研究生基本实验技能培训
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30cycles
72 ℃, 30s
72 ℃,30s (后延伸)
2.2
PCR操作步骤(重点)
1. 计算好所需扩增的PCR体系; 2. 打开PCR仪预热,设置PCR循环条件; 3. 准备试剂,融化,离心,置于冰上,备用; 4. 按顺序加样,混匀,离心,分装; 5. 加入模板DNA,混匀,离心; 6. 放入PCR仪,Start。
研究生科研实验教学基地建设 基本实验技能培训
首都医科大学附属北京朝阳医院 基础医学研究中心 ·梁燕
85231624,
liangyan1990@shou.com
主要内容
1.DNA的提取
DNA提取原理 DNA提取方法 操作注意事项 PCR体系和循环条件 PCR操作步骤 操作注意事项
2.PCR
3.琼脂糖凝胶电泳
操作步骤(重点)
7. 向吸附柱中加入700ul漂洗液PW, 12000rpm离心30 秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管; 8. 向吸附柱中加入500ul漂洗液PW, 12000rpm离心 30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管; 9. 将吸附柱和收集管再次离心, 12000rpm离心2分钟, 将吸附柱至于室温放置数分钟; 10. 将吸附柱转入一个干净的离心管中,向吸附膜中间位 置悬空滴加50-200ul洗脱缓冲液TB,室温放置2-5分 钟, 12000rpm离心2分钟,将溶液收集到离心管中; 11. 测OD值,计算DNA浓度和纯度;或电泳估计DNA浓 度。
3.琼脂糖凝胶电泳
凝胶电泳原理 电泳方法步骤 操作注意事项
作
业
实验记录 • 姓名,日期,试剂批号等 Fra Baidu bibliotek 实验设计 DNA提取步骤 PCR体系和循环条件 配胶和电泳方法
计算公式:
OD260/OD280=1.7-1.9
DNA浓度(ug/ul)=OD260×50×稀释倍数/1000 OD260=0.1 稀释倍数=250 DNA浓度=0.1×50 ×250/1000=1.25 ug/ul
操作注意事项
避免样品反复冻融 56℃水浴摇匀可消除GB中的沉淀
使用台式离心机,室温离心
子(灭菌)、离心管架
试剂准备:
试剂盒、无水乙醇等
试剂盒
试剂盒内容
操作步骤(重点)
1. 向52ml的缓冲液GD中加入68ml无水乙醇,并标记; 向50ml的缓冲液PW中加入200ml无水乙醇,并标记; 2. 取200ul全血,加入20ul的蛋白酶K溶液,混匀; 3. 加入200ul缓冲液GB,充分颠倒混匀,56℃放置10分 钟,期间颠倒混匀数次,溶液应变清亮。 4. 加入200ul无水乙醇,充分颠倒混匀,此时可能会出 现絮状沉淀。 5. 将吸附柱CB3放入收集管中准备好,将上述溶液移到 吸附柱CB3中,12000rpm离心30秒,倒掉收集管中 的废液,将吸附柱放回收集管;如果步骤5的溶液不 能一次加完,可以再次重复步骤6; 6. 向吸附柱中加500ul的缓冲液GD, 12000rpm离心 30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管;
2.3
PCR操作注意事项
避免试剂反复冻融
计算总量,顺序加样
更换吸头,避免污染
3.琼脂糖凝胶电泳
凝胶电泳原理 电泳方法步骤 操作注意事项
3.1
琼脂糖凝胶电泳原理
DNA分子带负电荷,在直流电场中由负极移向正极; 其移动速度与线性DNA片段长度成反比。
3.2
琼脂糖凝胶电泳方法(重点)
• 配置1%的胶:称1g琼脂糖于适当大小三角瓶中,倒入 100ml的1*TAE,微波炉加热至完全融化; • 待凝胶温度降至50-60度时,加入1ul的EB(10mg/ml), 摇匀,将胶倒入放好梳子的电泳板中,自然冷却30-60 分钟; • 轻轻拔掉梳子,将胶放入电泳槽中,倒入1*TAE,没过 加样孔; • 按照1ul上样Buffer+5ul的DNA混合后,点样;每排留 一个孔加DNA marker; • 100V电泳30分钟,凝胶成像仪照相。
Primer F (10mM)
Primer R (10mM) Ex Taq Sum
Template DNA (0.1ug/ul)
1ul
1ul 1ul 24ul 1ul
2ul
2ul 2ul 48ul 48/2=24ul 1ul
(1U/ul)
95℃,30s (预变性)
95℃, 30s
60 ℃, 30s
3.3
电泳操作注意事项
带手套操作EB
凝胶完全融化
凝胶冷却时间至少30分钟
应用BclI/RFLP 多态位点进行基因连锁分析
M
II-3
II-2
II-1
I-2
I-1
0
374 211 163
小
1.DNA的提取
DNA提取原理 DNA提取方法 操作注意事项
结
2.PCR
PCR体系和循环条件 PCR操作步骤 操作注意事项
PCR体系和循环条件 PCR操作步骤 操作注意事项
2.PCR
仪器准备:
PCR仪,微型离心机、移液器、离心管(灭菌)、吸头
(灭菌)、镊子(灭菌)、离心管架
试剂准备:
ddH2O, PCR Buffer,dNTP,引物,PCR聚合酶, DNA模板
2.1
PCR体系和循环条件(重点)
BclI PCR Total volume ddH2O 10×Buffer dNTP (25mM) 25ul *2 16.5ul 2.5ul 2ul 33ul 5ul 4ul
凝胶电泳原理 电泳方法步骤 操作注意事项
1.DNA的提取
DNA提取原理 DNA提取方法 操作注意事项
1.1
基因组DNA提取原理
既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离, 又要保持DNA分子的完整。
1.2
仪器准备:
基因组DNA提取
台式离心机、恒温水浴锅、紫外分光光度计、
移液器、离心管(灭菌)、吸头(灭菌)、镊