上海交通大学医学院文献检索课程2012级第2讲文摘检索(交大医201209版)
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比如：检索文章题目中含有高血压的中文文献 检索式:hypertension[ti] AND chi[la]
26
例：检索文章题目中含有高血压的中文文献 检索式：hypertension[ti] AND chi[la]
27
PubMed基本检索 常用检索字段描述和标识(2)
Publication date[dp]:出版日期 指论文所在期刊的出版日期 日期检索的形式为：YYYY/MM/DD[DP] 要检索一段时期内的文章，日期之间可以加冒号，如： 1993/01:1995/06[DP] Publication type[pt]:出版类型。有综述，新闻，传记，临床试 验等。如：review[pt] MeSH terms[mh]：主题词字段。如：hypertension[mh] Subheadings[sh]:副主题词。与主题词组配检索.
(基于OVID/ISI Web of Knowledge系统平台)
• CA&SciFinder Scholar美国化学文摘
2
数据库检索 A P44
3
一、PubMed数据库简介
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属的 国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于 WWW的医学数据库查询系统。 网址： http://www. /pubmed
Author Index
作者索引表
No Mapping
17
备注：
如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时， PubMed就将短语劈开，再重复以上顺序单独分别 查找，直到找到相匹配的词。如果仍找不到匹配 词，则用AND 将短语中的单个词连接起来在全部 字段中查找。 例：检索 h1n1 influenza 转换为: h1n1[All Fields] AND ("influenza, human"[MeSH Terms] OR ("influenza"[All Fields] AND "human"[All Fields]) OR "human influenza"[All Fields] OR "influenza"[All Fields])
7
MEDLINE
是美国国立医学图书馆MEDLARS 系统中最大的生物医学数据库，收 录1966年以来70多个国家4000种左 右生物医学期刊的书目信息和著者 文摘，每周更新。每条记录均带有
[PubMed--Indexed for MEDLINE] 标志。
8
PreMedline
收集未正式给予MeSH词、出版类型等 深度标引信息的一个临时库。NLM每天 把最新记录加入到PreMedline库中，每 条记录均带有[PubMed--in Process]标志。 工作人员在一周内将这些记录标引，然 后转入MEDLINE，同时从PreMedline 中删去。
34
PubMed基本检索
bacter*[TI]
截词检索可以 扩大检索范围 提高查全率。
35
PubMed基本检索
强制检索
PubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索。 如：在PubMed主页的检索提问框中键入“single cell”，并用双 引号引起来。点击“GO”按钮，系统会将其作为一个不可分割的词 组在数据库的全部字段中进行检索。 如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成2个词： single和cell检索，其检索表达式为：single AND cell. 很明显这 样的检索结果是不符号要求的。
32
PubMed基本检索
Eur J Immunol
期刊的一般检 索，是在检索 输入框中键入 期刊名或期刊 的ISSN号
33
PubMed基本检索
截词检索
截词检索的作用：扩大检索范围，提高查全率。 截词符：
*
----代表零到多个字符，只可用于词尾。
如：bacter*，可以检出bacter，bacteria， bacteriophage ，bacterium等单词。
5
二、通过PubMed可检索如下信息
oldMedline
MEDLINE
PreMedline
出版商提供的书目信息
NCBI其它数据库的相关记录
6
oldMedline 1950-1965年间发表的200多万篇文献 没有MeSH字段和摘要 记录中用[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]标记表示。
28
PubMed基本检索 作者姓名检索
按照姓+名缩写（不用标点）的格式键入作者姓名，如： smith ja或jones k, 系统会自动在作者字段内进行检索。姓名第 一个字母可用大写也可用小写，姓前名后,姓用全称，名字一般用 缩写。 考虑到作者姓名的不同形式，PubMed采用自动转换功能进 行作者姓名检索，如：smith j将检索成smith ja,smith jb,smith jr 等。 精确检索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段限 定[AU]，如："smith j"[au]，这样可避免PubMed自动转换，实 现精确查找。 29
11
NCBI其它数据库的相关记录
PubMed建立了与NCBI其他数
据库之间联系。它们是双向网
络互连的关系（见下页图）。
12
13
三、PubMed记录字段说明
Affiliation [AD] Article Identifier [AID] All Fields [ALL] Author [AU] Book [book] Comment Corrections Corporate Author [CN] Create Date [CRDT] Completion Date [DCOM] EC/RN Number [RN] Editor [ED] Entrez Date [EDAT] Filter [FILTER] First Author Name [1AU] Full Author Name [FAU] Full Investigator Name [FIR] Grant Number [GR] Investigator [IR] ISBN [ISBN] Issue [IP] Journal [TA] Language [LA] Last Author [LASTAU] Location ID [LID] MeSH Date [MHDA] MeSH Major Topic [MAJR] MeSH Subheadings [SH] MeSH Terms [MH] Modification Date [LR] NLM Unique ID [JID] Other Term [OT] Owner Pagination [PG] Personal Name as Subject [PS] Pharamcological Action [PA] Place of Publication [PL] PMID [PMID] Publisher [PUBN] Publication Date [DP] Publication Type [PT] Secondary Source ID [SI] Subset [SB] Supplementary Concept[NM] Text Words [TW] Title [TI] Title/Abstract [TIAB] Transliterated Title [TT] UID [PMID] Volume [VI]
