高等药物化学课程答案最最终版
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1.标准的Hansch方程是。
2.用于测定脂水分配系数P值的有机相溶剂是正辛醇。
3.在电荷丰富的分子与电荷相对缺乏的分子间发生的键合是电荷转移复合物。4.药物从给药到产生药效的过程可分药剂相,药物动力相,药效相三个阶段。
5.根据在体内的作用方式,可把药物分为两大类,一类是结构非特异性药物,另一类是结构特异性药物。
6.药物和受体的分子间相互作用方式有离子键,氢键,离子偶极,偶极-偶极,范德华力,电荷转移复合物,疏水键等。
7.药物的理化性质对药效产生重要影响,影响最重要的三种理化性质是溶解度,分配系数,解离度。
8.Hansch方法常用的三类参数是疏水性参数,电性参数,立体参数。9.在用计算机辅助药物设计研究时,如果能在蛋白库中找到受体的三维晶体结构,一般选择以生物大分子的3D结构为基础的方法方法进行研究
10.在用计算机辅助药物设计研究时,如果受体的三维晶体结构不清楚,可供选择的研究方法有(写出三种):分子形状分析法,距离几何学方法,比较分子场分析法。
11.在研究药物构效关系时,为了延长药物的作用时间一般可引入的最简单的取代基是烷基
14.分析药物的构效关系,如果引入磺酸基一般可使化合物水溶性增加,解离度增加,活性不提高。
15.药物产生药效的决定因素主要有药物的理化性质和药物和受体的相互作用。
1.QSAR :(Quantitative Structure-Activity Relationships )定量构效关系是研究一组化合物的活性或毒性或药代性质与其结构之间、物理化学性质之间或拓扑结构之间的相关的关系,用数理统计的方法揭示化合物活性与上述结构特征或性质的变化规律,并以数学模型或图形表征其间关系的量变规律,并根据信息进一步对药物的化学结构进行优化,是一种新药设计研究方法,是计算机辅助分子设计的一个重要内容。
2.3D QSAR:三维定量构效关系:是引入了分子三位结构信息进行定量构效关系研究的方法。这种方法间接地反映例分子与生物法分子相互作用过程中两者之间的非键相互作用特征,相对于二维定量构效关系有更加明确的无力意义和更丰富的信息量。
是以药物分子和受体分子的三维结构特征为基础,分析结构与生物活性间的定量关系。3.CADD :(Computer-Aided Drug Design )计算机辅助药物设计,是利用计算机的快速计算功能,全方位的逻辑推理功能、一目的图形显示功能,将量子化学、分子力学、药物化学、生物学科、计算机图形学和信息科学等学科交叉融汇结合,从药物分子的作用机理入手来进行药物设计,减少了盲目性,节省了大量的人力和物力。4.CoMFA:(Comparative molecular field analysis )比较分子场分析法,是通过研究
药物的优势构象,用各种立场反应分子的整体性质,建立三维的构效关系。该方法可以设计新的先导化合物。
5.Hansch Analysis :又称线性自由能相关模型。Hansh方程的基本通式是:
Hansch方法主要用于2DQSAR的研究,应用化合物的疏水性参数、电性参数和立体参数表达药物的结构特征,分析结构与生物活性的构效关系。Hansch方法是二维的QSAR研究方法,该方法只考虑了化合物与受体作用的位点,没有考虑化合物与受体(酶)的结合时构象的变化,所有参数只能表达二维意义上的结构特点,不能研究与受体三维空间作用的情况,不能研究药物构象和构型对活性的影响。只用于描述药物分子的二维结构,不能定量地描述三维结构与生物活性间的关系。另外只能优化先导化合物,不能发现先导化合物,这些是Hansch方法的主要缺陷。
6.Pharmacophore:药效团,所谓药效团是与特定的生物靶标产生适宜的相互作用,从而引发或阻断生物效应所必需的立体和典型特征的集合,换言之,药效团是产生特定药理作用所必需的物理化学特征及其在空间的分布。药效团是一个抽象的概念,不是具体的分子,而是一组离散的物理化学特征,分布在空间的特定位置。对于与特定靶标结合的药效团,特征之间的距离大致固定在一定的范围。作用于不同靶标的药效团是不同的,有不同的物化特征,距离也不相同。
7.Pharmacophoric conformation:药效构象,当药物分子与受体相互作用时,药物与受体互补并结合时的构象,称为药效构象。药效构象并不一定是药物的优势构象,不同构象异构体的生物活性也有差异。
关于药物作用生物学知识
1.生物大分子结构方面的特征与共性有哪些?
