应速率、能量变化、反应路径等现象。
然而，实验方法往往难以捕捉和研究快速反应的中间态，而计算化学提供了一种研究反应机理的有效手段。
计算化学在化学教学中的应用之二是帮助学生研究和理解反应机理。
学生可以通过计算化学方法模拟和研究不同反应的机理，预测各个中间态的稳定性和反应路径。
通过计算化学软件的使用，可以绘制出反应过程中的能垒图，直观地展示反应的速率和能量变化。
这种通过计算化学方法研究反应机理的实践操作，不仅培养了学生的计算和分析能力，还提高了他们对反应速率、能量变化等概念的理解和掌握。
三、计算化学在分子性质和理论模型验证中的应用分子性质包括反应活性、溶解性、光学性质等，这些性质对于理解分子的行为和应用具有重要意义。
一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具
一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具1 在线信息数据库部分√ SDBS光谱数据库：http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/direct_frame_top.cgi简介：很好的有机化合物光谱数据库，包含六类光谱：EI-MS、FT-IR、H-NMR、C13-NMR、ESR、Raman。
含3万余个化合物，其中以商业化学试剂为主，约2/3是6碳至16碳的化合物。
数据大部分是其自行测定的，并不断添加。
可以通过化合物、分子式、分子量、CAS/SDBS 注册号、元素组成、光谱峰值位置/强度方式搜索。
生物核磁共振数据库：http://bmrb.protein.osaka-u.ac.jp/depositCRYSTAL程序基组数据库：/~mdt26/crystal.html√ 计算化学比较和基准数据库(CCCBDB)：简介：此数据库包括各种量子化学方法、各种基组下对不同分子的各种属性的计算结果，也包含实验数据。
可用来对比不同方法计算结果优劣，此数据库内容在不断增加。
√ 量化频率计算校正因子：/vibscale.asp简介：实际上就是CCCBDB的一个子页面，比较重要故单独列出。
IUPAC金属络合物稳定常数数据库：注：需要付费，可免费下载试用版。
√ NIST化学数据库：/chemistry简介：是美国国家标准与技术研究院NIST的基于Web的物性数据库。
输入分子查找条件，可获得分子量、CAS登记号、各种热力学数据、谱图等信息，部分分子包含3D结构。
RESP ESP charge DDataBase(REDDB)：/REDDB/index.php 简介：分子的RESP电荷的数据库Uppsala Electron Density Server：http://eds.bmc.uu.se/eds简介：用于评价蛋白质数据库中晶体结构电子密度。
输入pdb ID（比如1cbs）进入后可以对各种内容做图。
《计算化学简介》课件
3 分子模拟在纳米材料研究中的应用 4 计算机辅助药物设计
通过模拟纳米材料的结构和性质，提供设 计和优化纳米材料的指导。
利用计算方法筛选药物分子，加速新药开 发和优化过程。
计算化学未来的发展方向与挑战
大数据和人 工智的应用
利用大数据和人工 智能技术，提高计 算化学的速度和准 确性。
宏观化学过 程的计算模 拟
发展能够模拟宏观 化学过程的计算方 法，如催化剂反应 和材料合成。
多尺度计算 的发展
将不同尺度的计算 方法结合，实现对 分子和材料性质的 准确预测。
挑战与机遇
面临着大规模计算、 能源和环境问题等 挑战，同时也具备 推动计算化学发展 的巨大机遇。
通过计算和分析分子的轨道来预测和解释其性 质和反应。
常用的计算化学软件工具
如Gaussian、VASP和GAMESS等，提供各种计算 化学方法和模拟工具。
计算化学在化学研究中的应用
1 结构优化和反应动力学模拟
2 化学反应机制的研究
通过计算方法优化分子结构，模拟和预测 化学反应的速率和机理。
揭示化学反应的过程和机理，为实验设计 和化学品的合成提供指导。
2
发展历程
经过半个多世纪的快速发展，在理论、方法和应用方面都取得了重大突破和进展。
3
应用领域
被广泛应用于药物设计、材料科学、反应机制研究等领域，对推动化学发展起到了积 极作用。
计算化学所需的数学和物理基础知识
量子力学基础
研究微观粒子的行为和性质，是计算化学的 基石。
统计力学
研究集合中的微观粒子的统计性质，为模拟 和预测宏观行为提供基础。
《计算化学简介》
计算化学是研究如何运用计算方法解决化学问题的学科。本PPT课件将介绍计 算化学的概念、发展历史、基本方法和常用软件工具、应用领域以及未来发 展方向和挑战。
计算化学相关文献
计算化学相关文献计算化学是一门交叉学科，涉及化学、物理、数学和计算机科学等多个领域。
在计算化学中，通过计算机模拟分子结构、反应机理和物理性质等方面的研究，加深了人们对分子、材料和生命系统等的认识，同时也为实验研究提供了重要的辅助手段。
