SEREX技术 肿瘤相关抗原的筛选方法
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卵巢上皮性癌相关抗原筛选中SEREX 技术的应用 卵巢上皮性癌相关抗原筛选中 广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科;2008 SEREX技术在筛选疾病相关抗原中的应用 技术在筛选疾病相关抗原中的应用 河北大学生命科学学院生物芯片研究室;2008 SEREX技术的研究进展 技术的研究进展 广西医科大学组织学与胚胎学教研室;2008 SEREX在肿瘤抗原分析中的研究进展 在肿瘤抗原分析中的研究进展 中南大学湘雅医学院肿瘤研究所,2002
应用SEREX发现的抗原
5. 结肠癌:Scanlan等在结肠癌中发现17个新基因 6. 大肠癌:何敬东等筛选获得16个阳性克隆, 代表12个 不同抗原基因 7. 肺癌:Gure等发现8个抗原,以NY-LU-12抗原最重要 8. 胰腺癌:Nakatsura等发现5个新基因高表达 9. 白血病:Itoh等在成人T淋巴白血病中发现3个抗原 10. 胃癌:王运伟等筛选出14个胃癌肿瘤相关抗原编码 基因
SEREX技术 技术
----肿瘤相关抗原的筛选方法 ------李巧玲 2012.02.14
目录
SEREX的概况 SEREX的原理 SEREX的基本流程 SEREX发现的抗原 SEREX SEREX的优点与缺点 SEREX的改进 展望
SEREX概况
中文名称:重组表达cDNA克隆的血清学分析技术 英文名称:serological analysis of recombinantly expressed cDNA clone(SEREX) 定REX,是1995年由德国血清学家Sahin等建立的 从分子水平鉴定肿瘤抗原的方法,开创了血清学 检测肿瘤抗原的新时代。
SEREX技术具体方法
对阳性克隆进行DNA序列分析 在Genbank中用BLAST进行 序列分析 对阳性克隆进行 序列 对比分析,判定该基因序列是已知还是未知,还可根据人 类基因组图谱对阳性cDNA序列进行染色体基因定位。 采用Southern blot或RT-PCR检测阳性克隆cDNA在正常组织 组织及肿瘤中的表达情况。 采用Northern blot Northern blot检测肿瘤抗原mRNA的表达,确定肿瘤抗 mRNA 原的组织表达谱。 采用Western blot分析各种组织中肿瘤抗原的表达。 用已知抗原检测体内相应抗体的浓度,定量分析肿瘤特异 性抗体及其临床意义。
SEREX展望
SEREX&库血清学分析技术在腰椎间盘突出症自 重组 身抗原筛选中的应用前景; 身抗原筛选中的应用前景;2010 应用SEREX技术筛选和鉴定肺癌相关抗原的研究进展 应用 技术筛选和鉴定肺癌相关抗原的研究进展 广西医科大学研究生院;2009 应用SEREX技术筛选和鉴定非小细胞肺癌肿瘤相关抗原 技术筛选和鉴定非小细胞肺癌肿瘤相关抗原 应用 技术筛选和鉴定非小细胞 北京市结核病胸部肿瘤研究所;2009 SEREX方法在肿瘤相关抗原筛选中的应用 方法在肿瘤相关抗原筛选中的应用 方法在肿瘤相关抗原筛选中的 河南中医学院基础医学院;2009
SEREX的改进
去除假阳性:筛选血清可以通过与野生型的细菌-噬菌体 裂解物预吸收来消除同细菌或噬菌体复合物起反减后的肿瘤cDNA再进行血清学筛选,可排除在正常 组织中有明显表达的基因。 发展真核表达系统:蛋白质的构造和翻译后修饰对抗原作 用的发挥及其重要,也影响其免疫原性。 将蛋白质组学与SEREX方法结合起来
SEREX鉴定肿瘤抗原的分类
通过SEREX方法已经在黑色素瘤、胃癌、卵巢癌、小细胞 肺癌、等恶性肿瘤中找到了约1500种抗原,用该方法鉴定 出来的抗原按来源和性质可分为以下几类: CT抗原 分化抗原 突变抗原 过表达抗原 剪切变异体抗原
应用SEREX发现的抗原
1. 肝癌:罗国荣等筛选出肝癌相关抗原SMP-30和Kinectin, 并应用基因工程技术方法构建、表达、和纯化出肝癌相 关抗原SMP-30和Kinectin的融合蛋白,采用western blot和 ELISA检测出SMP-30和Kinectin相应抗体在肝癌患者血清中 有较高的阳性率。 2. 卵巢癌:王颖等发现MY-OVA-13基因;周芙玲发现12个 新基因 3. 鼻咽癌:谢可发现一个新的热休克蛋白基因家族的抗原; 黄绍明发现了14个新的鼻咽癌相关抗原;舒峻筛选出16 个抗原,并首次在鼻咽癌组织中筛选出金属硫2A基因
请批评指正!
S标本或肿瘤细胞株抽提总RNA,逆转录合成 cDNA后重组到噬菌体λZAP表达载体中,经体外包装后转培养皿,孵育过夜,次日将噬菌斑转印至硝酸纤维素膜 (NC膜),接着5%脱脂奶粉(NFDM)于室温封闭NC膜1h, 后用TBS液冲洗干净,用1:200经预处理的自体血清与NC膜 室温孵育5-6h,再用TBS冲洗,将膜同1:3000稀释的碱性磷 酸酶(AKP)标记羊抗人IgG抗体孵育1h,最后进行显色反应。 挑取阳性克隆,阳性克隆再次扩增进行第2轮、第3轮筛或组织的mRNA,构建cDNA表达文 所获得的阳 性克隆经过体内删除成为噬菌粒后进行序列测定, 然后对其进行生物信息学分析,再进一步展开对 这些基因的结构和功能的研究。
SEREX技术基本路线
SEREX技术的缺点
SEREX技术必须构建cDNA基因表达,并且仅局限于对 一个或者很少几个病人血清的筛选,代表性差 SEREX技术不能检测肿瘤表达的所有抗原。 因为在SEREX方 法中,抗原在细菌-噬菌体系统中表达后,不能正确折叠 和翻译后修饰,所以不适用于鉴定具有翻译后修饰功能的 肿瘤相关抗原 对某些在肿瘤发展的不同阶段表达的抗原,若取新鲜组织 标本的时间与该抗原表达的阶段不一致也将被漏检
SEREX技术的优点通过构建进行筛选 简化筛选步骤 筛选的抗原分子多为全长cDNA,可诱导细胞免疫和体液免 筛 选血清可以是自体血清,也可以是同源异体血清 cDNA表达克隆的血清学分析,不只限于分析肿瘤细胞的表 面抗原,它涵盖了由肿瘤基因编码的大多数蛋白 将病人血清稀释后进行筛选,使得免疫分析仅限于那些可 以诱导强免疫反应的抗原 使用病人多克隆抗体血清筛选,使得在一次筛选过程中, 可以鉴定出多个抗原