KM-plotter在线做生存分析

KM-plotter在线做⽣存分析
KM-plotter（/analysis/index.php?p=service) 是⼀个在线进⾏⽣存分析的⽹站。

⽬前⽹站可以针对
54,675 个基因、18,674个癌症样本展开研究，涉及了乳腺癌、肺癌等等；数据类型有芯⽚数据、⾼通量测序数据，涉及mRNA和miRNA，并且在不断丰富之中。

⽹站的使⽤，⼀般是对相关研究数据进⾏分析（譬如针对GEO数据库数
据、TCGA数据库数据进⾏分析），筛选biomarker之后，再利⽤该⽹站对⽬标基因进⾏⽣存分析验证，从⽽佐证并丰富实验结果。

⽹站使⽤
KM-plotter的使⽤界⾯如下图（Ovarian Cancer界⾯），页⾯罗列了⽣存分析的各数据参数设置选项，包括分析的主要参数和其他相关数据设置。

1.主要设置
针对⽬标基因进⾏⽣存分析时，需要明确分析的癌症类型（见下图），确定癌症类型（mRNA芯⽚数据、mRNA RNA-seq数据或者miRNA数据）之后，填写正确的基因symbol或者提供芯⽚的探针ID(芯⽚数据，探针ID和基因对应关系可以从⽹页Download中
下载)，选择具体的病⼈分组标准，以及⽣存分析类型（OS、PFS、PPS等等）、随访时间等等。

2.具体数据
具体的相关数据设置，主要是选择将要利⽤的具体数据类型，譬如针对具体阶段、分型数据、或者具体的数据集等等进⾏分
析（见下图）。

3.设置差异
需要注意，不同的癌症类型将涉及不同的设置和选择；⽽同⼀个癌症内选择不同的设置，对应数据也可能有所不同，例如Breast Cancer可设置界⾯（见下图）明显区别于上⽅的Ovarian Cancer界⾯。

值得⾼兴的是，⽹站每个设置的相关解释简明易懂，按照提⽰选择需要的设置进⾏分析即可。

4.简单⼩测
⼩编选择了ANLN基因（拓展链接：基于多数据集分析ANLN在宫颈癌所起到的功能) 在Ovarian Cancer芯⽚数据中进⾏OS⽣存分析，参数和结果见下图，⼀秒出结果！
怎么样？是不是很简单快捷！赶快动⼿试试吧！。