适用于转录组测序的灰毡毛忍冬体胚总RNA提取方法筛选

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适于转录组测序的枣不同器官总RNA提取方法筛选

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适于转录组测序的枣不同器官总ＲＮＡ提取方法筛选
魏琦琦ｌａ－ｃ冯延芝，林青ｌａ－ｃ，贾宝光ｌａ－ｃ张琳ｈ
（１．中南林业科技大学ａ．经济林育种与栽培国家林业局重点实验室；ｂ．经济林培育与保护省部共建教育部重点
ＰｒｏｔｅｃｔｉｏｎｆｏｒＮｏｎ．ＷｏＯｄＦｏｒｅｓｔＴｒｅｅｓｏｆＥｄｕｃａｔｉｏｎＭｉｎｉｓｔｒｙ；Ｃ．２０１１ＣｏｏｐｅｒａｔｉｖｅＩｎｎｏｖａｔｉｏｎＣｅｎｔｅｒｏｆＣｕｌｔｉｖａｔｉｏｎａｎｄＵｔｉｌｉｚａｔｉｏｎｏｒｆＮｏｎ — ＷｏｏｄＦｏｒｅｓｔＴｒｅｅｓｏｆＨｕｎｎａＰｒｏｖｉｎｃｅ．ＣｅｎｒｔａｌＳｏｕｔｈＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙ＆Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｃｈａｎｇｓｈａ４１０００４，Ｈｕｎｎ，ａＣｈｉｎａ；２．ＴｈｅＣｅｎｔｅｒｏｆＲｅｓｅａｒｃｈｎｄａＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｆｏｒＮｏｎ－ｗｏｏｄＦｏｒｅｓｔＴｒｅｅ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆ
了Ａｍｂｉｏｇｅｎ和Ａｕｔｏｌａｂ２种总ＲＮＡ提取试剂盒和基于Ａｕｔｏｌａｂ试剂盒改良的ＣＴＡＢ法的总ＲＮＡ的提取效果。