18
PubMed主页:
h1n1 influenza
19
结果显示
结果处理
结果筛选
检索表达式
20
21
22
PubMed基本检索
布尔逻辑组合检索
逻辑与（AND） --检出记录中同时含有检索词A和检索词B. 如：A AND B A B
布尔逻辑文摘型生物医学数据库
信息资源中心 医学文献检索教研室
1
主讲内容
• MEDLINE&PubMed检索系统 • CBMDisc&SinoMed
中国生物医学文献服务系统
• EM&荷兰医学文摘 • BA&BIOSIS Previews美国生物学文摘
4
特点：收录范围广、内容全、检索途径多、 检索体系完备，可部分获取原文。
•PUBMED免费 •5000种左右来源期刊,其中英文期刊约占85% •2000万余条高质量的文献题录/摘要 •每日完成来自全球的检索>200万次 •医学\护理\牙科\兽医\保健\临床前 •生命科学的期刊 •全文链接超过 3000+种 •数据更新迅速:每日更新（星期二—星期六）
PubMed基本检索
smith j
作者姓名检索 按照姓(全写) +名(缩写)， 之间不用标点 键入作者姓名
30
PubMed基本检索
"smith j"[au]
精确检索避免 PubMed自动 词汇转换，实 现精确查找
31
PubMed基本检索 期刊检索
在检索框中键入期刊名，如：European journal of immunology ，系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成 “Eur J Immunol [journal]”进行检索。 也可直接输入Medline的期刊标准缩写形式Eur J Immunol ， 或输入该刊的ISSN号（国际标准连续出版物代码）检索，即： 1521-4141。 如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：cancer， science，cell等，PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表 中的主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标准化处理， 即 ： “cell”[journal]或“cell”[ta] 。
如：查找作者为crick在1993年发表的有关DNA方面 的文献。 检索式：DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
24
例：查找作者为crick在1993年发表有关DNA方面的文献. 检索式：DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
25
PubMed基本检索 常用检索字段描述和标识(1)
四、PubMed基本检索
•自由词检索 •布尔逻辑检索 •字段限制检索
著者检索 刊名检索 日期或日期范围检索 ……
•截词检索 •强制检索
15
PubMed基本检索
自由词检索
在检索框中键入一个或多个英文单词 （大写或小写均可），点击GO按钮， PubMed系统会自动在主题词表，期刊名 表，短语表及作者索引中查询与输入的词 相匹配的形式，这就是它特有的“自动词 汇匹配功能”。
逻辑或（OR） --检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。 如：A OR B A B
逻辑非（NOT） --在含检索词A的记录中，去掉含检索词B的记录。 如：A NOT B A B
23
PubMed基本检索
字段限制检索
采用字段限制方式进行检索，其规则： 检索词 [字段标识] 或 “检索词 ”[字段标识]
16
自动词汇匹配
•PubMed对输入检索 框中的检索词进行 智能化地校对，将 其逐步地与其数据 库中的各类术语匹 配的原则。
MeSH Translation Table
主题词注释表
Journals Translation Table
期刊注释表
检索词拆分 AND
Common Phrase List
常用词组表
9
New Data
Collect
Pre-Medline
Process
Medline
PubMed
10
出版商提供的书目信息
出版商提供的是整本期刊的信息，若有
部分没有被MEDLINE收录，PubMed仍保存， 在记录中做如下标记：
[PubMed--as supplied by publisher] 。
Title[ti]：篇名字段 Abstract[ab]：摘要字段 Affiliation [ad]：著者地址字段。 Author name[au]：文章的作者，检索格式：姓+名。如： "smith ja"[au] Journal title[ta]：期刊名称。如：cell[ta] Language[la]：论文出版语种。语种检索时可只输入前3个字母， 如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la]
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例：检索文章题目中含有高血压的中文文献 检索式：hypertension[ti] AND chi[la]
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PubMed基本检索 常用检索字段描述和标识(2)
Publication date[dp]:出版日期 指论文所在期刊的出版日期 日期检索的形式为：YYYY/MM/DD[DP] 要检索一段时期内的文章，日期之间可以加冒号，如： 1993/01:1995/06[DP] Publication type[pt]:出版类型。有综述，新闻，传记，临床试 验等。如：review[pt] MeSH terms[mh]：主题词字段。如：hypertension[mh] Subheadings[sh]:副主题词。与主题词组配检索.
