最新[应用]2 酶学与酶工程 第二章 学生幻灯片课件

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4.蛋白质工程
这是研究酶必需基闭和活性中心的最先进方法,即将酶蛋白相应 的互补DNA(cDNA)定点突变,此突变的cDNA表达出只有一个或几 个氨基酸被置换的酶蛋白,再测定其活性,可以知道被置换的氨 基酸是否为活力所必需。
优点:
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二、酶的结构和功能的关系
(一)酶的一级结构与催化功能的关系 酶的一级结构是酶的基本化学结构,是催化功能的基础。
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胰蛋白酶原(trypsinogen)的激活
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(二)酶的二级和三级结构与催化功能的关系
磷酰基(P=O)酰基(C=O) 糖基(Glu-C-OH)
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底物中典型的亲电中心为磷酰基、酰基和糖基
酶分子上未共 用电子对攻击 正电性原子
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4.金属离子催化 5.多元催化 6.微环境的影响
活性中心可避免水分子干扰
[应用]2 酶学与酶工程 第二 章 学生
第一节 酶的结构与功能
一、酶的活性中心 (active center,active site) (一)活性中心和必需基团 与酶活性显示有关的,具有结合和催化底物形成产物的空间区域 ,叫酶的活性中心,又叫活性部位。 活性中心可分为结合部位和催化部位。
结合部位决定酶的专一性, 催化部位决定酶所催化反应的性质。
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3.差别标记
在过量底物或可逆抑制剂遮蔽活性中心的情况下, 加入共价修饰剂,使后者只修饰活性中心以外的有关 基团;然后去除底物或可逆抑制剂,暴露活性中心, 再用同位素标记的向一修饰剂作用于活性中心的同类 基团;将酶水解后分离带有同位素的氯基酸,即可确 定该氨基酸参与活性中心。
具有四级结构的酶,按其功能可分为两类,一类与催 化作用有关,另一类与代谢调节关系密切。
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三、酶催化作用的基本理论
(一)酶—底物复合物
1.酶-底物复合物存在的证据 1903年,Henri用蔗糖水解酶水解蔗糖提出的。
E+S= ES= P+ E (S:substrate, P: product)
酶的二级、三级结构是所有酶都必须具备的空间构型。维持酶的 活性部位所必须的酶蛋白的二级和三级结构彻底改变,就会使酶 遭受破坏而丧失其催化功能,这是蛋白质变性的依据。
1.酶的变性和失活 2.活性中心的挠性 3.酶分子的结构域
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(三)酶的四级结构与催化功能的关系
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(二)酶作用的专一性机制
1.锁钥学说(lock and key theory)
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2.诱导契合学说(induced-fit hypothesis)
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(三)酶作用的高效性机制
1. S与E的靠近效应和定向效应 proximity and orientation
靠近效应:指两个反应的分子,它们反应的基团 需要互相靠近,才能反应。
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2. 酸碱催化(acid or base catalysis)
酸碱催化是通过瞬时地向反应物提供质子或从反应物接受质子以 稳定过渡态、加速反应的一类催化机制。由于E活性中心含有酸碱 基团,它们可以与S中的酸碱基团进行质子交换,加强了E与S的相互 作用,减弱了S分子内部的化学键,使S由稳态→不稳态
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3. 共价催化(covalent catalysis) 共价催化又称亲核催化(nucleophilic catalysis)
或亲电子催化(electrophilic catalysis) 亲核攻击集团: -OH,-SH,-N(咪唑基) 底物亲电中心:
在避开水分子的干扰后,分子间的离子键才容易
产生。
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优点: 改变酶蛋白中任一氨基酸而不影响其他同类残基 改变疏水残基,使其转变成亲水或另一疏水残基 同时改变活性中心内外的几个氨基酸 个或多个氨基酸的缺乏或插入 改变酶蛋白的磷酸化位点或糖化位点 不致引起立体障碍
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(三) 组成活性中心的重要化学基团
丝氨酸、组氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨 酸和赖氨酸
在反应过程中,酶首先与底物形成酶-底物中间复合物(ES, enzyme-substrate intermediates),再分解成酶(E)和产物(P), 使反应沿一个低活化能的途径进行,降低反应所需活化能。
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2. 酶与底物形成复合物的作用力 1)离子键 2)氢键 3)范德华力
狭义酸碱催化:H+和OH-
(specific acid-base catalysis)
广义酸碱催化:质子供体和质子受体
(general acid-base catalysis
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三、降低反应活化能的因素 Table Functional groups involved in general acid-base catalysis
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2.亲和标记
共价修饰剂是底物的类似物,可专一性地引入酶 的活性中心,并具有活泼的化学基团(如卤素),可 与活性中心的基团形成稳定的共价键。因其作用机 制是利用酶对底物类似物的亲和性而将酶共价标记 的,故称为亲和标记。
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