植物总rna提取试剂

植物总rna提取试剂植物总RNA提取试剂是一种用于从植物组织中提取总RNA的试剂盒。

总RNA是植物细胞中的一个重要组成部分，可以用于基因表达研究、转录组学和其他分子生物学研究。

本文将介绍植物总RNA提取试剂的原理、操作流程、优缺点以及注意事项。

一、植物总RNA提取试剂的原理植物总RNA提取试剂通过破碎细胞壁和细胞膜，溶解蛋白质，并在碱性条件下使DNA和RNA不同程度地溶解从而实现总RNA的提取。

它通常包括下述主要步骤：1.细胞破碎：将植物样品研磨或经过冻融循环处理，释放细胞。

2.蛋白质沉淀：添加试剂进行蛋白质沉淀，将细胞残渣上清液中的蛋白质沉淀下来。

3. RNA沉淀：通过加入酒精等试剂使RNA从上清液中沉淀下来。

4.清洗：用特定的试剂将沉淀洗涤，去除污染物。

5.溶解：加入溶剂溶解沉淀，得到纯度较高的总RNA。

二、植物总RNA提取试剂的操作流程1.准备样品：收集新鲜的植物组织，将其迅速冷冻在液氮中，然后使用试剂研磨或液氮研磨法将其破碎。

2.加入试剂：向研磨好的样品中加入试剂，根据试剂盒的要求进行操作。

3.离心：离心样品，以将细胞碎片和蛋白质沉淀分离。

4.沉淀RNA：将上清液转移至新的离心管中，加入酒精等试剂，使RNA沉淀下来。

5.清洗：用特定的试剂洗涤RNA沉淀，去除杂质。

6.溶解：使用特定的溶剂将RNA沉淀溶解，使其完全溶解。

7.检测：采用比色法、荧光法或电泳等方法对提取得到的RNA进行定量和质量检测。

三、植物总RNA提取试剂的优缺点1.优点：-操作简单，不需要复杂的仪器和设备。

-高效提取总RNA，得到纯度较高的RNA。

-可以快速提取大量的样品。

-可以适用于多个植物种类和组织类型。

2.缺点：-可能存在某些试剂无法完全溶解质体等问题。

-部分试剂存在对环境的污染隐患。

四、植物总RNA提取试剂的注意事项1.使用新鲜的植物组织进行提取，以确保RNA的质量和完整性。

2.严格按照试剂盒的说明进行操作，不要改变试剂的使用顺序或添加量。

RNA测序数据的分析方法与挖掘技术综述

RNA测序数据的分析方法与挖掘技术综述一、引言随着高通量测序技术的发展，RNA测序已经成为研究转录组的重要手段之一。

通过对RNA测序数据的分析与挖掘，可以揭示基因的表达模式、剪接变异、转录因子调控等信息，为生物学研究和医学应用提供重要的基础数据。

本综述将对RNA测序数据的分析方法与挖掘技术进行综合总结，并探讨相关研究的应用前景。

二、RNA测序数据分析的基本流程RNA测序数据的分析主要包括数据质控、比对、表达量差异分析、功能注释、基因剪接分析等步骤。

首先，对测序数据进行质控，包括去除低质量序列、去除接头序列、去除PCR复制、过滤低质量reads等，确保数据的可靠性。

然后，将得到的测序reads与参考基因组序列或转录组序列比对，以确定每个read的来源。

比对之后，可以通过表达量分析来探究基因的差异表达，常见的方法包括计算基因的FPKM值、TPM值等。

此外，还可以进行差异剪接分析、富集分析、通路分析等以获得更丰富的信息。

三、RNA测序数据分析中的关键技术1. 比对技术比对是RNA测序数据分析中的关键步骤之一。

常用的比对算法有Bowtie、TopHat、HISAT2等，它们根据不同的算法原理和性能特点适用于不同的数据类型和研究问题。

此外，对于转录组水平的分析，还可以使用比对到转录组序列库的方法，例如STAR、Salmon等。

2. 差异表达分析差异表达分析是RNA测序数据分析中的重要任务，可以用来筛选出在不同组间表达差异显著的基因。

常见的差异表达分析方法包括DESeq、edgeR、limma等，它们根据不同的假设模型和统计方法，对表达数据进行正态化、方差稳定化和差异显著性检验，从而找出差异表达的基因。

3. 基因剪接分析基因剪接是转录过程中的重要调控机制之一。

通过RNA测序数据，可以对基因的剪接事件进行定量和定性分析，揭示剪接形式的多样性和功能特征。

常见的基因剪接分析工具有JunctionSeq和SUPPA等，它们根据测序reads跨越剪接位点的情况，对剪接事件进行检测和定量分析。

转录组测序的流程

转录组测序的流程转录组测序是一种用于研究RNA转录本的高通量测序技术，它可以帮助科研人员了解生物体内部的基因表达情况，从而揭示基因调控、代谢途径等重要生物学过程。

