食用菌基因组学研究进展
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自然 界 的菌 物 有 １ ５ ０ 万 种 以 上 ，其 中大 型 真 菌 至
和数据库信息可知 ，除未公布序列信息 的香菇 、 杏鲍菇和黑木耳外雎 ，截 至 ２ ０ ｌ ６ 年ｌ ０ 月 ，已 完 成
３ ０ 种 食 药 用 菌 的 基 因组 测 序 ，包 括 伞 菌 目、多 孔
菌 目、牛 肝 菌 目 、非 褶 菌 目 、肉座 菌 目、硬 皮 马
勃 目 、银 耳 目及 块 菌 目中的 ２ ０ 余 科 。现 将 测序 名 录及 部 分数 据 信 息概 括 如表 １ 。
基 因 组 研 究 主 要 包 括 两 个 方 面 ： 以 全Fra Baidu bibliotek基
少有 １ ４ 万种 ；世界范 围内存在 的真菌约有 １ ０ 万 余 种 】 ，其 中食 药 用 菌 有 ２ ３ ０ ０ 余种Ｈ ；我 国约 有
注 的领 域 。
常 生 活 在 落 叶 下腐 殖 质 富集 的环 境 中 ，并 具 有 强 大 的竞 争 力 ，已 有 试 验证 实 双 孢 蘑 菇 具 有 分 解 植
通 讯 作 者 ：吴 素 蕊
３ ３—
一
注 ：表 中数据及相关 信息均来 自： Ｔ Ｚ Ｎ Ｃ ＢＩ 官网 （ ｈ ｔ ｔ ｐ ： ／ ／ ｗｗｗ． ｎ ｃ ｂ ｉ ． ｎ ｌ ｍ． ｎ ｉ ｈ ． ｇ ｏ ｖ ／ ）。
抗 真菌的降解¨ 。虽 然 已有 研 究 表 明食 用 菌能 合 成大 量 的酶 参与木 质纤 维素 的降解ｎ ，但参 与这 一 过 程 的 基 因 尚不 清 楚 ，因此 这 成 为 了研 究 者 们 关
纤 维 素 、半 纤 维 素 和木 质 素 ，且 大 都 不 能 被 食 用
解食 用菌 的遗 传本 质 ，食用 菌育 种 、生产 及应 用 ，开 拓 了更 为 广 阔 的前 景 阻 ” 。
１ 食用 菌基 因组 测序概 况
过 去 ，因染 色 体 小 ，以细 胞 学 为 基 础 对 食 用
的应用为食用菌遗传学研究带来 了曙光¨ 。组学
数 据 在 提 供 遗传 学 研 究 基 础 的 同时 ，也 为食 用 菌 生 理 研 究 提 供 了研 究 方 略 引 。特 别 是 基 因组 测 序
对 全 面 了解 一个 物种 的分 子 进 化 、基 因组 成 和 基
因调 控 等 有着 极 其 重 要 的意 义 ¨ 引 。根 据 文 献 报 道 “ 食 用 菌 ”俗 称 “ 蘑 菇 ” ，人 类 对 其 认 识 和 利用 均 有 着 悠 久 的历 史 ，我 国是 认 识 和 利 用食 用 菌最 早 的 国家 ，其 历 史可 追 溯 到公元 前 ４ ０ ０ ０ 年 到 公元 前 ３ ０ ０ ０ 年 的仰 韶 文 化 时期 ¨ 】 。据估 测 ， 目前
Ｖｅ ｇ ｅ ｔ ａ ｂ ｌ ｅ ｓ ２ ０１ ７ ． ３
文 献 综 述
食用菌基 因组学研 究进 展
余金凤 ，周 汐 ，赵春燕 ，陈正启 ，吴素蕊
（ 中华全国供销合作总社 昆明食 用菌研究所 ，云南 昆明 ６ ５ ０ ２ ２ ３）
摘 要 ：统 计 了近 年 来 食 用 菌 基 因 组 测序 的 情
的更 为 广 阔 的前 景 。
植物性蛋 白和营养要 素来源之一 ，包含了担子 菌 和子囊菌２ 门、３ ０ 余科 、１ ３ ０ 余属 的近１ ０ ０ ０ 种 】 。
近 年 来 ， 因其 在保 健 药用 方 面具 有 较 高 的价 值 而 被 视 为２ １ 世 纪 的一 项新 兴 朝 阳产 业 】 。 随 着 高 等 真 菌 分 子 生 物 学 的 发 展 和基 因工 程 技 术 应 用 的成 功 【 １ 叭 ，许 多 科 学 家 开 始 关 注食 用 菌
菌直接吸收利用 ，需要进一步降解 ，其 中木质
素 是 最 顽 强 的 部 分 ，常作 为 植 物 的第 一 道 防 线 抵
