生物化学原理复习题
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一、名词解释
km值:Km值等于酶促反应速度达到最大反应速度一半时所对应的底物浓度,是酶的特征常数之一。不同的酶Km值不同,同一种酶与不同底物反应Km值也不同,Km值可近似的反应酶与底物的亲和力大小:Km 值大,表明亲和力小;Km值小,表明亲合力大。
肽键:一分子氨基酸的α-羧基和另一分子氨基酸的α-氨基脱水缩合形成的共价键,即-CO-NH-。氨基酸借肽键联结成多肽链。
结构域:分子较大的多肽常折叠成两个或多个球状簇,这种球状簇叫做结构域。在球形蛋白中,结构域具有自己特定的四级结构,其功能部依赖于蛋白质分子中的其余部分,但是同一种蛋白质中不同结构域间常可通过不具二级结构的短序列连接起来。蛋白质分子中不同的结构域常由基因的不同外显子所编码。Tm值:天然结构与变性结构转换的中点温度,Tm值取决于溶液的PH和离子强度。不同序列的DNA,Tm 值不同。DNA中G-C含量越高,Tm值越高,成正比关系。
生物氧化:在生物体内,从代谢物脱下的氢及电子﹐通过一系列酶促反应与氧化合成水﹐并释放能量的过程。主要为机体提供可利用的能量
脂肪酸β-氧化:脂肪酸氧化是从羧基端的β碳原子开始的,每次切下一个二碳单位,这种分解方式就称为脂肪酸β-氧化。
乙醛酸循环:植物(尤其是尚不能完成光合作用的幼苗)以及某些细菌和藻类能够利用乙酸作为他们唯一的碳源去合成它们自身的化合物,这是因为这些生物具有将乙酸或乙酰CoA转变成草酰乙酸的酶系统,这一酶系统称为乙醛酸途径或乙醛酸循环。
磷酸戊糖途径:当加入碘乙酸或氟化物后,糖酵解和三羧酸循环被抑制,但葡萄糖的消耗并无太大影响,同时观察到葡萄糖-6-磷酸可以转化为CO2和5-磷酸核酮糖。于是把这个转变途径叫做磷酸戊糖途径。核苷酸的从头合成:利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及CO2等简单物质为原料,经过一系列复杂的酶促反应合成核苷酸。
顺反子(cistron):即结构基因,为决定一条多肽链合成的功能单位。
钙调蛋白:一种能与钙离子结合的蛋白质。钙离子被称为细胞内的第二信使,其浓度变化可调节细胞的功能,这种调节作用主要是通过钙调蛋白而实现的。
半保留复制:一种双链DNA的复制模型,复制时亲代DNA双链分离,以每条单链作为模板,按照碱基互补方式合成新的互补链,以组成新的DNA分子。这样新形成的两个DNA分子与原来的DNA分子的碱基顺序完全一样,每个子代分子的一条链来自亲代,另一条连是新合成的,这种复制方式称为半保留复制。外切酶:一类能从多核苷酸链的一端开始按序催化水解3、5-磷酸二酯键,降解核苷酸的酶。其水解的最终产物是单个的核苷酸(DNA为dNMP,RNA为NMP)。按作用的特性差异可以将其分为单链的核酸外切酶和双链的核酸外切酶
逆转录:在RNA的指导下合成DNA的过程,它的遗传信息流动方向是从RNA到DNA,与中心法则的信息流动方向和转录过程相反,故称为逆转录。
逆转录酶:一种特殊的DNA聚合酶,能够催化反向转录反应的酶叫逆转录酶。是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。
二、简答题
1.怎样区分分子量相同的单链DNA或RNA?