本文将介绍转录组测序的流程，包括样本准备、RNA提取、建库、测序和数据分析等步骤。

1. 样本准备。

转录组测序的第一步是样本准备，样本的选择和处理对后续的实验结果至关重要。

首先需要确定研究的对象，是细胞、组织还是整个生物体，然后采集样本并进行保存。

在采集样本的过程中，需要注意避免RNA的降解和污染，可以使用RNAlater等试剂来稳定RNA。

此外，还需要记录样本的相关信息，如采集时间、处理方法等。

2. RNA提取。

RNA提取是转录组测序的关键步骤，它可以从样本中纯化出RNA，并去除DNA、蛋白质和其他杂质。

常用的RNA提取方法包括酚/氯仿法、硅胶柱法和磁珠法等。

在进行RNA提取时，需要注意保持样本的完整性和纯度，避免外源性RNA的污染。

此外，还需要对提取得到的RNA进行定量和质量检测，确保其可以用于后续的实验。

3. 建库。

建库是将提取得到的RNA转录本转化为可以进行测序的DNA文库的过程。

建库的关键步骤包括RNA的反转录、cDNA合成、末端修复、连接接头、文库扩增和纯化等。

在建库的过程中，需要注意避免外源DNA的污染，确保文库的纯度和完整性。

此外，还需要对建库得到的DNA文库进行定量和质量检测，以确保其可以用于高通量测序。

4. 测序。

建库完成后，就可以进行高通量测序了。

目前常用的转录组测序技术包括RNA-seq和全长转录组测序。

RNA-seq可以对RNA转录本进行定量和差异表达分析，全长转录组测序可以获取RNA的全长序列信息。

在进行测序时，需要选择合适的测序平台和测序深度，确保可以获得足够的数据量用于后续的数据分析。

5. 数据分析。

测序数据的分析是转录组测序的最后一步，它包括数据的质控、比对、表达定量和差异分析等。

在进行数据分析时，需要选择合适的分析软件和算法，对数据进行准确的处理和解释。

灰毡毛忍冬DNA不同提取方法的比较试验

摘
要：以灰毡毛忍冬新品种——金翠蕾为试验材料，比较分析了ＳＳ法、ＴＢ法、良ＣＡＤＣＡ改ＴＢ法对金银花总ＤＡＮ
提取的效果。结果表明：用以上３种方法均能提取出完整的金银花基因组ＤＡ，ＤＡ提取量从大到小依次为利Ｎ而Ｎ
维普资讯
湖南林业科技２０年第３卷第２０８５期
砷奔报告
灰毡毛忍冬ＤＡ不同提取方法的比较试验Ｎ
李俊彬王晓明，，王平李永欣，，曾慧杰吴玲娜，
（．１中南林业科技大学。湖南长沙４００；２湖南省林业科学院。１０４．湖南长沙４００）１０４
２Ｈｕａｏｅｔａｅ，Ｃａｇｈ１０４，Ｃｉａ．ｎＦｒｓｙＡｃｄｍｙｈｎｓａ４００ｎｒｈｎ）
Ａｂｔａｔｓｎｅｎｗｓｅｉｓｏｓｒｃ：Ｕｉｇｔｅｐｃｅｆ厶ｍａｒｎｈｉｅ “ ｏｄｎｇｅｎ” ａｅｔｍａｅｉｌｈｆｃｓｏＡｘｒｃｉｎｏｈｃａｔｏｄｓｇｌｅ — ｒｅｓｔｓｔｒ，ｔｅｅｅｔｆＤＮｅｔａｔｆ厶ａｏｍａｒｎｃａ－
ＳＳ法、良ＣＡＤ改ＴＢ法、ＴＢ法，ＮＣＡＤＡ纯度依次为ＣＡＴＢ法、良ＣＡ改ＴＢ法、ＤＳＳ法。ＣＡＴＢ法是灰毡毛忍冬ＤＡ提取Ｎ
的适宜方法。
关键词：毡毛忍冬；Ｎ灰ＤＡ提取；ＩＳＳＲ—ＰＲＣ中图分类号：４Ｑ３１文献标识码：Ａ文章编号：１０ — ７０２０）２０１— ２０３５１（０８０ — ０５０

天女木兰不同组织总RNA提取方法的筛选与优化

天女木兰不同组织总RNA提取方法的筛选与优化侯哲;陆秀君;张晓林;梅梅;魏俊;李昂【摘要】Six extraction methods, including modiifed CTAB, Trizol, modiifed Trizol, TIANGEN extraction kit, were studied in the RNA extraction from Magnolia sieboldii buds, leaves, mature leaves, flower buds, petals and seeds. Integrity, purity and concentration of total RNA were examined by agarose gel electrophoresis and nucleic acid analyzer. Of these six methods, the method of modiifed Trizol was better for buds isolation, the method of modiifed CTAB was better for lfower buds and petals isolation, Trizol method can be used to extract mature leaves, while the RNA extracted by TIANGEN kit is effective to the leaves and seeds. High quality total RNA obtained by different extraction methods through RT-PCR analysis indicated that the RNA satisifed the standard for gene cloning and other molecular biological experiments.%试验以天女木兰叶芽、幼叶、成熟叶、花芽、花瓣、种子为材料，分别采用Trizol法、改良Trizol法、CTAB-异丙醇法、CTAB-NaAc和无水乙醇法、CTAB-LiCl法、天根试剂盒法对其各器官进行总RNA的提取。

