医学信息资源的查找和利用

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=pubmed
基本检索界面
基本检索：一框
AND、OR、NOT
检索结果右侧
词尾可使用截词符“*”
双引号“” 实现精确检索
自动转换及主题词自动扩展
基本检索举例
检索阻塞性睡眠呼吸暂停相关文献
OASH OR obstructive sleep apnea
在一个主题词下面往往收录了许多篇文献，为了让读者不必花太 多时间从头到尾一题不漏地看所有题录，就在每一个主题词下面又用 若干副主题词，以便把内容相近的文献集中到相应的副主题词下面， 让读者有目的地选择查阅。
正确选择副主题词也很关键。简单的如：诊断（Diagnosis，DI）、 药物治疗（Drug Theray，DT）、血液供给（Blood Supply，BS） 等。
应对策略
修改字段： [All Fields] ———[TIAB] 防止拆分："gene therapy" "Gastric tumor" OR "Gastric tumors" OR "Gastric tumours" OR "Gastric tumour" OR "Gastric cancer" OR "Gastric cancers" OR "Gastric carcinoma" OR "Gastric neoplasm" OR "Gastric sarcoma" OR "Stomach tumor" OR "Stomach tumors" OR "Stomach tumours" OR "Stomach tumour" OR "Stomach cancer" OR "Stomach cancers" OR "Stomach carcinoma" OR "Stomach carcinomas" OR "Stomach neoplasms" OR "Stomach neoplasm" OR "Stomach sarcomas" OR "Stomach sarcoma" OR "Stomach adenocarcinomas" OR "Stomach adenocarcinoma" OR " Gastric adenocarcinomas" OR " Gastric adenocarcinoma“
主题词也不是万能的
不是每个概念都有确切的主题词供选择的
atrial infarction(自由词)
“myocardial-infarction（主题词）and atrial
主题标引需要时间 最新文献检索须用自由词 主题标引质量不一，由词表设置和专家控制决定 PUBMED 的主题词检索 非常棒 ； BP词表丰富，有自己的特色； CBM的标引质量太差
使用规范化主题词有什么益处？
对于自然医学词汇中同义词、近义词、学名与俗名的 处理 例： Cancer *Neoplasms (大概念下所有子概念） German Meales *Rubella (同义词） Vitaman C *Ascorbic Acid (学、俗名） Apoplexy *Cerbrovascular Disorders (同义词） Deoxyribonucleic Acid *DNA (繁、简称） 有“*”者为规范化主题词。
需要变换的：例如肺发育不全，输入主题词“肺”后，在副主题词菜 单中选择“畸形”表示发育不全；再例如，双子宫——用 子宫/畸形 检索。
25种胃癌的“词组”表达，真不容易啊 ——但，这些，就够全了吗？？
*、“” 、与 主题词
“Gastric* tumor*”[TIAB] ；Stomach* [TIAB] AND Carcinoma* “” 与*不能同时用哦，因此： Gastric* tumor*” × 用了*和“”就不能执行系统的自动转换了噢 * 只能截取前600个单词，词根太短、文献太多的情况不适合
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特殊主题文献查找
Details 让我们知己知彼
检查检索策略 修改检索策略 查看检索结果及所用数据库
实例分析
实例一: 腺病毒为载体的胃癌基因疗法对照研究
知己知彼，修改策略
如何读懂detail提供的 系统自动转换过程呢？
Pubmed检索字段释疑
字段标识符 AB AD AU ， AUTH IP IS JOUR，TA MAJR MH,MeSH PY RN ,ENCO SH SO TI TIAB TW, WORD VI 字段名 Abstract Address ，Affiliation Author Issue International Standard Serial Number Journal Title MeSH Major Topic Medical Subject Headings Publication Year EC/RN number Subheading source Title Title/Abstract Text Word Volume 注释 文摘 第一作者工作单位、地址 作者名 期刊的期号 国际标准刊号 杂志名缩写 主要主题词，用*号表示 主题词 出版年份 化学物质登记号或酶标记号 副主题词 文献来源 文章标题 标题和文摘 文本词，包括题目、摘要、主 题词、副主题词等 杂志的卷次
学习检索
实例二: 消化系统肿瘤病因学研究
难点：病因属于概念范畴、分布广且不容易查准 如何把所有属于消化系统肿瘤的自由词查全 应对：利用主题词与副主题词组配检索 利用主题词表检索词提示功能
何为副主题词？
《副主题词(Subheadings)又称限定词(Qualifiers)，与主题词进 行组配，对某一主题词的概念进行限定，使主题词具有更高的专指性。
