常用化学软件
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质谱软件 （Mass Spectroscopy Software）
• • • • • • • • • NIST/EPA/NIH Mass Spectral Database ChemSite® Pro for NIST Elemental Formula Calculator Enzyme Kinetics!ProTM GC, GC/MS File ManagerTM Interactive Training - Mass Spec Module Mass Spec CalculatorTM Version 3 MassSpec CalculatorTM Professional Mass Spec ToolsTM
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• [6]周剑平编著.精通Origin 7.0.北京：北京 航空航天出版社.2004 • [7] 胡立江等编著. 精通ChemDraw. 北京： 清华大学出版社，2002 [10] 俞庆森，朱龙 观编著.分子设计导论.北京：高等教育出版 社，2000 • [8]赵文元，王亦军编著.计算机在化学化工 中的应用技术.北京：科学出版社.2001 • [9] 邵学广，蔡文生编著.化学信息学.北京： 科学出版社.2001
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绪论
• （一）内容与特色 • 内容重点介绍origin 、chemwindow、 chemsketch、以及ChemOffice（ chemdraw、chem3D、chemfinder）等 常用化学图文处理软件及其应用，着重介 绍这些软件的基本功能以及基本使用技巧 。 • 这些内容是撰写化学论文或相关学科论文 必不可少的计算机应用技术，也是进行计 算机功能分子设计、电子结构与性质分析 的重要基础。 Exit
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(Chemical Clip Art)
• ChemArt Deluxe Clip Art 玻璃器具贴图软件，种类齐全 ，采用矢量图像，调整图片比例或方向，能保持原图质量 。 • ChemArt History Collection 化学历史图片库，有古代化 学家肖像，试验设备，试验场景图片等。 • Chemistry Photo Art 化学照片图库，每一个照片都提供 四种分辨率供你选择。 • Chrom/PrepTM Clip Art 色谱用器具图片库，如果你从事 色谱研究和教学工作，就应该选择 Chrom/PrepTM Clip Art ！ • GlasTronixTM Clip Art 实验室器具图片库，用相关玻璃 器件图片可方便地组合成任意一种基础实验装置。 • SafetyArtTM Deluxe Clip Art 安全防护图片库，共计有 600幅专业级的图片，全色彩，涉及大多数重要的安全防 护题材。
常用化学软件及其应用
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• 参考书籍 • [1] 沈勇，张大经，郑康成编著. 现代化学信息基 础教程.广州：中山大学出版社，2000 [2] 缪强 编著.化学信息学导论.北京：高等教育出 版社，2001 • [3]叶卫平，方安平，于本方. Origin7.0 科技绘图 及数据分析.北京：机械工业出版社.2004 • [4]郝红伟，施光凯. Origin6.0实例教程. 北京：中 国电力出版社，2000 • [5] 吴功宜，吴英编著. Internet 基础. 北京：清华 大学出版社，2000
• Interactive TrainingTM 交互式培训软件，包括 以下几个 部分： • Atomic Absorption Spectrometry 交互式原子吸收光谱分 析培训软件。 • Gas Chromatography 交互式气相色谱培训软件。 • Advanced Interactive Gas Chromatography Training 高 级交互式气相色谱培训软件。 • High Performance Liquid Chromatography 交互式高效 液相色谱分析培训软件。 • Inductively Coupled Plasma Spectrometry 交互式感应耦 合等离子体光谱分析培训软件。 • Advanced Inductively Coupled Plasma Spectrometry 交 互式高级感应耦合等离子体分析培训软件。 • Mass Spectrometry 交互式质谱分析培训软件。 • Statistics for Analytical Chemists 适用于分析化学者的交 互式统计学培训软件。
– – – – – Mass Spectrometrist's Periodic Table Isotope Ratio Calculator Elemental Composition Workshop Mass Series Calculator Simple Electrospray Calculator
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生物化学 （Biochemistry ）
• • • • • • • • • Amino Acid DatabaseTM Enzyme Kinetics!Pro Fluorescence DatabaseTM GAPTM - Gel Alignment Program (SDS Page Gels) GPMAWTM - General Protein Mass Analysis for Windows IsoPointTM Peptide CompanionTM pH ProfileTM Protein ToolsTM
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化学数据库 （Chemical Databases）
