生物技术综合大实验
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2013-2014学年生命科学综合大实验
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GFP分离与纯化
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1.文献综述
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绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)是由238个氨基酸组成,分子量是,最初是从维多利亚多管发光水母(Aequorea victoria)中分离出来的,在蓝光照射下会发出绿色荧光。来源于水母的野生型GFP在395nm和475nm分别有主要和次要的激发峰,它的发射峰在509nm,处于可见光谱的绿色区域,来源于海肾的GFP只在498nm有单个激发峰。
GFP是典型的β桶形结构,包含β折叠α和螺旋,将荧光基团包含在其中。严密的桶形结构保护着荧光基团,防止它被周围环境淬灭,内部面向桶形的侧链诱Ser65-Tyr66-Gly67三肽环化,导致荧光基团形成。
北京时间10月8日下午5点45分,2008年诺贝尔化学奖揭晓,三位美国科学家,美国Woods Hole海洋生物学实验室的Osamu
Shimomura(下村修)、哥伦比亚大学的Martin Chalfie和加州大学圣地亚哥分校的Roger (钱永健)因发现并发展了绿色荧光蛋白(GFP)而获得该奖项。
下修村首次从Aequorea victoria中分离出GFP。他发现该蛋白在紫外线下会发出明亮的绿光。Martin Chalfie证明了GFP作为多种生物学现象的发光遗传标记的价值。在最初的一项实验中,他用GFP使秀丽隐杆线虫的6个单独细胞有了颜色。钱永健的主要成就在于让人们理解了GFP发出荧光的机制。同时,他拓展出绿色之外的可用于标记的其他颜色,从而使科学家能够对各种蛋白质和细胞施以不同的色彩。这一切,令在同一时间跟踪多个不同的生物学过程成为了现实。
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2.实验器材
实验材料:
含GFP融合质粒,Top10菌株
实验试剂:
质粒提取:溶液Ⅰ:50mM 葡萄糖/10mM EDTA /25mM Tris-HCl,pH=;溶液Ⅱ: NaOH/1% SDS;溶液Ⅲ:3M醋酸钾/2M 醋酸;无水乙醇,75%乙醇,TE Buffer;
转化:预冷 CaCl2,LB培养基,氨苄青霉素,阿拉伯糖;
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GFP提取:液氮,Lysis Buffer,饱和(NH4)2SO4溶液,溶菌酶;
疏水作用层析柱材:苯基琼脂糖凝胶CL-4B;
离子交换柱层析柱材:DEAE+纤维素,
Start Buffer(A液20mM Tris-HCl,(透析液))
Elution buffer(B液20mM Tris-HCl,1M NaCl,SDS-PAGE电泳:PEG10000,Loading Buffer,溴酚蓝,丙烯酰胺,Tris,SDS,过硫酸铵,TEMED,Gly,SDS,甘油,β-巯基乙醇,溴酚蓝,甲醇,考马斯亮蓝,乙酸等
实验仪器
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高速冷冻离心机,移液枪,超声波破碎仪,梯度混合器,恒流泵,层析柱,色谱仪,自动记录仪,SDS-PAGE电泳装置。
3.实验方法
质粒提取
1.取菌液,12000rpm离心1min,弃上清液;
2.加100μL溶液Ⅰ,充分悬浮;
3.加200μL溶液Ⅱ,温和混匀,室温5min;
4.加150μL溶液Ⅲ,混匀,冰浴5min;
离心8min,将上清加入一新的 EP管中;
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6.加800μL无水乙醇至上清液中,混匀,-20℃放置10min,12000rpm 离心8min,弃上清;
%乙醇洗DNA一次,离心弃上清;
8.在超净台中吹干DNA(一般吹5-10min即可);
9.加40μL TE Buffer溶解DNA,4℃备用。
感受态细胞的制备以及转化
1.取 Top10菌液,在4℃ 4000rpm离心10min,弃上清;
2.加200μL预冷的 CaCl2悬浮沉淀(无菌操作),冰浴15min后4℃4000rpm离心10min,弃上清;
3.加200μL预冷的 CaCl2悬浮沉淀(无菌操作),4℃备用;
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4.将1μL质粒和感受态细胞混合,冰浴30min;
℃热激90s;
6.立即放在冰上3-5min;
7.加入800μL LB液体培养基,37℃ 150rpm培养60min(使Top10
恢复正常生长);
8.取200μL菌液涂布在LB(Amp 100ng/ml,阿拉伯糖4mg/ml)培养基上,37℃培养过夜。
扩大培养
1.取含GFP质粒的Top10平板并挑取单克隆(在紫外灯照射下有绿色荧光的菌落);
2.将挑取的单菌落接种于试管中(含4mL的LB液体培养基,100ng/ml 的Amp和4mg/ml的阿拉伯糖)37℃,200rpm振荡培养至对数生长期(约3-4h);
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3.将上述摇好的菌液,按1:100转接至250mL LB液中(Amp工作浓度 100ng/ml,阿拉伯糖工作浓度2mg/ml),37℃,200rpm培养过夜。细胞破碎
1.将培养好的细菌3000g离心10min,紫外灯观察弃上清,沉淀用液氮冻融;
2.用30mL Lysis Buffer(50mM Tris-HCl ,1mM EDTA)悬浮沉淀;
3.向悬浮液中加15mg溶菌酶,混匀后室温溶解10min;
功率下,超声处理10min;
5.将破碎液9000g离心15min,紫外灯观察,留上清备用;
6.选取合适的浓度破碎(NH4)2SO4沉淀GFP;一般(NH4)2SO4饱和度为30%时,杂蛋白的沉淀量最大,饱和度达到70%时GFP沉淀量达最大附:(NH4)2SO4浓度与含量表,体积为10ml;