Windows下本地blast安装方法

Windows系统下本地BLAST安装方法

1．下载安装文件：

以blast-2.2.23-ia32-win32.exe为例，将此安装文件放至指定目录，以G:\blast-\为例，如图所示：

2. 运行安装程序：

双击上述安装文件，单击运行：

程序会自动在blast-文件夹下生成3个文件夹：\bin\、\data\和\doc\：

3. 添加配置文件：

在桌面（任意可以新建文件的地方）新建一个.txt文件，然后将其重命名为NCBI.ini，在提示更改后缀名的对话框中点是。打开NCBI.ini，在其中写入如下两行内容：

[NCBI]

Data="path\data\"

上边的path是你的blast安装路径，在本例中为G:\blast-，因此，NCBI.ini中的内容为：

[NCBI]

Data="G:\blast-\data\"

写完后保存，然后将该文件复制至C:\Windows目录下：

至此，本地blast-2.2.23-ia32-win32安装完毕。

4. 导入数据库：

从ftp:///blast/db/上，可下载各类数据库文件，下载完毕后，将其解压至G:\blast-\data\目录下。

注意事项：

1.NCBI.ini中的路径为blast所在安装路径；

2.此安装办法适用与指定版本，对于blast+版本不适用，若想安装新

版本，可自行到网站查阅安装办法；

附：运行示例：

1.打开cmd命令行；

2.通过cd命令到达安装目录的bin\目录下

3.通过dir命令查看全部可执行的子程序：

4.使用blastall.exe进行比对：

输入blastall.exe -d refseq_rna.01 -i G:\blast-\data\test_query.fa -p blastn

该命令各部分的含义为：

①blastall.exe：blast主程序；

②-d refseq_rna.01：选择refseq_rna.01为被搜索的数据库，其数

据已存至G:\blast-\data\下；

③-i G:\blast-\data\test_query.fa: 选择test_query.fa为查找序列文

件，注意，查找文件应输入其绝对路径，但数据库文件不用。

④-p blastn：选择blastn为匹配方法，blastn为核酸-核酸匹配，想

获取其他程序信息，可直接输入blastall.exe命令查看帮助信息。

程序部分运行结果为：

上述截图仅为一部分。

5.输入blastall.exe命令查看帮助信息：

好了，开始享受你的本地blast之旅吧~！