以下是一些计算化学相关的文献：1. Jensen, F. Introduction to Computational Chemistry, 3rd ed.; Wiley: Hoboken, NJ, 2017.2. Cramer, C. J. Essentials of Computational Chemistry, 2nd ed.; Wiley: Hoboken, NJ, 2014.3. Szabo, A.; Ostlund, N. S. Modern Quantum Chemistry: Introduction to Advanced Electronic Structure Theory, Dover Publications: Mineola, NY, 1996.4. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. 'Development of the Colle-Salvetti correlation-energy formula into a functional of the electron density.' Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789.5. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. 'Generalized Gradient Approximation Made Simple.' Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865-3868.6. Gaussian 16, Revision A.03, Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; et al., Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2016.7. NWChem: A Computational Chemistry Package for Parallel Computers, Valiev, M.; Bylaska, E. J.; Govind, N.; et al., Pacific Northwest National Laboratory: Richland, WA, 2010.8. Schrdinger Suite 2018-1, Schrdinger, LLC: New York, NY, 2018.9. Grimme, S.; Antony, J.; Ehrlich, S.; et al. 'A consistent and accurate ab initio parametrization of density functional dispersion correction (DFT-D) for the 94 elements H-Pu.' J. Chem. Phys. 2010, 132, 154104.10. Becke, A. D. 'Density-functional thermochemistry. III. The role of exact exchange.' J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652.这些文献涵盖了计算化学的基础知识、量子化学、密度泛函理论等方面的研究方法和应用，以及一些常用的计算化学软件包。
计算化学的软件工具和数据资源
计算化学的软件工具和数据资源计算化学是一种基于计算机科学的化学研究方法，它利用计算机模拟来预测化学物质的物理化学性质和反应机理。
随着计算机科学和化学研究的迅速发展，计算化学的应用已经得到广泛的推广和应用。
为了更加有效地使用计算化学方法，研究人员需要掌握一些计算化学的软件工具和数据资源，让我们一起来看看这些有用的工具和资源。
1. 分子模拟软件分子模拟软件是计算化学研究的核心工具。
它可以用来模拟分子的运动和反应，预测分子的结构、能量和性质。
常用的分子模拟软件有Gromacs、Amber、LAMMPS、CHARMM等。
这些软件通常需要一定的计算机编程技能，但是它们提供了很强的自由度和控制力，可以满足不同研究需求的要求，同时也是训练计算化学研究人员的基本技能。
2. 密度泛函理论软件密度泛函理论(DFT)是一种计算电子结构的方法，它可以用来预测分子的几何构型、电子能级和电荷分布等。
常用的DFT软件有Gaussian、VASP、Quantum ESPRESSO等。
这些软件通常需要一定的物理、数学和计算机科学知识，但是它们提供了很强的准确性和可靠性，可以用来研究很多重要的化学问题。
3. 虚拟筛选软件虚拟筛选软件是用来寻找化学药物和分子杂交物的软件工具。
它利用基于计算机的分子模拟和化学信息检索技术，可以从大规模化学库中筛选出具有特定生物活性的化合物。
常用的虚拟筛选软件有Autodock、Vina、Glide等。
这些软件允许研究人员进行高通量筛选和分子设计，可以大大提高化学药物和分子杂交物的研发速度和成功率。
除了这些软件工具之外，计算化学研究人员还需要掌握一些数据资源，这些数据资源可以用来支持计算化学研究的可靠性和准确性。
4. 化合物数据库和手册化合物数据库和手册是计算化学研究人员必备的资源之一。
它们收集了大量的化学结构、性质和反应信息，包括分子式、结构式、物理化学性质、毒性信息、化学反应机理等。
常用的化合物数据库和手册有Beilstein、PubChem、ChemSpider、EPA等。
化学工具总结
化学软件分子模型化3D分子图形显示工具 (RasMol and OpenRasMol)(免费)AMBER (分子力学力场模拟程序)autodock (分子对接软件)(免费)GROMACS (分子动力学软件)(免费)GULP (General Utility Lattice Program)(免费)NIH分子模拟中心的化学软件资源导航(Research Tools on the Web) X-PLOR (大分子X光晶体衍射、核磁共振NMR的3D结构解析)(免费) 高通量筛选软件PowerMV (统计分析、分子显示、相似性搜索等)(免费)化合物活性预测程序PASS(部分免费)计算材料科学MathubC4：Cabrillo学院化学可视化项目以及相关软件(免费)Databases and Tools for 3-D Protein Structure Comparison and Alignment (三维蛋白质结构对比)(免费)Democritus (分子动力学原理演示软件)DPD应用软件cerius2(免费)EMSL