基因载体的选择与构建
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(2)不相容性
同一复制系统的不同质粒在同一细菌中 不能相容 不同复制系统的质粒在同一细菌中可共存
(3)可扩增性
质粒就其复制方式而言分为两类
松弛型复制 严谨型复制
(4)可转移性
在天然条件下,大多质粒可通过 细菌接合作用从一种宿主细胞内转移 到另外一种宿主内。
2、质粒的构建
(1) 天然存在的两种质粒
DNA
3)连接样品DNA和质粒DNA的消 化产物
冷循环器
4)用连接产物转化大肠杆菌感 受态细胞
转化细菌有两个基本方法。 一是 化学法,即用CaCl 2 处理并加热激以
促进DNA进入菌体; 二是电激法,即 施加短脉冲的电荷以促进
DNA 吸收。
5)细菌在加有Amp+X-Gal 的培养 基上生长以进行筛选
2) λ基因组非常大,对于每一种酶来讲都含 有超过 1个的识别序列,酶切后产生多个片段, 连接不能形成 λ基因组。
4、典型的质粒克隆技术
1) 用限制性内切酶消化 DNA 样品 2)用限制性内切酶消化 质粒DNA 3) 连接样品DNA和质粒DNA的消化产物 4) 用连接产物转化大肠杆菌感受态细胞 5) 涂布在琼脂平板上进行耐抗菌素筛选
1)用限制性酶消化 DNA 样品
粘性末端
2) 用 限 制 性 内 切 酶 消 化 质 粒
二)载体应具备的特征条件
1.能在宿主细胞内独立和稳定的自我复制 2.具有与特定受体细胞相适应的复制位点或 整合位点 3.长度尽可能小,以提高其载装能力 4.具有多种单一的酶切位点 5.具有合适的选择性标记
多克隆位点
polylinker
复制起始点 ori
Amp遗传标记
基因载体
三)质 粒 (plasmid )
Amp r
Tc
1)限制酶切
2)DNA重组
利
无DNA插入
有DNA插入
用 抗
Amp r Tc r
转化
外源DNA
Amp r Tc s
性 基
Amp r Tc r
Amp r Tc s
因 进
行
无菌落
筛选重组子
阳性菌落
重
组
子
的
提取DNA 电泳
筛
选
Amp r Tc s
重组DNA
3、质粒的制备
实验室一般使用两种方法制备质粒
噬菌体通过特殊的生物学方式感染宿主细 胞,将其 DNA导入 : (1)吸附
(2)DNA注入 (3)DNA复制 (4)包装: 只能包装 λ-DNA分子的75%-105%
即包装范围为 36.4kb-50.9kb 的DNA (5)裂解
吸附 成熟、释放
穿入 生物合成
毒性噬菌体的溶菌性周期
温和噬菌体的溶菌性周期
质粒是存在于细菌细胞质中独立于染色体 而自主复制的共价、封闭、环状双链DNA分子 (Covalently closed Circular DNA, ccc DNA)。 ★不是细菌生长所必需的 ★可赋予细菌抵御外界因素不利影响的能力 ★分子量在1-200kb之间
1、质粒的基本特性
(1)自主复制性
携带有自己的复制起始区( ori ) 控制质粒拷贝数的基因 能独立于宿主细胞的染色体 DNA而自主复制
(d)改变复制子,变严紧为松弛,变少拷 贝为多拷贝
(e)根据基因工程的特殊要求加装特殊的基 因元件
例如:pBR322
pBR322 为4.36kb 的环状双链 DNA。
普通型载体pBR322 的结构图
PstI
ScaI
Ampr
HindIII BamHI
SalI
pBR322
(4.36 kb)
ori
第三章 基因载体的选择与构建
一、载体的功能、特征及质粒载体
克隆载体( clony vector ):具有在细胞内进行 自我复制的 DNA分子,起运送目的基因到受体 细胞的作用。
目前基因工程中常用的载体有: 细菌质粒、噬菌体载体、黏粒载体、
病毒载体、人工染色体等。
一)载体的功能 1.运送外源基因高效转入受体细胞 2.为外源基因提供复制能力或整合能力 3.为外源基因的扩增或表达提供条件
(1) 碱裂解法 (2) 沸水浴法
(1)碱裂解法
原理:利用溶菌酶在 NaOH 与SDS的混合溶液中破坏 细菌外壁,去除染色体 DNA及变性蛋白质, 离心,苯
酚-氯仿溶液处理,乙醇或异丙醇沉淀水相质粒。
特点:质粒较纯,收得率高,繁琐,且 有开环现象
(2) 沸水浴法
特点:质粒不纯,收得率低,且制备规模小, 但快速,特别适用于重组质粒的鉴定。
前噬菌体
温和噬菌体的溶源性周期
源自文库
二) λ-DNA载体的构建
λ 噬菌体线性双链 DNA病毒,具有末端互补的 12nt, 感染细菌后粘端互补成双链环状。全长 48 531bp ,含 50多个基因。
建立λ克隆载体前需要解决两个问题:
1) λDNA分子只能增加 5% 的大小,即只能插 入3kb 的DNA分子。
A、colE1 宿主细菌大肠杆菌 6.5kb 松弛型复制 20-30/cell
B、pSC101 宿主细菌沙门氏菌 8.8kb 严谨型复 制5copy/cell
(2) 质粒人工构建的目的
天然质粒存在缺陷 不适合用作基因工程的载体 必须对之进行改造构建
方法:重组,“拼拼接接,挖肉补疮 ”
(a)加入合适的选择标记基因 (b)增加或减少合适的酶切位点 (c)缩短长度,增加装载量
X-gal
X-gal水解
筛选结果
? 蓝菌落代表含有质粒的耐药菌,表
达出由完好的α LacZ序列编码的功能 性的 α 片段
? 白菌落代表含有质粒的耐氨苄青霉
素菌,质粒上α LacZ序列上有插入片 段
筛选结果模式图
蓝 菌 落
蓝白菌落
筛选白色菌落
二、噬菌体载体与黏粒载体
一)噬菌体载体
λ噬菌体是大 肠杆菌的噬菌体, 它由外壳蛋白和 λ-DNA组成
噬菌体 (电镜图)
1、λ-DNA的物理图谱
λ-DNA 为线状双链 DNA 分子,两端各有一个 12核苷 酸的互补单链(粘性末端) GGGCGGCGAC CT, CCCGCCGCTGGA ,称为 cos区,全长48.5kb 。
特点是功能相近的基因在基 因组中聚集在一起。
cos
位 点 的 作 用
2、感染周期
筛选会有三种结果:
一是要插入的序列自连,结果没有 菌落形成;
二是切开的质粒重连,结果表现为 蓝色菌落;
三是要插入的序列与质粒相连,产 生白色的抗氨苄青霉素菌落。
Amp+X-Gal+IPTG 培养基的筛选菌落法
倒平板
加IPTG和X-GAL
乳糖和诱导物IPTG的化学结构
iso propyl-beta-Dthio galactopyranoside