GST pull-down实验技术
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transferase) 融合,融合蛋白通过GST与固相化在载体
上的GTH(Glutathione)亲和结合。因此,当与融合 蛋白有相互作用的蛋白通过层析柱时或与此固相复合 物混合时就可被吸附而分离。
Western Blot
GST pull-down原理:
基本原理:
假定A蛋白和B蛋白可能有相互作用,将纯化的融合GST 标签的A蛋白和纯化的B蛋白以及能特异结合GST的 Sephrose 4B beads 孵育一定时间,充分洗涤未结合的蛋 白,煮沸beads进行SDS-PAGE电泳,通过Western blotting 检测,可以看见GST-A和B分别对应的条带,表明A和B因 相互作用而被GST-A pull-down;而GST对照组始终仅有 一个条带。
7、12000 rpm/min,4℃离心10min,将上清转移至新的离心管, 加DTT至终浓度1mmol/L。
Western Blot
1.2 GST-A融合蛋白的纯化
1、 在新鲜制备的裂解液上清中加入适量体积的50%Glutathione
Sepharose 4B,4℃缓慢摇动,反应30~60min;
4℃缓慢摇动,反应30~60min;
2、 3000 rpm/min,4℃离心5min,弃上清。该Ni-NTA珠子上结 合了His-B融合蛋白。
3、在管中加入预冷的200微升Wash Buffer(沿壁加入,小心勿 剧烈,以免打断珠子与蛋白的连接),轻晃悬浮珠子,将珠子
洗涤一次, 3000 rpm/min,4℃离心3min,弃上清;
4、重复步骤3三次(最后一次以小枪头吸净珠子表面液体,吸 净但不吸走珠子),即获得结合有GST-A融合蛋白的Sepharose;
Western Blot
1.2 GST-A融合蛋白的纯化
5、如果用于检测,在Sepharose 加入15~20微升1×蛋白电泳上
样缓冲液,于沸水中煮5~10min。
4、加入预冷的200微升缓冲液对Sepharose进行洗涤(沿壁加入, 不要直接冲击Sepharose,随后轻柔晃动,使Sepharose重悬即可;
Western Blot
3. 体外蛋白的结合
5、3000 rpm/min,4℃离心3min,弃上清(注意不要扰动底层
的Sepharose);
GST pull-down 实验技术
主讲:段志强
Western Blot
GST pull-down原理 GST pull-down实验流程
Western Blot
GST pull-down原理:
GST pull down 是一种在体外研究蛋白质相互作用的
方法。
原理:
利用DNA重组技术将已知蛋白与GST (Glutathione S
4、重复步骤3三次(最后一次以小枪头吸净珠子表面液体,吸 净但不吸走珠子),即获得结合有His融合蛋白的Ni-NTA;
Western Blot
1.1.2 (His)-B融合蛋白的纯化
5、加入适量体积Elution Buffer,不必吹打,晃动洗脱蛋白。
3000 rpm/min,4℃离心5mຫໍສະໝຸດ Baidun,吸净上清,His-B融合蛋白即在
(如需要该步沉淀能保存在-80℃);
Western Blot
1.1 GST-A融合蛋白的表达
5、重悬沉淀:按10ml菌液沉淀用1ml PBS重悬,并加入PMSF;
6、冰上超声沉淀重悬液:5S 间隔5S 至悬液透明(一般可容性
蛋白:10ml菌液沉淀用1ml PBS重悬液超声6~9min可透明);
的真核表达载体上,进行细胞转染;
2、转染后36~48h,取出细胞,用预冷PBS洗2遍; 3、加入适量体积1×RIPA(含PMSF),于冰上或4℃裂解细胞 10~30min;
4、 12000 rpm/min,4℃离心5min,取上清保存在-80℃或进行
下一步实验。
Western Blot
3. 体外蛋白的结合
1、 将结合有GST-A融合蛋白的Sepharose 4B悬浮在适量体积缓
冲液中,加入20~30微升含有B蛋白的溶液(原核表达或真核表