Computational Results DataBase (CRDB)MARVIN'S PROGRAM (表面与界面模拟)(免费)XLOGP(计算有机小分子的脂水分配系数)(免费)量子化学软件中文网美国斯克利普斯研究院：金属蛋白质结构和设计项目(免费)/(免费)3D Molecular Designs (蛋白质及其他3D分子物理模型快速成型技术)3D-Dock Suite Incorporating FTDock, RPScore and MultiDock (3D 分子对接)(免费)AMSOL (半经验量子化学计算)(免费)Amsterdam Density Functional (ADF, 第一原理电子结构计算) Bilbao晶体学服务器(免费)BOSS (蒙特卡罗模拟软件)CADPAC (剑桥量子化学计算软件)(免费)Car-Parrinello分子动力学(CPMD, ab-initio分子动力学计算软件)(免费)CHARMM (大分子分子力学模拟计算软件)(部分免费)Chem2Pac package (A computational Chemistry Integrator)(免费) ChemTK Lite (QSAR软件)(免费)Chemweb计算化学在线工具：GAMESS(免费)Clebsch-O-Matic (在线计算器)(免费)Collaborative Computational Projects (协同计算计划) COLUMBUS (量化从头计算分子电子结构程序集)(免费) CrystalMaker Software (晶体结构可视化软件)DL_POLY (分子动力学模拟软件)(免费)DockVision (分子对接程序)(部分免费)DPMTA (分子动力学并行模拟软件)(免费)Dr. Pablo Wessig 研究小组开发的计算化学软件(免费)eHiTS: Electronic High Throughput ScreeningEMSL Gaussian Basis Set Order Form(免费)GAMESS-UK (分子电子结构计算软件)GAMESS: The General Atomic and Molecular Electronic Structure System(免费)Genebrowser (生物技术、基因治疗资源导航)Glide (分子对接程序)GROMOS (通用分子动力学软件包)(部分免费)HyperChem (分子模拟)Interprobe Chemical Services (分子模型化软件)Jmol (分子可视化软件)(免费)List of Computationally Sick Species (ab initio计算出现问题的物质、方法)MacroModel (分子力学计算程序)MARDIGRAS和CORMA (弛豫矩阵分析)(免费)MCPRO (用于蛋白质和核酸的蒙特卡罗模拟软件)MDRANGE (分子动力学计算ion ranges)(免费)MDynaMix (分子动力学计算软件)(免费)MidasPlus (分子建模软件, 美国加利福尼亚大学旧金山分校计算机图形实验室开发)MOE(分子模拟应用环境、方法开发平台)MOLMOL (生物大分子3D结构分析和显示、NMR结构解析)(免费) MolPOV 2.0.8 (一个将PDB文件转为POV-Ray文件的软件)(免费) MOLPRO 量子化学软件包 (用量化从头方法计算分子电子结构)(免费) Mopac 2002 (通用半经验量子力学程序)NAMD (并行分子动力学计算软件)(免费)Norgwyn Montgomery (化学软件公司)NWChem (计算化学软件包)OpenEye (快速计算分子的静电性质、形状)ORAC (用于模拟溶剂化生物分子的分子动力学计算程序, 意大利佛罗伦萨大学)(免费)ORTEP-III (美国橡树岭国家实验室晶体结构可视化--热椭圆体绘图程序)(免费)OSIRIS Property Explorer (LogP, 溶解度、成药可能性预测)(免费) PAPA (计算粒状物料的三维并行分子动力学计算程序)(免费) PETRA (反应性参数预测，包括生成焓、键离解能等)(部分免费) PharmTree (3D药效团生成和化合物分类)Pipeline Pilot (药物发现集成平台)PMDS (并行分子动力学模板库)(免费)PreADMET (ADMET预测)Protein Domain Motion Analysis Software: DynDom （蛋白质分析软件）(免费)ProtoMol (分子动力学并行计算软件)(免费)PSI3量子化学软件包(量化从头计算)(免费)Q-Chem (量子化学计算软件包)SGI应用于化学、生物信息学的软件、硬件产品SIGMA (分子动力学相关软件)SimBioSys (药物设计软件SPROUT)SMILECAS 数据库 (描述分子结构、子结构和复合结构的线性编码系统)SURFNET (量子化学计算程序)(免费)Sweet (依据标准命名方法和分子顺序建立糖类三维模型)Swiss PDB Viewer (PDB蛋白质结构可视化软件)SYBYL/Base(分子模拟和药物发现平台)TINKER (分子设计软件)(免费)UCSF Chimera (可扩展的, 交互式分子图形程序)(免费)VAMP/VASP (采用从头计算量子力学的分子力学)(免费)VHMPT (螺旋膜蛋白拓扑结构显示与编辑程序)(免费)Virtual Molecular Dynamics Laboratory (分子动力学软件)(免费) voidoo(空腔探测软件)(免费)WAM: Web Antibody Modeling (抗体模型构建)(部分免费) WebMO (基于3W界面的计算化学软件包)(免费)并行分子动力学模拟软件DoD-TBMD(免费)大分子对接程序Hex(免费)大规模原子(分子)并行模拟器 