rna测序思路

rna测序思路RNA测序是一种基于高通量测序技术研究转录组的方法，可以快速获取一个基因组中RNA的种类和数量。

以下是RNA测序的基本思路：1. 样品准备：选择适当的生物样品，如细胞、组织或血液等，根据研究目的和问题来选择。

样品需要经过适当处理以提取出RNA。

2. RNA提取：这是RNA测序的第一步，目的是从样品中提取出RNA分子。

常用的方法有酚-氯仿法、磁珠法、柱子法等。

这一步的目的是去除样品中的DNA、蛋白质和其他杂质，以便进行后续的测序。

3. RNA纯化：提取到的RNA可能会伴随着DNA、蛋白质和其他杂质，需要进行纯化以去除这些杂质。

常用的方法有RNA酶消化、硅胶柱纯化等。

纯化后的RNA 质量对后续的测序结果有很大影响。

4. cDNA合成：由于RNA是单链分子，为了进行测序，需要将其转录成双链DNA，即合成互补DNA（cDNA）。

这一步通常使用反转录酶将RNA作为模板合成cDNA。

5. 文库构建：将cDNA片段连接到测序载体上，构建测序文库。

这一步需要进行末端修复、连接接头、PCR扩增等处理，最终构建成文库。

6. 测序：构建好的文库通过高通量测序技术进行测序。

常用的测序方法有第一代测序技术（Sanger测序）和第二代测序技术（如Illumina测序）。

测序过程会产生大量的原始数据，需要进行后续的数据分析。

7. 数据分析：测序得到的数据需要进行质控、序列比对、注释和差异表达分析等一系列的数据分析步骤。

这些分析可以帮助研究者了解RNA的组成、表达水平和功能等信息。

数据分析是RNA测序的关键步骤，涉及多个复杂的过程和技术。

通过以上步骤，研究人员可以获得基因组中RNA的种类和数量信息，进一步了解基因的表达水平和功能状态。

这有助于揭示基因的表达模式、基因融合、突变和差异表达等方面的信息，为深入探究生命过程和疾病机制提供有力支持。

灰绿藜rna提取方法及在cdna文库构建中的应用

灰绿藜rna提取方法及在cdna文库构建中的应用灰绿藜（C enc alium lute um）是分布在中国和日本的一种高维藜科植物，最近被发现具有抗肿瘤、抗衰老以及抗氧化等生物活性。

为了研究其种内的遗传多样性，了解其生物学功能，以及进行更深入的研究，我们将建立cDNA文库，开展转录组学研究。

RNA提取是mRNA文库构建的前提，也是灰绿藜转录组学研究的重要步骤。

RNA提取是一种技术，可以从植物或动物组织中提取细胞质性的mRNA或其他 RNA 分子。

灰绿藜的RNA提取主要使用Trizol法或Cetyltrimethylammonium bromide (CTAB)法。

Trizol法是一种常见的RNA提取方法，它使用两种溶剂，即琼脂糖正电子溶液sloution和氯仿正电子溶液chloroform。

这种方法可以保护非结构RNA，如mRNA，但不适用于灰绿藜。

为了提取其细胞质RNA，可以使用CTAB提取法。

它使用CTAB作为提取剂，可用于保护所有RNA类型，并可以提供高纯度的RNA分子。

一旦完成了RNA提取，我们就可以进行cDNA文库的构建。

首先，可以使用reverse transcriptase将细胞质的mRNA转录为cDNA，然后用消除反义序列（DSR）来筛选只包含正义序列（POS）的cDNA，在此之后可以使用合成DNA来克隆POS序列，最后通过PCR扩增clones然后测序得到文库。

通过以上方法，我们可以建立灰绿藜的cDNA文库，将可以深入探索其生物学功能。

cDNA文库的构建还可以帮助我们更好地理解灰绿藜的遗传多样性，从而为灰绿藜的育种提供科学依据。

总之，灰绿藜RNA提取和cDNA文库构建是非常重要的步骤，为灰绿藜的生物活性研究和育种提供了有力的技术支持。

circrna筛选方法

circrna篩選方法标题：circRNA筛选方法：探索非编码RNA的研究策略在生物科学领域，环状RNA（circRNA）作为一种重要的非编码RNA分子，近年来引起了广泛关注。

circRNA具有稳定的环状结构，参与基因表达调控、疾病发生等多种生物过程。

为了深入研究circRNA的功能和机制，筛选高效、准确的circRNA成为科研工作的重要一环。

本文将详细介绍几种常见的circRNA筛选方法。

一、基于生物学信息的筛选方法1.生物信息学分析：通过高通量测序技术获得转录组数据，利用生物信息学软件进行circRNA的预测和筛选。

常用的软件有CIRCexplorer、find_circ 等。

此方法可快速发现大量候选circRNA，为进一步实验验证提供依据。

2.基因组浏览器：利用基因组浏览器（如UCSC Genome Browser）对已知circRNA的基因组位置进行检索，分析其与疾病相关的基因、miRNA等分子间的相互作用，从而筛选出具有潜在研究价值的circRNA。

二、基于实验技术的筛选方法1.Northern Blot：通过Northern Blot技术检测特定circRNA在组织或细胞中的表达水平，从而筛选出感兴趣的目标circRNA。