达产物),同时采用结合有GST蛋白的Sepharose 作为阴性对照;
2、 在水平摇床上4℃晃动4~8h; 3、3000 rpm/min,4℃离心3min,弃上清(注意不要扰动底层 的Sepharose);
2、将过夜培养物按1:100比例接入200ml LB(Amp+) ,220 rpm, 30℃培养至OD600=0.4-0.6;
3、以预实验确定的最佳IPTG浓度、时间和温度诱导表达靶蛋 白(IPTG 0.5mM,20℃,200 rpm培养10~16小时);
4、诱导适当时间后,4℃,5000 rpm/min离心10min后弃上清
6、12000 rpm/min离心5min,取上清做SDS-PAGE和WB检测。
Western Blot
2. B蛋白的制备
B蛋白的来源:
1.1 (His)-B融合蛋白的原核表达与纯化
1.2 (HA/Myc/Flag)-B融合蛋白的真核表达
Western Blot
1.1.1 (His)-B融合蛋白的原核表达
1、活化冻存菌种His和His-B:按1: 50比例将表达蛋白的冻存菌
液加入5ml LB(Amp+),37℃,200 rpm培养过夜;
2、将过夜培养物按1:100比例接入200ml LB(Amp+) ,220rpm, 30℃培养至OD600=0.4-0.6;
3、以预实验确定的最佳IPTG浓度、时间和温度诱导表达靶蛋 白(IPTG 0.5mM,28℃,200 rpm培养10~16小时);
Western Blot
1. GST-A融合蛋白的制备
1.1 GST-A融合蛋白的表达
1.2 GST-A融合蛋白的纯化
Western Blot
1.1 GST-A融合蛋白的表达
1、活化冻存菌种GST和GST-A:按1: 50比例将表达蛋白的冻存
菌液加入5ml LB(Amp+),37℃,200 rpm培养过夜;
蛋白:10ml菌液沉淀用1ml PBS重悬液超声6~9min可透明);
7、12000 rpm/min,4℃离心10min,将上清转移至新的离心管, 加DTT至终浓度1mmol/L。
Western Blot
1.1.2 (His)-B融合蛋白的纯化
1、 在新鲜制备的裂解液上清中加入适量体积的Ni-NTA珠子,
4、诱导适当时间后,4℃,5000 rpm/min离心10min后弃上清
(如需要该步沉淀能保存在-80℃);
Western Blot
1.1.1 (His)-B融合蛋白的原核表达
5、重悬沉淀:按10ml菌液沉淀用1ml PBS重悬,并加入PMSF;
6、冰上超声沉淀重悬液:5S 间隔5S 至悬液透明(一般可溶性
Western Blot
GST pull-down 示意图
Western Blot
GST pull-down应用
用于验证两个已知蛋白的相互作用 筛选与已知蛋白相互作用的未知蛋白
Western Blot
GST pull-down流程
GST-A融合蛋白的制备
• B蛋白的制备
• 体外蛋白的结合 • Western blot检测
上清中;
6、如果用于检测,取10微升样品,加入10微升1×蛋白电泳上 样缓冲液,于沸水中煮5~10min;
7、12000 rpm/min离心5min,取上清做SDS-PAGE和WB检测。
Western Blot
1.2 (HA/Myc/Flag)-B融合蛋白的真核表达
1、将编码B蛋白的ORF克隆到编码标签蛋白(如HA/Myc/Flag)
6、重复步骤5三次;
7、吸干Sepharose上面的液体后,加入20~30微升1 ×蛋白电泳
上样缓冲液,沸水浴4min,冻存于-20℃备用;
8、做SDS-PAGE和Western blot检测另一个蛋白。
Western Blot
4. Western blot检测
谢谢大家!
2、 3000 rpm/min,4℃离心3min,弃上清。该Sepharose上结合 了GST-A融合蛋白。
3、在管中加入预冷的200微升PBS(沿壁加入,小心勿剧烈,以 免打断珠子与蛋白的连接),轻晃悬浮珠子,将Sepharose洗涤
一次, 3000 rpm/min,4℃离心3min,弃上清;