LAMMPS(免费)单晶和粉末衍射合作计算项目开发的免费软件(CCP14)(免费)蛋白质分子动力学模拟软件：CONCOORD(免费)蛋白质模拟资源导航，美国橡树岭国家实验室ORNL分子的物理化学性质在线计算 (用在基于结构的药物设计, 可计算logP, PSA,等)(免费)化合物3D结构VRML文件的自动生成(免费)化学中的常用计算机软件与资源(免费)化学资源工具箱(免费)计算机模拟的分子运动图像集(DSMM)(免费)可下载的教学软件(伦敦大学玛丽女王学院化学系提供)(免费)量子化学网美国华盛顿州立大学化学系：无机化学教学资源美国加州大学圣地亚哥分校所开发的化学软件 (化学反应计算、分子建模和可视化)美国康奈尔大学理论中心计算生物服务单元提供的免费软件 (计算生物与化学方面)(免费)美国马里兰大学：生物技术研究所Gilson研究小组美国能源部Ames实验室：经典分子动力学软件AL_CMD(免费)免费远程计算：贵州大学GHPCC量子化学从头计算系统(免费)模拟蛋白质的并行分子动力学计算程序EGO(免费)牛津大学：抗癌药物分布式计算项目 Screensaver Lifesaver欧洲科学基金资助项目：分子模拟所面临的挑战 (Simu: Challenges in Molecular Simulations)生物大分子结构分析和确认系列软件(美国加州大学圣地亚哥分校大分子结构计算研究中心开发)(免费)牙买加西印度大学Mona分校化学系所开发的免费软件(免费)应用于双原子分子的数值Hartree-Fock程序(免费)原子轨道3维模拟演示海域对流层气溶胶化学箱状模型(MOCCA, 源代码)化工过程相关软件材料模拟计算算法库MAPEngineeringtalk (产品新闻)(免费)GULP (General Utility Lattice Program)(免费)过程(工程)相关的单位换算在线工具(免费)化学工程进展CEP的化工软件目录(免费)计算材料科学Mathub绿色化学专家系统The Green Chemistry Expert System (GCES) 统计学数据集、软件StatLib (archive of statistical datasets and software at Carnegie Mellon University)制造业相关的软件目录(免费)FEATFLOW 软件(有限元方法计算和计算流体力学)(免费)MARVIN'S PROGRAM (表面与界面模拟)(免费)从Chemical Online查找最新发布的化工软件(免费)3E Company (在线MSDS管理和信息服务商)Actio Corporation (在线化学品管理解决方案提供商)ANSYS CFD FLOTRAN使用指南(免费)ANSYS Inc. Corporate (工程模拟软件)ANSYS使用手册AspenTechAutodesk, Inc. (中国)Autoplant plant design softwareBARON (非凸性函数全局最优化问题求解)(免费)CCSE Applications Suite(免费)CFD(计算流体力学)的软件, 数据, 视频和文字资料 (美国爱荷华大学IIHR-水利科学与工程研究中心发布)(部分免费)CFDTutor and CFDExpert (CFD学习与模拟软件)ChemiSoft (化学工程相关软件目录)ChemSage (无机物相图计算)ChemSep (多组分分离过程计算软件)Chemstations (过程模拟)COADE, Inc. (管道应力分析与设计、压力容器设计)DESIGN II for Windows (过程模拟软件)DIPPR (物性数据)DR Software, Inc. (MSDS管理软件开发商)Element DataSystem (环保实验室信息管理系统) Environmental Technology Network (与环境有关的过程软件) EPI Suite(与环境有关的物性估算程序包)(免费)ePlantData (过程数据交换方法)ESM Software(材料科学与工程软件)Flavor Selector 5.0 (调味剂管理工具)Fluent Inc.(CFD软件、流动和传热模拟)General Algebraic Modeling System (GAMS, 数学规划软件Haddock HazCom (MSDS专业服务公司)HSE Systems (MSDS软件开发以及管理服务商)Hyprotech (过程模拟)IDESImageTrak Software (MSDS管理软件开发与服务)ImageWave Corporation (MSDS管理数据库和服务商)InfoDyne Softwares (MSDS的建立与管理软件, 针对欧洲标准) LabView(仪器编程的图形化编程环境软件)Logical Technology, Inc. (环境卫生和安全EH&S软件和服务) M-Base Company (物性数据库和设计软件)MINOPT (模拟优化线性、非线性、混合整数、动态、混合整数非线性问题求解)Modeling Fluid Flow using Smoothed Particle Hydrodynamics(免费)Moldflow Corporation (注塑模拟)MSDS Archive (将纸载体的MSDS文件转换成符合OSHA标准的电子文档)MSDSpro (MSDS和化学品管理服务提供商)MSDSystem (MSDS 管理, 搜索和修复软件)OLI Systems (水溶液系统的模拟计算)Pacific Simulation (造纸过程模拟)ParCFD Test CasePenSim v2.0(青霉素发酵批处理过程模拟软件，免费) Philadelphia Mixers (搅拌器/混合器)PHOENICS (流体力学计算软件)Prosim (过程模拟软件)Reaction Design (反应、物理汽相沉积PVD)SafeTrax (MSDS创建工具)Scandpower AS (石油业咨询、过程模拟)Selerant (配方产品管理工具, 技术数据表Technical Data Sheets, TDS创建工具)SGI应用于化学、生物信息学的软件、硬件产品Sim42 (公开源代码的化学过程模拟器项目)(免费)Simons Technologies, Inc.Simulation Sciences Inc. (SIMSCI)Spotfire(决策支持软件Spotfire DecisionSite)Sunrise Systems (管道流动模拟)SuperPro Designer (过程模拟)Talos (MSDS 管理软件)THERIAK-DOMINO (平衡态及相图计算)(免费)Virtual Materials Group, Inc. (面向过程工程的热力学应用产品开发)WinSim Inc. (Windows、过程模拟软件)并行分子动力学模拟软件DoD-TBMD(免费)过程控制流程图绘制与管理软件ControlDraw 1(免费)过程模拟环境ASCEND(免费)韩国岭南大学计算应用流体实验室开发的免费CFD模拟软件(免费) 化学反应动力学模拟JavaScript Kinetics Simulator(免费)化学工程软件目录, 化学平衡计算程序EQS4WIN挥发性有机物对大气对流层影响的模拟(Tropospheric Chemistry Modelling)计算流体力学软件CFX空气和废气性质计算(Air and Exhaust Gas Properties V1.2)(免费) 流化床模拟分析软件ERGUN 6.0流体动力学模拟软件包：FOAM生物动态成象系统水溶液反应库及平衡计算Joint Expert Speciation Syetem(JESS)(免费)填料塔计算Packed Column Calculator烃类二元、三元系平衡模拟软件Equilibria物性数据库和工程小软件PhysProps, EngVert, PipeDrop下载与交换MATLAB开发的程序(免费)相图计算软件MTDATA橡胶、塑料部件加工模拟(SIGMA Engineering)意大利的里雅斯特大学应用物理系DINMA分部开发的一些CFD软件(免费)英国工程领域高性能计算计划CCP12 (High Performance Computing in Engineering, UK)与过程工业相关的工程软件导航（荷兰能源环境署）与过程相关的小型计算工具, Process Associates of America。
计算化学在化学中的应用
计算化学在化学中的应用化学作为一门研究物质的组成、结构、性质以及变化规律的科学，其发展一直与各种技术和方法的创新紧密相连。
在过去的几十年中，计算化学作为一种强大的工具，逐渐在化学领域崭露头角，并为化学研究带来了深刻的变革。
计算化学是理论化学的一个重要分支，它利用数学和计算机科学的方法来解决化学问题。
简单来说，就是通过建立数学模型和使用计算机程序，对化学体系进行模拟和计算，从而预测化学物质的性质、反应过程和行为。
计算化学在化学中的应用十分广泛。
首先，在材料科学领域，它为新材料的设计和开发提供了有力的支持。
通过计算不同原子组合和结构的能量、电子结构等性质，研究人员可以预测哪些材料可能具有特定的性能，如高强度、高导电性或良好的催化活性。
例如，在寻找新型半导体材料时，计算化学可以帮助筛选出具有合适能带结构的化合物，大大减少了实验的盲目性，提高了研发效率。
在药物研发方面，计算化学也发挥着重要作用。
药物分子与生物靶点（如蛋白质）之间的相互作用是药物发挥疗效的关键。
利用计算化学方法，可以模拟药物分子与靶点的结合模式，预测结合亲和力，从而指导药物的设计和优化。
这不仅能够缩短药物研发周期，降低成本，还能提高研发成功率。
比如，通过计算分析，可以对候选药物进行虚拟筛选，优先选择那些更有可能有效的分子进行合成和实验测试。
化学反应机理的研究是化学中的一个核心问题。
传统的实验方法往往难以直接观测到反应过程中的微观细节。
而计算化学则可以弥补这一不足。
通过计算化学反应过程中的能量变化、过渡态结构等，能够揭示反应的路径和速率决定步骤，帮助我们深入理解化学反应的本质。
这对于优化反应条件、提高反应产率以及开发新的反应具有重要意义。
此外，计算化学在环境化学中也有重要应用。
例如，对于污染物在环境中的迁移、转化和归宿的研究，计算化学可以模拟污染物与环境介质（如土壤、水体）之间的相互作用，预测其扩散和降解过程，为环境污染的治理和预防提供理论依据。
常用化学软件及其应用.
Interactive TrainingTM 交互式培训软件，包括 以下 几个部分： Atomic Absorption Spectrometry 交互式原子吸收光 谱分析培训软件。 Gas Chromatography 交互式气相色谱培训软件。 Advanced Interactive Gas Chromatography Training 高级交互式气相色谱培训软件。 High Performance Liquid Chromatography 交互式 高效液相色谱分析培训软件。 Inductively Coupled Plasma Spectrometry 交互式 感应耦合等离子体光谱分析培训软件。 Advanced Inductively Coupled Plasma Spectrometry 交互式高级感应耦合等离子体 分析培训软件。 Mass Spectrometry 交互式质谱分析培训软件。 Statistics for Analytical Chemists 适用于分析化学者 的交互式统计学培训软件。