基金项 目：云南省科技厅对外科技合作计划 国际科技合作项 目 （ ２ ０ １ ５ Ｉ Ａ ０ ０ ４ ）；云南省科技厅科技创新人才计划 （ ２ ０ ｏ ８ Ｏ Ｃ ０ ｏ ８ ）。
菌物 １ ． ６ 万 种 ，其 中食 用 菌近 １ ０ ０ ０ 种 】 ，被 广 泛 食 用 的约 ２ ０ ０ 种 】 。食 用 菌 是人 们 日常 生 活 的重 要
因 组 测 序 为 目标 的 结 构 基 因 组 学 （Ｓ ｔ ｒ ｕ ｃ ｔ ｕ ｒ ａ ｌ ｇ ｅ ｎ ｏ ｍｉ ｃ ｓ ）和 以基 因功 能 鉴 定为 目标 的功 能 基 因 组学 （ ｆ ｕ ｎ ｃ ｔ ｉ ｏ ｎ ａ ｌ ｇ ｅ ｎ ｏ ｍｉ ｃ ｓ ） 。结 构 基 因组 学 仅仅 是 获得 测 序 数 据 和 序 列 结 构 ，而 功 能 基 因组 学 研 究 才 更 具 意 义 ，必 将 为 食 用 菌 育 种 和生 产 开 拓 新
基 因工 程 的研 究 ，尤 其 近 几 年 ，无 论 是在 理 论 上 还 是应 用 上均 已取 得 了一 些新 突 破 ，这 为 深 入 了
２ 与 食用 菌木 质纤 维素 代谢 相关 的基 因研 究
已知 很 多 种 食 用 菌 可 生 活 在 腐 殖 质 丰 富 的环 境 中 ，其 营养 物 为 较 复 杂 的化 合 物 ，尤 其 木 质 纤 维 素 是 多 数 食 用 菌 生 长发 育 的 主要 营养 来 源 ｎ 刚 。 木 质 纤 维 素 是 植 物 细 胞 壁 的重 要 组 成 成 分 ，包 括
况 ，并 对 相 关研 究成 果 进 行 了综 述 ，主 要包 括 食
菌进行传统遗传学研究一直相对 困难Ｉ 。分子生
物 学 的发 展 、组 学技 术 的不 断 完 善 、生 物 信 息 学
用 菌 木 质 纤 维 素代 谢 、 活 性成 分 合 成 、人 工 栽培
的基 因研 究及 食用 菌基 因组 学 的未 来 。 关 键 词 ： 食 用 菌 ；基 因 组 测 序 ；木 质 纤 维 素 ；活性物 质 ；人工栽 培
和数据库信息可知 ，除未公布序列信息 的香菇 、 杏鲍菇和黑木耳外雎 ，截 至 ２ ０ ｌ ６ 年ｌ ０ 月 ，已 完 成
３ ０ 种 食 药 用 菌 的 基 因组 测 序 ，包 括 伞 菌 目、多 孔
菌 目、牛 肝 菌 目 、非 褶 菌 目 、肉座 菌 目、硬 皮 马
勃 目 、银 耳 目及 块 菌 目中的 ２ ０ 余 科 。现 将 测序 名 录及 部 分数 据 信 息概 括 如表 １ 。
基 因 组 研 究 主 要 包 括 两 个 方 面 ： 以 全Fra Baidu bibliotek基
少有 １ ４ 万种 ；世界范 围内存在 的真菌约有 １ ０ 万 余 种 】 ，其 中食 药 用 菌 有 ２ ３ ０ ０ 余种Ｈ ；我 国约 有
注 的领 域 。
常 生 活 在 落 叶 下腐 殖 质 富集 的环 境 中 ，并 具 有 强 大 的竞 争 力 ，已 有 试 验证 实 双 孢 蘑 菇 具 有 分 解 植
通 讯 作 者 ：吴 素 蕊
３ ３—
一
注 ：表 中数据及相关 信息均来 自： Ｔ Ｚ Ｎ Ｃ ＢＩ 官网 （ ｈ ｔ ｔ ｐ ： ／ ／ ｗｗｗ． ｎ ｃ ｂ ｉ ． ｎ ｌ ｍ． ｎ ｉ ｈ ． ｇ ｏ ｖ ／ ）。
抗 真菌的降解¨ 。虽 然 已有 研 究 表 明食 用 菌能 合 成大 量 的酶 参与木 质纤 维素 的降解ｎ ，但参 与这 一 过 程 的 基 因 尚不 清 楚 ，因此 这 成 为 了研 究 者 们 关
纤 维 素 、半 纤 维 素 和木 质 素 ，且 大 都 不 能 被 食 用
解食 用菌 的遗 传本 质 ，食用 菌育 种 、生产 及应 用 ，开 拓 了更 为 广 阔 的前 景 阻 ” 。
１ 食用 菌基 因组 测序概 况
过 去 ，因染 色 体 小 ，以细 胞 学 为 基 础 对 食 用
