基于遗传算法的结肠癌基因选择与样本分类

合集下载

1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。

ＣｏｕｅｇｎｅｉｇａｄＡｐｌａｏｓ２０４１）２２４．ｍｐｔｒＥｎｉｅｒｎｎｐｉｔｎ，０７，３（８：４－２５ｃｉ
ＡｂｔａｔＷｅｄｓｒｅｏｅｐｒａｈｆｒｇｎｓｌｃｉｎａｄｃｎｅｌｓｉｃｔｎｏｃｏｒａａａ，ｉｈｃｍｂｎｓｕｐ￣ｓｒｃ：ｅｃｉａｎｖｌａｐｏｃｏｅｅｅｅｔｎａｃｒｃａｓｆａｉｆｍｉｒａｒｙｄｔｗｈｃｏｉｅＳｐｏｂｏｉｏ
使用gasvm选择分类基因41支持向量机支持向量机是在统计学习理论基础上发展起来的一种针对有限样本情况的新型机器学习算法较适合处理基因表达谱这种样本数少维数高的数据集的分类和特征选取问题89数据是线性可分的svm计算一个最大化训练样本和类别边界的间隔的超平面
维普资讯
ｐｏｌｓｒｆｅｉ
摘
要：出了一种基于两轮遗传算法的用于结肠癌微阵列数据基因选择与样本分类的新方法。该方法先根据基因的Ｂａａｈｒｙ提ｈｔｃａａｔｙ
距离指标过滤大部分与分类不相关的基因．而后使用结合了遗传算法和ＣＳＣｒｌｔｎｂｓｄＦａｒＳｌｃｏ）Ｇ／ＦＦ（ｏｅａｏ— ａｅｅｔｅｅｅｔｎ的ＡＣＳ方法选ｉｕｉ择优秀基因子集，存档记录这些子集。根据存档子集中基因被选择的频率选择进一步搜索的候选子集，并最后以结合了遗传算法和
Ｅ—ｍａｉ：ｘｈｙ＠１ＣＢｌｈａｚｈ６３．Ｏ
ＨＥＡｉｉｎ．ｎｅｅｔｎａｄｃａｓｆａｏｏｉｒａｒｙｄｔｆｃｌｎａｄｎｒｌｔｓｕｓｓｇｅｅｃａｇｒｔｍｓ－ｘａｇＧｅｅｓｌｃｏｎｌｓｉｃｔｎｆｒｍｃｏｒａａａｏｏｏｎｏｍａｓｅｕｉｇｎｔｌｏｉｉｉｉｉｎｉｈ．
ｏａｈｅｅｓｕｅａｔｅｒｔｒｏｒｆｔｒｇｈｒｅｅａｔｅｅｒｃａｓｉａｉｎＴｅＧｃｍｂｎｄｗｉＳｓｄｐｅｆｅｃｇｎｉｓｄｓｈｃｅｎｆｌｉｔｅｉｌｖｎｇｎｓｆｌｓｉｃｔ．ｈｎＡｏｉｅｔＣＦｉｉｉｏｉｅｎｏｆｏｈａｏｔｄｔｎｉｆｒａｉｅｅｅｕｓｔ．ｉａｌ，ｓｎｒｈｖｒｃｒｓｏｈｓｓｂｅｓｔｅ５ｓｆｅｕｎｌｅｅｔｄｅｅｒｅｎｄｏｆｄｎｏｉｍｔｇｎｓｂｅｓＦｎｌｕｉｇａｃｉｅｅｏｄｆｔｅｅｕｓｔ，０ｍｏｔｒｑｅｔｓｌｃｅｇｎｓａｅｄｆｅｖｙｈｙｉａａｄｄｔｕｓｔｈｏｇｈｃｔｅＧＡｓｕｅｔｖｌｅｇｎｕｓｔｈｓｔｅｓｉｖｌａｅｙａＳｓａｃｎｉａｅｂｅｔｒｕｈｗｉｈｈｓｉｓｄｏｅｏｖｅｅｓｂｅｓｗｏｅｆｎｓｓｅａｕｔｄｂＶＭｃａｓｆｒｒｉｌｓｉｅ．ｉＯｕｍｅｈｄｉａｓｓｅｎｔｅｃｌｎｄｔｓｔａｄｉｂｅｔｅｅｔｓｌｕｓｔｎｔｌｉｒｖｌｓｉｃｔｎａｃｒｃ．ｔｏｓｓｅｓｄｏｈｏｏａａｅｎｓｌｏｓｌｃｍａｌｂｅｓｄｓｉｍｐｏｅｃａｓｉａｉｃｕａｙａｓａｌｆｏ
ＶｅｔｒＭａｈｎｓ（ＶＭ）ＣｒｅａｉｎｂｓｄＦａｕｅＳｌｃｉｎ（ＳａｄｅｅｉＡｇｒｈ（ｃｏｃｉｅＳ，ｏｒｌｔ — ａｅｅｔｒｅｅｔＣＦ）ｎＧｎｔｏｏｃｌｏｔｍｓＧＡ）Ｆｒｔｔｅｈｔｃａｙａｄｓａｃｉ．ｉｓ，Ｂａｔｈｒｙｉｎｅｈａｔ
ＣｍｕｒＥｇｎｅｉｎｐｌａｏｓ计算机工程与应用ｏｐｔｎｉｅｒｇａｄＡｐｉｔｎｅｎｃｉ
基于遗传算法的结肠癌基因选择与样本分类
何爱香
ＨＥＡｉｘａ — ｉｎｇ —
山东工商学院信息与电子工程学院，山东烟台２４０６０５
ＳｈｏｆＩｆｒｔｎａｄＥｅｔｎｃｎｉｅｒｇＳａｄｎｎｔｕｅｏｕｉｅｓａｄＴｃｎｌｇＹａｔｉＳａｄｎ６０５ＣｉａｃｏｌｏｎｏｍａｉｎｌｃｒｉｓＥｇｎｅｉ，ｈｎｏｇＩｓｉｔｆＢｓｎｓｎｅｈｏｏｙ，ｎａ，ｈｎｏｇ２ｏｏｎｔ４０，ｈｎ
Ｋｅｒｓｙｗｏｄ：ＧｅｅｉｇｒｔｍｓＧＡ）ＳｐｏＶｅｔｒＭａｈｎｓＳｎｔＡｌｏｉｃｈ（；ｕｐ￣ｃｏｃｉｅ（ＶＭ）ＣｒｅａｉｎｂｓｄＦａｕｅＳｌｃｉｎ（Ｆ）ｇｎｘｒｓｉｎ；ｏｌｔ — ａｅｅｔｒｅｅｔｏｏＣＳ；ｅｅｅｐｅｓｏ