2、学会一些基本的作图方法和作图技பைடு நூலகம்， 进行分子的电子结构与相关性质的计算。
3、综合应用上述软件，进行简单的分子设 计及化学反应机理分析。 4、学会利用国际互联网，对不断新推出的 国内外化学软件进行跟进并进行知识更新； 善于利用互联网的一切化学网络资源。
第一章 常用化学软件介绍
计算机作为一种化学学习和研究的工具有 着不可替代的作用。化学软件发展迅猛。
– – – – – Mass Spectrometrist's Periodic Table Isotope Ratio Calculator Elemental Composition Workshop Mass Series Calculator Simple Electrospray Calculator
常用化学软件与资源简介
B、键、链、原子基团的绘制：单击左边垂直工具条上 “Bond”或“Chain”工具按钮，选取单、双、叁键或链，在绘 图区单击鼠标左键或按住左键拖动鼠标即可绘制键或链。单 击左边垂直工具条上“Atom”工具按钮，在欲绘部位单击左键， 即出现文本输入框，可以直接从键盘输人或从下拉菜单中选 取欲输人的原子基因。 C、键、链、原子基团的编辑：点击左边工具条上的 “Select”按钮，双击欲编辑的键、链和原子基团，即弹出编 辑对话框，在对话框中修改完毕后点击“OK”即可。
☺
3、插入到word 方法一：首先，运行word，选择 “插入”——“对象”，在出现的对 话框中，选择“化学分子式文件”， 单击确定，出现一个方框，双击方框， 就可以像上面一样编辑方程式，编辑 完毕后单击对象外任一文档区返回 word编辑状态。单击对象，把鼠标移 到矩形框上的黑点上，拖动鼠标可以 改变对象大小。
4、 图文混排 ISIS/Draw2.4支持图文混排方式。有的反应式需在一定的 反应条件下进行，反应条件的描述只有通过文字表达。点击左 边工具栏上“Text”按钮，鼠标即变为“＋”字形，在欲写文本 处单击左键，输人所需的文本，输完后在任一处单击左键即可 （不可回车，否则程序认为你在换行）。若双击文本，弹出文 本编辑框，同其他文字处理软件一样，你可以选取字体、大小、 颜色等等修改文本属性。修改完毕，点击“Select”按钮，选中 结构式及文本。点击菜单栏“object”、“Group”，即将结构式 与文本组合为一个完整对象，进行整体拷贝、剪切、粘贴等等。
常用化学软件与网络资源简介
广东工业大学材料与能源学院 艾娇艳
引言
本文简单介绍了常用的几种化学作图、数据查 询与计算软件和一些常见的化学数据查询和软件下 载的网络资源，方便大家了解在专业学习中应当如 何使用这些软件和网络资源。
浅谈计算机在化学中的应用
浅谈计算机在化学中的应用摘要：本文主要介绍了计算机在化学数据和图形处理、分析化学方向、化学教学等化学知识中的应用。
关键词：计算机的应用分析计算软件教学计算机在化学中的应用是近十几年来化学领域中最话跃的课题之一，计算机与化学结合是化学学科发展的必然趋势。
理论化学的发展比较缓慢，主要是因为它的计算工作量庞大，非人力所能胜任。
如量子化学，复杂体系的化学反应动力学、多组分体系的化学平衡、配位化合物构型稳定化能的计算等，都需要计算机才能解决，所以计算机的发展促进了理论化学的发展。
化学学科中复杂计算对强大计算能力的依赖，海量化学信息对存储和管理能力的高要求，化学反应的复杂性和微观性对虚拟现实的需求，化工过程对自动化的需求等等，都要求化学工作者掌握现代计算机技术，驾驭计算机的能力已经成为衡量化学工作者能力的重要尺度之一。
以下为个人对计算机在化学应用中的几点浅见：1 在分析化学中的应用1.1 用于定量分析计算机定量分析可以应用于无机、有机、天然物质、人工合成等各个方面。
每一种化合物或络合物都有自己的光谱图，如果样品是由多种化合街或络台物构成的多组分混台体系，它们的光谱图必然产生相互重叠。
由于组分问的相互干扰，使这种重叠的光谱图变得十分复杂，给定量分析带来很大困唯。
借助计算机，则可以方便地同时定量分析出重叠内的所有组分。
例如，在共聚合成工业中，乙烯、丙烯共聚物中的链区长度（CH2基团的链长）对共聚物的性质（如柔软性等）产生重要影响。
因此，在共聚物的生产中必须对CH2基团链区进行定量分析。
丙烯、乙烯共聚物红外光谱图是由CH2、CH3、CH n重叠而成，因此可用计算机对这个谱图进行定量分析。
1.2 用于仪器分析原子吸收光谱在无机成分分析中占有十分重要的地位。
为了进一步提高分析的灵敏度和精确度，扩大光谱分析的应用范围，在原子吸收光谱领域中已开始把光谱分析技术同计算机技术相结合。
使用固定程序操作，用于连续分析、控制分析等场合，或者将原子吸收光谱测定出的大量各种数据送人计算机进行数据处理。
计算化学中软件的应用
计算化学中软件的应用化学软件是在化学研究和教学中广泛应用的一种工具。
它可以为化学家提供模拟、预测和分析实验数据的功能，有助于加快研究进程、优化实验设计和提高研究效率。
在本文中，我们将探讨化学软件的几种主要应用。
一、分子建模和计算化学分子建模是利用计算机技术对分子进行建模和模拟的过程。
化学软件可以帮助研究人员生成和操纵各种类型的化合物模型，从而探索不同的分子结构和属性。
通过计算和模拟，研究人员可以预测分子的热力学性质、分子动力学行为和化学反应的机理。
这对于理解化学反应的基本原理和优化化学反应条件非常重要。
二、药物设计和筛选药物设计是通过计算机辅助工具来设计和优化新药物的过程。
化学软件可以协助化学家进行分子建模、虚拟筛选和药物性能预测。
通过计算机模拟和分析，药物候选者可以被评估其与目标蛋白的相互作用、稳定性和活性。
这有助于加速药物研发的过程，减少试错成本，提高成功率。
三、反应预测和动力学模拟化学软件可以预测化学反应的机理和动力学行为。
通过输入反应物和反应条件，软件可以模拟反应的路径、产物分布和速率常数。
这对于理解和优化反应条件非常重要，有助于合成化学家设计更高效和选择性的反应。