此方法具有较高的灵敏度和准确性，但操作复杂、成本较高。

2.实时荧光定量PCR（qPCR）：利用qPCR技术对候选circRNA进行定量分析，筛选出表达量较高或具有显著差异的circRNA。

qPCR操作简便、成本低，适用于大量样本的筛选。

3.RNA干扰（RNAi）：通过RNAi技术敲低候选circRNA的表达，观察细胞或生物体的表型变化，从而筛选出具有生物功能的circRNA。

三、基于生物功能的筛选方法1.功能缺失实验：通过基因敲除或基因编辑技术抑制circRNA的表达，观察细胞或生物体的生理、病理变化，筛选出具有潜在功能的circRNA。

2.功能获得实验：通过过表达circRNA，观察细胞或生物体的表型变化，筛选出具有生物功能的circRNA。

灰毡毛忍冬组培苗生根过程中内源生长调节剂的变化

灰毡毛忍冬组培苗生根过程中内源生长调节剂的变化
灰毡毛忍冬是一种常见的中药材，其扦插繁殖效率较低，组培生根技术是一种能够快
速扩繁该植株的方法。

本实验研究了灰毡毛忍冬组培苗生根过程中内源生长调节剂的变
化。

实验选取了灰毡毛忍冬初生叶为外植体，用MS培养基进行愈伤组织培养，经过愈伤诱导和增殖后，将愈伤组织进行切割，得到了组培苗。

将组培苗移植到含有不同浓度NAA或IBA的半固体MS培养基上进行生根实验，同时采集生根前后的组织进行内源生长调节剂的分析。

实验结果显示，在组培苗生根过程中，NAA和IBA的处理对生根率和根长有显著影响。

在NAA处理下，随着NAA浓度的增加，生根率和根长均呈先增加后降低的趋势，并在1
mg/L时达到最高值。

而在IBA处理下，生根率和根长在2 mg/L时达到了最高值。

进一步地，本实验研究了组培苗生根前后植物内源生长调节剂的含量变化，并发现了
一些有趣的结果。

在生根前，细胞分裂素（cytokinin，CK）的含量显著高于吲哚乙酸（indole-3-acetic acid，IAA）和赤霉素（gibberellin，GA），而在生根后，CK的含量显著降低，而IAA和GA的含量则明显上升。

这表明，在组培苗生根过程中，植物内源生长调节剂的含量发生了明显的变化，其中IAA和GA的协同作用可能对组培苗的生根有重要作用。

综上所述，本实验研究了灰毡毛忍冬组培苗生根过程中内源生长调节剂的变化，并发
现了一些有趣的结果。

这些研究成果为进一步研究该植物的生长发育提供了参考。

转录组测序中提取微生物的方法

转录组测序中提取微生物的方法下载提示：该文档是本店铺精心编制而成的，希望大家下载后，能够帮助大家解决实际问题。

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适用于转录组测序的人参根总RNA提取方法的筛选

适用于转录组测序的人参根总RNA提取方法的筛选王颖芳;陈艳琳;王文娟【期刊名称】《广东药科大学学报》【年(卷),期】2017(033)001【摘要】目的筛选适用于转录组测序的人参根组织总RNA提取方法.方法以15年生长白山人参为研究对象,比较RNAiso Plus法、Trizol法、改良CTAB法、植物总RNA提取试剂盒、多糖多酚总RNA提取试剂盒（RNA prep Pure Plant Kit）提取人参根组织总RNA,利用琼脂糖凝胶电泳、Aligent 2100 Bioanalyzer对5种方法提取的总RNA进行质量检测.结果 Trizol法和RNAiso Plus法均能提取到总RNA,1%琼脂糖凝胶电泳显示28S、18S条带清晰稳定,D（γ）260 nm/D（γ）280 nm和D（γ）260 nm/D（γ）230 nm值均在2.0左右.Trizol试剂法提取总RNA的28S条带亮度明显高于18S,所得RNA浓度达485.66 ng/μL,经Aligent 2100 Bioanalyzer检测,28S条带亮度是18S的2倍.RNA prep Pure Plant Kit试剂盒及植物总RNA提取试剂盒提取RNA的条带模糊、弥散,RNA降解严重.改良CTAB法无法完成人参根组织总RNA的提取.结论 Trizol试剂法提取的人参根组织总RNA浓度、纯度及完整性与其他方法相比效果最佳,能满足转录组测序的要求,是人参根组织总RNA提取的首选方法.【总页数】5页(P18-22)【作者】王颖芳;陈艳琳;王文娟【作者单位】广东药科大学中药学院,广东广州510006【正文语种】中文【中图分类】R282.2【相关文献】1.适用于基因全长克隆的灰毡毛忍冬不同器官总RNA提取方法筛选2.适用于转录组测序的人参根总RNA提取方法的筛选3.适用于转录组测序的棉花幼根总RNA 提取方法筛选4.适于转录组测序的枣不同器官总RNA提取方法筛选5.适用于转录组测序的灰毡毛忍冬体胚总 RNA提取方法筛选因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