• • • • • • • • • • • • AgroSynTM Pesticide Synonym Database Chemical Structure & Information Databases Chem Sources USA Chem Sources-International Gardner's Chemical Synonyms & Trade Names Electronic Handbook Juice Products Analytical Database Merck Index Electronic version NutriChemTM Lab Database -Food Nutrient & Chemical Element Database Periodic Table Database Periodic Table Excel Prescription Drug Database SynapseTMChemical Library Exit
• 计算机作为一种化学学习和研究ห้องสมุดไป่ตู้工具有 着不可替代的作用。化学软件发展迅猛。
• 本章介绍一些常用的能在PC机上使用的化 学类软件，方便同学们在学习和研究中做 出有效、快速的选择。
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化学软件的分类
• • • • • • • · 化学综合软件 · 化合物结构绘制 · 图谱分析 · 化学工程 · 化学化工计算 · 分子模型 · 化学教育
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• • • • • • • •
分子绘制，模拟与计算软件 ◆质谱软件 ◆ 化学贴图软件 ◆化学数据库 ◆ 层析软件 ◆生物化学 ◆ 材料科学 ◆普通，有机，合成和分析化学软件
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分子绘制，模拟与计算 （Molecular modelling ，drawing）
• Alchem2000 v.2.0 Tripos公司开发的分子三维结构模 拟与计算软件。 • ChemOffice 2002 化学家桌面办公软件，分子结构绘制 ，模拟，数据库管理及搜索引擎等。 • Chemistry 4-D Draw Standard & Pro 分子结构(4D)绘 制软件。 • MolSuite2000 分子三维结构模拟，物理性质计算，统计 学分析，数据库开发及管理。 • Molecular Analysis Pro 研究分子生物活性和化学结构 及物理性质之间的关系。 • ChemSite 三维分子模拟程序，模拟有机和生物分子的 动力学行为。
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• ChemSite Pro 除了ChemSite 的全部功能外，还 增加了晶体创建功能，包括离子型、金属、共价 型和分子型晶体等。 • Molecular Modeling Pro 一个先进的分子模拟程 序。 • ChemDraw 6.0 化学结构和化学贴图绘制，结构 核磁位移分析等。 • Chem3D 6.0 分子3D结构模拟和计算软件。 • ChemSketch 5.0 化学画图用软件包，可用于画 化学结构、反应和图形。也可用于设计与化学相 关的报告和演讲材料。 • ISIS/Draw 2.4 一个智能的化学绘图软件包。
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层析软件 （Chromatography Software）
• CESARTM 毛细管电泳模拟与优化应用软件。 • Chromatography EquationsTM 色谱计算软件，包括气相 色谱、液相色谱和离子色谱。 • ChromViewTM 把GC和GC-MS高分辨率图片数据输入 到其它 Windows 应用程序,如：MS Word，Excel，或 Powerpoint。 • Gas Chromatography Simulation & Optimization Software 气相色谱模拟和优化软件。 • GC and GCMS File TranslatorTM 气相色谱和气质联用 色谱文件转换软件。 • GC and GCMS File TranslatorTM Professional Version 气相色谱和气质联用色谱文件转换专业版。 • HPLC Calculations Assistant & Reference Tools 高效液 相色谱计算助手和相关工具。 • HPLC OptimizationTM 高效液相色谱优化软件，用于优 Exit 化HPLC条件，如 isocrate溶剂和梯度洗脱。
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• 2、学会一些基本的作图方法和作图技巧， 进行分子的电子结构与相关性质的计算。
• 3、综合应用上述软件，进行简单的分子设 计及化学反应机理分析。 • 4、学会利用国际互联网，对不断新推出的 国内外化学软件进行跟进并进行知识更新 ；善于利用互联网的一切化学网络资源。
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第一章 常用化学软件介绍
• Adhesive Chemicals and Compounding Ingredients • Chemical Manufacturers Electronic Directory of Trade Name Products • Fillers, Extenders, and Diluents Electronic Handbook • Food Packaging Chemicals and Materials • Green Chemicals Electronic Handbook • Industrial Chemical Additives Electronic Handbook • Industrial Surfactants Electronic Handbook • Specialty Chemicals Electronic Source Book • Cosmetics & Personal Care Additives Electronic Handbook • Food Additives Electronic Handbook • Paints & Coatings Raw Materials Electronic Handbook • Pharmaceutical Additives Electronic Handbook • Plastic and Rubber Additives Electronic Handbook
• （二）目的要求 • 1、重点掌握origin 、chemwindow、 chemsketch、chemdraw等常用化学图文 处理软件的使用技术
• 2.能灵活绘制化学及其它相关学科论文所需 要的各种类型的化学分子式、分子图、反 应式、轨道图、能级图、实验装置图、化 学工艺流程图等；会灵活应用这些软件进 行科学准确的作图，合理的分析和处理实 验数据。
