生物无机化学part-1

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《生物无机化学》的部分杂志
Bioinorganic Chemistry J. of Inorganic Biochemistry J. of Biological Inorganic Chemistry Biological Trace Elements Research Curr Opinion in Biological Chemistry
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Essential Elements in Essential Elements in Organisms
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Percentage Composition of Selected Elements in the Human Body
Element
Oxygen Carbon
Percentage (by weight)
9
研究内容、研究方法、基本概念和基本思想
学化学的人进入生物领域时,先要体会几个指导思想: 首先要体会由没有生命的所谓 in vitro 的化学向有 生命参与的所谓 in vivo 的化学这一转变。 其次要体会由一种简单的、无活性的配合物向复杂 的、有活性的配合物的飞跃。 另外,还不能忽视。由一般化学处理的封闭的或部 分封闭的、背景单一的反应体系到开放的、有特殊 背景的生物反应体系的过渡等。不但要随时注意到 这些差异,而且要通过个别事例了解这些差别的由 来。
生物无机化学 Bioinorganic Chemistry
Lecturer:
周再春 Ph.D
E-mail: zhouzaichun@hnust.edu.cn
湖南科技大学大学化学化工学院 理论有机化学与功能分子教育部重点实验室
1
课程内容
第 1章 第 2章 第 3章 第 4章 第 5章 第 6章 第 7章 第 8章 生物无机化学中的基本概念和原理 生物无机化学的研究方法 生物体内金属离子的选择、摄取和调控 金属离子与生物大分子的结合与作用 金属蛋白和金属酶 细胞毒性和化学治疗 仿生固氮 生物无机化学的研究前沿课题
论未来我国生物无机化学的发展方向,生物无机 化学研究方向紧跟时代步伐,不断深入和调整。
Bioinorganic Chemistry Area:
A Multidisciplinary Research Area
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生物无机化学的基本任务
1. 生物机体中固有的无机元素,特别是生物金属 元素在生命体内的分布、形态、代谢规律以及 它们的生物学功能的研究。 2. 环境中的外来金属离子通过不同途径进入生命 体后的运输、分布、形态、代谢以及它们是如 何参与并影响生命过程的研究。
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构建和掌握化学知识的基本方法
化学知识的积累和构造
感性认识 现象 反应
物质
理性认识 性质 结构
化学知识的掌握和应用
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研究内容、研究方法、基本概念和基本思想
目前生物无机化学的研究工作绝大多数是点上的工作。但是 实际上,这些点之间有许多共性。怎样把握个性中的共性, 首先还是需要无机化学和生物化学等的基本知识。 例如,有许多促进水解的酶都含有锌离子或需要锌离子,而 且常常是酶蛋白中的组氨酸等和锌配位,又常常形成五配位 的配合物等等。 要想抓住共性,先要了解 Zn2+ 的配位趋向、易与 Zn2+ 结合 的氨基酸是什么, Zn2+ 的配合物立体结构是什么样的, Zn2+ 的基本性质 (有无传递电子能力、极化性大小、软硬 度等)又是什么。有了这些基本知识,当你遇到个别问题时, 就可以探索与它有关系的、类似的化合物了。
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教材存在的问题及学习注意事项
目前国内外出版的生物无机化学教材都缺乏 系统性和概括性。这两个问题不是在短期内 能解决的。 本课程的学习中,应注意: (1) 以研究生物体内有无机元素参与的有生物 活性的化合物的结构-性质-活性关系为主要 线索; (2) 选择有典型性的,各有特点的若干内容。
53.6 16.0
Element
Silicon, Magnesium Iron, Fluorine
Percentage (by weight)
0.04 0.005
Hydrogen
Nitrogen Sodium, potassium, sulfur Chlorine
13Fra Baidu bibliotek4
2.4 0.1 0.09
Zinc
这些事件标志着生物无机化学作为一个独立学科的建立.。
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国际生物无机化学会议(ICBIC)简介
ICBIC― ICBIC―0 ICBIC―1 ICBIC―2 ICBIC―3 ICBIC―4 ICBIC―5 ICBIC―6 1970年 1976年 1983年 1985年 1987年 1989年 1991年 1993年 美国 英国 意大利 葡萄牙 荷兰 美国 英国 美国 无机化学与模型研究方法 无机化学和生物交叉地带发展
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生物无机化学的特点
一是做这方面研究的人来自生物学、无机化学、医学科 学、农业科学等各个领域,对这门尚未定型的学科有不 同的见解与思路,使初学者感到只要涉及生物体甚至生 态环境中的各种无机元素的问题都是生物无机化学问题。 这样就把传统上本属流行病学、营养学、土壤化学、水 化学等方面的一部分内容都划入生物无机化学之中; 另一个特点是目前的研究工作多属点上的工作。比如, 载氧配合物、细胞色素、少数几种金属酶等正吸引着大 量科学家的注意,研究工作虽然很深入,但是很少把这 些点上的工作总结成为生物无机化学的整体学科体系。
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生物无机化学发展经历
1970 首届国际生物无机化学学术讨论会(U.S.Virginia) 《生物无机化学》(Bioinorganic Chemistry)论文集 1971 英国科学家D.R.Williams的专著《生命金属》 (The Metal of Life)出版 1971 学术期刊Bioinorganic Chemistry在美国问世 (1979年更名为Journal of Bioinorganic Chemistry)
ISABC―5 1999年 希腊
地中海贫血
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ISABC―6 2001年 英国 ISABC―7 2003年 墨西哥 ISABC―8 2004年 香港 小分子修饰使蛋白 酶功能改变和关闭 ISABC―9 2006年 阿根廷