的应用为食用菌遗传学研究带来 了曙光¨ 。组学
数 据 在 提 供 遗传 学 研 究 基 础 的 同时 ，也 为食 用 菌 生 理 研 究 提 供 了研 究 方 略 引 。特 别 是 基 因组 测 序
对 全 面 了解 一个 物种 的分 子 进 化 、基 因组 成 和 基
因调 控 等 有着 极 其 重 要 的意 义 ¨ 引 。根 据 文 献 报 道 “ 食 用 菌 ”俗 称 “ 蘑 菇 ” ，人 类 对 其 认 识 和 利用 均 有 着 悠 久 的历 史 ，我 国是 认 识 和 利 用食 用 菌最 早 的 国家 ，其 历 史可 追 溯 到公元 前 ４ ０ ０ ０ 年 到 公元 前 ３ ０ ０ ０ 年 的仰 韶 文 化 时期 ¨ 】 。据估 测 ， 目前
Ｖｅ ｇ ｅ ｔ ａ ｂ ｌ ｅ ｓ ２ ０１ ７ ． ３
文 献 综 述
食用菌基 因组学研 究进 展
余金凤 ，周 汐 ，赵春燕 ，陈正启 ，吴素蕊
（ 中华全国供销合作总社 昆明食 用菌研究所 ，云南 昆明 ６ ５ ０ ２ ２ ３）
摘 要 ：统 计 了近 年 来 食 用 菌 基 因 组 测序 的 情
的更 为 广 阔 的前 景 。
植物性蛋 白和营养要 素来源之一 ，包含了担子 菌 和子囊菌２ 门、３ ０ 余科 、１ ３ ０ 余属 的近１ ０ ０ ０ 种 】 。
近 年 来 ， 因其 在保 健 药用 方 面具 有 较 高 的价 值 而 被 视 为２ １ 世 纪 的一 项新 兴 朝 阳产 业 】 。 随 着 高 等 真 菌 分 子 生 物 学 的 发 展 和基 因工 程 技 术 应 用 的成 功 【 １ 叭 ，许 多 科 学 家 开 始 关 注食 用 菌
菌直接吸收利用 ，需要进一步降解 ，其 中木质
素 是 最 顽 强 的 部 分 ，常作 为 植 物 的第 一 道 防 线 抵
基金项 目：云南省科技厅对外科技合作计划 国际科技合作项 目 （ ２ ０ １ ５ Ｉ Ａ ０ ０ ４ ）；云南省科技厅科技创新人才计划 （ ２ ０ ｏ ８ Ｏ Ｃ ０ ｏ ８ ）。
菌物 １ ． ６ 万 种 ，其 中食 用 菌近 １ ０ ０ ０ 种 】 ，被 广 泛 食 用 的约 ２ ０ ０ 种 】 。食 用 菌 是人 们 日常 生 活 的重 要
因 组 测 序 为 目标 的 结 构 基 因 组 学 （Ｓ ｔ ｒ ｕ ｃ ｔ ｕ ｒ ａ ｌ ｇ ｅ ｎ ｏ ｍｉ ｃ ｓ ）和 以基 因功 能 鉴 定为 目标 的功 能 基 因 组学 （ ｆ ｕ ｎ ｃ ｔ ｉ ｏ ｎ ａ ｌ ｇ ｅ ｎ ｏ ｍｉ ｃ ｓ ） 。结 构 基 因组 学 仅仅 是 获得 测 序 数 据 和 序 列 结 构 ，而 功 能 基 因组 学 研 究 才 更 具 意 义 ，必 将 为 食 用 菌 育 种 和生 产 开 拓 新
基 因工 程 的研 究 ，尤 其 近 几 年 ，无 论 是在 理 论 上 还 是应 用 上均 已取 得 了一 些新 突 破 ，这 为 深 入 了
２ 与 食用 菌木 质纤 维素 代谢 相关 的基 因研 究
已知 很 多 种 食 用 菌 可 生 活 在 腐 殖 质 丰 富 的环 境 中 ，其 营养 物 为 较 复 杂 的化 合 物 ，尤 其 木 质 纤 维 素 是 多 数 食 用 菌 生 长发 育 的 主要 营养 来 源 ｎ 刚 。 木 质 纤 维 素 是 植 物 细 胞 壁 的重 要 组 成 成 分 ，包 括
况 ，并 对 相 关研 究成 果 进 行 了综 述 ，主 要包 括 食
菌进行传统遗传学研究一直相对 困难Ｉ 。分子生
物 学 的发 展 、组 学技 术 的不 断 完 善 、生 物 信 息 学
用 菌 木 质 纤 维 素代 谢 、 活 性成 分 合 成 、人 工 栽培
的基 因研 究及 食用 菌基 因组 学 的未 来 。 关 键 词 ： 食 用 菌 ；基 因 组 测 序 ；木 质 纤 维 素 ；活性物 质 ；人工栽 培