适用于转录组测序的大豆根总RNA的提取方法研究

适用于转录组测序的大豆根总RNA的提取方法研究谢钰珍;覃鸿妮;张宇;梅啸;吴凡【摘要】[目的]获得高质量、高产量并能满足转录组测序要求的大豆根总RNA.[方法]比较分析了Trizol法、CTAB-LiCl法和试剂盒法的提取效果.[结果]3种方法均能从大豆根中提取出总RNA.但与Trizol法、CTAB法相比,试剂盒法提取的大豆根总RNA纯度高、完整性好,平均浓度达413.9ng/μL,A260/A280≈2.14,A260/A230≈2.10,方法可重复性好.[结论]试剂盒法提取的RNA满足转录组测序的质量要求,可进行后续的转录组测序和其他分子生物学相关研究工作.%[Objective] To obtain total RNA from soybean roots with high quality,high yield and to meet the transcription group sequencing requirements.[Method]Three extracting effects were compared,including Trizol reagent,CTAB-LiCl method and Kit method.[Result] All three methods can extract total RNA from soybean.However,the extraction kit was the best with high purity and integrity RNA.The average concentration was 413.9 ng/μL,A260/A280 was approximately 2.14,A260/A230 was 2.10 by using extraction kit,which was repeatable.[Conclusion]The RNA extracted by Kit method meets the quality requirements for transcriptome sequencing and can be used for subsequent RNA-seq and other molecular biology-related studies.【期刊名称】《安徽农业科学》【年(卷),期】2017(045)036【总页数】3页(P137-139)【关键词】大豆;根;总RNA;转录组测序;提取方法【作者】谢钰珍;覃鸿妮;张宇;梅啸;吴凡【作者单位】苏州工业园区服务外包职业学院,江苏苏州215123;苏州工业园区服务外包职业学院,江苏苏州215123;金唯智(苏州)生物科技有限公司,江苏苏州215123;苏州工业园区服务外包职业学院,江苏苏州215123;苏州工业园区服务外包职业学院,江苏苏州215123【正文语种】中文【中图分类】S188从植物组织中提取质量高、纯度高、完整性好的RNA是植物分子生物学研究的基本技术之一。

适合转录组测序的葡萄叶片总RNA试剂盒提取法的改进

适合转录组测序的葡萄叶片总RNA试剂盒提取法的改进杨晓燕;张波;黄方爱;颜欢;李月荣;郑秋生【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2013(000)006【摘要】RNA试剂盒法是获取植物高质量RNA样品的常用技术,针对3种常见RNA提取试剂盒在红地球葡萄叶样品RNA提取效果进行评估和优化,以期找到适合红地球葡萄叶片RNA表达谱测序需求的高质量RNA提取策略.试验依据3种试剂盒推荐时间和条件进行RNA提取,并对时间等条件进行优化,比对了优化前后RNA质量.结果显示,试剂盒经优化后的方法提取的RNA收率高,完整性好,OD260/OD280在1.8-2.2之间,OD260/OD230大于2,28S与18S条带清晰完整,RNA-Seq测序质量及基因覆盖度符合要求.在红地球葡萄叶片上的RNA提取结果表明,延长提取试剂与样品的接触时间操作可以显著提高RNA提取质量(纯度/完整性).【总页数】6页(P215-220)【作者】杨晓燕;张波;黄方爱;颜欢;李月荣;郑秋生【作者单位】石河子大学药学院,石河子832002;石河子大学药学院,石河子832002;省部共建新疆特种资源植物药重点实验室,石河子832002;石河子大学药学院,石河子832002;石河子大学药学院,石河子832002;石河子大学药学院,石河子832002;省部共建新疆特种资源植物药重点实验室,石河子832002【正文语种】中文【相关文献】1.适用于转录组测序的大豆根总RNA的提取方法研究 [J], 谢钰珍;覃鸿妮;张宇;梅啸;吴凡2.适合软枣猕猴桃花蕾转录组测序的总 RNA 提取方法研究 [J], 李晓艳;张庆田;王振兴;秦红艳;艾军3.葡萄叶片中提取总RNA的三种方法比较 [J], 杨晓燕;张波;黄方爱;颜欢;李月荣4.适合转录组测序的芒果不同组织\rRNA试剂盒提取方法研究 [J], 张宇;黄国弟;莫永龙;龙凌云;张继;唐玉娟5.适用于转录组测序的大蒜花器官总RNA的提取方法 [J], 陈雅楠; 尚云涛; 范宝莉; 刘晓颖; 曹宝鑫; 王振英因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