结构方面:1、具有多种单体的共聚物。包括蛋白质多肽链的一级结构、DNA和RNA多聚核苷酸链的一级结构、多糖。
2、具有多层次结构。包括蛋白质的三维空间结构、DNA和RNA的三维空间结构。
3、生物高分子结构的可变性。包括一级结构的改变、高级结构的改变、结构可变性的限度。
2.生物大分子功能方面的特征与共性有哪些?
功能方面:1、作用的专一性。生物大分子在机体内行使各种各样的功能,参加各种反应,它们所行使的功能和参加的反应都有高度专一性
2、作用的配合和协调。生物大分子中的亚基之间或同一个分子中不同区域间都
相互联系,生物体内的成千上万的生物大分子更是相互配合,彼此统一。
3.试述药物-受体相互作用的化学键类别及特点。
1离子键
构成蛋白质和多肽的酸性氨基酸残基如天冬氨酸和谷氨酸在形成肽键后仍有游离羧基,在生理PH条件下部分离解成负离子;碱性氨基酸残基如赖氨酸和精氨酸的游离氨基酸质子化成正离子;核酸的磷酸基具有负电荷。这些离子可与含有相反电荷的药物分子(持久性电荷如季氨离子和磺酸基,部分离解性基团如羧酸和氨基等)可生成离子-离子相互作用。2离子-偶极作用
金属蛋白酶的活性中心如锌离子可与负电荷的未偶电子对配位结合,例如与巯基、咪唑环或羟肟酸等结合,这些基团在金属蛋白酶与抑制剂形成复合物中起重要作用
3偶极-偶极作用
偶极-偶极作用能与距离的三次方成反比,其作用低于离子-偶极作用,但因受体和药物分子中元素电负性的差异,广泛存在游偶极键,所以这类作用的总和是相当可观的,对识别和结合的特异性有重要的贡献
4诱导作用
药物与受体的识别和形成复合物常常伴有电荷的重新分布,这种分布包括诱导极化(分子内)和电荷转移(分子间),其结果是增强了药物与受体的吸引做哟哦难过。例如叶酸与二氢叶酸还原酶的识别和结合过程是部分电荷从蝶啶环移向谷氨酸基上,导致电荷密度发生重要变化,有利于双键的还原
5氢键作用
DNA维持双螺旋的结构是通过腺嘌呤A与胸腺嘧啶T间形成两个氢键,鸟嘌呤G与胞嘧啶C间形成三个请柬;维持蛋白质α螺旋或β片层是靠酰胺中的氧与另一残基H-N氢之间形成氢键。
6电荷转移作用
电荷转移的能力与给体的电离势或最高占据轨道和接受体的电子亲和力或最低空轨道之差值成正比,相差越大,转移能越强
7螯合作用
螯合环最常见和稳定的是五元环合六元环,含硫的四元螯合物也是稳定的,三元螯合环确实很难形成。体内有许多可发生螯合作用的物质,如氨基酸、蛋白质和三羧循环中某些羧酸等都是良好的配体。体内存在的可螯合的金属离子有铁、镁、铜、锰、锌和钴等,它们是血红蛋白和许多酶系的必需的辅基。
4.如何理解药物与受体的互补性?
互补性是药物与受体分子中各基团和原子的空间排列与构象互补。药物与受体的互补性程度越大,则其特异性越高,作用越强,该互补性随着药物-受体复合物的形成而增高。分子中取代基的改变,不对称中心的转换引起基团的空间排列或分子内偶极方向的改变,均能强烈的改变药物-受体复合物的稳定性,进而影响药效的强弱。
1)、受体与配体结合具有可逆性。
2)、受体与配体结合有高度的特异性。
3)、受体与配体结合有高度的亲和力(低浓度的配体就可激活受体)。