四、能源与环境化学软件在能源和环境相关应用中也发挥了重要作用。
例如，软件可以用于研究和优化能源材料的性能，如电池、太阳能电池和燃料电池。
此外，它们还可以应用于环境污染物的模拟和评估，以及清洁能源开发中的催化反应。
五、教学和学习工具化学软件可以作为教学和学习的工具。
它们可以使学生以交互的方式学习分子建模和化学反应机理，同时提供一系列的化学实验和演示。
这些软件可以为学生提供一个更直观和具体的方式来理解和应用化学原理。
总结化学软件在化学研究和教学中发挥着重要作用。
它们可以模拟、预测和分析分子的结构和性质，加速药物设计和反应优化的过程，同时解决能源和环境相关的问题。
此外，化学软件还可以作为学习和教学工具，促进学生对化学的理解和应用。
计算机化学及化学软件网站大全
计算机化学及化学软件网站大全http://www.chem.ac.ru/Chemistry/Soft/ 化学软件网址列表。
http://antas.agraria.uniss.it/software.html 化学软件列表和FTP站点列表。
http://bogense.chem.ou.dk/~icc/software.html 计算化学软件相关的网址。
http://www.lctn.uhp-nancy.fr/Chercheurs/Xavier.Assfeld/links.html 量化软件，基组库，量化教学。
http://www.sc.ehu.es/powgep99/dcytp/teoricos/txoni/programak.htm 量子化学软件和其它有用的应用程序。
/reports/1996/6802brown/ 量子化学缩写辞典。
.tw/pub/ 台湾高速电脑中心各学科领域研究软件，可以下载。
包括Chemistry，databases，parallel，physics，visualization。
/~pac/reps.html Clarkson大学相对论有效势数据库。
提供第二至第六周期全部元素的相对论有效势基组下载，可以用在Gaussian和COLUMBUS上。
/quantum/ 有Dyall博士的《相对论量子化学》授课笔记下载，即将出书。
/ Computational Chemistry List，有免费量化软件下载，以及量子化学论坛等。
/Doc/publist.html 与ADF软件有关的一些博士论文。
从中可以学到很多量化知识。
http://leroy.uwaterloo.ca/ 处理双原子分子光谱参数的一些fortran源程序（LEVEL，BCONT，RKR1，DSParFit）。
申请后，就会发到你的E-mail信箱。
http://zeus.polsl.gliwice.pl/~nikodem//linux4chemistry.html 集中了绝大多数用在Linux下的化学软件。
常用的量化计算软件
Molpro
国际上广泛使用的专业级电子结构量化计算软件
不同于其它的量子化学软件包，MOLPRO的重点是高精度计算，通过多参考CI， 耦合簇和有关的方法，广泛处理电子相关问题。程序的核心是MCSCF，MR-CI， 和耦合簇程序，以及一系列附加功能。 功能：多组态自恰场 ；自动计算振动频率，强度和热动力学特性；EOM-CCSD 计算激发态；MCSCF和MRCI波函的单电子跃迁特性，包括自旋-轨道耦合； MCSCF波函的一些双电子跃迁特性；多种单电子特性等等。
1
Gaussian 03
Gaussian是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件，可以研究：
1. 分子能量和结构； 2. 过渡态的能量和结构化学键以及反应能量，反应路径; 3. 分子轨道，偶极矩和多极矩，原子电荷和电势，振动频率; 4. 红外和拉曼光谱，NMR，极化率和超极化率; 热力学性质； 5. 计算可以模拟在气相和溶液中的体系,模拟基态和激发态； 6. 还可以对周期边界体系进行计算
主要功能
1. 采用周期性边界条件(或超原胞模型)处理原子、分子、团簇、纳米线(或管)、薄膜、 晶体、准晶和无定性材料，以及表面体系和固体
2. 计算材料的结构参数(键长,键角,晶格常数，原子位置等)和构型 3. 计算材料的状态方程和力学性质(体弹性模量和弹性常数) 4. 计算材料的电子结构(能级、电荷密度分布、能带、电子态密度和ELF) 5. 计算材料的光学、磁学、晶格动力学性质(声子谱等) 6. 表面体系的模拟(重构、表面态和STM模拟) 7. 从头分子动力学模拟 8. 计算材料的激发态(GW准粒子修正)
常用量子化学计算软件
• 业界最流行的量化计算软件：Gaussian 03； • 化学家通用的密度泛函程序：ADF • 基于第一原理的分子动力学计算的软件包：
化学软件下载及使用方法
(4)Microcal Origin (www．microcal．com) Microcal Origin是Windows平台下用于数据分 析、工程绘图的软件。Origin软件的功能强大， 在各国科技工作者中使用较为普遍，如Origin 可以制作各种图形，包括直线图、描点图、 向量图、柱状图、饼图、区域图、极坐标图 以及各种3D图表、统计用图表等，还可以对 数据进行线性拟合等。
化学软件下载及使用方法
作为一个化学工作者，在进行科研、教学等工作的同 时，往往要做一些必要的数据处理或做一些课件，还 要及时发表一些论文等。随着计算机的广泛运用及计 算机功能的增强，用计算机绘制分子的化学结构已经 成为现实。当今世界上有多种化学结构绘制软件，其 中一些可以免费使用，这些软件给化学家们提供了便 利的工具，可以直观地展示分子的结构。比如：借助 Chem Window可以轻松的绘出各种分子结构图和化 学反应方程式；借助MicrocalOrigin可方便地进行一 些数据分析等等。在提交论文发表时，很多刊物都明 确要求提供计算机绘制的分子结构图。