(基于OVID/ISI Web of Knowledge系统平台)
• CA&SciFinder Scholar美国化学文摘
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数据库检索 A P44
3
一、PubMed数据库简介
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属的 国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于 WWW的医学数据库查询系统。 网址： http://www. /pubmed
Author Index
作者索引表
No Mapping
17
备注：
如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时， PubMed就将短语劈开，再重复以上顺序单独分别 查找，直到找到相匹配的词。如果仍找不到匹配 词，则用AND 将短语中的单个词连接起来在全部 字段中查找。 例：检索 h1n1 influenza 转换为: h1n1[All Fields] AND ("influenza, human"[MeSH Terms] OR ("influenza"[All Fields] AND "human"[All Fields]) OR "human influenza"[All Fields] OR "influenza"[All Fields])
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MEDLINE
是美国国立医学图书馆MEDLARS 系统中最大的生物医学数据库，收 录1966年以来70多个国家4000种左 右生物医学期刊的书目信息和著者 文摘，每周更新。每条记录均带有
[PubMed--Indexed for MEDLINE] 标志。
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PreMedline
收集未正式给予MeSH词、出版类型等 深度标引信息的一个临时库。NLM每天 把最新记录加入到PreMedline库中，每 条记录均带有[PubMed--in Process]标志。 工作人员在一周内将这些记录标引，然 后转入MEDLINE，同时从PreMedline 中删去。
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PubMed基本检索
bacter*[TI]
截词检索可以 扩大检索范围 提高查全率。
35
PubMed基本检索
强制检索
PubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索。 如：在PubMed主页的检索提问框中键入“single cell”，并用双 引号引起来。点击“GO”按钮，系统会将其作为一个不可分割的词 组在数据库的全部字段中进行检索。 如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成2个词： single和cell检索，其检索表达式为：single AND cell. 很明显这 样的检索结果是不符号要求的。
32
PubMed基本检索
Eur J Immunol
期刊的一般检 索，是在检索 输入框中键入 期刊名或期刊 的ISSN号
33
PubMed基本检索
截词检索
截词检索的作用：扩大检索范围，提高查全率。 截词符：
*
----代表零到多个字符，只可用于词尾。
如：bacter*，可以检出bacter，bacteria， bacteriophage ，bacterium等单词。
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二、通过PubMed可检索如下信息
oldMedline
MEDLINE
PreMedline
出版商提供的书目信息
NCBI其它数据库的相关记录
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oldMedline 1950-1965年间发表的200多万篇文献 没有MeSH字段和摘要 记录中用[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]标记表示。
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PubMed基本检索 作者姓名检索
按照姓+名缩写（不用标点）的格式键入作者姓名，如： smith ja或jones k, 系统会自动在作者字段内进行检索。姓名第 一个字母可用大写也可用小写，姓前名后,姓用全称，名字一般用 缩写。 考虑到作者姓名的不同形式，PubMed采用自动转换功能进 行作者姓名检索，如：smith j将检索成smith ja,smith jb,smith jr 等。 精确检索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段限 定[AU]，如："smith j"[au]，这样可避免PubMed自动转换，实 现精确查找。 29
11
NCBI其它数据库的相关记录
PubMed建立了与NCBI其他数
据库之间联系。它们是双向网
络互连的关系（见下页图）。
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三、PubMed记录字段说明
Affiliation [AD] Article Identifier [AID] All Fields [ALL] Author [AU] Book [book] Comment Corrections Corporate Author [CN] Create Date [CRDT] Completion Date [DCOM] EC/RN Number [RN] Editor [ED] Entrez Date [EDAT] Filter [FILTER] First Author Name [1AU] Full Author Name [FAU] Full Investigator Name [FIR] Grant Number [GR] Investigator [IR] ISBN [ISBN] Issue [IP] Journal [TA] Language [LA] Last Author [LASTAU] Location ID [LID] MeSH Date [MHDA] MeSH Major Topic [MAJR] MeSH Subheadings [SH] MeSH Terms [MH] Modification Date [LR] NLM Unique ID [JID] Other Term [OT] Owner Pagination [PG] Personal Name as Subject [PS] Pharamcological Action [PA] Place of Publication [PL] PMID [PMID] Publisher [PUBN] Publication Date [DP] Publication Type [PT] Secondary Source ID [SI] Subset [SB] Supplementary Concept[NM] Text Words [TW] Title [TI] Title/Abstract [TIAB] Transliterated Title [TT] UID [PMID] Volume [VI]