适合金银花不同组织总RNA提取方法的筛选

适合金银花不同组织总RNA提取方法的筛选
易刚强;蔡嘉洛;朱贻霖;张亚利;刘峰;刘湘丹;高昱;童巧珍
【期刊名称】《江苏农业科学》
【年(卷),期】2016(44)8
【摘要】对Trizol法、CTAB法、十二烷基磺酸钠( SDS)法、多糖多酚试剂盒法、改良多糖多酚试剂盒法5种RNA提取方法提取金银花叶片、茎、根、花蕾组织RNA的效果进行比较,以期获得质量较好的金银花不同器官的RNA,为后续分子生
物学试验奠定基础。

结果表明：改进后的多糖多酚试剂盒法能够克服金银花中RNA提取难度大的问题,能够提取到质量、产量都很高的RNA,且稳定性好、无DNA污染,可以满足进一步的半定量反转录PCR( RT-PCR)等试验需要。

【总页数】3页(P63-65)
【作者】易刚强;蔡嘉洛;朱贻霖;张亚利;刘峰;刘湘丹;高昱;童巧珍
【作者单位】湖南中医药大学，湖南长沙410208;湖南中医药大学，湖南长沙410208;湖南中医药大学，湖南长沙410208;湖南中医药大学，湖南长沙410208;湖南省农业科学院，湖南长沙410000;湖南中医药大学，湖南长沙410208;湖南
中医药大学，湖南长沙410208;湖南中医药大学，湖南长沙410208
【正文语种】中文
【中图分类】S184
【相关文献】
1.天女木兰不同组织总RNA提取方法的筛选与优化
2.适用于基因全长克隆的灰毡毛忍冬不同器官总RNA提取方法筛选
3.适于转录组测序的枣不同器官总RNA提取方法筛选
4.一种适合三七多种组织的总RNA提取方法
5.一种适合葡萄多种组织的总RNA提取方法
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一种适合三七多种组织的总RNA提取方法