答:(1) DNA溶于苯酚而RNA不溶,故可用苯酚来沉淀,这是最简单的方法。(2)利用吖啶橙的变色特性可鉴别DNA和RNA。吖啶橙作为一种荧光染料已被用于染色固定,非固定细胞核酸,或作溶酶体的一种标记。观察死亡细胞荧光变色性变化以及区别分裂细胞和静止细胞群体。虽然测定DNA和RNA含量时较难获得好的重复性结果,但该方法已被许多实验室广泛采用。○1酸水解:在1mol/L Hcl存在下,由于DNA对酸敏感,此时RNA不敏感,因此可以用来分离;○2碱的作用:DNA耐碱,RNA易被碱水解;○3显色反应:鉴别DNA和RNA
浓HCl 浓HCl
RNA ------→绿色化合物 DNA ------→蓝紫色化合物
苔黑酚二苯胺
用啡啶溴红(荧光染料)和溴嘧啶都可对DNA染色,原理是卡在分子中,DNA的离心和电泳显色可用它们;○4溶解性:都溶于水而不溶于乙醇,因此,常用乙醇来沉淀溶液中的DNA和RNA。DNA溶于苯酚而RNA不溶,故可用苯酚来沉淀RNA;○5紫外吸收:核酸的λm=260nm,碱基展开程度越大,紫外吸收就
越厉害。当A=1时,DNA:50ug/ml,RNA和单链DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml。用A260/A280还可来表示核酸的纯度:>1.8,DNA很纯;>2RNA很纯。○6沉降速度:对于拓扑异构体(核苷酸数目相同的核酸),其沉降速度为:RNA > 超螺旋DNA > 解链环状DNA > 松弛环状DNA > 线形DNA,也就是在离心管中最上层是线形DNA,最下面是RNA;○7电泳:核苷酸、核酸均可以进行电泳,泳动速度主要由分子大小来决定,因此,电泳是测定核酸分子量的好方法;○8DNA分子量测定最直接的方法:用适当浓度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以将其他形式的DNA变成线形DNA,用电镜测出其长度,按B-DNA模型算出bp数,根据核苷酸的平均分子量就可计算出DNA的分子量
2.真核生物mRNA调控比原核生物mRNA调控复杂的原因?
答:从分子结构上来看,真核生物和原核生物的mRNA是完全一样的,都是核糖核酸,由四种核糖核苷酸组成,并且都是由基因转录而来,但两者有很多区别,如下:(1)原核生物mRNA常以多顺反子的形式存在。真核生物mRNA一般以单顺反子的形式存在;(2)原核生物mRNA的转录与翻译一般是偶联的,真核生物转录的mRNA前体则需经转录后加工,加工为成熟的mRNA与蛋白质结合生成信息体后才开始工作;(3)原核生物mRNA半寿期很短,一般为几分钟。真核生物mRNA的半寿期较长,有的可达数日;(4)原核与真核生物mRNA的结构特点也不同。真核生物mRNA由5′端帽子结构、5′端不翻译区、翻译区、3′端不翻译区和3′端聚腺苷酸尾巴组成,原核生物mRNA无5′端帽子结构和3′端聚腺苷酸尾巴。3.胰岛素的生化机制
答:多数激素和其他胞外刺激通过以下三种机制中的一种传递其信号:cAMP 途径;磷脂酰肌醇Ca~(2+)途径;或离子通道。胰岛素的作用不可能与这些机制中的任何一种直接相关。胰岛素是机体内唯一降低血糖的激素,也是唯一同时促进糖原、脂肪、蛋白质合成的激素。作用机理属于受体酪氨酸激酶机制。(一)调节糖代谢胰岛素能促进全身组织对葡萄糖的摄取和利用,并抑制糖原的分解和糖原异生,因此,胰岛素有降低血糖的作用。胰岛素分泌过多时,血糖下降迅速,脑组织受影响最大,可出现惊厥、昏迷,甚至引起胰岛素休克。相反,胰岛素分泌不足或胰岛素受体缺乏常导致血糖升高;若超过肾糖阈,则糖从尿中排出,引起糖尿;同时由于血液成份中改变(含有过量的葡萄糖), 亦导致高血压、冠心病和视网膜血管病等病变。胰岛素降血糖是多方面作用的结果:○1促进肌肉、脂肪组织等处的靶细胞细胞膜载体将血液中的葡萄糖转运入细胞;○2通过共价修饰增强磷酸二酯酶活性、降低cAMP水平、升高cGMP 浓度,从而使糖原合成酶活性增加、磷酸化酶活性降低,加速糖原合成、抑制糖原分解;○3通过激活丙