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PubMed主页:
h1n1 influenza
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结果显示
结果处理
结果筛选
检索表达式
20
21
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PubMed基本检索
布尔逻辑组合检索
逻辑与（AND） --检出记录中同时含有检索词A和检索词B. 如：A AND B A B
布尔逻辑文摘型生物医学数据库
信息资源中心 医学文献检索教研室
1
主讲内容
• MEDLINE&PubMed检索系统 • CBMDisc&SinoMed
中国生物医学文献服务系统
• EM&荷兰医学文摘 • BA&BIOSIS Previews美国生物学文摘
4
特点：收录范围广、内容全、检索途径多、 检索体系完备，可部分获取原文。
•PUBMED免费 •5000种左右来源期刊,其中英文期刊约占85% •2000万余条高质量的文献题录/摘要 •每日完成来自全球的检索>200万次 •医学\护理\牙科\兽医\保健\临床前 •生命科学的期刊 •全文链接超过 3000+种 •数据更新迅速:每日更新（星期二—星期六）
PubMed基本检索
smith j
作者姓名检索 按照姓(全写) +名(缩写)， 之间不用标点 键入作者姓名
30
PubMed基本检索
"smith j"[au]
精确检索避免 PubMed自动 词汇转换，实 现精确查找
31
PubMed基本检索 期刊检索
在检索框中键入期刊名，如：European journal of immunology ，系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成 “Eur J Immunol [journal]”进行检索。 也可直接输入Medline的期刊标准缩写形式Eur J Immunol ， 或输入该刊的ISSN号（国际标准连续出版物代码）检索，即： 1521-4141。 如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：cancer， science，cell等，PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表 中的主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标准化处理， 即 ： “cell”[journal]或“cell”[ta] 。
如：查找作者为crick在1993年发表的有关DNA方面 的文献。 检索式：DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
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例：查找作者为crick在1993年发表有关DNA方面的文献. 检索式：DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
25
PubMed基本检索 常用检索字段描述和标识(1)
四、PubMed基本检索
•自由词检索 •布尔逻辑检索 •字段限制检索
著者检索 刊名检索 日期或日期范围检索 ……
•截词检索 •强制检索
15
PubMed基本检索
自由词检索
在检索框中键入一个或多个英文单词 （大写或小写均可），点击GO按钮， PubMed系统会自动在主题词表，期刊名 表，短语表及作者索引中查询与输入的词 相匹配的形式，这就是它特有的“自动词 汇匹配功能”。
逻辑或（OR） --检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。 如：A OR B A B
逻辑非（NOT） --在含检索词A的记录中，去掉含检索词B的记录。 如：A NOT B A B
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PubMed基本检索
字段限制检索
采用字段限制方式进行检索，其规则： 检索词 [字段标识] 或 “检索词 ”[字段标识]
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自动词汇匹配
•PubMed对输入检索 框中的检索词进行 智能化地校对，将 其逐步地与其数据 库中的各类术语匹 配的原则。
MeSH Translation Table
主题词注释表
Journals Translation Table
期刊注释表
检索词拆分 AND
Common Phrase List
常用词组表
9
New Data
Collect
Pre-Medline
Process
Medline
PubMed
10
出版商提供的书目信息
出版商提供的是整本期刊的信息，若有
部分没有被MEDLINE收录，PubMed仍保存， 在记录中做如下标记：
[PubMed--as supplied by publisher] 。
Title[ti]：篇名字段 Abstract[ab]：摘要字段 Affiliation [ad]：著者地址字段。 Author name[au]：文章的作者，检索格式：姓+名。如： "smith ja"[au] Journal title[ta]：期刊名称。如：cell[ta] Language[la]：论文出版语种。语种检索时可只输入前3个字母， 如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la]