因此：tumor* × Carcinoma* √ 胃癌 策略修正： （1）stomach neoplasms[MESH] （2）-A(Stomach*[TIAB] OR Gastric*[TIAB]) （2）-B(neoplasms[MH] OR tumors[TIAB] OR tumour[TIAB] OR tumours[TIAB] OR tumorous[TIAB] OR tumorigenesis[TIAB] OR tumorigeness[TIAB] OR tumorigenic[TIAB] OR tumorigenicity[TIAB OR cancer*[TIAB] OR carcinoma*[TIAB] OR neoplasm*[TIAB] OR sarcoma*[TIAB] OR adenocarcinoma*[TIAB]) 最终策略： 1 OR (2-A AND 2-B)
医学信息资源的查找和利用
2010-11-10 图书馆参考咨询部
Tel: 0571-87951402 Email: zhychen@lib.zju.edu.cn
陈振英
科研与学习中经常碰到的问题
如何快速检索关键信息？
如何及时跟踪最新进展？



如何有序管理参考文献？
快速检索——及时跟踪——有效管理
纲
要
PubMed
BIOSIS Preview
网络资源
1.1 PubMed特点
世界公认的最具权威的生物医学文献数据库
查找医学文献利用率最高的网上免费数据库 内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统，前临床医学等学科
具有强大的检索和链接功能
包括MEDLINE、PREMEDLINE和出版商直接提供的文献数据库 5000多种重要生物医学期刊，每天更新
这下可以读懂了，研究一下吧
看懂了才能改——提示还是不少的噢 1.哪些是主题词？：gene therapy 、adenoviridae 、stomach neoplasms 2. 哪些有其他同义词？ Adenoviridae adenovirus 3.都限定在哪些字段？comparative study 可以作为一种出版类型限定 4.转换过程是否合理？ 自由词被限定在所有字段[All Fields] gene 与 therapy有 分开形式也有强制词组检索“gene therapy”； stomach与tumor分开；
系统自带有如下两种途径：
1. 高级检索页面 2.检索结果返回页面
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高级检索 限定检索
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强大的限定功能是查准专业文献检索的好帮手
强 烈 推 荐
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#8 AND
高级检索
腺病毒为载体的胃癌基因疗法对照研究 ——最后的策略
(gene therapy[MH] OR “gene therapy”[TIAB]) AND (stomach neoplasms[MESH] OR ((Stomach*[TIAB] OR Gastric*[TIAB])AND (neoplasms[MH] OR tumor[TIAB] OR tumors[TIAB] OR tumour[TIAB] OR tumours[TIAB] OR tumorous[TIAB] OR tumorigenesis[TIAB] OR tumorigeness[TIAB] OR tumorigenic[TIAB] OR tumorigenicity[TIAB] OR cancer*[TIAB] OR carcinoma*[TIAB] OR neoplasm*[TIAB] OR sarcoma*[TIAB] OR adenocarcinoma*[TIAB]))) AND 物有所值 (adenoviridae[MESH] OR adenoviruses[MH] OR Adenovirus[MH] OR adenovir*) AND (“comparative study” OR “Meta analysis” OR blindness[MeSH] OR Compara* OR Controll*) 9篇 （增加近一倍）
为什么一定要用主题词？？ 哪里去找那么多的同义词呢？？
什么是主题词（受控词）？
主题词（受控词）是能够表达文献主要内容的规范化名词 术语 。采用的词语有较严格的限定。通过对一个概念的同 义词、近义词及拼法变异词等进行“规范”，以保证词语 与概念的一一对应，是典型的规范化语言。 医学相关数据库中提供受控词检索的有： 医学主题词表（ MeSH表）：CBM和PubMed 受控词表：BA(BP)
什么时候必须用主题词：
1.大概念检索 2.无法预知情况(如：多个同义词）检索
回到刚才的问题
对同义词的控制：stomach neoplasms[MESH] 对大概念的控制：Cardiovascular Disease 主题词表是树状结构，默认为扩展所有下位类检索
GASTROINTESTINAL NEOPLASMS 胃肠肿瘤 INTESTINAL NEOPLASMS 肠肿瘤 CECAL NEOPLASMS 盲肠肿瘤 APPENDICEAL NEOPLASMS 阑尾肿瘤 COLONIC NEOPLASMS 结肠肿瘤 COLONIC POLYPS 结肠息肉 … … … … DUODENAL NEOPLASMS 十二指肠肿瘤 ILEAL NEOPLASMS 回肠肿瘤 … …
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