下一代测序技术在分子诊断中的应用
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Ap p l i c a t i on o f n e x t . - g e n e r a t i o n s e q u e n c i n g t e c h n o l o g i e s i n mo l e c u l a r d i a g n o s t i c s
分子诊 断与治疗杂志
2 0 1 3年 5月
第 5卷
第 3期
J Mo l D i a g n T h e r , Ma y 2 0 1 3 , V o 1 . 5 No . 3
・
述
评 ・
下一代测序技术在分子诊断中的应用
魏 军 赵测序是 破译人类 疾病 的一种强 大技术 , 尤其在 癌症方 面。 飞速发展 的下一代测 序
【 K E Y WORD S 】 Ne x t — g e n e r a t i o n s e q u e n c i n g ; G e n o mi c s ; Mo l e c u l a r d i a g n o s t i c s
近年 来 , 下 一代 i 贝 0 序( n e x t . g e n e r a t i o n s e q u e n c i n g ,
W EI J u n。
Z HA OZ h i j u n ( L a b o r a t o r y Me d i c i n e C e n t e r , G e n e r a l Ho s p i t a l o f Ni n g x i a Me d i c a l U n i v e r s i t y , Ni n g x i  ̄ , Y i n c h u a n 7 5 0 0 0 4 )
一
莫过 于 S a n g e r 测序 , 并 且 成为 了迄 今 为止 D NA测
N G S ) 技术迅猛发展 , 它的高通量测序技术 , 是对传统 测序技术 的革命性变革 … 。现有 的技术平台主要包
括 Ro c h e Ap p l i e d S c i e n c e [ 4 5 4 Ge n o me S e q u e n c e r F L X
,
[ A B S T R A CT ] D l NA s e q u e n c i n g i s a p o we r f u l a p p r o a c h f o r d e c o d i n g h u ma n d i s e a s e s , i n c l u d i n g c a n c e r s .
t h e h i g h - . t h r o u g h p u t , wh i c h a l l o ws U S t o o b t a i n he t wh o l e g e n o me s e q u e n c e ,a n d e n t i r e g e n o me i n f o r ma t i o n a b o u t t h o s e p a t i e ts n wh o a r e c l i n i c a l l y d i a g n o s e d . Ho we v e r ,t he b e n e i f t s o f f e r e d b y NGS t e c h n o l o g i e s c o me wi t h a n u mb e r o f c h a l l e n g e s ,wh i c h i s h o w t o ma k e t h i s t e c h n o l o g y b e c o me a c o n v e n t i o n a l me a n s i n t h e
c l i n i c a l d i a g n o s i s . T h i s a r t i c l e r e v i e ws t h e p r i n c i p l e o f a f e w t e c h n o l o g y p l a t f o r m, p o t e n t i a l a p p l i c a t i o n s a n d t h e c h a l l e n g e s o f NGS i n t h e c l i n i c a l d i a g n o s i s . ,
T h e r a p i d d e v e l o p me n t o f n e x t - - g e n e r a t i o n s e q u e n c i n g( NG S ) g r e a t l y r e d u c e t h e c o s t o f s e q u e n c i n g a n d r e a l i z e
( n e x t - . g e n e r a t i o n s e q u e n c i n g , NG S)极大 降低 了测序成本 , 并且实现 了高通量 , 这使我们可以获得整个 基 因组的序列 , 以及那些 临床上确诊病人 的全部基 因组信 息。 然 而下一代测序技术 带来诸多益处 的同时也 带来 了挑 战 , 那就是怎样使这个技术在临床诊断中成为常规 手段 。 本文就 目前 NGS的几大技术平 台原理 , 在 临床诊 断中的应 用 , 以及 目前 面临的挑战等进 行综 述。 【 关键词 】 下 一代 测序 ; 基 因组学 ; 分子诊断
分子诊 断与治疗杂志
2 0 1 3年 5月
第 5卷
第 3期
J Mo l D i a g n T h e r , Ma y 2 0 1 3 , V o 1 . 5 No . 3
・
述
评 ・
下一代测序技术在分子诊断中的应用
魏 军 赵测序是 破译人类 疾病 的一种强 大技术 , 尤其在 癌症方 面。 飞速发展 的下一代测 序
【 K E Y WORD S 】 Ne x t — g e n e r a t i o n s e q u e n c i n g ; G e n o mi c s ; Mo l e c u l a r d i a g n o s t i c s
近年 来 , 下 一代 i 贝 0 序( n e x t . g e n e r a t i o n s e q u e n c i n g ,
W EI J u n。
Z HA OZ h i j u n ( L a b o r a t o r y Me d i c i n e C e n t e r , G e n e r a l Ho s p i t a l o f Ni n g x i a Me d i c a l U n i v e r s i t y , Ni n g x i  ̄ , Y i n c h u a n 7 5 0 0 0 4 )
一
莫过 于 S a n g e r 测序 , 并 且 成为 了迄 今 为止 D NA测
N G S ) 技术迅猛发展 , 它的高通量测序技术 , 是对传统 测序技术 的革命性变革 … 。现有 的技术平台主要包
括 Ro c h e Ap p l i e d S c i e n c e [ 4 5 4 Ge n o me S e q u e n c e r F L X
,
[ A B S T R A CT ] D l NA s e q u e n c i n g i s a p o we r f u l a p p r o a c h f o r d e c o d i n g h u ma n d i s e a s e s , i n c l u d i n g c a n c e r s .
t h e h i g h - . t h r o u g h p u t , wh i c h a l l o ws U S t o o b t a i n he t wh o l e g e n o me s e q u e n c e ,a n d e n t i r e g e n o me i n f o r ma t i o n a b o u t t h o s e p a t i e ts n wh o a r e c l i n i c a l l y d i a g n o s e d . Ho we v e r ,t he b e n e i f t s o f f e r e d b y NGS t e c h n o l o g i e s c o me wi t h a n u mb e r o f c h a l l e n g e s ,wh i c h i s h o w t o ma k e t h i s t e c h n o l o g y b e c o me a c o n v e n t i o n a l me a n s i n t h e
c l i n i c a l d i a g n o s i s . T h i s a r t i c l e r e v i e ws t h e p r i n c i p l e o f a f e w t e c h n o l o g y p l a t f o r m, p o t e n t i a l a p p l i c a t i o n s a n d t h e c h a l l e n g e s o f NGS i n t h e c l i n i c a l d i a g n o s i s . ,
T h e r a p i d d e v e l o p me n t o f n e x t - - g e n e r a t i o n s e q u e n c i n g( NG S ) g r e a t l y r e d u c e t h e c o s t o f s e q u e n c i n g a n d r e a l i z e
( n e x t - . g e n e r a t i o n s e q u e n c i n g , NG S)极大 降低 了测序成本 , 并且实现 了高通量 , 这使我们可以获得整个 基 因组的序列 , 以及那些 临床上确诊病人 的全部基 因组信 息。 然 而下一代测序技术 带来诸多益处 的同时也 带来 了挑 战 , 那就是怎样使这个技术在临床诊断中成为常规 手段 。 本文就 目前 NGS的几大技术平 台原理 , 在 临床诊 断中的应 用 , 以及 目前 面临的挑战等进 行综 述。 【 关键词 】 下 一代 测序 ; 基 因组学 ; 分子诊断