(2)ChemDraw (www．camsoft．com) 世界上使用最多的大型软件包Chem Office中 的一个组件，其他两个组件包括Chem3D(分 子模型与分析)和Chem Finder(化学信息和结 构检索)。这三个组件可以分别购买或者购买 集成的软件包。
(3)Chem Sketch (www．acdlabs．com) Chem Sketch是加拿大的软件公司Advanced Chemical Development的免费产品。可从该公司的 网站免费下载或购买CD-ROM。如果是仅仅绘制化 学结构而不需要光谱信息和计算，那么Chem Sketch是一个不错的选择，事实上，在很多大学里 该软件与多种化学教科书捆绑。另外，该软件包中 还包括另一种有用的工具——3D Viewer，可以把 Chem Sketch中绘制的结构以三维的形式展示出来， 更加形象。
高中化学计算空间结构教案
高中化学计算空间结构教案教学目标：1. 了解计算化学的基本概念和方法；2. 掌握在计算化学中常用的软件和工具；3. 能够利用计算方法计算分子的结构和性质；4. 能够分析和解释计算结果。
教学内容：1. 计算化学基本概念2. 计算化学方法3. 计算化学软件和工具4. 计算分子结构和性质教学过程：一、引言（5分钟）介绍计算化学的基本概念和意义，引出今天的教学内容。
二、计算化学基本概念（10分钟）1. 计算化学是指利用计算机对化学问题进行研究和分析的一种方法。
2. 计算化学可以帮助我们预测分子的结构和性质，找到最稳定的构型等。
三、计算化学方法（15分钟）1. 常用的计算方法包括分子力场方法、量子化学方法等。
2. 量子化学方法可以更准确地描述分子的结构和性质，但计算量更大。
四、计算化学软件和工具（15分钟）1. 常用的计算化学软件包括Gaussian、NWChem等。
2. 这些软件可以用来计算分子的能量、振动频率、电荷分布等。
五、计算分子结构和性质（15分钟）1. 利用计算方法可以计算分子的几何构型、键长、键角等。
2. 还可以计算分子的能量、电荷分布等性质。
六、实验操作（20分钟）1. 请学生现场操作计算化学软件，计算一个简单的分子的结构和性质。
2. 引导学生分析计算结果，讨论计算方法的应用和局限性。
七、总结与展望（5分钟）总结今天的教学内容，展望未来的学习方向和实践应用。
教学反馈：1. 学生听课笔记2. 学生操作报告3. 学生问答互动注：本教案仅供参考。
实际教学中可根据具体情况进行调整和补充。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
ADF软件 软件
化学数据库（ 化学数据库（Data base） ）
分子结构库 晶体库 热力学数据库 药物库 高分子库 分子光谱、波谱图谱库 生物数据库（蛋白质、核酸、多糖库） 化学文献库
化学人工智能（需借助数据库） 化学人工智能（需借助数据库）
计算机辅助分子结构解释 化学模式识别 结构－活性关系分析 结构－性质关系分析 神经网络算法与神经网络计算机
常用计算化学应用软件及资源
Gaussian 软件
Gaussian的功能很强大 可以做从头算 半经验 DFT
Gaussiห้องสมุดไป่ตู้n 软件
可用来研究分子的能量与几何结构 化学反应过渡态的能量与几何结构 振动频率分析、红外与拉曼光谱; 分子的热化学性质、键能 化学反应能 化学反应途径
研究分子轨道的能量与性质 原子电荷分布（布居分析）和自旋密度分布 分子的多极矩（永久偶极矩和四极至十六极矩） NMR 屏蔽常数、化学位移及分子的磁化率、振动 园二色强度 电子亲和性与电离势、极化率与超极化率、静电 势与电子密度分布等
量子化学资源
International Journal of Quantum chemistry Journal of molecular modeling Journal of physical chemistry Journal of chemical theory and computation （美 国化学会2005年推出） Journal of molecular structure (Theochem) Reviews in Computational Chemistry （丛书） Journal of theoretical and computational chemistry Theoretical chemical accounts Journal of computational chemistry
ADF可以进行单点计算、几何优化、寻找过渡态、 计算力常数和热化学性质、跟踪反应路径、研究电 子结构、通过比较离子的激发态和基态而获得激发 能。 新版本的ADF包括了含时密度泛函理论，基组库中 包含了1～118号所有元素，而且对常见元素有不同 大小的基组，从最小的到高质量的。 ADF软件在材料科学和生命科学均有应用，但更侧 重于前者，尤其在重元素化学、无机化学、催化领 域非常流行。最新版的ADF加入了QM/MM方法， 可用于生物大分子体系的研究。
Gaussian公司的官方网站 Gaussian公司的官方网站
国际上著名的计算化学列表网站，开通较早， 国际上著名的计算化学列表网站，开通较早，内有大量关 于计算化学的邮件列表。 于计算化学的邮件列表。
北京大学化学系开设的量化计算论坛
厦门大学化学系开设的量化计算论坛
国内著名的量子化学论坛
国内著名的量子化学论坛
第一步工作准备输入文件。Gaussian程序对输入文件 有一定的格式要求，如图显示了一个完整的Gaussian 输入文件
准备好输入文件后，便可在Gaussian程序中读入 此输入文件进行计算
程序运算完后，Gaussian会给出正常结束的信息。此 时，可打开文本格式的输出文件，提取所需信息。
MOPAC 软件