质谱软件 （Mass Spectroscopy Software）
• • • • • • • • • NIST/EPA/NIH Mass Spectral Database ChemSite® Pro for NIST Elemental Formula Calculator Enzyme Kinetics!ProTM GC, GC/MS File ManagerTM Interactive Training - Mass Spec Module Mass Spec CalculatorTM Version 3 MassSpec CalculatorTM Professional Mass Spec ToolsTM
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• [6]周剑平编著.精通Origin 7.0.北京：北京 航空航天出版社.2004 • [7] 胡立江等编著. 精通ChemDraw. 北京： 清华大学出版社，2002 [10] 俞庆森，朱龙 观编著.分子设计导论.北京：高等教育出版 社，2000 • [8]赵文元，王亦军编著.计算机在化学化工 中的应用技术.北京：科学出版社.2001 • [9] 邵学广，蔡文生编著.化学信息学.北京： 科学出版社.2001
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绪论
• （一）内容与特色 • 内容重点介绍origin 、chemwindow、 chemsketch、以及ChemOffice（ chemdraw、chem3D、chemfinder）等 常用化学图文处理软件及其应用，着重介 绍这些软件的基本功能以及基本使用技巧 。 • 这些内容是撰写化学论文或相关学科论文 必不可少的计算机应用技术，也是进行计 算机功能分子设计、电子结构与性质分析 的重要基础。 Exit
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(Chemical Clip Art)
• ChemArt Deluxe Clip Art 玻璃器具贴图软件，种类齐全 ，采用矢量图像，调整图片比例或方向，能保持原图质量 。 • ChemArt History Collection 化学历史图片库，有古代化 学家肖像，试验设备，试验场景图片等。 • Chemistry Photo Art 化学照片图库，每一个照片都提供 四种分辨率供你选择。 • Chrom/PrepTM Clip Art 色谱用器具图片库，如果你从事 色谱研究和教学工作，就应该选择 Chrom/PrepTM Clip Art ！ • GlasTronixTM Clip Art 实验室器具图片库，用相关玻璃 器件图片可方便地组合成任意一种基础实验装置。 • SafetyArtTM Deluxe Clip Art 安全防护图片库，共计有 600幅专业级的图片，全色彩，涉及大多数重要的安全防 护题材。
常用化学软件及其应用
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• 参考书籍 • [1] 沈勇，张大经，郑康成编著. 现代化学信息基 础教程.广州：中山大学出版社，2000 [2] 缪强 编著.化学信息学导论.北京：高等教育出 版社，2001 • [3]叶卫平，方安平，于本方. Origin7.0 科技绘图 及数据分析.北京：机械工业出版社.2004 • [4]郝红伟，施光凯. Origin6.0实例教程. 北京：中 国电力出版社，2000 • [5] 吴功宜，吴英编著. Internet 基础. 北京：清华 大学出版社，2000
• Interactive TrainingTM 交互式培训软件，包括 以下几个 部分： • Atomic Absorption Spectrometry 交互式原子吸收光谱分 析培训软件。 • Gas Chromatography 交互式气相色谱培训软件。 • Advanced Interactive Gas Chromatography Training 高 级交互式气相色谱培训软件。 • High Performance Liquid Chromatography 交互式高效 液相色谱分析培训软件。 • Inductively Coupled Plasma Spectrometry 交互式感应耦 合等离子体光谱分析培训软件。 • Advanced Inductively Coupled Plasma Spectrometry 交 互式高级感应耦合等离子体分析培训软件。 • Mass Spectrometry 交互式质谱分析培训软件。 • Statistics for Analytical Chemists 适用于分析化学者的交 互式统计学培训软件。
– – – – – Mass Spectrometrist's Periodic Table Isotope Ratio Calculator Elemental Composition Workshop Mass Series Calculator Simple Electrospray Calculator
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生物化学 （Biochemistry ）
• • • • • • • • • Amino Acid DatabaseTM Enzyme Kinetics!Pro Fluorescence DatabaseTM GAPTM - Gel Alignment Program (SDS Page Gels) GPMAWTM - General Protein Mass Analysis for Windows IsoPointTM Peptide CompanionTM pH ProfileTM Protein ToolsTM
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化学数据库 （Chemical Databases）
• • • • • • • • • • • • AgroSynTM Pesticide Synonym Database Chemical Structure & Information Databases Chem Sources USA Chem Sources-International Gardner's Chemical Synonyms & Trade Names Electronic Handbook Juice Products Analytical Database Merck Index Electronic version NutriChemTM Lab Database -Food Nutrient & Chemical Element Database Periodic Table Database Periodic Table Excel Prescription Drug Database SynapseTMChemical Library Exit