国内定期召开全国生物无机化学学术讨论会,
2003年召开全国生物无机化学咨询会议,共同讨
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参考书
《生物无机化学》 杨频 高飞编著
科学出版社 2002年4月第一版 《Bioinorganic Chemistry——A short course》 Rosette M.Roat-Malone
《生物无机化学原理》
[美]S.J.Lippard and J.M.Berg著 席振峰 姚光庆 项斯芬 任宏伟译 北京大学出版社 2000年6月 第一版 《生物无机化学导论》计亮年 莫庭焕 中山大学出版社
金属识别、储存、输送和组装 固氮酶的分子结构以及自然界 N2转变为NH3的功能及其机理
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国际生物无机化学会议(ICBIC)简介
ICBIC―7 ICBIC―8 ICBIC―9 1995年 德国 金属离子对基因调节影响 1997年 日本 丙烯腈水合酶合成丙烯酰胺 1999年 美国
ICBIC―10 2001年 意大利 中枢神经系统的生物无机化学 ICBIC―11 2003年 澳大利亚 金属离子在细胞的交通图,
以及许 多交通干线的划分和金属离子的走向
ICBIC―12 2005年 美国 ICBIC―13 2007年 欧洲 ICBIC―14 2009年 中国
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国际应用生物无机化学 学术讨论会(ISABC)简介
ISABC―1 1990年 武汉 金属药物和抗癌药
ISABC―2 1992年 广州 生物矿化和生物材料 ISABC―3 1994年 澳大利亚 利用生物电子转移 设计制作生物传感器 ISABC―4 1997年 南非 环境生物无机化学
1.Essential Chemical Elements in Biological systems (1) Bulk elements(宏量元素):6 elements H、C、N、O、P、S; (2) Macrominerals and ions(矿物质离子): Na、K、Mg、Ca、Cl-、PO43-、SO42-; (3) Trace elements(微量元素): Fe、Zn、Cu; (4) Ultratrace elements(痕量元素): nonmetals: F、I、Se、Si、As、B; Metals:Mn、Mo、Co、Cr、V、Ni、Cd、 Sn、Pb、Li;
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CONTENTS
Chapter 1 The Basic Conceptions and Reasons of Bioinorganic Chemistry Chapter 2 The Research Methods of Bioinorganic Chemistry Chapter 3 The Choice, Extraction and Control of Metal Species in Biological Systems Chapter 4 The Binding and Acting in Between Metal Species and Bio-macromolecule Chapter 5 Metal Proteins and Metal Enzymes Chapter 6 Cell Toxicity and Chemical Treatments Chapter 7 The Enzyme Nitrogenase Chapter 8 The New Topics and Development Fields of Bioinorganic Chemistry
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研究内容、研究方法、基本概念和 基本思想
对一位学化学的人来说,往往注意的是各种各样物质 的组成和性质,而且都是没有生命活动时的情况。比 如,人们往往只把一种蛋白质都是由一定的氨基酸按 一定序列联接起来的化合物拿来研究,而不注意这种 蛋白质的生物活性是怎样产生的。 本来化学主要研究结构和性质的关系,但是若放在生 物体内来考虑,则应研究结构-性质-活性关系。 因此,我们研究的对象是有生物活性的物质。通过这 部分内容的学习先初略了解一下有生物活性的、含无 机元素的化合物大致包括哪些类,各有什么功能。
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研究内容、研究方法、基本概念和基本思想
必须了解研究生物无机化学的方法,否则就难以 体会那些观点和结果都是怎样得来的。 例如,某种元素是人体必需的,但是整个人体所 含的这种元素不过几毫克或者更少,我们怎样知 道它是人体必需的呢? 再如,一种酶的分子量高达几万,但一个分子中 只含有一个锌原子,我们怎样知道这个锌原子的 存在以及它在维持酶活性中所起的重要作用呢? 而且,象这样一个含有几百个氨基酸的酶,它的 结构是怎样确定的呢?
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教学安排与考评
第一和第二章教师讲授,从第三章开 始教师上课和同学讲解相结合。 每人准备一章内容,并制作ppt课件来 讲解,时间25~30min。 ppt的内容和讲解效果,作为考核成绩 的一部分。 期末考试每人写一篇论文(3~4千字)
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生物无机化学定义
生物无机化学是一门对处于生命环境中的金属离子 进行研究的学科。 研究在生命过程中起作用的生物金属与配体之间的 相互作用; 在分子、亚分子水平上测定、表征、阐明这些生物 化合物的结构、性能及其在生命体中的作用规律; 无机化学(特别是配位化学)、生物化学、医学临 床化学、营养化学、环境科学等学科相互渗透、相 互融合的产物。
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生物无机化学的发展前景和价值
1. 通过对生物无机化学问题和规律的研究探索有 助于进一步揭示生命的奥秘。 2. 生物无机化学规律的揭示及其成果将有助于改 善人类的生活环境,保护人类的健康,延长人 类的寿命,从而造福人类。
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Chapter 1
The Basic Conceptions and Reasons of Bioinorganic Chemistry
Copper, Bromine Selenium, Manganese, Arsenic, Nickel Lead, Cobalt
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