一种适合三七多种组织的总RNA提取方法
郭会娜
【期刊名称】《江西农业》
【年(卷),期】2016(0)10
【摘要】为了寻求三七组织中总RNA提取的有效方法,以三七多种组织为试验材料,采用改良Trizol法对总RNA提取方法进行了研究,建立了一套适合三七根部、茎部、种子等多种组织总RNA提取的方法.结果表明,该方法在三七多种组织中均能获得高质量的RNA,OD260/OD280=1.8~1.9,电泳结果显示,所得RNA完整性好,无降解.
【总页数】2页(P75-76)
【作者】郭会娜
【作者单位】右江民族医学院基础医学院广西高校右江流域特色民族药研究重点实验室 533000
【正文语种】中文
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（ＨｕｎａｎＡｃａｄｅｍｙｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙ。Ｃｈａｎｇｓｈａ４１０００４，Ｃｈｉｎａ）
Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｉｎｏｒｄｅｒｔｏｉｆｎｄｏｕｔｍｉｃｒｏ－ｓｐｏｒｅｅｘｔｒａｃｔｉｎｇｍｅｔｈｏｄｓｕｉｔａｂｌｅｆｏｒｔｒａｎｅｒｓｉｐｔｏｍｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ．ｔｈｉｓｓｔｕｄｙｔｏｏｋｓｏ．
适用于转录组测序的灰毡毛忍冬体胚总ＲＮＡ
提取方法筛选
乔中全，王晓明，陈建军，曾慧杰，李永欣，蔡能
（湖南省林业科学院，湖南长沙４１０００４）
摘
要：为了找到适用于转录组测序要求的灰毡毛忍冬体胚总ＲＮＡ的提取方法，以体胚发育过程中的球形胚、
ｍｅｔｈｏｄ．ＴｈｅｒｅｓｕｌｔｓｓｅｗｈｅｄｔｈａｔＲＮＡｃｏｎｃｅｎｔｒａｉｔｏｎｓｅｘｔｒａｃｔｅｄｂｙｉｍｐｒｏｖｅｄＣＴＡＢｍｅｈｏｔｄｗｅｅｒｌｏｗｅｒ，ａｎｄｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ－
第４２卷，第６期
２０ｌ５年１２月 Nhomakorabea湖南林业科技
ＨｕｎａｎＦｏｒｅｓｔｒｙＳｃｉｅｎｃｅ＆Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ
Ｖｏ１．４２．Ｎｏ．６
Ｄｅｃ．
．
，
２０１５
ｆｏｒｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ
ＱＩＡＯＺｈｏｎｇｑｕａｎ，ＣＨＥＮＪｉａｎｊｕｎ，ＷＡＮＧＸｉａｏｍｉｎｇ，ＺＥＮＧＨｕｉｊｉｅ，ＬＩＹｏｎｇｘｉｎ，ＣＡＩＮｅｎｇ
ＲＮＡｅｘｔｒａｃｉｔｏｎｅｆｅｃｔｓｂｙ３ｄｉｆｅｒｅｎｔｍｅｔｈｏｄｓ：ＥＡＳＹｓｐｉｎＰｌｕｓｍｅｈｏｔｄ，ＲＮＡＣｌｅｎｕａｐＫｉｔｍｅｈｏｔｄ，ｉｍｐｏｖｒｅｄＣＴＡＢ
ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００３ — ５７１０．２０１５．０６．０１９
ＳｃｒｅｅｎｉｎｇｏｆｍｅｔｈｏｄｓｔｏｅｘｔｒａｃｔｔｏｔａｌＲＮＡｆｒｏｍｍｉｃｒｏ－ｓｐｏｒｅｏｆｓｏｍａｔｉｃｅｍｂｒｙｏｓｏｆＬｏｎｉｃｅｒａｍａｃｒａｎｔｈｏｉｄｅｓＨａｎｄ．－Ｍａｚｚ
心形胚、鱼雷胚和子叶胚为实验材料，比较分析了ＥＡＳＹｓｐｉｎＰｌｕｓ植物ＲＮＡ快速提取试剂盒法、ＲＮＡＣｌｅａｎｕｐＫｉｔ试剂盒法及改良ＣＴＡＢ法３种方法的ＲＮＡ提取效果。结果表明：改良ＣＴＡＢ法提取的ＲＮＡ浓度较低，提取过程中发生降解；ＲＮＡＣｌｅａｎｕｐＫｉｔ试剂盒法提取的ＲＮＡ完整性较差，ＲＩＮ值没能达到转录组测序的要求。ＥＡＳＹｓｐｉｎＰｌｕｓ植物ＲＮＡ快速提取试剂盒法提取的ＲＮＡ质量最高，且完整性好，能够满足转录组测序的要求。关键词：灰毡毛忍冬；体胚；ＲＮＡ提取；转录组测序中图分类号：Ｑ９４９．７８１．２文献标识码：Ａ文章编号：１００３ — ５７１０（２０１５）０６ — ００９９ — ０３
ａｐｐｅａｒｅｉｎｄｅｘｔｒａｔｉｏｏｎｐｒｏｃｅｓｓ．ＩｎｔｅｇｒｉｔｙｏｆＲＮＡｅｘｔａｃｒｔｅｄｂｙＲＮＡＣｌｅａｎｕｐＫｉｔｍｅｔｈｏｄｗａｓｂａｄ，ａｎｄｔｈｅＲＩＮｖａｌｕｅｉｄｄ
ｅｍｂｒｙｏ，ｈｅａｒｔｓｈ印ｅｄｅｍｂｒｙｏ，ｔｏｒｐｅｄｏｅｍ］３ｙｒｏａｎｄｅｍｂｙｏｒａｓｒｅｓｅａｒｃｈｏｂｊｅｃｔ．Ｔｈｉｓｓｔｕｄｙｃｏｍｐａｒｅｄｎｄａｎａａｌｙｚｅｄｔｈｅ
ｍａｔｉｃｅｍｂｒｙｏｓｏｆＬｏｎｉｃｅｒａｍａ￣ａｎｔｈｏｉｄｅｓＨａｎｄ．一Ｍａｚｚ．ａｓｅｘｐｅｉｒｍｅｎｔａｌｍａｔｅｒｉａｌａｎｄｍｉｃｒｏ－ｓｐｏｒｅｉｎｄｕｃｅｄｗｉｔｈｇｌｏｂｕｌａｒ