• 计算机作为一种化学学习和研究ห้องสมุดไป่ตู้工具有 着不可替代的作用。化学软件发展迅猛。
• 本章介绍一些常用的能在PC机上使用的化 学类软件，方便同学们在学习和研究中做 出有效、快速的选择。
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化学软件的分类
• • • • • • • · 化学综合软件 · 化合物结构绘制 · 图谱分析 · 化学工程 · 化学化工计算 · 分子模型 · 化学教育
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分子绘制，模拟与计算软件 ◆质谱软件 ◆ 化学贴图软件 ◆化学数据库 ◆ 层析软件 ◆生物化学 ◆ 材料科学 ◆普通，有机，合成和分析化学软件
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分子绘制，模拟与计算 （Molecular modelling ，drawing）
• Alchem2000 v.2.0 Tripos公司开发的分子三维结构模 拟与计算软件。 • ChemOffice 2002 化学家桌面办公软件，分子结构绘制 ，模拟，数据库管理及搜索引擎等。 • Chemistry 4-D Draw Standard & Pro 分子结构(4D)绘 制软件。 • MolSuite2000 分子三维结构模拟，物理性质计算，统计 学分析，数据库开发及管理。 • Molecular Analysis Pro 研究分子生物活性和化学结构 及物理性质之间的关系。 • ChemSite 三维分子模拟程序，模拟有机和生物分子的 动力学行为。
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• ChemSite Pro 除了ChemSite 的全部功能外，还 增加了晶体创建功能，包括离子型、金属、共价 型和分子型晶体等。 • Molecular Modeling Pro 一个先进的分子模拟程 序。 • ChemDraw 6.0 化学结构和化学贴图绘制，结构 核磁位移分析等。 • Chem3D 6.0 分子3D结构模拟和计算软件。 • ChemSketch 5.0 化学画图用软件包，可用于画 化学结构、反应和图形。也可用于设计与化学相 关的报告和演讲材料。 • ISIS/Draw 2.4 一个智能的化学绘图软件包。
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层析软件 （Chromatography Software）
• CESARTM 毛细管电泳模拟与优化应用软件。 • Chromatography EquationsTM 色谱计算软件，包括气相 色谱、液相色谱和离子色谱。 • ChromViewTM 把GC和GC-MS高分辨率图片数据输入 到其它 Windows 应用程序,如：MS Word，Excel，或 Powerpoint。 • Gas Chromatography Simulation & Optimization Software 气相色谱模拟和优化软件。 • GC and GCMS File TranslatorTM 气相色谱和气质联用 色谱文件转换软件。 • GC and GCMS File TranslatorTM Professional Version 气相色谱和气质联用色谱文件转换专业版。 • HPLC Calculations Assistant & Reference Tools 高效液 相色谱计算助手和相关工具。 • HPLC OptimizationTM 高效液相色谱优化软件，用于优 Exit 化HPLC条件，如 isocrate溶剂和梯度洗脱。
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• 2、学会一些基本的作图方法和作图技巧， 进行分子的电子结构与相关性质的计算。
• 3、综合应用上述软件，进行简单的分子设 计及化学反应机理分析。 • 4、学会利用国际互联网，对不断新推出的 国内外化学软件进行跟进并进行知识更新 ；善于利用互联网的一切化学网络资源。
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第一章 常用化学软件介绍
• Adhesive Chemicals and Compounding Ingredients • Chemical Manufacturers Electronic Directory of Trade Name Products • Fillers, Extenders, and Diluents Electronic Handbook • Food Packaging Chemicals and Materials • Green Chemicals Electronic Handbook • Industrial Chemical Additives Electronic Handbook • Industrial Surfactants Electronic Handbook • Specialty Chemicals Electronic Source Book • Cosmetics & Personal Care Additives Electronic Handbook • Food Additives Electronic Handbook • Paints & Coatings Raw Materials Electronic Handbook • Pharmaceutical Additives Electronic Handbook • Plastic and Rubber Additives Electronic Handbook
• （二）目的要求 • 1、重点掌握origin 、chemwindow、 chemsketch、chemdraw等常用化学图文 处理软件的使用技术
• 2.能灵活绘制化学及其它相关学科论文所需 要的各种类型的化学分子式、分子图、反 应式、轨道图、能级图、实验装置图、化 学工艺流程图等；会灵活应用这些软件进 行科学准确的作图，合理的分析和处理实 验数据。